4N10A

Crystal structure of plasmodium falciparum oxidized glutaredoxin 1 (pfgrx1) complexed with cisplatin
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
SEAVKKWVNKIIEENIIAVFAKTECPYCIKAISILKGYNLNSHMHVENIEKNPDMANIQAYLKELTGKSSVPRIFINKDVVGGCDDLVKENDEGKLKERLQKLGLVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Interaction of Cisplatin with plasmodium falciparum Glutaredoxin 1
rcsb
molecule keywords Glutaredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 38
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2013-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4n10A00
1ZOFA 3LQ7A 5GAND 3RHCA 2LTKA 3UJ1A 1GTAA 1QGVA 3CXGA 5AISA 1B48A 3KZQA 3VPTA 3LGCA 2KP2A 2VIMA 3ZFLA 4HQSA 1K0CA 1K3LA 2HLSA 4YAVA 1VF2A 5D9WA 3KIJA 1T7PB 4XS4A 4KH7A 2YV7A 1O8XA 5FT3A 1QMVA 2HZEA 5F8BA 3I43A 5IQYA 1FAAA 1ERTA 5EPFA 2LV3A 5H5QA 4O92A 3IAM2 3WYWA 2QC7A 3BCIA 3FZ9A 1GSEA 1HQOA 3HY2A 17GSA 2H71A 1M0UA 2RM5A 1BEDA 3FR9A 3UEMA 1R26A 5ECHB 1RQMA 3KGKA 4L8EA 4XS4B 2FCHA 2ON7A 4PX1A 1S3CA 5LD0A 4GSSA 2H1DA 2HZEB 4ZB9A 2MMNA 3VWUA 5F0GA 1TK0B 5GAPD 4NPBA 5IOXA 3TKSC 2DBCA 4MJEA 5IMDA 2QKEA 2NDOA 1HNAA 4J56E 1T8EB 1EV9A 2LJAA 2P0GA 3UMAA 2V6OA 1Z9HA 1V40A 2IFQA 3GV1A 5EVOA 3M9KA 1GUMA 5IPHA 2GSRA 3A3TA 4YAPA 5G31A 2FA8A 2JZTA 4ZL7A 4PGTA 2YN1A 4KE3A 4HQZA 2MBSA 2H73A 2HT9A 1M2BA 5CO3A 4E8EA 5D8IA 5IMFA 1XWCA 3ZIJA 3W8SA 3IK7A 2B7JA 5CREA 1Z6NA 3GSSA 1SL0B 1EEJA 2C3QA 1EWXA 4MZWA 19GSA 1GSDA 1A0RP 1M2AA 3IOSA 4KDUA 3GKKA 1SJZA 3F6DA 5ID2A 1EV4A 2IFQB 2WGRA 3BCKA 2B5EA 4KSOA 1OC9A 2C80A 2NTOA 3C8EA 3V1WA 1U3IA 4KAEA 5H5SA 4DSSA 3IHQA 4OFMA 3HZ4A 2DJ2A 4CHSA 3IA1A 4NV5A 4JR4A 3FY7A 4Z7XA 3RAZA 1VF1A 1Q98A 2H70A 4FYUA 1TOFA 1THXA 1A0FA 1WWJA 2C3NA 1V58A 1A23A 4X1UA 4KB3A 1XWGA 1UN2A 1AW9A 2OKAA 4KCAA 3ERWA 2PVOC 3EVIA 1EGOA 4ZIJA 5ECRB 5ID2B 2B6MA 2RM6A 4EF0A 1OC9B 1U3AA 2RIIA 1GSYA 4DSSB 1B9XC 1LBKA 3C71A 3L9UA 2O85A 1YKAA 1J9BA 4PQHA 2YV9A 3APQA 3FR6A 2HFDA 1FOVA 4HOJA 1B8XA 11GSA 2FUG2 1ZGNA 10GSA 3E9JB 4GTUA 4POBA 4WEYA 1T3BA 3UBKA 3H93A 2ES7A 1GTUA 2X64A 4V2LA 1OKTA 3MNGA 5J9CA 4DSQA 2VM1A 1BX9A 3ZFBA 2TRCP 2CA8A 3CMIA 3US3A 2B3SA 3N5OA 5IPGA 4POKA 2O87A 5HR1A 2VLVA 3KH9A 2H0HA 5DQSA 2GTUA 4JU5A 4PUAA 1TXXA 2PPTA 4XHMA 1FHEA 3F4TA 1ZYQB 3LYPA 2P31A 3QCPA 2B5YA 1OE8A 1V98A 2JSZA 4I97A 1MD3A 4MPFA 4HUAA 3DVWA 1O73A 1HNBA 4TR0A 3VURA 5C00A 1G6WA 1PL1A 2VO4A 2V2GA 4GCIA 2JSYA 1N2AA 1ZCPA 4BWSA 5GZZB 1JZWA 4H86A 3TOUA 5D9VA 4MP4A 2E7PA 3UARA 2MMAA 2IMFA 2VCTA 2CQ9A 1V2AA 4WR5A 4PQ1A 4OFTA 4PUFC 4QL9A 2XBIA 3QR6A 4LL1B 2BTOT 1UA5A 3DWVA 5GSSA 1DSBA 3UL3A 5G30A 5JWQB 5IOWA 1T1VA 4TOPA 2K8VA 5DALA 3GSTA 3NZNA 4IKHA 4DSRA 2WZ9A 3H4KA 2H6ZA 1GL8A 6GSVA 2HRFA 1SYXA 4I5QA 1M7TA 3O6TA 3UVHA 1USBA 3QD9A 2QSIA 3HKRA 1Z7PA 3QPMA 4WXTA 4ZL9A 1AUCA 1SL2B 2HYXA 2IMKA 4N0VA 5DJMA 2C0FA 2H30A 3CTFA 1KBNA 1E6BA 1U88A 1RK4A 3L78A 4X0XA 2K18A 5CAXA 3D22A 2NBSA 5DALB 3TKSE 1SD8A 22GSA 1TK8B 4L0WA 3KEBA 3DD3A 1F2EA 1SJIA 4K9ZA 4XCSA 2E2MA 3IDVA 4IP6A 4BVYA 4HU9A 3ERGA 2M46A 2I1UA 3TCOA 4OD7A 1GNWA 4LLRA 4JZQA 4V1Ag 4KA0A 1SKRB 2GQKA 2H1BA 3DRNA 2B7KA 3FHKA 4MJAA 5J41A 2OADA 4WBJA 3APOA 3ZMLA 3ZTLA 1K3YA 2LJRA 1M99A 3H1NA 5ECIB 1F37A 2IN3A 3IRAA 2FNOA 2G0FA 3SBCA 1B4QA 4F0CA 2F51A 2IPAA 2LQOA 4ZBBA 3J7Yk 1XIYA 3P7XA 4PURA 2E0QA 1SD9A 3VWVA 1M9AA 1W4VA 3CSHA 3HJOA 5JCWA 1Q4JA 1EP8A 1BYEA 3TDGA 3CYNA 3MDKA 1FVKA 1DUGA 2H1AA 2H72A 3D21A 3OR5A 1GTBA 2Z9SA 2R5GA 4X43A 5B7CA 3IE3A 3A2XA 3ED3A 1GNEA 3KMNA 3GH6A 3IV4A 4FYCA 3G7IA 3A2VA 3WT1A 2I81A 1A2MA 3RPNA 1JZRA 4XS6A 1GWCA 4NHZA 2K8SA 4GQFA 1CQGA 2X8HA 3ZIVA 4ZBDA 5CRWA 5IMVA 5FHIA 5G5EA 3ZMKA 1ZMAA 2LEGA 3LXZA 3I69A 4MH3A 1CQHA 4I2TA 2C8UA 1XVWA 2ZCTA 2ZNMA 2AUVA 3D0ZA 4IS0A 2VCWA 4CDOA 3KP9A 3GKNA 2WCIA 2H6XA 3GNJA 3SWLA 1JFUA 2GSSA 2B1KA 2DJ3A 2JZSA 3F4RA 2MZCA 2DMMA 4KNDA 3IBHA 3ERFA 4JEDA 1O7UA 2YWIA 2FGXA 4AGSA 5DVBA 3VFIA 1TI3A 5J3RA 2XHFA 4YH2A 3GURA 5D73A 3F8UA 3C1RA 2R2JA 4PXOA 2CZ3A 3GIXA 2F3MA 4MF5A 1SYRA 2JL4A 3GMFA 3EC3A 1GUHA 4MDCA 5AN1A 3I6AA 5IMZA 1UVZA 1R5AA 3CBUA 3D5JA 2X99A 4ML1A 3HJPA 4BWQA 2YWNA 2FWGA 1XOAA 4EC0A 1C72A 1ON4A 3AY8A 4K6XA 2QGVA 2R3XA 1XOBA 3GX8A 3BOAA 2L6DA 4JRRA 1Z5YE 3CRTA 4K8MA 1WRYA 14GSA 3O76A 3FZ4A 4AJ8A 5KEJA 4IHUA 1DE2A 3TGZA 3H8QA 5ECMB 1FVJA 4RQRA 3FK8A 4YQVA 2AB6A 3CSJA 1K3OA 5ECNB 3TJKA 5KN3A 3HDCA 2EIQA 2L4CA 1ML6A 3TOTA 1TK5B 1WE0A 5ECQB 2A4VA 5B6NA 5A4WA 2H0GA 2F9SA 4O7HA 1GSSA 9GSSA 4PNGA 4ACSA 2LUSA 5G1KA 2O89A 4POLA 3IC4A 1IYIA 1EOHA 4NHWA 2VL9A 3HA9A 1YZXA 2CV4A 3R2QA 4FO5A 2L6CA 1H4OA 4OWYA 2PN8A 3BJ5A 2JU5A 4ZL8A 3D6IA 3PGTA 2YCDA 4MK3A 1TTZA 2DJ0A 1XW6A 1O81A 2KLXA 1SJ6A 5E4WA 5DBQA 2OA7A 4ZILA 1Z7RA 3ZZXA 2LKUA 3TKQA 2VM2A 1A8LA 1O8WA 1GSFA 4PNFA 3QOUA 3KCMA 3G7JA 4KCEA 3KTLA 3M1GA 1EGRA 4RUVA 1GLPA 4IELA 1YF0A 3G7YA 4KDXA 1AC1A 3FZAA 3MAKA 1VGLA 1TRUA 4V1Ap 4F2IA 2HE3A 2HI7A 1H75A 2KHPA 3L4NA 2XPDA 3TRPA 5ELGA 1YEXA 2CAQA 1KNGA 4IBPA 3J7Yb 3GHAA 1BG5A 1ERWA 2GT5A 3KMOA 4L5LA 4RI7A 4MABA 4ML6A 2L5LA 4MA9A 1FW1A 2L57A 4ECJA 5B8AA 2H74A 2YZHA 4PQIA 3TJBA 1J0FA 4Q5RA 3QFBC 1EP7A 2VL3A 3LG6A 4IP1A 2V6KA 2GQLA 4HDEA 4G2EA 2O8VB 1A2JA 5DCGA 4KGIA 1A2LA 2IIYA 2LSTA 3Q19A 3LORA 4YQUA 4OO5A 4V2MA 3FYGA 3F63A 2GSTA 2C0GA 2DMLA 2VLTA 4KSMA 2R37A 6GSWA 1F3BA 5GSTA 1EEMA 1HYUA 4HJMA 2I4AA 2DJJA 1AAZA 3KJYA 2GLRA 2CX3A 1GULA 1BQ7A 3QAVA 4MMMA 3QDNA 3DYRA 2HXKA 2H66A 3KTBA 2VCXA 4YQMA 1K0DA 1X5EA 1AXDA 3EE2A 4TR3A 2PBJA 3EINA 2LNSA 4EO3A 1WMJA 5A5KA 2CVDA 4V2NA 1ZZYA 1AQXA 3HCZA 4GQCA 1PD21 1GTIA 1X5DA 2F8AA 1M9BA 1TW9A 4XTSA 2I3YA 3D4MA 5E59A 2WFCA 2X8CA 5FWGA 4RI6A 2OE1A 2C3TA 1YY7A 1T4YA 3FRCA 1S3AA 3IK9A 3A2WA 4F9ZA 1X9MB 3FR3A 4LMWA 4Q5QA 3WT2A 3HD5A 18GSA 4MZCA 5C04A 4EUYA 1XVQA 3GFKA 5G2ZA 4EKZA 4L5OA 2MYGA 1KTEA 2H19A 3WD6A 3ZVJD 4I8BA 3ZRDA 3JCML 1W89A 4G9HA 4HZ2A 5HFIA 4MJBA 4AJ7A 3EMXA 1JLWA 1JLVA 1NHYA 2PGTA 4HZ4A 4TKYA 3M3MA 1TU8A 3Q74A 4TR4A 2WRTA 3F0IA 3Q6OA 4EE0A 5A4UA 3FEUA 1V9WA 2OE0A 4TXOA 5CNWA 2V1MA 2M72A 1EZKA 2RLIA 2L5OA 1FG4A 1XBSA 2AYTA 3QAGA 2HRNA 3U6VA 2EIOA 3QMXA 4K2DA 3M8NA 3TJFA 5DQYA 3FKFA 16GSA 2TIRA 4LA1A 1M2DA 2YWOA 2N5BA 4OO4A 1OYJA 2K6VA 4AF2A 2LS5A 2EIRA 1JHBA 4ID0A 1PX6A 2KOKA 5CP1A 2CZ2A 4TXOB 3ME7A 3S9FA 3VWWA 3L9VA 1BAYA 2FD3A 5LNKe 6GSUA 2VCQA 4IQAA 5IO2A 1DE1A 2WJUA 3EU4A 1OAZA 3LWAA 3APSA 5B8BA 2AHEA 3ISOA 1NSWA 3NOFA 1AQWA 4BA7A 3HXSA 4IW9A 5J4UA 1TDIA 3IXRA 1TI1A 5JWOB 2L59A 4EDZA 3GYKA 1X0RA 1X9SB 3DMLA 3HVXA 2VL2A 1EOGA 3P8WA 1Y6EA 4O5RA 2H6YA 1WJKA 4EVMA 4HJ2A 2LRNA 4KUNA 1LJRA 3RBTA 2GZPA 2E2GA 3IAS2 1B9YC 2GQMA 2HNLA 1GH2A 3MWHA 2LNTA 2DLXA 2NPBA 4HU7A 5F06A 1UC7A 2PU9C 1MDIA 4TW5A 3ZLPA 1XCCA 4ZB6A 2F8FA 4EDYA 4NWYA 2HSYA 1F6MC 5AGYA 2K9FA 2J23A 4RQXA 2MMZA 4JBBA 1OC8A 1PA3A 1DBYA 3LJRA 1XW5A 5ECLB 4P3YB 5DJLA 4D73A 5COHA 1N8JA 1G7EA 1PRXA 2B5XA 3W8JA 2A2SA 1THOA 1QXHA 1HNCA 2H76A 5HFKA 3CSIA 5ENUA 5CRGA 2YZUA 5DDLA 3L9SA 3D4TA 2WB9A 2L4QA 2H75A 4MH2A 2IMEA 3GKMA 4QL7A 3WGEA 3F6FA 1ILOA 3K8NA 1SU9A 2JACA 2HSHA 4Q5FA 5CRHA 1VF4A 1PMTA 2I9HA 2C0EA 1G0TA 4D73B 2YWMA 5DCHA 2AAWA 1YDKA 2MBTA 5ECOB 4F03A 1VRSD 4K0NA 3TJGA 4EXJA 2V32A 5HFGA 2H0IA 1ERVA 3BBYA 1PSQA 3IPZA 1GP1A 3ZVJA 1YJ6A 5IO0A 3CRUA 2DJ1A 2LJKA 1MEKA 3DXBA 1MDJA 1ABAA 3TJJA 4JR6A 4POMA 5HR3A 2O7KA 3BD2A 1O6JA 4TR1A 2GSQA 2DJKA 4N11A 2BMXA 2YNXA 5HR2A 2CAIA 3TRXA 6GSYA 1PGTA 1SENA 4N10A 4G10A 3FW2A 2JZRA 4IVFA 1XWAA 2C4JA 4MF6A 5EY6A 1GSQA 5IMCA 2OBKA 2IWTA 2VD1A 1LU4A 5IM9A 2KUCA 2YP6A 4IJIA 1XWKA 4IN0A 2N5AA 2ZUPA 1WPIA 2C1YA 3EMPA 3VK9A 1Z6MA 1SKWB 2JADA 5AIVA 1QQ2A 3CTGA 2YJHA 4L0UA 3GRXA 3TRQA 3TKSA 4TR1B 2GZZA 2VOCA 4ISDA 1TKDB 5IMAA 1ERUA 2PERA 5JWRB 1QK8A 3WGDA 2VCVA 2IMDA 5ELAA 1FB0A 4KW6A 2J9HA 5G1LA 5J9BA 3M9JA 1MTCA 2AV4A 3RHBA 2GS3A 4FH8A 1QFNA 3ZL5A 3N9JA 2C0DA 4TRXA 3EURA 1V57A 2PWJA 2X8GA 5D9XA 3W6GA 3E3EA 5INYA 5JCGA 3GKXA 4OCEA 3P2AA 2WULA 1PKWA 1XWBA 2M80A 3P90A 1TP9A 1A8YA 3GN3A 4N0ZA 1XPVA 4GXZA 4CW9A 2GGTA 3C1SA 1QUWA 3E0UA 1TU7A 1NHOA 2XBQA 1PX7A 5B6MA 5KN2A 2YOIA 1SK0A 4IGJA 3LSZA 2OJLA 4MZBA 3TKRA 5HR0A 3FZ5A 3TB2A 1VF3A 3GUSA 1OE7A 6GSXA 1FB6A 1Z3EA 4XS1A 1TRWA 3EU3A 4K0GA 3GA4A 3DGQA 5F05A 1O85A 4O32A 5CRDA 6GSTA 3PH9A 4WR4A 3KXOA 1WOUA 1YF1A 2ALBA 2TRXA 5ECSA 2CT6A 2VLUA 3PR8A 3GTUA 3TKPA 1KEBA 1YEPA 2VAFA 1HD2A 4GSNA 1X9WB 2LQQA 1U87A 2VUPA 3A5WA 2KP1A 1XW9A 4LL4B 5ABRA 1YKCA 1GUKA 1MDKA 1NM3A 3I9V2 4HI7A 4IQ1A 1IYHA 2CX4A 1F3AA 1E2YA 4F82A 3LYKA 1GLQA 1AIUA 4I6XA 7GSSA 4EL1A 4GRFA 2LRTA 3DVXA 4HEA2 1TRVA 4MJCA 2LRCA 4OFNA 4N30A 1ZYEA 3GTUB 2BJXA 5LCZA 4ILFA 4J2FA 4BL7A 4MLYA 3L0HA 4FYBA 5A4VA 5F07A 1FO5A 1OC3A 2VCZA 2FY6A 4TVEA 4J57E 3PINA 1R4WA 2DIZA 1AQVA 4GWRA 1XZOA 1T4ZA 4GF0A 4ECIA 2IJYA 1GSUA 3LEFA 1SL1B 4NAXA 3HVVA 2DC5A 4BVXA 3VLNA 2RUFA 4KDYA 5D96A 3GL5A 2DSAA 1WIKA 3H79A 2N5FA 5JCUA 3LFLA 1XXUA 4NV2A 5IIZA 2ON5A 2XC2A 3UAPA 4NXIA 3GL3A 4MCUA 4TXVA 3QAWA 2IL3A 4K1FA 1OVNA 4AJ6A 2P5QA 2YPMA 5D93A 2GDRA 4MPGA 4WETA 2CVBA 5HQPA 1PQNA 2V41A 2H1GA 3HVSA 8GSSA 4MF7A 1R7HA 2D2ZA 2FWFA 3DIEA 3ZITA 2OACA 4ECBA 4IJ3A 3VI7A 4XRDA 1MD4A 3KP8A 4WF5A 1U6TA 2VD0A 1PL2A 3F4SA 2PVQA 4WF4A 3DKSA 5DAKA 1B4PA 4WBRD 2YANA 1WP0A 3IR4A 4DVCA 1I5GA 3G9BA 1XFLA 1K0MA 2WDUA 3C7MA 2H01A 2WS2A 2B1LA 2H8LA 3U5RE 1R5PA 2FWHA 5D9TA 4WKWA 1Y25A 2OE3A 3C73A 4OCFA 4K7IA 1NW2A 3DEXA 2A2RA 4G19A 1URMA 3GX0A 6GSSA 4NMUA 3VPQA 1K0OA 1GRXA 4GLTA 4ZBAA 1ZL9A 3HHVA 3F9UA 4XRAA 5DAKB 4FIWA 2P5RA 2IMIA 2REMA 3EWLA 5KN1A 5H5RA 20GSA 2XPEA 4K7NA 2HZFA 1RW1A 2FLSA 4TN8A 2OBIA 5J5NA 3Q18A 5G5FA 5CYYA 2FA4A 5ECPB 2NVLA 1J08A 2VL2C 5AIXA 4BPYA 4GSTA 2CVKA 1ACVA 1K0BA 1G7OA 3F3QA 3WGXA 3RDWA 4HS1A 4XIHA 2PMTA 2RUEA 2YJ7A 2MMOA 2G2QA 1K0NA 1K0AA 2EC4A 2R6KA 3ZREA 1T00A 1I9DA 1S3DA 2DIYA 1YQ1A 4DEJA 3UIWA 3O3TA 4OMVA 1A24A 4I2UA 1G6YA 5ECKB 2PUKC 4JE1A 3UVTA 4E8HA 4LMVA 1SK2A 3KD0A 3HJMA 3ME8A 1PN9A 3LXTA 1JZOA 5L71A 1X5CA 3KH7A 12GSA 3NIVA 1OKDA 3HZ8A 3MSZA 3VWXA 4F0BA 1PKZA 2AJQB 1SK1A 4ULXA 5EL8A 3UOMA 1ST9A 3UBLA 1SKSB 3M0FA 1JZDA 4K7OA 4KX4A 3ZYWA 4Q5NA 2FHEA 3EYTA 2GVPA 13GSA 4QQ7A 3RPPA 1BJXA 1TJDA 2FWEA 5KN0A 1TRSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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