4MZBA

Crystal strucutre of grx1 from plasmodium falciparum
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
EAVKKWVNKIIEENIIAVFAKTECPYCIKAISILKGYNLNSHMHVENIEKNPDMANIQAYLKELTGKSSVPRIFINKDVVGGCDDLVKENDEGKLKERLQKLGLVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Atomic resolution crystal structure of glutaredoxin 1 from Plasmodium falciparum and comparison with other glutaredoxins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
molecule keywords Glutaredoxin
total genus 34
structure length 106
sequence length 106
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2013-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mzbA00
2V2GA 3DYRA 5DQSA 5EVOA 1TTZA 2L6DA 1ERWA 4GF0A 1PRXA 3RHBA 1GUMA 4KA0A 2CX3A 4LL1B 5GZZB 4TOPA 5IMAA 3L9VA 4DVCA 2H73A 1EGOA 3TKSE 4ZBBA 4POBA 4KSOA 5JWQB 4POLA 2LNTA 2YWOA 1VGLA 2NVLA 1M0UA 4YAPA 4IHUA 3GIXA 2ZCTA 4HJ2A 1TDIA 1QXHA 4ZXGA 2DJ2A 2FD3A 4Q5RA 3S9FA 4GRFA 2IMEA 4K7IA 5HR2A 5DJLA 1JLWA 4X0XA 3TOUA 1MDKA 1TOFA 5AGYA 3TGZA 3LQ7A 4MZCA 4LL4B 4XS4B 1GULA 1B4QA 4K8MA 2HE3A 1WOUA 1NSWA 4GWRA 5D96A 3M1GA 3TJKA 4NAXA 2JACA 3ERWA 1A2JA 2DBCA 3QAVA 3EMPA 5ECKB 2VCWA 3FKFA 1VF1A 4IW9A 4XTSA 2EIQA 1B9YC 1ON4A 3MNGA 3GSTA 2O89A 2PWJA 4NV2A 5IM9A 1OC9B 3W8SA 1TRSA 2NPBA 5HR1A 4RQRA 2OE0A 2WS2A 5CRDA 3LSZA 3ME7A 5A4WA 1XCCA 3RPPA 3ZFLA 1JZRA 1PL2A 3MAKA 1A8YA 1FAAA 1EZKA 4XS6A 1QQ2A 4F82A 3F6FA 3KGKA 1S3DA 3VI5A 2M72A 2GQMA 3F8UA 2QSIA 5G5FA 3ZITA 2R5GA 5D73A 2JZSA 1XWAA 4ECJA 6GSVA 4KDUA 1VF3A 1BX9A 4TR0A 2VCVA 1FVKA 3DKSA 3EE2A 3TKRA 1QMVA 3HHVA 1BEDA 3WYWA 2GVPA 1PQNA 2VLVA 3M0FA 3GFKA 3F3QA 3IAM2 1TU7A 3FYGA 2DMMA 2HLSA 4WR4A 1WPIA 4WETA 2I81A 2B1LA 4O92A 3J7Yk 3Q18A 5CRGA 2L6CA 4PNFA 1OE7A 1S3AA 5ECNB 3E9JB 1V2AA 4TW5A 5D9VA 2WGRA 1SK2A 1X5DA 1SKRB 5GAND 1ZMAA 3KZQA 3TRXA 1GH2A 2WJUA 3QCPA 3M9JA 5IIZA 1V40A 2YP6A 3EWLA 3KCMA 4JRRA 1XOAA 3GURA 1M7TA 2FGXA 1XOBA 1X0RA 1MDJA 1WWJA 2KP2A 4X1UA 3L4NA 3QMXA 2C1YA 3ZVJD 2N5AA 2VM2A 2MBTA 5F0GA 2GZZA 5D9WA 1ML6A 2WULA 2C8UA 3D4TA 5ECMB 1PN9A 1BYEA 4G2EA 3ZZXA 2C0GA 4KGIA 1R5PA 1XWGA 2FUG2 2E7PA 2VAFA 5ECHB 2YWNA 2REMA 3ZLPA 1XWBA 2LJAA 3WT1A 4NMUA 2H1BA 5F8BA 3TDGA 1O81A 1T8EB 1TK0B 1B48A 3FR6A 1YF1A 3O6TA 5IMZA 3RDWA 5CRWA 4D73B 1G7EA 5CO3A 3FY7A 2OKAA 1HNCA 4EDYA 4ZL8A 4PGTA 1GP1A 2YV9A 4JZQA 2GZYA 3TJFA 1YJ6A 6GSUA 1Z9HA 3EU3A 1DE2A 4PQ1A 2VLTA 4KSMA 4ACSA 1WJKA 1F3AA 3ERGA 1MD3A 1SJZA 5AIXA 4MCUA 3I6AA 3IBHA 1YEXA 5E4WA 3GH6A 5CP1A 1ST9A 4DSRA 1YKAA 3GX0A 1TW9A 3Q74A 3G9BA 2GSRA 3FR3A 2WDUA 20GSA 2VCTA 1TKDB 5ECPB 4HS1A 1ERVA 2PPTA 1PL1A 2AB6A 5F05A 3BCIA 5ENUA 2R6KA 4XS4A 4DSQA 4OO4A 2BTOT 2YOIA 2LRTA 3GKNA 1U3IA 1UC7A 3A5WA 2FLSA 1FVJA 3C71A 2GT5A 2CV4A 1U6TA 4MLYA 2LJRA 3QPMA 3HJMA 4K7OA 3APSA 2OADA 2FHEA 2K6VA 2PVOC 4KCAA 1THOA 1OC9A 2RUFA 1ZL9A 2IMDA 5DALB 4ULXA 1UVZA 1QGVA 12GSA 5JWOB 2XC2A 2X64A 3GN3A 2CAQA 5JWRB 4ECIA 13GSA 5GSTA 5L71A 1K0CA 3PH9A 1OVNA 4P3YB 4TVEA 3DIEA 2GDRA 2L57A 4MMMA 1TI3A 4HQZA 2H6YA 1SD8A 1JZDA 5EPFA 2A2RA 4MPFA 3IPZA 2EC4A 4RI7A 1TP9A 5IMVA 3DMLA 1AW9A 3KH9A 3P90A 2X8HA 3P8WA 5HR3A 1I9DA 1T4YA 5J3RA 4L5LA 1GUHA 2ALBA 1M99A 5JCWA 4PQIA 3ISOA 3RAZA 3ERFA 1H4OA 2LKUA 3CSHA 5DVBA 4I6XA 4OCEA 2V6OA 3IE3A 3SBCA 3GHAA 4TR1B 5H5RA 2F9SA 4F9ZA 2VL2A 1XBSA 5IPHA 2HZFA 3CMIA 3DEXA 2O87A 3UVTA 2GLRA 3H79A 4F2IA 2XBIA 6GSXA 5DAKB 2P5RA 1GLQA 1N8JA 3HCZA 2J23A 2H6XA 3HVSA 5FWGA 1HNBA 3VURA 2C0DA 3US3A 5ECLB 5GSSA 2LS5A 2MMOA 1V57A 3TRQA 4ZB8A 1PGTA 3QAWA 6GSYA 4IGJA 3H8QA 3KP9A 3RHCA 5B7CA 3LFLA 1THXA 2M80A 3C7MA 2H76A 2MMAA 4V1Ap 4KX4A 1FO5A 2OACA 3CTFA 4V2MA 4ZB9A 4CW9A 1R7HA 3ZRDA 1K3LA 2YN1A 3GX8A 4D73A 3I9V2 3TKPA 2H1AA 2F51A 2FCHA 1XW9A 4HOJA 2XPEA 5DBQA 3Q6OA 1YDKA 4TR3A 3DWVA 4OWYA 1G0TA 4HI7A 4I2TA 1BJXA 3AY8A 3UIWA 2C80A 1ERUA 1PA3A 2L5OA 4FYCA 3G7IA 4EUYA 3WGEA 3PR8A 6GSTA 4N30A 4HEA2 4IQ1A 1SU9A 3EC3A 3FZ9A 4PX1A 2ZUPA 1BAYA 3UARA 1XPVA 1O6JA 1Y25A 2H01A 2IIYA 5IOWA 4GSNA 14GSA 3ED3A 3LYPA 2DIYA 3LYKA 7GSSA 4ECBA 3GH9A 1F6MC 1G6YA 2HZEA 2CVDA 2V32A 3TKQA 3MSZA 4N11A 4V2LA 5G31A 1X5CA 3IC4A 4EDZA 3O3TA 4K9ZA 3ZIJA 1OAZA 1GSUA 6GSSA 4KH7A 3E0UA 3PGTA 2LV3A 2A2SA 3IR4A 3DGQA 3OR5A 4EC0A 3KEBA 5CRHA 3KH7A 5B8AA 3GMFA 3UBLA 18GSA 2RM5A 1IYHA 1F2EA 4TN8A 5HFIA 1DUGA 2DJ1A 2C0FA 1NHOA 1XWKA 4KUNA 2R37A 4MDCA 2R2JA 4ISDA 2FWFA 3IV4A 5DALA 2GS3A 1M2DA 2O85A 2F8AA 3F4RA 1VF4A 4MJCA 1FB6A 1ABAA 4ID0A 2H19A 1TK8B 4NHWA 2FA8A 1SK0A 1ZZYA 1MD4A 2OE1A 4FO5A 4IQAA 1Z3EA 3W8JA 1O7UA 5GAPD 2L4QA 3U5RE 4JU5A 1XWCA 1TRWA 3D22A 4G19A 3D4MA 2IFQB 2WRTA 4MJBA 5IMCA 3NIVA 4AJ8A 4H86A 3A3TA 4MF6A 1J9BA 2R4VA 4KCEA 4MPGA 1A8LA 3QAGA 4PUFC 3L0HA 2WCIA 1N2AA 2E0QA 1EEJA 1X9SB 1YY7A 2IJYA 1MTCA 4EVMA 3HZ4A 5ID2B 1SKSB 4WF5A 2PVQA 1TRVA 3H93A 4TR1A 4MJEA 4ILFA 2AJQB 1M9AA 4V2NA 2H1DA 1PKWA 1NW2A 3WD6A 1NHYA 3IK7A 2GGTA 1T1VA 2YNXA 4IVFA 2V6KA 4OO5A 1FG4A 2VUPA 4LMWA 3F0IA 5DAKA 4J2FA 3G7YA 1GSDA 3IOSA 1X5EA 1M2BA 1V98A 3V1WA 1GSYA 1K0AA 5DQYA 4HZ2A 4I8BA 2CX4A 3A2WA 1DBYA 3LWAA 3FZAA 5D93A 1SL0B 1GSSA 2C4JA 2L5LA 2C3NA 4LLRA 4OMVA 3DRNA 3BOAA 3J7Yb 2DSAA 3F4TA 3KM6A 4IJ3A 3UVHA 2OBIA 1QUWA 2F8FA 2P0GA 3G7JA 4MK3A 3DVWA 1WE0A 4YQMA 1Z6MA 4ZILA 1GWCA 4QL7A 3CYNA 1GTAA 2PUKC 3LORA 3IK9A 4E8HA 2GQLA 5E59A 4PNGA 2R3XA 3GNJA 1YF0A 3NZNA 3HY2A 5ECSA 2VIMA 3O76A 4TRXA 1G7OA 2B1KA 1CQGA 4PUAA 4FYUA 4BVYA 2OA7A 3APOA 2OE3A 4G9HA 2X99A 3HXSA 4CDOA 1ZYEA 4POKA 5CAXA 1O73A 2K8VA 3C1RA 2VL9A 3IAS2 1U88A 3IA1A 2LRCA 4L5OA 3M3MA 2LSTA 5DCHA 1SL1B 1JZOA 3TCOA 2I3YA 2HFDA 5DJMA 2P31A 2EIOA 5G1LA 4IS0A 4G10A 3CRTA 4TXOA 1SYRA 4QL9A 1Y6EA 4K7NA 1KBNA 2DJ3A 2IL3A 5EL8A 1F9MA 2KLXA 1LU4A 2C3TA 3BBYA 1TXXA 1GTBA 1O8WA 2LTKA 4XIHA 3R2QA 1WP0A 2HZEB 3TB2A 3P2AA 4JR6A 2PGTA 4NPBA 2P5QA 2G0FA 3D0ZA 2C0EA 5FHIA 5F07A 1DE1A 3HA9A 3LG6A 3UOMA 2E2GA 1T00A 5KEJA 2F3MA 3ZL5A 4N0ZA 2VOCA 1GRXA 1A24A 5FT3A 4N0VA 2QKEA 4EXJA 1YKCA 1EEMA 4Q5QA 4HU7A 5KN2A 2EIRA 3TKSA 3ZVJA 2GSTA 4WBJA 4ZBAA 2V1MA 1EGRA 2IFQA 1V58A 2AV4A 2O8VB 3FZ5A 1ZCPA 3EURA 1XVQA 2H71A 6GSWA 3EYTA 1R26A 4EF0A 2CZ3A 2YCDA 2LUSA 4Q5NA 2YWIA 2X8GA 4KE3A 1RK4A 4X43A 2PBJA 4K6XA 9GSSA 2FY6A 3GA4A 2YV7A 3D6IA 1WIKA 5C04A 2XHFA 5C00A 5CREA 4HDEA 3UEMA 16GSA 5ID2A 3VWXA 2VCZA 2K8SA 3Q19A 3PINA 5LNKe 1USBA 3UL3A 2TIRA 1XW6A 1ZYQB 1HQOA 2X8CA 2IMFA 1SL2B 3E3EA 1GTUA 5JCGA 2GTUA 3EMXA 5AISA 1Z7PA 4IKHA 2L59A 1RQMA 1C72A 1E6BA 3FHKA 2CQ9A 3QOUA 3EVIA 1YZXA 2H66A 4ZB6A 3MDKA 5ELAA 1J08A 2FWGA 3M9KA 4TR4A 4BVXA 5D8IA 1S3CA 4J56E 4JE1A 4YAVA 2O7KA 1EV4A 11GSA 1G6WA 1BQ7A 2HYXA 1JHBA 1WRYA 5LD0A 1AQWA 4ML1A 3K8NA 1T4ZA 4POMA 5DCGA 2CVBA 3H4KA 2ON7A 5IMFA 3TJGA 4DEJA 1KTEA 8GSSA 1X9MB 3L78A 3ZFBA 2WZ9A 4LMVA 4L8EA 1B8XA 1GNWA 1M9BA 2PU9C 2GZPA 5HR0A 3GKKA 3KMOA 2B3SA 2VL3A 3F3RA 4GXZA 2VD0A 1SK1A 3DXBA 2MZCA 3F9UA 1PMTA 4FH8A 1XIYA 1GTIA 4RUVA 2VCXA 3GKMA 4IN0A 2OJLA 4E8EA 2Z9SA 1AQVA 4XRAA 4TXVA 4ZBDA 2H0HA 3ZIVA 3QFAC 2B5XA 4F0BA 1K3OA 4HQSA 3GL3A 4FYBA 4J57E 1NM3A 5J9CA 2GSSA 5J5NA 2I4AA 4YQUA 4IP1A 2JZRA 2VL2C 1ILOA 3UMAA 3EU4A 3TUEA 2XBQA 5ELGA 4V1Ag 3QFBC 2TRCP 5ECRB 1A23A 4QQ7A 2A4VA 2VLUA 3GYKA 3VLNA 2PN8A 1ZOFA 1IYIA 1YEPA 1SYXA 4TXOB 1DSBA 4IELA 2H74A 1K0DA 2B7JA 3TRPA 2LRNA 3U6VA 4HJMA 3VK9A 1EOGA 3APQA 1F3BA 1A2MA 2LQOA 4BWQA 2HNLA 3IHQA 3GRXA 3KP8A 4ECCA 1XVWA 2B5EA 4PURA 5COHA 4PXOA 3QD9A 4NXIA 1AC1A 3GSSA 2FA4A 1VRSD 1PD21 2K18A 1Q98A 2H1GA 4K0GA 1F37A 1SKWB 3GV1A 4GSTA 3WT2A 3GUSA 1CQHA 4L0WA 3CRUA 2E2MA 4AGSA 2I1UA 3DVXA 4EE0A 3HYPA 5LCZA 2MBSA 3CSJA 2VO4A 1K0BA 5KN0A 1OC8A 2JU5A 2GQKA 1X9WB 2WB9A 3ME8A 5DDLA 5H5QA 3I69A 1SJIA 2YWMA 2B5YA 5H5SA 4MF7A 4WR5A 4MZWA 3CSIA 2M46A 4HU9A 2AYTA 2FWHA 4DSSB 2RUEA 5G2ZA 5J9BA 3W6GA 1GL8A 2IWTA 5D9TA 3HVVA 2XPDA 10GSA 3ZREA 2CA8A 1UA5A 3FK8A 1PX6A 1U3AA 1FB0A 2JADA 4AJ6A 2AUVA 5J4UA 2NBSA 5IQYA 4KNDA 1OKDA 4ZL7A 3BCKA 4F0CA 3FEUA 2QC7A 2FNOA 1K0MA 5ECIB 5ECQB 1RW1A 4RI6A 4AF2A 4K0NA 2DJJA 3TJBA 4AJ7A 2JL4A 3CTGA 3NOFA 3A2XA 1PX7A 1TI1A 1B9XC 2LQQA 2DJKA 4EKZA 1EV9A 3F6DA 4CHSA 4K2DA 1PKZA 1OE8A 4XCSA 3L9SA 4GSSA 2H6ZA 4GCIA 4ZIJA 4O5RA 3RBTA 1GNEA 5INYA 2NDOA 1FOVA 4MABA 3I43A 4I2UA 5ABRA 1O85A 2DC5A 2ES7A 2KP1A 3HVXA 2CAIA 1B4PA 3FZ4A 3JCML 2MMZA 3GTUB 3D21A 4EO3A 2YZUA 1OYJA 5A4VA 2VD1A 3FW2A 3FRCA 1MEKA 3HKRA 3QDNA 3D5JA 1ACVA 5IO0A 2HI7A 4L0UA 5KN3A 2MMNA 4NWYA 1A0FA 3F63A 4HUAA 4KDXA 4MH2A 2B6MA 2HSHA 5AN1A 3FR9A 4FIWA 3C73A 1QK8A 5IPGA 5J41A 3VWWA 3IRAA 1GUKA 2C3QA 1U87A 2H30A 3KIJA 4OFNA 1E2YA 2HXKA 2H75A 1Z7RA 5HFGA 1FW1A 4MJAA 2RM6A 3GKXA 4PQHA 4WF4A 1GLPA 3C8EA 3C1SA 5IMDA 1VF2A 3N5OA 2RLIA 3HD5A 2HRNA 4BL7A 1K0NA 3VPQA 2DJ0A 3LXZA 2AHEA 2LNSA 3BJ5A 2JZTA 2D2ZA 1A0RP 2BMXA 1EOHA 4NV5A 4MA9A 1GSQA 3F4SA 4F03A 1LJRA 3EINA 1ERTA 1FHEA 1TRUA 4WBRD 5EY6A 4JBBA 2G2QA 3KMNA 2LEGA 1SENA 2DMLA 1HNAA 3LXTA 3LJRA 3KJYA 3ZMLA 4K1FA 3IDVA 2JSYA 4NHZA 4ZL9A 3HJPA 4IBPA 2MYGA 4BA7A 4KB3A 4JR4A 1XZOA 2V41A 3VFIA 4GTUA 2NTOA 1UN2A 4MP4A 19GSA 1JFUA 1PSQA 2IMKA 2CVKA 2N5FA 5B6MA 4TKYA 4XHMA 1XXUA 4LA1A 1JZWA 5KN1A 1TU8A 2BJXA 4MF5A 3HZ8A 17GSA 5A4UA 2YPMA 1URMA 2DIZA 2GSQA 1W89A 1SD9A 4IJIA 4HZ4A 2I9HA 5D9XA 1AXDA 2RIIA 2IN3A 2J9HA 3M8NA 2H72A 2ON5A 2HSYA 1YQ1A 2PMTA 3ZYWA 1OC3A 4DSSA 5IOXA 5CYYA 1J0FA 5CNWA 4YQVA 3DD3A 2K9FA 3TJJA 1QFNA 2B7KA 2IMIA 3HDCA 2H8LA 1GSFA 1JLVA 5IO2A 4GLTA 4I97A 3ZMKA 1W4VA 3A2VA 4BWSA 3MWHA 3CBUA 4ML6A 1HD2A 2PERA 1TJDA 4EL1A 1AQXA 1A2LA 4OD7A 22GSA 2VM1A 3P7XA 2YZHA 1LBKA 2QGVA 5ECOB 2IPAA 4YH2A 4WXTA 1Z5YE 3BD2A 4XS1A 3TOTA 3UAPA 1TK5B 4GQFA 4RQXA 3UJ1A 4OFMA 4O7HA 3L9UA 2HRFA 2KHPA 4IP6A 1EP7A 2KOKA 3H1NA 2YJHA 1Q4JA 3VWUA 5F06A 1KEBA 2VCQA 4OCFA 5AIVA 2ZNMA 1WMJA 2LJKA 3GTUA 2L4CA 3LEFA 2TRXA 3TKSC 3KXOA 4KDYA 1XFLA 1T3BA 3LGCA 3HJOA 3QR6A 1R5AA 1K0OA 3ZTLA 1I5GA 3GL5A 4WEYA 4BPYA 3SWLA 1SJ6A 5G30A 5G1KA 2OBKA 3VWVA 2AAWA 2JSZA 2FWEA 1H75A 4Q5FA 4Z7XA 1EP8A 4MZBA 3KTBA 2H70A 3WGDA 2WFCA 5G5EA 2N5BA 1T7PB 3VI7A 5HQPA 4KW6A 4MH3A 2CT6A 5A5KA 4JEDA 4WKWA 4O32A 2DLXA 5B8BA 1XW5A 2KUCA 1R4WA 1AUCA 5B6NA 5JCUA 3WGXA 3CXGA 3RPNA 2H0IA 1V9WA 1O8XA 3VPTA 1AAZA 2GT6A 3IXRA 3KD0A 1ZGNA 2HT9A 3UBKA 4N10A 3N9JA 1EWXA 1HYUA 5HFKA 1BG5A 1K3YA 4KAEA 2H0GA 2YJ7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite