4M7YA

Staphylococcus aureus type ii pantothenate kinase in complex with a pantothenate analog
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
266
structure length
266
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Type II pantothenate kinase
publication title Discovery of Potent Pantothenamide Inhibitors of Staphylococcus aureus Pantothenate Kinase through a Minimal SAR Study: Inhibition Is Due to Trapping of the Product.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 95
structure length 266
sequence length 266
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7yA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7yA01
1HKBA 3F9MA 2QWNA 5AQKA 5JICA 3FZHA 4JHDB 1E4FT 2ZF5O 3WT0A 2FLOA 3VEOA 3VEWA 3SJHA 1GLFO 3CI5A 3H46O 3HZ6A 5BN9A 3C7NA 3HI0A 3WQTA 1DKGD 2GWJA 1BO5O 3CJ9A 5BRDA 3WUHA 3FFKB 2Q31A 2E20A 3VF2A 1GLLO 2A41A 4FWMA 3FZLA 5EY4A 1NGFA 4H5WA 3M3ZA 4A2AA 4FO0A 2F9WA 3FE1A 2E88A 3HSCA 1RFQA 5KQDA 4B1VA 4RCHA 5AZJA 4MO5A 4GNIA 4GY2B 5FPDA 3VENA 5AQIA 2NRHA 4IZ9A 1GLCG 3BF1A 3EO3A 1NM1A 1ZBSA 1ZXOA 1HPMA 2P9IB 5AFUH 3A8YA 5ADXA 1SZ2A 3QMLA 5BREA 4CI6A 2P9KA 5LJWA 4CZIA 5EXWA 1G99A 1P8ZA 1QQOA 4BRNA 3WEEA 1XQSC 2V51B 3U8XA 3CIPA 4BRDA 1GLAG 1NGHA 3QFUA 4QS8A 1HUXA 1X9JA 2P9NA 4BQLA 1JCEA 4B9QA 2QM1A 4IJAA 4JN4A 4H5NA 3MN6A 4E1JA 4YDUC 3CQYA 3UKRB 3LDQA 4A62A 3KVGA 4PKIA 5FPEA 4A2BA 1NGDA 2D1KA 1E4GT 1KAXA 3HM8A 2HF3A 4I6MA 4FSVA 2PBDA 3O5BA 3C7NB 2A5XA 2AA4A 3A5MC 5AQQA 3GDQA 4MLEA 1SAZA 3CERA 4BC4A 4BG9A 3UKUA 2E1ZA 3FR0A 4C23A 3DXMB 1T6DA 4L3QA 4BRMA 5AQNA 4IWVA 3WXIA 1ATSA 4BRFA 2NZTA 2GELA 1ATNA 4O8KA 4ISGA 1XUPO 2P9PA 4EIAA 4FWKA 1KXPA 4BRHA 3S41A 4BRKA 3D2EA 4CZGA 3BF3A 4K41A 3R8EA 5E84A 4M7XA 1H1VA 3TU5A 1BA0A 4CBUA 4H0OA 3O1BA 5F2RA 4M63C 4WQ5A 5BRFA 2A3ZA 3FGUA 1U2VA 4KBOA 3GG4A 4XH4A 4B1XB 1LCUA 4J8FA 1S3XA 2Q97A 2P9KB 3UB5A 3FZFA 2CH6A 3LM2A 2CH5A 5BPNA 5KPZA 3ZX0A 3R9PA 3VGMA 4B1YB 3WEEB 3EZWA 3UE5A 2A6AA 3W3DA 2V7ZA 1QZ6A 4BRQA 2VCPA 3ENHA 4BC5A 3LDNA 3IDHA 4AM6A 3QBXA 1OKJA 5AQZA 4H0TB 4K42A 3ZX3A 4BC3A 1NGIA 1NMDA 4CZEA 3GE1A 4FWNA 1CZAN 3VOVA 4BR7A 1Q18A 1BWFO 3O4WA 4BRAA 4FL9A 3MN9A 1S22A 5TKYA 4QS7A 5BN8A 2ASMA 1V4SA 3CJ1A 1YAGA 4Z94A 3MN5A 3VEZA 4MLHA 4I6MB 1XC3A 4DB3A 2Q0RA 4AM7A 3A5OC 2P9SA 3A5LC 3J8AA 4H0PA 2I7NA 4HTLA 3KHYA 2IIRA 3BEXA 1IG8A 3UKUB 5KQ8A 1J6ZA 2AP1A 5EOYA 4CJ7A 2E2PA 4FWQA 2FF6A 1GLBG 4JD2A 3ENOA 1C0FA 4PKHA 2W40A 1KAYA 4WQ4A 2QWRA 4CD1A 3ULEB 2YI1A 2CGLA 1NGJA 2ASPA 2FSJA 5EVZA 2GTDA 4EHUA 3LDOA 3D2EB 2E2QA 1ESVA 2OANA 2QWQA 2A42A 3GL1A 3RSEB 4CBXA 2D0OA 4Y0WA 3CJAA 2A40A 3IMXA 5KPTA 3D2FA 2IVNA 4CZFA 2NLXA 3L4IA 3BP8A 3H1QA 4M7YA 3DXKB 3VESA 1U2VB 4CZJA 3CHWA 4H0VB 2ITMA 3ID8A 2D4WA 4H5VA 3DAWA 1QQNA 4MO4A 3I8BA 1DGKN 3SMSA 4CD3A 3OHRA 3IUCA 3ZETA 3FZKA 2BUPA 3AAQA 4XH5A 1NBWA 3QBWA 3VETA 2UYTA 4IXCA 3MDQA 5AQLA 3JXUA 1LOTB 1IJJA 1HLUA 3ZEUA 3ATVA 5AQVA 4B1UB 2P9UA 2D0PA 5ADXH 3LL3A 3BUZB 1BDGA 4FWSA 4LC9B 3VEYA 4FWLA 5CE3A 2CGKA 3D7EO 3VEVA 3HTVA 1YUWA 4EHTA 4B1ZA 2PAVA 3QB0A 1HKGA 4XEIA 3CJCA 3VPZA 1K8KA 2YHWA 2FXUA 2I7PA 5LY3A 1GLEG 1WOQA 2FF3B 1BA1A 2P9SB 4BRLA 2Q36A 2J4RA 4CZHA 2E8AA 1Z6RA 1BUPA 2ASOA 1MDUB 2W41A 4BRCA 4HWIA 4JD2B 3O1WA 5AQHA 1BU6O 4XH1A 5AZJB 3U9ZA 4FPAA 2VWBA 2HMPA 4ISFA 2QWOA 2V52B 4BR4A 5AQTA 3A0IX 3QICA 3WXKA 1ZC6A 3O08A 3C0BA 5FPMA 3D2FB 3MCPA 3SMPA 4BR2A 5F0XA 5BPLA 2FSNA 2F9TA 1T6CA 3HBTA 5AQMA 4JAXA 3AAPA 3R6MA 1SQKA 4NO7A 4RTFD 3WXJA 3MMVA 3M6GA 2CGJA 4IO8A 3DJCA 2QXLA 5AQSA 2P9NB 3I33A 4BC2A 5KPRA 2H3GX 2Q2RA 1MWMA 2FSKA 2IVPA 5AZIA 1U6ZA 2KHOA 2GUPA 5AQJA 5B8HA 5JLFA 1Z05A 2P9LA 2V7YA 1HKCA 3CJ7A 4ISEA 1TYQA 4BROA 4CZLA 2Q0UA 2QWPA 4B1WB 5EX5A 1DEJA 5FPNA 3MN7A 4FWPA 1GLDG 1YVNA 3QDKA 3UKRA 5E26A 3H6EA 3VGLA 1K8KB 3O80A 3WQUA 4BG8A 2ZWHA 5AFUA 3H1VX 4DQ8A 3WXLA 1ATRA 4JNEA 3AARA 4WQ5C 3P4IA 1RDWX 5AQGA 4BRPA 3W0LA 4BREA 2P9PB 2QW9A 5BR9A 4CZKA 1T44A 4FOEA 1GLJO 2E2NA 4BR0A 3DXMA 4YDUA 3U4LA 4K25A 3EN9A 4H0XB 2YCHA 3VEXA 3VF4A 2ZGZA 1NGBA 2E1YA 1NWKA 1NGGA 2YHYA 3H45C 3LDLA 4QS9A 1KAZA 3EKSA 3L0QA 2HOEA 1YXQA 3FZMA 1RGIA 5AQXA 4IJNA 4H5RA 3L6QA 4O5FA 1JCFA 4BVPA 5AQWA 1WUAA 3KZBA 5AR0A 5AQPA 1QQMA 3B8AX 2HF4A 4PL8A 2YJFA 4EFHA 3O6WA 3VERA 4PKGA 3SLCA 3VGKA 2YJEA 1TUYA 3EL2A 5BPMA 5AZIB 3U9DA 2EWSA 4JHDA 2P9LB 5AQFA 5AQOA 4FOIA 3ZX2A 3JS6A 4WQ4C 1D4XA 1TYQB 4BRGA 1C0GA 1BOTO 3MK6A 1R59O 1HJOA 1QZ5A 1NGEA 1QHAA 4CBWA 1NGCA 1NGAA 4CZMA 2GEMA 5F1XA 3VF6A 5JMVA 1X3NA 1X3MA 1JCGA 4FPBA 1Y64A 3AY9A 4BR9A 1BG3A 3TPQA 3DWLA 3H3NO 3M1FA 4BR5A 2VYPA 2ZGYA 5JLHA 5AQRA 1NLVA 4DCHA 5BRHA 3A5NC 4A61A 2WUSA 3CETA 3EKUA 2IVOA 2BTFA 2E2OA 4H5TA 3CJBA 3ULEA 3FLCO 2QWMA 4RWTA 4PL7A 4EAHD 3RSEA 2P9IA 3LDPA 3O8MA 4BGAA 4DHYA 2YHXA 3ATUA 2GWKA 3CQXA 4BRIA 4F9OA 4K43A 2Q1NA 3H3OB 3LM9A 1HX1A 5I9EB 5ELZA 3DXKA 1MWKA 4BGBA 3ZETB 4FWOA 1V4TA 3IFRA 5AQYA 2QWLA 4BQZA 3SK3A 2DPNA 3ZEUB 3QFPA 4WYBA 5AQUA 2P9UB 4NB4A 4BVOA 3G25A 1TUUA 3GOIA 3GBTA 5LJVA 4H0YB 1EQYA 1MA9B 4H03B 4FWRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AVNA 4QAGA 3SYZA 3IAYA 1EP4A 5CHIA 2OTJN 2NRWA 1S1TA 1W9HA 1FKPA 3J80O 2FLOA 5GIOA 2O8EA 4JKHA 4CFCA 1NJYA 3N4PA 2QKBA 1BO5O 3CJ9A 4WFNL 2PYLA 3I8DA 4NLBA 3HM9A 5M1OA 3LP2A 4CIEA 3TAFA 4FK0A 4FWMA 3V1OA 4FZZA 4JI4K 4JI1K 5M1QA 1XNQK 3HPHA 2BE2A 5DK5A 4B1VA 2IGIA 4GY2B 2Z1HA 3EO3A 1BGXT 1HPMA 1ZXOA 4DSIA 3A8YA 4B9MA 4OGCA 1SZ2A 1TK5A 3BDPA 4F3TA 4DQPA 1KSPA 2IOCA 4BE1A 5K14A 4I2PA 4CCHA 1S1UA 1WSGA 4BDYA 1VSFA 3NH2A 3ULDA 2D0AA 3TARA 1IKYA 1RTDA 4BRNA 4PUOA 3KD1E 3CIPA 4CJ5A 3T3FA 1R0AA 1WAFA 3RTVA 2DFFA 3V9WA 2KFNA 3OYHA 4DR7K 1JCEA 2QM1A 4IJAA 3AVMA 1BI4B 4KHNA 1NK4A 4JI3K 3HP9A 3C6HA 3UKRB 3DMJA 4OPJA 4PKIA 1NGDA 1KAXA 3HM8A 3OBWA 3C7NB 3IKMA 4B8AB 3OY9A 1RT7A 2XY5A 5LL6Z 4BC4A 2IAJA 3UKUA 4OPKA 2F4VK 3RR8A 3QEIA 2X6SA 4CHZA 4PWDA 1T6DA 1B92A 3MEGA 3ZT4A 3PV8A 3IG1A 3J81O 3E66A 4O8KA 4ISGA 4N41A 3CCRN 4YOYA 4LFCK 3VA0A 3OJSA 4ILGB 4BRKA 1VQKN 4Q0BA 2P51A 1I94K 4M3WA 1BA0A 5F2RA 5AJ3K 1QQCA 3HVRA 4B9VA 5BRFA 4PQUA 2YNGA 4UY8O 1U2VA 4KBOA 3GG4A 4BWMA 3ZT2A 1QSSA 2BH1A 3QO9A 4B1XB 3ZT1A 2CH6A 3L2QA 3LM2A 3C6AA 3R9PA 1T03A 4DV1K 3P38A 2V7ZA 1WSEA 4A57A 2HHVA 2VCPA 4B3RK 2XO7A 2KW4A 4K42A 2RPIA 1NMDA 1K8AO 4FWNA 4NCAA 3VOVA 4BR7A 3LWMA 1BWFO 4AQYK 5DMRA 4FL9A 2NRRA 1GOCA 4Z94A 3VEZA 2W6LA 4MLHA 1XC3A 2O4GA 4AHTA 3LPTA 2Q0RA 4K8ZA 4DSFA 3A5OC 4KO0A 3A5LC 3J8AA 4H0PA 1WSHA 4HTLA 1IG8A 2VG7A 5JS2A 3SQ1A 1YI2N 1SL0A 1VQ4N 4FJ8A 1J6ZA 1HQEA 2FBXA 5J1EA 1WNSA 2HNDA 3E9OA 5C15A 4J2EA 4CGDA 1BL3A 1D9FA 1C0FA 4E3SA 4IEIA 1KAYA 2KLAA 1A5VA 2YI1A 2PYJA 1XWLA 4CECA 4M3RA 3GL1A 4J2BA 4OO1J 4DSLA 2D0OA 2NRVA 1VSJA 3ZYYX 4I9QA 4E7JA 4CZFA 2O8CB 3CCLN 4M7YA 3DXKB 3VQ8A 3LZJA 3HRGA 1VSIA 1RDDA 3NDKA 3QEPA 3DAWA 3I8BA 3ZSRA 2Z1GA 3OHRA 4AHCA 1NKEA 3ZETA 4DQQA 4JYAK 4XH5A 1VRTA 1N34K 3OYLA 2UYTA 4O0IA 1LOTB 1RDAA 3NH0A 1HLUA 3ATVA 1K73O 4B1UB 2P9UA 2D0PA 3LL3A 4F2SA 3O4QA 3ZSWA 3VEYA 3C6TA 3WNHA 1RTJA 3VEVA 2YKMA 3PX0A 4CW7B 1J5OA 1HKGA 4XEIA 3VN5A 4FJHA 1YIJN 2YHWA 2HHWA 1RT5A 1ZBFA 1Q9XA 2FXUA 5LY3A 1VQPN 2P9SB 1SKWA 2PZSA 1VQMN 3I55N 4C1NI 3SI6A 2UUBK 4Z0UA 1VSMA 4W5QA 2VWJA 1BUPA 2ASOA 3T7ZA 4DR5K 3DOLA 1TV6A 4CJKA 1RNHA 3O1WA 5FLXO 4KHSA 1YT3A 4FPAA 1HNZK 4WF9L 3CM5A 2G8IA 1VRUA 4BR4A 1ZC6A 3O08A 5FPMA 4DSJA 5KGWA 3SMPA 5F0XA 1NK5A 1DTTA 2FSNA 4DUYK 2YNIA 1QVGM 2YX6A 4Z4EA 4ID5A 2PY5A 3NGYA 2ITGA 3SBTA 1JL1A 2P9NB 2Q2RA 1I39A 3CC2N 3AA4A 5AZIA 1U6ZA 3VA3A 1Z26A 3RR7A 2P9LA 4GKJK 1HKCA 4ISEA 3NF9A 1TYQA 4KTZA 4BROA 2QWPA 4LF7K 1IO2A 4FJIA 2QXFA 2GV9A 1NJIO 5E26A 1NK0A 4FLWA 4LF5K 4DTUA 1MU2A 3WQUA 3PIPL 4DQ8A 3T1YK 4BRPA 2BANA 4DU3A 2NRTA 4DTSA 3AO1A 2P9PB 4R5PA 3DYAA 1LAWA 4JV5K 1T44A 1QS4A 1VSEA 2E2NA 1C0TA 1C1BA 3U4LA 4CIGA 3VEXA 3NFAA 1CLQA 4CK3A 1RT4A 1NGGA 2YHYA 5KRSA 3TABA 1S9EA 3EKSA 4M3YA 4H5RA 1VQ5N 3L6QA 4B9SA 1VQON 4CHYA 4IFYA 3PO5A 3KK7A 4BVPA 3J7YP 1WSFA 2G8HA 3NAEA 3NVKA 5AQPA 1Z25A 2YJFA 1IBKK 3K58A 4Z4HA 2D5RA 1YJ9N 5BPMA 4I9LA 4DTJA 4DFMA 3FFIA 3VQ9A 3AVIA 5AQFA 4FW2A 3ZX2A 2NNWA 4FJ9A 1SKSA 4LH4A 1HJOA 1J9AA 1IKWA 4CF0A 5IWAK 5FRNA 4GV6A 1NGAA 4BDPA 2GEMA 5J2NA 3F9KA 4C8KA 4W5RA 3F2KA 4M3UA 3HVTA 3VQDA 2QI2A 1SV5A 4IG3A 3TPQA 3DWLA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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