4MCKA

Crystal structure of family gh19, class iv chitinase from zea mays
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
201
structure length
201
Chain Sequence
XXXXXVVSDAFFNGIKNQAGSGCEGKNFYTRSAFLSAVNAYPGFAHGGTEVEGKREIAAFFAHVTHQTGHFCYISEINKSNAYCDASNRWPCAAGQKYYGRGPLQISWNYNYGPAGRDIGFNGLADPNRVAQDAVIAFKTALWFWMNNVHRLMPQGFGATIRAINGLECNGNNPAQMNARVGYYKQYCQQLRVDPGPNLTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitinase
publication title Crystallographic structure of ChitA, a glycoside hydrolase family 19, plant class IV chitinase from Zea mays.
pubmed doi rcsb
source organism Zea mays
total genus 70
structure length 201
sequence length 201
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4mckA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 4mckA02
4OWHA 1QDTA 2YBJA 1LJ3A 1JEFA 1B7MA 2BQJA 1UC0A 2I6ZA 3QE8A 4DWXA 4NSJA 1EQ4A 1TCYA 3CSRA 3WPLA 2DQHY 4ML7A 1GEVA 1GF7A 3TXDA 1OUIA 1ZMYL 2Z18A 1WQNA 2BQKA 1LSZA 3WW6A 3A6CY 4LYMA 1VAUA 1GFGA 1B5YA 1JIYA 4GCCA 1IOCA 1IWYA 3A6BY 4NGYA 3W6CA 1UCOA 1JTPL 5C6JA 2ZIKA 4QDNA 2BQOA 4DD9A 1LJKA 1IOTA 3WUAA 4NHIA 4NGVA 1E8LA 4I0CA 4OOTA 1GAZA 1XFPL 3G3BB 2MEGA 3B0KA 4YEOA 3EXDA 5KXPA 4M6DA 1LJNA 1CJ6A 1JWRA 4GN3A 1OUBA 4KXIA 1QUSA 1XGRC 2BLXA 4H9IA 2X0AA 4G4BA 1LSYA 2LZ2A 3WW5A 3A90A 2G4QA 4KT3A 1UICA 4XADA 1LYOA 3LYMA 1OUCA 1GAYA 5E4PA 2VB1A 1UIFA 4W96A 1QIOA 3G3AB 4WM3A 2FYCA 3W3EA 3AZ5A 3LN2A 1C7PA 5KXRA 1MELL 1HEMA 1HEQA 5B07A 2LYMA 2ZWBA 1BB6A 2BQCA 1YAQA 4TUNA 1GFEA 1UIGA 4H9BA 5AMYA 5F81A 1B5VA 1JKCA 3AW6A 4H8YA 4TTDA 3QNGA 4U3XB 4YEMA 5APFA 1IP6A 1GFAA 5ILFA 1NBYC 2CJLA 2NWDX 1WTMA 4C3WA 1VDSA 2CWIA 1V7TA 4UWUA 5LINA 5I54A 4XJGA 1GB5A 3TXIA 1I20A 1XGUC 2FBBA 1GBOA 1NKHA 2LZTA 4TX7A 2DQAA 4NY5A 4A7DA 1O23A 4DDAA 1GEZA 3WPJA 3M3UA 4ETCA 3F6ZA 4H94A 3IJUA 2I25L 1HFZA 4KPMA 4WM5A 4LT0A 4LYOA 1LJ4A 1RFPA 4NHQA 5APEA 1G7LC 5KXNA 3FE0A 3B6LA 3TXHA 4CFOA 1QDRA 3WU7A 1JPOA 1B5ZA 1LZ5A 4N1EI 1B2KA 1NQIA 1T6VL 1CKGA 3AW7A 1IR7A 1W6ZA 4DC4A 4GCBA 5L3HA 4GN5C 3RZ4A 5LA5A 1LHIA 1GF9A 1XEKA 1HNLA 1IP3A 1HERA 2YBNA 1LOZA 1FLWA 2MEDA 1LZDA 2ZNXY 2MEEA 1GPQC 4NSHA 3TMWA 4WO6A 4WLYA 3CT5A 3N9CA 1QUTA 1JISA 1ZVHL 4MCKA 1H87A 5FHWA 5LYTA 1ZV5L 3EMSA 3W6BA 1LHJA 2ZNWY 1BWIA 5DM9A 9LYZA 3AZ6A 3QY4A 4B0DA 1GFTA 1BB4A 1YANA 1IP2A 1B7LA 1BWJA 3LYTA 3MGWA 3RT5X 4GCFA 3VWOA 4C5FA 1GXXA 3A34A 4RW2A 1LSAA 4XJFA 5B1FA 1IY4A 1LZ6A 2HEAA 3J4GA 1GDXA 5D5FA 1B7RA 2Z2EA 4CHXA 4N8ZA 3EO5A 3W6EA 1AT5A 2BQGA 4UWVA 3TMXA 4DT3A 4DYGA 1Z55A 3A67Y 4H90A 2YBIA 4HTNA 1LSEA 1JITA 5K7OA 1NMMA 1IOQA 4AXTA 1REYA 1KXWA 1REMA 4Z46A 1ALCA 4NSGA 1J1PY 4H1PA 4BAFA 3AGHA 1TAYA 1KIRC 1GE1A 5KXOA 4WM6A 2MECA 3WUNA 1G7MC 3A92A 2MEHA 4II8A 5EBHA 3FI7A 1J1XY 1WVVA 3TMUA 4MR1A 3M18B 2F4GA 1HFYA 1XEIA 1CJ7A 2MEAA 4LZTA 1NBZC 5LVKA 3D9AC 4B4JA 1OUJA 1FDLY 1GFJA 2C8PA 1BQLY 1OUFA 1LJJA 1YKXX 3CT1A 1B7PA 4RLNA 3ZVQA 1IP4A 1D0KA 1IR8A 1LTMA 2Z39A 2Z38A 5HMJA 1C43A 4N0JA 1CKFA 1LYSA 2HEFA 1YQVY 1YROA 4NEBA 4BAPA 4CGEA 4WM1A 1DXJA 3CSQA 4HSFA 1LHKA 2IFFY 3A94A 4XN6A 4N5RA 1A2YC 1LZ9A 3TXBA 1VFBC 2H9KA 3CT0A 4DD0A 1D0LA 1EQEA 4EMNA 1LYZA 4H9CA 4PPOA 3W6FA 1AM7A 4B4EA 4RDSA 1AZFA 1LZGA 2BQAA 208LA 4H8XA 2LYZA 2BQHA 3N9AA 1JUGA 1D6PA 4XYYA 1GE0A 1LHHA 2H9JA 5F9XA 3D3DA 5HNCA 4NGOA 3A8ZA 4PHIA 5LVIA 5KY1A 3ZEKA 3HFMY 2G4PA 1NWGA 3KAMA 4HTKA 4TSCA 154LA 3HBEX 1HFXA 5A3EA 4DDBA 2BQBA 4YOPA 1BWHA 2G4NA 2ZIJA 1IX0A 5C6LA 2CDSA 3HBHA 1WQRA 1B7QA 1RJCB 1GF8A 4ZFPA 4J1BA 1HSWA 2BQMA 5B06A 4YF2A 1LZ8A 1GBXA 5L3IA 4MSTA 3ULRA 1JSFA 1SLYA 2HU1A 1IWXA 1WTNA 2FBDA 4BADA 5J7CA 1QQYA 5KJ9A 1PZYA 4O34A 5T3FA 4LYTA 1GBYA 3LZTA 4W94A 1LHMA 2ZQ3A 4LGKA 1LMOA 1GE4A 4H92A 1XSFA 1LSFA 3P64A 3WU8A 3WMKA 3WVYA 4DD2A 2YBMA 3GXKA 1NDGC 193LA 2HEEA 1FKQA 1ZVYB 4WMGA 1D9UA 1G7HC 1REXA 1GB6A 1RI8B 2Q0MX 4G9SA 5I53A 3RU5A 4H8ZA 5FSTA 4DDCA 1WQPA 1UBZA 1VDPA 4HPEA 4WL7A 4NG8A 1YKYX 3OJPA 3SP3A 1LMNA 1BB7A 4H9HA 133LA 2YDGA 3A95A 1HELA 3CQLA 3TXJA 3AZ7A 2BQNA 1IOSA 1LSBA 3WXUA 3OK0A 1GDWA 3AYQA 1IR9A 3WUMA 132LA 1LZBA 2YBHA 5LVGA 1DKJA 5KXKA 3WYHA 1I1ZA 4DD1A 1GWDA 4NFVA 1WVUA 4WM2A 5HQ1A 3AJNA 4XJDA 1LJGA 2ZYPA 2LHMA 1F6SA 5HNLA 1B0DA 1B7OA 5LAGA 5KXLA 3T36A 2ZQ4A 2BQLA 1DI5A 5LVJA 2HUBA 1LZYA 2PC2A 1LSDA 1UIDA 1LZEA 2IHLA 4NSIA 4WLXA 1FKVA 1KIQC 4LYZA 1JKDA 4OOOA 1BVKC 1UIHA 3B72A 1B7NA 4HJYA 1XGQC 1IWZA 4IATA 2DQGY 4Z41A 1CKCA 1BB3A 3CSZA 1GB0A 2EIZC 1YL0X 2Y8PA 4NGKA 4XJHA 4P2EA 3LYZA 4N9RA 4KL7A 1GE3A 1GFRA 1LPIA 1IP5A 1QTEA 5APCA 5IELA 4L41A 2FYDA 5F9UA 2W1MA 4HJVA 4OWEA 4ETAA 1OUHA 4XJIA 4DD7A 4WOAA 4LT1A 1FLUA 1GF6A 3P4ZA 1LMTA 4LT3A 4HTQA 4IJ4A 4AGAA 2F30A 1HMLA 1TBYA 2C8OA 4FDYA 135LA 5A3ZA 1LZSA 2F4AA 4LT2A 4NGLA 4BS7A 3HBDA 1FN5A 2EKSC 5KXXA 5M1YA 1LSGA 4HV1A 1TEWA 5LYZA 2Z2FA 4NGWA 4H93A 4WLDA 2BQFA 3WPKA 1CKHA 4LYCA 1B7SA 1PS5A 1LJEA 1LKRA 1JTTL 6LYZA 1IEEA 5LIOA 5FCPA 1C10A 4NHPA 5KKJA 1JTOL 2DQFC 4LFPA 2D6BA 2YBLA 1MLCE 4WG1A 3WXTA 3W6AA 6LYTA 4B4IA 1NHEA 1LKSA 2BQIA 1OP9B 4CFPA 5I5QA 4ET8A 1C08C 3AGIA 1JKBA 1HMKA 4G4CA 1IVMA 2BPUA 3T6UA 1UUZC 1V7SA 4TSBA 5KXYA 1BHZA 5KXZA 1LZRA 5ILCA 1RCMA 2ZYCA 1LZAA 4YM8A 1GB7A 4GLAA 4WO9A 1INUA 5DL9A 1LSMA 1IY3A 1JHLA 4J1AA 5F16A 4ZEEA 2WARA 5LVHA 1GB8A 1IC5Y 1AKIA 1LZTA 3A93A 4YENA 1KIPC 4NGZA 2Z37A 5F14A 4HPIA 2H5ZA 3WU9A 5FELA 1LMAA 1HSXA 1SQ2L 1J1OY 2LYOA 2N5ZA 1LZ1A 2MEFA 4XJBA 1LZ4A 1XEJA 1JSEA 2D4JA 3CB7A 2XJWA 4J7VA 7LYZA 3AGGG 5L9JA 1WQMA 4D9ZA 1BGIA 1OUAA 1C45A 1GBZA 3W6DA 3TXGA 3LYOA 1HEOA 1GF0A 3ATNA 1KXYA 3IWRA 3RNXA 1DQJC 5APDA 5LAFA 2BQDA 3TXKA 3WH1A 1VDQA 4B49A 4ETDA 1IWTA 4G4HA 1FLYA 4GCEA 1BB5A 1EQ5A 2BAAA 1B5XA 1LMQA 194LA 1GXV2 1RE2A 1EL1A 3RW8A 2BQEA 5HMVA 2HECA 1UA6Y 1DI4A 3ZVQB 2Z19A 2XBRA 1DZBX 5KXTA 4ETBA 1OQMA 4H9EA 5I4XA 2A7DA 4G49A 1LSCA 2DQCY 1UIAA 4PRUA 5HLLA 1YAPA 3WL2A 4GN4A 1CJ8A 1W08A 3A3QA 1IWVA 4OWAA 1HF4A 1VEDA 4NWEA 2D91A 3A3RX 4ANRA 5II3A 1C46A 1AT6A 2I26L 1HEPA 5KXMA 1FLQA 4LFXA 134LA 1IC4Y 4Z98A 4RW1A 2D4KA 3E3DA 1YILA 4WLTA 1WQQA 1LJFA 1IO5A 4GCDA 5KXSA 3GXRA 5I4YA 2W1XA 4NHSA 1IC7Y 1YIKA 4UWNA 1JJ3A 4H91A 2DKVA 5DN4A 4QEQA 2B5ZA 4RLMA 2AUBA 1LYYA 1LZCA 1YAOA 207LA 2HEBA 1JKAA 1H6MA 4HV2A 2GV0A 5E9RA 2F2NA 1DKKA 3P68A 1OUEA 1QTKA 5LA8A 2MEBA 2EQLA 1GE2A 3TMVA 1IIZA 1GF3A 4NHTA 1QSAA 1DI3A 1D6QA 4HP0A 153LA 1GB3A 1IWWA 1YL1X 2DQDY 1GF5A 4NIJA 3A96A 1NDMC 1BVXA 4XENA 3ATOA 1OUGA 1UACY 5DLAA 2Z12A 4WM4A 5IDDA 2DQJY 5B05A 3EBAB 3LZ2A 2RSCA 1GB2A 1LZNA 2CGIA 3P65A 5IHGA 5KXWA 1IP7A 1N4FA 2HTXA 3A91A 1CNSA 2D4IA 4FJRA 1GD6A 3N9EA 3AZ4A 5I4WA 1HENA 4PRQA 4E3UA 1G7IC 4H9AA 1UIBA 5B59A 1FBIX 4CJ2A 5B1GA 2EPEA 1LSNA 1GFKA 1REZA 4DD3A 5LXWA 4I8SA 1LMPA 1JJ0A 4NWHA 1I56A 1LJIA 1NF5A 1DPXA 1F10A 1GFVA 1D0MA 1HHLA 2BLYA 1HC0A 3WVXA 1GHLA 4PJ2C 1LAAA 1GB9A 2DQIY 2HU3A 2W1LA 2YSSC 1UIEA 1G7JC 1CJ9A 1XGTC 4IASA 2A7FA 1B5WA 1CKDA 1B9OA 1QSWA 3AB6A 1F0WA 4ETEA 3P66A 2MEIA 4QY9A 4N1CC 4X3BA 2W1YA 5DN5A 4GLVA 1GFHA 1B5UA 2XTHA 4OWBA 1LCNA 4OW1A 4PGJB 4H9FA 1GFUA 1IP1A 4NGJA 5FEKA 1IWUA 3TXFA 5FDJA 1IORA 5C6IA 4NGIA 4ET9A 1XGPC 8LYZA 2DBTA 2DQEY 1LMCA 3BKHA 1T3PA 2ZILA 3J6KA 4M4OA 1OUDA 4J0LA 1HEWA 3WULA 3K3TA 1KXXA 1DPWA 2XBSA 4NG1A 4WG7A 4QGZA 4EOFA 1GF4A 5JENB 5KKIA 5D5CA 1TDYA 1YKZX 4OWCA 3TXEA 2HEDA 3LHMA 4Z3MA 5LYMA 2YVBA 4WL6A 1LSPA 1WQOA 3IJVA 4LYBA 1LJHA 1LHLA 3BKVA 1P2CC 1F6RA 1GBWA 1YAMA 1A4VA 1VDTA 3B0IA 4R0FA 1VATA 4R6CA 4TWSA 1JJ1A 4B1AA 3B0OA 1GBSA 4ZIXA 4HJZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QE8A 2DQHY 4ML7A 1OUIA 3DNAA 1L06A 1LSZA 3WW6A 1B5YA 3C82A 1IWYA 1L34A 2ZIKA 2BQOA 1LJKA 5KXPA 1L73A 3OE8A 4E97A 3HH6A 1OUBA 1LYDA 1XGRC 1L03A 4H9IA 112LA 1LSYA 1T6HA 3WW5A 1UICA 3LYMA 1DYBA 1GAYA 1NHBA 3G3AB 1C7PA 5KXRA 1MELL 2RBSA 1HEMA 1L79A 4TUNA 2BQCA 5F81A 1B5VA 4YEMA 5APFA 1NBYC 1WTMA 1V7TA 183LA 3HT9A 1GBOA 1NKHA 2LZTA 4TX7A 2DQAA 4NY5A 2OU8A 3M3UA 3F6ZA 4H94A 182LA 3IJUA 245LA 1HFZA 4I7TA 4KPMA 4I7LA 4LT0A 4NHQA 1G7LC 3B6LA 1L26A 1B2KA 1NQIA 1T6VL 3AW7A 4DC4A 4GCBA 4GN5C 1L69A 1HERA 1LOZA 1L07A 111LA 1JISA 1H87A 1LHJA 228LA 5DM9A 9LYZA 3QY4A 4B0DA 1D3FA 1QTHA 1BB4A 3PDSA 3LYTA 3MGWA 150LA 1GXXA 2RBNA 1C68A 1LZ6A 1L80A 2HEAA 3J4GA 1L58A 2Z2EA 3HUAA 1L57A 3FADA 125LA 3SB9A 4HTNA 3A67Y 2YBIA 1LSEA 1JITA 1P46A 4AXTA 1KXWA 4Z46A 1J1PY 4H1PA 1KIRC 1GE1A 1L53A 1G7MC 4LDOA 2MEHA 3TMUA 4MR1A 3M18B 1HFYA 1XEIA 1CJ7A 176LA 1GFJA 4DQJA 3ZVQA 3CT1A 1B7PA 1IR8A 1C43A 4CGEA 2HEFA 1YROA 4WM1A 4HSFA 3A94A 1A2YC 3CT0A 4DD0A 3DMXA 1LGUA 1L32A 1LZGA 1LYHA 3N9AA 1L04A 1D6PA 1LHHA 2H9JA 170LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4OWH A;  1QDT A;  2YBJ A;  1LJ3 A;  1JEF A;  1B7M A;  2BQJ A;  1UC0 A;  2I6Z A;  3QE8 A;  4DWX A;  4NSJ A;  1EQ4 A;  1TCY A;  3CSR A;  3WPL A;  2DQH Y;  4ML7 A;  1GEV A;  1GF7 A;  3TXD A;  1OUI A;  1ZMY L;  2Z18 A;  1WQN A;  2BQK A;  1LSZ A;  3WW6 A;  3A6C Y;  4LYM A;  1VAU A;  1GFG A;  1B5Y A;  1JIY A;  4GCC A;  1IOC A;  1IWY A;  3A6B Y;  4NGY A;  3W6C A;  1UCO A;  1JTP L;  5C6J A;  2ZIK A;  4QDN A;  2BQO A;  4DD9 A;  1LJK A;  1IOT A;  3WUA A;  4NHI A;  4NGV A;  1E8L A;  4I0C A;  4OOT A;  1GAZ A;  1XFP L;  3G3B B;  2MEG A;  3B0K A;  4YEO A;  3EXD A;  5KXP A;  4M6D A;  1LJN A;  1CJ6 A;  1JWR A;  4GN3 A;  1OUB A;  4KXI A;  1QUS A;  1XGR C;  2BLX A;  4H9I A;  2X0A A;  4G4B A;  1LSY A;  2LZ2 A;  3WW5 A;  3A90 A;  2G4Q A;  4KT3 A;  1UIC A;  4XAD A;  1LYO A;  3LYM A;  1OUC A;  1GAY A;  5E4P A;  2VB1 A;  1UIF A;  4W96 A;  1QIO A;  3G3A B;  4WM3 A;  2FYC A;  3W3E A;  3AZ5 A;  3LN2 A;  1C7P A;  5KXR A;  1MEL L;  1HEM A;  1HEQ A;  5B07 A;  2LYM A;  2ZWB A;  1BB6 A;  2BQC A;  1YAQ A;  4TUN A;  1GFE A; 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 2HTX A;  3A91 A;  1CNS A;  2D4I A;  4FJR A;  1GD6 A;  3N9E A;  3AZ4 A;  5I4W A;  1HEN A;  4PRQ A;  4E3U A;  1G7I C;  4H9A A;  1UIB A;  5B59 A;  1FBI X;  4CJ2 A;  5B1G A;  2EPE A;  1LSN A;  1GFK A;  1REZ A;  4DD3 A;  5LXW A;  4I8S A;  1LMP A;  1JJ0 A;  4NWH A;  1I56 A;  1LJI A;  1NF5 A;  1DPX A;  1F10 A;  1GFV A;  1D0M A;  1HHL A;  2BLY A;  1HC0 A;  3WVX A;  1GHL A;  4PJ2 C;  1LAA A;  1GB9 A;  2DQI Y;  2HU3 A;  2W1L A;  2YSS C;  1UIE A;  1G7J C;  1CJ9 A;  1XGT C;  4IAS A;  2A7F A;  1B5W A;  1CKD A;  1B9O A;  1QSW A;  3AB6 A;  1F0W A;  4ETE A;  3P66 A;  2MEI A;  4QY9 A;  4N1C C;  4X3B A;  2W1Y A;  5DN5 A;  4GLV A;  1GFH A;  1B5U A;  2XTH A;  4OWB A;  1LCN A;  4OW1 A;  4PGJ B;  4H9F A;  1GFU A;  1IP1 A;  4NGJ A;  5FEK A;  1IWU A;  3TXF A;  5FDJ A;  1IOR A;  5C6I A;  4NGI A;  4ET9 A;  1XGP C;  8LYZ A;  2DBT A;  2DQE Y;  1LMC A;  3BKH A;  1T3P A;  2ZIL A;  3J6K A;  4M4O A;  1OUD A;  4J0L A;  1HEW A;  3WUL A;  3K3T A;  1KXX A;  1DPW A;  2XBS A;  4NG1 A;  4WG7 A;  4QGZ A;  4EOF A;  1GF4 A;  5JEN B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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