4N13A

Crystal structure of psts (bb_0215) from borrelia burgdorferi
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
255
structure length
253
Chain Sequence
b'EKIVSIGGSTTVSPILDEMILRYDKINNNTKVTYDAQGSSVGINGLFNKIYKIAISSRDLTKEEIEQGAKETVFAYDALIFITSPEIKITNITEENLAKILNGEIQNWKQVGGPDAKINFINRDSSSGSYSSIKDLLLNKIFKTHEEAQFRQDGIVVKSNGEVIEKTSLTPHSIGYIGLGYAKNSIEKGLNILSVNSTYPTKETINSNKYTIKRNLIIVTNYEDKSVTQFIDFMTSSTGQDIVEEQGFLGIKT'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Sequence, biophysical, and structural analyses of the PstS lipoprotein (BB0215) from Borrelia burgdorferi reveal a likely binding component of an ABC-type phosphate transporter.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding pro
source organism Borrelia burgdorferi
molecule tags Transport protein
total genus 87
structure length 253
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n13A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n13A01
4XKNA 1NL5A 3D4GA 4EQBA 1A7LA 5CC2A 4L17A 1URDA 4LQ5A 5AA2A 5I57A 2ZYNA 5KCJA 5EYFA 4QFLA 3GBAA 1IUDA 1YTVA 4O3AA 1JQFA 1MXUA 3K1NA 1DTZA 3L6HA 5ISUA 2UVHA 1N76A 4YU0A 4OXVA 2DVZA 4FEBA 5DTBA 1NMUA 3TCFA 4R6KA 3QUFA 3S9EA 5FHNA 4NE4A 4RPOA 2XHDA 4GRKA 3MZ1A 3H6TA 2Q89A 3OXNA 1Y4CA 3VLVA 4GXAA 3AXFA 4F1YA 2XXXA 1B58A 3FATA 2ALUA 4H0WA 4FIMA 3VLWA 3MP8A 2WKYA 3PV0E 4RJZA 3OEKA 4BDQA 3FGSA 4YMAA 3IOUA 1Y20A 4ZE9A 4JXIA 1FTJA 4IO3A 5KZTA 1I69A 1B4ZA 1QULA 3QYTA 3KJTA 3O6GA 4I62A 2FA7A 3DP4A 3R26A 3KGCA 2XX8A 1BIYA 3VDFA 3VVDA 2A5TB 4R2BA 4R74A 3CG3A 4RYAA 1A8EA 4OMBA 1SVXB 4C1TA 3IJOB 3GLBA 5FHMA 4MLQA 4ZEIA 1B3EA 1DSNA 1B0HA 4JWXA 5AA2B 3LSFB 5I57B 1Y1MA 1TXFA 3M3FA 4YAHX 5KCJB 1IXHA 1LFHA 1HSLA 2XXWA 1JNFA 2PVUA 3QIMA 4U4XA 5AA2D 3FVOA 2GRVA 5H8NA 3PU5A 4X48A 2V93A 1OLCA 4AQ4A 2THIA 1IQ7A 2DOJA 2RF1A 2XX7A 2Y7KA 4F29A 2YLNA 3RLFE 3FJ7A 2NXOA 3G3IA 2PT1A 3LBSA 1MY1A 1R9QA 4PFYA 1Q1KA 1GGGA 1PB7A 3IK6B 3FASA 3MPLA 4OVJA 2H9BA 3QXMA 4QSCA 3H03A 1FQBA 4ESXA 1A99A 2QS3A 1T0KA 3EN3A 4IB2A 4IGTA 4EQ9A 1GR2A 2QL3A 1XOCA 2I4CA 5B7DA 3HHGA 1XHYA 3KN7A 4JB7A 4ECFA 4QSEA 1XVYA 4F3GA 1D9VA 3M3KA 3KG2A 2UYEA 1UTBB 5IAIA 1VFEA 2RINA 3CFLA 2XXTA 4KI0E 2Z8EA 2DYXA 2UVJA 3V5AA 4GIZA 4C0RA 3RN8A 2D21A 5K2YA 1MXWA 4ZZAA 2XXRA 1M5DA 3ONMA 2R71A 1B9JA 4N13A 3MVWA 1LAGE 2ZMBA 5AA1A 3FXRA 3JYRA 2F6GA 5I2NA 2QMWA 4KYDA 5I2KA 4ZZEA 1PDAA 4YB7A 4F2OA 5H8NB 2Y7IA 2F35A 2Y7RA 3KBRA 2V3UA 4OEUA 3O29A 5I56A 5BUUA 2HZKA 4TLMB 5FHOA 1MY4A 1ZIUA 3MWBA 3OSQA 3GBBA 4WEPA 4LA9A 4Q5TA 1P1NA 5AE4A 4XTCQ 2I6EA 4DE8A 4H6DA 3O2AA 4QFPA 4ELOA 1Y4TA 3FV1A 4UA8A 4ELQA 3V89B 3RQTA 4EUOA 2VD3A 5JTYA 1US4A 4P11A 2ZYOA 2P2AA 4DCYA 1LAXA 1NNPA 3FD3A 4KR5A 3R7XA 2OBGA 5I59A 1B5JA 3OO8A 1MDQA 4OHNA 2H5YA 1TFAA 2B65A 3DM0A 4DIGA 4F39A 1B5HA 2DS9A 3Q27A 4LQ2A 4ZS9A 1WDNA 1Y3NA 2GFEA 3C33A 3KZGA 4M4GA 1VFDA 5I84A 2NUVA 3UIFA 2ZNSA 3USDA 2REJA 1NH8A 3FIRA 4HW8A 2XXVA 1RYXA 1GTKA 1FTOA 4QFOA 3B6WA 1LSTA 5ELVA 1SI1A 3M3LA 4U21A 2PX1A 5AA4A 5M2VA 1NNKA 4OFJA 3KN3A 3HN0A 4G68A 3HPIA 3FXQA 3FXUA 4YKPA 4G2ZA 4F22A 4Q8RA 4MBPA 4LONB 1B3HA 2UVIA 3Q29A 5I56B 3ZS6A 3RTFB 4EDPA 2XXIA 4KYSA 1NNFA 4RNSA 3HHFA 3FVNA 1B52A 4F3BA 4H65A 5CMCA 3MVXA 2Q2CA 1IEJA 1MG1A 3GXAA 3CSBA 3SEVA 1ATGA 5CBSA 2I3WA 4X1DA 2Q8JA 3G7WA 4GOTA 1FQAA 2XD3A 1ZKBA 2DE4A 3ZKLA 1SDXA 2UYFA 4U1OA 3T9XB 1LBCA 4UACA 3S9LC 2DWAA 4H8JA 1MQGA 1MM7A 3K01A 1B0LA 2W7YA 1MY0A 2DSFA 2XXHA 4BDNA 1ZBMA 4F1VA 3PUWE 3IR1A 3K4UA 4NEDA 3DELB 3IB1A 2ZNUA 4MF3A 1SW4A 5ITPA 1OVTA 3OSRA 2I0CA 3N26A 2FNCA 2HEUA 3PGFA 1A8FA 1FW0A 3C9HA 3FVKA 4ELPA 5FTHA 3HV1A 3TEPA 1FTLA 1QKBA 3TPAA 4OENA 3UN6A 3O66A 2I3VA 5AA4B 1FQCA 4TLLB 2KLFA 3W9WA 2NOOA 2RC7A 4AB6A 4G68B 3PPNA 1AIVA 4JWOA 3KOTA 1Z7ME 5CMKA 1YPNA 3JZJA 5FTIA 3PD8A 3H4ZA 1LCTA 4RXLA 4F18A 4OTEA 4Q0CA 1XS5A 3O97A 3KSJA 4JBZA 3JV9A 1IXCA 3N6TA 2QS1A 1SW5A 3H06B 2G93A 4XKRA 1JW5A 2PMSA 5L8DA 1JW1A 1IXIA 1MQHA 4F2QA 2DWJA 3Q26A 3RY3A 3I6VA 4WEDA 3CG1A 1MS7A 3MQ9A 2OWSA 3GZGA 4KCCA 1SD3A 1D3KA 2O7UA 1UTHA 4R2FA 2XXPA 1B32A 2RKMA 2VP1A 2O1MA 1UTBA 3A3CA 2ONSA 3MW0A 4LZ7A 4O3CA 3N94A 1MH4A 3VXBA 2F97A 2DQVA 3QSLA 2OLBA 1NKXA 5L9MA 4KCDA 3VXCA 4GFRA 5KDTA 2HXWA 3G3KA 2F34A 3EF7A 1MY3A 3O28A 1AOVA 1P1OA 2B3FA 3IB0A 2R9JA 1JEVA 1Z7NE 3K6VA 1MY2A 3G3JA 2OZZA 2QMXA 4G8NA 5JK4A 2AL5A 5DVJA 2ZNTA 3PPRA 1B7UA 1FTMA 1MRPA 4MFIA 1YAEA 1GV8A 3ZSFA 3OEMA 2HQ0A 4WXJA 2ONRA 4FORA 2VOZA 4YZZA 5LOMA 3PUVE 4IY6A 2ABHA 4XXUA 4KQPA 4GL0A 4IO2A 3SEYA 1FQDA 3D4CA 3DLNA 2PYYA 4G68C 5DYHA 1QUIA 1II5A 3I3VA 1XVXA 2M8CA 1POY1 3TTLA 1S9TA 5TPAA 3K2DA 4R9FA 3MUQA 4LZ8A 3SEUA 3G3GA 2XXQA 3TQWA 1QVSA 4N6PA 2O51A 1B1HA 1YCJA 1Q35A 1Y3PA 2A5SA 4ZEBA 2IEEA 2V3TA 4OERA 3TQLA 3BKIB 1L5TA 3WAEA 5B70A 2Z23A 1I6BA 1TWYA 2Q88A 1UTHB 1JETA 4EF1A 3CSGA 4F3SA 3U94A 4RK9A 2LAOA 4Z7EA 5L9SA 3PPPA 1ANFA 4JWYA 3FJMA 1M5BA 1MPBA 3IOTA 1N7XA 1BTJA 2I49A 2OK2A 2V3QA 2F7AA 3TTRA 2P0SA 4HCYA 5KDTB 5CRYA 3QAXA 2GHAA 3UK4A 3VV5A 1OQHA 3O9PA 4O3BA 4OYVA 2HAVA 1SI0A 4ESWA 3IJXB 2YJPA 1PB9A 1IZ1A 1LGBC 4QFKA 4YB6A 3E4RA 3PUXE 3PUZE 1Y1ZA 4EF2A 3PD9A 4GWOA 3TELA 4IY5A 3TODA 4F1UA 4NWCA 3T66A 3TDJA 4DZ1A 4JSDA 3CR9A 3FZVA 1RKMA 4JSOA 1H43A 4YKIA 4HTGA 1ZU0A 4QF9A 3RT8A 2ONKE 5IKBA 4DLDA 4PETA 4K3FA 2FYIA 3E13X 2QRYA 2RCAA 4GL8A 5TPAB 3K1MA 1B51A 3V8XB 1F9BA 3OO7A 5ICQA 1DTGA 3U93A 2QJEA 3IOWA 1HSEA 3TFLA 2D3IA 3A09A 3UP9A 2I48A 1TT1A 1US5A 1M5EA 1EZOA 1O63A 2REGA 4BDLA 5BWJA 1JVYA 2DXRA 4GD5A 3M8UA 3UORA 3C31A 1BKAA 3TYHA 3KJ7A 2UVGA 1ELJA 2I4BA 4PFWA 1R9LA 3TCGA 1PC3A 4GQOA 4EXLA 1PBQA 3LC8A 5CBRA 4AB5A 4FAJA 3KEIA 3TTNA 2OJTA 3MP6A 3OMBA 4JDFA 4G8MA 1CB6A 1EZ9A 5CI5A 1J1NA 2X26A 4PP0A 2GHBA 3C4MA 5H8FA 2Q2AA 2PT2A 1JEUA 4KYEA 4POWA 1SQYA 3VVFA 4H8IA 5CM6A 5EHSA 4U4SA 1USYE 3SERA 1LFGA 3C34A 3ILTB 4NTLA 3VVEA 2CMOA 3FVGA 3IOVA 4YB5A 1B05A 4DXUA 2DP8A 3MC2A 5H8SA 2DWHA 2ESNA 3RTWB 1POTA 5F7VA 2UXAA 1TFDA 4HS7A 1JW4A 1P1WA 3T9VA 4PQJA 4NF4A 3FJGA 1AMFA 4OEVA 2Y7PA 3CRBA 2V25A 1PBPA 3EQ1A 1H45A 3I5OA 3RPWA 3Q25A 1HSJA 3IX1A 3P7IA 2F5XA 3Q28A 1NH7A 2QS4A 5DEXA 3B6QA 3SESA 1B1XA 3MP1A 4PFUA 4NF6A 4ISUA 3B7DA 4RA1A 3B6TA 3H3GA 4PE5B 5A5XA 1QKAA 4GVOA 4YKKA 5DT6A 4LVQA 3WAFA 1B4HA 3MZBA 3PMVA 2XXUA 4MLVA 2RCBA 1MQIA 4FJPA 2H25A 4KFQA 4OQOA 1BLFA 3OO9A 3C32A 2X7PA 4BLAA 4ONYA 1MPCA 2F78A 5H8FB 1B7ZA 3UA8A 1UIVA 1ZMGA 2DE2A 4RY1A 2PBWA 2Z8DA 4QFNA 3ILUB 1H44A 5TU0A 3MZ9A 3FV2A 2DWIA 4IO5A 1QUKA 4POXA 3OD7A 4BDMA 4ZEKA 2YPNA 3MBPA 1RYOA 1H3DA 1VE4A 3KOSA 4XKPA 3V83A 4M1VA 1B6HA 3TMGA 5TP9B 3S9NC 3PPOA 4QSDA 1ZTYA 1P99A 1AH5A 4NF4B 3OELA 3TTKA 3VLUA 1IXGA 3OO6A 1B5IA 1MM6A 3PMXA 4R73A 2Q9TA 3H7MA 1DMBA 4F19A 2HCAA 2HZLA 3K6UA 4NF5A 5DEXB 1UQWA 1FTKA 1N0TA 3LSWA 4OWDA 4NF6B 2VD2A 2QPQA 5A5XB 3IORA 4MH5A 2B3BA 2I58A 5I58B 4R9GA 2P1SA 1N04A 4F31B 4FEDA 2AYSA 1D4NA 5H8HB 2Z22A 2RC8A 3LUYA 2AL4A 3IL1B 3S2VA 2F36A 4E0WA 4THIA 1Y3QA 4E0XA 1B3FA 3T22A 1I6QA 1PB8A 3K6XA 4Z0IA 2O84X 4TOZA 4LP2B 4BDRA 4IO4A 4ZE8A 5HM4B 4H5GA 1ZLQA 1M5FA 2BJJX 1MDP1 3MVYA 1O64A 2ANJA 1P1UA 4R72A 1LB8A 3T9UA 1OMPA 2QSXA 2XX9A 3MJNA 3VE1B 3T93B 2R6GE 3RUMA 4XIGQ 1LB9A 1SYIA 4DDDA 2DVCA 4FECA 5ITOA 3U92A 3PMWA 4KD5A 3S4UA 1B3GA 4NF8A 4KHZE 3H6WA 5J1DA 4U23A 4QHQA 2H98A 2I0BA 2Y7WA 3K0VA 3OOAA 4OFLA 1CE2A 1MPDA 3FUZA 2G29A 5H8QA 3T96B 2GH9A 1ZJLA 3CVGA 4Q30B 3SEXA 5DVFA 2VHAA 4YICA 2F7BA 3SETA 3C35A 4P0IA 4FE8A 5AA3A 5ICTA 2O1LA 4NF5B 1XC1A 3KN8A 3T9HB 4EQ7A 2NVUB 4OETA 1OIBA 4OZ9A 1N7WA 2O68A 3LR1A 4WKMA 4ZECA 3UGWA 3HO7A 4YKJA 4RK2A 1EZPA 4U2RA 1OLAA 1UIUA 3TAJA 4HCWA 1H76A 3ZKKA 4P0GA 2DXYA 2E1SA 1LFIA 1I6AA 1DPPA 4ZEDA 3MVZA 4I9DA 3QK6A 1MQJA 1N3XA 3R6UA 1GVCA 1R6ZA 4DCXA 4BDOA 4RPNA 2CZLA 3LSLA 3K00A 3TKDA 3CFZA 5CMBA 4X1BA 4C1UA 3BBRA 4U22A 3W9VA 4NMYA 3MAMA 2H4IA 1SW1A 4I1DA 3W15C 1JVXA 2VGQA 2HAUA 1URGA 3C36A 4TQUQ 3OENA 5DVIA 1SW2A 2V84A 4H67A 1FQEA 1B2HA 4GXSB 1WVJA 3RT6B 3SEWA 1MXYA 3TCHA 4NF8B 1Y9UA 3VFJA 1N3WA 1OQGA 2Y84A 1QW0A 1IIWA 1A55A 4R6YA 3IO6A 4OESA 1MXVA 3EHUA 2OWTA 5H8QB 4G4PA 4ZEFA 1VSOA 3PUYE 3IB2A 3K6WA 3RGYA 1M5CA 3K1PA 1N84A 3ODBA 1KWHA 4U1ZA 4F3PA 4G8HA 1DOTA 4H5FA 3K02A 5EHMA 3BFUA 3QUJA 1B40A 3G3FA 1FCKA 1R1NA 2AIXA 3TUSA 1MH3A 5L9OA 1D9YA 1NNTA 1QUJA 3H6UA 3EPEA 3LSXA 3BFTA 2F6PA 3O6IA 4IO7A 1EU8A 1WODA 3SKPA 4GF8A 1OVBA 1NFTA 2IA4A 3TZAA 2RC9A 1BP5A 4DXCA 3CIJA 5HPQA 1LAHE 1B46A 3EHSA 4XKQA 3PPQA 4R6HA 3N6UA 5HBCA 2F8DA 3U8QA 1B7HA 3IAZA 1P1QA 2E0SA 1LAFE 4IO6A 4KPTA 3U1OA 3F11A 2QS2A 2O6AA 5K2XA 1O7TA 4H1XA 1LLSA 5I2NB 1SYHA 1S50A 5I2KB 3RNNA 1B3LA 2XXYA 3MPKA 4G77A 1LCFA 2XD2A 3S9MC 4ZDMA 5CMMA 1IITA 2OCUA 4LUBA 4QRZA 5F1QA 5TP9A 1A40A 2ZYKA 4PFTA 4GLIA 2X7QA 1DPEA 3A3UA 1PEBA 2ZYMA 3CI8A 4ELRA 3H6VA 4YMBA 1EH3A 1XT8A 4LZ5A 1S7YA 1URSA 1SBPA 4X9TA 2D5WA 2HFBA 3G3HA 2O69A 4NWDA 4LATA 1VR5A 4OFOA 4R75A 3CFXA 1LBBA 3THIA 1QJMA 5JTYB 3E9XA 3DP6A 3KSXA 3N5LA 3TTMA 3E3KA 5I59B 3HCQA 3DP8A 4IGRA 5I58A 1A54A 4ND9A 2O7IA 1FQFA 4N07A 5H8HA 2Z8FA 2H99A 2NWJA 2ZXTA 4FATA 4I8CA 1MXXA 3HSTA 3ECRA 1MQDA 4DXBA 3SDFA 3IO4A 2F7CA 2A5TA 3O6HA 2DE3A 3EHTA 1USYH 3L6GA 5JEIA 1MXZA 3U72A 1AL3A 4EXKA 3KFMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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