4N13A

Crystal structure of psts (bb_0215) from borrelia burgdorferi
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
255
structure length
253
Chain Sequence
EKIVSIGGSTTVSPILDEMILRYDKINNNTKVTYDAQGSSVGINGLFNKIYKIAISSRDLTKEEIEQGAKETVFAYDALIFITSPEIKITNITEENLAKILNGEIQNWKQVGGPDAKINFINRDSSSGSYSSIKDLLLNKIFKTHEEAQFRQDGIVVKSNGEVIEKTSLTPHSIGYIGLGYAKNSIEKGLNILSVNSTYPTKETINSNKYTIKRNLIIVTNYEDKSVTQFIDFMTSSTGQDIVEEQGFLGIKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Sequence, biophysical, and structural analyses of the PstS lipoprotein (BB0215) from Borrelia burgdorferi reveal a likely binding component of an ABC-type phosphate transporter.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding pro
molecule tags Transport protein
source organism Borrelia burgdorferi
total genus 87
structure length 253
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n13A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n13A01
1UTHB 4KI0E 4KYSA 1NL5A 3LC8A 1B51A 1VFDA 3KOSA 2F5XA 4PP0A 2XD3A 1CE2A 2V25A 4DCXA 3Q29A 3D4CA 1ANFA 2GHAA 1JEVA 1SD3A 3IJOB 3O6GA 1SVXB 4RJZA 2I48A 4ELOA 1NNKA 3MZ1A 3KFMA 5AA2B 1AH5A 5LOMA 3K6WA 3KN7A 3TKDA 2DWHA 3TQWA 3RT8A 3LSLA 3MBPA 4LATA 1N04A 4G68C 4R72A 4P0GA 1NMUA 2Q2CA 4GXAA 2NXOA 2Z8FA 1JEUA 3MWBA 1WODA 4ZE8A 5JTYA 1URSA 2O69A 1JQFA 4YAHX 1D9YA 1SQYA 1SI1A 4OMBA 1P1NA 5K2YA 5TPAA 2O6AA 4F3GA 5DTBA 1PDAA 4F29A 4BDNA 1D4NA 1II5A 2E1SA 1D3KA 1NFTA 4TLLB 3O97A 4FE8A 4M1VA 2DXYA 4EQBA 3O6IA 4QSDA 3THIA 3UA8A 1B05A 3PMXA 3G7WA 4JWXA 3S9NC 3L6GA 2Q88A 2ZXTA 5M2VA 2XX7A 1N3WA 4E0WA 4WEDA 1Q35A 5L8DA 4PFYA 3ECRA 3ZKLA 1FQEA 4YICA 4M4GA 4AB5A 1FQBA 3SERA 2NUVA 4FJPA 4ZECA 5CC2A 5BWJA 2QPQA 3IORA 3MPLA 1NNFA 1S50A 4IO7A 2PT2A 4FEDA 1P1WA 3O29A 5CI5A 3T66A 3ILUB 2VD3A 1LFHA 1MS7A 4GIZA 3H6TA 1XVXA 4IY5A 5DEXA 4YZZA 1B5IA 3PPRA 4PQJA 1EH3A 3M3FA 3OSRA 5I2NA 5CRYA 2HXWA 5J1DA 3H06B 1IEJA 2H4IA 3C31A 5TP9B 4QFOA 1XC1A 4MH5A 2QL3A 1B58A 2YJPA 1B6HA 3C4MA 4U1OA 4LQ2A 4MF3A 1UQWA 4O3AA 3N26A 2Z22A 4ESWA 2I0BA 3E13X 2I3VA 3MZ9A 4H0WA 3N94A 4GOTA 2I6EA 1NKXA 3RT6B 1FTJA 3B6WA 3TODA 1IXIA 1MDQA 3PU5A 1B3HA 1B52A 3RQTA 2GRVA 5CBSA 1SW1A 4QSEA 2NVUB 4BLAA 2VD2A 3FATA 1JW5A 3LR1A 4BDMA 4F18A 3IOTA 4LVQA 1Y1MA 4XKQA 2DYXA 2DE3A 3G3GA 1SW5A 2ESNA 3CIJA 4QF9A 1FQFA 5I2NB 1R9LA 3CI8A 4YB7A 1O7TA 4R73A 2QS1A 2Y84A 1MXVA 5AA3A 3BFTA 1US5A 4OENA 1LBBA 3DM0A 3S2VA 3KGCA 4LP2B 5FHNA 3W9WA 1OIBA 2HCAA 5CMKA 2YLNA 3RN8A 1XHYA 3CRBA 2O68A 3OD7A 3KN8A 4ECFA 2HFBA 1B9JA 4GWOA 1GV8A 4ZEFA 3PUYE 3KOTA 2DSFA 1B46A 4YB6A 3ILTB 3FVNA 4X1BA 1JW1A 4G4PA 3KJ7A 5H8QA 5F7VA 1IXGA 2QJEA 2HEUA 3K0VA 4NWDA 1OLCA 1N0TA 4POXA 2Y7KA 4FATA 1DPPA 2F8DA 1ZKBA 4U4XA 1D9VA 3RLFE 1EU8A 4R6YA 4EXKA 4EQ7A 5IKBA 2H99A 1O64A 3MVWA 1B3GA 4KD5A 3UN6A 4E0XA 3MVXA 1B0HA 3OOAA 4PETA 3FVOA 4AB6A 1SYHA 1R6ZA 1A7LA 3IX1A 4G8MA 2XXYA 2XXHA 2F7CA 3C33A 4RY1A 1POY1 2Q2AA 5EHMA 4H8IA 3O9PA 3CG1A 4ZEKA 1MXUA 4KCDA 1LAXA 2I58A 4JWYA 2OWSA 4H67A 4N13A 5AA2D 1QVSA 2O7UA 3CSGA 4I8CA 3H3GA 2E0SA 3K6VA 2H9BA 1VR5A 4DLDA 3T96B 5L9SA 2PBWA 5H8FB 3MP1A 5H8HB 1H44A 4FECA 2QS2A 1AMFA 5H8QB 3TCHA 3O2AA 2ZYOA 4QFNA 1P99A 1FQAA 2XHDA 3C34A 3B6QA 2VHAA 2XXRA 2QMXA 4JSDA 3RGYA 1GGGA 2RC9A 3GXAA 5KZTA 3QIMA 4KYEA 1IIWA 4EUOA 4C1UA 4OZ9A 4YMBA 5KDTB 4I9DA 4HW8A 1Y4CA 4K3FA 2UYFA 1R9QA 3QXMA 2Y7WA 2W7YA 3JV9A 5H8SA 3C35A 4UACA 4RK2A 4ZZAA 4P11A 3PMVA 2ZYNA 2GFEA 4IB2A 3PPOA 3TTLA 1JVYA 1UTBA 2A5TB 1NNPA 2CMOA 1GR2A 1RYOA 1ZMGA 3M8UA 4OVJA 2G93A 3QYTA 1F9BA 1XS5A 4MBPA 2M8CA 1N7WA 4DXUA 5EYFA 4O3CA 3H7MA 3T9UA 1B7UA 3MVYA 3FD3A 3E3KA 3KSXA 3KBRA 3O66A 1VE4A 3KSJA 2Y7PA 4F2OA 4ZEDA 4FAJA 2ABHA 2Y7IA 4IGRA 1EZPA 1Y3PA 3KZGA 4HTGA 3DELB 2I4BA 5CM6A 1QW0A 2D21A 5CBRA 4XKRA 4KPTA 4BDOA 4G8NA 2PT1A 4N6PA 3OENA 2PX1A 1H45A 3S9MC 1B40A 3R7XA 4KFQA 1SW2A 4KYDA 1AIVA 3A3CA 3FXRA 5B70A 3USDA 1GVCA 1MXYA 5ICTA 1IQ7A 5B7DA 4I62A 2QS4A 1USYH 3OSQA 5HPQA 3K6XA 3FASA 1QULA 4DXBA 4R75A 4QSCA 3PPPA 4O3BA 2A5SA 3BFUA 2UXAA 4ZS9A 3IR1A 2I4CA 3F11A 2ALUA 2DWJA 4Q0CA 1MPBA 1ZTYA 1EZ9A 3D4GA 3CR9A 1LBCA 2DP8A 3DLNA 3RPWA 4R6HA 3MQ9A 5BUUA 2F6PA 4OYVA 1KWHA 3SESA 4F1UA 1FTKA 2FA7A 1LFIA 2Z8EA 1SDXA 5TU0A 4YKKA 1MY2A 2UVIA 4H8JA 3SEVA 4OEVA 2O84X 5L9OA 2B65A 4R9GA 3OO9A 5ICQA 1B3EA 1LCFA 3JZJA 2D3IA 3MUQA 1BIYA 4OQOA 4C1TA 3U8QA 5FTIA 4X9TA 1RYXA 3SEUA 3OO8A 3A3UA 2F34A 4F3BA 1LB9A 5I56A 3LBSA 4F39A 1A8EA 2DVCA 3CFXA 2OCUA 5JTYB 4JB7A 3PUZE 3V83A 2DOJA 1B4ZA 1M5BA 4WKMA 4DCYA 3QK6A 3O28A 4L17A 4G2ZA 4R2FA 5TPAB 3V5AA 4YB5A 1LCTA 3K00A 2RCBA 3LSXA 4G77A 1O63A 2OZZA 3Q27A 1VSOA 1TWYA 1LLSA 4NF8A 1M5FA 2ZNUA 2B3FA 1MXWA 1T0KA 3TTMA 2THIA 3KG2A 1PB8A 4GXSB 1H3DA 3OEKA 4H5FA 3IOUA 3TTKA 3EHUA 4F2QA 1WVJA 5IAIA 1I6QA 1TFDA 1PB7A 1QUKA 4LUBA 4N07A 2GH9A 2NOOA 2QRYA 1TT1A 1OMPA 4EQ9A 3GLBA 2XXVA 4H6DA 4ELPA 5AA4A 5A5XA 3A09A 3VDFA 5I56B 2UVGA 4LA9A 1FQCA 1JW4A 1R1NA 4OERA 4U1ZA 2RC7A 3BKIB 2ZNTA 1A8FA 2D5WA 1LSTA 1UIUA 2F7AA 2ZMBA 1A99A 3N6UA 4C0RA 4NF8B 5DVFA 1YTVA 2XXPA 3Q26A 5I2KA 5EHSA 1MM7A 3RTFB 3TTNA 3SKPA 5DEXB 5DT6A 5ITPA 3HO7A 1OVTA 1USYE 4OFJA 2PYYA 1B4HA 4ONYA 3HHGA 1WDNA 3PUXE 2HAVA 2OBGA 3BBRA 4KCCA 2HAUA 1H43A 4U4SA 3R6UA 1I6AA 3FUZA 3IB0A 3IB2A 1B7HA 1ZBMA 3PPQA 4NF6A 4G8HA 4R74A 2V84A 5AA4B 2H25A 1LAHE 5A5XB 3FV2A 3K6UA 3G3HA 3QUJA 2XXTA 4BDRA 4DIGA 1B1HA 4OFOA 1HSEA 5HBCA 3M3LA 1OQGA 3SEWA 1S7YA 2V93A 4OETA 3QAXA 3SDFA 2F7BA 5CMMA 3GZGA 3U92A 5ISUA 3PUVE 3E9XA 5I2KB 4R6KA 1DSNA 1XT8A 1B2HA 1P1OA 3KN3A 4R9FA 3CSBA 2AIXA 4KR5A 2Q89A 4EDPA 3UIFA 4QFPA 1MY1A 1YAEA 3CFZA 5FHOA 5I57A 2WKYA 4P0IA 4H65A 4IO3A 3V8XB 2LAOA 1Y9UA 4I1DA 3MPKA 1RKMA 1YPNA 3C9HA 1N76A 3MP8A 4GF8A 4THIA 2ONRA 1FQDA 4H1XA 2V3QA 1Y3NA 3K2DA 4NWCA 4Z7EA 5H8NA 1MQJA 2OLBA 3WAFA 3RY3A 4HCWA 1MG1A 3I3VA 1B5HA 5AA1A 2Q8JA 3ZKKA 3UP9A 1MPDA 3VV5A 3DP4A 2XXWA 1Q1KA 1MH3A 3T9VA 3FVKA 3LUYA 1MQGA 1Y1ZA 1ZJLA 4QFLA 3U93A 3OEMA 3S4UA 4GL8A 3AXFA 3TUSA 4NE4A 2F78A 1PEBA 2R71A 4NF5A 2I49A 4R2BA 4IO6A 3B6TA 2X26A 2BJJX 2F97A 5AE4A 4GD5A 2UVJA 2H5YA 2XX8A 3IB1A 2P1SA 3OELA 3KEIA 4F19A 1PB9A 3K1MA 4ND9A 1ZLQA 5JK4A 1H76A 3HCQA 2P2AA 4ZEIA 3GBBA 1IUDA 2GHBA 4U2RA 1VFEA 5DYHA 1PBQA 1AL3A 1FCKA 3FV1A 2OWTA 2RF1A 1A40A 4DZ1A 4PE5B 2X7PA 1MXZA 4NMYA 4F3SA 5L9MA 3ODBA 3TAJA 1A54A 3MC2A 2RCAA 1Z7NE 4TOZA 2O51A 4NEDA 2DS9A 3I5OA 2XXUA 3MAMA 2AL4A 1B5JA 2Q9TA 5DVIA 2XXIA 1MRPA 4FEBA 3LSFB 3VLWA 2PMSA 3JYRA 4NF4A 3E4RA 1L5TA 4MFIA 1SW4A 2ZYKA 3IOWA 4YU0A 3T9XB 1FTOA 2X7QA 4H5GA 3K1PA 1MQHA 1LB8A 1Y20A 1MPCA 4RPOA 4GL0A 1UTBB 2IEEA 2QMWA 3G3IA 3T9HB 3CG3A 1MY3A 3OO7A 4X48A 3KJTA 1DPEA 3PV0E 4Q8RA 1I6BA 1QKAA 2H98A 1FTLA 2V3TA 3VFJA 3C36A 2I3WA 4OXVA 3EN3A 4GLIA 1FW0A 3HN0A 3VLUA 5ELVA 2ANJA 3G3FA 2HZKA 3FXQA 1BKAA 4NF4B 3Q28A 2ONKE 1Z7ME 5K2XA 3TQLA 1OLAA 1ELJA 3IAZA 4ZE9A 4F1VA 5ITOA 4F1YA 3UGWA 3IJXB 4LZ8A 1TXFA 2CZLA 1SBPA 5KCJA 2OK2A 3UORA 2UYEA 2YPNA 2O1LA 4RK9A 4ISUA 3DP8A 3V89B 3UK4A 4PFWA 3TPAA 3K1NA 4FIMA 1PBPA 1QJMA 3TCGA 4ELQA 4XXUA 3TMGA 1PC3A 3PMWA 2R6GE 3W15C 4F22A 3HSTA 1URDA 3IO6A 3LSWA 2DXRA 2RC8A 4YMAA 4IO2A 2REGA 3IL1B 5I59A 4U23A 1BTJA 4U22A 1LFGA 3ZSFA 5TP9A 1YCJA 3CFLA 3H6WA 4TQUQ 1B32A 3FGSA 2F6GA 1QUJA 1OVBA 2Z23A 1M5EA 3RUMA 5KCJB 3SEXA 2XD2A 3SETA 4OEUA 2P0SA 4X1DA 4QHQA 4UA8A 4MLQA 3K4UA 5HM4B 1URGA 3OO6A 3FZVA 4OTEA 2Y7RA 1M5CA 3ONMA 4YKPA 3FJMA 3H6VA 3G3JA 4GVOA 3MZBA 2UVHA 4HCYA 4KQPA 3FIRA 4TLMB 1DMBA 5I58A 3QUFA 4OESA 2REJA 4LZ7A 1NNTA 3WAEA 5I59B 1DTZA 3VXCA 2I0CA 3H4ZA 3B7DA 4RNSA 4MLVA 4KHZE 1M5DA 2OJTA 3N6TA 3GBAA 2DVZA 1MY4A 2ONSA 1FTMA 1POTA 4LONB 4AQ4A 1B0LA 3U94A 1Y4TA 3Q25A 2F36A 4RA1A 1AOVA 1B7ZA 1B1XA 5CMBA 2RINA 4GQOA 2RKMA 1IXCA 2DWAA 4IO4A 1US4A 1JETA 4GRKA 3MW0A 3DP6A 2QSXA 3TTRA 2XX9A 3I6VA 3HPIA 4WXJA 3M3KA 4U21A 3MP6A 1GTKA 5I58B 5F1QA 4PFTA 3TYHA 4QRZA 2KLFA 1XOCA 2DQVA 2DE2A 3N5LA 3W9VA 3FJ7A 3TZAA 1DTGA 3HHFA 3H6UA 3PUWE 3S9EA 4EXLA 3VVDA 1N7XA 3OMBA 1IZ1A 1CB6A 1B3LA 5FTHA 1Y3QA 5I84A 2PVUA 4Q5TA 2FNCA 4ZZEA 3TEPA 4JWOA 3TELA 2G29A 3ZS6A 3K01A 3TCFA 3EPEA 1SYIA 4OWDA 2VOZA 3T93B 1LGBC 3FVGA 4RPNA 1XVYA 4G68A 5H8FA 5H8HA 3K02A 4OHNA 2DE4A 1ZU0A 4XIGQ 3VVEA 1A55A 4NF6B 2HZLA 4GFRA 4RXLA 3U72A 1LAFE 3IO4A 4JBZA 1S9TA 2B3BA 5CMCA 3TDJA 4DDDA 3H03A 4EF2A 4ZDMA 4XKNA 5KDTA 3PD9A 3VE1B 1N84A 3VXBA 4PFUA 3EHSA 4Q30B 4F3PA 4QFKA 3G3KA 1NH7A 3MJNA 2QS3A 1TFAA 3VLVA 3CVGA 4YKIA 4JSOA 5DVJA 3RNNA 1I69A 1DOTA 2R9JA 2A5TA 4IO5A 3VVFA 4G68B 2VGQA 2IA4A 2AL5A 4BDLA 3HV1A 1MDP1 1QKBA 5I57B 2O7IA 1LAGE 2DWIA 1MXXA 1BLFA 3MVZA 3IK6B 4XTCQ 3RTWB 2F35A 3QSLA 3P7IA 2VP1A 2Z8DA 3IOVA 1QUIA 4POWA 2ZYMA 3C32A 4XKPA 1P1QA 3PD8A 1HSLA 4Z0IA 1EZOA 4IY6A 1ZIUA 4LQ5A 3FJGA 5H8NB 1ATGA 1JVXA 1UTHA 1OQHA 4JXIA 3PGFA 3L6HA 4ELRA 1B3FA 1P1UA 2V3UA 1JNFA 2NWJA 1MM6A 1N3XA 1BP5A 1J1NA 4HS7A 3T22A 1MH4A 1UIVA 4BDQA 4F31B 3EHTA 2AYSA 3U1OA 2ZNSA 5JEIA 3TFLA 1MQIA 4ZEBA 1HSJA 1MQDA 5AA2A 3S9LC 3SEYA 4NF5B 3PPNA 4WEPA 3FXUA 3R26A 4LZ5A 4ESXA 1IITA 4EF1A 4RYAA 4DXCA 5FHMA 1NH8A 4NTLA 2XXQA 1MY0A 4FORA 2HQ0A 2XXXA 3OXNA 1SI0A 4JDFA 4IGTA 1IXHA 4DE8A 3EQ1A 3O6HA 4OFLA 2O1MA 2FYIA 4YKJA 3EF7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1UTHB 4KI0E 4GX4A 1NL5A 3LC8A 4KYSA 1B51A 1VFDA 3T0JA 3KOSA 2F5XA 4PP0A 2XD3A 1CE2A 2V25A 4DCXA 2OX3A 3Q29A 3D4CA 1ANFA 2GHAA 1JEVA 1SD3A 3IJOB 3O6GA 2FVZA 1SVXB 4RJZA 3HFUA 2I48A 4ELOA 1NNKA 3MZ1A 3KFMA 5IZ3A 5AA2B 1AH5A 3LUZA 5LOMA 1NUYA 3K6WA 3KN7A 3TKDA 2DWHA 3TQWA 1LBYA 3LSLA 3RT8A 3MBPA 4LATA 1N04A 1YYZA 4G68C 4R72A 4P0GA 1NMUA 3KC0A 2Q2CA 4GXAA 2NXOA 2GQ1A 2Z8FA 4P1EA 1JEUA 3MWBA 1WODA 4ZE8A 5JTYA 1URSA 2O69A 1EYIA 1JQFA 4YAHX 1D9YA 1SQYA 1SI1A 2CEXA 4OMBA 1DBZA 1P1NA 5K2YA 2DDKA 5TPAA 3U65A 2O6AA 2PFZA 4F3GA 1PDAA 5DTBA 4F29A 4BDNA 1D4NA 1II5A 2E1SA 1D3KA 1NFTA 4TLLB 3O97A 5ESYA 4FE8A 4PCDA 4M1VA 2DXYA 4OANA 5IZ3B 4EQBA 3O6IA 4QSDA 3THIA 3UA8A 1B05A 3PMXA 3G7WA 4JWXA 3S9NC 3L6GA 5IM2A 2Q88A 2ZXTA 5M2VA 2XX7A 1N3WA 4O7MA 4E0WA 4WEDA 1Q35A 5L8DA 4PFYA 4I3EA 3ECRA 3ZKLA 1FQEA 4X8RA 2Q74A 4PAIA 4JVDA 4YICA 4M4GA 4AB5A 1FQBA 3SERA 2FIEA 2NUVA 4FJPA 4ZECA 5CC2A 3MSTA 5BWJA 2QPQA 3IORA 3MPLA 4PGNA 1IMEA 1NNFA 5I3SA 1S50A 4IO7A 2PT2A 4FEDA 3IFCA 1P1WA 1KZ8A 3O29A 2WBBA 1FRPA 5CI5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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