4N13A

Crystal structure of psts (bb_0215) from borrelia burgdorferi
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
255
structure length
253
Chain Sequence
EKIVSIGGSTTVSPILDEMILRYDKINNNTKVTYDAQGSSVGINGLFNKIYKIAISSRDLTKEEIEQGAKETVFAYDALIFITSPEIKITNITEENLAKILNGEIQNWKQVGGPDAKINFINRDSSSGSYSSIKDLLLNKIFKTHEEAQFRQDGIVVKSNGEVIEKTSLTPHSIGYIGLGYAKNSIEKGLNILSVNSTYPTKETINSNKYTIKRNLIIVTNYEDKSVTQFIDFMTSSTGQDIVEEQGFLGIKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Sequence, biophysical, and structural analyses of the PstS lipoprotein (BB0215) from Borrelia burgdorferi reveal a likely binding component of an ABC-type phosphate transporter.
pubmed doi rcsb
source organism Borrelia burgdorferi
molecule tags Transport protein
molecule keywords Phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding pro
total genus 87
structure length 253
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n13A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n13A01
3RPWA 2Z8FA 5I57A 1MQHA 1P99A 2GHAA 3R7XA 2Z23A 4JSOA 2HZKA 4AB6A 1JNFA 1XS5A 1JW1A 1MQIA 1H76A 2HZLA 3IAZA 2F7BA 3JYRA 3PGFA 1FTKA 1USYH 3E3KA 4NWDA 2FNCA 4JBZA 3LUYA 3TTMA 4ELRA 5J1DA 2I4CA 4Q30B 2I49A 3O6GA 3MP6A 2F7CA 4ZEBA 2V93A 2XXYA 4I62A 4H6DA 3TELA 2X7QA 4RPNA 4EUOA 1FTLA 1US4A 4OTEA 1LFGA 3KSXA 3TQWA 2ALUA 4GRKA 3UN6A 3ZS6A 4HW8A 4NF8A 5A5XB 2RKMA 3TPAA 2F8DA 3B6QA 4KYDA 1US5A 3T9XB 1FTJA 2OZZA 3PPPA 2DVZA 3O6HA 4GL0A 2XX8A 4LZ7A 4G8HA 4R73A 1URGA 2QS2A 4R6KA 3RTFB 3SETA 1B40A 4OVJA 3MZBA 4Q0CA 2R9JA 1JETA 3OENA 5I2KB 5BWJA 1FTOA 5A5XA 1MG1A 2ZNSA 3DLNA 1XT8A 1NNFA 2DS9A 3KJ7A 1MXXA 4EQ7A 1H43A 2YPNA 3PUYE 3WAEA 4G8MA 1XVYA 4KR5A 3S9MC 1I69A 2REGA 1A8FA 1PBQA 2A5TB 2AYSA 3CI8A 1JVYA 2P1SA 2ONRA 3IL1B 3IOVA 3L6HA 3RT6B 1TT1A 2Y7IA 2Y7WA 1QVSA 2XHDA 3TAJA 5H8NB 2QL3A 4F3SA 4ZEDA 4QFOA 4YKIA 1R1NA 2HEUA 2XX9A 1WODA 1EZ9A 1ZIUA 1MPDA 1TXFA 2GHBA 3FGSA 4QSCA 4QFNA 1AH5A 4RY1A 3U93A 4DXCA 2OLBA 4R9GA 1O7TA 3MQ9A 4KD5A 2P0SA 4KYSA 5H8QA 3W9WA 4BDLA 4YMBA 1B0LA 3D4CA 2DXRA 2ZNUA 3SEXA 1MXVA 2I4BA 4U23A 3HV1A 3FATA 1UTHA 1RYXA 3GXAA 3SERA 3PUZE 4P0GA 2REJA 3C35A 3KOTA 2ANJA 4FE8A 3W9VA 1FCKA 1NNKA 3B7DA 4Q5TA 3C4MA 3V5AA 3E4RA 4F2OA 1TFAA 3G3GA 3S9NC 2F6PA 1B3GA 3BBRA 3PMVA 4QSEA 4BLAA 1LGBC 4MF3A 4RK2A 5B70A 5TPAA 1F9BA 1PB9A 1NNPA 3GBAA 3K0VA 3OD7A 1FQFA 4ISUA 3OEMA 1IEJA 1VSOA 3IO6A 3FJMA 1ZJLA 3FZVA 3DP8A 4XXUA 1SDXA 3EF7A 2YLNA 2X26A 3RUMA 3RLFE 3TTLA 2DOJA 3H03A 4WEPA 1AOVA 1NL5A 3FIRA 3K6UA 4PQJA 3QYTA 4JWXA 2O69A 1EZPA 4LP2B 4GWOA 3TTNA 3MVYA 3MZ1A 1UTBA 3O29A 2R71A 2QMWA 4GXAA 2DE4A 1JEUA 3N6TA 3VXCA 2UVIA 4G68B 4FEBA 3UIFA 5JK4A 2DE2A 4F3PA 5AA4A 3OO8A 2V3TA 1XHYA 3S2VA 3PPQA 2Z8DA 1PC3A 2IA4A 3GBBA 2I0BA 3MJNA 3MVXA 5CMMA 2XXVA 3QSLA 3O66A 3SEWA 2I58A 4OYVA 3SEYA 3JV9A 2QSXA 4OESA 2OBGA 3PUXE 4HTGA 2Z22A 2Y84A 4KFQA 5CBSA 1RKMA 1UTHB 3CSBA 3LSFB 2F78A 1CE2A 2O7UA 3PUVE 5AE4A 4KCCA 2H5YA 4NEDA 5EYFA 4ZZAA 5I58B 2V25A 1ZMGA 3FUZA 3QUFA 3RNNA 3SEVA 3IORA 3IR1A 4GIZA 3V89B 4EF1A 3QIMA 1QW0A 4TOZA 1B05A 2E0SA 2GRVA 3A3UA 2Q8JA 3T9HB 2DWIA 4RNSA 2QS1A 1IXGA 3FD3A 5KZTA 1HSJA 2O7IA 1SYHA 1II5A 1PB8A 2O1MA 3ILUB 4DCXA 4AB5A 3Q27A 1YTVA 4EXKA 3MVWA 3FXRA 3U94A 1M5CA 3HPIA 2PMSA 2DYXA 4DDDA 1CB6A 1JVXA 3G3FA 2VOZA 3VV5A 1VFDA 1J1NA 1LSTA 2DE3A 1SD3A 1H45A 2H25A 1FTMA 4IY6A 4GF8A 3CRBA 2XD3A 3OO9A 3B6WA 4Z7EA 1D9VA 5AA2D 3QAXA 4H5GA 3DP4A 2R6GE 1OVTA 1JQFA 3LR1A 2Y7KA 1MM6A 1MQGA 3TTRA 2ONSA 4F1YA 4KCDA 3V8XB 1B7ZA 3Q25A 5AA4B 2DP8A 4H1XA 4L17A 4H5FA 2I3VA 1LCFA 4U22A 1MM7A 3QUJA 4JXIA 3UORA 1I6QA 4DE8A 4U21A 4H8IA 1WVJA 4F1VA 4YU0A 1B32A 5IKBA 3CIJA 4YAHX 5HBCA 1S50A 2D3IA 3TCFA 3KEIA 1BTJA 1MQDA 1XC1A 1B4HA 1LB8A 1UIVA 3IOTA 4BDNA 4EQBA 1ATGA 1DOTA 3KN3A 4XKNA 4ELOA 3IJOB 3T93B 1OQGA 4OXVA 4G68C 1IQ7A 3SDFA 3KN7A 1D9YA 2PT1A 1PB7A 3E13X 1QUJA 3HSTA 1O63A 3C34A 4TLLB 1OMPA 1IIWA 1XVXA 1MDQA 1A55A 2F7AA 4NF6A 1URSA 2B65A 5I84A 4XIGQ 5I59B 3DP6A 1Q1KA 5DEXB 3MZ9A 4F3GA 2DSFA 4ESXA 1MY3A 3BFTA 4MH5A 4NF6B 1PEBA 3N6UA 3O97A 4IGRA 3TCHA 4IB2A 4IY5A 4RJZA 4U1OA 1JEVA 5DTBA 1VE4A 1M5DA 3FVKA 4ONYA 2Q9TA 4N13A 4NF4A 2LAOA 5HM4B 4R6YA 3K1MA 3PV0E 4ZECA 4FAJA 1NKXA 1D3KA 3IO4A 3EPEA 3S9LC 1MPBA 1OIBA 3LC8A 4GFRA 1VFEA 1B6HA 2Q88A 1D4NA 4WEDA 2XXIA 5KDTB 3CSGA 1AMFA 3K1PA 3S9EA 2HAUA 1HSLA 1URDA 3EHTA 3TEPA 4OETA 3VDFA 3VLUA 1B7UA 2D21A 1MPCA 4FJPA 1LAXA 2ZXTA 4MLQA 4QHQA 3R6UA 1UQWA 1FQCA 4LZ8A 5L9OA 2F34A 4QSDA 2XX7A 4RXLA 2ESNA 3EHSA 4GVOA 1DTZA 1LBCA 1M5FA 3CG1A 4LVQA 4GQOA 4WXJA 4YKJA 5CRYA 1IUDA 5ITOA 3RT8A 5M2VA 3RQTA 4OMBA 1B3FA 2Y7RA 3HO7A 2A5TA 3FV1A 3FVGA 3ZKKA 1P1WA 1IXHA 4DZ1A 2ABHA 1WDNA 5ITPA 3G3JA 1N04A 3KJTA 3O9PA 4O3CA 3W15C 1MDP1 5DVIA 3C36A 2Q89A 1B9JA 3H3GA 2OJTA 3B6TA 1Y3NA 3ILTB 4KHZE 4P0IA 1OVBA 2X7PA 4YB5A 4AQ4A 1B3HA 3K01A 2I6EA 3LSXA 3N26A 5B7DA 2V3QA 3KSJA 5CC2A 3TKDA 2CMOA 2QS3A 2NUVA 1Z7ME 3C9HA 3TDJA 2Q2AA 3LBSA 3N94A 3PPOA 4H65A 4HCWA 4IO7A 4F3BA 3OSRA 2A5SA 3JZJA 5H8QB 5I57B 4LQ5A 2DVCA 1QUIA 1PDAA 4EF2A 4QFLA 5CBRA 3H6VA 4YB7A 5TP9B 1ANFA 3KG2A 4G77A 1MY2A 1MH4A 1B51A 3IK6B 1OLAA 3LSWA 4LA9A 1QULA 1YPNA 4PP0A 4U1ZA 5FHMA 3USDA 5CMKA 3GLBA 3PU5A 5ICTA 4TQUQ 1MY4A 1BLFA 4ZE8A 4LZ5A 4ESWA 2OWTA 1POY1 4FORA 4RK9A 2AL5A 3IB0A 4UACA 4ZEKA 3T9VA 1USYE 2QS4A 1B3LA 3CFLA 1MRPA 4MBPA 1MS7A 3T22A 4OHNA 4DLDA 5AA3A 4R9FA 3WAFA 3BKIB 5KCJA 1N3WA 4G4PA 4RYAA 1DSNA 2ZNTA 3ZSFA 2QMXA 1LAFE 3IOUA 5F1QA 3A09A 5FHNA 2HAVA 3K02A 3KGCA 4F22A 2ONKE 3UP9A 2ZYKA 3VVDA 3KN8A 5HPQA 4O3BA 1Y4CA 1SI0A 1IZ1A 2GH9A 2PYYA 3MC2A 4F39A 2D5WA 5I56A 4YZZA 4YB6A 3T9UA 3FVOA 2VD3A 3ONMA 4M1VA 4NE4A 4K3FA 3IOWA 2XXRA 3CG3A 2Z8EA 3A3CA 5FHOA 1SI1A 1T0KA 5CMBA 1EH3A 2DWHA 2G29A 2XXPA 5CMCA 4C1UA 3TTKA 2HQ0A 1FQDA 1ZTYA 1I6BA 1O64A 4F31B 3TCGA 4I1DA 5FTIA 4IGTA 4ZEIA 3R26A 3SKPA 3P7IA 2O84X 4TLMB 3TQLA 1A8EA 1MXZA 3T96B 4YMAA 5I59A 4ZZEA 1A7LA 1SW5A 1Y3QA 4OFJA 2PX1A 3OO7A 3O2AA 4HS7A 3K6XA 4F29A 2F97A 1IXIA 4JSDA 4JDFA 1N7XA 2DQVA 3UA8A 2FA7A 2UXAA 2VP1A 1YCJA 2QJEA 3IJXB 4G2ZA 2O1LA 4YKPA 1M5BA 3PD8A 1BKAA 5ICQA 1SYIA 2H9BA 3VFJA 1JW4A 2RC8A 4H67A 4WKMA 4X1BA 4QFPA 3MWBA 3MVZA 5TU0A 2XXUA 5AA2B 4JB7A 2THIA 3F11A 3UK4A 3U72A 3KFMA 5JTYB 4BDOA 4F2QA 3IX1A 4QFKA 2NOOA 3K6WA 3M3FA 4GXSB 3VVFA 1MY1A 4X9TA 4U2RA 5CM6A 5ISUA 2OCUA 3PPRA 3K00A 1B5HA 3BFUA 4ZE9A 1UIUA 3IB2A 5FTHA 5L9MA 2I48A 2UVJA 4U4SA 4BDMA 1OQHA 2RF1A 4GOTA 4N6PA 2F6GA 3HN0A 1N0TA 2QPQA 3I5OA 1FQEA 1UTBB 2HXWA 3H06B 4ZS9A 3PUWE 3QXMA 1IITA 4R2BA 3FXQA 5H8HB 3RN8A 4EQ9A 5L9SA 1SW1A 1B5JA 2HCAA 4G68A 3K2DA 3SESA 5L8DA 3LSLA 2ZMBA 2F35A 4H0WA 4I9DA 4OEVA 2RC7A 2OK2A 1I6AA 4KQPA 3U8QA 1SW4A 2XXHA 2XXTA 4GLIA 3MW0A 1B1XA 4OFLA 4RA1A 4X48A 1GTKA 4U4XA 3G7WA 3PMXA 5AA1A 3M3LA 3SEUA 1B0HA 1TFDA 1ZU0A 1DPPA 4ECFA 2V84A 3TUSA 1P1UA 2M8CA 1DTGA 1N3XA 1MY0A 4XKRA 1Y3PA 2ZYMA 2ZYOA 3K6VA 4NF8B 1LCTA 2PT2A 3MUQA 4OZ9A 5I56B 1LFIA 5H8FB 2AL4A 3OO6A 1B1HA 5DEXA 2GFEA 3TZAA 3TYHA 1NNTA 1SW2A 1VR5A 1YAEA 4NF4B 3G3IA 1SBPA 4YICA 5H8SA 4LUBA 3D4GA 3N5LA 4R72A 1N7WA 4IO3A 4EXLA 3C33A 4ELPA 2CZLA 2UVGA 3IB1A 2BJJX 3VLVA 1B3EA 2F36A 3TMGA 5KDTA 3U92A 5EHSA 1B4ZA 1H3DA 4OFOA 1EU8A 1R9QA 3Q26A 1ZLQA 1Y4TA 1BIYA 4ND9A 3TFLA 4DIGA 1MXWA 3DM0A 1B58A 3MAMA 2Q2CA 2P2AA 3H6WA 1DPEA 3H7MA 4OENA 3G3HA 5H8NA 4JWOA 1IXCA 1A99A 1TWYA 2AIXA 3H6TA 4GL8A 1QUKA 5F7VA 1HSEA 3DELB 2H99A 3OXNA 4G8NA 1NFTA 4PFYA 4LATA 4OWDA 2XXQA 3MP8A 5I2KA 1PBPA 4IO5A 5TP9A 2VHAA 3GZGA 4PETA 2DXYA 3MBPA 4R6HA 3KOSA 1R6ZA 3OSQA 1MH3A 4PFTA 4ELQA 2Y7PA 2XD2A 1B52A 5TPAB 2UYFA 2G93A 2YJPA 4ZEFA 1POTA 1B5IA 3Q29A 3T66A 5ELVA 4QRZA 4OERA 4HCYA 2XXWA 3MP1A 1ZBMA 5DT6A 4ZDMA 4XKQA 3TODA 4R75A 5JEIA 4F18A 1M5EA 2I3WA 1LLSA 1ZKBA 3EHUA 2ZYNA 3E9XA 4P11A 4UA8A 4FECA 5BUUA 2RCAA 3PMWA 4KI0E 4NWCA 4C0RA 1S7YA 3H4ZA 1DMBA 4FEDA 3M3KA 2RINA 2O6AA 1SVXB 3Q28A 4KYEA 3VLWA 2V3UA 2RC9A 3VXBA 2I0CA 1A40A 4X1DA 5I2NA 3RY3A 2PBWA 4C1TA 3O6IA 1R9LA 2O51A 2UYEA 4IO6A 4IO4A 2FYIA 4JWYA 1B2HA 3RTWB 5AA2A 1QJMA 3C32A 3O28A 1LAHE 1NH8A 1P1NA 2VD2A 4O3AA 1MXYA 3FJGA 1RYOA 5KCJB 4IO2A 4NF5B 3OOAA 1FQBA 3FV2A 1KWHA 2XXXA 3OMBA 4MLVA 1JW5A 1QKBA 4YKKA 1Z7NE 1GVCA 3S4UA 3CFZA 3FJ7A 1LBBA 4MFIA 3VVEA 2WKYA 3MPKA 1AIVA 3UGWA 1MXUA 1Q35A 1P1QA 2DWAA 3VE1B 4BDRA 1QKAA 4PFWA 4Q8RA 3EQ1A 5I58A 1XOCA 3I6VA 3M8UA 2DWJA 4XKPA 5I2NB 3K4UA 2F5XA 4BDQA 4GD5A 1NMUA 5IAIA 3HHFA 2NVUB 2H98A 1FW0A 2O68A 3H6UA 4DCYA 4NTLA 4QF9A 2PVUA 3FASA 1N84A 1L5TA 3THIA 1Y1ZA 4KPTA 2IEEA 1BP5A 4DXBA 4LQ2A 1P1OA 3CR9A 3OELA 5DVJA 5H8FA 2B3BA 1OLCA 4H8JA 4M4GA 1SQYA 5LOMA 2RCBA 1S9TA 2E1SA 4DXUA 3K1NA 4I8CA 3KBRA 5DYHA 5K2YA 2VGQA 3FVNA 3KZGA 1FQAA 1AL3A 1B46A 3FXUA 3OEKA 4OQOA 4FIMA 1A54A 1Y1MA 2NWJA 5H8HA 4E0XA 3QK6A 2W7YA 3HHGA 4EDPA 1LAGE 3PPNA 3C31A 3CFXA 1GV8A 1LFHA 4POXA 1MQJA 3EN3A 4FATA 2QRYA 4RPOA 4Z0IA 2H4IA 4NF5A 4POWA 1GGGA 3MPLA 4THIA 1EZOA 1B7HA 2NXOA 1N76A 3I3VA 1LB9A 1NH7A 3U1OA 3CVGA 2B3FA 3ECRA 1H44A 4LONB 4PE5B 4XTCQ 4F19A 1Y9UA 5CI5A 4F1UA 5EHMA 1GR2A 2OWSA 3L6GA 2HFBA 3V83A 4R2FA 3ZKLA 4OEUA 3ODBA 3G3KA 4NMYA 4PFUA 5DVFA 3RGYA 4E0WA 3AXFA 2UVHA 2KLFA 3HCQA 4N07A 1Y20A 5JTYA 1ELJA 3PD9A 4R74A 5K2XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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