4MNMA

Crystal structure of gh18 chitinase (g77w/e119q mutant) from cycas revoluta in complex with (glcnac)4
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
ALKVGFWPAYSVSEFPPSKINSRLFTHLYYAFAELNAPTFEVRVPPGSEKTAEDFTPTVRRLNPSVKTLISIGGWGSEVRDNFAKLNSDASARQRFVKSSIALARRYGFHGLDLDYQYPEPQLEMENFVKLVSELTAAIREEARTSGKPRLLLTEAVYFHQKLFPWEVVTEYPVQFIAAGLDWVNVMAYDFHGSWENFTGAPAALRDPNSKFTASVGIESFLAAGMPPEKLVLGIPLFGRSWLLKNNNEVGIGAPAVGAGPVDGALSFSEIQNFIRGGAREVFDTTTVSAYAYKDNVWVGYDNQQSVALKVQYAKEKRLGGYFFWSVNQDIDAILPKIASDTWG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of GH18 Chitinase from Cycad, Cycas revoluta
rcsb
molecule keywords Chitinase A
molecule tags Hydrolase
source organism Cycas revoluta
total genus 122
structure length 344
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4mnmA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4mnmA01
3UG4A 2EPLX 4BCEA 1CTNA 1G0CA 5CPQA 1CGVA 2ZICA 1QI0A 4JL1A 3A3HA 3KL5A 2XGBA 3W6MA 4MDPA 3AICA 1X1NA 1B3ZA 2WLZA 2E8YA 2DSUA 1JZ7A 1BG4A 2BXZA 3WEMA 2XWEA 1UWRA 4JKMA 3SCRA 5BRQA 5E0FA 4B16A 1WCGA 3GTNA 4C7DA 1XCWA 2W92A 3WL0A 3WQ4A 1E9LA 3EDDA 3VGDA 1UWUA 4D6FA 4PCTA 1GVYA 1J9YA 5E9AA 2XGIA 4TX8A 4Z2HA 1HJSA 3WDJA 1H5VA 3IJ7A 4U33A 1B30A 3AHYA 4NZCA 1BVZA 3WH9A 2CPUA 2IUZA 3CZEA 6CGTA 3OGSA 3KWXA 2WC4A 1GORA 3BAXA 2V3GA 1C91A 4WKAA 4U5IA 4LGXA 4CVUA 2EJ1A 1NOFA 3FXYA 4GQQA 4CD8A 4CN1A 1UKQA 3RJXA 1JDCA 1HP4A 1XSJA 4PMNA 4JL2A 3W27A 2VZOA 2PWHA 2J8FA 1CGTA 1PX3A 1GW1A 3G6LA 5A95A 4WK9A 2BY3A 3FAWA 3EDEA 3UG5A 2WMGA 1NARA 1C92A 3L4XA 2YOCA 2OSXA 2QV4A 4NRSA 2VRKA 4XB3A 2WCGA 4WKHA 1X6NA 2W5FA 1UD2A 1PX4A 4YHEA 5LA0A 1I75A 3WQ8A 2ZXBA 2ESCA 5E6YA 1UWIA 4PMQA 3ZJ7A 1E71M 2XVNA 2O9OA 1EXPA 5KEZA 1J0KA 2D3LA 4PTWA 1FH8A 1F4AA 4JFUA 1HXJA 5I77A 1KGUA 1GNXA 5BRPA 2PWGA 3CZ8A 5AC5A 1JZ6A 4JIEA 1BQCA 4JCMA 2WPGA 3BSGA 1PIFA 3PZIA 2DIEA 2XIIA 3AS0A 1JDAA 8A3HA 1KR0A 2C8NA 1HP5A 4AZCB 1E6SM 4ZENA 1VBUA 4MNJA 3AISA 4D6JA 3DYPA 4M56A 4CCEA 4UQCA 2A3EA 1EHNA 4UCFA 2VCCA 4AZCA 5D8WA 1QOXA 1JYXA 5ABEA 3MMUA 3NUKA 4J27A 1QNRA 5CG0A 2EPKX 2YLLA 1B2YA 1XRVA 3AJ7A 2XSBA 2WCAA 3HN3A 3WD0A 4OIFA 1V3JA 3WDQA 3ARVA 2ZXAA 1E56A 3HU7A 1GQIA 2WANA 4QAWA 3UR8A 1UA7A 1W3JA 3MANA 4GIAA 4TUFA 1ESWA 3T08A 1GONA 3ZMRA 2UY2A 3WNLA 1TCMA 3CBWA 5I3DA 1PJ9A 4XZWA 3GM8A 4UOQA 4LXFA 5CPSA 1ZBKA 5TD4A 3CZGA 2Y8VA 1MQRA 5I2UA 1HKMA 1E0WA 1J0IA 4QLKA 2X2YA 1QI5A 3WD2A 5GQBA 3B8SA 3VIHA 4HU8A 1FP9A 3B9EA 2QF8A 2FH6A 4OOUA 3SCSA 3FAXA 1XD0A 3K4AA 1VFFA 2FHBA 1QW8A 1YQ2A 5I78A 3GXMA 3QOKA 4JFVA 2OYMA 4ML4A 1WDRA 5E70A 4GO9A 3NSMA 3N17A 1IT0A 2ZXQA 5JBFA 2YDQA 4PSRA 3TTSA 2OYLA 1UR1A 3RM8A 1OT1A 1L0PA 1LL7A 1CPUA 2CEQA 5D8ZA 2AMGA 2JIWA 3A4XA 2VT0A 2YKKA 4IPLA 1US2A 1JD9A 4RE2A 2JFEX 2CETA 2X0HA 3BAIA 3QHNA 1XSIA 4WLCA 4WIWA 1V0NA 4D71A 1AQ0A 4KRUA 1J0ZA 2DSKA 5CQ1A 3CZJA 1K9EA 1N82A 4PUEA 4AIUA 4HMDA 4MB3A 2XG9A 3PBGA 4OZOA 1HN1A 4TXEA 2J7GA 4CD4A 1HKIA 1QHOA 4C7FA 3QHOA 1MW3A 2X1IA 1J18A 2CBJA 1LQ0A 3M7SA 2OWXA 3M6DA 2J77A 1V0KA 1GUVA 2Q8XA 4HOXA 1LJYA 3AXXA 2WMIA 3PZVA 3WN6A 4Z2JA 5BXSA 4D1JA 5A6LA 2V3DA 4PYSA 2V3FA 3AIUA 4N42A 3THCA 1UR8A 2UY5A 5JIPA 1GOOA 1CLVA 4KRTA 3EDJA 1H09A 1GOWA 5GNYA 1JGIA 1JNEA 1UH3A 1TZ7A 1CNVA 5CSUA 3AHTA 4HZ8A 5AC4A 2XM2A 1EGZA 1MWOA 4AD5A 4U3CA 3GNRA 4AD1A 4LX4A 5HPCA 4JKLA 3WQ5A 1FHDA 4D6CA 4W93A 1UD4A 1UD6A 4AZBA 4D6IA 2YJQA 5ECUA 2CERA 2YIHA 1B90A 1ZBWA 3VO0A 3QGVA 3WMCA 2J75A 1GQKA 1GOIA 3M46A 1O6IA 1Y7VA 3N12A 3RO8A 5A8PA 1FP8A 4UOJA 3MV01 3WDHA 3N9KA 5EBAA 5CJ5A 2E3ZA 4FLRA 4UFHA 1QHPA 1V3MA 4NSBA 4GI9A 4URIA 5ABFB 4H2CA 4E8DA 2DSVA 4XX6A 3WF3A 3NJ3A 4HPHA 3AIRA 3TTYA 1PAMA 5ABFA 2DSZA 1PEZA 2VMFA 2OSYA 5CSYA 1V02E 1WNOA 4KH2A 1HX0A 4PMUA 5LYRA 1BTCA 4PRWA 4W8LA 3CGTA 3K8MA 3NYDA 3GNOA 2VCAA 5M5DA 2CBIA 2XFYA 4JAWA 4B3LA 4EAMA 3POHA 1ITXA 1W9DM 1J10A 1VEPA 1UG6A 1BSIA 2E9LA 1OIFA 4P7NA 1NWSA 2XFRA 2XUCA 2CHNA 5A6MA 3AS1A 1UR0A 1E4IA 4TTUA 4TOQA 1V0LA 3BCFA 3T2OA 2ZUVA 1PZ3A 1VBRA 1E5NA 1M04A 4L4OA 2V38A 2DT2A 1EOMA 1BF2A 5BWFA 2AAAA 1U30A 2VX4A 1GPFA 4F9DA 2YL5A 3PZQA 1UD5A 3JUGA 5AY7A 1BG9A 2XVKA 1WAWA 4AD3A 1JYVA 2FDMA 5M17A 3DHUA 2XVLA 4MB5A 2BVDA 2YBUA 2GUYA 2WC3A 2GFTA 3GYCA 1OSEA 1IZJA 3SCQA 2CESA 3EBVA 3PZOA 2G3MA 3OGVA 2X05A 2O9PA 1GHSA 5A8OA 3PN8A 4CU8A 1L8NA 3VD5A 1VB9A 2TAAA 2WMKA 4U5KA 1UYQA 4OKDA 5D9MA 4AZ6A 1JG9A 1VENA 4AZHA 2J4GA 3E1F1 1I1WA 3WMBA 2EQDA 3N1AA 3PZGA 3DYMA 2F2HA 1O7AA 2ZOXA 4K68A 1ISYA 3ZR6A 7CGTA 1ISWA 1QI3A 3TP4A 1GOKA 1LLOA 1QBAA 1UKTA 5DEZA 1DTUA 4QFUA 5DFAA 3VUPA 9CGTA 2E9BA 1JXKA 3UEQA 1HF6A 1W2PA 3AXIA 3SCTA 5EB8A 3ARTA 4BQ2A 1OT2A 1UKPA 1FH7A 1HL8A 2PBGA 4D6HA 2D2OA 3AMDA 1AMYA 1W9PA 2W67A 5A69A 4AZ5A 2FH8A 3OIHA 4J7RA 1FA2A 2WHJA 1R8LA 3ARUA 2O92A 1JIBA 1CXLA 3WNKA 1MFVA 5A6JA 2FGZA 5AYBA 3ZQ9A 3AOFA 3GH4A 1UWTA 3PZUA 1E6QM 4W7UA 3VX0A 2JALA 2WXDM 5E0CA 1UWSA 5BXTA 5LA1A 4PCSA 4U2ZA 1RP8A 1GQLA 1F4HA 5FOOA 1HIZA 4DM2A 4AYSA 4Z2KA 5GNXA 2D24A 4KWUA 2OYKA 2A3HA 1GJWA 5ABGA 3W4RA 4QCEA 1UOKA 4HTYA 2J7DA 3FY1A 3W26A 3AMGA 3BGAA 1E1FA 1BPLB 2J7HA 1E72M 3VIFA 2GJRA 2BNJA 1JZ8A 4U31A 2B31A 1EQPA 3OG2A 4BQ5A 1KCKA 3OLEA 5KZ6A 3VD3A 1ISVA 1JZ2A 2VL4A 4BQ3A 1FHLA 1US3A 3CHDA 2D1ZA 1WDPA 2WMJA 2D20A 2DEPA 2JF6A 3S6TA 3QR3A 4CCCA 3T0DA 5IFTA 3WBEA 1JZ5A 1NWTA 1W3HA 3RILA 1W9VA 2X09A 2GDUA 3AHVA 4P8UA 1E0VA 3VINA 2D0HA 2X0YA 1R87A 1H49A 3EYPA 2W63A 4JFTA 1SYTA 1V3KA 3VVGA 5A6KA 3I3DA 4W5UA 1ZBVA 1TVPA 7A3HA 4V2XA 1B31A 4NRRA 4R27A 4KGJA 1PPIA 3GZAA 4CN4A 4W7VA 1JAEA 1IV8A 1LWJA 5A6BD 3VGFA 1NM9A 1Q6FA 3U57A 1JL8A 2D22A 5A2AA 4DWSC 2UY4A 1DWGM 3ZT7A 2VZSA 2CIPA 4LPCA 3GXDA 1HJWA 3WH6A 3A6OA 5BXPA 5A94A 3CMJA 4DUXA 1WZKA 1M01A 4LYPA 2WB5A 3N04A 2BVTA 3W28A 4Z2GA 2FGLA 1CZ1A 2VX7A 3OLIA 1VJSA 4N0RA 1KXVA 1K6AA 4UQDA 2CKRA 3II1A 1C90A 2CNCA 1CXHA 3ZO9A 3PTKA 5C8BB 3HMCA 1H11A 1W2VA 3L2LA 3OLDA 3O2LA 4B15A 3BXWA 3UR7A 4ATDA 2XJ7A 2VOTA 1XSKA 2G3JA 4P7QA 1XCXA 5EFFA 4MNMA 1C7TA 2J74A 3A4AA 1G9HA 2DT0A 1VJZA 1ODZA 4M29A 3WF2A 4CD6A 4QP0A 4IM4A 3WDIA 1K9FA 1XD1A 2E0PA 3CUFA 3MUIA 2NW0A 1LF1A 2WHMA 1HT6A 2GK1B 2ZX8A 5ABHA 5A2CA 4LYRA 1ZB5A 1BFNA 1GZJA 1WP6A 4GQRA 1E70M 3GXFA 3RDKA 2WBKA 3AIEA 5C71A 2GK1A 1BGAA 1SMDA 3T0AA 1CGXA 1UQYA 4UZSA 3K46A 3WUEA 1JF6A 1J01A 3PTMA 4DWSD 3OBAA 2NSXA 1QNQA 4GINA 4PEEA 4E4PA 1VEMA 2VVSA 1H3GA 4IPNB 3F4VA 5IDIA 3W81A 1MXGA 7TAAA 5IHRA 4MTVA 4BA0A 2CITA 4UFLA 3VM7A 3CMGA 4PMYA 3AIQA 3WNNA 1V6UA 3DC0A 1E0XA 1BYDA 2C0HA 4AD4A 3FNDA 4OOZA 4PTVA 1C8QA 1B3YA 4FLQA 2YL6A 4MNLA 3SEPA 4AXNA 4MADA 4X0VA 3I3EA 1G01A 4L4PA 3I3BA 4D6DA 5C70A 3APGA 1VEOA 3S2CA 1CGYA 1JZ4A 3VGGA 4BZYA 3T0BA 2XHYA 3AZTA 4B9YA 4RE3A 4AZ7A 1R7OA 3ZIZA 1XH2A 3NIYA 3CZKA 2PC8A 4H7VA 4HU0A 4BQ4A 3W25A 4W88A 2BHZA 2RGMA 3F5LA 3AS3A 1X6LA 3OZOA 4UZUA 1CGWA 3ZT5A 1Q6CA 1XYFA 5A3HA 1E55A 3W29A 2XVPA 1KBKA 4MNKA 1NQ6A 4WSJA 1CXKA 1DWHM 4PSPA 1GOMA 4AC1X 3QOMA 3AZRA 2G8ZA 2W91A 5JBEA 4UTFA 3VU2A 4EANA 4CGTA 3DHPA 4AW7A 4YHGA 2ZE0A 2BHUA 1W1YA 1BYAA 3PHAA 1DP0A 3F5KA 3NCOA 4PMZA 3T2PA 3LPOA 4P8VA 4M8UA 3WIJA 1KXQA 1WB0A 1OIMA 1KGXA 1ZS2A 4DUVA 1CXEA 4JKKA 2VR4A 2DDXA 2Y8KA 3U7BA 2DH2A 1UH2A 4MB4A 4UFMA 1HKJA 3MSGA 2VZUA 1J12A 1B9ZA 3IJ8A 4JHOA 1G94A 4H41A 1D7FA 3KEHA 4UNIA 1D3CA 3N11A 2XFFA 4CD5A 4P8WA 1CEOA 3VIKA 2UY3A 2PI6A 3VNYA 3VMNA 1Z32X 1W1TA 2YDRA 2DGAA 3EDFA 4FMVA 1DWAM 4CU7A 3VX1A 1TFVA 3UESA 2J79A 1MVYA 1M53A 3CTTA 3VOCA 1CIUA 3BC9A 1DWIM 3L4WA 3WENA 1MXDA 4QLJA 3WD1A 4GZEA 3CHEA 1E4LA 1LG2A 4E8CA 3AMKA 3WNMA 8CGTA 1KCLA 4Q22A 2J7BA 4DUWA 3UETA 3CIVA 1E40A 1ZBCA 1HKKA 3WUBA 4D72A 2HVMA 3THDA 4M1RA 3VPLA 5CZKA 3ZJ8A 1W1PA 3NSXA 2CCRA 5IXEA 1ISZA 1BGGA 3KE0A 1CLXA 4H8VA 1FOBA 4E2OA 2G4FA 1TA3B 4YN5A 4GI6A 2QMKA 1NP2A 1PZ2A 1KQZA 4UQ9A 2VRQA 1JDDA 4AZIA 1TA3A 3SCNA 1H4PA 2BY0A 1VFOA 2VI0A 1H1NA 1UD3A 1VFUA 3W24A 2A3AA 5A6AA 4W84A 3DYOA 5CPTA 4CD7A 4BF7A 4UFKA 2BXYA 4PTMA 1GVIA 2HISA 3VDAA 2A3CA 1S46A 4UFJA 1IZKA 1MQPA 2VQTA 1HVXA 4AEEA 3AYSA 3VDCA 3WKZA 3VGHA 1WE5A 5FCZA 3RCNA 3FW6A 1ITCA 2E4TA 4AIOA 1E6XM 1XH1A 2FHCA 4PMVA 3IAPA 1NOUA 4HPGA 3BLKA 1UZ1A 5HOSA 1KWGA 3WQ6A 4EE9A 4WJXA 5JBDA 2WWCA 5FIPA 1UKSA 4D1IA 4AD0A 1KXTA 2JEPA 4B3KA 1PX8A 2E9MA 1EDGA 3OZPA 4CKQA 1VIWA 3AIWA 4CCDA 3ARYA 4W8AA 3VIPA 1M7XA 3MSDA 2PWDA 3ARPA 2WM0A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2XVG A;  1CXI A;  1TVN A;  4LQ1 A;  1J0Y A;  1JZ3 A;  4ACZ A;  3CUG A;  2OWC A;  1TG7 A;  4AMC A;  2J7E A;  2YA2 A;  1LL6 A;  2QMJ A;  2YL9 A;  3IAQ A;  2Z1K A;  6A3H A;  4QCF A;  3WF0 A;  4IUG A;  1KFW A;  1VRX A;  3BSH A;  5DMY A;  5JIW A;  5BXR A;  4KMQ A;  2BY2 A;  1U2Y A;  1JAK A;  1QHZ A;  2CBU A;  1V02 A;  1WO2 A;  1CDG A;  1EQC A;  1UD8 A;  2UWF A;  5F7U A;  3CZL A;  1BYC A;  1JXJ A;  1A47 A;  1C8Y A;  2JEQ A;  1YHT A;  1FFQ A;  3BCD A;  1R7A A;  3O9N A;  4Z2L A;  3WSU A;  3WUG A;  1E5J A;  4F79 A;  2OSW A;  5JH8 A;  3PZ9 A;  4S3J A;  1VF8 A;  4ZXO A;  1B1Y A;  1MW1 A;  2XPK A;  2ZUW A;  3WEL A;  3VIO A;  2F61 A;  2WZH A;  3CO4 A;  5HBF A;  4V27 A;  2QPS A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1IGS A;  2XU2 A;  3A3X A;  3WJY A;  3CZ8 A;  4JCM A;  5G1Y A;  4I6V A;  3PZI A;  3UWW A;  2DIE A;  8A3H A;  1JDA A;  1KR0 A;  3UYI A;  2Y0F A;  2C8N A;  4ZTX A;  3W7R A;  1VBU A;  4MNJ A;  3AIS A;  4D6J A;  6REQ B;  2C3Z A;  4PGL A;  4AWU A;  1XYL A;  1HKW A;  1EHN A;  4ODP A;  4RV3 A;  1QOX A;  1JYX A;  3NUK A;  2IPW A;  4HU4 A;  5CG0 A;  3EPM A;  2CLK A;  2QCF A;  1B2Y A;  4BEQ A;  3KCE A;  2WCA A;  3HN3 A;  4M6Q A;  1DIO A;  3SJ3 A;  4EX4 A;  1WOA A;  3GSM A;  3WDQ A;  4D2J A;  2MUC A;  2P8C A;  3H4X A;  3HU7 A;  3AXM A;  3W1P A;  1OFO A;  3B8I A;  1W17 A;  4GHR A;  4C6F A;  3MAN A;  4GIA A;  4JD4 A;  4L64 A;  1VPX A;  3KP0 A;  5F1V A;  3B8D A;  1GON A;  3WNL A;  3LSC A;  4ZOB A;  4HAR A;  2R1P A;  2FB2 A;  2GL5 A;  3CQJ A;  4LXF A;  2OB3 A;  5TD4 A;  3TN4 A;  2DW6 A;  3CZG A;  2ZFA A;  3GC2 A;  2HTM A;  2VEF A;  4G2P A;  2X2Y A;  4DBW A;  1IR2 A;  4J40 A;  1I6N A;  1UR3 M;  3TSD A;  3B9E A;  1PV8 A;  4IQ2 A;  1VFF A;  4NVT A;  5DQP A;  4JFV A;  4C6I A;  1IT0 A;  4XD6 A;  3SRH A;  5C54 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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