4MD7E

Crystal structure of full-length symmetric ck2 holoenzyme
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
332
structure length
332
Chain Sequence
SGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Active Form of the Protein Kinase CK2 alpha 2 beta 2 Holoenzyme Is a Strong Complex with Symmetric Architecture.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Casein kinase II subunit beta
total genus 110
structure length 332
sequence length 332
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4md7E01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4md7E02
2JFMA 4RWKA 3LKMA 2XB7A 2PMOX 3IG7A 2FVDA 4DTAA 4DBNA 4FIJA 4FV2A 2CLXA 2PWLA 3IDPA 5M07A 4F9AA 4IB0A 3GC9A 1U5RA 4GG5A 4KKHA 4EH9A 3QF9A 3O8UA 4EOLA 4LI5A 4QNAA 4GT4A 4QPSA 4IAZA 1XH9A 4U97A 4A9UA 4FC0A 4GV1A 3RZFA 4OTDA 4WOVA 4YSJA 3TUCA 5AV2A 1PXPA 3QGYA 3ZLWA 5CXHA 3FMJA 3IKAA 5AP7A 5FDXA 3C1XA 3R22A 5DH3A 4O7YA 1PJKA 5L3AA 3V04A 5EYCA 3L9LA 2XVDA 2J5FA 2X2KA 3GCPA 4K33A 4P4CA 2X0GA 4ZEGA 2RL5A 5K3YA 5TOZA 4UWCA 3VUGA 2QONA 2VWWA 2C1AA 1Z5MA 3FC1X 3MTFA 1W98A 3BV3A 5IA0A 4F7SA 4O38A 3MJ1A 5C26A 4G16A 1PXJA 4TYGA 3BE2A 3OD6X 4E73A 5HGIA 3A4OX 2C0TA 3UG1A 4MBJA 3EQGA 4XCUA 3WZJA 5J5TA 2BMCA 4I5MA 4ALVA 5CANA 2UV2A 3GB2A 4OTFA 5HVKA 2YM5A 1SVHA 3PVGA 4D1XA 1WAKA 4FV6A 2JDTA 5M4IA 5H8BA 4FGBA 2X4ZA 4L68A 3MY5A 3E7VA 5T68A 4ZZNA 4QMLA 5I5ZA 3QRTA 4EQUA 3MV5A 2CDZA 3F2AA 3Q2MA 3FY2A 2UUEA 4PP7A 4FK3A 2B55A 3EQPA 3D5VA 3RPOA 3ZUUA 4BI2A 4R8QA 4WUNA 2CJMA 2EU9A 5AX3A 2QU5A 3FZSA 3K5VA 2ZB0A 1UVRA 4FVRA 4C4GA 2XNNA 1FVVA 4JBOA 4CLJA 2OIQA 3FMLA 3CR0A 5AUWA 4DE4A 2O2UA 1YXXA 5CT0A 3TG1A 4OTGA 3MA6A 3L9NA 4C59A 1MUOA 3QZHA 1XH5A 2RFEA 4BCJA 2X9FA 3DPKA 3BBTB 4BI0A 2C6TA 3MFUA 2ZM4A 2Y9QA 4J95A 3NNUA 2PVJA 3A2CA 2HXQA 3KF4A 3R0TA 1OZ1A 5K9IA 5M09A 1PMUA 2WKMA 3GU7A 4USEA 2C6DA 4D2WA 4MXAA 1FGKA 4XLVA 4F65A 4DYMA 2VO0A 2ZV2A 3VULA 3EYHA 4BGHA 4FSWA 4MXZA 2RSVA 2XIRA 3P7BA 3EZRA 2BDWA 2YLFA 2R7BA 5EM5A 3MVHA 4E6AA 5KE0A 2RFSA 5IA4A 4GFOA 5E8XA 3LVPA 4XHKB 5EKOA 3SX9A 1OL6A 4Y95A 1PXKA 4CYIA 5I9XA 3Q52A 5JN2A 1W82A 4M84A 4DFXE 2FB8A 4E20A 5JFXA 2QNJA 4JJRA 5CU2A 2C3JA 3R1SA 3G15A 5EK7A 2B0QA 4N57A 3BU5A 4AAAA 1XBCA 1YHWA 4BCNA 4DH7A 2HAKA 3PXZA 4FTAA 4N0SA 4BCKA 2P3GX 4KBAA 3F3UA 1YXSA 3FLZA 3LJ2A 1R39A 2QR8A 3ORMA 4JBQA 3RM7A 2QO9A 2PMNX 3M1SA 3HUBA 1SNXA 2PVYA 3OCGA 3UOLA 4E1ZA 5IQBA 3N4VA 2WAJA 2QI8A 2C5XA 4LYNA 3DK6A 4ZTLA 3LJ0A 1Q61A 4UXLA 4GL9A 4PTEA 4A4LA 4FGRA 2E9VA 2GS7A 5HE2A 5F4NA 3SQQA 1FVTA 1UA2A 3EFWA 1UU9A 4JG8A 4I6HA 3R9NA 3VS1A 4XV1A 4C61A 5LWNA 4BTJA 1NW1A 1YHVA 3AOXA 3BI6A 3FL4A 3VUTA 2WMRA 4CQEA 4EKKA 3GFEA 2YIWA 1UNLA 4XP2A 5IQGA 2VN9A 4M67A 4R7IA 4P5ZA 5M56A 1KWPA 3OG7A 2B9HA 4ZTRA 3G9LX 4BGQA 2CNQA 3UYTA 5HCZA 4NW5A 5L6OA 2R3PA 3V8SA 2JLDA 3W2PA 2UW5A 3HZTA 3EH9A 4C2WA 2BRMA 4U43A 5FTOA 3FI8A 4FKOA 4KWPA 4XH6A 4PX6A 4YLLA 3LFAA 3R7OA 3UOJA 2BKZA 3HV3A 3R2YA 4PL4A 1M7NA 3ORXA 5HIDA 1PYEA 2XBJA 3NNXA 1XWSA 4WSQA 4DH3A 5JSMA 1FGIA 4BCHA 2UZWE 3B8QA 3H9OA 4JG6A 2I0YA 1ZOHA 2HY0A 2NP8A 2PVLA 3QX2A 2BAKA 2R2PA 3A99A 1KE5A 4IBMA 4EZ7A 3KRJA 4ANQA 2YJSA 3W18A 4GFMA 1H25A 4CTCA 5BVEA 1UU7A 2H9VA 4HGEA 4QPMA 5EYKA 3WF5A 5CTPA 4AN3A 3EN9A 4FV7A 1ZYJA 5A46A 2GNJA 3WF8A 5EM8A 4HNIA 4C4HA 3QWKA 3P78A 2A19B 2YABA 4OTHA 5F1ZA 3R1YA 4QMPA 4ANSA 3BV2A 3P5KA 3TJCA 2JITA 3FEGA 2OF4A 3PY3A 3GCVA 4BIDA 4CD0A 3QQHA 5KUPA 4FL2A 3FY0A 3H9FA 3MVLA 3MYGA 2XH5A 4I0RA 4RGJA 2QO2A 5AM7A 2YAKA 4I6BA 2XMYA 4L67A 4L53A 3QCXA 3HDMA 3EN7A 5JZJA 2HW7A 4YO4A 3EIDA 3KCKA 4FVQA 3BZ3A 5AUYA 4J7BA 2R3RA 2XYUA 4C02A 4MF1A 2ZM1A 4ANOA 4R7BA 2VWUA 4KAOA 3DNDA 3CSVA 4I20A 2VX1A 1BUHA 4TL0A 1UKIA 2A4LA 3IQ7A 5IQHA 3HRBA 3QRUA 1TKIA 4KNBA 2WZJA 3IONA 3MPAA 4HPUE 2FA2A 4UX9A 4ASDA 3F88A 4X0MA 4KRCA 4RFZA 4IH8A 5DNRA 3W33A 3PA3A 4G9CA 2PVMA 3DZOA 1K3AA 3P0MA 4WNOA 3VHEA 3SRVA 2YLEA 5KBQA 2HWOA 1OIUA 5I3OA 3DS6A 2GDOA 3D2KA 5CQUA 1GY3A 5EFQA 4ZJJA 4AWIA 4ZY4A 1ERKA 3HRCA 3PWDA 1YW2A 4W9XA 5CVFA 3W1FA 1LP4A 2CSNA 2GSFA 3G9NA 4RJ7A 4RX9A 4EH2A 5HD7A 3PUPA 3FJQE 3R73A 4QTCA 4D5HA 5DPVA 2FSLX 4V01A 4ZJVA 2V5QA 3RINA 1YI4A 2UW4A 5FXQA 4QQ5A 3DBQA 3E3PA 4JXFA 5CSHA 4W4YA 2FSMX 5LVPA 4DEIA 1BI8A 3UMXA 4EQMA 4UXQA 3Q53A 3F5PA 1P4OA 2O3PA 4O1PA 1JKKA 3RGFA 4FNXA 1Y8YA 3ODYX 2VTRA 2W9ZB 3D7TA 2C3IB 4JIKA 4LOOA 4MF0A 4USFA 3I6UA 5CSPA 3DKOA 3R00A 3LM5A 3QA8A 4MVFA 3BLRA 3FV8A 5KMKA 3FLQA 3OUKA 2PE0A 3ACJA 5BVWA 2ZV9A 1NA7A 3I7BA 2ITTA 4FZAB 4R5YA 5AIKA 5CVHA 4CV9A 2EXCX 4C3FA 3GU8A 4AT4A 5D41A 4AW5A 2OLCA 2Z7RA 4QMZA 4AF3A 2ZMCA 4O27B 2XUUA 4MTAA 4JQ8A 2BFXA 3LOKA 4BDCA 3COHA 3EQHA 5T6KA 1K9AA 2WQBA 4WSYA 3FMEA 4RLKA 4P90A 3TTIA 1Y57A 5FDPA 3DJ6A 3C13A 4RIYA 3BWFA 2WFYA 1G3NA 4BZDA 3FKNA 3QCQA 3ZO2A 3WF7A 4ZXTA 5A4EA 4U7ZA 4E8AA 2C6OA 4NKSA 4IAFA 4I5PA 4GVAA 2B9JA 5I9WA 4AP7A 1MRYA 4XYFA 2UZVA 3QFVA 4IAIA 2JIIA 3E8CA 2I40A 2J7TA 3SDJA 4IJPA 2WTKC 4MQ1A 3R9DA 4YURA 5L4QA 2VWBA 3E8DA 2JKMA 5IQDA 5C4LA 2ZVAA 3VRYA 4KB8A 2AC5A 3GQIA 4HZRA 2KTYA 4PUZA 2BIKB 4F64A 4O91A 3FI4A 5IUIA 2JGZA 2UZEA 2GHLA 5H9BA 2E9UA 4HGTA 5FXSA 3VO3A 4DEHA 4O7VA 2XYNA 3ORLA 4EC9A 4YPSA 1WVWA 5E8SA 3DTWA 2EWAA 4K1BA 4OTPA 3QHRA 5H2UA 3UIXA 1M2RA 3QAME 3PSDA 4YJUA 5L8LA 3ZLSA 3UDBA 2QOKA 4EH5A 1B6CB 2P0CA 4QQCA 3TJDA 4UWYA 3NYXA 1VR2A 4DINA 4L46A 4MWIA 3OY1A 5IEXA 3I4BA 4DA5A 1UV5A 1FBNA 5EDPA 4LOPA 4ZSLA 3R63A 5A14A 4FV5A 3KQ7A 4B9DA 5HG9A 2O8YA 4QMTA 1IA8A 4EH8A 4M3QA 3QD3A 3SV0A 4HVDA 3RHXA 4QT1A 3LQ8A 4RIXA 5AAFA 3A4PA 4D2RA 1KE6A 4DLIA 2E9NA 1MQ4A 4IW0A 4BKYA 5J7HA 4OTQA 1XHAA 3BKBA 1BYGA 5EW8A 2VAGA 3NIZA 4C58A 3PJ8A 4GU6A 4YJOA 3AMBA 2OXXA 4WG3A 3D4QA 5DGZA 3I1AA 3PFQA 4ZLYA 1Q8YA 2P2IA 3DTCA 2GQGA 4ASXA 1WBNA 4IHPA 4TWNA 3KULA 3DXPA 3B8RA 2ETKA 1OUYA 2W1FA 2QCSA 2VO6A 1YDTE 3BHVA 3MBLA 2WMWA 4ZSJA 3VNTA 1ZMWA 3PSCA 4YP8A 1GOLA 2V7OA 3DKCA 4D0WA 5E4HA 4DFNA 2ITNA 3QTQA 3OCTA 1KV1A 3Q9YA 2GNGA 2C30A 3KXZA 4QP1A 3AC1A 1MQBA 3V6RA 4K6ZA 2A27A 5H8GA 2CLQA 4UWBA 4J96A 4E6CA 4QTAA 2ITPA 5ETCA 3GXLA 1WBVA 5EHOA 3FDNA 3DV3A 2CGUA 2F49A 4TWPA 1IG1A 2IWIA 2W5BA 5JRSA 3L8VA 1ZAOA 4GSBA 4YC3A 2GHGA 3S2PA 3Q6WA 4BCIA 4Z3VA 5JKGA 3TNPC 5ACBC 3KCFA 1O6LA 1W7HA 4E26A 4NWMA 4XEYA 2HZ4A 2WQNA 5DEWA 4TTHB 4CZUA 3EZVA 4FSRA 1H08A 4JDHA 4IB1A 5HNIX 1HCKA 3QQKA 5DLSA 3TZMA 5KX8A 4EH4A 2VUWA 4FKIA 2QR7A 1QL6A 3BCEA 2C5VA 2ONLA 5EQYA 3DBDA 3UC4A 4F9YA 4LL5A 2XNMA 3CS9A 4O0VA 5AP5A 1NVSA 5JFVA 5IF1A 1OI9A 4XJ0A 4QP4A 4LQMA 2H34A 1V1KA 1ZYSA 4G3GA 4NSTA 2REIA 5TF9A 1GAGA 5EOBA 4GIHA 4FTOA 5DT3A 3NWWA 4EH3A 5AWMA 1BL7A 3LLAA 3GCSA 4CVAA 4WT6A 3WARA 4BWXA 4C33A 3UNZA 4DAWA 5IZFA 4FSNA 3DK3A 2B53A 2CN8A 2X4FA 3SC1A 3GUBA 5LMAA 3TV4A 1MRUA 1UWJA 5GIPE 3UO4A 3JUHA 2H8HA 1H26A 1XH4A 3E62A 4EHEA 3RAWA 1R0PA 4N6YA 2GQRA 4BICA 3RPSA 4A9RA 1ZLTA 4F99A 2EXMA 3REPA 2Q0NA 3SXRA 1QMZA 2VWVA 4BYJA 2HZIA 2GFSA 4RA5A 5C4KA 3R21A 4XRJA 2Z7LA 4OAVB 2ITYA 2PPQA 3OW3A 3QQJA 4MXOA 4U0IA 5AUUA 2YIXA 5CAOA 4S30A 3LFSA 2F57A 3FI2A 3MH0A 3PIYA 4ANLA 1JSTA 1QPCA 2HXLA 3I81A 2J0KA 5HVYA 3BLHA 4EQCA 3C4WA 4UMRA 3UPZA 4V0GB 4AN2A 5CEPA 2YCQA 5CSVA 3LQ5A 5J1VA 3NSZA 3NUNA 3OWKA 4KKGA 2NO3A 3SGCA 4NM7A 1OL5A 4JOAA 2ITXA 3F7WA 3VUDA 1WBPA 4BKJA 3E87A 4WO5A 1XQZA 3HECA 4GS6A 1GIIA 5HO8A 1OPKA 2XF0A 3U54A 1YWVA 4QMYA 5CI6A 2RKUA 4LV8A 4YNOA 4U40A 1FPUA 3PP0A 4M7IA 3TACA 3UMWA 5FEQA 3ZRMA 5ICPA 5TKDA 2VTOA 3LMIA 3L9PA 4YSMA 4C62A 4IB3A 4F6SA 2XJ1A 3ORKA 1VYZA 2W1HA 4WHZA 4ZTNA 1J1BA 2OGVA 3BELA 2J5EA 4NZWB 3R1NA 4J52A 4EOIA 5IA1A 2PMLX 4O7LA 4ZMFA 3F61A 2IZSA 3KREA 4FVPA 3MH1A 1GNGA 4CFXA 5GZAA 5FLFA 3HA8A 3T8OA 5C03A 3TKIA 3C0IA 1R3CA 1K2PA 3RTPA 4C57A 5K4JA 3OS3A 3QTWA 3DKGA 2F2UA 1H1QA 3KRXA 3P1AA 2A2AA 2OIBA 5KO1A 4FTUA 3ORPA 4QP2A 4X2NA 5JK3A 2WMXA 2P33A 2YM8A 3IOKA 4J98A 4RVKA 4ZZOA 2ZB1A 2ZV8A 4O81A 3AT4A 2GNLA 3NPCA 4FIFA 3C4CA 4DGNA 1JSUA 4YJPA 2ITZA 3ORNA 3Q2JA 4AQCA 2OKRA 4DTKA 2PUUA 4QMSA 2XBAA 3LAUA 5IDPA 2H6DA 5BVDA 4IE9A 3OTVA 5HNGA 2UW0A 3NGAA 2FSTX 4GEOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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