4MQ1A

The crystal structure of dyrk1a with a bound pyrido[2,3-d]pyrimidine inhibitor
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
346
structure length
345
Chain Sequence
VYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKTKDGKREYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Pyrido[2,3-d]pyrimidines: Discovery and preliminary SAR of a novel series of DYRK1B and DYRK1A inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1
total genus 122
structure length 345
sequence length 346
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2013-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4mq1A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4mq1A01
2XUUA 4IWPA 2PZRA 3HLLA 4V0GB 1OITA 3AC1A 5BPYA 3V01A 5EDQA 2OJ9A 5FWKK 3UOLA 2C30A 2VTTA 3B8QA 3CS9A 2XK3A 4FKOA 4FEQA 5JFXA 3P7AA 3QWJA 4PUZA 2PUNA 4XYFA 3TACA 2UZVA 3AD4A 5ANEA 1GZKA 4JDJA 3QTZA 2RIOA 4GIHA 1WBTA 5M53A 4ANMA 3QUPA 4EZ5A 1H28A 1M14A 5IA3A 2UZLA 1XBBA 3LOKA 3RZBA 2UVYA 4WUNA 2W1IA 3O17A 2VTQA 4U81A 3H4JA 3P78A 2GU8A 2V7AA 5E9EA 1JQHA 3AC4A 3NW6A 2JAVA 1OGUA 4HVHA 3BLQA 4E93A 5FM3A 4NZWB 2CJMA 1V0OA 3WZUA 4FL3A 4QT1A 5CENA 4AGDA 4DEAA 4F4PA 2C3KA 4C3PA 3TIZA 1OL6A 2FSMX 4KRDA 5FP6A 3A4PA 1JAMA 5CX9A 3ZLWA 5ICPA 3BYOA 3DTWA 3G0EA 4C36A 4FTNA 4GT3A 4BHZA 1W82A 3VQHA 5HO6A 3ERKA 3MS9A 4E3CA 5GJFA 4ERKA 2GHLA 4ERWA 4RC4A 3Q3BA 5A46A 3ZRLA 4CRLA 1ZOEA 3SKCA 4JDIA 2JIUA 3KFAA 3RK7A 3GCQA 1L8TA 4FEVA 3ZXTA 3UQFA 3GU8A 5B0XA 1ZYDA 5EQYA 4R6VA 2NRYA 4G3CA 3D7ZA 4H1MA 1MUOA 5CSXA 2SRCA 4AU8A 5AAEA 3DK6A 3WYXA 4CFUA 1YOJA 2QOBA 5I9XA 4KBKA 3F69A 4I21A 4D5HA 2UW9A 4RX7A 4ZLOA 4QMNA 5E8VA 3M1SA 3H0ZA 4RWIA 2CMWA 4AA5A 3MVMA 2XK9A 1LUFA 2YACA 3QCYA 4W4YA 4YZBA 3SW4A 3ZH8A 2AC3A 4KIQA 4C8BA 5AR7A 1FVTA 3V5TA 5M07A 2YDKA 3QD4A 5L2WA 2JDOA 3PLSA 4ASEA 2JKMA 3HYHA 1QPJA 3DDQA 4FZ7A 1ZAOA 2A2AA 3TCPA 3V5PA 4D5KA 3N4TA 1Q8ZA 3SOAA 4JBPA 1WBOA 4JRVA 4N70A 1IA8A 3RNYA 2CKPA 3BQRA 3PSDA 4KKGA 1GAGA 3RK5A 3C1XA 2Q0NA 3BWFA 4MXCA 5I9UA 5LWMA 4HVIA 3FPQA 4QQCA 4TWOA 3UVRA 3MY5A 2F7EE 2C3JA 4GJ3A 4Q9SA 3COKA 5DI1A 5AADA 5D41A 1V0PA 4KIKB 5B7VA 3PWYA 2YM3A 4O0WA 3ZSIA 3LFDA 3QCXA 4G6OA 4WBBB 2H34A 3P1AA 3I4BA 3PXYA 5ACKA 3VUTA 3LQ3A 5IQCA 1JKLA 3NR9A 4YZNA 3GP0A 4W9WA 2QO9A 2BILB 3DZQA 4L7FA 3SOCA 3UP7A 4EWHA 5HBJA 1H1WA 3ZYAA 2PYWA 4K33A 1XH7A 4M97A 4CFVA 3GENA 2PTKA 3ZCLA 2VX0A 2PVKA 4M69A 5E8XA 2VNWA 4RVKA 3DBQA 3BGPA 3F88A 1J1BA 2B9FA 3QQKA 4FTMA 4QP3A 4FK6A 5BQ0A 2UVZA 3LCKA 1S9JA 3HGKA 3HV7A 3R00A 2JD5A 3LAUA 4EH6A 1IAHA 3NUAA 1PYEA 4FEUA 4RC3A 1PHKA 2WTJA 3QCQA 1OKYA 2QVSE 3DAKA 1OL1A 5KCVA 2EXEA 2XKEA 4NFMA 1PYXA 1UKIA 4R7IA 4GH2A 4PF4A 2O3PA 2XH5A 2PY3A 4NM5A 5HE1A 3PSBA 4M3QA 4JX3A 2QG7A 4RWJA 3ZSHA 4QP9A 4IFCA 5IA1A 4R3PA 4DFLA 1LEZA 2BROA 4QMZA 2E9PA 4S33A 1U59A 4LGDA 2JKOA 4TYJA 4A4LA 4YURA 2Z02A 3Q6WA 3SV0A 4QYEA 4CMUA 1V0BA 1W7HA 4EKKA 3U9NA 2WQMA 2R3QA 5IH6A 4C59A 3AT4A 5LMAA 5DH3A 3UC3A 4C4HA 4DEIA 3F7WA 4D1ZA 2HW6A 3TZMA 5DFPA 3QAME 5FTGA 4AN9A 3DGKA 1YRPA 2PVHA 4RJ4A 5C9CA 3BRBA 2C6TA 1KOAA 4IJ9A 4TNDA 2WOTA 4V01A 4LG4A 3KRXA 4EHVA 3OHTA 3SDJA 3VS7A 3TUBA 4ZLYA 5JQ8A 2XIRA 4XV1A 4L42A 4YJOA 5EI2A 4GYGA 4MWIA 3TKIA 5CU0A 3QQJA 3G90X 4LUEA 3FZTA 1ZLTA 4P5QA 4F9BA 4YO6A 3DK3A 1X8BA 3ENMA 4L6QA 4D4SA 4XNEA 2GNGA 2G9XA 3UPXA 4EKLA 1KE9A 3PIZA 2YM8A 2UW0A 2QODA 1XBCA 2B53A 3CJGA 3FE3A 3CXWA 3PE1A 5AP6A 1SVHA 4UZDA 5KBQA 2GFCA 3LIJA 5C8NA 2HIWA 4MD8E 5DPVA 5AJQA 4RJ7A 3VNTA 4HNFA 4BVUA 4FE2A 4C58A 4ANQA 5IA0A 5A9UA 1G8SA 3AC5A 3AT2A 4RA5A 2EUFB 4S2ZA 3NCGA 2FH9A 5EYDA 4EOPA 3DCVA 3HMOA 3CGFA 3OY3A 4ITJA 4QPMA 2HYYA 5CU3A 4OW8A 4FEWA 3BV2A 1UU7A 1YXTA 4QMXA 3A61A 3DS6A 4NSTA 5FDXA 4L7SA 3EZRA 4MXOA 4IE9A 3PDTA 4EEVA 5AUVA 3CSVA 2GMXA 4FMQA 2YA9A 3LFQA 4LFIA 5AP2A 3GQLA 3FKOA 5LWNA 4C4FA 3O2MA 2VO7A 4LGGA 4NCTA 5FBNC 5A54A 1Y91A 1F0QA 3KMUA 3Q53A 4FSYA 3HDMA 3UJGA 3FAAA 3CTQA 4KINA 4WG4A 5ETFA 2OXXA 5CASA 2X6EA 1IEPA 1PXNA 2X8IA 3HEGA 4GMYA 4BRXA 2JIIA 4ZEGA 1O6KA 2HXLA 2XYNA 3DU8A 4R77A 3QBNA 5G1XA 4FKPA 3ZDIA 3C4EA 3COMA 1MQBA 4I23A 5A4EA 1H27A 2ZMCA 3G2FA 4IIRA 2W0JA 4BI0A 1CTPE 4GK3A 4YBKA 4NT4A 1FQ1B 5A3XA 5CEPA 1O6YA 5CLPA 3TJCA 4B8LA 4R8QA 3PP0A 4J52A 3A60A 4UWYA 3TEIA 3DOGA 3EQCA 5BVOA 4TT7A 1KV1A 3R1QA 3QKMA 3PPKA 4CKRA 4DGNA 2R3IA 3TZ9A 5CSHA 5EI6A 3GU5A 3DKFA 4GUBA 4I94A 2ZV9A 4YC3A 3V5LA 1WVXA 3E8CA 3NDMA 4IB0A 2UZDA 2O63A 3R7YA 2UZWE 2BTSA 2WMBA 2XEYA 2R7IA 2QCSA 2ZOQA 4J7BA 4O7SA 5L3AA 4RG0A 4O83A 2WMRA 2HWPA 4NM0A 4QD6A 5EKOA 5CF6A 5KHXA 3UIMA 2UZNA 3PY1A 4FTCA 4CCUA 5EW9A 4QMYA 4RJ5A 4AW5A 3REPA 1J3HA 4U44A 3C0GA 1O9UA 2C5XA 3DNDA 3OBGA 2QLQA 5F20A 2VWBA 3KXHA 4OAVB 4FKUA 4GIIA 3MPAA 5H3QA 2XP2A 3THBA 4CD0A 5IDPA 4ZTSA 4FSMA 3VW6A 1UV5A 4BWXA 4EI4A 5IH4A 2BALA 3ORKA 3CKXA 3IW5A 4MK0A 3QXOA 4EWQA 2F57A 4TWPA 5JQ5A 3R0TA 3MIAA 5HO7A 4IC7A 4TYGA 3RM7A 5GIOE 3AT3A 3RWPA 1DAYA 3KXNA 2VTLA 4EK4A 3GB2A 4JG6A 5AUUA 2VWVA 4E6DA 2AYPA 2GNFA 3BE9A 4J53A 4WKQA 4ACHA 4CG8A 4DT9A 2W1DA 1XH9A 2OF2A 5AR5A 3EQRA 1OKVA 5ANJA 2V0DA 3QTQA 3ULIA 4MBLA 4EH3A 1TVOA 3QQUA 3TTIA 2ZM3A 4TPTA 4HVSA 1F5QA 2W4JA 4N57A 2UW6A 1GIIA 5IQEA 3KRRA 1OB3A 4E5WA 3PXKA 3PPJA 3FMMA 2UUEA 4I41A 4H58A 3QD2B 5J8IA 2YITA 4BL1A 2YCQA 3NIZA 4CQGA 4K6ZA 4NIFB 3EHAA 5BVKA 3TNQB 3BEGA 2RFSA 4IMYA 3SRVB 5FXSA 5EFQA 4BDJA 3EYHA 5D10A 4GSBA 4EQCA 4E20A 2R3HA 4O6LA 4Z55A 4BGGA 4CLIA 3M2WA 4JJRA 4EYJA 5C26A 5IMEA 3ORNA 3C0IA 2HOGA 1OIYA 2WTVA 3R21A 5AX3A 1OECA 3A7JA 5EHLA 3O7LD 3O8UA 3QA0A 3U55A 3GCPA 4FBXA 5J87A 4DLJA 4CYIA 4AP7A 3VF9A 5DE2A 4FTIA 3UOJA 4PV0A 5CTPA 4YUQA 3ZRMA 4PMPA 3B2WA 3GEQA 4TNBA 5EI8A 3VUMA 1ZWSA 4ANBA 4EOMA 3ITZA 2GPHA 2YABA 2OXYA 4EUUA 3WILA 4NL0A 2CGUA 5IEXA 3F5XA 2W17A 4BCJA 3AGMA 4FICA 2HW7A 3A8XA 3GT8A 3H0YA 5KE0A 2YM7A 3QRTA 4YJPA 3WF9A 4FYNA 4DCAA 4IWQA 3DV3A 4IB1A 3AXWA 4XV3A 4BCQA 2YWVA 5C4KA 3JXWA 4OT6A 2G1TA 4HVGA 3GCVA 3FI2A 5LVOA 4YTIA 1ZRZA 3PA5A 4Z7GA 3T9TA 3V5WA 1UWJA 4NH1A 4F7SA 4K9YA 2C3IB 1VYWA 3UGCA 2GDOA 2WEIA 3TI1A 4PP9A 4AXAA 4O96A 1WMKA 2RKUA 1WBWA 2WELA 4Y95A 4BZDA 5L6WL 4C33A 3L8VA 5HQ0A 4X21A 3MESA 5EYCA 3MFRA 4JG8A 3A7FA 3GU7A 3OT8A 5E8ZA 5EW3A 4A9YA 1YWRA 3LVPA 5EHYA 4EH5A 1J7UA 2PZIA 2C4GA 1PY5A 5KZIA 3BWJA 2VD5A 3VBVA 4HNIA 3RHKA 2C6EA 3C4XA 4KIKA 4DG3E 4ZAUA 5M57A 4G3DA 5IISA 4FTKA 3V6SA 2PULA 2WIHA 1W0XC 3SQQA 2XNGA 3VF8A 4WNPA 3ENHA 5DR2A 3LFAA 5CAOA 3ACJA 3I5ZA 3DQXA 5L6PA 5AR2A 4WNKA 2QQ7A 3IW4A 3QTUA 5FLFA 2HENA 4XBRA 2ONLA 5JRSA 3TV6A 3S1HA 5CANA 1OPJA 3VC4A 3OCTA 3WARA 4F99A 3HDNA 4RMZA 3QLFA 5DRBA 2ZV2A 1FMKA 4CXAA 2B9JA 3KMWA 2VUWA 4R5SA 5TE0A 2BRBA 3RAWA 5L8JA 3OD6X 5DR9A 2EWAA 4X3JA 2OIDA 4KB8A 5HTBA 3GCUA 1QPEA 4GJ2A 3CY2A 4F0GA 4U8ZA 3KB7A 5FM2A 2XVDA 5HTIA 3R02A 5IZFA 4QMUA 2CHLA 3UNZA 3E62A 4RWLA 2IG7A 3LMHA 1Y57A 4MXZA 4O0VA 1M2QA 4DFXE 1IRKA 1GIJA 5HI2A 5JZNA 3TKHA 3FKNA 4QTDA 4ZSEA 2A1AB 4O21A 4NCTC 3BU5A 1UA2A 3E7OA 4RIWA 4K18A 1BL7A 3KN5A 4FIFA 5LJJA 3FJQE 4I6FA 1XH4A 3QXPA 4GG5A 2Y4IC 3BHHA 4GL9A 3FY0A 5IA4A 3E8NA 3O8TA 5HO8A 3QQLA 4MHAA 4FKGA 4D9TA 4FOBA 2C5NA 3SG8A 1H07A 4AT4A 3VVHA 4M69B 3MJ1A 1WBPA 5FXQA 4EC8A 2ZDTA 4TW9A 4AN2A 3MH1A 5I9VA 3KF4A 2R0UA 5HIDA 3RINA 4AZVA 4EOIA 1VR2A 3W1FA 5LOHA 1NVRA 2H9VA 2EXMA 3RCJA 4ZMEA 3QTWA 2QOHA 4YP8A 3H9RA 3QTRA 4F0FA 3RGFA 1B39A 3ORXA 3K5VA 3K3JA 3UYSA 2C68A 3BCEA 3QRUA 5CF8A 3EQIA 3ZOSA 3WIGA 1GJOA 5BUEA 2VWWA 4M0ZA 3CTJA 3KQ7A 4UV0A 4PP7A 5M4IA 2ITUA 3P5KA 4FV2A 2H8HA 3G5DA 5CI6A 4ONAA 5HNBA 2PVYA 3LXNA 1PXMA 4C34A 5HG5A 3RPVA 4BDHA 3MVHA 2J2IB 3TV4A 2DWBA 4ID7A 1JKKA 5AUXA 3ZO1A 1FMOE 3QZFA 4K77A 5E8TA 3BZ3A 2ITNA 1WBVA 2IWIA 4K8AA 4FVPA 2R2PA 5IQBA 3VUKA 3G0FA 4H36A 4MYGA 4EUTA 1U54A 1UU8A 3JY9A 3JUHA 4OGRA 4ACMA 4MKCA 2CN5A 4FIHA 3OROA 4NWMA 3L9NA 3NIEA 5DBXA 4E26A 2O2UA 4J8NA 3D5UA 3QC9A 3II5A 3QTIA 1PXLA 2BUJA 2VTHA 5AIRA 5HHWA 3OBJA 4GUEA 4A9RA 4FG9A 2CLQA 3HRCA 3NZ0A 2Q83A 5FEDA 4U6RA 2VWXA 3BGZA 4YJSA 4D4VA 4E5BA 3HAMA 5K0KA 1H01A 4QP8A 1H24A 5HLNA 4EC9A 3HA8A 3ZO4A 3Q5ZA 4A07A 3DY7A 4OTHA 3VAPA 4DFYA 3CPBA 3FC1X 3Q04A 3OXZA 3Q5IA 3OZ6A 4X7QA 3FI3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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