4MLJA

Dihydrodipicolinate synthase from c. jejuni, y110f mutation with pyruvate bound to the active site
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
295
structure length
294
Chain Sequence
NIIIGAMTALITPFKNGKVDEQSYARLIKRQIENGIDAVVPVGTTGESATLTHEEHRTCIEIAVETCKGTKVKVLAGAGSNATHEAVGLAKFAKEHGADGILSVAPFYNKPTQQGLYEHYKAIAQSVDIPVLLYNVPGRTGCEISTDTIIKLFRDCENIYGVEASGNIDKCVDLLAHEPRMMLISGEDAINYPILSNGGKGVISVTSNLLPDMISALTHFALDENYKEAKKINDELYNINKILFCESNPIPIKTAMYLAGLIESLEFRLPLCSPSKENFAKIEEVMKKYKIKGF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords dihydrodipicolinate synthase
publication title Tyrosine 110 Plays a Critical Role in Regulating the Allosteric Inhibition of Campylobacter jejuni Dihydrodipicolinate Synthase by Lysine.
pubmed doi rcsb
source organism Campylobacter jejuni
total genus 119
structure length 294
sequence length 295
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.3.3.7: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase.
pdb deposition date 2013-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4mljA00
4I9AA 1LLWA 2V2CA 3LERA 3E02A 3STGA 3DHFA 3NR0A 3SJ3A 1GWJA 3PUEA 5I3KA 1DVJA 4BF9A 1BEUA 4XKYA 4NZFA 8TIMA 5AC7A 5C5YA 1XBXA 3OBKA 3HOJA 4JTKA 5U7SA 2H3BA 3VE9A 4NT0A 4DBEA 3ZR4A 4O0ZA 4DO6A 2J27A 1T96A 2ISVA 3HGRA 1ZAIA 4A2RA 2GVGA 1SUXA 3BV4A 3VI2A 3W1LA 1W5OA 4TX9A 3KRZA 1XUUA 5KITA 2ISSA 1JCMP 4UTMA 1Q6RA 1BWLA 1M5WA 1OX6A 1VYRA 3EX6A 3P5YA 5G1YA 4JTJA 3TNOA 3ABQA 3OVQA 1XKYA 1B9BA 3EXSA 3GVGA 4FNUA 4MZ1A 3GIYA 1Z48A 2Q8ZA 5L9FA 2OX1A 4HN4A 1QDSA 3HF3A 4JNMA 2RH9A 4JD4A 4Y96A 1Y0EA 5K4ZA 1WOBA 3W7GA 3ZWTA 1BTMA 4N9CA 3NPWA 1JUEA 3E96A 1XDLA 3CIWA 5CZ0A 4LS0A 1LBMA 3HPZA 4R34A 4UFJA 1OFBA 3GZ3A 3EXRA 5LGZA 2E6YA 3MW7A 3LHWA 4BFAA 2TYSA 3S42A 1E51A 3R2GA 3EWWA 3W1XA 1G67A 3P60A 4XKYB 3B0UX 4X3ZA 2QJGA 5D05A 3C3NA 3QQ1A 5AYYA 5DBTA 3O07A 1LM1A 5K2ZA 2J9ZA 1VCFA 5TBOA 1I2PA 4JICA 1U5JA 3DFSA 1V5XA 4NX0A 2YCEA 3DI1A 3BPWA 3C2FA 1KM0A 3NM1A 1S5TA 3HJZA 4FX6M 6ALDA 3HG3A 4IJBA 4A21A 4EOUA 3C61A 3HQ1A 1EP3A 1K8ZA 3RU6A 5FEZA 1ZFJA 3TAOA 1WBHA 3LV5A 3QMTA 1GOXA 3W7DA 3MJYA 1LROA 3QFEA 4BI7A 4ADTA 5AHEA 4UFKA 2A21A 3NL6A 3KOFA 4IMCA 1G4TA 4OBTA 4GFSA 3M5ZA 3UWZA 1OFOA 4EWND 3AO0A 5F2MA 2DP3A 4MLJA 3WK3A 3TR2A 4ZL1A 4R53A 3N9RA 3NGJA 2ZRVA 2LLEA 2ZA3A 3IRDA 1QMLA 3W72A 3OA3A 3O06A 5F2GA 1G69A 3O05A 3LHYA 3DI0A 3C56A 3R12A 1MO0A 1QOQA 1A53A 3G18A 5LKYA 4HNUA 3G1DA 1VPXA 4NJJA 3QRHA 3I7SA 4LWWA 1OJXA 3M5XA 4LNYA 1LOLA 4XZ9A 1VRDA 5AHNA 1G4EA 4NJKA 3W71A 3W22A 3PBWA 4UMAA 1KW1A 2PC4A 2V0TA 3A5FA 4JTUA 2DJLA 1JJKA 3NL5A 4I7UA 3HB9A 3N19B 4O16A 4H3DA 1YDVA 1ZAJA 5HNRA 2GVJA 2O7SA 3CLMA 3N3MA 1XDMA 1SO4A 5DY2A 2AQWA 3F4NA 2Y7GA 4MJMA 4Z0JA 5K7JA 2EF9A 1VYSX 1WXJA 2DZUA 3LHZA 3PS7A 3S5NA 2B0MA 3GXNA 3PAJA 1VHCA 2IQTA 3M5YA 4EF9A 4FEZA 1KM1A 4FB7A 2VOMA 3NQ8A 3P8JA 5K9DA 3DH7A 4O4VA 1EUNA 1O95A 5F2IA 5G4EA 3C0JA 3S6DA 2AGKA 1TV7A 1VYPX 2QJIA 4K37A 4JY9A 4NX5A 3UNDA 3L21A 2C14A 1W8SA 4UTKA 2WOQA 3EKLA 4KFPA 1SPQA 3BGJA 5EKYA 5D03A 2WNQA 2E1DA 4GC4A 5AYZA 1FCUA 4NVTA 2H3DA 2CWNA 3NZRA 2QAFA 2VFDA 1M7OA 3IVTA 3GDTA 4Z08A 3GDMA 3HPXA 5G2HA 4IX2A 2YDAA 3TFCA 4N02A 2V5LA 1KFKA 3GDLA 3NXFA 4XBKA 3EXTA 3LXCA 1V7YA 4NJGA 5U4NA 5K9XA 1W3NA 3NG3A 5GVJA 2VFEA 1IGSA 2ZRUA 1TPEA 3JR2A 2J9XA 4UTWC 1RQHA 1AG1O 2FTPA 3W76A 1O5XA 1W0MA 3TSDA 3G0SA 1GVSA 4MFEA 5EBUA 1TJRA 3LCHA 4D2JA 1LP6A 1EP2A 2X1TA 4JDYA 4FO4A 3L0KA 2NUXA 3DKJA 3M6YA 3E49A 4PODA 2RDWA 3GDKA 5C54A 3U6WA 1EUAA 3FKRA 3MI2A 5D2XA 3MBFA 4N9DA 4RLIA 1QNVA 2QCNA 4ZVJA 4A22A 1KFEA 1LCOA 4Q4KA 1X1OA 3T78A 3IIVA 4A29A 2J24A 1VHNA 4K8EA 3LXBA 2NXHA 1W3IA 5KZMA 4IMEA 1OFAA 1B57A 3RK8A 3O6DA 5KZDA 1HUVA 3W7MA 3CTLA 1CX9A 5E93A 4TR9A 4UTHA 1DKWA 3L2IA 4PC8A 1FWNA 3HGOA 3W1PA 3KAOA 3CEUA 2CLLA 4QIUA 2ATSA 5F2LA 5IBXC 3QEZA 5DBUA 4POCA 4FNPA 5KINA 5BMXA 1XBVA 3B0VC 3RFAA 1XM3A 2BWGA 1HL2A 3W7IA 1VQTA 2ZYFA 4QQ3A 4S1FA 2PRLA 4QISA 3Q37A 1H50A 2E09A 1OK4A 5F4SA 3NQEA 3QF0A 4MY1A 3ZWSA 3QW4B 3NAVA 4MZYA 1H62A 3FJ6A 3EWZA 1TIMA 2ZZ2A 1H60A 4MKNA 4U28A 2JK2A 2BLEA 2PE4A 3W7LA 3E12A 1SSGA 2G5WA 2Z6IA 4AHPA 3GXPA 3W1MA 1ZENA 1RQEA 4UTLA 4BWLA 3QZEA 2YSWA 3UQNA 1GQNA 3LB0A 4NNBA 4TO8A 1AMKA 3C8FA 4TU1A 3UPWA 3LI0A 4JYFA 4AH7A 2NUYA 2W6RA 3MP5A 3SW6A 4GNJA 3A5VA 1MEWA 2BX7A 3P82A 4FNTA 2ABBA 2FIQA 3M5VA 3NL3A 4ZQCA 2NWSA 4O1AA 1H7PA 1L9WA 3L9CA 4GRSA 5C2XA 1QWGA 3Q58A 4NNAA 4JDBA 3NZ1A 1CI1A 5DXXA 2GOUA 3C2EA 3GKAA 2E6AA 4GUIA 2HS6A 4ZQPA 4FX8A 1RV8A 2Y62A 3NQ7A 2EPHA 1TRIA 1TQXA 4ONVA 5DCEA 4O12A 5D2TA 3UY8A 1PVNA 4DO4A 3G1XA 3W2LA 3ZFHA 4Z0SA 2WSQA 1GZGA 3DU0A 2FQIA 2A7PA 1EWDA 1DQWA 3EWXA 5D30A 5G5IA 2ZDRA 4WJEA 3TU9A 2VEMA 3PG9A 4AMAA 1FUYA 3WJSA 2FPVA 3LCGA 3R13A 1KTBA 1SSDA 4UFHA 5G2IA 3Q2DA 1LBLA 1TB3A 2OMAA 1PHWA 4BI6A 4QJ1A 5BMWA 1YTKA 5EMUA 3UWVA 2Y63A 5CZTA 4IGHA 3TROA 4O50A 2RHGA 1TPB1 1SU5A 3W1UA 1P1XA 2QCHA 3W2UA 1W5MA 1DJNA 4O19A 1AW1A 4UTUA 3L5MA 3VFLA 1P0NA 4X22A 2F7FA 2Z1BA 4NUWA 4R7JA 3IIZA 2DZPA 3DFNA 3QW3A 3TXZA 3EKZA 3NQMA 1K8YA 3TJLA 1N55A 1XXXA 4Z1BA 4Z1DA 2QUVA 2BXVA 3YPIA 2H8ZA 1AW5A 4M5PA 1DJQA 3G1SA 3F1QA 3VE7A 2WQPA 4WY0F 3B05A 2V2HA 3MMTA 4JTLA 2ZRXA 1HG3A 1ONRA 5HWMA 5DCBA 3W86A 5IM51 2Y61A 2YFOA 1GT8A 3ELFA 3JRKA 2OJPA 3VNDA 1JQVA 3PVFA 1SW0A 1TTJA 3W73A 3I6RA 1TTQA 3W7PA 3B0PA 2JBMA 3QSRA 1JCNA 2BTMA 3BW2A 4LRTA 4JX6A 1SR9A 4MVAA 2PURA 3W84A 3NA8A 3SFKA 2I9EA 2V2DA 2ZRWA 5AN7A 1LYXA 2Z2UA 1F73A 2NV1A 4O1DA 2RDUA 2JKPA 1W54A 1DBTA 1VH7A 3TH6A 4FX7A 3UYCA 1PV8A 2CU0A 3W83A 2QCGA 4WXYA 4YWIA 3USBA 5I3IA 2Y6ZA 1H5YA 4UR8A 5KSWA 1FWTA 5KZEA 3FJLA 4AEOA 2YGYA 3HMJG 4PTNA 1UUMA 3MUXA 2TSYA 2YYUA 4WQ6A 5G2WA 2A0NA 1VCGA 3IV3A 3TX9A 1I2QA 1A5SA 2RKXA 4IMDA 1FWSA 4O57A 3CIXA 3EWUA 1KFCA 3B06A 1JCXA 4O1BA 3G24A 4RK8A 1K7XA 4YMZA 1WDWA 3KX6A 1YADA 3C52A 4JS3A 1YPFA 3I68A 4RR4A 4BR1A 4P61A 2DZTA 4LW7A 2ZZ3A 5HQEA 5FF0A 1N8FA 4Y9AA 1QPQA 2F84A 4HIBA 4FNRA 4O14A 3CHVA 5C55A 3UWWA 4IXHA 5HR7A 1Q45A 3M44A 3GXTA 2VEPA 3W2MA 3BO9A 3L0GA 1R30A 2V81A 3PULA 3FYOA 2ZQ0A 5CSSA 4MY9A 2ALDA 3KRSA 2A2IA 1Z44A 3BG3A 5BRBA 6TIMA 3W7KA 3W9ZA 3GAKA 3TC7A 2DJXA 2G96A 2C6QA 2HTMA 4PCFA 4O8RA 3FA5A 3W1QA 5AC8A 1KFJA 1FCVA 1Q6QA 4OWGA 1LRTA 4UTTA 5CZSA 3SECA 1SO5A 1XC4A 4JEQA 4JYDA 3M47A 4MJZA 2QKFA 2A7RA 1VGAA 1K7EA 4LC6A 3LBCA 3IGXA 1MZHA 5FF4A 1QPNA 2Y88A 1YTEA 3RNDA 3G3MA 4MUZA 4CNNA 1T99A 3PSVA 1H7NA 2Q3RA 4WZHA 5AB3A 2CFFA 2D73A 1KBJA 5I3GA 1OG0A 3S1XA 4WXZA 3M7WA 1JUBA 1TQJA 3O6CA 1FWRA 4OHQA 4LV4A 1NFBA 3LM7A 2BSLA 4UR7A 4ORIA 1H7RA 3DZ1A 3PC0A 3CU2A 2GUUA 3PBUA 3O15A 2WSRA 3L67A 1K3UA 1IXNA 1EIXA 3E0IA 3UD6A 3TC6A 1F6KA 3VCRA 4JR5A 1G7VA 3LX9A 1WV2A 3A23A 1ME9A 2OZ0A 4ZQNA 3PUOA 4IWWA 3MP3A 4GJ1A 2FFCA 1NF7A 1WOAA 3FYPA 3L66A 3WK1A 3TFXA 4MY8A 1K7FA 1LOQA 4HKPA 4CQ9A 1RQBA 2YW3A 4I7VA 5D38A 4N2YA 3MI6A 2CZ5A 4N4QA 3DBPA 1QPOA 4RKAA 3P5ZA 4C1LA 2QUUA 3DHDA 1OVDA 2Q3OA 5FEPA 1ZALA 3S5ZA 1W37A 3C4UA 2E5DA 1F05A 2FB2A 3L5LA 3OIXA 2CLEA 1FWWA 1JR1A 1H63A 4LVBA 4PL2A 5K3VA 4P2VA 4K7YA 4IX0A 3CWOX 4DPQA 3ABRA 4UTTC 2E68A 5K9CA 1PE1A 1KV5A 3G0UA 4Z1CA 1FX6A 3HG5A 4K6AA 5G4WA 1TCDA 3NO5A 3NQCA 5I3JA 3STCA 1KM2A 3UPBA 1H7OA 4GXMA 1VLIA 4FNQA 1GG0A 3HG2A 3PG8A 3WK2A 3W70A 4NJHA 4AVFA 3NM3A 3LTYA 3ZS4A 4AHQA 1B3OA 4LRSA 1SO3A 1YXYA 2QUTA 1DL3A 2FPTA 4LY8A 1ZJIA 1ICSA 3AJXA 2XN0A 1QFEA 1N7KA 2B4GA 2NX9A 1YXDA 2ZZ7A 3NOEA 3W7NA 2QDHA 3NPVA 1VS1A 3IGSA 5K4XA 1O94A 1GVFA 5J5DA 5D33A 1VLWA 2CZEA 4X9SA 3LCLA 2P1FA 1C29A 2FJKA 3GNNA 2WV8A 2E6FA 4XTDA 4DQWA 2YX0A 2Y85A 1QOPA 3DKLA 2ZZ6A 3HGSA 3C2VA 4M19A 4NXSA 1A5CA 3LCFA 3EX3A 2DU2A 1EA0A 2FLIA 3G1FA 1TPVA 1VR6A 5D2VA 5HMSA 1OK6A 3THAA 1LBFA 1IIGA 3T7VA 4WOQA 1H51A 5DN1A 2QCMA 1J2WA 2ZBTA 4FNSA 4NXKA 5CPMA 4O13A 3C6CA 1TPUA 1OFEA 1TPWA 1ZNNA 5AHIA 1ADOA 1WAUA 1SFJA 1H61A 3MHUA 1QO2A 2GVLA 3HIJA 4NNCA 3GNDA 3EWBX 3A22A 1WBJA 1MSSA 5E1QA 3EWYA 3U2OA 1RPXA 1F7BA 3QJAA 4EF8A 4JTIA 2QDGA 3DFTA 4AXKA 2W0UA 3BG9A 3S8HA 4JYEA 1KM5A 1KLZA 3RLUA 1B4KA 2C3ZA 4MIMA 3CC1A 4O4WA 1XL9A 1W31A 2DZVA 3TW6A 1RVGA 1G7UA 1OFRA 3WJYA 4UIOA 2Y7FA 5CKSA 1OX5A 2NXGA 1A5BA 3SZ8A 3G8EA 1Z41A 3ABSA 3NPXA 1OYBA 5BW6A 2J9YA 3O1NA 4DO5A 2RFGA 2OT0A 5BOOA 3KVLA 1X8FA 4UTJA 4IXXA 3BLFA 5FF3A 3ATYA 3TKFA 1J5TA 4UFMA 1IXPA 1P5BA 4RZ6A 4BK9A 1FBAA 3W7JA 1GTEA 1SQ7A 3O63A 1M7PA 2X1UA 1DHPA 3Q94A 4O28A 1TRDA 1AL7A 1UASA 2FPYA 4M7SA 2CZDA 4ML9A 2YW4A 3NQDA 2E5BA 3NQAA 1KTCA 3W7EA 2WJZA 5I3HA 5LHFA 3IEBA 2NV2A 1X7FA 1SFLA 3N14A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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