4MEDA

Crystal structure of ser/thr kinase pim1 in complex with thioridazine derivatives
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
273
structure length
272
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of Ser/Thr kinase Pim1 in complex with thioridazine derivatives
rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase pim-1
total genus 77
structure length 272
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-08-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4medA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4medA01
4U7ZA 3VRZA 4U44A 4PF4A 4KAOA 4FNYA 5DYJA 2XNEA 4MXXA 2QOOA 5IA4A 4BI0A 3FDNA 4AACA 5IEVA 1VEBA 3QZIA 3HV4A 4EH8A 2X81A 3CSVA 5KKRC 3VF8A 3F3TA 5M09A 5JFWA 3U6HA 4QMMA 3QCYA 4YHFA 5HIEA 2C5OA 3COMA 4S34A 2YEXA 4IEBA 4FEQA 4S31A 3TM0A 4BIBA 1KE8A 5G1XA 5L2WA 5LWMA 4FKRA 1J7IA 2B53A 4FKPA 3VNTA 3R8UA 3RWPA 4Q5HA 2OK1A 2QHMA 4HGTA 4C3FA 1SYKA 4CV8A 4HVHA 3AMBA 3IKAA 2W05A 3FMMA 1XJDA 3FHIA 3QKMA 2ZAZA 5DR2A 3ORTA 3DAEA 2YACA 4I0RA 5CEPA 3LLAA 3EZRA 2JLDA 2ZM4A 3RNIA 4C62A 1YHSA 4ZTQA 2BAJA 1XH8A 3KXMA 4X2NA 4AOTA 3QF9A 5GJFA 3AC2A 3G33A 3RALA 4CFXA 4BCHA 3PJCA 2PUIA 4CVAA 3IOKA 3LKMA 4CLIA 3QGYA 1SZMA 2NP8A 2OJJA 1BLXA 5D7AA 1H4LA 3BGPA 3UC3A 1Q97A 3QWJA 4DF3A 1CKIA 2I40A 3ULZA 3QUDA 3K54A 2OO8X 2DUVA 3SA0A 4F0FA 3IW8A 1YW2A 2A0CX 3Q32A 5HE3A 3TIZA 3KK8A 2W4KA 3ITZA 1RDQE 3G6GA 3NUXA 5EW8A 2GS6A 4EH2A 5GZAA 4QYGA 1P4FA 2RKUA 4XG6A 3ZH8A 3DKGA 1YHWA 2YM3A 4WUNA 4KKHA 3S2PA 3ZFMA 4DYMA 5ANDA 1Z57A 1U5QA 4I93A 3CGOA 4KNBA 4BDCA 2ITWA 2AYPA 4DFUA 1E9HA 1YWNA 4YP8A 1ATPE 3ZU7A 4JL9A 2HXQA 3UDBA 3SRVA 3VBXA 3DY7A 3F7WA 4U6RA 4JLCA 2WMTA 2QOFA 5CAVA 2HZ4A 3SHEA 1M52A 3AG9A 2Y7JA 4OBPA 5FBOA 2Y4IC 3ZM9A 3TDVA 3II5A 4O96A 4YC8A 3BHVA 3D5VA 1F5QA 4WNKA 5F20A 3RZBA 5IA3A 4K18A 2OW3A 2PZPA 3FY2A 4GG5A 5AAGA 3LM0A 1Q8UA 2B54A 2ZV9A 3VF9A 4ACMA 4DG0E 3C4XA 2PVMA 1VYZA 4QYEA 4RRVA 3ZLXA 4AE9A 4U3YA 2R4BA 3LAUA 2PZYA 5KMKA 2VX0A 4EZ3A 4CZUA 4PPBA 5EI2A 5AV2A 1W0XC 3RHXA 4D5HA 5DPVA 3DB6A 5CANA 5L2QA 5AAEA 2JKMA 4M66A 2QOCA 3W33A 4B99A 3VHEA 3U87A 4IDTA 4DGMA 4HW7A 2UVYA 2X0GA 4ZTNA 4XLIA 3C7QA 5E90A 3UOHA 1BI8A 3GU8A 2CGWA 3NNVA 2BZJA 4LUDA 3FYJX 4ZS0A 1XHAA 4O81A 5B2KA 3NRMA 4LMUA 4WBOA 4EI4A 4JIKA 3ACJA 3BWJA 1BKXA 1ZRZA 3REPA 4QQCA 3EYGA 5I9ZA 3I6WA 4EOSA 4HPUE 3LHJA 3TNQB 1GIHA 4WNMA 4IB5A 5AR7A 3R7UA 4E73A 2IW9A 3P7BA 3DLZA 3JVSA 2WMUA 2XEYA 3QL8A 4DEGA 2CKEA 4F65A 5HX6A 2GNIA 5L6OA 4EZ7A 3DB8A 3NWWA 3F3VA 3UVPA 3TDWA 4FTTA 4IACA 3OOMA 3MFUA 4DG2E 2C6TA 4UMUA 3U6IA 4EK4A 2EB3A 3QRIA 4AGCA 1FBNA 3GC7A 2PVHA 2PWLA 2WTKC 3R63A 4UYNA 4FSRA 4FTCA 4IAZA 3QUPA 5CU3A 5ICPA 1PMNA 3QD0A 4L68A 3BHYA 4FL1A 3UODA 3UNZA 1OUKA 2YHVA 2BUJA 4ZTMA 2IPXA 3SXSA 4JBPA 4IBMA 1BUHA 4LV8A 4TTHB 3IONA 3PP1A 3NVMB 1NVRA 4DFYA 2BDJA 2R3RA 3EQDA 3TXOA 4EUUA 2ITQA 3GCPA 3ORMA 1PMVA 2B52A 3CY3A 3DS6A 1A06A 3U4WA 4XRJA 1GJOA 2F9GA 3ZZEA 4ZLOA 2UZVA 3WZUA 3WYYA 2BRNA 4IAAA 5CWZA 5CF5A 1NT2A 3ANRA 5EHYA 4D2VA 4G3FA 4LGDA 4HGLA 1OUYA 3CTQA 1QPJA 5TKDA 2VO7A 5D9HA 3SV0A 3OTVA 1DM2A 2R3GA 4C36A 4HYHA 4FV4A 3R83A 1P14A 3M1SA 4GU9A 4I92A 3ZO3A 4TL0A 2CCHA 3WBLA 3HMOA 4I22A 4XNEA 4QMLA 4OGRA 4ARKA 2QC6A 4PTEA 3V5PA 5HO8A 4E5AX 3DNEA 3FXWA 3OC1A 3LLTA 1YXSA 2JKKA 2RFDA 3UPXA 5CXZA 2PHKA 4F0GA 3HLLA 3OTUA 2XRWA 4LOPA 3K2LA 3P78A 4IM3A 1W98A 4S2ZA 4A9TA 3C0GA 4BDDA 3P0MA 4GS6A 4L8MA 2R0UA 4O7NA 1FGKA 4IZAA 4J96A 2UW6A 2UZEA 4NU1A 4EQMA 5CEQA 3TZMA 2XJ1A 5CSXA 4ANMA 2CN8A 2JDOA 4AW1A 4BDHA 4ZSGA 2R3QA 3MBLA 3R04A 4LOQA 4YJVA 3UMXA 3V8TA 1AD5A 4LUEA 1BMKA 4C02A 5E8YA 3B8QA 4QMTA 2VN9A 5DE2A 5H8EA 3UG2A 3HMNA 3OWPA 3RTPA 1JQHA 4IVAA 4DFXE 2VGOA 3O8UA 4QMZA 3B2TA 4A9YA 3MS9A 4TKSA 4HVSA 1S9IA 2OZAB 1PXPA 2YA9A 2YJRA 4IQ6A 4E93A 4IE9A 2JFMA 3V04A 5GZ8A 4KBAA 3UG1A 5KMLA 3VQUA 4LM5A 4F7LA 3E92A 2BR1A 2PE1A 2X2KA 2WB8A 4O7ZA 4PMMA 2I0HA 3ZSIA 4IB1A 1K9AA 2XEZA 3VS2A 3ZBFA 1H26A 4D2RA 4M68A 3FKLA 4QOXA 1SVEA 5E91A 4C33A 2IZUA 3C1XA 2BZHB 3DKFA 4KKGA 5FEDA 4ORKA 4GU6A 4AT4A 2XCHA 1P4OA 3OEZA 3NNUA 4O21A 3P4KA 4YU2A 2GNFA 3QX4A 1H07A 5DWRA 4UZHA 3TZ7A 2Y9QA 4D1ZA 4FEXA 4D5KA 4O2ZA 3HKOA 4WG5A 5IA2A 5EI8A 4Z55A 1B6CB 4IAIA 2WTCA 4BYIA 3IDPA 4G6LA 4FA2A 5FG8A 3I7CA 3P79A 4NKSA 4EL9A 5HE1A 3ZS5A 4KIKA 3HECA 3AT2A 1HCLA 2YCQA 3KCFA 3R7VA 4FEUA 3BV2A 4UXQA 3OY1A 5EHOA 3POOA 4W9XA 3S0OA 1DS5A 2UUEA 2UW8A 1ZOHA 4L52A 3NPCA 4EH6A 1WBSA 5EYDA 5T68A 4G6OA 3SXRA 5KZ0A 1B38A 2XNGA 3ZXZA 1XH4A 3RKBA 3GBZA 4I6QA 4FTUA 4O22A 5EW3A 5HHWA 1ZMVA 4F0IA 2Z02A 3CBLA 4ZJJA 5EKNA 2VZ6A 2OZAA 2QLQA 3NX8A 3VS4A 4D4SA 3ORZA 4F9AA 2W4JA 3PJ1A 4JG6A 3AC3A 4XP0A 4EQCA 1DAYA 2JC6A 5T3QA 1GZKA 4X6QC 4O27B 5ITAA 3U55A 5KZIA 4DBNA 4FG7A 4XG2A 1OKVA 1YOMA 5HCYA 5LMAA 3VUMA 5IQGA 4PY1A 3NYNA 3EQBA 3VQHA 5LQFA 3F6XA 3QC4A 5ANJA 3RVGA 1PHKA 1ZXEA 3F9NA 4MKCA 2O65A 3IOPA 4XX9A 3PA5A 4DBXA 4GFOA 4X7QA 1PMUA 3BBTB 4JDHA 2Y0AA 5GNKA 2J51A 1URCA 1OECA 3DBFA 4QYYA 2YJSA 4WIHA 4GT4A 2VU3A 2YM4A 2VWBA 2C3JA 5H8GA 2XK6A 3OXIA 1ZYJA 2W1DA 2ITZA 4GKHA 2ITNA 4O83A 1SVGA 1FMOE 2YDKA 5E8UA 1FMKA 1PXMA 4DTAA 1KWPA 4U43A 3TV4A 4EH4A 3LJ0A 3CC6A 3GNIB 3LMIA 3CJGA 5I9UA 4CFUA 1AQ1A 1DAWA 1CM8A 3I5ZA 5IF1A 3F5PA 1ND4A 2PUPA 4E4NA 3HMMA 2FSTX 2GHLA 2WQNA 3KF7A 4IXPA 5EK7A 4CT1A 2GQSA 2G2IA 3BYMA 4IAKA 4RQKA 3N4VA 4YLKA 3OCBA 4ZY4A 2Z60A 4MBJA 3KFAA 2J0IA 2XP2A 3A7JA 3TJCA 3W2QA 4W4WA 5CVFA 3TEIA 3HZTA 4G3EA 3HGKA 3ZRKA 2VWUA 3D2KA 4D9UA 3KMMA 3N4TA 5KX8A 1OI9A 5HTBA 3PIZA 4TWOA 2G15A 5J5SA 3QAME 3DKCA 3R7YA 5JKGA 3MA3A 4O7WA 4MNFA 4FZ7A 3TNWA 4M69B 4O1OA 3MJ2A 2PMOX 2HAKA 1UKHA 3H9OA 2X8IA 3QRUA 4I5CA 4BWPA 4IHPA 5CAUA 2QKWB 4CG9A 1YOJA 4IB0A 4LQMA 4PNIA 1KOAA 4RLLA 2XS0A 4FSZA 4IFCA 5AIRA 4PDSA 2A1AB 1BL6A 3VUKA 4AGWA 4EH5A 3LJ1A 3OZ6A 2ACXA 2ZMDA 4TXCA 2IVVA 3JUHA 4S33A 1STCE 2GU8A 3FMLA 5BYYA 2W17A 2NNWB 2XCKA 4M12A 4IC8A 3IQ7A 4L6QA 4TNDA 2J50A 1ZYCA 3E62A 1ZY5A 2P0CA 2XYNA 3HP5A 2IWIA 3ENMA 4JDIA 4BHZA 4EOQA 4FV9A 4CXAA 1R78A 2NRUA 4ZSEA 4HCTA 4D1XA 3PSCA 2VTNA 3ZBXA 4MD9E 4AA4A 1GZOA 2WAJA 2RF9A 4ZLZA 4YJSA 3Q52A 5FP6A 3E3PA 5J5TA 4NYEA 4N0SA 3I4BA 2OKRA 4YTHA 4GUBA 5CALA 2VWXA 5I9YA 1WBWA 3DBQA 5ANKA 5IISA 3NMUF 2PULA 5HBEA 4RZVA 4C0TA 4AF3A 4WG4A 2HY0A 4MQ1A 4UEUA 3ZUTA 4M69A 3WE8A 4QTCA 3LXLA 1RQQA 2W1ZA 2E9UA 5TO8A 2ERKA 3DQXA 3BU5A 5CEKA 3EN7A 3FWQA 4HZSA 3PXRA 1NY3A 4UV0A 4ZTHA 1LUFA 4O0SA 4DTBA 3BE2A 5CQUA 4UBAA 3HMIA 3FI3A 4HCVA 3FJQE 4FOBA 5EG3A 4BCFA 4FIHA 4LRJA 4DH5A 3LXKA 4OBQA 4RC4A 3I0QA 1YXTA 3OMVA 4NJ3A 4ZTLA 5IUIA 4BTJA 3HAMA 3C4WA 4UY9A 4EYMA 3SGCA 2CN5A 2EVAA 2F2CB 5CQWA 2FYSA 3JVRA 1UNHA 3OHTA 3TKUA 5M44A 5E1SA 4RWLA 4EOIA 4FKIA 4UMQA 5DT4A 5EYKA 3VUIA 4CMOA 5GINE 4AA5A 1R1WA 3NNXA 4MH7A 2PK9A 4Q5EA 2VTAA 1H28A 5A4QA 3GXLA 2PZRA 4WRGA 4AP7A 3DXQA 2W1HA 4ASEA 4JRVA 5E8VA 5FWKK 3UOJA 3G9NA 3IPHA 2I7QA 4U42A 3EB0A 4BCOA 4GL9A 3D5XA 1WMKA 1PYEA 2RIOA 5ETAA 5AUWA 2E9NA 2GFCA 3FMKA 3AC8A 3D4QA 3WIKA 4WD5A 5IH5A 3MW1A 4IADA 2ITVA 2X1NA 2R3PA 4GFMA 2F7XE 4BCIA 4BL1A 4FK3A 3PVUA 4ZJIA 3HRFA 3RPSA 5AX3A 3ZEWA 5FTOA 3ROCA 3V51A 4MTAA 4IWQA 3QC9A 3MPTA 3ZCLA 3ZFXA 5AMNA 3BLHA 4JX7A 2ETMA 5J9YA 2UZTA 2C3IB 4J99A 3V6SA 1Y91A 3ZLYA 4H3BA 1TQMA 1OL5A 4ZZNA 5BVFA 1UU9A 3MSSA 1FINA 4RBLA 4EC8A 4NUSA 2VTHA 2C1AA 2W5AA 4IC7A 4DGNA 3GU5A 5A3XA 2PVYA 5AUXA 3PYYA 4Y72A 1BI7A 2ONLA 4L9IA 2W9FB 4YMJA 5CF4A 5IG1A 5J9ZA 2P4IA 3TTIA 3CQWA 3EN9A 3QLGA 3I5NA 2C6IA 4FK6A 5J9LA 5E8TA 4CQGA 4J95A 3FZOA 4FIFA 5BVOA 3AT4A 4W9WA 2VV9A 3DZQA 5AP6A 4MHAA 3GB2A 4QP2A 2QU6A 4G2FA 4TNBA 2XF0A 3ZZWA 3A61A 4OR5A 3ZOSA 2J0MB 3M2WA 3OVVA 2JAVA 4XV9A 2UW4A 2YIWA 3L8VA 3MVMA 3QQUA 2PMNX 3BWFA 5FDXA 4QTEA 3ORKA 3E8EA 4QNAA 2X8DA 4BIDA 5HU9A 4CRLA 3F7ZA 4IZ7A 3RBWA 3UO5A 4WUAA 3VBQA 3O50A 2GS7A 1KSWA 3R8ZA 5JH6A 3EQCA 3MDYA 5CEIA 2I0EA 2XKEA 3VS0A 3SOCA 2BPMA 1J91A 1KV2A 2FGIA 2ZM3A 3JXWA 4E6AA 1MP8A 3O7LB 3M42A 2FO0A 1XKKA 1OM1A 3ZHPC 5A6OA 3QQGA 1OB3A 4JG7A 2E9PA 1Q3DA 2V5QA 1WBOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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