4N6PA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with meclofenamic acid at 1.4 a resolution
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structre of C-LOBE OF BOVINE LACTOFERRIN COMPLEXED WITH MECLOFENAMIC ACID AT 1.4 A RESOLUTION
rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 116
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2013-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n6pA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n6pA02
4ZDMA 3IB1A 1QJMA 3TCFA 1LAHE 5I56A 1NH7A 2D5WA 3N94A 3B6WA 3C9HA 4PE5B 3PPOA 3Q26A 1A55A 4G8NA 1VR5A 3LSLA 5FHNA 3VLVA 2GHBA 4JDFA 3U92A 1MQIA 4EUOA 1HSJA 2I49A 2Z23A 3PPRA 4ZEDA 4H5FA 1SD3A 3M3FA 2F97A 3CRBA 1M5FA 2H5YA 1IITA 4OVJA 1EU8A 1XOCA 3UP9A 3C32A 1ZBMA 2DWAA 3QIMA 3THIA 3HSTA 1D3KA 4R6YA 4F2QA 2F6GA 5L8DA 1QVSA 4LP2B 1DMBA 1LGBC 3QUFA 4OMBA 4FECA 2O1MA 3RTWB 2RC7A 2PYYA 4NE4A 2AL5A 3PUYE 1Y4CA 2Q88A 2XXTA 4I9DA 1O63A 4TQUQ 3K00A 4X1DA 5DVIA 3KJTA 4IO4A 4OEVA 4QFNA 1I69A 2H4IA 1N04A 3TTNA 4GXAA 1MY4A 4NWCA 3K1MA 3W15C 1DPPA 4KFQA 4MFIA 1POY1 3FV1A 3KOSA 4RA1A 4FIMA 5K2YA 2RCAA 2YJPA 1XS5A 1AMFA 1RKMA 2NXOA 1OLAA 2H25A 2F7AA 1WVJA 3Q28A 3QXMA 1EZOA 3UK4A 5H8FB 1IXHA 1NMUA 4HTGA 3FIRA 4H67A 4YB6A 3SDFA 1YAEA 3G3KA 3TQWA 1II5A 4C1UA 3OEMA 3G3IA 1SW5A 2QJEA 3IOWA 3K6XA 4OETA 4X48A 3TTRA 1NNTA 3GZGA 3MUQA 4E0XA 4F1YA 5BUUA 4QFOA 3TUSA 1T0KA 5EHMA 2NWJA 3EHUA 3KG2A 1A8EA 3KN7A 4YKKA 5A5XB 3MC2A 3KFMA 4M1VA 4K3FA 1N84A 4F3PA 2G29A 3HPIA 1BTJA 1NH8A 2VP1A 3JV9A 3CG1A 4IGRA 3I6VA 3C31A 1FW0A 3GBBA 1B7HA 2O84X 4NF6B 3T96B 3TDJA 4PP0A 4XXUA 3IB0A 3O6IA 4LZ8A 1QUJA 4R2FA 4HW8A 2OWTA 2DOJA 3MPLA 3M3LA 2A5TB 2HZLA 3I3VA 3FJMA 2DQVA 1B1XA 3A09A 4GXSB 1B3HA 2DE2A 5CM6A 3RT8A 2HQ0A 4LA9A 5FTIA 3FVNA 3LSXA 4OFJA 1GVCA 5L9MA 4C0RA 1ELJA 2ZNSA 3FGSA 2DS9A 2UVHA 3IR1A 4H1XA 4YKPA 5I2KB 1US4A 4KYEA 4ELOA 1OVTA 4R74A 3FJGA 1EZ9A 2FNCA 4Z7EA 2ONSA 2OK2A 2REJA 4G2ZA 1SI1A 1LSTA 1XT8A 3VXBA 2I3WA 5KDTA 1TWYA 1SYIA 2Y84A 3UA8A 2QS3A 4Z0IA 4P0IA 1B4HA 1AOVA 4OYVA 2XX7A 2H98A 4XKRA 1VFDA 2DVCA 3N6TA 4R72A 1URSA 3IJOB 2PMSA 3SEVA 3C35A 4YMAA 5B70A 3G3HA 3E9XA 2WKYA 1JW4A 3BKIB 3K1NA 2GFEA 3VDFA 2W7YA 1FQBA 1KWHA 3K01A 4N6PA 1MQJA 1XHYA 3RQTA 1B32A 3LSWA 5I57A 5HPQA 2X7PA 2XXQA 3VE1B 4X1BA 4KI0E 4LQ5A 4I8CA 1B40A 1FQFA 4IB2A 1PEBA 1SDXA 5H8NA 1R9LA 1SYHA 4FEDA 4KHZE 4NEDA 1I6QA 4LQ2A 4NWDA 4PQJA 1Y9UA 5H8QA 3TCHA 4DLDA 1PB9A 1ZIUA 4F3SA 5FHOA 5H8SA 4H0WA 1SW4A 2DXRA 2B3FA 1P1OA 2B65A 3O6GA 4QHQA 3PPQA 1L5TA 3RUMA 3TZAA 4U1OA 2HAVA 1N0TA 4U21A 4F2OA 1A7LA 2XXVA 3PUZE 4GL8A 4F39A 4XTCQ 5AE4A 1LAFE 3CR9A 3MP6A 1NFTA 3O97A 1TXFA 2DXYA 5FTHA 2Y7KA 2XXPA 3PV0E 4RPOA 3A3CA 4ELPA 1B6HA 5DEXA 5I84A 2UYFA 2RC8A 3FVGA 4NF4B 1LLSA 3H4ZA 1MY3A 5H8QB 5TPAB 1UTBB 4FEBA 4FAJA 1MY1A 4OFOA 2XXIA 4YAHX 1DPEA 1GTKA 3TEPA 4IO3A 3H7MA 1TFAA 4YICA 4U23A 1JVXA 4C1TA 3IL1B 1MH3A 1JW5A 3B6QA 3KGCA 4OZ9A 3IO4A 4KPTA 1ZKBA 3ILTB 4POXA 3HHGA 4X9TA 1FQEA 3SEWA 4WEDA 1JVYA 1N7XA 1QKAA 3MVWA 4JWOA 5HM4B 2I0BA 1B7ZA 5J1DA 3EF7A 3FATA 3U94A 2VD2A 1LCFA 1LFGA 4F19A 3PMXA 3VLWA 5AA2D 3KEIA 4QFKA 3OXNA 1AL3A 2GH9A 3UORA 2ZMBA 3OD7A 4H65A 4KYSA 1MXWA 1D4NA 2BJJX 3PMWA 1LAGE 2Y7WA 4GL0A 3E13X 4U2RA 1PBQA 2F5XA 3ZKLA 3WAEA 2ONRA 1Y1MA 4YZZA 2V84A 1LB9A 3EHTA 2ANJA 1M5BA 3OO9A 4RK9A 4XIGQ 1LBCA 3IOUA 4PFTA 4FATA 1FTLA 4JWYA 1IIWA 2DVZA 4BDNA 4JB7A 3N6UA 1URGA 4XKPA 3R26A 3BBRA 3T22A 4DE8A 1BIYA 1MM7A 3FXUA 1VFEA 1MPDA 1SBPA 3SETA 4DIGA 5AA2A 1ZJLA 1XC1A 1MXXA 3OENA 4HCYA 2F8DA 1R9QA 4TOZA 5I2KA 1IZ1A 1N3WA 5H8HB 2I0CA 1ZLQA 4NF8A 5CBSA 1P1UA 2REGA 1MM6A 3PU5A 4KQPA 2Q9TA 3PMVA 4ZZAA 3VVEA 3W9VA 2D3IA 2RF1A 2X26A 1OIBA 2G93A 3QK6A 3KOTA 5JEIA 3C4MA 3GLBA 3K4UA 4NF4A 1FTJA 4QRZA 4QSCA 5TPAA 5I56B 1LFHA 2Y7IA 3E4RA 4G68B 5ICQA 3SERA 3VLUA 3AXFA 1B2HA 4ZS9A 4NTLA 4RXLA 3T9XB 3RLFE 4EXKA 1TFDA 5HBCA 3TELA 5JTYA 1MG1A 3MZBA 3H6VA 4H5GA 1GV8A 4U4SA 1I6AA 2Z8DA 4XKNA 1FCKA 1RYOA 3B6TA 4H8JA 4GF8A 1B1HA 4QSDA 3S9MC 2GHAA 4KCCA 2VGQA 4AQ4A 2DSFA 4GOTA 3KN8A 1JQFA 1LAXA 1IQ7A 1Y20A 2OCUA 3G7WA 4OXVA 4ONYA 2IA4A 2DWIA 5EHSA 3T66A 1HSEA 2O69A 3RNNA 3TFLA 1FQCA 1LB8A 4ND9A 3CSGA 2HCAA 1POTA 2Y7RA 5ELVA 4DXBA 1OLCA 3DELB 3G3JA 3WAFA 4N07A 4HS7A 1WDNA 1B05A 5I2NA 1IXGA 1HSLA 1F9BA 1OVBA 1ZU0A 4Q30B 3RY3A 3U1OA 4BLAA 1AIVA 4N13A 1NNKA 3L6GA 4R9GA 3UIFA 3FVKA 4ISUA 5DVJA 4F22A 1O7TA 2UYEA 3TCGA 4F1VA 3DLNA 4FJPA 1FQAA 2H9BA 4QF9A 3O66A 3GBAA 3ODBA 2DE4A 1US5A 2LAOA 4OERA 1P1WA 2CMOA 2I3VA 3MWBA 3MZ9A 3K1PA 3TTKA 2XHDA 3ZS6A 2O51A 4TLMB 3MZ1A 2QS4A 4KR5A 2ZNTA 3U72A 3V89B 2HFBA 4DXCA 1YPNA 4NF8B 4WXJA 1A99A 5KCJA 3MVZA 3T93B 1QUKA 2THIA 3FD3A 3U8QA 4EF1A 2O7UA 4LUBA 4NF5B 3IOTA 2V25A 3H06B 3O6HA 3PGFA 1VE4A 1B7UA 5CMCA 5TP9A 1Q1KA 1DTGA 1MQGA 3H03A 2F7BA 4G68A 2P2AA 4EF2A 1JEUA 3FXQA 5I58B 1UTHB 1QULA 3PUVE 4GD5A 3VVDA 4KCDA 5KCJB 1GR2A 3LBSA 1BLFA 1YCJA 5CMMA 4KYDA 2OWSA 4BDMA 5ICTA 4O3BA 1JW1A 2KLFA 3CFLA 4DXUA 3USDA 4ELRA 1Q35A 4R9FA 3LSFB 5IAIA 1B3FA 2QS1A 1MPBA 4OESA 1B9JA 2Z8EA 3MAMA 1B46A 3RGYA 3RN8A 3RT6B 3SEXA 3SKPA 4EQ9A 3TODA 4F3GA 4IO6A 3K6VA 3PD9A 2AYSA 1Z7NE 3V5AA 3S9EA 1H43A 4ESWA 3KBRA 5ISUA 1MXVA 2F35A 3O9PA 2DWHA 2R71A 5CI5A 4JSOA 3TQLA 4AB5A 3V83A 5CMKA 1MY0A 4DDDA 1MDP1 1SQYA 3ONMA 1WODA 2V3QA 5I2NB 3FVOA 4LATA 2M8CA 3TYHA 4UACA 3KZGA 1H45A 3OSRA 3K6UA 4BDOA 3EN3A 4POWA 4RJZA 1S9TA 3MQ9A 1B52A 1SW1A 5L9SA 3VXCA 2E0SA 3LR1A 2HAUA 4PFUA 2E1SA 2RKMA 4Q5TA 2V3TA 1XVYA 1MH4A 3FXRA 3O29A 1UTBA 4P0GA 1BP5A 3T9VA 1YTVA 3DM0A 1A40A 3EHSA 1B5IA 2PX1A 4R6KA 2PBWA 2F6PA 3HV1A 3IK6B 3PPNA 5KZTA 1FTMA 1DSNA 4EDPA 1P1QA 1MXYA 5F7VA 1NNFA 1SVXB 1URDA 2PVUA 5FHMA 1CB6A 2OJTA 4YB7A 3EPEA 4JWXA 5JK4A 2UVJA 2UVIA 2I4CA 4MH5A 4XKQA 1GGGA 5IKBA 3OO8A 4IY5A 3BFUA 4KD5A 4OENA 3OO6A 2I4BA 2FA7A 3C36A 4OEUA 3Q29A 2Q2CA 2Z22A 1PB8A 4E0WA 4O3CA 1LFIA 2QS2A 2RC9A 3IORA 1Y3QA 4IO5A 1JNFA 2D21A 1S7YA 2I48A 3SEUA 1O64A 1PBPA 3QAXA 2NUVA 3HO7A 3BFTA 3IOVA 3DP4A 3M8UA 3GXAA 4I1DA 4OFLA 5DVFA 5M2VA 3RPWA 4DZ1A 2NOOA 3JYRA 4GIZA 3F11A 3FJ7A 3Q25A 4IY6A 3IAZA 2YPNA 3KJ7A 3TKDA 4THIA 4G8HA 1MDQA 1Y3PA 3ZKKA 1OQGA 2GRVA 3CFXA 5BWJA 2OLBA 3KSXA 1MQHA 1USYE 4F31B 5DTBA 1M5DA 5I57B 1MPCA 4YMBA 4BDLA 4H8IA 3MPKA 1Y3NA 4LZ7A 5I59B 5I59A 2H99A 2DWJA 1MQDA 3ZSFA 1B3GA 1QW0A 4ZE9A 3C33A 3CIJA 3S2VA 2OZZA 4GLIA 4UA8A 2VOZA 2ABHA 1Y1ZA 2QMXA 3IB2A 2YLNA 3HN0A 2Q8JA 2A5TA 4QFPA 3RTFB 5L9OA 5I58A 5AA3A 2DP8A 4ZEIA 2V93A 2IEEA 1D9VA 2XXYA 1A54A 3ILUB 5DYHA 3Q27A 4ZEFA 1B58A 3JZJA 4LZ5A 3OSQA 5B7DA 4GFRA 3EQ1A 1PB7A 4R6HA 2QMWA 4U1ZA 3H6TA 3MBPA 3PUXE 1IXIA 2O6AA 4OHNA 4BDQA 4GVOA 2DYXA 2RCBA 2QRYA 3D4GA 4ELQA 4MF3A 1M5EA 1B0HA 2B3BA 3U93A 1OMPA 1B3EA 1QKBA 3PPPA 4L17A 4PFWA 3E3KA 4Q0CA 4RK2A 3TTMA 4DCYA 1P99A 2XXXA 1OQHA 3G3GA 1ANFA 4QFLA 3T9UA 1ZTYA 1B5JA 2OBGA 4F3BA 1USYH 1IUDA 1N76A 2P1SA 4GRKA 2FYIA 1MRPA 1UIVA 2O1LA 3OMBA 4PFYA 5CRYA 2NVUB 1B4ZA 3FV2A 2CZLA 4EQBA 1DOTA 2R9JA 4U4XA 2ZXTA 2DE3A 3C34A 2ZYNA 4MLQA 1XVXA 3MP8A 3QUJA 3MVYA 3N5LA 3VFJA 4IGTA 1NNPA 2P0SA 2ZYOA 2F78A 1ATGA 3G3FA 4MBPA 3VV5A 4WEPA 1FTKA 2Z8FA 4RPNA 5EYFA 1MS7A 4ZZEA 4EQ7A 2V3UA 1P1NA 3PUWE 2F7CA 3CVGA 4ZE8A 2A5SA 2XD2A 4I62A 2QSXA 4YB5A 2VHAA 2Q2AA 4R73A 4F29A 2UXAA 2R6GE 1PC3A 5AA1A 1CE2A 3DP6A 1UQWA 1LCTA 1B5HA 4U22A 3I5OA 2XD3A 4TLLB 4YU0A 1QUIA 2ESNA 3OEKA 3FUZA 2HEUA 4ESXA 2PT2A 1Z7ME 2QL3A 3OELA 4Q8RA 5KDTB 4WKMA 4HCWA 2ZYMA 1LBBA 4IO7A 3LC8A 2AIXA 3IO6A 2O68A 4G4PA 5ITOA 1MXZA 4QSEA 4R2BA 3O2AA 4F1UA 3FASA 5LOMA 3O28A 4GQOA 5TP9B 1S50A 4ZEBA 4NF5A 2VD3A 1H3DA 2Q89A 3M3KA 5TU0A 4EXLA 1A8FA 4G77A 2HXWA 4NF6A 3DP8A 3PD8A 3W9WA 3S9NC 2ZYKA 3D4CA 3TAJA 4LONB 4H6DA 5AA4A 1UIUA 1AH5A 5H8HA 4AB6A 1NKXA 5ITPA 2I58A 3HHFA 2RINA 4RY1A 3L6HA 4F18A 3R7XA 3A3UA 2HZKA 4YKJA 5CBRA 1EZPA 3K02A 2AL4A 2O7IA 2F34A 3IX1A 4MLVA 5F1QA 3H6WA 3S4UA 3K0VA 3LUYA 3UGWA 4O3AA 5H8FA 4FE8A 4JBZA 1MY2A 1R6ZA 2UVGA 3KSJA 1PDAA 4RNSA 2Y7PA 3H6UA 4OQOA 5H8NB 2XXUA 4JSDA 1NL5A 3HCQA 3MJNA 4GWOA 2I6EA 3CG3A 3TMGA 1ZMGA 1IXCA 4JXIA 4OTEA 1Y4TA 1IEJA 5K2XA 1N3XA 1RYXA 2XXWA 2XX8A 3CI8A 4FORA 4YKIA 5AA4B 1B0LA 1H44A 1N7WA 1SW2A 1TT1A 2PT1A 4G8MA 2XXHA 2XX9A 4M4GA 4R75A 3TPAA 3N26A 3IJXB 4IO2A 1D9YA 1I6BA 4DCXA 1EH3A 1BKAA 3SEYA 3S9LC 1DTZA 4PETA 1JETA 3OOAA 3P7IA 3ECRA 3SESA 5CMBA 3K2DA 1MXUA 4NMYA 4ZECA 1SI0A 1H76A 4G68C 5CC2A 4ZEKA 4LVQA 3B7DA 1JEVA 1FTOA 1B51A 3H3GA 1VSOA 3K6WA 4RYAA 3QYTA 5JTYB 2QPQA 3MW0A 4P11A 1R1NA 3MVXA 3CSBA 3R6UA 1B3LA 3QSLA 3KN3A 1UTHA 3OO7A 5DEXB 3VVFA 2X7QA 3FZVA 4ECFA 2ZNUA 2ONKE 1J1NA 1M5CA 3MP1A 1FQDA 2XXRA 3UN6A 2ALUA 3V8XB 4OWDA 3T9HB 4BDRA 5DT6A 3TTLA 5AA2B 3CFZA 2F36A 5A5XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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