4MNEA

Crystal structure of the braf:mek1 complex
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
317
structure length
286
Chain Sequence
LKDDDFEKISELGAGNGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKGLTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIPPPDAKELELMPPMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADLKQLMVHAFIKRSDAEEVDFAGWLCSTI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the BRAF-MEK Complex Reveals a Kinase Activity Independent Role for BRAF in MAPK Signaling.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 91
structure length 286
sequence length 317
chains with identical sequence D, E, H
ec nomenclature ec 2.7.12.2: Mitogen-activated protein kinase kinase.
pdb deposition date 2013-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4mneA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4mneA01
2J0JA 3NNWA 5HESA 3BU3A 4Z16A 4A07A 4H05A 4FEWA 4H1JA 4YURA 4BCJA 3F88A 3F3WA 4GV1A 5HIEA 3RAIA 4IX3A 3GC7A 1Z5MA 3GOPA 4GFMA 4AN9A 4HGSA 3RBWA 3QKMA 5KMJA 3CJFA 4BBEA 4HVDA 2KTYA 4LQMA 4FK3A 4CZYB 5EI6A 1APME 3I0OA 5HE3A 4R6VA 2WKMA 1JLUE 5ETFA 3W2PA 4NTTA 3GC0A 2C3LA 2WTIA 2JKMA 3CPBA 4HJOA 3DLSA 5CU2A 4BVUA 4CLIA 4GVJA 2WU7A 2PUPA 2YCFA 1QMZA 4NEUA 3G9LX 4JG7A 4UX9A 1PF8A 3EJ1A 5IDPA 3PIZA 4GIHA 5M4IA 3RAKA 3E8EA 4OTWA 3F5GA 1OM1A 3IDPA 4JQ7A 4M15A 2YDJA 1MRVA 4O7ZA 2BRHA 5JQ8A 4EK3A 2X1NA 1CSNA 4DEEA 2EWAA 5K5XA 3NUAA 4OUCA 3E5AA 4J1RA 4DEAA 3VS4A 3WIKA 3EQPA 4D2PA 4RC3A 2PVJA 4R8QA 3MB6A 4FTIA 4FV9A 5CWZA 3ZSIA 3VF9A 4E6AA 5M06A 3ORIA 1TVOA 4E6QA 5I9ZA 1MRYA 4BIEA 3R71A 3C1XA 3A4OX 3PG1A 4ALUA 3PDTA 3U55A 2I0VA 4NM0A 4G3DA 3UVQA 2PVLA 5M4UA 1XO2B 2YM3A 5BUIA 4F9AA 1CM8A 5AX9A 3C4ZA 3RPVA 1OPJA 4NCTA 3ANRA 5KMMA 4CKIA 5HU3A 5L8LA 5DR2A 3H9FA 4DLJA 4TPTA 1OGUA 2V7OA 4GG5A 5AP1A 4MD9E 1IEPA 2YAAA 3ACKA 4F1MA 1GAGA 4IWPA 2GFSA 1URWA 4BCHA 5A4EA 4CFWA 5CSHA 4AU8A 5BVDA 2YCQA 4RWIA 3TG1A 3R7VA 3BLHA 4IX6A 4RIYA 2W5HA 1OB3A 3PA5A 4DH7A 3UVPA 2V7AA 2PK9A 4N4SA 5FXSA 2A27A 2PSQA 3HDNA 3AC8A 4JVGA 4JIKA 3DK6A 3BRBA 4EOKA 4XRLA 2QOHA 3S1HA 3MY5A 4K6ZA 4PTCA 2ONLA 2VNYA 3O0GA 4EH9A 2WMAA 3EB0A 2GNIA 3TUCA 2XK9A 5CEOA 2ZJWA 3F3VA 4J7BA 5AA8A 3SDJA 3LVPA 3R00A 2BRMA 2BPMA 1WBTA 4BGGA 4FGBA 4BBMA 3I79A 4C2WA 3NYNA 4FSWA 1P4OA 1YDTE 3V5LA 3DCVA 4NM3A 1WAKA 1H01A 3C4FA 1OBDA 2P33A 4IVCA 4FV0A 3TL8A 1R3CA 4O0VA 5HEZA 2J0KA 5DPVA 4C8BA 2CSNA 3U87A 4G9RA 1H1PA 2OJJA 3UNJA 5C9CA 3VNTA 1OIUA 3LXLA 4RQKA 2XP2A 5J9YA 5EM8A 4IVDA 3K54A 2B55A 3O50A 3QUDA 4YC3A 4TNBA 3V6SA 3VBWA 4X2GA 5AAGA 4JRNA 4QP7A 5EW9A 2W99B 1PXMA 5FP6A 5C4KA 3RNIA 2PL0A 4RWKA 4EYJA 1XH6A 1X8BA 4QMMA 1BL7A 2UVZA 4MF0A 2AC3A 3CP9A 1PXLA 3ZO1A 3SOCA 4IZ7A 2ZB1A 5M57A 5KMLA 1PXIA 4G3CA 4WNPA 4F1TA 4ZMFA 3NGAA 4Z55A 3VW8A 2W1EA 4PL3A 2RKUA 3CBLA 2YM7A 4QYEA 4K18A 5CI7A 3T3UA 5ETCA 3OY1A 1BL6A 3VIDA 3MFTA 3THBA 3VULA 2OLCA 4XRJA 4JQ8A 4FZ6A 1H24A 4CMUA 4C2VA 3DBFA 4W4YA 4QTBA 1PMVA 2F2UA 4IMYA 5TKDA 2E2BA 1ZOEA 5DE2A 2DWBA 2EB2A 2WGJA 4KIOA 2WELA 4U6RA 4O7SA 4MNEA 4UZHA 4EH5A 3TNIA 1VEBA 4QMYA 5CU0A 4EQUA 4OBOA 4BICA 3GP0A 4B7TA 3QC4A 3PJ8A 1VJYA 1CTPE 2OGVA 4FIHA 3QF9A 4NZWB 1YXSA 3ODYX 1ZYJA 4NFNA 4R3CA 4ZY6A 3ZO4A 5LOHA 4HZRA 4FG9A 4AE6A 4I6HA 3OY3A 5LMAA 1SVGA 4BDKA 2HK5A 4X2JA 1AD5A 2Y4PA 4EKKA 2VU3A 4J96A 2QKRA 4D1ZA 2VAGA 4DCEA 4ZZOA 3MESA 3NW6A 4M68A 4OTPA 5M09A 5AV3A 2HAKA 3B8RA 4XJ0A 3ZZEA 4EWQA 4X2FA 3FKNA 3OOGA 2PUUA 3QCXA 4FSQA 2QLUA 4D4YA 3NMUF 2W5AA 2OJIA 4S33A 4K8AA 4EOSA 2PWLA 2XKEA 4C35A 1VR2A 3NS9A 3VF8A 5HNBA 4BDDA 3HMMA 2BILB 4ZS0A 3PG3A 5FUTA 2DQ7X 3PWYA 5D7AA 5FBOA 3TUBA 4FL2A 4FZDB 3JY0A 2W17A 5LARA 5IUGA 3HMOA 3QTZA 3HV3A 3KK9A 3D9VA 4TYIA 4C38A 4ZTNA 3CKXA 5B2LA 2ZMCA 4TRLA 4AACA 4OBQA 3OT3A 2XNMA 3TZ9A 4UBAA 2V55A 3FUPA 4N6YA 5FLFA 4HVSA 3EMGA 4DTBA 1JAMA 4PP9A 1H0VA 3NNXA 4BDIA 1DS5A 1EH4A 1WBSA 3RAHA 1OL6A 4NCTC 3P7CA 4RJ6A 2IZRA 1UKIA 2ITWA 1L8TA 4RIOA 3KXZA 3BHTA 4R5YA 3ZDUA 2WQEA 4EKLA 4ZAUA 2ETRA 4DTAA 1H00A 5HO6A 3CPCA 3NZ0A 3N9XA 5AR3A 5CEKA 2PTKA 3TNHA 1XJDA 2OXXA 4TYJA 5ANEA 4DTKA 4G2FA 5HIBA 3H4JA 3I81A 2R0UA 4RIWB 2B0QA 3TZ8A 4RIXB 4I20A 4D9UA 4QMPA 1YKRA 2B1PA 3R2YA 3E8CA 2IVTA 4U42A 2VD5A 3BPRA 4IW0A 1ZMUA 5HORA 2JFLA 3CKWA 1M52A 2VTAA 3GU8A 3ZXTA 4NM5A 4D55A 5ACKA 4FKIA 4BL1A 4DFBA 1UU7A 2ONLC 3S0OA 5FRIA 1R0EA 5HLPA 2YITA 4EBWA 2QKWB 3MGYA 3UQGA 3K3IA 5J79A 3VVHA 3RHXA 3MJ2A 4FTQA 4ZLOA 2A4LA 1H25A 3AXWA 3FLQA 3IW4A 5FM3A 3DOGA 1JKLA 1SZMA 3NUXA 3FZRA 3JVSA 5ANDA 3ZCLA 3UNKA 2QHMA 2Y6MA 2GTMA 1H07A 5KBQA 2BZIB 5DT4A 4CMTA 4RGJA 4IB5A 3LM0A 3SKCA 2BFXA 3ZYAA 4WT6A 4I5HA 3T8OA 3W55A 4M97A 3OWKA 4QP8A 4E5AX 2PZ5A 3TDWA 4L44A 4PDSA 3EIDA 5L2TA 1J3HA 2X7FA 4FOBA 4YJRA 5AWMA 3N4VA 2BZKB 3QQLA 3W1FA 5IA0A 3PJ1A 3UVRA 4AGDA 2VTPA 2RFNA 3BYVA 2IW8A 4DYMA 4DINA 3SA0A 5GIOE 5CQUA 1U5RA 3AD4A 5HZNA 2QD9A 3D7TA 5L2WA 3ZH8A 5J1VA 3BEGA 2HY81 2V22A 3QX2A 3MIAA 5BUEA 5AFVA 5EM6A 2IO6A 4U8ZA 4IAZA 2I0HA 3ENHA 3G51A 5E8SA 1AGWA 1M17A 3UDBA 3QA8A 4D28A 5L8JA 2RFDA 4DFNA 3ERKA 4MBIA 2JBPA 4ZSGA 5HHWA 5CF5A 5DNRA 5IQBA 4C62A 3AG9A 4FSYA 3DU8A 5CQWA 3RZFA 4N6ZA 5B0XA 3LXNA 3TM0A 3HP5A 2HZ0A 3SC1A 4IH8A 4M8TA 3U9CA 3BIZA 4QTCA 4RVMA 4I5PA 4O7TA 1DI8A 4B99A 2Z7SA 2QG7A 5J7HA 3CLYA 3G2FA 4GU6A 5E92A 2YM6A 3KU2A 5CU3A 4GMYA 2VX0A 3OFMA 2BUJA 2QOQA 5HI2A 2PMOX 3U51A 3W10A 4F6UA 4NTSA 4X3FB 3FQHA 5GJFA 3RPSA 4GFOA 3N51A 4DG3E 4X6RA 3A7HA 4DCAA 2ERKA 3KXNA 2J4ZA 3TJCA 2ERZE 3BBTB 1MP8A 4N57A 4PV0A 3PRFA 3EQIA 5CSXA 2JDRA 3Q2MA 4BBFA 3SVVA 4ZLYA 3HRCA 4FV4A 3E93A 4G6OA 3TACA 3VAPA 1GZNA 4PMSA 4TWPA 2BCJA 2V5QA 2CKEA 4FEUA 3TJDA 4BKJA 4M69A 3ATSA 1NA7A 3P86A 3DB8A 1QPJA 4D4VA 2Y8OA 3BYSA 4IZAA 4JR7A 3Q4ZA 3BZ3A 3ELJA 4IJ9A 2HWOA 4PPBA 4C3RA 4EH8A 2CKOA 4ZZMA 2R5TA 2OXDA 3G0FA 5FWKK 4IC8A 3TWJA 1ZAOA 2PVNA 4BHNA 4IB1A 4W4XA 1LEWA 3P0MA 3PSDA 4RSSA 3QWKA 2FVDA 2VO3A 4FODA 4WG4A 4W8EA 1NXKA 3GT8A 3ODZX 5FTQA 5HE2A 3WBLA 5AR7A 3OOMA 3D2IA 2YM5A 4HPTE 2IZTA 4ZTHA 4MXXA 3OT8A 5C03A 5IH6A 5DWRA 3R9NA 3C4EA 4L01A 5I9UA 5CSWA 5KZIA 2LAVA 2XRWA 3ZRKA 4YTHA 3LAUA 2XK3A 3ORPA 4I24A 2W1GA 5FBNC 3UC4A 2YERA 5A4LA 4GT5A 3Q04A 2Z7RA 4AW2A 3F2RA 4WNKA 3AGLA 2YIWA 4EJNA 4QQJA 5J7BA 2PVHA 1DAYA 2XJ1A 3C7QA 3F3UA 2R3IA 2J0MB 3DK3A 3RM6A 3JYAA 2C1AA 3ZS5A 3LCOA 2A19B 3O8UA 4LGGA 2BZHB 3O2MA 3UMWA 4PL5A 3BGPA 3C0GA 4GU9A 4I94A 3VBTA 4O7LA 2WB8A 1BLXA 3PA4A 4XG3A 3MTFA 3F2NA 2QCSA 5IZFA 4W4WA 5BVKA 3DDQA 4E8AA 1G5SA 2VTIA 3ZOSA 4C4HA 2CNQA 3DJ5A 3H0ZA 1UNLA 4JBOA 1JPAA 3CY3A 4MXZA 3FZTA 4I41A 3DBEA 3ORMA 2YLEA 3PJCA 4YBKA 3H30A 3ZZWA 4U0IA 3ZFXA 4L3PA 3ORKA 4MYGA 3GGFA 4QP2A 4DEGA 4FSRA 3LCDA 3LE6A 4N70A 5DI1A 3OWPA 5L2QA 3R8LA 2GU8A 5BYZA 2GQSA 3UOKA 4I6FA 5IA2A 4MNFA 5JRQA 1BUHA 2GCDA 2X7GA 5ETAA 4Q9ZA 4PDOA 3QWJA 2C1BA 1H08A 2H96A 3NUPA 3A62A 4FC0A 3IW8A 4BCMA 1SNXA 4TYGA 4JS8A 3A61A 3IQ7A 5EHOA 3D5VA 4MWHA 1H1RA 3LMIA 1UWJA 4QRCA 4FNXA 2V0DA 4Z7HA 4M0ZA 4G5JA 4QNAA 5GINE 2O8YA 3AOXA 4PY1A 4K11A 3R02A 4LYNA 3R7UA 3IW6A 2W1IA 2X2MA 2CGXA 4F6SA 2GMXA 3EYGA 4U5JA 4EH7A 4FV3A 3ORTA 2AC5A 4O7WA 2GNJA 4D0XA 4KKGA 1DI9A 3QTWA 4R1VA 5AP3A 3TN8A 3QX4A 1RDQE 4UN0C 3UZTA 2YAKA 4XS2A 5EI2A 4FT3A 3OG7A 2BIYA 2WIHA 5HD4A 3QRKA 3FMMA 4M14A 4XHKB 4KRCA 4NSTA 3PPKA 4XLVA 4UYAA 4CRLA 3QA0A 1E1XA 3E62A 4Q5HA 5C8NA 2UV2A 3FY0A 3LCKA 4E5BA 4BGHA 3REPA 4IM0A 3UO5A 2V62A 1QPEA 4FTTA 4TYHA 1PMUA 5J1WA 4MAOA 2YIQA 1ZARA 5C01A 3FQEA 5TT7A 4O0TA 3R6XA 2XCKA 4J8MA 3AQVA 3KA0A 3C4XA 3QZGA 4XNEA 4I22A 5CLPA 3V5QA 3LLTA 3R8VA 3NSZA 4EWHA 3QQKA 4KKHA 4NWMA 5AUVA 4YZNA 3I6WA 5AR8A 3ATTA 2X6EA 3EYHA 3MVJA 2XNPA 4JX7A 4LG4A 3OCBA 3UOHA 3UG2A 3FZSA 5HX8A 4FTKA 3GENA 3CD3A 3E3BX 3VS3A 4PPCA 4YZMA 3L8VA 4BCIA 2QU5A 3DKFA 4NM7A 1URCA 2RF9A 4KB8A 2XK7A 5EYDA 3FYJX 2QLQA 2WTWA 3F5XA 3A7FA 5F9EA 3GUBA 5EOLA 4JBVA 3OVVA 4BRXA 3ZSGA 4FTNA 5HCYA 4O1PA 3JY9A 5BMSA 3P78A 3D4QA 3DQXA 3EL7A 3GFWA 1OL5A 1U46A 3P08A 2OXYA 4FTUA 3BQRA 4QOXA 1JWHA 3KMWA 4IAAA 5ANJA 2CN8A 3GB2A 4WUAA 4CVAA 4DEBA 4C37A 4F09A 4FKGA 4RQVA 3VHKA 1U5QA 3DK7A 4P2KA 4BF2A 2I1MA 4HGTA 4J53A 3UZPA 2QI8A 4AT4A 3CCNA 2GHMA 3W33A 3IGOA 4IM2A 5CVFA 2PVMA 2XK6A 1XH8A 3HRFA 4WD5A 5AV0A 4DT8A 1GY3A 3OP5A 3COMA 5K4JA 5IKWA 2Z7LA 5JFXA 3W8QA 4FKWA 3DXNA 3HMNA 4I6QA 3VUKA 5FP5A 4ASZA 1H0WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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