4N6PA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with meclofenamic acid at 1.4 a resolution
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structre of C-LOBE OF BOVINE LACTOFERRIN COMPLEXED WITH MECLOFENAMIC ACID AT 1.4 A RESOLUTION
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
source organism Bos taurus
total genus 116
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2013-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n6pA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n6pA02
4IY6A 1MXUA 1PB7A 3TMGA 3O2AA 1ZMGA 5FHMA 1FQFA 5JEIA 3IK6B 4R6KA 3KEIA 2W7YA 1LBBA 3OENA 4OTEA 3RTWB 1A8EA 4DE8A 4E0XA 2ZYNA 3IOWA 3PPPA 1DSNA 5CM6A 1VR5A 4NF8B 2Q8JA 1LFHA 1Y9UA 4O3BA 3KFMA 5CMCA 1MY0A 2O51A 4LQ2A 3CVGA 2UYFA 3EHTA 5EHSA 3RT6B 2O1MA 3IORA 2F8DA 1FQEA 4F18A 1PBPA 2LAOA 4OVJA 2H25A 2VHAA 3Q26A 3MVXA 2I58A 3IB2A 1Y4CA 4P11A 1OVBA 2Z8EA 3TTMA 2Y84A 2OCUA 5AA4A 1B32A 4C1TA 3MW0A 1Y1ZA 4ONYA 5KDTB 2F7CA 4JB7A 4G77A 3M3KA 1UIUA 3E3KA 4R75A 4R6YA 3OO7A 2IEEA 3KJTA 3H06B 1QUJA 5K2XA 4KD5A 3FV1A 1AOVA 4H65A 4FE8A 3QXMA 3CIJA 3PPQA 1NMUA 3MP6A 1I69A 1R9QA 5A5XA 3C36A 1NFTA 3SESA 1IUDA 1B3LA 1H43A 5DVIA 4NWDA 2DWIA 3IAZA 3KN8A 4LATA 3KOSA 3U92A 5F7VA 1H45A 1P1WA 1RYXA 2AYSA 4GD5A 4OFOA 2F78A 3CI8A 3IJOB 3T66A 5JTYB 2I0CA 3MPKA 4ZEIA 2QL3A 1T0KA 4GFRA 1SQYA 1JVYA 1OLAA 1WVJA 3TCGA 3VV5A 4RPNA 4R9FA 5CC2A 2V93A 1ZKBA 1B58A 2D5WA 3V8XB 4F2QA 1IXHA 1Y3QA 1R6ZA 1ZTYA 5I56B 3EPEA 4WXJA 1PB9A 4IGTA 3RQTA 2XXHA 2F36A 1NH8A 1B40A 2ZMBA 2ZYKA 3TDJA 3DP6A 2XD3A 1QJMA 5B7DA 3FIRA 5AA1A 4LA9A 5H8SA 1NNPA 3TQWA 3HHFA 1ZIUA 3VVFA 3FXQA 3PUVE 3TAJA 5ICTA 2B3BA 3MWBA 3VXCA 2DXYA 5HBCA 4EXLA 2O69A 1SYIA 3UGWA 4DCYA 1JEVA 1MQGA 4JSDA 1QUKA 3Q28A 1B0HA 3EHUA 1UQWA 1Y20A 4F1UA 3C32A 3R6UA 2Z23A 4AB6A 4E0WA 4OESA 4H6DA 3SEUA 3SEYA 2Q9TA 1DTZA 1Y3NA 3RN8A 3HSTA 1B7ZA 4FORA 1IZ1A 3TCFA 4JWOA 4RK2A 1FTLA 3O97A 3K1PA 1CB6A 4MF3A 1MH4A 1GR2A 1US4A 2O1LA 3PPRA 1H44A 3ODBA 5CMBA 4MBPA 3PV0E 1WODA 2D3IA 3B6TA 3O9PA 4OFLA 2HXWA 2VP1A 2Y7RA 4TLMB 2FNCA 3T9VA 4ZDMA 3V89B 3SERA 4RY1A 3K6WA 3MBPA 2DWAA 4NF6A 4XIGQ 4F2OA 1FCKA 4TLLB 3FVKA 5CBRA 2ALUA 1OLCA 1YAEA 1RYOA 1URGA 2REJA 1URDA 3CG3A 4QSCA 1VSOA 1M5BA 2ONSA 4GF8A 1SI0A 3W9WA 1MXWA 3M3LA 4NF8A 2O6AA 3OO6A 1A99A 4PFUA 2O84X 3VLVA 1IIWA 4X1BA 5TP9B 1SW1A 4I62A 4WEPA 4BDOA 4JWYA 2XXIA 3K0VA 4JSOA 1NNKA 3QSLA 4Q0CA 5ICQA 2OK2A 4GVOA 4N07A 1WDNA 1SI1A 5B70A 4O3CA 3H3GA 2NOOA 1M5FA 2KLFA 3HCQA 4MLQA 3T9XB 2F35A 2QS2A 3GBBA 3IB0A 2QS1A 4G68A 5ITPA 4G8HA 1MG1A 3VVEA 1XVXA 2F5XA 1FQCA 1EU8A 2P1SA 3G3IA 3UIFA 2X7PA 1B1HA 3TUSA 3HPIA 3K1NA 4PQJA 3KOTA 3VXBA 4TQUQ 4HCYA 3TTKA 1VE4A 3UP9A 1EZOA 5CMKA 2OWSA 1I6BA 4YB6A 1A7LA 4YKKA 3SEXA 3L6GA 3B7DA 2I3VA 5CI5A 1B51A 3KN3A 1SW2A 3JZJA 1PDAA 2OJTA 3MVYA 3TEPA 4ZEKA 3V5AA 1MQHA 2DP8A 1Z7NE 4F3GA 2R9JA 2ZYMA 4X48A 3MAMA 3ZKKA 2QS4A 2ZYOA 4ELQA 2DQVA 3M3FA 2AL4A 4EUOA 4ELPA 1N0TA 3MP1A 3O28A 2X7QA 5FTHA 3THIA 4ZZEA 4NTLA 1FTJA 3FATA 3KSXA 3C31A 3PPOA 4U2RA 2R6GE 1BP5A 1GTKA 1SW4A 1M5CA 1ATGA 4GOTA 2QRYA 1MRPA 2Q88A 4O3AA 2RC9A 3VLWA 1XOCA 2DWHA 4IO7A 1Y4TA 1URSA 4IGRA 3RUMA 4DDDA 4QFOA 3T9UA 4R6HA 2XXRA 1L5TA 4ZECA 3ILTB 2FA7A 5AE4A 3C34A 1II5A 1QVSA 3ECRA 4KPTA 1IITA 3I6VA 4KHZE 3AXFA 3K6VA 4C1UA 5AA2A 2X26A 4IO5A 1QKBA 5I58B 4NF5A 1MQJA 4RPOA 1NNTA 2D21A 4LZ7A 2ZNUA 4OEVA 3L6HA 4XKQA 3C9HA 2HAVA 1AH5A 3N6TA 3WAEA 1B5IA 3SETA 4BLAA 2RKMA 3IX1A 3RGYA 5DYHA 1SW5A 5TP9A 4EQ9A 1D9VA 1UTHB 4KFQA 2Q2CA 4ZEBA 4IO2A 2Y7KA 5KCJA 2QMXA 2OZZA 2I6EA 2VD2A 3U8QA 3IO6A 3GZGA 1SVXB 3B6WA 2GHAA 1HSJA 3S9LC 1JW4A 2AL5A 3FGSA 3RY3A 3DM0A 4H0WA 4GXAA 4FEDA 1MY3A 4QRZA 3UK4A 5K2YA 1JEUA 1NKXA 4ND9A 2IA4A 2HAUA 4N13A 3K6UA 1MXVA 2A5SA 3V83A 3OSQA 3K6XA 3KSJA 2GFEA 2V3QA 3K01A 1A40A 5ELVA 2RINA 2ZXTA 4FEBA 5ITOA 4HS7A 4I9DA 5JK4A 4PFTA 2FYIA 3DLNA 3W9VA 3UA8A 1MM7A 1OIBA 4PE5B 1SDXA 1M5EA 2YPNA 2PVUA 4GIZA 5FTIA 3K1MA 4AQ4A 3PUWE 2YJPA 3LSLA 1NNFA 4GXSB 2Q89A 4BDLA 1IXIA 5I57B 1FW0A 4OEUA 5H8FA 4R74A 5DVJA 3PMVA 4L17A 4YU0A 2A5TB 3CR9A 5EYFA 4Q5TA 2THIA 3HO7A 4GL0A 5CBSA 3Q25A 2QS3A 1B1XA 3K4UA 4EQBA 1POY1 1QW0A 1MXZA 3CG1A 1B05A 3CSGA 3OSRA 1N76A 3O29A 4G4PA 4F31B 4H5FA 4EXKA 3R7XA 2E1SA 1NH7A 2PMSA 5H8QB 4QHQA 3C4MA 3CFZA 1EZPA 5L9OA 3RNNA 3QUFA 4ZS9A 4KYDA 4R2BA 5DEXB 3RT8A 2Y7IA 4ESXA 5HPQA 2RF1A 3O6IA 2F7BA 3MVZA 2DXRA 5KZTA 4F22A 1P1QA 1LCFA 4EQ7A 1P1NA 2XX9A 1LLSA 4QFNA 4QFLA 3MC2A 5DT6A 2XXWA 3UN6A 3BKIB 4Q8RA 4RA1A 2BJJX 3Q27A 3HHGA 1B2HA 1Y3PA 4XXUA 2R71A 4U1OA 3S9EA 4OWDA 5I2NB 4DXCA 3A3UA 4HW8A 5IKBA 2XX8A 4IY5A 1XHYA 5TPAB 4TOZA 2RC8A 3OEMA 3MZBA 2WKYA 1I6QA 1FTMA 2GH9A 1TWYA 2V84A 4ZZAA 3RPWA 4PP0A 4LZ8A 4U4SA 2I48A 3JYRA 2PT1A 2XXTA 4R9GA 1A55A 1B3EA 3N6UA 2ZNTA 3G3JA 2H98A 4RNSA 3PD9A 3R26A 3IL1B 2OLBA 1S7YA 3RTFB 1BKAA 4F39A 2XXQA 2NUVA 3H4ZA 3IB1A 1HSEA 3DP4A 3FJMA 4H8JA 3PD8A 4OMBA 3G7WA 4H5GA 3PU5A 5KDTA 4ZE8A 4YB5A 5AA4B 2HEUA 4GWOA 5DTBA 3FXRA 2REGA 3FD3A 3ZS6A 1FTOA 4BDMA 1LAHE 3PUZE 3SEVA 1ZJLA 3MZ1A 1ANFA 3KZGA 3CFLA 2RCAA 3FJ7A 4ECFA 2HCAA 5FHOA 3OOAA 1R9LA 2UVGA 5LOMA 1XVYA 1B3HA 4G8MA 4C0RA 3BBRA 3EQ1A 3LSXA 5H8HB 1XS5A 3FJGA 3TTLA 1IQ7A 4QSDA 5JTYA 4QFPA 2I3WA 2HFBA 2V3TA 1JQFA 1DMBA 3WAFA 5I2KB 4DZ1A 5I84A 3FASA 3ZKLA 1R1NA 1USYH 3CFXA 4F19A 5I56A 1PEBA 4MFIA 5I59B 1QUIA 2NVUB 1HSLA 3QUJA 2DSFA 3LSFB 3HN0A 4DXUA 3OEKA 1OQGA 1AL3A 1H76A 1B5JA 2Y7WA 5IAIA 1MDQA 1QKAA 1LCTA 2Z8DA 3S9NC 2PBWA 4YICA 1NL5A 4MH5A 2GHBA 5EHMA 2UYEA 1A54A 3N94A 5TU0A 3U94A 2Z22A 4ELRA 3LSWA 1BIYA 1Q1KA 4P0IA 3DP8A 3IR1A 3ONMA 1JW1A 2XXPA 2XXYA 3A3CA 3CRBA 3FVOA 3OMBA 1MPCA 2PYYA 4N6PA 2I4CA 2M8CA 4OERA 4QFKA 3TYHA 5H8QA 2F97A 4UA8A 1H3DA 4IO4A 2GRVA 3SKPA 1P1UA 4GL8A 4F1VA 5DEXA 3CSBA 2ABHA 1B7UA 4XKPA 1EH3A 2DOJA 3OO8A 2PX1A 3KG2A 3IOVA 1LAXA 1MPDA 1AMFA 4Q30B 2ONRA 1B9JA 4R72A 4DLDA 4F3BA 1B46A 1JNFA 1MXYA 1D4NA 1LSTA 2V3UA 1N7XA 1B3FA 3E9XA 3PPNA 1Y1MA 4LP2B 4H8IA 3H6WA 1D9YA 3VVDA 2DVCA 4YKJA 4NF6B 5J1DA 1DPEA 4XKRA 5I2NA 3U93A 2DYXA 4U23A 5TPAA 3T9HB 1O7TA 4YMAA 1QULA 1JETA 1N04A 3KGCA 3PUYE 2DS9A 2CMOA 1ZBMA 3UORA 3I3VA 3VE1B 1JVXA 1TT1A 1VFDA 4LVQA 4RYAA 1MY2A 1B52A 1P1OA 4U1ZA 1B4ZA 2Z8FA 3G3FA 2RCBA 4PFWA 4KQPA 4OHNA 4OZ9A 1B6HA 3BFUA 4QSEA 2ANJA 3DELB 3FXUA 2AIXA 4U4XA 3BFTA 3O6HA 1O64A 2HQ0A 3M8UA 3TTNA 4AB5A 2Q2AA 3FVNA 2DE2A 1UTBB 4NF4B 1J1NA 1I6AA 1PB8A 4XKNA 4THIA 1F9BA 5CMMA 4OETA 1LAGE 1US5A 1A8FA 4GQOA 5M2VA 4OYVA 4G68B 1MQIA 3EF7A 3H7MA 4EDPA 3LBSA 1GVCA 1POTA 3KJ7A 4RJZA 2NWJA 1LAFE 3E13X 4FECA 2P2AA 3JV9A 4ISUA 1TFAA 5AA3A 1ELJA 4IO6A 5H8HA 4JBZA 4R73A 3TFLA 3FVGA 1LGBC 3H6UA 4NE4A 2ZNSA 4YZZA 4JWXA 4LQ5A 1VFEA 3T93B 4HTGA 4XTCQ 5H8NB 3S9MC 4HCWA 1IEJA 2XXUA 3TODA 5L8DA 1YTVA 3C35A 5I2KA 3MUQA 4EF1A 4YB7A 1IXGA 1GV8A 3U72A 1FQAA 3K2DA 2VGQA 4I8CA 2I0BA 5I59A 1KWHA 1MY4A 3O66A 4R2FA 1AIVA 1M5DA 4Z7EA 1MDP1 2QMWA 2O68A 1MS7A 3F11A 3S2VA 1FQDA 4F1YA 3KBRA 1LB8A 2F7AA 3W15C 4YMBA 1IXCA 3IO4A 2E0SA 1BTJA 2VOZA 3EHSA 4BDRA 1GGGA 1TXFA 1UIVA 1FTKA 1CE2A 2H5YA 4OXVA 4FIMA 3S4UA 4KI0E 2DWJA 4WEDA 4M1VA 3O6GA 4FJPA 4I1DA 5BUUA 3T96B 1SD3A 4YKPA 2F6GA 2DVZA 2UVIA 3MVWA 2ESNA 2I4BA 4EF2A 4KYEA 4H67A 4M4GA 1B5HA 1B4HA 3H6TA 3PUXE 3QYTA 4DCXA 2B3FA 4DXBA 3T22A 4P0GA 4WKMA 4OFJA 4JXIA 1D3KA 4ZE9A 4NEDA 1SBPA 4UACA 3QK6A 1N7WA 2QPQA 3SDFA 4POWA 5BWJA 3GLBA 3VLUA 2HZKA 2ONKE 3D4CA 4KYSA 4ELOA 5I58A 2OWTA 1N3XA 1B3GA 1ZLQA 2H4IA 3TQLA 5AA2B 3VDFA 1N3WA 3FUZA 1LBCA 1ZU0A 3OELA 5AA2D 3PMXA 4NF5B 3EN3A 2H9BA 3MJNA 1Z7ME 2DE4A 4ZEFA 2CZLA 2XXXA 2H99A 3A09A 4U22A 3QAXA 5CRYA 1MXXA 4FATA 1UTHA 4POXA 4PFYA 2B65A 3Q29A 3KN7A 4FAJA 1OQHA 2QJEA 5ISUA 4X1DA 4JDFA 4G68C 4K3FA 3TPAA 1BLFA 5KCJB 1OMPA 4G2ZA 1DTGA 3GBAA 5FHNA 1YPNA 2F34A 4GRKA 4YKIA 1S50A 3P7IA 1MY1A 3TELA 1B0LA 4LZ5A 4OENA 1UTBA 1EZ9A 3G3KA 4NF4A 2G93A 3USDA 1LFGA 4LUBA 5A5XB 3PGFA 2YLNA 3QIMA 3HV1A 3PMWA 3MP8A 2V25A 3U1OA 3IOUA 1JW5A 2QSXA 2OBGA 1XC1A 3IJXB 3ZSFA 4F3SA 2O7IA 4BDQA 4U21A 2NXOA 2PT2A 3TKDA 4F29A 4LONB 4NWCA 4QF9A 5H8NA 4Z0IA 4RK9A 4MLVA 3K02A 3OXNA 1DPPA 2RC7A 3B6QA 1MH3A 3H03A 3SEWA 1PC3A 3LC8A 3N5LA 3FZVA 5L9SA 3MPLA 5I57A 2VD3A 3MZ9A 3N26A 3FV2A 1OVTA 3TCHA 4OQOA 3MQ9A 4NMYA 3TTRA 1USYE 5H8FB 2A5TA 2XXVA 1MQDA 3VFJA 3G3HA 4G8NA 3IOTA 4PETA 5F1QA 4KCCA 4GLIA 4ESWA 2G29A 3G3GA 2I49A 1P99A 1Q35A 2UVJA 1YCJA 3TZAA 3H6VA 4YAHX 2Y7PA 3E4RA 1LB9A 4BDNA 1XT8A 1MM6A 2P0SA 3GXAA 1MPBA 1N84A 2XD2A 3LR1A 5HM4B 4ZEDA 1O63A 2DE3A 2XHDA 4IB2A 2HZLA 2F6PA 1SYHA 2UXAA 3I5OA 3OO9A 1TFDA 2XX7A 4X9TA 4KCDA 3D4GA 3OD7A 1FQBA 3C33A 4F3PA 2O7UA 4KR5A 3RLFE 1PBQA 1DOTA 5L9MA 3LUYA 3ILUB 1B7HA 4RXLA 4IO3A 4DIGA 3K00A 1RKMA 2UVHA 1LFIA 1S9TA 4H1XA 5DVFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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