4MJCA

Synechocystis sp. pcc 6803 glutaredoxin a - p84r
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
99
structure length
99
Chain Sequence
b'MRGSHHHHHHGSAVSAKIEIYTWSTCPFCMRALALLKRKGVEFQEYCIDGDNEAREAMAARANGKRSLPQIFIDDQHIGGCDDIYALDGAGKLDRLLHS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Utility of Synechocystis sp. PCC 6803 glutaredoxin A as a platform to study high-resolution mutagenesis of proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable glutaredoxin ssr2061
source organism Synechocystis sp.
molecule tags Electron transport
total genus 30
structure length 99
sequence length 99
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mjcA01
2LUSA 2AB6A 1J9BA 1T7PB 4NV5A 4YQMA 1NM3A 1JLVA 2H6XA 4HZ2A 4OO5A 1E2YA 2JU5A 2IMKA 2JSZA 5DAKA 5AN1A 4DSSB 4BWQA 5IMCA 2LRTA 2HNLA 2WS2A 4Q5NA 5HR1A 4HUAA 3R2QA 1SL0B 6GSWA 1URMA 3L4NA 2XBIA 3TGZA 4MDCA 1EZKA 5CYYA 3SBCA 1FOVA 1GULA 4MPGA 3AY8A 4K2DA 3P7XA 1K3LA 11GSA 1K0NA 4MH2A 3D22A 1Z6MA 2CV4A 1YKCA 2B1KA 1TK0B 3QAVA 3TDGA 3I9V2 4ZL9A 1ERWA 3EU4A 1SJ6A 1A23A 3VURA 17GSA 2WCIA 4ISDA 1O73A 3VI5A 3I6AA 3NZNA 4FO5A 3KCMA 2HI7A 3IDVA 4OWYA 3C1RA 3ZYWA 2HRNA 2LQOA 3WYWA 3TB2A 1A0RP 1SYXA 4PQ1A 5D9VA 1XXUA 3HVVA 5ECOB 3BBYA 2V32A 1M99A 4I2TA 2YJHA 1UVZA 2H1AA 4O7HA 3TCOA 1EEMA 1XCCA 2PGTA 3QR6A 5EY6A 3SWLA 1JHBA 2MBSA 2GT5A 4HDEA 3L9UA 3M0FA 2OJLA 1G6YA 4IELA 2K8SA 1GSSA 3EINA 4TKYA 2K8VA 4PNGA 4EVMA 4IHUA 4F2IA 1XVWA 3C1SA 3ZFLA 2O8VB 5DALA 3DIEA 4RUVA 13GSA 4OFNA 4DSQA 2OKAA 2PPTA 4BVYA 1Q98A 2YNXA 3UAPA 5JCWA 4E8HA 3KMNA 3ME7A 3KXOA 4KCEA 1ZL9A 3P2AA 3IE3A 4PXOA 4PURA 1R7HA 3J7Yb 4Q5RA 3HY2A 4O92A 3LORA 2H76A 5COHA 3CYNA 2FHEA 2YZUA 1XW5A 1O7UA 3G7YA 2C0EA 3DGQA 1V40A 4GXZA 2V41A 5F05A 5D93A 3GMFA 2VCWA 2B3SA 2DIYA 4IJ3A 1EWXA 3GV1A 4ACSA 2C1YA 3VI7A 2VL9A 2DJJA 3HCZA 5GAPD 5KN1A 2EIQA 2BTOT 2B1LA 1AQXA 3ERGA 1TK5B 4XIHA 5GSTA 1XW9A 1TW9A 5JWRB 2GSQA 4V1Ap 2FLSA 3HVXA 4MH3A 3N5OA 1TU8A 4DVCA 2IPAA 3ZFBA 2IJYA 3CBUA 2K9FA 5H5RA 5GSSA 4QL9A 5DCHA 2PN8A 1XWGA 3PH9A 5IM9A 5DDLA 3KJYA 4MABA 2ON5A 2X8GA 2GGTA 3GX0A 4LL4B 4POMA 3FZAA 2VD0A 2IL3A 4G10A 3ERWA 1S3AA 1FO5A 4MA9A 3L0HA 3GTUA 3N9JA 3UL3A 1UC7A 4BL7A 4IN0A 3M1GA 2YWIA 4ML1A 2B7KA 2ZNMA 3KP8A 2XPEA 1ZGNA 4YAVA 3KP9A 2GDRA 2GZYA 4N11A 5C00A 3EMPA 3APSA 3TOTA 2VCZA 2JADA 3D5JA 4ILFA 1Z6NA 1B9YC 1YKAA 4JU5A 1K0MA 4IGJA 4RI6A 3QPMA 1B8XA 2IFQB 4ZBDA 5F06A 1BQ7A 2J23A 4N30A 3JCML 3DKSA 1GTAA 2MMNA 4IP1A 2D2ZA 1A0FA 4NHZA 1EGOA 1R4WA 2JZSA 5A4UA 1MDKA 2A4VA 3M9JA 2ON7A 4TVEA 3ZLPA 2H1DA 1OAZA 2OE1A 5G2ZA 4FYUA 2KLXA 4EXJA 3O3TA 1T8EB 1ZYQB 1SKRB 2DBCA 3KD0A 4OCEA 5HR0A 5JWQB 3TJFA 1MTCA 4WBRD 4X0XA 3KTBA 2H0GA 2EIOA 2H01A 3H1NA 4K7NA 3FR9A 4HEA2 2XBQA 4PGTA 2LTKA 3Q19A 5ECLB 3CTFA 2PERA 4TXVA 3TKSC 3VWWA 5LCZA 4IS0A 3H4KA 4Q5FA 5ECNB 4QQ7A 3G7IA 2H74A 3HJMA 2MYGA 5LD0A 4WXTA 2L6CA 2WZ9A 3P8WA 3A5WA 4DSRA 1B4QA 4J2FA 4Q5QA 1XBSA 4ECBA 4LL1B 1PRXA 4GTUA 4TXOA 2V1MA 3HZ8A 5F8BA 1KEBA 1GUHA 1ST9A 2C0GA 1ILOA 5HR2A 2CAIA 3K8NA 3WT1A 3OR5A 2B5YA 5D96A 2L59A 1U88A 2DLXA 4EDYA 1SYRA 4MK3A 2M46A 2OE0A 5DVBA 1B48A 4AF2A 2O7KA 1A24A 2K6VA 1OKTA 3FR3A 4POLA 3GRXA 1XZOA 1USBA 2H70A 3LQ7A 2I3YA 2FA4A 5LNKe 3UJ1A 4IJIA 3NOFA 3BOAA 4ECCA 1XWBA 3UIWA 2B5EA 1A8LA 2IMFA 3GKMA 3GN3A 3F4RA 2H0HA 2GZPA 4BVXA 2X8CA 2XHFA 2EC4A 1FAAA 2VIMA 3DXBA 3M8NA 2GSTA 2I81A 3I69A 2LS5A 5A4WA 2JSYA 2RM5A 1V9WA 2FCHA 5G30A 1SJZA 3M3MA 1DSBA 4N0VA 1GTUA 2RUEA 4MJCA 3LJRA 2RLIA 3LFLA 3A2VA 5G5EA 2C4JA 4MCUA 4F03A 5HR3A 4KNDA 3MNGA 3DRNA 1K0BA 1A8YA 2C80A 2B5XA 3EU3A 1T4YA 2VL2C 2WULA 5HFIA 3EWLA 4KGIA 20GSA 2VCTA 4OD7A 3ERFA 4MMMA 3GUSA 3VWXA 5HFKA 2L57A 3BD2A 1GRXA 1HQOA 4NPBA 1XOBA 2H0IA 4EE0A 2CZ3A 2RIIA 2C3QA 2DJ0A 4I6XA 2EIRA 4FIWA 4K7OA 2PWJA 1M2DA 1O8XA 2KP1A 1CQGA 3GH9A 4TR4A 1N2AA 2G0FA 2G2QA 5DQSA 2XC2A 1FHEA 1YEXA 2DJ3A 2H6ZA 4PNFA 2V2GA 4GLTA 5IMAA 1OVNA 1X9WB 1FG4A 4RI7A 2VUPA 3J7Yk 1B9XC 2C8UA 3L78A 3LG6A 1FB6A 3FYGA 4BWSA 2QGVA 1V98A 1Z9HA 4PX1A 1XIYA 2FA8A 1J08A 5B6NA 1PKWA 2TRCP 4K7IA 1ERVA 1NW2A 4ZXGA 5D73A 2VL3A 3FK8A 4YH2A 3TKQA 3GL3A 4I2UA 3D21A 6GSTA 1DE1A 5AGYA 1SK2A 3EVIA 2DJ2A 1A2MA 1H4OA 3FZ5A 2YJ7A 4MZCA 3HVSA 1XWCA 3Q18A 2CVDA 3IAS2 3EE2A 5HFGA 5G5FA 3HHVA 5DALB 16GSA 1GSFA 3FR6A 1MDIA 1U87A 5JCUA 4KDYA 2CVBA 5ENUA 3APQA 3VWVA 3RHCA 1Y25A 2AJQB 1QGVA 2AUVA 4AJ6A 1JZDA 4WF4A 1X5DA 4GSSA 3IRAA 1M2AA 2CZ2A 1O6JA 3F3QA 4F9ZA 2H75A 1XOAA 3TKRA 2NTOA 1YF1A 3ZIJA 2P0GA 1VRSD 4HQSA 1E6BA 3W8JA 2VAFA 3U6VA 2PU9C 3CMIA 1AUCA 4KX4A 1ERTA 3F4TA 4ZBBA 3LWAA 2ES7A 4IVFA 5J4UA 1K0AA 4ZL8A 3CTGA 2H19A 4BPYA 1GSQA 3CSHA 3C8EA 3QD9A 1HNCA 2WDUA 8GSSA 4DEJA 4L0UA 1S3CA 1JLWA 3TOUA 4DSSA 5CP1A 1T00A 3F63A 3W8SA 2LNTA 5KN0A 4ZIJA 3DVWA 1PN9A 2B6MA 4RQRA 3KGKA 3EURA 4TW5A 5J3RA 3QFAC 3WGDA 2K18A 4MPFA 3HJPA 4KE3A 4PQIA 12GSA 1OC9B 2OE3A 3WGXA 3IOSA 3IPZA 4WEYA 1TI1A 4N10A 1G6WA 5CAXA 4WF5A 1FVKA 4ID0A 1PA3A 4ZB8A 1ZMAA 3TKSA 5CRGA 2CX3A 3GX8A 3UVTA 4D73B 3A2XA 4GSTA 1YZXA 2HZEB 3IK7A 3L9VA 3VPTA 2REMA 2KP2A 3ZVJA 1Z7RA 4CHSA 4OMVA 3LSZA 1X5CA 2MMOA 2VLVA 2VM1A 4AGSA 1V58A 1K0CA 2FY6A 4ZILA 1F9MA 2MMZA 4TOPA 3VFIA 5CRWA 4IP6A 5ECRB 2JZRA 4EF0A 3HZ4A 2VOCA 1K3YA 4Z7XA 2LRCA 3HKRA 4L0WA 5ID2B 2C0FA 1A2JA 2YOIA 4X43A 3RPNA 4YQVA 3PGTA 4LMVA 3HDCA 1V57A 5G1KA 5JCGA 4G9HA 5IQYA 1WIKA 2E7PA 4GSNA 1X0RA 5DQYA 1BEDA 1R5AA 1SKSB 2IMIA 4I97A 3Q6OA 1T4ZA 1EGRA 14GSA 1W4VA 2N5AA 3G7JA 1EEJA 1HNAA 2LJRA 3F3RA 3TKSE 2H72A 4XS4B 1I5GA 2JACA 3UOMA 3GA4A 5AIXA 2CVKA 2H1BA 1WP0A 5FWGA 2PUKC 5EVOA 1VF2A 1SD8A 1WWJA 3H79A 4MF6A 2RM6A 1Z3EA 2HRFA 3LGCA 2C3TA 5EL8A 4FH8A 2OADA 2VL2A 4TR1B 3FY7A 5IO2A 4HQZA 2JZTA 4MF7A 1WJKA 2HZFA 3F0IA 4F0BA 2IMDA 5ECMB 3TRPA 2PVQA 4PUAA 3HJOA 5DJLA 4K0NA 1IYHA 2L5LA 3QFBC 4PUFC 4MZWA 5DJMA 5CRDA 4FYCA 2F3MA 3GKKA 4NWYA 4V2LA 2AHEA 3HA9A 4G19A 3UBKA 5IPGA 1GL8A 3ZMLA 1F2EA 2A2SA 5HQPA 2L6DA 2R4VA 1U6TA 3VWUA 3ZL5A 2LNSA 4EDZA 4WR5A 3Q74A 4KH7A 1GP1A 3WT2A 1EV9A 1ABAA 1KTEA 4LA1A 3E3EA 2H8LA 1MD3A 18GSA 4O32A 2WGRA 1C72A 1RQMA 2N5BA 3IV4A 1BG5A 2LQQA 1A2LA 1XVQA 1SK1A 4L5LA 5J41A 3IK9A 4EC0A 2IMEA 5IOXA 4V2MA 2LKUA 2P31A 1PKZA 4WKWA 2IFQA 1EP7A 5H5QA 1VGLA 4MZBA 1BJXA 3TRQA 5KN3A 4ECJA 3O76A 5CO3A 1Z7PA 2L5OA 5J9BA 4WBJA 2OA7A 2CT6A 2IIYA 2IWTA 1GNWA 1SU9A 3V1WA 3S9FA 4GRFA 2GZZA 2H30A 3TJKA 3DMLA 1QXHA 4NMUA 1GNEA 1B4PA 1RK4A 1VF1A 2YZHA 1WMJA 1AQWA 4POBA 1GLPA 4IQAA 2H6YA 2H1GA 3EYTA 4KW6A 3IBHA 6GSUA 2BJXA 3US3A 2TIRA 1SL1B 4OCFA 1JZOA 2AYTA 2I9HA 1F6MC 3DVXA 1XFLA 5B8BA 5ECKB 2VLUA 1OYJA 2HXKA 1OE7A 4N0ZA 4MJAA 1YDKA 1R26A 1PL2A 5DAKB 1DE2A 9GSSA 2MBTA 3IHQA 4AJ7A 1LBKA 3KH7A 3GH6A 2O85A 1F3AA 1K0DA 2H73A 1PSQA 3KMOA 3DWVA 3F6DA 1NHYA 1SK0A 3C71A 2GVPA 2GQMA 2B7JA 2FUG2 2YV7A 5ECPB 4ULXA 2R37A 3GL5A 4OO4A 1WPIA 5IMVA 3E9JB 3FW2A 2CX4A 2F8FA 2HE3A 2PVOC 1AXDA 4KSOA 1M9BA 2KHPA 4NAXA 3DD3A 4XHMA 2DSAA 3A2WA 2YWMA 3APOA 2LSTA 5IMDA 4YQUA 1M9AA 1SL2B 3GFKA 1EOHA 2VCXA 2DIZA 1W89A 4OFMA 1PQNA 4XS1A 3UBLA 4RQXA 2NBSA 1TP9A 4MP4A 2NPBA 2ALBA 3PR8A 1N8JA 4ZL7A 1GH2A 3CSJA 3FZ9A 1X5EA 1PD21 1VF3A 1TXXA 3LEFA 1AAZA 4O5RA 2QKEA 3ISOA 3QMXA 1GSUA 4KDUA 1F37A 3ZREA 4K6XA 3F9UA 4TN8A 5IPHA 3VLNA 1EV4A 5D9WA 4EKZA 1WRYA 5DBQA 1NSWA 4ZBAA 4CW9A 4GWRA 19GSA 7GSSA 1GSDA 4YAPA 1GTIA 2P5QA 5CRHA 3L9SA 2L4CA 2H71A 1DBYA 1XWKA 2X99A 4TRXA 1Z5YE 3ZZXA 5ECSA 6GSYA 1TKDB 1TRWA 5CNWA 4NHWA 1T3BA 2QC7A 3UARA 5KN2A 2HLSA 2FD3A 1QMVA 2AV4A 3FKFA 5FHIA 4ZB9A 5F0GA 4E8EA 3FRCA 6GSXA 3LYPA 4XRAA 3KZQA 4EO3A 3MDKA 1QUWA 1TU7A 4MJEA 3TJJA 3TRXA 2F9SA 1SKWB 3GHAA 3DEXA 3QAWA 2HT9A 1ZYEA 4HZ4A 5DCGA 2YCDA 2V6KA 1OC8A 5JWOB 1VF4A 1TRUA 2HFDA 4JEDA 6GSSA 3GKXA 1ON4A 2L4QA 2XPDA 2WRTA 3EC3A 2FWEA 4HOJA 4ECIA 1O8WA 4KUNA 4GQCA 4OFTA 2PBJA 1MEKA 3IR4A 2HSHA 5E4WA 1X9MB 2DJ1A 4HJMA 5AIVA 2LJKA 2OBKA 5L71A 2N5FA 3QDNA 1PX7A 4HJ2A 1XW6A 3WD6A 3WGEA 1I9DA 5B7CA 2QSIA 5G31A 5ECHB 3GTUB 4JE1A 1FVJA 3CXGA 1AQVA 1SENA 1O81A 2FGXA 2FNOA 3F4SA 2YWOA 4G2EA 4I8BA 2VLTA 10GSA 2X8HA 1PMTA 1JZRA 1K0OA 2AAWA 1HYUA 2GLRA 1ML6A 1TI3A 1YJ6A 1QQ2A 1AC1A 4KB3A 1WOUA 1G7OA 2R2JA 1HNBA 6GSVA 1FB0A 3ZMKA 4EL1A 3F6FA 1K3OA 5IOWA 2DJKA 2R3XA 3E0UA 2YP6A 4HI7A 2LV3A 2GSSA 1GLQA 1PGTA 2FWHA 2OACA 2DMMA 3ZIVA 4KSMA 3C7MA 3W6GA 4ML6A 3RPPA 2LJAA 3O6TA 4LMWA 1MDJA 3CSIA 3VK9A 1LU4A 4WR4A 5C04A 5A4VA 1OC9A 4KA0A 1ACVA 4PQHA 4JR4A 1JZWA 5CREA 3ZVJD 2DC5A 3IA1A 1M2BA 4XRDA 1YF0A 2WB9A 5ECQB 4D73A 1PL1A 2VO4A 3HYPA 2HZEA 1JFUA 4F82A 2CQ9A 2R6KA 3KEBA 2R5GA 1XPVA 1TOFA 3M9KA 4TR0A 3VPQA 1SJIA 4IW9A 4GQFA 2E0QA 4TXOB 4I5QA 3UVHA 3CRUA 2M72A 5INYA 2NDOA 3KTLA 4LLRA 4GF0A 2GS3A 4NV2A 3MAKA 3TKPA 4P3YB 1TK8B 1G7EA 5J9CA 22GSA 2YANA 4JR6A 5AISA 5ID2A 1GWCA 2J9HA 2RUFA 5IMZA 2A2RA 1GSEA 5FT3A 4KAEA 4K0GA 4F0CA 2VCQA 5D8IA 2ZCTA 1Q4JA 3P90A 1YY7A 4AJ8A 3CRTA 4HU7A 3KIJA 4HU9A 1AW9A 4IKHA 2E2MA 3RDWA 4JZQA 2MZCA 2Z9SA 1V2AA 1TRVA 2GQKA 3EMXA 3QAGA 1NHOA 3MWHA 3HD5A 4K8MA 5D9XA 5IO0A 1MD4A 4ZB6A 2V6OA 1BYEA 2VM2A 2O87A 2OBIA 1M7TA 1ZOFA 5EPFA 2TRXA 1T1VA 1SD9A 4NXIA 1QK8A 2KUCA 4K1FA 4XS4A 3NIVA 1G0TA 3GIXA 3BCKA 5B8AA 3QCPA 4CDOA 5ELGA 1M0UA 3D4MA 3GSSA 4J57E 1DUGA 1RW1A 3KM6A 3IAM2 1XWAA 5H5SA 2M80A 4KDXA 2GQLA 3ME8A 4GCIA 3GYKA 4MJBA 4TR1A 5ECIB 3ZTLA 2O89A 4MLYA 3LXTA 2CAQA 1TRSA 2JL4A 4BA7A 2F8AA 2C0DA 3IXRA 5ABRA 5KEJA 2DMLA 4K9ZA 3UEMA 3ED3A 4JBBA 4EUYA 1GTBA 5B6MA 3RHBA 4POKA 3KH9A 1TJDA 3UMAA 2HSYA 3TUEA 1THXA 5F07A 2VCVA 1O85A 3BJ5A 3RAZA 2NVLA 5IMFA 1Y6EA 1R5PA 2FWGA 4V2NA 1J0FA 2I4AA 2KOKA 1U3AA 5ELAA 1UA5A 1YQ1A 2WJUA 2H66A 4XS6A 4L5OA 3RBTA 3LXZA 3FZ4A 4J56E 3GNJA 4QL7A 3TJBA 5D9TA 5IIZA 3D4TA 2YWNA 1ZCPA 1FW1A 1YEPA 2WFCA 3I43A 3QOUA 3ZITA 1KBNA 3FEUA 3MSZA 1OC3A 2F51A 2I1UA 1AIUA 1HD2A 2LRNA 3BCIA 1S3DA 3A3TA 4WETA 2IN3A 1F3BA 1QFNA 3GSTA 3GURA 1X9SB 2VD1A 4H86A 2C3NA 4IQ1A 1PX6A 1OE8A 5GAND 3F8UA 5E59A 1THOA 2ZUPA 4V1Ag 2MMAA 1U3IA 4L8EA 5GZZB 3C73A 3U5RE 1BAYA 2HYXA 3LYKA 4HS1A 4XCSA 2YPMA 3TJGA 1GUKA 4XTSA 4JRRA 1GUMA 1TTZA 3PINA 4MF5A 1OKDA 1BX9A 1IYIA 1H75A 3IC4A 3FHKA 3D0ZA 3HXSA 2BMXA 3ZRDA 1LJRA 2CA8A 1EP8A 3G9BA 4X1UA 1GSYA 2P5RA 2YV9A 2YN1A 1ZZYA 3GKNA 5G1LA 4TR3A 4KCAA 3H8QA 2LEGA 4FYBA 4IBPA 5A5KA 1UN2A 2FWFA 2GT6A 3H93A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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