4MBPA

Maltodextrin binding protein with bound maltetrose
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Extensive features of tight oligosaccharide binding revealed in high-resolution structures of the maltodextrin transport/chemosensory receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Periplasmic binding protein
molecule keywords MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN
total genus 128
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-08-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4mbpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4mbpA01
1SW1A 2UVIA 1EZ9A 1URGA 2YJPA 3OSRA 4G8HA 3KSXA 1RKMA 3JYRA 2O6AA 4G2ZA 1MPCA 1IQ7A 1A99A 1HSEA 1Y1MA 3SETA 3KFMA 3W15C 1EU8A 3DP6A 2DE4A 4BDQA 3H7MA 4F2QA 4N6PA 1M5CA 2ZYKA 4I62A 2P0SA 3R6UA 4IGTA 4ONYA 3ZS6A 1LB8A 1SVXB 5K2XA 2UVHA 2IEEA 5B7DA 1JETA 4TQUQ 2H4IA 2RINA 2ZNTA 2HZKA 2XXHA 2NOOA 1B4ZA 3K6WA 3O6HA 4JWXA 4QFNA 3MP1A 2I49A 1UTHA 2OZZA 1B5IA 2ABHA 2Z8FA 4RA1A 4DLDA 4ZECA 5TU0A 3QXMA 2DWIA 4WXJA 1B52A 4YKKA 5KDTB 3VVDA 1A7LA 1GGGA 4KCCA 4GD5A 4PQJA 3C35A 3BFUA 3GLBA 2XXVA 3KBRA 5JK4A 1I69A 3UORA 3HPIA 4BDOA 3RTWB 1D4NA 5I58B 1URSA 1XOCA 2XXTA 3OSQA 1MS7A 4JDFA 4LZ5A 4UACA 5B70A 1IITA 2M8CA 2OLBA 1SI0A 1M5EA 3QUJA 3ECRA 3EQ1A 1TFAA 3IOVA 2QJEA 3OENA 2DSFA 4KD5A 1FQCA 1QKBA 3C4MA 4M1VA 3WAFA 1MM6A 4DXCA 3V8XB 5L9OA 1XVYA 1DTGA 5H8NA 4O3CA 1I6BA 1MDQA 3U93A 3VLVA 5CC2A 2Q9TA 2W7YA 3H06B 4LATA 1ZLQA 3E3KA 2QMXA 4ZDMA 1M5FA 1Y3PA 3B7DA 2RC7A 1B32A 4FJPA 3TUSA 1URDA 4XXUA 1OIBA 2H25A 2Q2CA 3FXUA 3IB1A 4F3SA 1SW5A 1ZKBA 1LBCA 3T9HB 3HV1A 1PB9A 2HXWA 3CFZA 4JWYA 2E1SA 4EF1A 1P99A 1PDAA 3PUZE 1UTHB 2I6EA 1B3LA 4GL0A 5A5XA 5AA3A 5J1DA 5JEIA 1DOTA 2OWTA 2PT1A 2X7PA 2GHAA 2NUVA 3H4ZA 2YPNA 4R6HA 3PV0E 5EHMA 1FCKA 5EHSA 4P0IA 3S2VA 3C33A 4EF2A 4G8MA 1SBPA 3VLWA 1PB7A 5I57A 1JW4A 3QSLA 4KCDA 5ELVA 1MQHA 4X48A 3N26A 1MQGA 2Q2AA 2XD2A 3JZJA 4JB7A 1NNKA 3FV1A 4NF4B 4GFRA 1RYXA 1Y9UA 2QPQA 4ND9A 3D4GA 3MAMA 3PGFA 3G3GA 4R72A 5ICTA 1B7ZA 4MFIA 4XKQA 1GV8A 1O64A 4JSDA 3FVOA 5K2YA 1XC1A 4Q8RA 4NF5A 5TPAB 3SESA 2XXQA 3TTNA 2P2AA 4QFLA 1US4A 3D4CA 3KZGA 4U4XA 4KHZE 1LAFE 3FVKA 2GRVA 4F39A 4G68C 4FAJA 1LAGE 4KYSA 3TEPA 2GFEA 3LUYA 3OEMA 3PU5A 4FECA 3PPNA 4N07A 4WEPA 5I2NA 5KCJB 1MM7A 4JXIA 4YKPA 1S7YA 3IB0A 1PEBA 5AA2D 2I0BA 5H8HA 1GVCA 2ZYOA 4RY1A 2F7BA 2HAUA 1B7HA 4ESXA 4GWOA 4FORA 3V89B 4X9TA 3TCGA 3TZAA 1SW2A 1MXXA 2D5WA 2DVCA 1PBPA 2A5SA 4ELOA 2UYFA 4NMYA 2UYEA 3G3KA 3N5LA 2H99A 3O6IA 4NF4A 4ZEDA 3ZKKA 4ZZAA 1OVBA 1WODA 1ZIUA 1QUJA 1CE2A 2V3QA 3PPPA 1AH5A 1QUIA 2NWJA 4P0GA 1FTLA 3IO6A 1HSLA 2QS4A 2CMOA 2VP1A 4H5GA 4NF5B 1Y4TA 4HCWA 5TPAA 3CR9A 3CSGA 3MWBA 4G68A 5H8SA 3VVFA 1NKXA 1TFDA 3MBPA 1RYOA 4IO7A 3UP9A 4F2OA 2THIA 5I59A 3CIJA 1XS5A 3RPWA 4H1XA 1B6HA 4AQ4A 1B40A 4PE5B 2I58A 1UTBB 3PUXE 3E9XA 3HHFA 3HO7A 3P7IA 4NWCA 2ZYNA 5DVJA 4IGRA 3PPQA 2ZYMA 5I56B 5AE4A 3PD9A 3B6WA 2VD3A 3ONMA 1SQYA 4OYVA 1FW0A 2YLNA 4F18A 1VSOA 2FNCA 4PP0A 4G4PA 4DZ1A 3H6TA 4YU0A 1FQBA 2XXYA 3PUYE 5AA4B 3IAZA 5BUUA 4LQ2A 4H0WA 1WDNA 4FEDA 4ELRA 2F6GA 3CFXA 2XXIA 3Q27A 3RT8A 1N04A 1M5BA 3QYTA 4GIZA 3TMGA 2X26A 1Q1KA 3THIA 3UN6A 1MXVA 4JWOA 1ZTYA 4TLLB 4H67A 3U72A 4MLQA 3LR1A 4RYAA 1P1OA 4OQOA 3LBSA 4RJZA 4YMBA 5DVFA 4HS7A 5FHNA 2GH9A 1IIWA 3T96B 3OO7A 2HAVA 1D3KA 2QS1A 4QSEA 3TTKA 3S9LC 1NH7A 3T22A 4OHNA 4KI0E 1LBBA 3PPRA 5AA2B 1B4HA 1UTBA 3K0VA 3K4UA 3SEWA 2AYSA 3O28A 5KZTA 1JVXA 3SEVA 4GXSB 1QJMA 1WVJA 3C36A 4NEDA 4QSDA 1MH4A 4OESA 4FATA 1II5A 1N7WA 4IO2A 2XHDA 3U94A 1LFIA 4NF6A 3USDA 4BDNA 4FEBA 1LFGA 3K01A 5L9SA 3Q28A 4GQOA 3LC8A 1LSTA 1MQDA 1IEJA 4I1DA 2ZNUA 3KN8A 4YKJA 3FVNA 1NH8A 5I2KA 3GXAA 3TTRA 5I84A 5ISUA 4F3BA 3FGSA 3MW0A 4R75A 3RGYA 1PB8A 3KOTA 3QIMA 5IAIA 2DP8A 4F3GA 3PD8A 2V84A 3T93B 2O51A 4X1BA 3M3KA 3PUVE 4WKMA 2B65A 5ICQA 4R2BA 5ITOA 1O63A 4U21A 2PVUA 4KYEA 1FTMA 4GRKA 4MF3A 2OBGA 1O7TA 1ANFA 1MPDA 1XVXA 1SD3A 4ZEBA 1N3WA 2UVGA 4Z0IA 1R6ZA 5L9MA 3I6VA 4U1OA 4GLIA 4DXUA 5AA2A 3BBRA 5HPQA 4GVOA 4I8CA 2ESNA 4U4SA 2RCAA 2Y7IA 3OMBA 3CI8A 3TTLA 3OOAA 5EYFA 1LAHE 4X1DA 4YICA 3RY3A 1LCTA 3C34A 3DLNA 3FUZA 3PPOA 2BJJX 4Q30B 1A8FA 3N6TA 4KFQA 4MLVA 4RPNA 3A09A 3E13X 3TTMA 2CZLA 2Z8EA 4RXLA 1FQEA 3F11A 1T0KA 2O7IA 3E4RA 3B6TA 3DP8A 2P1SA 4QF9A 5F7VA 2DXYA 3CG1A 3FXRA 3QUFA 1OLCA 4PFWA 5CMKA 2AIXA 1MPBA 3FVGA 3O29A 3PMWA 1OVTA 4G8NA 3IOWA 4M4GA 4OMBA 3IB2A 4R6KA 3V83A 2F36A 2O1LA 4POXA 4EQBA 2ZNSA 1H43A 3KN3A 3MZ9A 5CMBA 2ONSA 3CG3A 1B9JA 3KSJA 1UIUA 3R7XA 4LP2B 3DP4A 3T9XB 1FQDA 1XT8A 3B6QA 3SEXA 1MXUA 3W9WA 3EHTA 1AOVA 4F31B 3K1PA 2A5TA 2XXWA 4LQ5A 1EZPA 4OENA 3ODBA 3BFTA 4OXVA 1MXWA 1LGBC 4NE4A 1JW1A 4H65A 1MXZA 2AL4A 2NVUB 4KR5A 2KLFA 4OFJA 4PFTA 1P1QA 3T9UA 4IO4A 3U92A 3G3FA 3Q25A 4GXAA 1B1XA 1ZJLA 2Y7RA 2H98A 4IO3A 4QSCA 2DS9A 4H8IA 2XXXA 2O68A 5DEXB 4QHQA 3FIRA 3VE1B 3RN8A 1DPEA 1JNFA 3CVGA 2DYXA 4Q5TA 1BKAA 3MVWA 2H9BA 1S50A 1ZU0A 2O7UA 2DWHA 1F9BA 1ZMGA 2R6GE 4OERA 4ZEKA 1A55A 4OEUA 4DCYA 2VHAA 2XXRA 4JSOA 2Q88A 1B5JA 4RPOA 3FXQA 4NF8B 2Z22A 3TCFA 3S9MC 4IO5A 1VE4A 3FD3A 2B3BA 5CI5A 3KJ7A 4IY6A 1FTJA 1MRPA 4KPTA 5DVIA 3SKPA 1BP5A 2QS3A 2VOZA 3K6XA 1VR5A 1LLSA 1OQGA 3VXBA 5H8NB 5M2VA 4U1ZA 5H8QA 4OEVA 3GBAA 1OLAA 3HHGA 4PFUA 2B3FA 3IJOB 4PFYA 3H3GA 3V5AA 4BDLA 5H8FA 5CM6A 1AIVA 4HW8A 1IXIA 1YPNA 2A5TB 5DT6A 1POY1 3EF7A 3IOTA 1KWHA 3G3HA 1A40A 3IX1A 3G3IA 1NNTA 3M8UA 3MZBA 4LZ8A 4PETA 2DWJA 1OMPA 1B3GA 3DM0A 3MP8A 4C1UA 4EUOA 4DCXA 4ESWA 3S4UA 5CBRA 5I58A 1JVYA 2F34A 1MY4A 2Y7WA 2I4CA 3I3VA 5CMMA 5IKBA 4UA8A 1B7UA 4POWA 1DTZA 1Q35A 2DQVA 4QFOA 4GL8A 3T66A 4F1YA 1R1NA 3VXCA 3PMVA 4LUBA 2V93A 1R9LA 3G3JA 3IR1A 3T9VA 2F5XA 2I3VA 3UK4A 3LSLA 4R9GA 2G93A 4NF8A 1POTA 3KN7A 1DSNA 4F22A 3MUQA 4R6YA 1MQIA 1MG1A 4HTGA 3K1MA 3K1NA 1M5DA 3TAJA 1IXGA 3AXFA 2ANJA 4U23A 5H8QB 5H8FB 5HM4B 1P1UA 1DMBA 1BLFA 1QVSA 2F7CA 4XKPA 5A5XB 2DE3A 2RC8A 4YB7A 2XX9A 2HFBA 1TXFA 4OFOA 4MH5A 4OZ9A 4FE8A 5I2NB 5ITPA 5DYHA 5KCJA 2Y7PA 1NMUA 3PUWE 4Z7EA 1FTKA 2Z23A 3H6UA 2DVZA 1OQHA 2XX7A 3L6GA 3RT6B 4F19A 3GZGA 4R2FA 5I57B 2R71A 3K6UA 2O69A 3I5OA 2HQ0A 1CB6A 2F78A 2UVJA 3EPEA 3O9PA 3HSTA 1AL3A 4OVJA 2XD3A 1B3EA 5JTYB 1B46A 1N3XA 1SYHA 2V3TA 4YB6A 2Q8JA 2XXPA 3UA8A 2F97A 2IA4A 4YMAA 3SDFA 3H03A 1HSJA 3LSXA 4MBPA 4OFLA 4E0WA 3OO8A 1NNPA 3N94A 1ELJA 4TOZA 3Q26A 1IUDA 3C31A 4ELQA 4R9FA 3MJNA 1TWYA 3IO4A 3C9HA 3QK6A 4P11A 3FASA 5AA1A 1Z7NE 3KJTA 1NL5A 3KEIA 1B1HA 3Q29A 4ECFA 3O6GA 3FJGA 3FATA 3ZSFA 1MY0A 1Y1ZA 4OWDA 3H6VA 1QULA 4WEDA 2V25A 3UGWA 3DELB 5CBSA 3SEYA 3N6UA 5H8HB 2ZXTA 3FV2A 3BKIB 3M3LA 2R9JA 3GBBA 3RTFB 4DDDA 3TCHA 4G77A 1L5TA 1A54A 2ZMBA 2DXRA 2HZLA 2OCUA 4U22A 3KOSA 3O2AA 5I56A 1NNFA 2REGA 3K02A 3MPKA 1PC3A 4THIA 1R9QA 2VD2A 4KYDA 3KGCA 2ONRA 5JTYA 1IXHA 3TFLA 4H8JA 5L8DA 1B58A 1SYIA 1UQWA 2G29A 2Y7KA 1SI1A 2D21A 4LONB 4QRZA 4ZZEA 1EH3A 3TELA 3TPAA 4XKRA 1S9TA 4E0XA 3VVEA 1LFHA 3JV9A 4IO6A 3U1OA 3RNNA 1USYE 3A3UA 3CRBA 4AB5A 2OK2A 3O97A 2I4BA 3MVYA 4G68B 4NTLA 5DTBA 2E0SA 5BWJA 3C32A 3TQWA 2NXOA 1H76A 1D9VA 3KG2A 4LA9A 4DE8A 5I59B 1H45A 1LB9A 1MQJA 5FTHA 2ONKE 4C1TA 2HCAA 4H5FA 4Q0CA 1J1NA 1LAXA 1NFTA 2QS2A 1P1WA 2Q89A 3HN0A 4FIMA 4F1UA 2PMSA 3O66A 5LOMA 3K2DA 3OO9A 3MVXA 3EHSA 3VDFA 1QUKA 4JBZA 4XKNA 2GHBA 4RNSA 3EHUA 1QKAA 1YTVA 2FA7A 3QAXA 4R74A 1TT1A 4RK2A 2V3UA 2QMWA 3OXNA 3LSWA 4ISUA 4EDPA 3OD7A 3SEUA 1H44A 3TODA 1FQFA 3FZVA 3MC2A 3K00A 4L17A 1IXCA 2FYIA 4YB5A 5F1QA 4RK9A 4QFPA 2RC9A 5CMCA 3U8QA 3S9NC 1DPPA 3M3FA 4I9DA 4XTCQ 2F35A 3IOUA 1YCJA 4GOTA 2PT2A 1N0TA 3OO6A 2F7AA 1Y20A 3VFJA 2HEUA 4F29A 5FTIA 4F3PA 4IB2A 1EZOA 3TKDA 4OETA 3TQLA 3TYHA 3IL1B 2QL3A 2RKMA 5I2KB 4EXLA 3OELA 4XIGQ 4GF8A 1VFDA 5AA4A 2D3IA 3MZ1A 1Y3NA 1MDP1 1PBQA 1A8EA 2QSXA 2REJA 3OEKA 3VV5A 1P1NA 3ILTB 4LZ7A 4BDMA 1MY3A 1N76A 1ATGA 1MY1A 4EXKA 3L6HA 2RF1A 4KQPA 3PMXA 4K3FA 5FHMA 3RLFE 4ELPA 3ZKLA 3H6WA 4BLAA 2H5YA 4YZZA 5TP9A 1Z7ME 3ILUB 4O3BA 2RCBA 2PBWA 3MPLA 3RQTA 4ZE9A 1MH3A 1UIVA 4OTEA 4ZS9A 2X7QA 2WKYA 1N7XA 2PYYA 4H6DA 1USYH 4QFKA 3A3CA 2OJTA 1XHYA 4NF6B 1MXYA 1US5A 4HCYA 3TDJA 3RUMA 1H3DA 4F1VA 2VGQA 3EN3A 1JW5A 2O84X 2F8DA 1GR2A 3SERA 1I6AA 3CSBA 1VFEA 3S9EA 1Y3QA 4ZE8A 1B3HA 4YAHX 3HCQA 4R73A 1BTJA 3CFLA 1B05A 2UXAA 3LSFB 3MVZA 1AMFA 1QW0A 1ZBMA 4ZEIA 4IY5A 2PX1A 5HBCA 4N13A 2AL5A 3W9VA 1B3FA 4NWDA 5CRYA 5FHOA 4TLMB 1D9YA 3FJ7A 3IK6B 3IORA 3MP6A 1GTKA 4O3AA 4BDRA 1B5HA 2LAOA 2I48A 4U2RA 1MY2A 2DE2A 2OWSA 1JEVA 3FJMA 4ZEFA 3UIFA 4EQ9A 1JQFA 2O1MA 1FTOA 5TP9B 1BIYA 1JEUA 1Y4CA 2I3WA 4DIGA 1IZ1A 1B51A 2DOJA 3K6VA 2F6PA 3VLUA 1N84A 1SDXA 5KDTA 1B0HA 1LCFA 3R26A 2ALUA 2Y84A 3MQ9A 4DXBA 4LVQA 3IJXB 2DWAA 2I0CA 1FQAA 4AB6A 2XX8A 2Z8DA 2XXUA 1B0LA 3G7WA 3WAEA 1YAEA 1SW4A 4YKIA 5DEXA 4EQ7A 1B2HA 1I6QA 2QRYA 4C0RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2UVIA 3OSRA 4PBHA 1RKMA 4N8YA 1Y1MA 2DE4A 2VPOA 4X04A 4BDQA 4F2QA 1M5CA 1LBWA 1SVXB 5K2XA 4PFRA 2UVHA 5B7DA 3O6HA 2HZKA 2XXHA 3K6WA 4JWXA 4QFNA 3MP1A 3QXMA 2DWIA 2WYPA 1B52A 3VVDA 4KCCA 1GGGA 4GD5A 4PQJA 3HPIA 3RTWB 5J16A 4JDFA 1SI0A 1AWBA 4KD5A 1FQCA 1QKBA 4M1VA 4DXCA 1FPDA 5L9OA 1DTGA 2Q9TA 2QMXA 1URDA 4XXUA 3IB1A 4F3SA 1SW5A 1ZKBA 1LBCA 3HV1A 1PB9A 2E1SA 5JEIA 5AA3A 3FBPA 1FCKA 3S2VA 5I57A 3UGWA 3N26A 1MQGA 4ND9A 1NNKA 3G3GA 3FVOA 1XC1A 3SESA 4P1LA 1LAFE 4F39A 2CEXA 4WEPA 4YKPA 4PDHA 2I0BA 4PCDA 4JVCA 2ZYOA 4FORA 3V89B 2DVCA 2UYFA 2UYEA 1FBFA 1OVBA 2V3QA 3PPPA 1HSLA 2QS4A 4H5GA 2VP1A 1Y4TA 3CR9A 3CSGA 3MBPA 1RYOA 3UP9A 1B6HA 4AQ4A 1B40A 3PUXE 3B50A 5FBPA 4PP0A 2CEYA 4FEDA 3CFXA 3RT8A 1N04A 4GIZA 1Q1KA 3THIA 4JWOA 3U72A 1LBYA 1P1OA 4OQOA 4HS7A 2XWIA 3OO7A 1D3KA 3S9LC 3T22A 4KI0E 1B4HA 3K0VA 3SEVA 3T0JA 1II5A 1LFIA 4MJOA 4H45A 4YKJA 5I84A 1FPJA 1PB8A 3KOTA 2V84A 3T93B 3KC0A 4R2BA 4U21A 1O7TA 1MPDA 4ZEBA 5L9MA 5HPQA 4GLIA 3FXBA 2ESNA 2RCAA 2Y7IA 4NF0A 5EYFA 4X1DA 4N17A 3C34A 3FUZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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