4MDLA

Meta carborane carbonic anhydrase inhibitor
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Carborane-based carbonic anhydrase inhibitors.
pubmed doi rcsb
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4mdlA00
1I90A 4KNIA 3FFPX 1IF6A 4QJPA 1CIMA 1CAMA 4N0XB 3DD8A 5EH7A 3TMJA 2CABA 4Q7WA 4QIZA 3T82A 4RH2A 4R59A 2POVA 3M3XA 1IF5A 3T85A 3TVNX 5CA2A 6CA2A 3DC9A 4TWLA 1T9NA 4QSJA 1EOUA 5FL6A 3S77B 4M2VA 5DSLA 5FNLA 3P4VA 5FLTA 4MO8A 1TBTX 1CVBA 3JXHC 3HFPA 1DMXA 3MNHA 5FNHA 5J8ZA 5E5UA 1CALA 4FVOA 5G01A 1CNBA 3F7UA 4YXUA 1KOQA 3S72B 4E3DA 3KLDB 2NXTA 4G0CA 2IT4A 4DZ7A 1RZBA 1CAJA 5BRWA 4MDLA 3DCWA 4YWPA 1LG6A 5CACA 5DSKA 1CVFA 3IBNA 3NB5A 1UGGA 4IWZA 3KS3A 1KWQA 3M96A 2ABEA 3P5LA 4M2WA 2FMZA 1CAHA 5DSIA 1ZNCA 1G0FA 3S71B 4XE1A 1IF7A 4YGNA 4YYTA 2CA2A 4ZX1A 1I91A 5DVXA 5FLQA 2NNSA 5JEHB 3MNIA 2HFWA 1RZCA 1ZFKA 2HD6A 3RYXB 1CNKA 4JSZA 4MDGA 1AVNA 5FDIA 4ZWZA 1H4NA 3F8EA 4Q83A 5EHVA 3V3GB 5JQTA 1CA3A 1BV3A 4QEFA 3V2MA 1LG5A 4HBAA 4M2RA 3RG4A 2EU3A 1CCTA 1V9IC 3MNKA 4CNWA 3V3FA 1DCBA 2WEOA 3MHLA 4MDMA 1LZVA 4Q87A 1BNWA 1Z93A 3MMFA 1TE3X 5FLSA 3HKQA 4Q8ZA 1I9NA 2H15A 4PQ7A 1CZMA 4K13A 5E5RA 5EH8A 5EOIA 4Q6DA 3MHIA 1HVAA 4Q0LA 2NWPA 4GL1X 4CACA 2VVBX 1RZDA 1FQRA 1H9NA 1I9QA 2W2JA 5HPJA 2EU2A 1ZGEA 1UGAA 7CA2A 4PXXA 4WR7A 3M67A 1CANA 5EH5A 5DSRA 3RZ5A 1FQNA 1HUHA 4E49A 1I9LA 4ILXA 4QTLA 3L14A 1BN3A 3S75B 4QSIA 1AZMA 3KONA 5E2KA 1TH9A 4FL7A 4ITPA 1IF9A 1XEVA 2FOSA 4KP8A 3IGPA 3S73B 5BNLA 5E2NA 1CCSA 1UGBA 5EZTX 3DA2A 3F7BA 4KUYA 4Q49A 2NN7A 2AX2A 3M14A 1V9EA 5SZ7A 2NXRA 3RZ0B 3R16A 3MNJA 2ILIA 5BRVA 3M1QA 1FLJA 5FNMA 1DMYA 1CVCA 1CINA 3BL1A 4Q7PA 4ZWIA 4L5VA 1TEUX 4XFWA 3IEOA 1G6VA 1FQMA 3TVOX 5SZ4A 2X7UA 1CNGA 1RZEA 2QP6A 1BCDA 5FL4A 4E4AA 5C8IA 2NNOA 4CNXA 3KOIA 1HEDA 4HEWA 3V5GA 3HS4A 3M5SA 5JESB 4BCWA 1HEAA 5SZ2A 4KAPA 4WW6A 5DSMA 1XQ0A 4RFCA 2WD2A 1BNNA 3DCCA 4K0SA 3V2JA 3RZ1B 5JG5B 3D92A 2X7SA 3T84A 3M1WA 3M2NA 5SZ0A 4HU1A 3BETA 5IPZA 3LXEA 4QK3A 4C3TA 5DSOA 4Q6EA 3U45X 3PJJA 4Q7VA 3DCSA 1CCUA 5EKJA 1JCZA 3P3JA 1BNMA 3FW3A 5JGSB 4TWMA 4XIXA 4Z0QA 4Z1JA 2NNVA 3DVBA 3U3AX 9CA2A 4L5UA 4QY3A 3MWOA 4YX4A 5JG3B 4HT0A 3S9TA 4QJMA 3S97A 4QJ0A 4QK2A 5AMLA 3M2YA 1CAIA 4E9OX 4FIKA 4WUQA 5SZ1A 5FDCA 3S76A 4YGFA 4RIVA 3RG3A 3D8WA 3CAJA 3KWAA 5G03A 3W6IA 4QK1A 3N2PA 4WUPA 2O4ZA 4ZWYA 2AW1A 1HEBA 3V3HB 4QSAA 4WW8A 3JXFA 2CBEA 1FQLA 3P55A 4K1QA 1TB0X 1CAKA 3DVCA 1MUAA 1TEQX 4RFDA 4HT2A 2VVAX 2F14A 4Q7SA 4ETQC 4PZHA 2WEHA 3M98A 1Z9YA 4HEZA 1G4OA 1HCAA 3U7CA 3ZNCA 4HF3A 4RUZA 3ML2A 4FPTA 3M04A 4KP5A 3B4FA 3M1JA 2QO8A 3MHMA 4Q06A 5G0BA 3HKNA 5FLRA 3IBIA 4G7AA 1CNHA 4KNMA 4QIYA 5JDVB 1OQ5A 5FNIA 4BF1A 4LHIA 12CAA 4UOVA 4YXOA 4YGJA 3S78B 1THKA 1YDCA 3RZ8A 3ML5A 3V3JA 4K0TA 1CAYA 1G4JA 3BL0A 2WD3A 4R5BA 1BN1A 3RYJB 3S8XA 4Y0JA 1YO0A 3T83A 1I8ZA 2GEHA 3OKVA 5SZ6A 2POUA 3EFIA 3DAZA 5JEGB 4Q90A 1I9PA 3MYQA 3PO6A 4Q08A 1XEGA 5CJFA 1UGCA 1G48A 3M1KA 1FSQA 4PYXA 3MNUA 1BN4A 1CRMA 1G0EA 4MLTA 1YDAA 4KUWA 4HEYA 4YHAA 3UYNA 1OKNA 4LU3A 4M2UA 1CVAA 1G53A 3MHCA 2POWA 1CAZA 4LP6A 2EZ7A 3V7XA 4DZ9A 3Q31A 3P44A 1G1DA 1F2WA 1AM6A 3GZ0A 4MTYA 5FNJA 3M2XA 3T5UA 1Y7WA 1UGDA 5DSPA 5EKMA 4ZAOA 5BYIA 1G52A 3D9ZA 1ZH9A 1OKLA 5FLOA 3KIGA 2HL4A 3ZP9A 4Q8YA 3FE4A 4JSWA 3HLJA 4Q09A 4XZ5A 4E5QA 1BNQA 3PYKA 1G45A 2FOUA 1CNWA 3M5TA 5DOGA 5L3OA 2Q1QA 4Z1EA 5FL5A 1BICA 1J9WA 1HUGA 1G3ZA 2H4NA 3DC3A 1JD0A 4KNJA 3N3JA 2QOAA 4JSSA 5FLPA 2FNMA 2CBAA 5FNGA 4E3HA 1FR4A 2FW4A 1G46A 3R17B 1ZSAA 3CA2A 5DRSA 4Q8XA 3K34A 3KKXA 1A42A 1CVEA 1G54A 4FU5A 3RZ7A 3OKUA 1BNUA 1I9OA 2FMGA 3MDZA 3SBIA 1ZFQA 4Z1KA 1JV0A 1CNXA 2HNCA 2OSFA 1CILA 5EHWA 1CNYA 1UGEA 4PYYA 4Q81A 3IAIA 3SAPA 3OILA 5G0CA 1URTA 3CYUA 3RGEA 3DBUA 4Q9YA 5EHEA 1DCAA 4QJOA 1RAZA 2HKKA 1FSRA 1OKMA 2NWOA 2CBCA 3OIKA 5A25A 1BNTA 3P58A 1MOOA 4YVYA 4FRCA 1UGFA 3JXGA 1CA2A 3M2ZA 1XPZA 1KWRA 3N0NA 4ITOA 3DD0A 1ZE8A 3KOKA 5JEPB 5DSJA 3IBLA 1YDBA 5JQ0A 3HKUA 2FNKA 1CNIA 4IDRX 2OSMA 2NN1A 4Q99A 3S74B 5SZ5A 1KOPA 2Q38A 4ZX0A 2ZNCA 1ZGFA 4BF6A 4YGKA 1CVDA 1BZMA 4Z1NA 3EFTA 5DOHA 4R5AA 5E2SA 2HOCA 4JS6A 1LUGA 2WEJA 3K2FA 4KV0A 5EKHA 1TTMA 5DSQA 3RLDA 4CA2A 3DVDA 4JSAA 3RYYA 1RAYA 2NWZA 2GD8A 1LGDA 2NNGA 2NXSA 5CLUA 3OY0A 4E3GA 1RJ5A 2FNNA 5L6KA 3MZCA 4RIUA 1HCBA 3D93A 1TG9A 4QJXA 5JGTB 4QSBA 4CQ0A 2X7TA 5E2RA 1KEQA 1Z97A 3QYKA 2Q1BA 1ZSBA 3RYVB 3P5AA 4RUXA 1HECA 3P3HA 5BRUA 1CNCA 4YGLA 5A6HA 4ZWXA 4Q78A 3C7PA 2CBDA 3OYQA 4E3FA 5FNKA 3VBDA 1RJ6A 2NMXA 5AMDA 4QJWA 4YXIA 4X5SA 3RJ7A 4CNRA 3MHOA 4FVNA 3K7KA 1CAOA 2FOVA 4K0ZA 4RUYA 5E28A 1YO2A 3U47A 3MNAA 1YDDA 1ZSCA 1CRAA 3D0NA 1I9MA 1FSNA 3NI5A 4XIWA 4CNVA 2WEGA 1YO1A 3UYQA 8CA2A 3N4BA 3IBUA 5AMGA 1H9QA 4N16A 3V3IB 1IF4A 4KNNA 3B1BA 4RN4A 4COQA 2FOQA 1RZAA 4WL4A 5E2MA 3DV7A 5SZ3A 2NWYA 5EIJA 2FOYA 5DSNA 2CBBA 3NJ9A 5LMDA 1CNJA 1FR7A 3CZVA 3KNEA 3RYZA 3M5EA 3W6HA 4MLXA 4L5WA 3SBHA 1BNVA 3T5ZA 3OYSA 3OIMA 4KUVA 4Q07A 1IF8A 1TG3A 3HKTA 3SAXA 1CVHA 3M40A 3F4XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1I90 A;  4KNI A;  3FFP X;  1IF6 A;  4QJP A;  1CIM A;  1CAM A;  4N0X B;  3DD8 A;  5EH7 A;  3TMJ A;  2CAB A;  4Q7W A;  4QIZ A;  3T82 A;  4RH2 A;  4R59 A;  2POV A;  3M3X A;  1IF5 A;  3T85 A;  3TVN X;  5CA2 A;  6CA2 A;  3DC9 A;  4TWL A;  1T9N A;  4QSJ A;  1EOU A;  5FL6 A;  3S77 B;  4M2V A;  5DSL A;  5FNL A;  3P4V A;  5FLT A;  4MO8 A;  1TBT X;  1CVB A;  3JXH C;  3HFP A;  1DMX A;  3MNH A;  5FNH A;  5J8Z A;  5E5U A;  1CAL A;  4FVO A;  5G01 A;  1CNB A;  3F7U A;  4YXU A;  1KOQ A;  3S72 B;  4E3D A;  3KLD B;  2NXT A;  4G0C A;  2IT4 A;  4DZ7 A;  1RZB A;  1CAJ A;  5BRW A;  4MDL A;  3DCW A;  4YWP A;  1LG6 A;  5CAC A;  5DSK A;  1CVF A;  3IBN A;  3NB5 A;  1UGG A;  4IWZ A;  3KS3 A;  1KWQ A;  3M96 A;  2ABE A;  3P5L A;  4M2W A;  2FMZ A;  1CAH A;  5DSI A;  1ZNC A;  1G0F A;  3S71 B;  4XE1 A;  1IF7 A;  4YGN A;  4YYT A;  2CA2 A;  4ZX1 A;  1I91 A;  5DVX A;  5FLQ A;  2NNS A;  5JEH B;  3MNI A;  2HFW A;  1RZC A;  1ZFK A;  2HD6 A;  3RYX B;  1CNK A;  4JSZ A;  4MDG A;  1AVN A;  5FDI A;  4ZWZ A;  1H4N A;  3F8E A;  4Q83 A; 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