4M7YA

Staphylococcus aureus type ii pantothenate kinase in complex with a pantothenate analog
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
266
structure length
266
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Discovery of Potent Pantothenamide Inhibitors of Staphylococcus aureus Pantothenate Kinase through a Minimal SAR Study: Inhibition Is Due to Trapping of the Product.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Type II pantothenate kinase
total genus 95
structure length 266
sequence length 266
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7yA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7yA01
2D4WA 2OANA 1Z6RA 1NM1A 1KAZA 5EXWA 2A40A 5BRHA 3UKRB 5F1XA 1BOTO 3CQXA 1U6ZA 2GWJA 3SMPA 4JHDB 4H0XB 4QS8A 5EY4A 3I33A 4ISFA 3VEVA 3VF2A 4CZLA 5AZJB 4BRIA 4JAXA 3ZX3A 1R59O 3M3ZA 3LL3A 4C23A 2WUSA 1MWKA 4XH4A 4LC9B 1KAXA 3CJ7A 5AQTA 2F9WA 2Q1NA 3W0LA 2E20A 3VEOA 3TU5A 4BRNA 2QW9A 4FWRA 3H45C 2VWBA 1ATNA 2P9UB 5EVZA 2W41A 2FF3B 3ZX0A 4KBOA 2GUPA 5JLHA 1BU6O 4GY2B 3VGMA 3UKUA 1GLBG 1XQSC 2P9PA 5BN8A 5AQVA 2AA4A 3IDHA 5E26A 2E1YA 1GLEG 3VENA 2QM1A 4BVOA 1YXQA 1NGDA 2ASPA 1IG8A 1T6CA 1X3MA 3U9ZA 3VEWA 3H3NO 5AQIA 3L6QA 3O08A 4FO0A 3GOIA 4M7YA 2P9SA 3WQTA 3CJ9A 3ENOA 2HF4A 2QWRA 1Z05A 1E4GT 4BR7A 3GDQA 4FOEA 1S22A 2Q0RA 1BA1A 3QFUA 4J8FA 4CBWA 4BRLA 1SZ2A 2ASMA 4MLHA 1DKGD 4JHDA 3ZX2A 1KAYA 5AQZA 2UYTA 3VGLA 3CJ1A 2NLXA 3FGUA 5E84A 5AQNA 1X3NA 2IVPA 2H3GX 5AQPA 4AM6A 1EQYA 3VF4A 4BC4A 3D2EA 3MK6A 4BR0A 2V7YA 5BPMA 4CZIA 3D2EB 2CGKA 3WXJA 1T44A 4Y0WA 3MN6A 1NBWA 4H0PA 3IMXA 4WQ4C 3O8MA 4H5RA 3H46O 4JD2B 2FSKA 4HTLA 5AQXA 1GLFO 4WQ5A 4CBUA 3DXMA 3BP8A 2GELA 5BPLA 2YHYA 3CI5A 4CBXA 1NGGA 2KHOA 2V7ZA 1HKBA 4IXCA 5FPDA 1NGCA 3M6GA 3KVGA 3ZEUB 3WT0A 2Q0UA 5AQFA 4JN4A 3U8XA 5I9EB 2FSNA 3MN7A 4CZJA 2P9KB 5AFUH 3FZLA 3UKUB 3EZWA 1TUUA 3MDQA 5AQGA 1HX1A 2EWSA 4PL7A 1P8ZA 4FWNA 4CZEA 2D1KA 3BUZB 1ZC6A 4M7XA 3FZMA 5AQUA 3A8YA 5AQRA 3B8AX 4CZHA 1QQOA 3C7NA 5AQWA 4K41A 3R8EA 3A5OC 5LY3A 3HSCA 1BA0A 1NGAA 4BRMA 3ULEA 1ATRA 4IJAA 5F0XA 4YDUC 1DGKN 5AQQA 5AZJA 3R9PA 2FXUA 1LCUA 4FOIA 1NGEA 3FFKB 5EOYA 1NGHA 4HWIA 2HOEA 4CD1A 4BG9A 4FWKA 4H5WA 4BR5A 4JNEA 1H1VA 4DHYA 5LJWA 3EN9A 5FPNA 1BWFO 2FF6A 5AQKA 2P9UA 5BN9A 3SLCA 2Q31A 1S3XA 1GLAG 1SQKA 2BUPA 1NWKA 5JICA 4B9QA 2QWNA 3DAWA 3QBWA 2QWLA 3CJCA 3FZHA 3A5MC 4BRFA 3LDPA 2PAVA 3MCPA 3FZKA 4B1XB 3HBTA 4A61A 1BG3A 4DB3A 1HJOA 3RSEB 2IVOA 2DPNA 3O4WA 4BR2A 3CJAA 5KPTA 4A62A 3H1VX 2GEMA 4PL8A 2NRHA 1MDUB 1TYQB 4A2AA 3ZEUA 4BGAA 4DCHA 2IIRA 4O8KA 2P9KA 3IUCA 2ITMA 5AQOA 1NGIA 2D0PA 3RSEA 3UB5A 1HKCA 4BQLA 4BROA 5BR9A 4K43A 5AQHA 2CH6A 2Q97A 4FWOA 4XEIA 1IJJA 1GLDG 1XC3A 4I6MB 2P9LA 3TPQA 2ZF5O 3U4LA 3FE1A 2E88A 3SJHA 5TKYA 5CE3A 1JCGA 4EHUA 4H0TB 4BRDA 3BF1A 2P9NB 4FPAA 4K25A 3H1QA 2P9NA 5ADXH 4WQ5C 1QQMA 2P9SB 3IFRA 1NLVA 5F2RA 2HMPA 2I7NA 1NGBA 3ATUA 2A6AA 3AAPA 1NGJA 3CHWA 3L4IA 3VESA 4BRPA 4FWPA 5FPEA 1D4XA 3JS6A 3QB0A 4JD2A 4GNIA 1K8KB 2IVNA 2Q36A 4CZGA 2D0OA 3EKSA 4IWVA 3DXKB 4NO7A 1U2VA 3DXKA 3EKUA 4WQ4A 5EX5A 5BPNA 1ZXOA 2P9IB 1QZ5A 2E2QA 5KQDA 3ID8A 3O1BA 4BGBA 3EO3A 3FZFA 3O6WA 1ATSA 2GTDA 3D7EO 5AQJA 3H6EA 4Z94A 2VCPA 3EL2A 3WEEA 2QXLA 4PKHA 5JMVA 3LDNA 5AQSA 4I6MA 1J6ZA 1BUPA 4NB4A 3WXKA 4EAHD 4CJ7A 2PBDA 1MA9B 4BRQA 1HUXA 4BR9A 4B1UB 1NGFA 3MMVA 3ZETA 2CGLA 3FLCO 3J8AA 2Q2RA 4XH1A 4H5VA 3QDKA 2A41A 4FWQA 3ULEB 3CIPA 3VOVA 3U9DA 4BC2A 3LDQA 1CZAN 4IJNA 4BRGA 3C7NB 2GWKA 3UE5A 2HF3A 3VPZA 1MWMA 4IZ9A 2ZGZA 4PKGA 1SAZA 1BDGA 3CERA 3LM9A 3P4IA 3VEZA 3FR0A 3MN9A 4YDUA 1NMDA 4CZMA 3SMSA 2CH5A 1HLUA 4ISGA 3A0IX 4AM7A 3VETA 1LOTB 2P9LB 2YI1A 3O5BA 4CZFA 1V4SA 3VEXA 2F9TA 4MO5A 4BR4A 3HTVA 3HI0A 2E2PA 4H0VB 4H5NA 1C0GA 1QZ6A 2YCHA 3O80A 4H0YB 3D2FB 3CQYA 5BREA 1QHAA 1K8KA 1V4TA 3GG4A 1JCFA 4O5FA 1GLLO 2E2OA 2QWQA 3WXIA 4EHTA 1BO5O 4PKIA 4BREA 3GL1A 3QICA 3CETA 4BVPA 1Y64A 3H3OB 3VF6A 1RFQA 4FL9A 5BRDA 4FPBA 3LM2A 3KZBA 4FSVA 4FWSA 2ZGYA 3DWLA 1GLJO 3QFPA 3VERA 4A2BA 3WUHA 5JLFA 2V51B 3AY9A 3VEYA 4B1VA 2FSJA 3O1WA 1RGIA 2P9PB 3KHYA 5AFUA 1E4FT 3LDOA 2ASOA 2VYPA 3A5LC 1OKJA 3I8BA 2CGJA 3AAQA 5ELZA 3VGKA 3BF3A 5BRFA 3G25A 5ADXA 1HPMA 4WYBA 1X9JA 2QWOA 3GE1A 3UKRA 4RTFD 1WUAA 4BG8A 4CD3A 4QS7A 5FPMA 2W40A 1TYQA 5AZIA 4E1JA 4H03B 5AZIB 4B1ZA 3C0BA 4DQ8A 4B1WB 5AR0A 4MO4A 2I7PA 2NZTA 3L0QA 4IO8A 4MLEA 3AARA 4BRCA 3M1FA 3DJCA 1G99A 2FLOA 3SK3A 3LDLA 4XH5A 4RCHA 1DEJA 4BC3A 2QWMA 3WQUA 2BTFA 1TUYA 4BQZA 5KPRA 1Q18A 1KXPA 4CI6A 3ZETB 4CZKA 1T6DA 3DXMB 5AQYA 4H5TA 4BRHA 2YHXA 2J4RA 3BEXA 3HM8A 2E2NA 3R6MA 4ISEA 3ENHA 4BC5A 1RDWX 2YHWA 3A5NC 4K42A 4EFHA 3HZ6A 4BRAA 2A3ZA 1XUPO 4FWMA 5KPZA 3ATVA 2QWPA 2A42A 3GBTA 4EIAA 3WXLA 3QMLA 4F9OA 1HKGA 2E1ZA 1ZBSA 1YUWA 4H0OA 5KQ8A 1JCEA 2V52B 2P9IA 3JXUA 1C0FA 3WEEB 3MN5A 1YVNA 1WOQA 3QBXA 1GLCG 2ZWHA 2AP1A 2YJEA 3D2FA 5AQMA 4B1YB 4L3QA 2YJFA 2A5XA 1ESVA 5LJVA 1QQNA 2E8AA 5AQLA 3W3DA 1U2VB 3S41A 3CJBA 4RWTA 3F9MA 4FWLA 3OHRA 5B8HA 4BRKA 4QS9A 4M63C 1YAGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3THYB 5EXWA 1HYSA 4RW9A 3CQXA 1U6ZA 5M1PA 1M1KO 2GWJA 1U04A 4JHDB 3PX4A 4JI8K 4GKJK 5AJ3K 4CZLA 1JLBA 3OW2M 4OLBA 3LL3A 3B6PA 4C23A 4LC9B 3CJ7A 3THWA 2Q1NA 3PIPL 2HVHA 2QXFA 3MXIA 3VEOA 2ZJQL 3SV3A 3V9XA 3DI6A 2ETJA 1VSJA 3SAHA 3CPWM 3V81A 3HRGA 4FVMA 3OYDA 5EVZA 1Q9XA 1RBUA 1S6PA 2GUPA 5JLHA 1NK4A 2BE2A 5CYMA 1XQSC 3KLGA 5BN8A 5AQVA 5GAGP 3OYCA 3QNNA 4CEFA 1D9DA 4DTSA 2QM1A 1YXQA 1NGDA 1GOCA 1IG8A 4B8AB 1N34K 3H3NO 4QAGA 1WBDA 4C8NA 4OPJA 4W5NA 3O08A 2JWKA 2YNIA 4M7YA 3P83D 3WQTA 4OJRA 3PY8A 2QWRA 2NRZA 3HPHA 4BR7A 3K58A 1S1WA 3THYA 2HBJA 1WN7A 3L4QA 4I9LA 4CHOA 5T7BA 4CBWA 4FJLA 1KRPA 4MLHA 1I39A 3MEDA 3ZT3A 3ZX2A 1G15A 2NLXA 4Q5VA 4JI5K 5CY4A 1IKVA 5AQNA 3N4QA 3VQAA 3O3FA 2GV9A 3SQ1A 1QVGM 3AA2A 5AQPA 4A57A 1YJ9N 3D2EA 4YOWA 3MK6A 1FXXA 4H4MA 4BR0A 2V7YA 4OO1J 4CZIA 1JLAA 3D2EB 4DFPA 3AO4A 4HTUA 1X9MA 1OH6A 3HP9A 4KKOA 2KQ2A 4FLZA 3L2QA 2G8VA 4H0PA 5FRMA 3IMXA 3RMBA 2UUAK 1OH5A 3O8MA 4H5RA 4WQ5A 4CBUA 5BPLA 1SL1A 2GELA 2YHYA 3HO1A 4CBXA 2UUCK 2WBNA 4IXCA 4F2RA 2Q0UA 3U8XA 1K9MO 3CXCM 1VQLN 2NRVA 2NRXA 4I2PA 3BZCA 3QERA 5E41A 1KFSA 4FWNA 4CZEA 2O8FA 4ID1A 3BUZB 4HCCA 1ZC6A 4HUFA 3THXA 1WSIA 4CJQA 5AQRA 4DSEA 4K41A 4FW1A 2HNZA 4DSJA 1ZBIA 2D0AA 4CGJA 3ULEA 5MLCQ 1SKSA 4IJAA 3M5RA 4GVEA 1BIUA 1RT3A 4DV7K 2KFZA 5EOYA 3QEWA 4KHSA 3G0ZA 4M45A 4FXDA 1TK8A 4CW7B 4YOTA 2FF6A 4MDBA 4LY7A 2P9UA 3O4QA 3M8QA 3T69A 3J7ZO 2Z1IA 1SQKA 3ZT2A 2W6LA 4Z0UA 4B9QA 3OYHA 3DAWA 2FBVA 1HJRA 2QWLA 3CJCA 2ITGA 1C1BA 3SYZA 3A5MC 4BRFA 3LDPA 2O8EA 3LP2A 5SWMA 3HBTA 1BG3A 3D6RA 3DM2A 1Q9YA 4LFBK 1QVFM 3MXMA 2ZE2A 3V4IA 4CF2A 4Z4CA 1U4BA 3DRRA 2ZM6K 4AHVA 3KLIA 2XY5A 1MDUB 4BGAA 2IIRA 4O8KA 1O13A 1X1PA 1MU2A 3OYEA 3RSEA 1K8AO 2PYLA 4BROA 2HVIA 1VSHA 3ZCMA 2CH6A 1XI1A 4DR2K 4LH4A 4F8RA 1RT4A 2P5GA 3V1QA 1GLDG 3LWMA 1J5OA 1JCGA 3IRXA 1RTHA 4KTZA 4J2AA 1D9FA 1Z25A 2P9NA 5ADXH 5FLXO 2P9SB 3IFRA 4DSKA 2HMPA 4E1NA 1NGBA 4NYFA 1VQ5N 3SNNA 1NGJA 2YNHA 1WSFA 4FWPA 2XHBA 5C10A 4E7HA 5HRRA 1IBMK 4N5SA 1RT5A 4CF0A 2HHXA 2IVNA 2Q36A 3K5MA 4CZGA 2D0OA 1U2VA 3EEQA 3CCMN 1XWLA 3EKUA 4WQ4A 5EX5A 1RDUA 1QS4A 2E2QA 2P9IB 5KQDA 3DRPA 1NK6A 4CERA 4BGBA 3EO3A 2B5JA 3FZFA 3O9QA 3CMEN 3VQ9A 3L3VA 1VQ7N 3O9TA 4LSNA 1KD1O 5TKWA 5JMVA 3DOKA 1GOAA 5AQSA 2O8BB 4M3UA 1BUPA 2GUIA 4DTJA 3THVA 4FLXA 3E9PA 3TAPA 4KH5A 1IBLK 4IKFA 3OJSA 3AVAA 3TAFA 4FK2A 1S9GA 2QA4N 3MWTA 4FJGA 4CFCA 3L2WA 3FLCO 4LFCK 4BRGA 3U9DA 4HUGA 3C7NB 1R0AA 4CJRA 2D5RA 3UE5A 3LPUA 5HBMA 4B9NA 5KGWA 4PKGA 1TVRA 1BDGA 3CERA 1VAZA 3VEZA 3CQ8A 1RT7A 3JAMO 1JXEA 1BCOA 1HLUA 4EP4A 4AM7A 3TSPA 1TL1A 2YI1A 3VEXA 5I3UA 3AGRA 3HTVA 3VQEA 1Q7YO 4CEDA 3OVNA 4H5NA 3D45A 1IKWA 1Z26A 3D2FB 3CQYA 1VSIA 2O4IA 1UA1A 3GG4A 1WSEA 4O5FA 3WXIA 4EHTA 3OY9A 4PKIA 1J54A 4C8KA 3GL1A 3M8RA 3HOSA 1ZBFA 3KKSA 4IEEA 1HMVA 3ASMA 3NE6A 3PV8A 2UU9K 3H3OB 3HOTA 3VF6A 3JYTA 1RTDA 1LAWA 3QO9A 4FSVA 4MFBA 3ZSXA 4KHWA 3DWLA 2P1JA 3O3HA 3HPOA 3VERA 4GV6A 3WUHA 5JLFA 3KTQA 4JI4K 2V51B 2HHUA 5AFUA 1E4FT 3EE9A 3LDOA 3A5LC 3HM9A 2E6MA 5ELZA 5BRFA 3BF3A 3HVTA 3CFRA 3GE1A 4RTFD 1WUAA 4K8XA 4WE1A 4B1ZA 3C0BA 4DQ8A 3WNGA 5AR0A 1XMQK 2YHAA 4MO4A 4JS4A 4JYAK 4BACA 4DTRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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