4N6PA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with meclofenamic acid at 1.4 a resolution
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
b'YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structre of C-LOBE OF BOVINE LACTOFERRIN COMPLEXED WITH MECLOFENAMIC ACID AT 1.4 A RESOLUTION
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
source organism Bos taurus
molecule tags Hydrolase
total genus 116
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2013-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n6pA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n6pA02
3OO8A 4KFQA 1H45A 4QFLA 4R74A 4KYEA 3FVOA 5EHSA 1JW4A 1P1UA 2Z8EA 4RPOA 1MM6A 3QK6A 2O1MA 3K1PA 2V25A 3EN3A 2I4BA 3VLUA 1FQFA 3IL1B 2A5SA 1NNPA 1SDXA 4FJPA 3I3VA 1B5JA 2GFEA 4P0GA 3ODBA 3S9MC 3RN8A 4BDOA 4GOTA 1UQWA 1LLSA 4GFRA 4KQPA 2DYXA 1J1NA 1II5A 5KCJB 4ZE8A 1RYXA 1WODA 2WKYA 1MY4A 3QXMA 3SEXA 3M3LA 3CI8A 3UN6A 5CMMA 1JVXA 1DTZA 1BIYA 3RGYA 1US4A 1SW5A 2R6GE 1B6HA 1XHYA 2HAUA 1SYHA 5CMKA 1UIVA 3EHTA 3B6QA 1MY0A 3H3GA 1B2HA 2G93A 2XXQA 5BWJA 5IAIA 3PPNA 4ISUA 3MVYA 5EHMA 1B0LA 2I3VA 4LA9A 2XXTA 1MRPA 3ONMA 3MVXA 2XD3A 3O66A 2I0BA 3OSRA 4X1BA 3K6VA 2D3IA 1NL5A 3QUJA 1M5EA 3A09A 4HW8A 4G8MA 2P2AA 3G7WA 4R6HA 4GRKA 1UTBB 2R9JA 1HSLA 1BTJA 2VOZA 3K01A 1A55A 3H06B 3SERA 3ZS6A 5A5XB 4G8HA 1MPBA 4O3CA 1NNFA 3WAFA 1S7YA 3T9XB 3W15C 1Y20A 1QVSA 3O28A 1L5TA 1QUKA 1MQGA 1P1NA 2X7PA 3O9PA 5I57A 5KDTB 3O6GA 3IOWA 2DSFA 3VXBA 2O6AA 1SYIA 4NF5B 4PETA 3LSWA 2HFBA 4F29A 4XTCQ 2I6EA 3QIMA 4YU0A 1QKBA 5I2KB 3USDA 1I6BA 2HZLA 1SVXB 1M5FA 3KZGA 3MP6A 3JV9A 4JWXA 1UTHA 1XOCA 4JBZA 2Y7KA 4GIZA 3OEMA 4DCYA 4DDDA 2OWSA 1NH8A 3LSLA 2DQVA 2QS4A 1MY2A 1AL3A 4ELPA 3OOAA 3U93A 1JEUA 1D3KA 2AIXA 4H1XA 4JDFA 2F6PA 3OELA 4OESA 3SESA 4AB6A 2XXUA 3IX1A 2R71A 4RPNA 1JQFA 1RYOA 1M5DA 5BUUA 3EPEA 3RT8A 4P0IA 3FJMA 3VLWA 5AA2A 2RKMA 4AB5A 3UA8A 4EUOA 2PT2A 3TCHA 4POWA 4LONB 1MY1A 5FHNA 2REJA 3S9EA 3TKDA 3VV5A 4H8JA 4U21A 2GRVA 4TOZA 3DELB 4G4PA 4ELOA 4IO3A 1Y3PA 3ZSFA 1MQDA 4G68B 5DVJA 1N0TA 5AE4A 4OXVA 2XX9A 3KBRA 4DXCA 4KHZE 5JTYB 3G3HA 1LAXA 4KCDA 2OZZA 4I8CA 3FATA 3TTMA 3IR1A 4ZDMA 5TU0A 1XC1A 4GL0A 3IORA 4KD5A 5TP9B 2HEUA 1GGGA 3LSFB 2X26A 2O69A 3DLNA 1CB6A 4RA1A 1OLAA 1LSTA 5ELVA 4OQOA 1IXIA 4JXIA 4MLQA 3VVDA 2RC7A 1N7WA 5L8DA 2DE4A 3TMGA 4ND9A 4IO6A 1RKMA 5H8NB 3S2VA 2Q89A 3MJNA 2P1SA 1QUJA 4X48A 1LAHE 2NXOA 3VFJA 4BDNA 3FXUA 1MQHA 3OO9A 4PFWA 3G3JA 5H8QA 4ZS9A 4ZECA 4C0RA 3GBBA 4IB2A 2RF1A 1USYE 3Q29A 5CRYA 1MQIA 1Z7ME 4N6PA 5DYHA 3T96B 3C31A 4NF6A 4ZZEA 1MH4A 4QFKA 2AL4A 3T22A 1D9YA 3H03A 1GR2A 3QAXA 4RXLA 2FNCA 3IB0A 2PVUA 3H7MA 3MZ1A 4I9DA 2F78A 1QW0A 2V3TA 3PUWE 4EF1A 3H4ZA 3MWBA 3R7XA 1ZKBA 2ESNA 1B1XA 5CC2A 2F7BA 1LGBC 2VD3A 5FTIA 2NUVA 3K2DA 3TFLA 5DEXB 3IOVA 4F2OA 4HTGA 1MY3A 3IJOB 1NNTA 4PP0A 3ZKKA 4IO5A 3V8XB 3B7DA 1LFHA 4GXSB 2RC8A 5ISUA 3N5LA 1YPNA 3PD9A 1YAEA 1LFGA 4U1ZA 3BKIB 3K6XA 3B6WA 1MXWA 1EZ9A 3W9WA 3SDFA 1URSA 3PUZE 4LUBA 5CM6A 3PU5A 1IXHA 3HV1A 4YB5A 1OQHA 2PT1A 3LR1A 1DSNA 3K0VA 1TFAA 4Z0IA 1ELJA 1PB8A 4H5GA 1GTKA 1H43A 2B65A 3A3CA 3UP9A 4OVJA 4ELQA 2DVZA 3O6HA 2OJTA 1UTBA 1VE4A 2ZYNA 4WEPA 4ESWA 4LATA 5A5XA 4XKQA 2DP8A 1LAGE 2Y84A 4XKNA 4C1UA 3TQLA 2Z23A 1YTVA 1B51A 1S9TA 4G2ZA 1PDAA 1FQEA 3Q26A 1PB7A 4BDLA 4PFYA 4OENA 4NF5A 3JZJA 5AA1A 1FQCA 4MBPA 2QS1A 3FV1A 4BDQA 2O51A 4YKPA 5I2KA 3T9VA 4LP2B 1ZU0A 2REGA 1EU8A 3FVNA 3FASA 5CMCA 4YB7A 1ZJLA 3K6UA 3KEIA 4EQ9A 3K1MA 1SW4A 3FVKA 4G68C 4R73A 1XVXA 1VSOA 3H6VA 2Y7PA 3KJTA 4U23A 4WEDA 3DP4A 4RY1A 1Y4TA 2QJEA 2AL5A 3PPOA 4K3FA 1FTJA 3QYTA 2ZNSA 4NWCA 5FTHA 2Y7WA 1B1HA 4Q0CA 1MPDA 3M3KA 1ZTYA 1F9BA 3PUVE 2QS2A 5H8HB 3EHUA 3RTFB 4LZ7A 4GXAA 4NTLA 4IY6A 1JETA 3N94A 1MDP1 2H25A 4PFUA 4QFPA 4UA8A 2VP1A 2Z8FA 4YMAA 4I1DA 3TPAA 1B3EA 2LAOA 1FQDA 3LBSA 2YLNA 4QF9A 1WDNA 2M8CA 1YCJA 4F18A 1LBCA 2HAVA 2DXRA 1B46A 1USYH 4F1UA 2XHDA 2O7IA 3LC8A 2QPQA 4GLIA 3RLFE 1B58A 2F34A 2NVUB 4GD5A 1POTA 3DM0A 3RQTA 1IXGA 2I58A 3ILTB 3QSLA 2ZYMA 5JTYA 4DIGA 5JEIA 4AQ4A 2I49A 5ICQA 3CG1A 4X9TA 2ZYKA 3TDJA 1Y3NA 4Z7EA 2NWJA 1N04A 4U1OA 1A40A 4IY5A 1GV8A 3R26A 1ZIUA 2P0SA 2UYEA 4NF4A 1PC3A 5TP9A 3CSBA 1JW5A 2OCUA 3TZAA 4O3BA 1M5CA 1MG1A 4BLAA 2Z8DA 1LAFE 2VD2A 4KI0E 3PPPA 3KG2A 3Q25A 1BP5A 5IKBA 4Q8RA 4R75A 2DE3A 4NF8A 3E13X 1BLFA 3CFZA 1O64A 2PYYA 3VVFA 2OWTA 3MC2A 4OTEA 3DP6A 4LQ5A 3HHFA 4OEVA 3VE1B 1LCFA 1MXVA 5B7DA 2X7QA 4H8IA 2ANJA 4C1TA 1P1OA 2XXXA 2DWIA 2V93A 3HCQA 3OO6A 4FECA 3K1NA 3KN8A 3T9HB 4DXBA 4E0XA 1ANFA 3CSGA 5J1DA 2Q2AA 1B3LA 1R9QA 4F3GA 4YKJA 1SQYA 1I6QA 1DPEA 4EF2A 4ZEFA 1P1QA 2YPNA 4MFIA 3PGFA 3GXAA 4HCYA 5TPAB 4GWOA 2ZYOA 3AXFA 3PMWA 4RK9A 1OLCA 4G8NA 1BKAA 5I84A 3KOSA 3FJGA 4HS7A 2D21A 5CBSA 3DP8A 3ECRA 3V83A 5HPQA 4THIA 1B3FA 1FW0A 4BDRA 3TODA 5B70A 2ONSA 5FHOA 3TCFA 4FORA 4NEDA 4F3SA 4R2FA 4YKKA 2XX8A 1A54A 1EZPA 4QFOA 1IEJA 4Q5TA 4JWOA 1CE2A 1HSEA 1VFDA 3KSJA 3CRBA 4U4SA 3A3UA 4FEBA 1AOVA 4NMYA 1DOTA 4LQ2A 4E0WA 1B9JA 3IK6B 1PEBA 3TUSA 1B7HA 2F7AA 4OZ9A 3IO6A 4QSDA 1NH7A 4RJZA 2DXYA 3JYRA 4JWYA 1Y1ZA 3KN7A 4MF3A 4XIGQ 1PB9A 3K00A 4KYDA 1PBPA 5EYFA 3G3IA 3FUZA 3C4MA 2GHBA 2HCAA 3CR9A 3S9LC 2I4CA 2IA4A 1T0KA 1MDQA 1MXYA 5DVIA 2A5TB 3V89B 3KOTA 2YJPA 4ESXA 4ZEBA 4UACA 4H65A 3U92A 2B3BA 3FXQA 1MQJA 3GZGA 4QFNA 3IJXB 4DLDA 3KSXA 1OVBA 2XXPA 3SEWA 1Z7NE 3TTLA 1B4HA 1D4NA 3FVGA 3TELA 3PUYE 4N13A 2H5YA 3BFUA 4F22A 1B7ZA 2RCAA 3C32A 3PPRA 3RT6B 4MLVA 3M3FA 3TYHA 5DVFA 4YAHX 5KCJA 2F35A 5I2NB 2G29A 1NNKA 1FTKA 4POXA 3KGCA 3C34A 3O2AA 5CI5A 3ZKLA 3CFLA 3CG3A 3ILUB 2Y7RA 2ZXTA 3RY3A 1FTMA 4LZ5A 3N6UA 4JSOA 1B3GA 5F7VA 3E3KA 5I56B 1A7LA 2FYIA 4EDPA 1Y9UA 1EZOA 4X1DA 1JW1A 4RYAA 4YMBA 2UYFA 2UVIA 3R6UA 4N07A 4OFOA 5H8FB 4XKRA 1ZBMA 5CMBA 1A8FA 3G3GA 4H67A 3S9NC 1Q1KA 3GBAA 3L6GA 1NMUA 1H44A 5DTBA 4YB6A 4R6YA 5K2YA 3MZ9A 4I62A 1IZ1A 1SI1A 2OK2A 1B4ZA 3S4UA 2UVGA 3HHGA 3GLBA 1JNFA 1M5BA 1TWYA 3H6TA 3IOUA 3U8QA 1DPPA 3M8UA 3HO7A 3K4UA 1B3HA 3Q27A 3IB1A 3MBPA 4QSCA 1IIWA 4MH5A 4IO2A 3RPWA 2F5XA 2ALUA 3WAEA 1LB8A 2XX7A 2DVCA 1MPCA 2H99A 3U72A 4WXJA 1B5HA 4M4GA 2Q8JA 5I59B 3RTWB 5H8QB 4FE8A 1B32A 2H98A 2RCBA 3E9XA 5KDTA 2F7CA 3Q28A 1WVJA 1UIUA 2ABHA 2ONRA 4IGTA 1QJMA 2HXWA 5JK4A 2XXWA 2UVJA 2I0CA 1DTGA 3PUXE 1TT1A 4NF6B 2VGQA 1AH5A 3TTRA 3I5OA 1AIVA 3L6HA 3G3KA 1SD3A 1KWHA 1URGA 1XT8A 4RK2A 1Y3QA 3SEUA 2QMXA 3OD7A 1A8EA 3HSTA 3MVWA 3LSXA 3MPKA 4KR5A 2DWHA 3V5AA 5I58B 2H4IA 4GF8A 4QRZA 5AA4B 4OHNA 3OENA 4ECFA 3T66A 1P1WA 2O7UA 4FAJA 1ZLQA 2ONKE 4U2RA 2Z22A 3PMXA 4OETA 3QUFA 1FQAA 3THIA 4F3PA 2ZNUA 1R1NA 4F3BA 5ITOA 2W7YA 1N3XA 5HM4B 2CMOA 3D4GA 3UORA 3CFXA 4ZEIA 4TLLB 1IUDA 1O7TA 1NKXA 1TFDA 5H8SA 1MS7A 4KCCA 4M1VA 1SBPA 1N7XA 4QHQA 2I48A 3LUYA 1R9LA 3EHSA 3O6IA 1JEVA 4EXKA 1URDA 2I3WA 4PFTA 4GL8A 4F39A 3U1OA 5HBCA 2FA7A 4G68A 4H0WA 5TPAA 1I6AA 1B05A 1IQ7A 1OIBA 3TTKA 3PV0E 1ATGA 2IEEA 5LOMA 4IO7A 4G77A 3VVEA 3N26A 1R6ZA 4PQJA 1N84A 1XVYA 5L9SA 3TAJA 2E1SA 2F6GA 3FD3A 1P99A 3EF7A 1OVTA 5ICTA 5CBRA 3SEYA 4U22A 1FTLA 3CIJA 2XD2A 3UK4A 5H8NA 4QSEA 4HCWA 2THIA 2DWAA 3FZVA 2CZLA 1TXFA 3W9VA 3IO4A 3MW0A 4GQOA 4XXUA 4FIMA 1B52A 2NOOA 1LBBA 2DE2A 1I69A 3VDFA 2Q2CA 4IGRA 5FHMA 1B0HA 4WKMA 4XKPA 2V3UA 1MH3A 4OMBA 1MXXA 2A5TA 4F19A 3MAMA 2VHAA 1Q35A 4L17A 3B6TA 3T93B 3H6UA 1SW2A 2BJJX 3VLVA 3VXCA 3UIFA 4OERA 2DS9A 2F97A 4ONYA 2XXRA 1US5A 4H6DA 3PPQA 1AMFA 3BFTA 3RNNA 3FV2A 3OMBA 2XXYA 3BBRA 3FXRA 3MZBA 2QMWA 1MXUA 5I2NA 1LFIA 3H6WA 2KLFA 4RNSA 1GVCA 4JSDA 4YKIA 3T9UA 1HSJA 2F36A 1SW1A 4ZEDA 4YICA 3C35A 5DEXA 4KYSA 4OEUA 4R9GA 4F2QA 2OLBA 1Y4CA 2DWJA 2O1LA 1Y1MA 3SKPA 2H9BA 2DOJA 4R9FA 3TQWA 4YZZA 3CVGA 2QSXA 4DE8A 1B7UA 3TTNA 5I56A 4DCXA 2HZKA 1MM7A 1QUIA 2ZNTA 3IOTA 2AYSA 3FJ7A 5I57B 5H8FA 1H76A 3KFMA 2OBGA 2D5WA 1IITA 2E0SA 1VFEA 4H5FA 5AA3A 4Q30B 4NF4B 3C36A 1B5IA 2PMSA 4R72A 2PBWA 1DMBA 3MPLA 1EH3A 1D9VA 1OMPA 1IXCA 4OWDA 5L9MA 3K02A 3SETA 1UTHB 3MQ9A 1VR5A 1XS5A 2QS3A 2F8DA 5M2VA 2RC9A 1LCTA 2QRYA 3UGWA 1MXZA 4JB7A 4NF8B 1POY1 2Q88A 1O63A 3C33A 3KN3A 3FIRA 3IAZA 1A99A 1FCKA 2HQ0A 4P11A 5I59A 4OFLA 2QL3A 3TCGA 4DZ1A 4PE5B 4U4XA 4O3AA 5K2XA 4BDMA 1QULA 2GH9A 5AA2D 4OYVA 5AA2B 4LZ8A 3G3FA 3C9HA 3OO7A 3P7IA 2XXHA 3RUMA 1NFTA 2UXAA 4NWDA 4EXLA 4F1YA 3MP1A 3E4RA 5F1QA 2V84A 5ITPA 4EQ7A 2B3FA 3HPIA 2RINA 4DXUA 4ZEKA 3MUQA 3N6TA 2GHAA 3OXNA 5I58A 1LB9A 2O84X 5AA4A 3O97A 3D4CA 3O29A 3PMVA 3KJ7A 4IO4A 4FEDA 1N3WA 3I6VA 1B40A 1SI0A 3SEVA 4R6KA 1ZMGA 3MVZA 1FTOA 5KZTA 5H8HA 1FQBA 1N76A 4F1VA 4TQUQ 4ZE9A 4LVQA 3TEPA 4TLMB 2ZMBA 4F31B 3K6WA 4FATA 4EQBA 1H3DA 2Q9TA 4ZZAA 3EQ1A 2PX1A 4GVOA 3PD8A 3F11A 2UVHA 3MP8A 2V3QA 4ELRA 4NE4A 3FGSA 1PBQA 2XXVA 3IB2A 4KPTA 3U94A 4R2BA 1JVYA 3OSQA 4OFJA 1OQGA 5L9OA 2Y7IA 1S50A 2XXIA 1QKAA 2O68A 3HN0A 5DT6A 3OEKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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