4MJEA

Synechocystis sp. pcc 6803 glutaredoxin a-r27l
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
99
structure length
99
Chain Sequence
MRGSHHHHHHGSAVSAKIEIYTWSTCPFCMRALALLKLKGVEFQEYCIDGDNEAREAMAARANGKRSLPQIFIDDQHIGGCDDIYALDGAGKLDPLLHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Utility of Synechocystis sp. PCC 6803 glutaredoxin A as a platform to study high-resolution mutagenesis of proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable glutaredoxin ssr2061
molecule tags Electron transport
source organism Synechocystis sp.
total genus 27
structure length 99
sequence length 99
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mjeA01
4K7IA 4KCEA 3QCPA 5ELGA 1EOHA 2H76A 3Q18A 2YZUA 2V2GA 2X99A 4GSNA 1MD3A 5DCHA 4WBRD 2CT6A 5C00A 1C72A 1WIKA 8GSSA 5D73A 3V1WA 1GNEA 3DXBA 1ILOA 2QSIA 4NHWA 18GSA 6GSXA 5ECKB 1OC9A 4V1Ag 2F3MA 3TKSC 4Z7XA 4RQRA 4TN8A 5IMCA 2DIYA 2YPMA 5JCUA 4MF6A 1GSFA 3TKSA 4PUAA 3D0ZA 1SYXA 3HA9A 4JU5A 4NMUA 3D22A 3CSJA 3EU4A 1N2AA 1M0UA 2H0GA 5J41A 2MMNA 1AC1A 3QR6A 2DJJA 1GTAA 4K0NA 2O8VB 4NWYA 3UOMA 3GA4A 1RW1A 2DJ3A 2YP6A 4PURA 1TDIA 4EC0A 1GSDA 3GSTA 5D9TA 1SK1A 5ECOB 4WF5A 2GDRA 4TR1A 1AIUA 3KMNA 3DWVA 2B1KA 22GSA 2LTKA 4X0XA 2K6VA 3IAS2 1X5CA 1TRUA 3BOAA 2H6XA 3FEUA 4MPFA 4O92A 4XHMA 4ZL7A 5KN1A 2LJAA 1F3BA 1HYUA 4LA1A 3ZLPA 1LJRA 5ECSA 5IO0A 1FW1A 2C8UA 3K8NA 5DQYA 5D9WA 2RM5A 1N8JA 1GUKA 3VPQA 1GSQA 4PQ1A 1SJ6A 1ERTA 3I9V2 5IMFA 1G7EA 3U6VA 3TCOA 3LYPA 5HR0A 3BCIA 11GSA 2HZEA 1VGLA 3AY8A 1T1VA 1OC8A 2VM1A 2H8LA 1ERUA 2GZPA 1FHEA 2RIIA 1VF1A 1YEXA 2VM2A 1V40A 2C0GA 3APQA 1PX7A 1SD8A 3TB2A 2VUPA 1YQ1A 2JSYA 1BQ7A 3GV1A 3H1NA 4WETA 2WRTA 3IC4A 5J5NA 1EV9A 2YWIA 1TU7A 3A2XA 4HS1A 3F6DA 1XVWA 5CRWA 4HZ2A 3D4MA 2VL2C 2WS2A 5F06A 3LYKA 1G6YA 4MMMA 2VL2A 2F8AA 3OR5A 2LRNA 1J08A 3LG6A 2H01A 1GSYA 4P3YB 1R4WA 2L5LA 3LORA 1IYIA 2EIQA 4N0VA 2B1LA 3EMPA 1T4ZA 3L4NA 3TOTA 2N5AA 3GL3A 1HNBA 3GL5A 3GX8A 1K0BA 1A0FA 1XCCA 1NW2A 1MEKA 3TJBA 1A24A 2H73A 2IMIA 5D96A 4XRDA 4GLTA 4MPGA 3VI7A 1AAZA 5IPHA 3CRTA 1ZZYA 2L59A 3M1GA 2AYTA 4TR4A 5KN0A 3HXSA 2HRNA 3WD6A 2HXKA 4BA7A 4Q5QA 2OKAA 2JZRA 1EGOA 4EDZA 4Q5FA 5HR3A 3FYGA 4K2DA 1YKCA 3VWVA 1AQXA 4D73A 3D21A 4ECIA 3KGKA 4HI7A 4DSSA 1ZGNA 4MABA 2HSHA 4Q5RA 3F4TA 2V41A 3ZIJA 1SL1B 2VL3A 2CAQA 1AQWA 2GZYA 1YZXA 4OWYA 3RBTA 1OKDA 3WGDA 5DAKB 2DMLA 2OE1A 1U3AA 2C3TA 2HE3A 4ML1A 2PGTA 2LQOA 3RHBA 4N11A 1XW6A 2R6KA 2EIOA 4BVYA 1RK4A 4TXOA 3HZ8A 4IQAA 5IOXA 1GTUA 3VLNA 1T3BA 2H74A 4ZBAA 1O7UA 2H1AA 1R26A 4HU9A 2J23A 4F0CA 1TRWA 3MSZA 1QK8A 4EE0A 3ED3A 2DSAA 4K6XA 2R4VA 1GSSA 4GTUA 5J3RA 4OCFA 3ME8A 4AGSA 4MP4A 5ECNB 1NHYA 1SD9A 2H6YA 4EDYA 4BPYA 1JZWA 2K9FA 3GH6A 5G30A 1J0FA 2LKUA 2CX4A 3ZVJA 5ID2A 5ELAA 3EINA 5B7CA 3GUSA 1JZOA 4GSTA 4I8BA 3KH9A 4G10A 4TVEA 3US3A 3FZ5A 1S3AA 4JR4A 3QMXA 1SU9A 2B5XA 2LNTA 3G7YA 1BEDA 3G7IA 3DRNA 4NPBA 1O81A 3GHAA 2HYXA 2KHPA 4PX1A 1PSQA 1TK0B 1X5DA 4ISDA 4LLRA 2GQKA 5H5RA 1UN2A 1EV4A 2REMA 3IAM2 5D8IA 4HUAA 4FYBA 3VI5A 3DD3A 1U88A 2FWEA 4HJMA 1SJIA 3GH9A 4ZL9A 3IK7A 3LXZA 1H75A 2L57A 1FO5A 2V32A 4TR1B 1XFLA 1EGRA 3CRUA 5G5EA 1PGTA 1EP8A 4MJEA 5HQPA 2EIRA 1ZYQB 1A0RP 4HQSA 17GSA 1NSWA 1JZRA 2C4JA 3ERWA 4OO5A 5G5FA 2WULA 5CRDA 5COHA 2LS5A 1YF1A 1PKZA 2KOKA 3E3EA 5B8AA 2YN1A 3FRCA 3D6IA 4XCSA 3ERGA 13GSA 3LQ7A 4MH2A 1YKAA 3L9SA 2A4VA 3ZREA 4ZBBA 1BAYA 2VD0A 4FYUA 1ZYEA 2AV4A 2FWFA 3PGTA 2H72A 1FVJA 1GSEA 3P7XA 2FLSA 3DKSA 1LU4A 3A2WA 4RUVA 4MZWA 2OE3A 4WR4A 1V98A 2HZEB 2VLUA 3TRPA 19GSA 5G1KA 5JWRB 5F07A 1TP9A 2XBQA 1KEBA 4YAVA 4JE1A 2ALBA 1R7HA 4POKA 3IBHA 5ECRB 3UJ1A 2VIMA 4X43A 5DJLA 4V2NA 3RDWA 4EUYA 5G1LA 2PERA 4BWSA 3F4RA 3NOFA 5GAPD 2VLTA 3QPMA 5JWOB 2ZNMA 2LRTA 2VCWA 2FY6A 4K0GA 4OFTA 2CZ3A 1O6JA 1V9WA 3GFKA 3KM6A 4TR0A 3UIWA 1FG4A 1F2EA 3F8UA 3PR8A 3F4SA 4KAEA 1MDKA 1JLWA 3M8NA 3MWHA 3C7MA 6GSUA 2GSTA 4EXJA 3HD5A 3HYPA 3TJKA 3CSHA 2DBCA 1M7TA 1M99A 1W89A 3ZMKA 1UA5A 3L0HA 2O85A 2F51A 1TXXA 3KMOA 2X8CA 2RUFA 4EL1A 3L9VA 5KN3A 3DMLA 4Q5NA 1MTCA 3VPTA 1XWGA 1F9MA 3LSZA 1TKDB 2ZCTA 4KCAA 2CAIA 2JSZA 4KDYA 1YJ6A 2NBSA 3EE2A 1EEMA 2P31A 5H5SA 3WT1A 2N5FA 5DJMA 1WMJA 4LL1B 2IFQA 4POBA 1DSBA 2G2QA 3IA1A 5ECLB 4D73B 4YH2A 3UVHA 1THOA 1ABAA 4GQCA 4OFMA 1DBYA 4GQFA 2I3YA 1PKWA 4DSSB 2QKEA 1T7PB 4XS4B 1USBA 5DALA 3H93A 4AJ6A 2H1BA 5FT3A 1X9MB 3GTUA 3UL3A 4TXOB 4NHZA 3LEFA 3HJPA 2R5GA 4V2LA 2LJRA 3ERFA 4HZ4A 5D9VA 3ZITA 2CVKA 2L4CA 3KD0A 1PX6A 3FW2A 1MD4A 1O8XA 4RQXA 1K3YA 1PMTA 1K0CA 1Z7PA 3QD9A 2OBKA 3A2VA 4F03A 3VFIA 1B48A 3KEBA 2C3NA 4HOJA 1A2MA 3EYTA 1OVNA 2C80A 2PWJA 1VF3A 5KEJA 1PD21 3FZ4A 1K0AA 1XOAA 2YOIA 2H0HA 2X64A 1X9SB 3TRXA 1KBNA 1M2BA 2MZCA 4CHSA 4ZILA 2ES7A 4HEA2 4KDUA 1GL8A 4WEYA 5DVBA 3GRXA 1THXA 4I5QA 3LXTA 1Y25A 2H1GA 2FNOA 3GKNA 4ZB8A 3KP8A 4GCIA 1ZL9A 2C1YA 5IIZA 2H0IA 3O6TA 4MA9A 2GT5A 2M46A 3H4KA 3M3MA 2E2GA 2F8FA 2L6CA 3TJJA 3DYRA 3UBKA 2H75A 3HVSA 2FWHA 4O32A 2HI7A 2A2SA 4PGTA 1WE0A 2G0FA 4KA0A 1O73A 4MLYA 3F0IA 3FZ9A 2NDOA 3IRAA 2HRFA 3GKMA 3M9KA 5J4UA 2D2ZA 5IMAA 2VOCA 3F6FA 2JL4A 3LWAA 5F05A 2AB6A 3APSA 2NPBA 3UBLA 1HNAA 5EY6A 1JFUA 3IXRA 3KZQA 4KUNA 3A5WA 3HZ4A 1I9DA 1RQMA 12GSA 2JU5A 2O87A 1A2LA 2VAFA 1AXDA 2YV9A 5ABRA 3P2AA 1HNCA 2I81A 4NV2A 2MMZA 2PPTA 4IQ1A 4YQVA 1ON4A 1XW5A 4DEJA 4DVCA 5HR2A 5D93A 2YV7A 2GS3A 1T8EB 1DUGA 2FD3A 1OE8A 3EWLA 1GLPA 2KLXA 1TU8A 2BJXA 2GSSA 2M80A 4H86A 1EEJA 3PINA 3VWUA 2EC4A 2DMMA 2H19A 2BTOT 2GZZA 2WZ9A 3FZAA 1IYHA 3N9JA 2LEGA 1X0RA 1OE7A 4ACSA 3TKRA 1VF2A 3BJ5A 4ZB6A 3CMIA 3MDKA 3CSIA 1FOVA 3VWWA 3BCKA 2H30A 5A5KA 1G0TA 16GSA 1MDIA 1A8LA 3WYWA 3RPNA 2RM6A 3Q6OA 4O5RA 3FR9A 1ZOFA 3VURA 4IBPA 3S9FA 4PQIA 2R3XA 1BX9A 3CYNA 5AIVA 1B4QA 1F6MC 5JWQB 2P0GA 3IHQA 3BD2A 1GTIA 5HFIA 3I6AA 1OC3A 3GURA 2YJ7A 3KTBA 2XHFA 1GRXA 1A2JA 4IVFA 2PVOC 4G2EA 4N10A 4ZB9A 4KSOA 4ULXA 2CA8A 4V1Ap 3IK9A 3WGEA 2KUCA 2YWMA 4I97A 5IQYA 3KXOA 4MJCA 2OJLA 1GWCA 1CQHA 5E4WA 4L8EA 3LJRA 1EWXA 1VRSD 4KX4A 1UC7A 2H71A 4IN0A 2V6KA 6GSWA 1TI1A 4ZBDA 3VK9A 4LL4B 1XOBA 3IOSA 3GYKA 1OC9B 2IFQB 4EF0A 1XW9A 3ZRDA 1Z5YE 5HFKA 1XWKA 2B5EA 5DQSA 2B3SA 3JCML 1SK0A 3ZYWA 2H70A 3U5RE 2LRCA 5DALB 5JCWA 1B9XC 20GSA 1E6BA 4NXIA 2IPAA 1H4OA 2E7PA 1Z6MA 3GTUB 2V6OA 4OCEA 4J57E 4IELA 3TKQA 3QDNA 14GSA 2HT9A 2DLXA 5GZZB 2VCQA 5FHIA 3HDCA 2Z9SA 4HJ2A 3C1SA 4HDEA 5DCGA 1SL0B 4KB3A 3IV4A 1F37A 3GN3A 4QQ7A 2CVDA 1GLQA 1ERVA 1ZMAA 5ENUA 2L4QA 2ON5A 1E2YA 4FO5A 4PNGA 3TKSE 1PA3A 3ZFLA 2GLRA 4JZQA 2VCXA 4XS1A 3FHKA 4PNFA 4MF5A 2HFDA 2K18A 3TUEA 4IW9A 1ST9A 1O85A 4YAPA 3EMXA 2VL9A 1TK5B 3KP9A 4E8EA 3BBYA 1TK8B 2GTUA 1YEPA 1YDKA 1GTBA 1Q98A 5E59A 1U3IA 5EL8A 3FK8A 2HNLA 1JLVA 4MJAA 2IMKA 1KNGA 2B6MA 3KCMA 4QL7A 2PU9C 1W4VA 3IPZA 1FB0A 5FWGA 3EURA 5L71A 1PL2A 1J9BA 1M2AA 5LNKe 1GH2A 1GP1A 2RUEA 5IMZA 1OYJA 3HVVA 2NTOA 5AISA 4WR5A 4K8MA 3EU3A 1U6TA 1QFNA 2KP2A 4POLA 1G7OA 4CW9A 3IDVA 5AGYA 2FGXA 1B4PA 3H8QA 5CO3A 2XPDA 2FCHA 4TXVA 3TJGA 4F2IA 1DE1A 1QUWA 1JZDA 2JZTA 4F9ZA 1QGVA 4AF2A 3I69A 4TW5A 3ZFBA 4KDXA 1TRVA 5DAKA 5A4VA 1ML6A 1GUMA 2XPEA 3RPPA 4JEDA 3F3RA 4J2FA 2B7KA 2CVBA 1ERWA 5H5QA 2DJ2A 4YQUA 1BYEA 1FAAA 2PMTA 3FR3A 1Y6EA 2I1UA 4O7HA 1PRXA 2PBJA 1GSUA 4L0WA 1Z6NA 2IIYA 2VD1A 6GSYA 3WT2A 2F9SA 1PN9A 1V58A 3GMFA 3R2QA 5DDLA 4FIWA 4OD7A 5B6MA 3FKFA 5IM9A 9GSSA 3QAWA 2YJHA 1Q4JA 2H1DA 4XS6A 1U87A 3GSSA 2OADA 4GSSA 2JACA 2FA8A 3QFBC 4WF4A 1K0DA 4TRXA 2J9HA 3DGQA 1SKSB 1Z7RA 5INYA 3J7Yk 2JADA 3CBUA 2DC5A 1XWAA 1R5AA 2GQMA 1YY7A 3DVXA 5GSTA 3W8JA 3UEMA 4IJ3A 4WXTA 3W8SA 5CP1A 2LNSA 3WGXA 1XZOA 4IP1A 2YWOA 2WJUA 3G9BA 4ID0A 2C0EA 4ECBA 10GSA 1NHOA 2YCDA 1TOFA 5AIXA 5F0GA 3HHVA 3FR6A 4RI6A 2VCTA 3FY7A 4GF0A 5IPGA 3C1RA 2GSRA 5JCGA 3KIJA 6GSTA 1S3DA 3J7Yb 3MNGA 3H79A 2FUG2 3QAGA 1T00A 1BG5A 1V57A 2VCVA 5AN1A 3M9JA 4G9HA 5LCZA 5G2ZA 5GSSA 1HD2A 5CAXA 3F63A 3HJOA 3UMAA 1Z9HA 1OKTA 5IMDA 4G19A 2H6ZA 1QQ2A 5A4UA 1CQGA 2TRCP 3L78A 2MMOA 3ME7A 1A8YA 4ML6A 1JHBA 1K0MA 4MDCA 4KGIA 2TIRA 2FHEA 2X8HA 5ID2B 2LV3A 2XC2A 5ECMB 5CYYA 1SENA 3E9JB 1K0OA 3D5JA 1HQOA 3Q19A 1F3AA 4IHUA 4TKYA 2L5OA 1T4YA 4JRRA 3SBCA 4L5OA 4KW6A 1OAZA 1YF0A 3HJMA 4K9ZA 3RAZA 2WB9A 3ZTLA 1WRYA 4IS0A 1PL1A 2HZFA 5GAND 7GSSA 4ILFA 5G31A 3IR4A 5CRGA 2R37A 2I4AA 5IOWA 1I5GA 3C8EA 1SK2A 3C73A 4ZL8A 4IP6A 1UVZA 5B6NA 2LJKA 5HFGA 2B7JA 2GGTA 3HCZA 6GSSA 2LUSA 3QAVA 3GIXA 4NV5A 2ON7A 1SJZA 4MJBA 4PUFC 2C0DA 3RHCA 3W6GA 1AUCA 2V1MA 1MDJA 4EO3A 5DBQA 2KP1A 4TR3A 2RLIA 3A3TA 3ISOA 4EVMA 5ECQB 1G6WA 1TTZA 2AAWA 3ZIVA 4ECCA 2ZUPA 1SYRA 2VO4A 4WKWA 1TRSA 5J9CA 3ZVJD 2GVPA 1SKRB 1GULA 5EPFA 1XXUA 6GSVA 4MZCA 3ZZXA 3SWLA 1LBKA 1X9WB 3Q74A 1URMA 2DJ0A 2P5RA 4PXOA 1WP0A 3DEXA 2PVQA 4AJ8A 2P5QA 4PQHA 5ECIB 1R5PA 4IJIA 4BVXA 2A2RA 1GNWA 1K3LA 3CTGA 3D4TA 4GXZA 2PN8A 1GUHA 1VF4A 2CZ2A 5LD0A 2E0QA 1ZCPA 2VCZA 2H66A 4LMWA 1A23A 2QGVA 4XS4A 3ZL5A 3CXGA 1EZKA 1M9BA 1NM3A 4WBJA 4F82A 1QMVA 2BMXA 4F0BA 2OACA 3E0UA 2OA7A 2IWTA 2C3QA 2LSTA 3ZMLA 1SKWB 4KE3A 2L6DA 3F3QA 3DIEA 3HVXA 5IO2A 4ZXGA 4I6XA 4MH3A 4V2MA 1DE2A 2OBIA 2CQ9A 2K8VA 1PQNA 2IJYA 3NIVA 3P8WA 4XTSA 4DSRA 3L9UA 1M2DA 2YWNA 3QFAC 2YNXA 1KTEA 1WPIA 1EP7A 5F8BA 4MZBA 3VWXA 4HQZA 4IGJA 4K7NA 2WDUA 3EVIA 4JBBA 4RI7A 4AJ7A 3IE3A 4J56E 1AW9A 4E8HA 2O7KA 3C71A 2C0FA 5C04A 2DJ1A 2IMEA 4ZIJA 3KH7A 2B5YA 3TOUA 4L5LA 1XBSA 2DJKA 5A4WA 1BJXA 3M0FA 1FB6A 3P90A 5IMVA 2JZSA 3LFLA 2HSYA 2XBIA 5KN2A 4BL7A 1K0NA 1X5EA 1SL2B 3QOUA 5ECPB 3APOA 4JR6A 4EKZA 1Z3EA 3TKPA 1XWBA 2GT6A 3UAPA 2WGRA 2PUKC 3GX0A 4FYCA 4KSMA 2IMFA 2MBSA 2R2JA 4POMA 2FWGA 1WOUA 3MAKA 4I2UA 2M72A 2AHEA 1TI3A 3TGZA 3TDGA 4HU7A 4X1UA 2WFCA 2IL3A 2N5BA 1B9YC 2AJQB 4QL9A 1TJDA 3EC3A 3HKRA 2QC7A 4MF7A 2OE0A 1O8WA 1V2AA 1XIYA 1XVQA 4OMVA 2CV4A 3DVWA 4XRAA 2GQLA 5CREA 4I2TA 1AQVA 1TW9A 3TJFA 3TRQA 2WCIA 5D9XA 5CNWA 3F9UA 5J9BA 3G7JA 4LMVA 2MBTA 3GNJA 2FA4A 4L0UA 4GWRA 4DSQA 1XPVA 1WWJA 4GRFA 4KNDA 1QXHA 3UVTA 2YANA 5B8BA 2DIZA 1M9AA 1K3OA 3GKKA 5HR1A 3O76A 4YQMA 4XIHA 4OO4A 3HY2A 3KTLA 3UARA 3I43A 2AUVA 4TOPA 2MMAA 2TRXA 4MK3A 3KJYA 5ECHB 2GSQA 4NAXA 4KH7A 4K1FA 3O3TA 3N5OA 2X8GA 2K8SA 5EVOA 2O89A 2I9HA 4OFNA 2E2MA 2IN3A 4ECJA 4K7OA 2MYGA 1WJKA 2LQQA 1ACVA 5CRHA 4IKHA 1S3CA 4BWQA 1FVKA 3NZNA 1XWCA 4N0ZA 2VLVA 3LGCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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