4N13A

Crystal structure of psts (bb_0215) from borrelia burgdorferi
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
255
structure length
253
Chain Sequence
EKIVSIGGSTTVSPILDEMILRYDKINNNTKVTYDAQGSSVGINGLFNKIYKIAISSRDLTKEEIEQGAKETVFAYDALIFITSPEIKITNITEENLAKILNGEIQNWKQVGGPDAKINFINRDSSSGSYSSIKDLLLNKIFKTHEEAQFRQDGIVVKSNGEVIEKTSLTPHSIGYIGLGYAKNSIEKGLNILSVNSTYPTKETINSNKYTIKRNLIIVTNYEDKSVTQFIDFMTSSTGQDIVEEQGFLGIKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Sequence, biophysical, and structural analyses of the PstS lipoprotein (BB0215) from Borrelia burgdorferi reveal a likely binding component of an ABC-type phosphate transporter.
pubmed doi rcsb
source organism Borrelia burgdorferi
molecule tags Transport protein
molecule keywords Phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding pro
total genus 87
structure length 253
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n13A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n13A01
4KQPA 1OVBA 5ICTA 1DTGA 3MUQA 4Z7EA 3C35A 4F22A 1DOTA 2O7IA 3B7DA 2B65A 3QAXA 3U93A 3K4UA 3MVXA 5A5XB 2HAVA 5J1DA 1US5A 2B3FA 4R6YA 3TTKA 5DVJA 1I69A 4JWOA 4TLMB 1PB7A 3O66A 4XKQA 4YKPA 5H8QB 5TU0A 4BDRA 3B6QA 4E0WA 3BFUA 1ZJLA 5AA4A 1AH5A 1UIVA 4PETA 5DTBA 5I56A 2I3WA 3G3JA 1JETA 1B58A 3M3KA 3PMVA 2XX9A 4GQOA 4OEUA 4POXA 3FJMA 3N94A 4Q0CA 5L8DA 3CI8A 5TP9B 1LSTA 4YKKA 3M8UA 5AA4B 5KCJA 3ILUB 3CRBA 2REJA 1LAHE 4NF4A 4DCYA 1DSNA 5HPQA 3KFMA 1P1WA 1PBPA 4F2OA 3H6WA 2LAOA 5JK4A 2ZNTA 4GL8A 4U1OA 3FASA 4RYAA 4LZ7A 5JTYA 2DP8A 3SDFA 2Z8EA 4LQ2A 4LP2B 4F1YA 2UVGA 1SW5A 2ONRA 3PD8A 5IKBA 1A8FA 2P0SA 1ATGA 3G3KA 3LSLA 4QFPA 3RT8A 3D4CA 3CSGA 3IX1A 1URSA 2A5TB 3K6WA 2NOOA 2D21A 4GVOA 1ZTYA 2M8CA 3U94A 4GXSB 3PUXE 2I3VA 2VOZA 2Q2CA 3C4MA 4IO6A 5K2YA 2OLBA 1VR5A 2RC8A 3OEMA 4QSCA 4YMBA 1IZ1A 3KEIA 1PDAA 2DE3A 1B1XA 3QUFA 4GIZA 3K6VA 2QJEA 5CI5A 4QHQA 5FHOA 4OMBA 1B46A 2UVJA 3LBSA 1IXIA 3KN7A 4F18A 4KYEA 4N13A 3MWBA 4OENA 2I58A 2R9JA 4H6DA 4QF9A 4BLAA 1TFAA 3GXAA 3JYRA 3JV9A 3MC2A 4YKIA 1NL5A 5H8NB 1MY3A 4RK9A 1FQFA 2V84A 4MFIA 4ND9A 5DEXB 4XIGQ 4GFRA 4H8IA 3MW0A 4MBPA 5H8QA 3R6UA 2YPNA 3HCQA 3HN0A 2UVIA 3S9NC 4KYSA 1MG1A 3U92A 4F39A 2F7BA 1Q35A 3WAEA 4ZZAA 2ABHA 5L9OA 1TT1A 2ZXTA 4GF8A 3TKDA 3FXRA 3LR1A 4MLQA 3DP4A 3IORA 3PUYE 1XVYA 4LVQA 3K02A 4PE5B 4PFYA 2QMXA 2RCAA 2I4BA 3MVWA 1TWYA 3UP9A 2A5SA 1PB9A 2ZNUA 3OELA 1MM6A 1OLCA 2VD3A 1FCKA 3HO7A 1S9TA 4QSEA 3RTWB 3W9VA 2R71A 3TPAA 3RLFE 1FQCA 1QUJA 2HXWA 3GZGA 3IB2A 3N6UA 4LONB 4N07A 4R75A 3MVZA 1LB8A 1SI1A 4FEBA 5LOMA 1TXFA 3H03A 3H6VA 2F7CA 4U23A 1H45A 3VLUA 4EQ7A 1ZLQA 3F11A 5H8HA 4OWDA 4F29A 2UXAA 3QUJA 1A54A 3RGYA 1NFTA 3DP6A 2O1MA 2QRYA 1UTBB 4JSDA 5A5XA 2DS9A 1LFIA 2D3IA 3M3FA 4F3GA 1IXCA 1B5JA 1SYHA 2XD3A 2XXYA 2DE4A 3KJ7A 1MQIA 4POWA 4IO2A 3USDA 1MY1A 3M3LA 4I8CA 4O3AA 3VVDA 3Q25A 3LSXA 3R7XA 2ZYOA 3G3GA 4JSOA 5K2XA 4BDNA 2AIXA 3IOVA 3UK4A 4DLDA 2I0CA 4K3FA 5AA2A 1M5FA 3CFXA 3S9MC 5AA2D 1P1QA 1Y1MA 4R9GA 4KYDA 5ELVA 4ZEKA 4DCXA 1O63A 1P99A 1SYIA 3ZKKA 2PT1A 4DXBA 4U21A 1LB9A 1URDA 4JDFA 2XXIA 5M2VA 3SEYA 2Y7IA 3KZGA 3AXFA 3TTLA 5H8SA 2DE2A 3MZBA 1B4ZA 3T22A 4QFOA 3TCFA 3FGSA 3E4RA 4HS7A 1L5TA 5ICQA 2WKYA 1ZBMA 1FQDA 1H43A 4O3BA 1US4A 1I6QA 1USYE 4NF8A 5CMBA 4EDPA 2OBGA 5AE4A 5BUUA 4I9DA 1GR2A 3OO8A 2O51A 3QYTA 4PFTA 3UN6A 2VHAA 3TEPA 1OLAA 4NF5A 4XKNA 1LCTA 1GVCA 5JEIA 3N26A 3IO6A 3C34A 4YMAA 1H76A 1BP5A 5DVIA 2OCUA 4IO5A 1JVYA 2IEEA 2NWJA 4RNSA 4IO4A 1MXWA 1R1NA 1LBBA 4LUBA 3KBRA 1SW2A 1MY0A 4HTGA 4E0XA 2HZKA 4U22A 3G3FA 5H8FA 1N84A 4LZ5A 3DP8A 4X1BA 1QKAA 3MVYA 3UIFA 3EPEA 1RYXA 2XXVA 3TQLA 2F6PA 1BTJA 1M5DA 4DE8A 1FTMA 1SQYA 2QS1A 1AMFA 3IJOB 3IOTA 3FJGA 4IY5A 4OZ9A 3V89B 4BDLA 1IITA 2GH9A 2OWTA 3SEXA 1B5HA 2PYYA 2Y7RA 2H4IA 1HSEA 1B7ZA 2RCBA 1MXXA 3MZ1A 4F2QA 5B70A 1RKMA 2DQVA 3C33A 4FIMA 3KGCA 1D3KA 1OMPA 1NKXA 3JZJA 3CVGA 1B0LA 4Q5TA 1FTKA 2H25A 2Z8FA 2H5YA 3RN8A 1P1NA 5I57B 1A8EA 1N7XA 1TFDA 1UTBA 3HSTA 2NUVA 3T9HB 2XX8A 2Z8DA 3QIMA 4DDDA 3H3GA 2V3TA 3OSQA 1EZ9A 1QW0A 1S50A 3K2DA 3RUMA 4RPOA 5L9SA 3O9PA 5TPAB 1QUKA 1XOCA 4X48A 3FVOA 3U8QA 4WXJA 4UACA 4WKMA 2V25A 1VFDA 2QPQA 5DEXA 3W15C 4OEVA 2RF1A 4NEDA 4IO3A 1LFHA 1VSOA 4NE4A 2HEUA 1YTVA 2QS3A 1B0HA 2RKMA 3C32A 3DLNA 2IA4A 3FZVA 3O28A 3O97A 1QVSA 4N6PA 1MQDA 3BFTA 1P1OA 4XTCQ 3HHFA 4ONYA 1B05A 3SERA 1J1NA 4H5FA 1B3LA 4TOZA 4C1UA 1IIWA 1ANFA 3ECRA 5DVFA 3C9HA 2HCAA 1ZKBA 4F31B 3V83A 4U2RA 4GRKA 4IY6A 4P0GA 4QFKA 4THIA 1FTOA 3Q28A 4F1UA 3PPRA 2QL3A 1VE4A 4HCYA 1FQAA 1HSLA 2DVCA 2ONSA 3MAMA 1MXUA 3MJNA 4HCWA 4EXKA 3TZAA 5FHMA 3K1MA 1N3XA 3A3UA 5I2NB 2O68A 1AL3A 1ZIUA 2F7AA 3HPIA 4FE8A 4EUOA 4FATA 3BKIB 4GL0A 3VLVA 1JNFA 3G3HA 1SW1A 3TTNA 4WEPA 1PBQA 1R9QA 1MH4A 4P0IA 1PC3A 2YLNA 2PT2A 2XX7A 1GTKA 4G68B 3TFLA 2Y7WA 1O64A 4C1TA 1FW0A 2HQ0A 4U1ZA 1FQEA 1MXVA 2CMOA 1B5IA 2O1LA 2V3QA 1PEBA 3ILTB 1QUIA 1YPNA 3PUZE 4H8JA 3PPQA 4KI0E 1D9YA 1QKBA 2GHBA 2F97A 3PPNA 2YJPA 3VV5A 3KSJA 3U72A 5ITOA 5I84A 2FA7A 1B9JA 4R6KA 5H8FB 1ZMGA 2QS2A 4BDMA 1B1HA 5DT6A 3FVGA 1D4NA 4X1DA 2DWIA 3R26A 1ELJA 4O3CA 3VVFA 3KJTA 3THIA 4AB6A 1NNTA 1URGA 1MPBA 1II5A 5AA2B 3S9EA 2I4CA 4NF6A 3RNNA 3GBAA 5IAIA 3O2AA 3LSWA 1IXHA 3K6XA 3OEKA 5I59B 2UYEA 1N04A 3RY3A 5KDTB 2I48A 4ESXA 2QS4A 2DYXA 3O6HA 4M1VA 2DXRA 3EHTA 3RTFB 4GLIA 3BBRA 1MDP1 4R6HA 3TMGA 3S2VA 4QFNA 1XT8A 1M5BA 3ZS6A 2F78A 5H8HB 5I59A 5AA3A 5I2KA 1P1UA 2A5TA 2G93A 1EH3A 3T9VA 2NXOA 3CR9A 3SEUA 5CBSA 2ESNA 2ZYMA 3IAZA 2XXWA 1LFGA 3H6UA 1MM7A 4G68C 2PMSA 4ZZEA 3MZ9A 5CMCA 2QSXA 3VXCA 3V5AA 2Y7KA 4LA9A 4H67A 2RC7A 2AL4A 4OVJA 4OFOA 4MH5A 4ESWA 1DTZA 1NNFA 2P2AA 3GBBA 2X7PA 3OOAA 3RQTA 4I62A 1F9BA 3SEVA 4JB7A 4G4PA 4H1XA 2F35A 4QRZA 2OZZA 2ANJA 1B7UA 3IO4A 4DIGA 2UVHA 3FVNA 5CMKA 5ITPA 1B2HA 2H9BA 3FATA 4OFLA 5L9MA 4OHNA 1Y3QA 2F5XA 3OENA 1NH8A 2KLFA 3MBPA 4ELPA 4F1VA 4XKRA 1LGBC 1BIYA 1DPEA 5I56B 3FIRA 1OVTA 3EQ1A 1SD3A 2B3BA 2HZLA 2XHDA 2ZYKA 2DWJA 4QSDA 5H8NA 3OO7A 4ELQA 4EQ9A 3Q26A 5I2KB 5F7VA 5BWJA 4OYVA 3I3VA 4XKPA 4H65A 3I5OA 1POTA 2I6EA 1LLSA 1USYH 4KR5A 1M5EA 3IL1B 1AIVA 3O29A 1MQJA 4RY1A 4RXLA 4IO7A 1A40A 4ZEBA 1B4HA 5AA1A 3T9XB 2H99A 4OFJA 4LATA 4P11A 1NNPA 4NWDA 5TP9A 4NTLA 4BDQA 4AQ4A 1B6HA 5KCJB 1SVXB 5FTIA 2RC9A 3P7IA 1B3GA 1MXYA 4G8MA 5ISUA 2XXQA 3B6WA 2O69A 3E3KA 1A99A 1IXGA 1FTJA 1MXZA 2PX1A 4Q30B 3C36A 3FVKA 4MF3A 4ZS9A 3T93B 1IUDA 4IB2A 3OSRA 4KHZE 2Q9TA 2XXRA 3C31A 4EF1A 2G29A 4IGTA 3IB1A 3TTRA 1T0KA 1POY1 2O84X 4EQBA 4JBZA 5DYHA 4ZDMA 4DXCA 4DZ1A 1H3DA 1H44A 4ECFA 1I6AA 3MPKA 3ZKLA 3IB0A 3L6HA 4L17A 4FECA 3KN3A 4NF4B 2HAUA 1KWHA 4PQJA 5HBCA 1D9VA 1JEUA 3IK6B 3Q29A 4FEDA 3PU5A 1Y3PA 3LSFB 3PV0E 3CIJA 1M5CA 2Q2AA 2VGQA 2Y84A 4PFUA 4G77A 4ISUA 4DXUA 1LBCA 1N0TA 2V3UA 2QMWA 3T9UA 1IEJA 3FV2A 4GD5A 4R73A 3FV1A 4YKJA 3U1OA 4AB5A 3VFJA 3A3CA 2NVUB 3UA8A 3SKPA 2F34A 2P1SA 4U4XA 3MQ9A 4YZZA 3HV1A 5I58A 3N5LA 1CE2A 1MDQA 3EHSA 4M4GA 4PP0A 5CC2A 3OD7A 2DOJA 1QJMA 3MPLA 1MPDA 4ZEIA 3K1PA 3OXNA 3K01A 2Z22A 3FUZA 3K1NA 5CRYA 2R6GE 3W9WA 3TAJA 3LUYA 1Q1KA 1EU8A 4FJPA 4OESA 4H5GA 3IR1A 4ZE9A 1EZPA 1SDXA 4F19A 5I2NA 2HFBA 1B3FA 4KPTA 3FXUA 4KCDA 1UQWA 1B52A 4RJZA 2ZMBA 4NMYA 2FYIA 4LZ8A 2OJTA 1DPPA 2UYFA 4YB5A 1JVXA 2DWHA 3OO9A 4YU0A 1A55A 1LAXA 2GFEA 3S9LC 4ZECA 3VXBA 2REGA 3SEWA 1JEVA 4PFWA 4RA1A 4YICA 1PB8A 2Q8JA 4RPNA 3T96B 2X26A 3RT6B 2H98A 1SW4A 2Q89A 2XXTA 2F6GA 3E13X 3MP6A 3KOSA 3LC8A 1UIUA 3CG1A 4G68A 1YAEA 2PBWA 4X9TA 3GLBA 2Z23A 3VDFA 1OQGA 2ALUA 1A7LA 3SETA 1R9LA 3PUVE 2GRVA 1Y1ZA 3TELA 3TQWA 5B7DA 1HSJA 4XXUA 4KCCA 3HHGA 4LQ5A 2XXUA 1B51A 3FXQA 5TPAA 4QFLA 3CFZA 1MQGA 2D5WA 1B32A 1WDNA 1LAGE 1B7HA 3G7WA 3KN8A 4MLVA 1XHYA 3ODBA 1Y9UA 2AL5A 3OO6A 1OQHA 3UGWA 1GV8A 5KDTA 5CM6A 3FJ7A 1NH7A 3QK6A 4JXIA 4NF6B 1MPCA 4OQOA 4TLLB 1Y4TA 3IOUA 1JW4A 1OIBA 1XC1A 1B40A 1MY4A 3Q27A 3PMWA 4I1DA 3E9XA 1I6BA 3N6TA 3G3IA 4GXAA 4NF5B 5EHSA 2BJJX 3PD9A 3CSBA 4Z0IA 4ELRA 1N76A 4OXVA 4F3SA 1YCJA 3K00A 1WVJA 3QXMA 3ZSFA 2DSFA 1XS5A 2FNCA 1DMBA 2XD2A 1IQ7A 3CG3A 4R9FA 1MH3A 3EHUA 4F3PA 1BLFA 4IGRA 3VE1B 1QULA 3TCGA 1MS7A 5EYFA 2F8DA 1B3EA 4R74A 4BDOA 1N7WA 1GGGA 1R6ZA 4FORA 4GWOA 2O7UA 3RPWA 1UTHB 3CFLA 4Q8RA 5CBRA 1BKAA 1AOVA 3KOTA 5CMMA 2ZNSA 4ZEFA 3DM0A 3TYHA 1Y3NA 2Q88A 4G8NA 4F3BA 4ZEDA 2I49A 2RINA 4YB6A 1Y4CA 4GOTA 4JWYA 3QSLA 4U4SA 3TTMA 2X7QA 1JW1A 2OK2A 1EZOA 4R2BA 4OTEA 3TDJA 4NF8B 2O6AA 4KD5A 5FHNA 3TUSA 1SI0A 2E1SA 3PPOA 4YB7A 1JQFA 2XXPA 2GHAA 3V8XB 2ZYNA 3DELB 2F36A 3I6VA 3MP1A 2THIA 3UORA 4G2ZA 1VFEA 3L6GA 5FTHA 3VLWA 1CB6A 2DWAA 1NNKA 3FD3A 3MP8A 3O6IA 1Z7NE 4UA8A 4C0RA 4HW8A 3OMBA 2AYSA 4OETA 4ZE8A 3TCHA 2DXYA 1ZU0A 3H06B 3PPPA 1XVXA 1JW5A 2V93A 1MY2A 4WEDA 4YAHX 4FAJA 5HM4B 1S7YA 1UTHA 2VD2A 1RYOA 3A09A 3D4GA 3EN3A 3H7MA 2CZLA 2OWSA 3PGFA 1LCFA 4NWCA 1FQBA 1N3WA 5KZTA 1MQHA 3IJXB 1MRPA 3ONMA 5JTYB 4TQUQ 2E0SA 3S4UA 1Y20A 1SBPA 2W7YA 4ELOA 1NMUA 3PMXA 2PVUA 2ONKE 4R2FA 2XXHA 3SESA 3TODA 4EF2A 5I58B 5I57A 4RK2A 4JWXA 3KSXA 4G8HA 3H4ZA 1Z7ME 3B6TA 3KG2A 3T66A 3O6GA 3WAFA 3IOWA 4EXLA 2I0BA 4OERA 4H0WA 4KFQA 2Y7PA 1B3HA 4R72A 3H6TA 5F1QA 3K6UA 3VVEA 1WODA 2XXXA 3EF7A 3PUWE 1FTLA 2DVZA 2VP1A 3K0VA 5EHMA 1LAFE 1O7TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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