4N4IA

Crystal structure of the bromo-pwwp of the mouse zinc finger mynd-type containing 11 isoform alpha in complex with histone h3.3k36me3
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
211
structure length
192
Chain Sequence
NKQEMGTYLRFIVSRMKERAIDLVDVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGAASAQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNVHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords Zinc finger MYND domain-containing protein 11
publication title ZMYND11 links histone H3.3K36me3 to transcription elongation and tumour suppression
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 65
structure length 192
sequence length 211
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
A PF00855 PWWP PWWP domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4n4iA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4n4iA02
5IIDA 4LYWA 3LGLA 4C5HA 5FDZA 2FSAA 4CFLA 3MO8A 3ONIA 4Z93A 4NRBA 3DB3A 4C5IA 3OYFA 2RHIA 5C4QA 4QSVA 5E73A 4MENA 1WJSA 2RO1A 3S3OA 3NTIA 4NR5A 5EICA 5C0MA 3U5OA 3P8DA 3FC3A 5ENFA 2DKWA 4UITA 3NTKA 3OQ5A 2R57A 5A5PA 4QC3A 5C6SA 5CQ6A 5D24A 5D3PA 1N27A 5HRVA 5I1QA 1WJRA 4QY4A 5A85A 5HQ5A 5HELA 2RHZA 3MP6A 3P1CA 3U5NA 5LKZA 5FFWA 5HCLA 2BUDA 4A9NA 5TB6A 5D3RA 4CUQA 3Q2FA 1G5VA 2E5QA 4QUUA 4NYXA 2X4YA 3OYAA 3L2UA 3FKMX 5E9YA 2DVQA 5ENIA 4FL6A 2O4XA 5II2A 3PMTA 1OI1A 2R0YA 3E9GA 4BDYA 4ALHA 5ACYA 4BW4A 4UC4A 4ZTFA 5H1UA 4E7LA 5JWMA 4IORA 4QQ6A 4LDFA 4NR4A 4ZTJA 2E7NA 5D3JA 2WP2A 5EU1A 4QR4A 5HQ7A 5A81A 1OYXA 5DLXA 4IUUA 4BE1A 5F63A 5E3DA 3SVHA 5EWCA 4YAXA 4OUFA 3DLMA 5EVAA 4QNSA 3ZYUA 2NXBA 5A5SA 5KE3A 4O72A 4NR8A 2WACA 3LQHA 2RNWA 3DAIA 5E9VA 3MEUA 3P5OA 4PL6A 4J0SA 3JVMA 4UYFA 5CPEA 2R0VA 2VYTA 1WUGA 5ENCA 5J26A 5IGKA 4UIWA 3OB9A 4QSRA 4GPJA 3PFSA 2F6JA 2RJCA 4A4GA 3MULA 4QEVA 2LVMA 5LJ1A 2E6NA 3L2WA 3P1DA 2MWOA 3S91A 5LKUA 4WIVA 2YYNA 4L59A 4LYSA 4O76A 4TU4A 2X4XA 1WJQA 4O77A 5D0CA 4BHWA 4TZ2A 5JI8A 2DVSA 4B9XA 4N4FA 3UVWA 2EFIA 5A5QA 4YBMA 5J0DA 4J1PA 4RVRA 3O36A 3UV5A 3M9QA 4QR5A 5CQAA 4CLBA 5LVRA 4QSSA 3FDRA 4YK0A 3MEWA 4YY4A 4KV1A 5HM0A 1MHNA 4A9JA 4A4EA 4A9MA 5HRWA 4A4FA 5CUGA 5HENA 2K3YA 4KCXA 4LYIA 5CIUA 4UIYA 3K2JA 4O7EA 1ZS5A 4OGJA 4UYGA 1OZ2A 5D6YA 4QSXA 4TYLA 4NXJA 5BT4A 3OY9A 5I80A 5AMFA 1E6IA 4IR5A 4TQNA 5D3NA 3H8ZA 2R10A 4Q0OA 4YH4A 5KHMA 3ZEHA 2RNYA 2RHYA 3FLGA 5DKCA 2PQWA 2RO0A 4QEUA 5DBMA 2KTBB 3MP1A 4O70A 4Z02A 5F61A 4C5EA 3AADA 1WUMA 2YELA 4IUTA 5CQ8A 4BE2A 5H1TA 4UIVA 3MB4A 5AMEA 5EISA 4O78A 4HXOA 4N4IA 4NUDA 5I83A 3CEYA 4TT2A 4YYHA 4E7JA 5FH7A 5HRXA 4QSPA 5DYAA 5E3GA 5CQTA 3Q1JA 5CZGA 3SVFA 4YYKA 2EQMA 4QYDA 3QIIA 5CS8A 5A7CA 3GG3A 3OMCA 4YYIA 3O37A 4E7HA 4QR3A 4YATA 3O8VA 4IURA 5DW1A 5ENBA 4QUTA 4IKFA 4J3IA 2LCCA 5CP5A 3MUKA 4NYVA 5F62A 5BT5A 4NYWA 3PNWC 1H3ZA 5FB1A 4O71A 3LGFA 4QSWA 5FRNA 5J39A 4QSUA 4YYGA 2RI2A 3NTHA 4PCIA 5KO4A 4QC1A 3QJ6A 5DKHA 3L2QA 5BT3A 5FE7A 3UVYA 2OSSA 4FLPA 3DB4A 4TU6A 5CUAA 4C66A 1JSPB 4LC2A 5FH6A 5FE0A 2L85A 2RHUA 4NUCA 4UIUA 1N72A 5D25A 5EV9A 3OYGA 5L97A 4Z1SA 1RI0A 4X34A 2E7OA 3QZTA 5FFVA 2E3KA 2DVVA 4NUEA 4O7AA 5KTWA 2RI3A 3L2RA 2QQSA 5FRMA 4NR9A 4YYMA 4PTBA 3C4SA 3OS1A 2XDPA 4QYLA 4CUSA 2M0OA 2DATA 4A9FA 4A9EA 2GRCA 5I40A 4OVAA 4YYNA 5DKDA 5I7XA 5FE3A 3UV2A 4TZ8A 4XUBA 5CUCA 5A5RA 5K29A 5FE2A 3RCWA 5C7NA 5HFRA 1WGSA 2I8NA 2DVRA 5LJ2A 2RHXA 3LYIA 2LDMA 4Q5WA 5F60A 5CUBA 4PLIA 3OYKA 4E96A 5EM3A 3H6ZA 3IU6A 5A5OA 5CQ3A 3META 1SSFA 5EGUA 4LZ2A 4F3IA 2L3RA 3QBYA 2FHDA 5COIA 4UYFB 4LD6A 3E9FA 5FG6A 4NQMA 5IGMA 5FE4A 5F3AA 5D7XA 5ETBA 3L2VA 4CUUA 5F5ZA 5CU8A 3LQIA 5FE6A 4TS8A 4A4HA 2RFJA 5E7DA 5CY9A 2D9TA 5FG5A 3HMEA 5ENGA 3O33A 2DIGA 5H85A 5HEMA 2F5KA 5G4SA 4WHUA 3U5LA 5LKXA 5LVQA 4NRCA 3IU5A 2G4AA 5CQ5A 3ASKA 2YW5A 5EWHA 4HXNA 4UIZA 5CRZA 4YYDA 4MR3A 5E0RA 5DLZA 4FU6A 4MEQA 4TT4A 2YEKA 3JVJA 5DYCA 4A9KA 5EWDA 5TCMA 5E9MA 2L8DA 5C87A 4CUPA 3L42A 5D3HA 3P1FA 2G3RA 4QW2A 4QEWA 4HBYA 5EPRA 4HXRA 5ETDA 4N4HA 4J0RA 2GFAA 2B8AA 4A9OA 1F68A 4LR6A 5A5NA 4ALGA 5L8UA 2M16A 2L89A 3KUFA 5EP7A 4NRAA 4YABA 5D3SA 5ENJA 3SVGA 4IUQA 2DIQA 4IR4A 4ZW1A 4A9IA 3MQMA 3UW9A 5EK9A 1JM4B 4GY5A 2RJEA 4LZSA 4MEOA 2OUOA 5EQ1A 2F6NA 5L98A 4XYAA 2M1HA 2RI7A 3U5JA 5C8GA 3MXFA 4HXSA 3G0JA 3F70A 4UYEA 5L8TA 4XY9A 2YRVA 5I89A 4BACA 5E9KA 4X2IA 5F1LA 4CUTA 4BD3A 5ENEA 2GF7A 3UVDA 4BE0A 5I88A 2MWPA 5D3TA 5HFQA 5CUEA 3LXJA 3JVKA 4E7IA 4HBWA 5FH8A 5CQ7A 4B9WA 4PCEA 4YC9A 5E9IA 4QQDA 2N9GA 5DFDA 3OYCA 3OYNA 5L96A 5EA1A 2DAQA 5EPBA 3UT1A 3S3MA 4LZRA 3OYEA 2WP1A 4KV4A 4Z6IA 4YYJA 5I7YA 3UWNA 4QZSA 4CFKA 3G0LA 2HQEA 3Q2EA 2R5AA 5L99A 3NXBA 2EQKA 2RI5A 3P8HA 4NS5A 5EWWA 5H1VA 5IGNA 5KE2A 4HXKA 3MP8A 2RNXA 3LJWA 4CL9A 3GOXA 4UIXA 2I7KA 5CGPA 4PLLA 5IAYA 4QQGA 3OMGA 3ME9A 4MR5A 4NQNA 4BDZA 3O34A 5DW2A 5FE8A 4O7CA 3OYHA 4IR3A 4HXPA 4YADA 4YY6A 5LKTA 2HQXA 2RJDA 4BW1A 5CQ4A 1XNIA 2O4XB 4II1A 5AD2A 4CURA 5I29A 2H60A 4O75A 5C85A 3JVLA 3OS2A 4LRGA 5FFYA 5IN1A 5D6XA 4UYHA 4C5GA 2R0SA 1OZ3A 2D9EA 3AQAA 4HXLA 3SD4A 5KTUA 5CRMA 4QVZA 5DY7A 5F25A 3LLRA 4QSQA 5DYXA 3O35A 4O7BA 4QB3A 4PKLA 4WHWA 5KU3A 4IOOA 5KTXA 2MJVB 5F2PA 4Q0NA 5CTLA 4XUAA 2CKKA 4A9HA 5HJCA 2IG0A 5IGLA 2R58A 3I3JA 3OA6A 2L5EA 4QBMA 3PMIA 3BDLA 5D6WA 5A82A 4RG2A 4XY8A 2XK0A 1KHCA 4O74A 2D82A 3DWYA 4IOQA 3MEAA 3OYIA 4HBXA 4E7KA 3S3NA 2EKOA 4HBVA 3LX7A 5KCHA 4N3WA 2R5MA 3HMFA 5KH6A 5CFWA 5FBXA 5FROA 4MR6A 2LSPB 4C67A 5I86A 5A83A 4Z6HA 4O7FA 2JZ2A 3OYJA 4PS5A 2NLUA 4IUPA 3UV4A 5DYUA 3HMHA 4Y03A 4Z1QA 4IUVA 5E9LA 5KCOA 4BJXA 5AD3A 4IR6A 4BW2A 2K3XA 4YBSA 4YBTA 4TT6A 5FB0A 5D3LA 4AKNA 3QZSA 5F36A 5F1HA 2YEMA 5EI4A 4PY6A 2RS9B 1X0JA 3S92A 2EQJA 4HXMA 4N4GA 2YQDA 5FE9A 3OYDA 5CUDA 2DWWA 4MEPA 2LTOA 3S6WA 2P0KA 3P1EA 5D26A 3U5PA 2EQUA 2JTFA 4YH3A 5FG4A 4QSTA 4DONA 3EAEA 4HCZA 3OYMA 4ZC9A 3OS0A 3UVXA 5FE1A 4TTEA 5E74A 2BKDN 3MB3A 4OGIA 5HLSA 3TLPA 5DX4A 4A9LA 5FE5A 2YDWA 5M9OA 5EWVA 2X4WA 3LH0A 4EDUA 3OYLA 1EQFA 5IG6A 2L84A 2QQRA 5DFCA 5HQ6A 4NR7A 4CRIA 4NR6A 4BW3A 5DFBA 2LRQA 3FEOA 3MEVA 3OYBA 5ENHA 3U5KA 2BIVA 3QZVA 5IBNA 5LJ0A 5C89A 2RJFA 5LUUA 3D7CA 4UYDA 5G4RA 3U5MA 2GFUA 4ZQLA 4MR4A 5II1A 3LQJA 2OO1A 3QKJA 5EPSA 2X35A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1PD0A 1QVFA 1NM7A 5LJ3g 1Y71A 4PJOF 4EMHA 3MO8A 1R8OB 2V8JA 3UA7A 5DY9A 3HFNA 4Z93A 5EG2A 3DB3A 4C5IA 3NHNA 4QKUA 1D0YA 4QSVA 5A0DA 4MENA 4CC3A 1ZKRA 1LPLA 5EICA 5C0MA 1BYMA 2ZPEB 2EW3A 2AZVA 2HBWA 3P8DA 3UATA 4M75E 1UGSB 5C6SA 5CQ6A 5D24A 1N27A 5HRVA 1QVFP 1WJRA 5HQ5A 2RHZA 1NBEB 2CP3A 2J7IA 3MP6A 3P1CA 2HBPA 5GMKm 5HCLA 1PG5B 2DRMA 4A9NA 1HJDA 4CUQA 4D8DA 3IQLA 4WCIA 1Q82U 2E5QA 1SPKA 2KE9A 3OYAA 5E9YA 1NYGA 1OOTA 3CCQA 2JMCA 3H41A 3PMTA 1KFZA 1YITQ 5KYUB 1ZX6A 4E7LA 3PVQA 4IORA 4QQ6A 4ZTJA 5A81A 3M0SA 2WP2A 4BE1A 1I0CA 5F63A 3SVHA 5EWCA 5GAN6 2DM1A 1IHVA 3CCET 1SHFA 1SKUB 5GMKh 2WACA 2M0YA 1WXBA 2RNWA 1E6HA 2P4RA 3V7SA 1IHWA 3P5OA 2DNUA 4J0SA 3JVMA 3TEEA 2R0VA 1W70A 3NMZC 2VYTA 3G6EA 3ZBDA 3RKYA 3OB9A 4QSRA 2FZCB 3PFSA 4GLMA 2V1RA 3GF5A 2YUOA 1H641 3CCVA 3CMET 1M1KC 3AHUA 5FWBA 2KNBB 2FEIA 5GANh 1MUZA 1ZA1B 3J7AF 3C0CA 4O76A 2BE9B 3VV0A 1AOJA 2OTJQ 5D0CA 3I35A 2DVSA 4AT1B 3UVWA 2OAUA 1E6GA 1N8RR 3M9QA 1YWOA 4QR5A 3G71Q 3MEWA 2DERA 3CCJQ 2E3IA 1IO6A 2V26A 5HRWA 4C0FA 1OX9A 2CH4W 3EFSA 2VUBA 2F2XA 4HT9A 5IHIA 1ZS5A 1UGPB 1OZ2A 4QSXA 2JTEA 4TYLA 4NXJA 5BT4A 2NUPA 3BDUA 4FSXA 4O6JA 5CKHA 4IR5A 4TQNA 1K9MU 4Q0OA 1OU9A 2KK4A 3QJYA 5GAOp 5KHMA 1YIJA 4LDVA 3HHTB 2RNYA 5DKCA 1P92A 2X51A 4M7DD 1KQSS 4C5EA 1WUMA 2YELA 3G4SQ 4C8QB 2CUDA 4NUDA 3ZFJA 3CEYA 1RUWA 3D1BA 2DXUA 3CXCS 5CZGA 3SVFA 4M75G 4YYKA 1UEBA 2EQMA 4BB7A 4XU0A 3X24B 1XOVA 2GGRA 4OGCA 5GAMe 1VQ7T 2KRMA 2ZGWA 4O71A 2JS0A 4J9CA 1N8RC 1UHCA 3EHRA 1TTHB 3QJ6A 5DKHA 2COWA 1UJ0A 2OSSA 1OV3A 1W1FA 5FU6C 4M75F 2H3JA 5LJ5e 3I5RA 4M78E 2L85A 2DYBA 1BIBA 2VXEA 1K9AA 2DJZA 2DF6A 5L97A 1PRMC 3M0QA 1DJ7B 4PFOA 3QZTA 3VKGA 2E3KA 2BZYA 4O7AA 5KTWA 2RI3A 3L2RA 1N6AA 1G3TA 2QQSA 4ELYC 2GNCA 3TU4K 4YYMA 5FWCA 4HXJA 1TOVA 2XKOC 1Y7XA 2Y4XA 5I40A 1D3BB 4OVAA 5DKDA 1MMNA 5FE3A 2RK1A 4LNPA 5GJVB 5FE2A 1WGSA 3LYIA 2BE7D 4JRKA 2VKNA 2RD1A 5GANg 2LNHB 4Q5WA 4XK8E 3VKHA 3QG1A 4F7UB 1N5ZA 3H6ZA 3NPFA 3CMAA 3QO3A 1D1BA 3JCMb 2OTLQ 1TS9A 5CQ3A 2PU9B 4LZ2A 1UDLA 2L3RA 4N0AC 1YHQT 5COIA 4UYFB 4NQMA 5IGMA 5F3AA 4AG2C 1VQ6T 3GLXA 2FPEA 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4BW1A 3A5ZB 4CURA 5I29A 1S72Q 3CCEA 4LRGA 5IN1A 5D6XA 4MMKA 1OZ3A 4HXLA 3SD4A 5CRMA 1KK7A 5DY7A 4QVZA 3REAB 4BY6B 5DYXA 1N9RA 4QB3A 5KU3A 5F2PA 1WDXA 2RH2A 4RTYA 1BI3A 2KXDA 2KGTA 2HAXA 4HCCA 5IGLA 2R58A 1VUBA 4QBMA 1WHKA 2ATCB 3PMIA 3BDLA 5D6WA 3CMEA 5A82A 2EJFA 1D0XA 1B34B 5FU7B 1KHCA 1NJIR 4HBXA 1X27A 2FYKA 1IREB 4HBVA 5CFWA 5FBXA 5FROA 2E65A 1KD1U 4MR6A 4C67A 5GAOn 4Z6HA 4O7FA 3PTAA 2DA9A 2LJ3A 5DYUA 3HRTA 4Z1QA 3JCMJ 1YNZA 2CGHA 4DEXA 1T3SA 1M90C 4BJXA 4AG1C 1LVKA 3QXEB 1K73U 4M77E 5GMKe 5GAMh 1X0JA 4N4GA 5GAN7 5FE9A 1U1TA 4MEPA 3WXMB 2DBMA 1VQNQ 4RCCA 3EAEA 3EG0A 4HCZA 2FZGB 5LJ5h 4ZC9A 4JLGA 2BTTA 4XU1A 1YJNT 1YITT 5DX4A 2BZXA 4A9LA 5FE5A 2YDWA 4HA8A 3LH0A 2A37A 1EQFA 4C8QA 1FMKA 5LL6S 5IG6A 3BFMA 3CBMA 2L84A 2QQRA 1M3AA 1M2VB 4E7SA 1NJIC 4BW3A 3MEVA 2AKKA 4A4KA 2B86A 4JPBW 3D7CA 5LJ3f 4RTWA 4ZQLA 2P0PA 4OMPA 2OO1A 3QKJA 4PJOE 2ED1A 3RUXA 1X6OA 5IIDA 1WHHA 3LGLA 3MHXA 5FDZA 4CFLA 3ONIA 4RUGA 3OYFA 1Q95G 3EHQA 1WJSA 3PE0A 2RO1A 1RI9A 2XDDA 3S3OA 1KQSA 2CDTA 4NR5A 2HZYA 2OTJT 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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