4MJBA

Synechocystis sp. pcc 6803 glutaredoxin a-a79s
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
99
structure length
99
Chain Sequence
MRGSHHHHHHGSAVSAKIEIYTWSTCPFCMRALALLKRKGVEFQEYCIDGDNEAREAMAARANGKRSLPQIFIDDQHIGGCDDIYALDGSGKLDPLLHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Utility of Synechocystis sp. PCC 6803 glutaredoxin A as a platform to study high-resolution mutagenesis of proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable glutaredoxin ssr2061
source organism Synechocystis sp.
molecule tags Electron transport
total genus 30
structure length 99
sequence length 99
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mjbA01
2MYGA 2QC7A 3KH9A 5DAKA 3UMAA 3Q74A 3L0HA 2LNSA 5D9VA 1QQ2A 5LNKe 2CX4A 2RUEA 1EV4A 2HZEB 4NAXA 4JE1A 4YAPA 2LRNA 3EURA 2IN3A 3D5JA 2R6KA 3QCPA 2CZ2A 2BMXA 2LTKA 3ZZXA 3IA1A 11GSA 1OAZA 1U3AA 3VPQA 2I1UA 5DJLA 2L4CA 1X0RA 2JZRA 4RI6A 1C72A 4EC0A 1TKDB 1BEDA 1XWCA 1TK8B 2HRFA 1JZDA 3TJKA 4MF5A 1WP0A 4I8BA 3ZFBA 3DWVA 1MD3A 3P90A 1OC3A 3VK9A 4BVYA 1Q4JA 2F8AA 1XOAA 4BVXA 4FH8A 4P3YB 1EP8A 3UARA 5D9TA 3IV4A 1GUKA 1BJXA 2GZYA 5CAXA 3KP9A 1DE1A 7GSSA 3U5RE 5G5FA 3GL3A 3CRTA 3HVSA 2X8CA 3EVIA 1YEPA 5H5RA 5EVOA 5J9BA 4L5LA 3QFAC 2CVBA 1ZOFA 2HT9A 1LJRA 1DE2A 3TOTA 3F9UA 3HKRA 5G31A 1YKCA 4POLA 2FD3A 4XRAA 3FHKA 4KB3A 1X9MB 1SJIA 4NXIA 1YY7A 5AGYA 2OE3A 2QKEA 1ACVA 1DSBA 2LQOA 1M99A 4LL4B 5GZZB 2DIZA 3UEMA 3TRPA 5F06A 1I9DA 4TR0A 3UAPA 4GF0A 1AQXA 1FG4A 2LKUA 4GSTA 5HR0A 1K3OA 2AJQB 1XZOA 5CRDA 1K0CA 4L5OA 1TI3A 5DBQA 5GSTA 1MTCA 2YNXA 4ZL9A 4K7OA 3CSJA 1B4QA 4LMWA 2H76A 5DVBA 1FAAA 14GSA 1X9WB 1MEKA 4L8EA 4KCAA 5J41A 2OJLA 5IPGA 3G7JA 5ECKB 2B7JA 2IJYA 3BOAA 1B8XA 2K9FA 1GSFA 1XBSA 4KNDA 2J23A 2ZCTA 4YQVA 3GKNA 5A4UA 2M72A 3L9SA 5G1KA 4IELA 3UVHA 2WGRA 3IK9A 2F51A 3APSA 2ON7A 5IPHA 3GX8A 2MBTA 4ZL7A 5GSSA 2YWOA 2NVLA 4GRFA 3KMOA 1WRYA 2WFCA 4KX4A 1ERTA 1Z5YE 4TR1B 2GSTA 4XS1A 3W8SA 2HSYA 4AGSA 5LD0A 2DMLA 2H75A 5KN0A 2FCHA 2GVPA 1TRSA 2PN8A 3M3MA 5EL8A 5IO2A 1ML6A 3KTLA 5H5QA 2HXKA 5DQSA 3C71A 1XWBA 4GWRA 3GX0A 4BWQA 4X0XA 4F2IA 1YF0A 2IFQA 4ECBA 3RBTA 3PGTA 1V58A 2H72A 3IDVA 4PUFC 1PKWA 3I9V2 2GZPA 3IK7A 1XOBA 2F8FA 5INYA 1V40A 1MD4A 5DALA 4WF4A 2PVOC 1V57A 4V1Ag 5IMVA 2AUVA 2DJ1A 4XS6A 3GFKA 5FT3A 3HVVA 5FWGA 3WGEA 4NMUA 3O76A 3H1NA 4EF0A 5A4WA 4XTSA 3IRAA 4AJ7A 3E0UA 1KEBA 2L57A 3RHCA 4WEYA 6GSUA 1PRXA 2AB6A 3DGQA 5CO3A 2WJUA 3EINA 2HYXA 3CTFA 2C3TA 2YZUA 2N5BA 2YP6A 4ML6A 2EIOA 4O7HA 1HQOA 2GQMA 1VF3A 2GDRA 3BCIA 4ZB9A 2AAWA 2GT6A 3LXTA 2YN1A 4TN8A 2VCWA 3VI5A 3GA4A 1RW1A 1EZKA 1JLWA 5AISA 5IMZA 4IJIA 4F0CA 4J57E 1THXA 1G0TA 5IMAA 3VURA 2RIIA 4LMVA 3L9VA 4RUVA 1PX6A 2AV4A 1S3AA 1TI1A 4E8EA 1PX7A 2REMA 2YV7A 1A0RP 1T4YA 2IPAA 1GLPA 2H71A 1PGTA 5CYYA 1GNWA 5D8IA 4CW9A 3TUEA 1PQNA 3FZ5A 1K0OA 1OC9B 2EIRA 2HZEA 3PINA 3A2XA 2YPMA 2GSQA 5J3RA 5IIZA 1THOA 3EE2A 2ES7A 2HE3A 2I9HA 3GHAA 5CNWA 1U6TA 3J7Yk 3GSTA 3JCML 1J0FA 1A2MA 3VWVA 2CV4A 4V2MA 4ZIJA 4RI7A 2N5AA 1N2AA 3GV1A 1TJDA 5JCWA 3DEXA 2WS2A 4K0GA 4F03A 2H6XA 22GSA 3FZ4A 2CAQA 2C0EA 3TOUA 1FW1A 3KGKA 4RQRA 1T1VA 4MJBA 2IWTA 4WF5A 1FVJA 4IGJA 1GNEA 2C0GA 19GSA 3QFBC 3UL3A 3TKSC 4ECIA 4MZBA 3LQ7A 1F3AA 2H0IA 3WT1A 1OC8A 4TVEA 2HSHA 5ECMB 1X9SB 5EPFA 3QPMA 3C8EA 3TDGA 1LBKA 3SWLA 4O32A 1HNAA 1PSQA 3KTBA 5DCHA 1SL2B 3KEBA 5L71A 1FOVA 4K2DA 3QD9A 1XWGA 2VCZA 4IHUA 3D22A 1NSWA 5C00A 3KJYA 2QSIA 3GYKA 1SL0B 2JZSA 3KH7A 2JU5A 3BCKA 3J7Yb 3FR6A 3KD0A 3TJJA 5G1LA 1A2JA 1A8LA 2N5FA 2VD1A 4MPGA 1WOUA 4ISDA 2HLSA 4KDUA 4OD7A 4DSQA 2V41A 1GUMA 5B7CA 1R4WA 2L4QA 3GL5A 1HNBA 3HA9A 2MMNA 4KDYA 4XIHA 4NHWA 1G7EA 4PNFA 2H74A 3GRXA 5IO0A 2LJRA 1GSEA 4BWSA 2PERA 4N0VA 2R5GA 1X5CA 4PGTA 5CRHA 4I5QA 4OFTA 4KDXA 2DJ2A 4J56E 2AYTA 1ERWA 2LUSA 1T00A 5JWOB 3IR4A 3CBUA 3DKSA 2TRXA 1M2AA 4HZ4A 2M80A 2CX3A 1VRSD 3K8NA 2XBIA 2YOIA 1NM3A 1G7OA 3E3EA 1BG5A 1WWJA 3ZIJA 4TR1A 3C1SA 1QXHA 1Z7PA 2G2QA 1CQHA 2FA8A 3VPTA 3HDCA 4TW5A 5IMCA 3HYPA 17GSA 2I4AA 1I5GA 3VLNA 3LWAA 1EGRA 3FY7A 2C4JA 3RDWA 4IQAA 1PN9A 1SK0A 5D73A 3FR9A 1SD9A 1Z3EA 3ED3A 3TJGA 4IS0A 2H0HA 4F0BA 1F2EA 1HYUA 1XXUA 4DEJA 1WMJA 2HRNA 2IMFA 3M9KA 1K0AA 2DLXA 3TKPA 4D73B 4CDOA 2JL4A 1A8YA 1H75A 4POBA 3A2VA 2P0GA 5GAPD 3P8WA 2YJ7A 3D0ZA 4LA1A 2R3XA 1SENA 4ZB6A 2CZ3A 1BQ7A 4MF6A 3GKXA 2HNLA 1R26A 3DYRA 5DJMA 3QAWA 4HUAA 1R7HA 3FR3A 3N9JA 2AHEA 4N10A 5J5NA 3S9FA 4XRDA 3HJOA 1SKRB 1M2DA 2V1MA 3HD5A 3VWUA 5A4VA 1M9AA 2FWFA 2B7KA 2R37A 4HS1A 4MK3A 1TK5B 3ZMKA 3TGZA 4HJ2A 2XPEA 3EMPA 4MJCA 5ABRA 1OKDA 2KLXA 4ZXGA 3LORA 3TRQA 1R5AA 3ZIVA 2IMDA 4ULXA 1FHEA 3CMIA 2LNTA 4POKA 2G0FA 1AQWA 1WE0A 1TP9A 5CREA 4MABA 1A24A 3GNJA 2M46A 3HJMA 2VIMA 4GXZA 4NPBA 1SD8A 4PXOA 4K6XA 6GSSA 1RK4A 2RUFA 3HCZA 1YEXA 3NOFA 5IMFA 2WB9A 4MLYA 4DSSA 2FUG2 1AC1A 1O8WA 3EU4A 5ECRB 4QQ7A 4JR4A 2DIYA 3QAGA 1OC9A 5EY6A 3HY2A 4TRXA 4MP4A 2YWIA 3P7XA 1V2AA 4QL9A 3A3TA 4OFMA 4JU5A 2OACA 2VLUA 2DSAA 5ID2A 3Q6OA 2V32A 2NBSA 1AW9A 4BPYA 4PUAA 1PD21 1GH2A 1QK8A 1XCCA 1W4VA 4HZ2A 1XW5A 3GURA 3HXSA 3M1GA 4JEDA 3F4SA 2RLIA 3F8UA 1T7PB 3FW2A 3FK8A 2KOKA 4KUNA 3IPZA 1Z6NA 1EOHA 20GSA 4E8HA 1AUCA 1EEJA 3ZYWA 3BD2A 3GH9A 4EXJA 1XFLA 2C3QA 2DJJA 3HZ4A 2H1AA 3ERFA 2YCDA 4Q5FA 5IM9A 2E2MA 1SYXA 5ECQB 3FZ9A 5B6NA 2JSZA 2B6MA 3DD3A 4NWYA 2ZNMA 1GTAA 2K6VA 3EYTA 1S3CA 4XHMA 5G2ZA 1T8EB 4EVMA 1EV9A 3TJBA 4MZCA 3TKRA 1YDKA 3D21A 4HQSA 3ZL5A 2WULA 2JZTA 5ENUA 5JWQB 1TRVA 3CSIA 5HR2A 2YV9A 1SKWB 3F3QA 4K7NA 2B5YA 4KH7A 1T4ZA 2VL2A 3IBHA 3WGDA 1Z7RA 3IAS2 2GQKA 2PWJA 3RHBA 2CA8A 2F3MA 1EGOA 2B1KA 1QMVA 3KCMA 3SBCA 4AJ6A 1GTUA 4ECJA 2IMEA 1SJ6A 3FYGA 3C7MA 2GQLA 5CP1A 2I81A 2VLVA 4HJMA 5HR1A 4TXOB 2R4VA 6GSTA 3DRNA 3Q18A 5ECIB 2OBIA 1F9MA 2LV3A 1TRWA 2FA4A 4BA7A 2J9HA 1GUHA 5IOXA 2DBCA 1ZYQB 2DMMA 3L4NA 3ZVJD 6GSVA 4N0ZA 1JZRA 1TK0B 2L6DA 2VCTA 2VO4A 4GSSA 3IXRA 2GS3A 2XC2A 3ERWA 2RM5A 3MAKA 1URMA 3W6GA 1JLVA 1N8JA 4K9ZA 3UBLA 4K1FA 3TKQA 4MMMA 1MDIA 4JZQA 3UIWA 3WT2A 3H8QA 2LJAA 4D73A 5F05A 2WZ9A 1NW2A 2O85A 2IIYA 4EL1A 4NV5A 2CAIA 1PMTA 3ZLPA 1B4PA 2VL3A 4ZB8A 2OE0A 2FNOA 4IP6A 2PPTA 4OFNA 3C73A 3GMFA 3UVTA 1GP1A 2OADA 2PMTA 4MCUA 4ACSA 3E9JB 1ILOA 3GH6A 5IQYA 5F8BA 1K0DA 1TDIA 5ECNB 4GSNA 5F0GA 5J9CA 2K8VA 3LEFA 3TKSE 4YH2A 3F6DA 1X5EA 4PQ1A 2KP1A 4IW9A 2H66A 4NV2A 4HEA2 3H4KA 1QFNA 3H93A 4X1UA 1Z9HA 1ST9A 1GSYA 2FWGA 3F63A 4KGIA 1TXXA 1QUWA 4I2UA 2MZCA 3EC3A 2V2GA 4F82A 1VF2A 4OO5A 2A4VA 2IFQB 3G7YA 4KAEA 4QL7A 2VM1A 5DQYA 16GSA 2CVDA 3ZFLA 6GSYA 3HHVA 5DCGA 4MF7A 2I3YA 4XCSA 1GRXA 2H30A 2LRTA 2F9SA 3L9UA 1UA5A 3ME7A 4X43A 4HDEA 3M9JA 1F3BA 3F0IA 3V1WA 2GT5A 2KUCA 2JACA 4I6XA 1VGLA 3DXBA 2C1YA 1Y25A 4G19A 5KN2A 2YANA 2MMOA 3GIXA 4KSMA 2H0GA 4FYCA 2C0FA 2DJKA 4WETA 4MPFA 1TTZA 4N11A 1DBYA 4KCEA 2EC4A 1FVKA 8GSSA 2LSTA 3ZREA 1CQGA 2K18A 1M7TA 4KA0A 1TOFA 3I43A 1E6BA 1S3DA 5F07A 4K0NA 4PQIA 2ALBA 4HOJA 3OR5A 1O7UA 3LFLA 2V6OA 1TRUA 1J9BA 2H70A 3AY8A 4Q5NA 2IMIA 1E2YA 1QGVA 5COHA 3KZQA 2JSYA 5ECLB 13GSA 2LRCA 3ZMLA 2VCVA 4MH3A 5D93A 3LYKA 4IJ3A 4MA9A 5ECSA 1U87A 3KXOA 4MDCA 2LS5A 4FO5A 3TRXA 3N5OA 3F4RA 2H01A 3H79A 1SU9A 3UOMA 2H6ZA 4GQCA 3O3TA 1H4OA 4OO4A 1M9BA 2FY6A 1GSSA 1U88A 4V2LA 2PGTA 3D4MA 4JR6A 2KHPA 5IOWA 2EIQA 1GL8A 1VF1A 2L6CA 2O7KA 2PBJA 3FZAA 1SKSB 2CT6A 3EU3A 1MDJA 1YJ6A 1AXDA 1EP7A 2JADA 4I97A 2HFDA 1OVNA 4ML1A 3GSSA 3CTGA 3Q19A 1AQVA 3GTUB 1W89A 4MZWA 4WR4A 2GTUA 5LCZA 5HQPA 1ZMAA 4FYUA 4Q5QA 18GSA 2YWMA 3NZNA 3MWHA 3IHQA 1ERVA 4YQMA 1G6YA 5H5SA 4MJAA 2HZFA 2V6KA 3ME8A 4WBRD 4TKYA 4HU7A 3HJPA 1ON4A 2GLRA 1WJKA 1K3YA 3RPPA 1EOGA 3UJ1A 5ECHB 3RPNA 1IYHA 1A0FA 5HR3A 1OE7A 2BJXA 3I69A 4MJEA 1O6JA 2NPBA 3FRCA 2OBKA 4TXOA 2GSRA 1AAZA 4IN0A 1KTEA 1SL1B 1KBNA 4ID0A 4ZBAA 1SK1A 2VUPA 3F3RA 1TU7A 5FHIA 3QMXA 1T3BA 4FYBA 3D6IA 4O92A 2Z9SA 2X99A 1O8XA 4Q5RA 4DSRA 1TW9A 2GGTA 4KE3A 1TU8A 4JBBA 1B48A 3CXGA 1LU4A 1YKAA 3ERGA 4ECCA 3IE3A 4OCFA 4PURA 4ILFA 1R5PA 3EWLA 5ECPB 2P31A 3IAM2 1K0MA 4KSOA 1PKZA 1XPVA 4GTUA 3VFIA 3VI7A 4O5RA 1K0NA 2VLTA 2A2SA 2H1GA 2B1LA 2E7PA 3LYPA 1FO5A 4ZILA 4NHZA 3MNGA 4MH2A 1GSUA 5AIVA 1V98A 2E0QA 4EUYA 2KP2A 2P5QA 1ZL9A 3KMNA 2B5XA 2TIRA 1F6MC 4GCIA 3KP8A 3DVXA 4H86A 1GTBA 2VOCA 2RM6A 3RAZA 4YQUA 4POMA 3R2QA 4I2TA 2H1BA 3A2WA 2PUKC 2FLSA 3IOSA 4IKHA 1OKTA 3KM6A 1GSDA 3L78A 2GSSA 1UN2A 3F4TA 4GLTA 1BAYA 5E4WA 2K8SA 2VM2A 3P2AA 3QOUA 2X64A 5KN1A 1FB0A 4LL1B 2LEGA 1XWAA 3BJ5A 2IMKA 2H1DA 2O87A 3DIEA 4XS4B 5IMDA 2VL2C 5DAKB 4AF2A 1PL1A 5HFKA 2L59A 2X8GA 1A23A 2LJKA 3GN3A 3U6VA 1NHOA 4BL7A 4GQFA 5GAND 2H6YA 2XHFA 3ISOA 1Z6MA 1FB6A 1GWCA 3TCOA 3BBYA 4RQXA 1ERUA 3WD6A 3EMXA 2CQ9A 2VCQA 4EDZA 3CYNA 1XIYA 4K8MA 5AN1A 4G2EA 3LGCA 3GKKA 5JCGA 4JRRA 2WRTA 3G9BA 1USBA 3CSHA 1OE8A 2NDOA 2C80A 3C1RA 4DVCA 1B9XC 1GULA 2X8HA 3ZTLA 5KEJA 4TR3A 3TB2A 1UVZA 3A5WA 5AIXA 4EKZA 2FWHA 3QDNA 1K3LA 3W8JA 6GSWA 4V2NA 1G6WA 5A5KA 1V9WA 3WYWA 1VF4A 2MMZA 2B3SA 1ABAA 4L0UA 2CVKA 3G7IA 2QGVA 4IQ1A 1ZCPA 2IL3A 1XVWA 3NIVA 3LJRA 1WPIA 1EWXA 1ZGNA 3PH9A 1WIKA 5DDLA 5HFIA 5D96A 1DUGA 2WCIA 4CHSA 2WDUA 5B6MA 4HI7A 1SK2A 2DJ3A 4DSSB 3ZRDA 1MDKA 4PQHA 3PR8A 2O89A 2MBSA 1XW6A 3HVXA 4TXVA 2OA7A 2XPDA 3HZ8A 4G9HA 4IBPA 1UC7A 5JWRB 3I6AA 3APOA 1EEMA 1XW9A 4TR4A 1YZXA 2YZHA 9GSSA 1AIUA 2GZZA 4IVFA 4HQZA 2C3NA 2PU9C 1HD2A 1IYIA 5E59A 4AJ8A 2VD0A 5ID2B 3GTUA 2YWNA 2OKAA 3F6FA 2NTOA 4EO3A 1JHBA 1A2LA 2PVQA 3O6TA 5C04A 2DC5A 2D2ZA 2FGXA 12GSA 2ON5A 2A2RA 3QAVA 1JZWA 1ZZYA 4Z7XA 3DVWA 4J2FA 2H19A 3CRUA 5B8BA 4K7IA 2E2GA 2L5LA 2C8UA 3M8NA 3DMLA 2ZUPA 3GKMA 1Y6EA 3FEUA 2H8LA 2VCXA 4KW6A 1SJZA 2C0DA 3TJFA 1M0UA 4ZBDA 5J4UA 3UBKA 1GTIA 6GSXA 3ZVJA 3D4TA 4EE0A 2MMAA 2HI7A 4YAVA 4L0WA 3IC4A 5HFGA 1ZYEA 2DJ0A 1O73A 1X5DA 4HU9A 2O8VB 1O81A 5DALB 4OCEA 2L5OA 2VL9A 5JCUA 2YJHA 2OE1A 3QR6A 1YF1A 2VAFA 4OWYA 1J08A 1PL2A 2XBQA 4TOPA 5CRGA 1KNGA 1JZOA 1SYRA 3TKSA 5G30A 1XWKA 2BTOT 4N30A 5G5EA 5ELGA 3VWXA 4OMVA 3WGXA 5ELAA 3KIJA 1HNCA 4PX1A 3LXZA 1OYJA 4WBJA 3VWWA 3M0FA 5CRWA 2R2JA 5KN3A 4WKWA 1B9YC 4WR5A 1F37A 5B8AA 1XVQA 3MSZA 10GSA 3US3A 4G10A 3ZITA 1JFUA 3LG6A 1YQ1A 5D9WA 1O85A 2TRCP 4V1Ap 4EDYA 4ZBBA 2B5EA 2FHEA 3APQA 1PA3A 1M2BA 1GLQA 1RQMA 3GUSA 1GSQA 4F9ZA 4PNGA 5D9XA 4ZL8A 5ECOB 3LSZA 3FKFA 1K0BA 4IP1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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