4N6E | Genus

Total Genus 80

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	80
sequence length	244
structure length	244
Chain Sequence	DEPWLKIGAREFRSRILVGIEQYDSVPLVRDVLNAAGADVFITTVDPDNRRSSLLLMDLADELPLDDFTWIGTTSFARTKESALRSARILRDSLGIEILKLDVRGDDNTPDNAGTVEAARELRAEGMELLPFILPDLATARALEEAGCAALRVMASPVASGRGIANPAAIRELIEQIGIPVVVEGGIGSARHVAEAMELGASATLVNTALVRAESPLLMAAAMRQAALAGLLSYESGPMPEVAA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Co-opting sulphur-carrier proteins from primary metabolic pathways for 2-thiosugar biosynthesis. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Putative thiosugar synthase
molecule tags	Lyase/biosynthetic protein
source organism	Amycolatopsis orientalis
total genus	80
structure length	244
sequence length	244
ec nomenclature
pdb deposition date	2013-10-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF05690	ThiG	Thiazole biosynthesis protein ThiG

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4n6eA00

4GC4A 4GUGA 4K36A 3HG5A 3I7SA 1WV2A 3IIPA 5KZEA 1OABA 3W9ZA 1GQNA 2F7FA 3W7DA 3A5VA 5G2IA 3HIJA 3BW4A 1KM3A 3NL3A 3IVTA 4OT7A 2H8XA 4JTSA 4A2RA 3IVUA 4WY0B 3WK3A 3GKAA 5AHNA 4MZYA 1TREA 3TCEA 2GQ9A 3W7EA 3HPSA 3LV6A 2ZQ0A 4M7TA 1GYNA 4LV9A 4Z1AA 3HGSA 3UYCA 4TMBA 4UFJA 3OA3A 5HR6A 2H8ZA 2V2HA 3LX9A 5C6MA 4IJBA 1OJXA 3F4WA 3PWAA 3ELFA 1M7OA 1OFAA 1DQXA 3ZFHA 3LLFA 4KFPA 4LW7A 5J5DA 2VKZG 4GRSA 1F6PA 1SW3A 2HMCA 3O06A 3QYQA 2A7PA 2X16A 3G3MA 1RZMA 1U5JA 4H3DA 2Q8ZA 4J9JA 4QJ1A 4AF0B 1JUEA 2CLHA 4XBKA 2DU2A 1G7VA 1SU5A 1L6YA 1SZEA 1T96A 1KV8A 3I7QA 1LROA 2C13A 4ZQPA 1H60A 3C61A 4JYEA 2ZTKA 5DY2A 5K4ZA 4FX6M 1FDYA 1MZHA 4UTUA 1XKYA 1OHLA 4G1KA 3UZJA 3OG3A 3SI9A 2AQWA 3WK2A 3QEZA 4ADUA 1TV5A 3NR0A 1G6CA 2Z6JA 3FJ6A 5CPLA 5AHFA 3G22A 3LHVA 4NJIA 1PE1A 2YW3A 3QM3A 3LI1A 4UTTC 5CSSA 2A85A 3B03A 2CZEA 3RNDA 1T0OA 1JR1A 1G7UA 1Z42A 5IM51 1VC4A 7TIMA 1K8YA 4K39A 3W88A 2B7OA 1TMHA 1A5SA 4MLRA 3P80A 2DZUA 1OFOA 1LBFA 4WOZA 5E1QA 4CQAA 2BXVA 4MYAA 4IMEA 2A2IA 2GVLA 5FEXA 1QNVA 1BWKA 2CLKA 4TIMA 3IGSA 1FWWA 3TH6A 3M7WA 3GR7A 5HULA 2WV8A 2YFOA 2ZRUA 3M5ZA 3GXTA 3CTLA 4MVAA 5FF0A 4UNKA 1H62A 1GYLA 1OK6A 2OT1A 2Z1BA 5KITA 2YFNA 3ABRA 5TQLA 3B8DA 3FIGA 3O16A 4FNSA 1HUVA 1NF0A 3QF0A 1K02A 3W1AA 2BWGA 3P61A 2RKXA 1W3NA 4A2SA 1HFBA 3G1YA 2WNQA 1T8XA 2QCDB 5LGZA 1QPRA 1XC4A 5D2TA 5C54A 3TNOA 4O53A 1RQEA 1NSJA 1KM2A 2VEPA 3C2OA 2ZA2A 4AEOA 2YX0A 1GG1A 3N3MA 2ZYFA 2PURA 1WDWA 5D32A 3E9AA 3MP3A 4RZ5A 3STEA 3QRHA 3U6WA 2X1SA 3L5AA 4TU1A 1F6KA 1TPUA 2GPTA 4JIQA 4O1DA 4Z0SA 2W6RA 3NG3A 1I45A 2ZDRA 3LXBA 2VEMA 3IRDA 3GZ3A 1KFKA 3DU0A 3I7RA 4O17A 4X9SA 2V2CA 2TPSA 1N8FA 3UZ5A 3S0CA 2WJZA 5CGQA 1VJIA 3M5YA 2Z2UA 3N34A 3GB6A 1W1ZA 1FWNA 2WSRA 4XTIA 2G5WA 1A53A 3DI1A 3M43A 3LCXA 4DO4A 4M7SA 4CCDA 2WQPA 2J9ZA 1P4CA 3EWBX 1W31A 4NJKA 1GJPA 1JUBA 5AC6A 2PCQA 3UQNA 1SZNA 3TQVA 1IIHA 3W1LA 5KINA 4O8RA 4S1FA 2VFFA 5CPOA 4CNNA 3NZ1A 2FPVA 3GLCA 2A1YA 1L6SA 1I2OA 2B7QA 1GVRA 1WXJA 1EUNA 4FO4A 4XUGA 4UTLA 2VELA 2ISVA 3BVJA 4X2RA 4TMCA 1GWJA 3W7PA 4ML9A 2VFGA 5DCDA 1KM1A 3P5YA 5F4SA 3RMJA 3V75A 1SFLA 4JDYA 4FHAA 3F4NA 2YZRA 5MHBA 4JX5A 3C4UA 1QPOA 4ZMGA 1TB3A 4RV8A 3GXPA 3L0KA 2B0MA 2B4GA 5F4XA 3WJSA 1BEUA 2C6QA 3KXQA 4RZ6A 4OV9A 1MEIA 2NLIA 3L68A 3TR2A 2BSLA 2JK2A 3NPUA 1ZJIA 1ICPA 1DQWA 1G67A 1SO5A 1ML1A 2FQIA 4HKPA 1DJQA 1JCNA 4JXCA 3LCFA 3LRLA 3MW7A 2VFHA 4OU1A 3UXAA 3G8RA 3HJZA 5I3GA 2VC6A 4UFMA 5FF2A 3W7OA 3PUOA 3LHYA 1R46A 3E12A 3GKFA 2DJLA 1K8XA 4ORMA 1NAL1 4OWGA 5EL1A 1H7XA 1FCBA 3SSJA 2X1UA 4NXKA 4K7VA 1THFD 4AVFA 1J4EA 1GEQA 1KFLA 4RR4A 1JRBA 3VNDA 3NQDA 1RQHA 4LVDA 3IGUA 1QAPA 4O52A 3W2MA 3NNTA 5KTLA 1K03A 4DELA 4R53A 3MJYA 2A21A 4FNPA 2H90A 5F1UA 1EX5A 4JTHA 4O1BA 5G1YA 4UR8A 3D0CA 2QAPA 3BO9A 4YL2A 5FF3A 1R30A 2QJHA 4O18A 2FLIA 5K2ZA 3EX6A 5F2IA 3MI6A 3T4CA 3UPWA 3TC7A 5EKYA 4KKXA 5HINA 4NU7A 4N4QA 1SPQA 4POCA 5AN7A 5AOUA 3P8IA 4ORIA 1B4KA 5H91A 4Y9AA 5L6UA 3CEUA 5KSWA 3S8HA 1O4UA 1XI3A 3HMJG 1EWDA 4AWSA 1IGSA 3BGGA 3W7NA 5BW6A 2X2GA 5AB3A 3P74A 1Q45A 1IXPA 4IGHA 3LHZA 3TUUA 1ICSA 1OFQA 3W7RA 3QSTA 4MJMA 3W1PA 5AC7A 4JR5A 4GUHA 4IQLA 2CLIA 1W54A 1NVMA 3KOFA 3SIZA 3TV8A 1AW1A 2HSAA 3A21A 1K7FA 3FLUA 2QCCA 4PODA 4JX6A 1F73A 1VYSX 1PS9A 4UTIA 1TRDA 3BW3A 4YWIA 5D02A 4MOZA 3L5MA 1LRNA 3I68A 4KWVA 5A8GA 3HG2A 1QPQA 3TFCA 3G1VA 1KLZA 4Z08A 3DH7A 3WJXA 2FFCA 3EX4A 1OFBA 4K38A 1OYAA 1EWEA 1S5TA 3W7IA 1NEYA 4FIQA 3THAA 3NQCA 3BW2A 1VS1A 1TPB1 2R8WA 4IPJA 2R91A 2EF9A 4O16A 2RDUA 1EPXA 1VCVA 1MSSA 2E1DA 4S2BA 1KM4A 1TTIA 4MY1A 2R14A 3NL6A 4BWLC 4DO5A 2V82A 2WSYA 5CSRA 2J27A 3CPRA 1ZAHA 4LUIA 2DORA 3QZEA 4NVTA 2ZRXA 4I7WA 3MHFA 3G18A 1HTIA 3WJZA 2QUUA 1VH7A 3PUDA 5CPNA 3M6YA 1LYXA 5K4XA 4DXVA 2GVGA 3UY7A 1PIIA 4HSNA 1ZENA 4N02A 4H6KA 4R33A 4BFAA 4DF2A 1JJKA 3MBFA 5F2LA 3BK0A 1Z48A 4E38A 4K8HA 1VHNA 3ABQA 3CWNA 2NXHA 1LTDA 3EXSA 4WY0A 3MWAA 4IPIA 3CC1A 3EX2A 4UTTA 1ADOA 3HPXA 2DP3A 3GXNA 1I8JA 2HS6A 4JY8A 5G4WA 1JVNA 2JGYA 2A6LA 1QCWA 1KFCA 3AO0A 3W7QA 1GVFA 2NUWA 3VE9A 5HWMA 4OGZA 3PG8A 4UMBA 4RX0A 1TTPA 1FDZA 3E96A 2E09A 2A5HA 1SW0A 3PM6A 3FEMA 3GVGA 2VFDA 4DPQA 4E2BA 1W5MA 2YYTA 2CFFA 5DN1A 3TU9A 4HN4A 4AHQA 3FS2A 5BRBA 3GDRA 2GJLA 1LORA 4DF1A 2A7RA 2FTPA 2PRHA 3C8FA 4IXHA 3BV4A 3W2UA 3DZ1A 1GG0A 3ATZA 3R13A 1Q3NA 2RHGA 2R94A 4IMCA 4GXMA 5EYWA 2CW6A 2V5BA 3O6CA 4NNAA 3UWQA 3NM3A 4JN6A 2KZHA 2XN1A 4O4VA 1BKSA 2Y61A 3W1NA 3QQ0A 1LLZA 4EWND 4NXSA 2J9YA 2E5BA 3O15A 1DJNA 3FFSA 4LWWA 3INPA 3W3OA 4FNUA 1R47A 4IMDA 2WNZA 1TCDA 5F2GA 3FJLA 1PCWA 4JTKA 3DI0A 3QW4B 5AYYA 3E0IA 3G1AA 3ZS4A 4LC6A 4XZ9A 3LHWA 2Y62A 5D38A 1TJRA 1VR6A 4GNJA 3EWXA 2Y7FA 4O15A 4GUJA 1AW2A 1GPWA 3Q94A 3QMTA 3KVJA 3TC6A 2QDHA 1GOXA 5G2HA 5AYXA 2V5LA 3P81A 3PSWA 4ZQRA 2EPHA 4YXGA 1EEPA 1UBSA 1W5NA 2HTMA 3EXTA 1P0KA 2WO5A 3NQGA 3JR2A 4UFLA 2CLLA 3W1RA 1SZFA 3MI3A 3W86A 4DEFA 1LRTA 1SW7A 2ATMA 2YPIA 3A24A 3B05A 1R2TA 4OBTA 3W74A 3L67A 6ALDA 3OEXA 2GJNA 5G2WA 3P62A 1FCQA 4Z1CA 4X22A 5C5YA 4JTLA 4UTKA 1B57A 2Y88A 2NZLA 3GK0A 4HIBA 3DENA 4XQ6A 4N9EA 1WOBA 4I7UA 5HMSA 3CIWA 3OVPA 1ZAIA 4LC8A 1CW2A 2Y89A 3KVLA 3PB2A 3W7CA 3MHUA 4JX4A 1M7PA 4BR1A 3NM1A 1H61A 3NEVA 3QH2A 3G1DA 1RVGA 2ALDA 4S2CA 1KFJA 4E0CA 1VLIA 1G69A 3W7GA 3ZWSA 1TQXA 1Z44A 3LHUA 4K6AA 3W2KA 3H54A 1TPVA 4K37A 3WK0A 1IXQA 2A6NA 2ZCGA 3A22A 3I6RA 4FX8A 4XKYB 1C29A 1W56A 1IXNA 1Q6RA 3O63A 3QMSA 3MYPA 1S3HA 3NQEA 3L66A 3L5LA 1GT8A 3QMRA 1AG1O 2X30A 4O19A 1S5VA 4IMGA 2WOQA 4JTIA 3S5OA 5I3JA 4CNOA 1XUZA 4LUJA 1OF8A 2BLEA 4UFHA 1PL9A 1VCFA 4WUIA 2A7NA 1R2SA 1I2NA 1MXSA 1F05A 2XFWA 4QIUA 1BTMA 3EB2A 4JTGA 3N14A 3ZWTA 1MEWA 1OVDA 3EWWA 5CG7A 2QKFA 5LNWA 5A5WA 3W1XA 3TW6A 4JTTA 2ISWA 3MP4A 2ZRWA 3A23A 5E0KA 3W6YA 1F5ZA 3GIYA 2EAWA 3UWZA 3MI2A 3S1WA 4NUWA 5SWUA 2O7QA 5DBTA 3B04A 4Y96A 5K9CA 3IIZA 4IUOA 1A5CA 8TIMA 1OG0A 3NXFA 3VCRA 3W1MA 2FIQA 2ZZ7A 5IBXC 3MMTA 3BARA 3TDFA 1AK5A 3RLUA 5EMUA 1X1ZA 1OYCA 3UWYA 3SGUA 3R8RA 3PF3A 3TMLA 1VPXA 4HNNA 3B0PA 4XWUA 1ZALA 3W07A 1TTJA 1KTBA 4O11A 2OJPA 2O7SA 2ZZ2A 2CLOA 4NNBA 5LHEA 1O5KA 3GR8A 1XBXA 2VFEA 2VEIA 3M1ZA 4FXRA 3QPZA 4GUFA 3NQAA 5AYZA 1O94A 3DKJA 3O6YX 3S42A 3U2OA 3HG3A 2Y63A 4JY9A 1MO0A 5U4NA 1VCGA 2Q3OA 3EEGA 1F2JA 3T44A 4ZQOA 2A0NA 1YDOA 2C1HA 3UY8A 4ICNA 3W7MA 2ZA3A 3MUXA 3RU6A 1TPFA 4DF0A 1AL7A 1TYGA 2YCEA 1A5BA 3N9SA 3TJXA 4R7JA 1LOLA 3NQ8A 4CQ9A 1H63A 5D03A 2CZFA 1V5XA 4WQ6A 3BG9A 4YMZA 1WBJA 1KM5A 4ONVA 1FX6A 1OX6A 1ZAJA 3DFOA 4ALDA 1W5QA 1DKWA 1OFEA 1DORA 5HJLA 1NF7A 1QPNA 3WFAA 5K9DA 4N4PA 4YLWA 1LZOA 5FEZA 4JS3A 5CZJA 3LCLA 3S1XA 1I2RA 2I14A 4FB7A 4O13A 1HO4A 4A22A 4BWLA 1TPC1 2Z0IA 2Z6IA 3HO8A 1QR7A 2B7PA 5HWNA 5LNRA 3GDTA 1TV8A 3NPVA 5HUOA 3LTPA 2VFIA 4RZ4A 3GDKA 4O28A 2FPTA 1IIGA 3QC3A 4GFSA 3LTYA 4NX5A 4W9TA 2Q3RA 1W3TA 1SSGA 3H53A 1SO4A 3OBKA 3LRKA 2ABAA 1KLYA 4Y90A 3TMQA 3W87A 1FXQA 5D37A 3TIMA 1AL8A 1RR2A 3SECA 1M5WA 5FEWA 2AAMA 4BF9A 3QSRA 6TIMA 3F1QA 2QJIA 1H51A 3M16A 1TTQA 1RQBA 2GOUA 2H3DA 4O1CA 2J9XA 1G4SA 4N9DA 1UASA 1EP3A 1FDJA 4A21A 2ISSA 3LHTA 3DAQA 1KM6A 1XBVA 4CLMA 3G0XA 3IIVA 2Y7GA 2DZSA 1NFBA 4PEKA 3R2GA 1PHWA 4JGDA 2V9DA 1M6JA 2RDWA 1YPFA 1W8SA 3DFNA 2J6XA 2VOMA 5DCBA 1F7BA 3EX3A 3G0UA 3GNNA 3U8GA 2NUYA 2EHHA 5I3IA 3DFPA 1VHCA 5LNVA 1WBHA 5AHMA 5LZLA 1H7NA 1KA9F 4WX2A 2QCFA 2ABBA 4RLIA 1TJPA 1L6WA 1FUYA 3TSBA 4MPQA 3P84A 4IXXA 4N6EA 2QEZA 3MYOA 5KZDA 1ME7A 2JKEA 2P0OA 2QCMA 3NAVA 1KW1A 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3G3DA 2LLEA 3IIXA 4JTEA 1TPEA 1V7YA 3FYOA 2CLFA 4AF0A 5K7JA 5K9XA 1VQTA 1Q6LA 3KRUA 4GWEA 5IBXA 1SUXA 1ZY9A 2WPBA 1EB3A 2H6RA 3CHVA 2ZZ4A 3C2VA 3W7LA 4QISA 2OX1A 3UWWA 1S5WA 5D2XA 5AHLA 5G5IA 4MYXA 4PL1A 1L9WA 1IXOA 2BZNA 3WJWA 3SY5A 1EUAA 5D33A 4ZL1A 4O4WA 4WD0A 1GVQA 1B3OA 1EP2A 1OFDA 1H50A 2Y85A 3H55A 1LCOA 1DL3A 2YXGA 4N2YA 4N9BA 5LNUA 4HPXA 3TQKA 2TSYA 4HT3A 4UUIA 1C9DA 5D04C 3S5NA 4IWWA 3S9YA 3PULA 1TRIA 3LI0A 1WAUA 3SGZA 1WOAA 2IQTA 3PY2A 4UTMA 1YADA 1VRDA 3NL5A 2P1FA 4IOTA 2Y7DA 2GVJA 4FEZA 2PRLA 4WXYA 3IVSA 2C3ZA 1YXCA 3W22A 1TO3A 4QM1A 1QWGA 1LBMA 4JNMA 3LCGA 3UD6A 5FESA 2FB2A 3TX9A 4O14A 3KFTA 1I2PA 1W5PA 1J5TA 2JBMA 2EGZA 3UNDA 3UXDA 3W1TA 1VYRA 2YR1A 1WA3A 4JTJA 1QOQA 5EBUA 3STCA 2E5DA 4AXKA 2DZWA 3GAKA 2QCDA 4IMFA 1XDLA 3JRKA 4UTJA 5FI8A 1PCKA 2NX1A 1G4TA 4JD4A 3FKKA 1O5XA 3TFXA 1ZHAA 3M5VA 2NV2A 4LVAA 2BTMA 3NQ6A 3NDOA 5I3FA 4PL2A 1LBLA 5AC8A 4OE7A 3TROA 1VZWA 1HO1A 3F03K 2W0UA 1ONRA 5AFDA 3PBWA 4PC8A 5EA9A 3LTSA 1L2UA 3LXAA 4XTDA 2I1OA 3W71A 4DQWA 2YW4A 1A50A 3ANYA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4N6EA

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