The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
Crystallographic characterization of the nitric oxide derivative of R-state human hemoglobin.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
59
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-10-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5CNE A; 1F5P A; 2D2M D; 4NK1 A; 1Y2Z A; 1Y83 B; 1A6N A; 1SI4 B; 3MYN A; 3SDH A; 1A0U A; 1WMU B; 3ZJS A; 1HCO B; 1HLB A; 5CN6 A; 1Y4G B; 3NG6 B; 2QRW A; 1BVC A; 4M4A B; 3GQR B; 4YU4 B; 4C44 A; 3D1A A; 1ABS A; 3S48 C; 104M A; 1J7S B; 3WFU A; 6HBI A; 1Y22 A; 1ABW A; 5ILE A; 3ARK A; 1BZP A; 2FRK X; 1VRE A; 1XZ2 A; 1ABY B; 1IRD A; 1MKO A; 3HF4 B; 1LFZ A; 2R4W A; 1J41 A; 4F6I A; 3W4U B; 4MQI A; 3NMM A; 1S5X B; 2WTG A; 1YDZ B; 3R0G A; 1A0Z A; 2ZFB A; 3G4Q A; 2O5B X; 3ORD A; 1YEU A; 2ZT0 A; 1B86 B; 3GYS A; 3RJN B; 1AJ9 B; 2SPL A; 2CMM A; 3GDJ B; 4PNJ A; 2OH8 A; 3B75 B; 1O1J A; 3D4X A; 3S66 A; 2EB9 A; 3ECL A; 1FN3 B; 1YIH B; 2D60 B; 2FAM A; 2V1J A; 4WJG A; 3V2Z A; 1OJ6 A; 4F4O B; 1S5Y A; 1YMC A; 1O1M A; 1UVY A; 5HU6 B; 1ECN A; 4B3W A; 1BIJ B; 3R5I B; 5EYS A; 2O5S X; 3HRW A; 2G0V A; 1D8U A; 1Y0T B; 2EVP A; 3WTG A; 1YIE A; 1Y8H A; 1Y0C B; 1AJH A; 1G0B B; 1Y5J A; 2NSR A; 2HBF A; 4VHB A; 1HBA A; 1RQ3 A; 1FLP A; 1NZ2 A; 3GLN A; 3WCV D; 2IG3 A; 1MYG A; 1PBX B; 1GDL A; 1C7B A; 1MWC A; 2G3H A; 3WI8 A; 3PI9 A; 2G11 A; 2GTL A; 1MBD A; 1NPF A; 2DN3 B; 1YVT A; 3PT8 A; 4GZG A; 1Y8W A; 1S56 A; 1GDJ A; 2R80 B; 3PI8 B; 2MYE A; 5JGG B; 1YG5 A; 3OJ1 A; 4NZI A; 1HDA B; 4TWU A; 1RVW B; 3ZOM A; 3G4R A; 2G0X A; 1HRM A; 3AQ7 A; 1JZL A; 1VXF A; 1HDS B; 1XZ5 B; 5C6E B; 1FSL A; 2ZSX A; 2MGH A; 2ZT2 A; 4L7Y A; 2QMB B; 1YHU D; 5CNB A; 2BLH A; 3AQ9 A; 4NS2 A; 1G09 A; 5JDO D; 2FRJ X; 3WCV C; 1COH A; 1NWI A; 3UHW A; 1GVH A; 1I3E A; 1J7W A; 3QM7 A; 2HBD B; 1YOI A; 3PEL A; 3HXN A; 1RPS A; 1CO9 A; 2ZS1 B; 2QSP B; 2D5Z A; 2MGA A; 3DHT A; 1MLN A; 4DWT A; 2FRI X; 5CMV A; 1HAB A; 1EBC A; 1LH5 A; 1MLM A; 4NI1 B; 1XZU A; 1AZI A; 4UZV A; 1Y09 A; 4JYQ A; 4F6F A; 4H07 A; 3DUT B; 3BA2 A; 1DTI A; 1Y7G A; 1BZZ B; 1QI8 B; 5EET A; 1GBV A; 4AVE A; 4H0B A; 2EKU A; 1HBH B; 1MTK A; 1LFT B; 1LFY A; 1DWS A; 1J7Y A; 3LB1 A; 1G9V B; 2GRH A; 3P5Q B; 3QMA A; 5D5R A; 4N7P B; 3HC9 A; 4HRT B; 2O58 X; 3HYU B; 5EOH A; 5EUI A; 1R1Y A; 1MLR A; 1Y4V B; 3ZJQ A; 2OHB A; 3VHB A; 3ZJO A; 1NS9 B; 1OUT B; 1JL6 A; 1TU9 A; 1QPW B; 1NPG A; 3ZJL A; 3BCQ A; 1G0A B; 1MLG A; 1VXC A; 1XYE B; 1NEJ B; 3UHR A; 1JY7 B; 4ROM A; 1MBA A; 2D2N A; 1FSX A; 1M6C A; 3FS4 A; 3VRG A; 5KER A; 2MHB B; 3AT6 A; 4PQ6 A; 3UH5 A; 4HRR A; 1XY0 B; 1NS6 B; 4TWV A; 1A01 B; 2JHO A; 5B85 A; 2NX0 A; 1CIK A; 1NIH A; 7HBI A; 1Y46 B; 2HBE A; 2D6C A; 1YGD A; 1ITH A; 3NL7 A; 4ROL A; 5E6E B; 1N9H A; 2DN2 A; 5HLX A; 1KD2 A; 1CPW A; 3MBA A; 4O35 A; 1VWT B; 111M A; 1IBE A; 1UT0 A; 1Y8I A; 5AZR A; 4BJA A; 1CLS B; 1YVQ A; 3WHM B; 2WY4 A; 1DXT A; 3K8B A; 2HHD B; 3EOK B; 1MLL A; 1GBU B; 4G51 B; 1CH9 A; 1IT3 A; 2W6X A; 1Y45 A; 2MGF A; 4MBN A; 1Y4P B; 1A4F A; 1Y0A B; 1HDB B; 3BJ2 A; 4UIQ A; 3GQG B; 4QAU A; 5EYJ A; 4F69 A; 1DO1 A; 3GOU A; 2BMM A; 1BBB B; 1Y4Q B; 2AUQ A; 4N7O A; 3WR1 A; 2DN1 B; 2RAO A; 1LH2 A; 1V4W A; 3GKT A; 1QXD A; 4U8U A; 2ZFO D; 4MXL A; 1HBG A; 5E83 B; 2PGH B; 4N7N B; 5D1V A; 1Y5K A; 3EU1 A; 1FCS A; 1Y4B A; 3CY5 A; 4XS0 B; 1RQA A; 5KDQ B; 1X9F A; 2QU0 A; 4KN3 A; 4XDI A; 4KMV A; 5HY8 A; 1MNH A; 2G14 A; 5CN9 A; 1XZV A; 1A3N A; 1O1O A; 5CN7 A; 1LJW B; 3AT5 A; 2ZS0 D; 1QSH A; 3BJ3 A; 1OUU B; 1LFL B; 1V75 A; 5E29 B; 2VM0 A; 3UBV A; 3E4N A; 1T1N A; 3AG0 A; 3UHK A; 1XQ5 A; 2Z85 A; 3ODQ A; 1O1L B; 2ZLT B; 1Y7D A; 3M3A A; 2ZST A; 2EB8 A; 1MOD A; 1HGA B; 2O5Q X; 2M6Z A; 1MGN A; 2C0K A; 1BZ1 B; 1XXT B; 1LFQ B; 1V4X A; 2RI4 B; 1R1X B; 4MU5 A; 1VRF A; 2ZLU B; 4MQK A; 2SPN A; 3ECX A; 1O1N A; 2R1H A; 1MNO A; 3ZJJ A; 3AQ5 A; 4FC3 B; 1A3O B; 2ZS0 C; 1YHR B; 1SHR B; 2O5M X; 4MQG A; 5AB8 A; 3WCW C; 1HHO B; 2MGC A; 2Z6T A; 3BOM A; 3WCP A; 2HCO B; 3SZK A; 3OO5 B; 4FWY A; 3WCU C; 4ILZ A; 3QJB A; 1MLQ A; 2V1G A; 3IC2 B; 1HGB A; 1YCB A; 3MKB A; 1CQ2 A; 4G1B A; 3CIU B; 1LA6 A; 2ZLX B; 4YU3 B; 2Z6S A; 2NRL A; 4MQC A; 1NQP A; 3UHN A; 1YEO B; 4HHB A; 2W72 B; 1GCV B; 1EMY A; 3ZJP A; 2QFK A; 2G12 A; 2H35 B; 2ZLW A; 3DHR A; 4MQH A; 2HBS A; 4LPI A; 3VRF A; 2HHB B; 105M A; 1I3D A; 1MOC A; 1HV4 B; 1Y7C B; 1YE0 B; 2AA1 B; 5ILR A; 2MGL A; 1MDN A; 3QZZ A; 1F5O A; 4G1V A; 4MQJ A; 1V5H A; 3ASE A; 1YEQ B; 5JDO F; 3K9Z A; 1C7C B; 4X0L B; 3VRE A; 3NFE B; 4ESA B; 2ZFO A; 1EW6 A; 3MOU A; 1UMO A; 3D17 B; 5HLQ A; 1Y5F B; 3UH7 A; 5CNG A; 4M4B A; 3E5I A; 2W6V B; 4HBI A; 1Y2Z B; 2MYB A; 2ZS0 B; 1A0U B; 1N9I A; 2ZT1 A; 1M9P B; 3WCW B; 1H1X A; 1YE2 A; 3A59 A; 1X3K A; 1CP0 A; 1MYZ A; 2BLI A; 3WCU B; 1Y83 A; 3ARJ A; 2XKI A; 1VHB A; 1FHJ B; 1CBL A; 5CN4 A; 1Y4G A; 3MYM A; 2ZSP A; 2V1I A; 3G4V A; 3NG6 A; 4DC8 A; 2MGM A; 3FH9 A; 2GNW A; 1Y22 B; 5CN5 A; 3GQR A; 2BK9 A; 2G0S A; 1MBC A; 1K0Y A; 1YFF A; 1YH9 B; 2BNL A; 2MGJ A; 3RJ6 A; 3S65 B; 1XZ2 B; 2GDM A; 2MGK A; 1IRD B; 1OR4 A; 3NML A; 1DO4 A; 1O1I B; 1SDL B; 4MAX A; 1J41 B; 2OH9 A; 2VHB A; 1CMY B; 2H8F A; 3NMM B; 1C40 A; 1MTI A; 1ABY A; 3HF4 A; 2MB5 A; 2ZS1 D; 1MYI A; 1YHE A; 1JF4 A; 1LTW A; 2QLS A; 1MNK A; 2ZFB B; 3QJC A; 1L2K A; 1BVD A; 3W4U A; 1U7R A; 1YEU B; 2V1E A; 1YOG A; 2Z8A A; 1S5X A; 3QJE B; 5M3S A; 4NXA A; 1YDZ A; 1Y35 A; 2HZ2 A; 1IT2 A; 1MYJ A; 3GQP B; 1UFP A; 2ZSR A; 1B86 A; 3UHQ A; 1XZ4 B; 1AJ9 A; 1MZ0 A; 3GDJ A; 1CH7 A; 5C6Y A; 3KMF A; 2O5L X; 4SDH A; 3LQD B; 4IT8 A; 1XZ7 A; 1GJN A; 2ZSQ A; 2G0Z A; 1YIH A; 3UHY A; 1ECO A; 5HU6 A; 4F68 A; 3TM9 A; 2ZS1 C; 1DO7 A; 1BIJ A; 3R5I A; 3MJP B; 3G4U A; 1MLS A; 2ZLV A; 1Y5J B; 1A00 A; 2HBF B; 1Y85 A; 1HBA B; 1UVX A; 2AUO A; 1CG8 A; 1HAC B; 3WCT C; 3GKV A; 1YCA A; 4KJT A; 3H57 A; 1RQ4 B; 2VYW A; 3ZJI A; 1HJT A; 1CO8 A; 2DHB B; 4H2L B; 3VAU A; 1VXB A; 1VXG A; 3PI9 B; 2LH3 A; 3OZU A; 1YEN B; 6HBW A; 2D2M A; 2GTL B; 1DTM A; 2ZSO A; 1SPE A; 1YVT B; 2V1K A; 3PT8 B; 3HEN A; 2FAL A; 1PBX A; 1A6M A; 1O1P A; 5EQM A; 2MGG A; 3TLD A; 3UGZ A; 1DKE B; 1HGC B; 1JPB A; 2VYZ A; 4ZVB A; 2DC3 A; 2ZT4 A; 5JDO E; 110M A; 3PI8 A; 2R80 A; 1CH4 A; 1Y0D B; 5JGG A; 1KFR A; 2YRS B; 1LFV B; 1RVW A; 1HDS A; 1G09 B; 1XZ5 A; 1COH B; 5C6E A; 1DO3 A; 1J7W B; 2MYD A; 2NRM A; 3PEL B; 1FDH G; 1WVP A; 1Z8U B; 3D7O B; 2BWH A; 1RTX A; 1NGK A; 1QXE B; 1RTE A; 1UIW A; 2AV3 A; 3IC0 A; 3KUN A; 1HAB B; 3OO4 B; 1WLA A; 1J3Z A; 1Y01 B; 1Y8K B; 1V4U A; 1J52 A; 3WCT B; 3WFX A; 2R4X A; 1Y7G B; 1F65 A; 1GZX B; 3LB3 A; 2NSS A; 3DUT A; 1LFY B; 2XYK A; 3MJU A; 1CH5 A; 1BZZ A; 1DWR A; 1JEB B; 3AQ6 A; 1LFT A; 3HHB B; 5EUI B; 3UHG A; 3GK9 A; 1CH2 A; 1A6G A; 1CH1 A; 2GRZ A; 1LH7 A; 2VEE A; 1G9V A; 3P5Q A; 2E2Y A; 4N7P A; 2VLZ A; 1M6M A; 3S1I A; 4MPM A; 1DUO A; 3BCQ B; 3HYU A; 1MWB A; 1Y4V A; 3OK5 A; 1K1K A; 1VXE A; 5IKS A; 3QQQ A; 1FSX B; 3UHU A; 2MGE A; 1BZ0 A; 1G08 B; 3FS4 B; 1QPW A; 2MYC A; 3UHD A; 5SW7 A; 1G0A A; 2OIF A; 4HRR B; 1XYE A; 3D1K B; 1JY7 A; 3WCV A; 1NIH B; 3G4W A; 3O89 A; 1XY0 A; 1HBB B; 2IN4 A; 3NL7 B; 1YZI A; 2DN2 B; 1KD2 B; 3PI4 A; 5CHQ A; 2MBW A; 1THB B; 2BW9 M; 2QSS B; 5ILP A; 1DXT B; 5E6E A; 1Y45 B; 1A4F B; 3A0G A; 4ODC A; 1URY A; 1W92 A; 4WJG 1; 2GL3 A; 3ZH0 A; 3GOU B; 1DUK A; 1GLI B; 3EOK A; 1GBU A; 1YHU A; 3UHS A; 3LB2 A; 4FWZ A; 3WR1 B; 2LH1 A; 1Y4P A; 1Y7Z B; 1Y0A A; 1HDB A; 102M A; 3GQG A; 1QXD B; 1JZM A; 3A9M A; 5KKK A; 2V1H A; 3ED9 A; 1BBB A; 2DN1 A; 3UBC A; 5HAV A; 3ZJH A; 1Y5K B; 3CY5 B; 2G0R A; 5E83 A; 2PGH A; 1DXU A; 1SDK B; 1YMB A; 2B7H B; 2W72 C; 4F6G A; 1A3N B; 1O1O B; 4XS0 A; 1O16 A; 1QSH B; 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1YEV B; 1YEQ A; 3IA3 B; 1IDR A; 1Y4F A; 4M4B B; 2W31 A; 2AUR A; 4X0L A; 3UHI A; 3D17 A; 4O4T A; 3A59 B; 4F6D A; 2GTL D; 2VYY A; 1MOA A; 1SI4 A; 2W6V A; 1WMU A; 2AV0 A; 2ZS0 A; 1HCO A; 4L2M A; 3D1A B; 1HBI A; 1M9P A; 3WCW A; 1VXA A; 3MVC A; 1ABW B; 1AJG A; 4M4A A; 3FH9 B; 3WCU A; 4YU4 A; 1NAZ A; 5AZQ A; 1FHJ A; 1K0Y B; 1S61 A; 1YFF B; 1MKO B; 1J7S A; 1LFZ B; 4MQI B; 1MLJ A; 2AUP A; 5CN8 A; 3UH6 A; 2H8F B; 3G52 A; 1YH9 A; 3LHB A; 1C40 B; 3S65 A; 3TM3 A; 1JF3 A; 1O1I A; 101M A; 1A0Z B; 1SDL A; 1YHE B; 3QJC B; 2QLS B; 4AVD A; 2GTL C; 1OFJ A; 1DM1 A; 1NZ5 A; 2D2M C; 1CMY A; 1MOB A; 3GYS B; 5B84 A; 1LHT A; 3UHH A; 2LH5 A; 1MWD A; 1NZ3 A; 1Y35 B; 3WCT D; 1O1J B; 2LHB A; 1S69 A; 3U3E A; 3D4X B; 3S66 B; 1Q1F A; 2VLY A; 5ILM A; 3QJE A; 1JP8 A; 1S5Y B; 1JDO A; 1NZ4 A; 1O1M B; 1MYT A; 1BZR A; 1PMB A; 2R4Z A; 3B75 A; 2VEB A; 2EF2 A; 1F63 A; 2O5T X; 1UX8 A; 3HRW B; 1FN3 A; 3GQP A; 1XZ7 B; 3RGK A; 5MBA A; 2D60 A; 4F4O A; 1XZ4 A; 2XKH A; 2GLN A; 3WTG B; 1YIE B; 3LQD A; 1Y8H B; 1V07 A; 3KUO A; 2QFN A; 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