4MA9A

Wild type salmonella alkyl hydroperoxide reductase c in its substrate-ready conformation
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
publication title The sensitive balance between the fully folded and locally unfolded conformations of a model peroxiredoxin.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule tags Oxidoreductase
total genus 59
structure length 163
sequence length 163
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ma9A00
3EYTA 2C1YA 2L59A 4TN8A 4GXZA 5IOWA 4GTUA 1YKAA 4IKHA 5GAPD 4YAVA 1A8YA 4EO3A 2CZ2A 2GT5A 5DQYA 1W89A 2WZ9A 3WT1A 4N0ZA 4ECBA 4MZWA 1GSUA 1WRYA 5IMZA 3ERWA 4L0WA 5HR1A 2K8SA 5ECNB 4GF0A 1AQXA 4O32A 1DUGA 4JBBA 5ELGA 3P8WA 4I6XA 4IS0A 5CRDA 2GQLA 19GSA 1X9MB 2FNOA 1OC9A 3IR4A 1GTBA 2AYTA 1T8EB 2EIOA 1IYHA 2A2SA 4IN0A 3HDCA 4X1UA 2OBKA 1XVWA 3PH9A 4RQRA 3ZRDA 11GSA 10GSA 1S3AA 2H71A 1U6TA 1HYUA 1BYEA 3DKSA 1T00A 1PKWA 2B5YA 4HI7A 4MJAA 1V98A 1JLVA 3F6FA 2PPTA 1JLWA 2L6CA 2LUSA 3WGXA 3UVHA 3KH9A 2IWTA 3OR5A 2JACA 1MDIA 2K6VA 3TKSE 4GSSA 4G9HA 3ERFA 4KE3A 2H0IA 4PXOA 1ZZYA 5DJMA 4XS6A 2WJUA 3ZMKA 2GZPA 4TR0A 4MZCA 1K0BA 4XS1A 2R3XA 1ACVA 4MA9A 2L4CA 5CP1A 5CREA 3TKSC 5ECHB 2IMFA 3N9JA 2H30A 5AIXA 2H19A 4TVEA 3P90A 4NV5A 2E7PA 4GSTA 3D0ZA 4GQCA 1DE2A 5CO3A 1BQ7A 5IPGA 2WB9A 4FO5A 4YH2A 3UL3A 2B1KA 3FR9A 4K8MA 4WF5A 4K2DA 4MZBA 1SU9A 5J9BA 4TR4A 4LA1A 5E59A 2X99A 3DD3A 2CA8A 4EDYA 2K9FA 5IMVA 3TKRA 2RUFA 4LLRA 4MJEA 3EMXA 1TRSA 4EDZA 12GSA 1H4OA 4F2IA 1MD3A 2H76A 5JWQB 4KCEA 5B7CA 5H5QA 1YEXA 3R2QA 1TK0B 4JZQA 1R4WA 4ZL7A 3ZTLA 1PMTA 4WBRD 2HRFA 2FY6A 2PGTA 1M9AA 2LNTA 4L8EA 1Z6MA 2B5XA 2JADA 5J4UA 4FH8A 4ML1A 5D73A 4D73A 3GIXA 2C0DA 3TCOA 2CT6A 1GSQA 3ZFBA 1TK5B 1QQ2A 1QFNA 1WJKA 2MBTA 3CSIA 1THXA 4K0GA 3LORA 1ERVA 1TRVA 3M3MA 4J57E 4FYUA 1WOUA 3Q6OA 1VF3A 4IP1A 5IO0A 1OKTA 3CRTA 4G2EA 1Q98A 1FVJA 2PWJA 2HSHA 3UOMA 4K7NA 2P0GA 4WF4A 3TJFA 2FCHA 4CDOA 1U87A 2OACA 5G31A 4TR3A 3UBLA 3CTFA 4KSOA 3UJ1A 1XWCA 4D73B 1HNAA 5ECLB 1X9SB 4LMVA 3IA1A 2I1UA 4CHSA 1Y25A 1OE7A 1EOGA 4EE0A 5IM9A 5DBQA 2YCDA 4NMUA 4EC0A 2OKAA 5A4WA 4MF6A 5INYA 2QGVA 3PGTA 3HVVA 1OE8A 3GKXA 1T1VA 3GUSA 3HZ8A 1XVQA 1MTCA 1JFUA 3QAWA 5LNKe 5A4UA 1Z5YE 3WD6A 2VLTA 2VOCA 3SBCA 1FB6A 2JL4A 4XHMA 2PN8A 1AQVA 1M9BA 4TXVA 4ACSA 2GLRA 3QCPA 3KM6A 1EWXA 2GDRA 4WR5A 1I9DA 4Z7XA 2FA4A 3GKMA 2MBSA 2VIMA 5HR0A 2H6XA 1XZOA 4MH2A 4TW5A 1BAYA 5G5FA 4POKA 4JR6A 4ZB9A 1T7PB 1TU7A 1DE1A 1URMA 1NW2A 1XOBA 1YF1A 3US3A 3M1GA 2GSTA 3IV4A 2FWFA 4FIWA 5J41A 1ST9A 2IJYA 1FG4A 2O7KA 5AIVA 3UEMA 2KLXA 1N2AA 5KN3A 3FHKA 3ZITA 4OCFA 2HSYA 1F6MC 1ZCPA 1B9XC 4OMVA 1HNBA 4JU5A 4KDUA 4Q5QA 1YY7A 1OYJA 1BJXA 4MPGA 1VF2A 2DJJA 2H72A 3HVSA 2Z9SA 1RW1A 2LSTA 2OE3A 5JCWA 2HE3A 3GRXA 1K0CA 1TP9A 3ZVJA 3GSTA 1UN2A 2J23A 4FYBA 4ULXA 1R5AA 22GSA 2WFCA 1FOVA 4H86A 2H1BA 2FGXA 3TJBA 3C8EA 3M8NA 3MSZA 4BPYA 4IVFA 2CAIA 5EY6A 3KCMA 3FZ4A 5JCGA 4BA7A 3O3TA 1ERUA 2F8AA 3LYKA 3C71A 3PR8A 3F0IA 4ZBBA 3APOA 2CX4A 2DJ3A 1FO5A 3KTBA 3A3TA 2H75A 3TRXA 3E0UA 1G6YA 2M80A 1XWBA 3IDVA 3LSZA 2E0QA 5CRHA 4JE1A 4KUNA 2BTOT 2VCZA 3FEUA 3RAZA 3A2WA 3S9FA 4PUAA 2OE0A 2A4VA 4IHUA 3G7IA 2GVPA 4RQXA 2ALBA 1GWCA 5A5KA 4IQAA 4LL4B 2FA8A 2VCXA 4IW9A 7GSSA 1ABAA 5J3RA 2D2ZA 1ZYEA 4XCSA 3A2XA 2JZTA 2CQ9A 5E4WA 5HFIA 3TJGA 2DMMA 5D96A 2DJKA 3GA4A 2WCIA 1WWJA 3F4TA 2GS3A 3TB2A 2LJKA 2TRXA 5C00A 1LBKA 4ECJA 4Q5NA 3TRPA 3GX8A 5C04A 1TRUA 5DAKB 1ERWA 4NXIA 4HU7A 18GSA 4NHZA 4ECCA 4MABA 1Z9HA 1QUWA 1GSDA 2QSIA 3CSHA 4IGJA 4EKZA 3IK9A 4RI7A 1XPVA 3TOTA 1GH2A 4E8HA 4Q5RA 4K7OA 5IMCA 5D8IA 1EGOA 1UC7A 2IIYA 3VFIA 1A24A 4MJBA 3V1WA 1SJ6A 1AXDA 2VL3A 4V1Ag 2PERA 3D6IA 1AC1A 4V2NA 3FZ9A 4KSMA 1X9WB 4EF0A 2V32A 1F37A 3IAS2 4CW9A 1H75A 2H1DA 2VM2A 3BCKA 3L0HA 1GUKA 4KW6A 1PSQA 1GTIA 3C1RA 3IE3A 4P3YB 3VURA 3C7MA 3WGDA 3ZL5A 2FWHA 2NVLA 3QOUA 3TJJA 2XPDA 2OBIA 4GRFA 1N8JA 4L5LA 3M0FA 3BBYA 5JWOB 2GQKA 3A5WA 3ZLPA 1HNCA 4RI6A 2VLUA 4IBPA 3HJOA 1WP0A 4F82A 1E6BA 3HHVA 1RK4A 1C72A 5ABRA 5G1KA 4ILFA 4N10A 4X43A 5G2ZA 5F05A 4WR4A 3QFAC 3SWLA 1GSFA 3D21A 2X8HA 5AGYA 2F51A 3TOUA 3HCZA 4JRRA 1SKWB 3VPTA 1GLPA 1ZL9A 2M72A 4F03A 5FHIA 1YZXA 1K3YA 5G1LA 2GTUA 3H93A 2G0FA 2I9HA 3QAVA 4BL7A 5CRGA 1FB0A 2VCQA 5D93A 1TI1A 2MYGA 2H6ZA 2MZCA 1Z7RA 1GL8A 4MDCA 1YQ1A 1K3OA 4HQZA 4ZB6A 1X5EA 1DSBA 1U3AA 3G7YA 4BWQA 4AF2A 3D22A 4MF5A 2P5RA 3HD5A 2AAWA 1A23A 5COHA 1NSWA 4ID0A 4AGSA 5ID2A 3F8UA 2I3YA 1SKRB 1TK8B 2C8UA 3IBHA 3QMXA 5CAXA 4HJ2A 1K0OA 5F07A 1VGLA 3L78A 4K6XA 4HJMA 2J9HA 1KBNA 3HY2A 3LXTA 2VL9A 1F3AA 2VCTA 3TDGA 2VO4A 1QXHA 3GTUA 4RUVA 1XW9A 3GL3A 4KDXA 4POLA 1B8XA 3HJMA 2CVBA 4DSSA 5IMAA 2WS2A 3EC3A 3DGQA 5ECPB 2LRNA 3LGCA 3FYGA 3UARA 1FVKA 2YZUA 3EU3A 2AJQB 2AUVA 3G7JA 4YQVA 6GSWA 5ID2B 1A2LA 2M46A 5H5SA 2IMDA 2FUG2 1SKSB 2HNLA 1GUMA 2ON5A 2I4AA 2FWGA 3J7Yk 3QAGA 4Q5FA 3F3QA 2E2GA 4O5RA 2R5GA 2IN3A 2ZUPA 1V2AA 2K8VA 3GTUB 1FW1A 3W6GA 3I43A 4J56E 3VWUA 2HZEB 5D9XA 2H1AA 1ZGNA 3IRAA 3RDWA 4DSSB 2GZYA 1M2AA 1GSSA 4MCUA 4KH7A 1I5GA 14GSA 1QMVA 3EVIA 2KUCA 4K7IA 2DJ1A 1THOA 1TU8A 5L71A 2F8FA 3VWWA 3QR6A 4QQ7A 3F6DA 3LEFA 1AIUA 3Q74A 2DBCA 4BVYA 1GLQA 3NZNA 3DXBA 1EP8A 2O87A 3EU4A 4ZBAA 1FHEA 3O76A 4PX1A 2RLIA 5LCZA 1A0FA 3KH7A 2LJRA 3KTLA 1AQWA 1MDKA 2YPMA 4EUYA 1PGTA 1PRXA 3TKQA 3EURA 2H01A 3EMPA 5JWRB 1TTZA 5EPFA 3I69A 1PN9A 1Y6EA 4NV2A 1JZDA 2H8LA 3DVWA 4HZ4A 1OC8A 2DMLA 3TUEA 1M2BA 3GX0A 17GSA 1BEDA 4NAXA 1A0RP 1TDIA 4MMMA 2WULA 4ML6A 1BG5A 5HFGA 4OCEA 1X5DA 3HA9A 2B6MA 2V6OA 4OFNA 3GMFA 2ZCTA 4ZILA 4E8EA 2B3SA 2C3QA 2LJAA 5J9CA 3GKKA 5AISA 3K8NA 2FHEA 4I97A 2H74A 3D4MA 4LMWA 3ZIVA 2HI7A 4ZB8A 2N5FA 4HQSA 2L6DA 2YANA 1UA5A 4WXTA 2HLSA 1JZRA 1XFLA 4I2TA 4MF7A 6GSXA 5IPHA 4LL1B 1CQHA 2VL2A 1J0FA 2JSZA 5HFKA 4KNDA 4OO4A 4KA0A 4DVCA 5ELAA 2MMOA 1U88A 1KTEA 3KD0A 2REMA 3MDKA 2GSSA 4MK3A 3HZ4A 2OJLA 4XTSA 5HQPA 3M9JA 2IL3A 1R26A 3ERGA 3IXRA 2L5OA 1M0UA 1XBSA 2HRNA 2K18A 3NOFA 1TJDA 2H66A 4K9ZA 1WE0A 3F4SA 1AW9A 2VLVA 4IP6A 2B5EA 2R2JA 3EE2A 2YWMA 2L57A 3ISOA 4I5QA 5ECRB 3KEBA 4YQMA 5EL8A 3LFLA 1J9BA 4GWRA 3GNJA 1JZOA 4HU9A 3DVXA 3VWVA 3CTGA 1F2EA 6GSSA 1SJZA 3U5RE 5IIZA 3BCIA 4ZIJA 2HT9A 2O85A 2PVOC 3PINA 1V58A 3W8SA 2EC4A 1M7TA 1OVNA 2PMTA 4EVMA 3E3EA 2H6YA 4IQ1A 4PUFC 2HYXA 2BMXA 2WRTA 1YF0A 1QGVA 2HFDA 5D9WA 2KHPA 2XBQA 5KN2A 1EEMA 2N5BA 5B6MA 2CVKA 4L0UA 2EIRA 2OE1A 3RHBA 3MNGA 4F0CA 1K0NA 2JZRA 3KJYA 3VI7A 1GRXA 5DAKA 5B8BA 4DEJA 4PNGA 3KMNA 4HS1A 4KDYA 1SL2B 3LG6A 3H79A 1MEKA 3VPQA 1F9MA 5FT3A 4N11A 1G6WA 1TRWA 4OFMA 3DYRA 1M2DA 4V2MA 1K0AA 1QK8A 1BX9A 4HZ2A 3CSJA 4V1Ap 1SL0B 3Q18A 4ISDA 1XWAA 5CNWA 5DVBA 2KOKA 1PQNA 1PX7A 2VCVA 3DWVA 1PL2A 2V2GA 3ZVJD 2H0HA 1TW9A 5AN1A 3LQ7A 1EP7A 1EV9A 2LS5A 5DQSA 4PURA 1XW5A 1Z6NA 1S3CA 1WIKA 2X8CA 2YWOA 3HYPA 2C3NA 2L4QA 2H70A 3L9UA 4KAEA 1W4VA 4XS4A 1WMJA 1HD2A 2DJ2A 4HUAA 2FD3A 1X0RA 2O8VB 1O6JA 1USBA 5GSTA 1K0MA 1T4YA 1YKCA 2NTOA 4IJIA 4X0XA 2NBSA 1WPIA 3O6TA 1O81A 3ED3A 2YOIA 2GT6A 2V6KA 4K0NA 2WDUA 4K1FA 1TXXA 4G19A 2TRCP 2KP1A 2JU5A 2C0EA 3QD9A 1VRSD 1PD21 3CYNA 2HZFA 2JSYA 3F9UA 1ZYQB 4QL7A 2VAFA 4XS4B 5F06A 2YP6A 4O7HA 4ZL8A 3M9KA 1PX6A 4AJ8A 3ZZXA 3H1NA 1YEPA 4TKYA 3UAPA 4EXJA 2FLSA 4TOPA 2VCWA 2RM5A 3FK8A 4PQHA 4F0BA 4WBJA 1GP1A 2YNXA 2AHEA 2F9SA 1ILOA 5J5NA 2LRTA 1EGRA 1A2JA 3F63A 1SK1A 3BOAA 3APQA 1XW6A 1A2MA 4NPBA 3VLNA 3GFKA 1SK2A 1SYRA 3EINA 4PGTA 3QDNA 3KXOA 2C4JA 1XWGA 4WETA 1Q4JA 2L5LA 3QFBC 2MMNA 1S3DA 3AY8A 1GUHA 1B48A 2LQOA 1EZKA 2X8GA 1O73A 2DIYA 1OC9B 1NM3A 1GNWA 2R6KA 3LWAA 1EV4A 2NPBA 1B4QA 1VF1A 2MMZA 1XCCA 3HKRA 3P7XA 4IELA 6GSTA 5H5RA 3WGEA 5GAND 1LJRA 2PU9C 1NHYA 1T3BA 3F3RA 1SL1B 1G7EA 4FYCA 3KGKA 2H73A 3VK9A 1GTUA 5ECIB 4L5OA 5GZZB 1OAZA 2VUPA 3UVTA 2QKEA 2DLXA 5KN0A 3HVXA 3J7Yb 1G7OA 4QL9A 2XHFA 2OA7A 2B1LA 2YJHA 2OADA 4PQIA 2HXKA 2V1MA 1EOHA 2HZEA 3RBTA 3TRQA 3GURA 5DDLA 5F8BA 4OD7A 1GSEA 2LNSA 1B9YC 1YJ6A 2YZHA 4JR4A 1HQOA 1LU4A 1RQMA 1DBYA 1KEBA 3KP9A 1K3LA 3JCML 2C3TA 1V9WA 4F9ZA 2CX3A 1OKDA 2IPAA 2IMIA 5B8AA 1UVZA 3TKPA 4DSQA 3IHQA 2DC5A 2XC2A 3H4KA 3ZMLA 2GZZA 5ECQB 3KMOA 2IFQA 4BWSA 1GULA 4TRXA 3UMAA 4G10A 1SK0A 2LKUA 1PL1A 4ZBDA 3BJ5A 3FKFA 3CMIA 3TJKA 2YN1A 4I8BA 2DSAA 1MDJA 2EIQA 3DEXA 4O92A 6GSUA 3FR6A 3D5JA 1M99A 2ON7A 4WEYA 3ZFLA 1JHBA 2I81A 4PQ1A 1J08A 1ZMAA 3RPPA 1EEJA 3UIWA 2O89A 2JZSA 1ZOFA 1O7UA 3DIEA 1GNEA 2IFQB 4IJ3A 4TXOA 5D9VA 5ENUA 3VWXA 3ME8A 1U3IA 5ECOB 1O8XA 4AJ7A 2QC7A 4YQUA 4MJCA 1B4PA 4GSNA 1XXUA 4YAPA 3C1SA 4MLYA 3LJRA 3FR3A 2TIRA 2P5QA 4POMA 2CZ3A 3WYWA 2YWNA 1XIYA 1GTAA 4EL1A 3WT2A 2PUKC 5IMDA 3UBKA 1R5PA 2H1GA 5G5EA 2YJ7A 2KP2A 3C73A 4TXOB 2E2MA 3DMLA 1K0DA 1ON4A 3L9VA 1T4ZA 2YV9A 3HJPA 1X5CA 4POBA 3CXGA 1AAZA 13GSA 2X64A 2ES7A 4GQFA 5LD0A 5IOXA 3QPMA 3KZQA 4OO5A 2C0GA 5DALA 1IYIA 2PVQA 1TKDB 2G2QA 3KP8A 2FWEA 5IO2A 5EVOA 3IAM2 2IMKA 20GSA 1NHOA 4HDEA 4KGIA 4V2LA 1Z3EA 3CRUA 2LQQA 3E9JB 4XRDA 2PBJA 1SJIA 2C0FA 2A2RA 3I9V2 2F3MA 4OWYA 1PA3A 4XRAA 2LEGA 5GSSA 5JCUA 3HXSA 3RPNA 4HOJA 4N30A 2MMAA 5CYYA 1SD8A 2GSQA 5DCGA 5DALB 2GQMA 4MP4A 2WGRA 1R7HA 3MWHA 3GHAA 2RUEA 2R37A 2NDOA 1O8WA 2YWIA 2CV4A 1OC3A 1ML6A 5D9TA 4MPFA 2C80A 1VF4A 3DRNA 5FWGA 3L9SA 2DIZA 5B6NA 2P31A 1XOAA 4NHWA 3ME7A 5ECSA 3BD2A 2LV3A 2AB6A 2GGTA 3IK7A 3FRCA 1ERTA 3NIVA 3W8JA 1O85A 1PKZA 1E2YA 3N5OA 2N5AA 2YV7A 1TI3A 5HR3A 4KB3A 2ZNMA 2XBIA 1V57A 1SD9A 3RHCA 1YDKA 2LRCA 1GSYA 3G9BA 3GH9A 5ECMB 4GLTA 3I6AA 2LTKA 2RM6A 5KEJA 2RIIA 4BVXA 5CRWA 2B7KA 16GSA 3ZIJA 3D4TA 1XWKA 4MH3A 2BJXA 3IOSA 4ZL9A 4ZXGA 3EWLA 1FAAA 2R4VA 2VD1A 4NWYA 4TR1A 4XIHA 8GSSA 3Q19A 2IMEA 3KIJA 3GL5A 3TGZA 3A2VA 5KN1A 9GSSA 2DJ0A 4J2FA 5ECKB 3FW2A 1KNGA 3VI5A 5DJLA 3GYKA 3IC4A 2VD0A 3P2AA 2GSRA 4WKWA 4ECIA 3TKSA 2AV4A 3GN3A 3F4RA 4AJ6A 1F3BA 1MD4A 3ZREA 2CAQA 3FZ5A 3IPZA 2V41A 1AUCA 4KCAA 3APSA 4TR1B 5IQYA 3L4NA 6GSYA 4N0VA 3CBUA 3GH6A 3ZYWA 5F0GA 2CVDA 3FZAA 4GCIA 3U6VA 1CQGA 1SYXA 3GKNA 3MAKA 2H0GA 3FY7A 4OFTA 4JEDA 2VM1A 1G0TA 1Z7PA 3GV1A 1A8LA 4KX4A 4PNFA 5A4VA 2B7JA 3LXZA 5DCHA 1TOFA 4DSRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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