4N9RA

X-ray structure of the complex between hen egg white lysozyme and pentacholrocarbonyliridate(iii) (1 day)
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Interaction between proteins and Ir based CO releasing molecules: mechanism of adduct formation and CO release.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4n9rA00
1GXV2 1V7TA 4LYMA 5D5CA 2F30A 4ET8A 1TBYA 1QTKA 5KXTA 4HV1A 3IJUA 153LA 5KXOA 4DD1A 1F10A 3ZVQB 1B7LA 4MR1A 1XEJA 2FBBA 1GBSA 4LYCA 5F9XA 4YEMA 4NHQA 4GCEA 4C3WA 1GPQC 1IP1A 2D91A 5I4YA 5KXXA 1YL0X 2BQMA 1LZYA 4LT0A 1JUGA 4ETBA 1IC7Y 4CFOA 3A67Y 3CT1A 2LZTA 4LT1A 4W96A 1HC0A 1C45A 1BWHA 4OOOA 5DLAA 5KXSA 4WM5A 4DWXA 193LA 3RZ4A 2EQLA 1YROA 1IIZA 2W1XA 3P66A 4UWNA 4WL7A 1JWRA 4GN3A 1YAPA 3WH1A 1B5WA 1JHLA 4OOTA 3TXFA 2CJLA 4G9SA 1CKFA 2PC2A 1OUEA 4WLXA 1LMNA 4PJ2C 4IASA 3W6AA 1KXXA 1IORA 1JSFA 2MEFA 3A3RX 2DQGY 4NWEA 1UICA 1HSWA 4BAPA 2B5ZA 3WYHA 4HTQA 2C8PA 4ETCA 1OUGA 3P65A 5AMYA 1NBYC 4H9CA 4NFVA 4R0FA 1LSEA 1GBZA 1XGPC 3TXBA 1KXWA 1GXXA 1CKHA 2BQDA 1EQ4A 1LSGA 1LZRA 1B2KA 1LZGA 4WM6A 4NHSA 4OWCA 1GFUA 1LSPA 2BQIA 1IP6A 1DI4A 1LHMA 1NQIA 3TMWA 3W6FA 1UIDA 3AGHA 1OQMA 3LYTA 1B7RA 4R6CA 5I5QA 1B5VA 1BB3A 3T6UA 3ATNA 1LSAA 2CDSA 208LA 4WG7A 4J1BA 1QSAA 3A95A 1LZ5A 2ZIKA 4YF2A 1C43A 1UIBA 4HJYA 4HTNA 154LA 1FBIX 1G7HC 4Z41A 1GF6A 1O23A 5DN5A 4TTDA 1LZBA 4GCCA 1LJJA 3RU5A 4CGEA 1JJ1A 5E4PA 4LYBA 3ZVQA 1LKRA 1GB6A 1YKYX 1NMMA 2F2NA 1TEWA 4ML7A 1EQEA 3CSZA 4G4CA 1OUBA 3A91A 4UWVA 4E3UA 1OUHA 3FE0A 3TXGA 4CFPA 4DDBA 1LYZA 5FHWA 1HENA 4RW2A 2MEEA 4CJ2A 4L41A 3P68A 3TMUA 4WM3A 4LYTA 1TCYA 3HBHA 4WO6A 4NSJA 1GF7A 2F4AA 4OW1A 3IWRA 1UIAA 2EIZC 1LZ9A 3J6KA 3LHMA 4N0JA 4WM1A 5JENB 1QIOA 1IY3A 1LMCA 1WQNA 4PRQA 1CJ9A 4ZEEA 1QQYA 1YKZX 2G4NA 2MEHA 3J4GA 5T3FA 1LCNA 1YAOA 1GD6A 1GEVA 1EQ5A 5II3A 1WTNA 1HELA 4N1CC 1CKGA 2VB1A 1LJIA 5LVHA 1IOTA 3AZ6A 1IWUA 1JISA 2YBIA 3W6BA 3A94A 1DPXA 4ET9A 1IR8A 1LSZA 1GBYA 1JPOA 1C08C 2ZNWY 3HFMY 1HMLA 1LAAA 4GN4A 1P2CC 4NY5A 1B5UA 4P2EA 4NGWA 1B7SA 1UA6Y 2G4QA 1G7IC 2W1MA 1HSXA 1FLQA 3CQLA 4TUNA 1JSEA 3D3DA 2YBMA 4H91A 2BPUA 3ZEKA 2FYCA 1LPIA 1XGUC 4DD0A 1BWIA 2W1YA 3GXRA 5C6IA 4KPMA 1IWWA 1BVXA 1NHEA 3CSQA 2YSSC 3WVXA 4NWHA 5FELA 1GAZA 2D4IA 1YKXX 1DI3A 4D9ZA 4H9EA 1I20A 4KL7A 3TXIA 133LA 3B6LA 4C5FA 4OWBA 4YM8A 1ALCA 2YBJA 1IOQA 3BKHA 4GLVA 4G4BA 1EL1A 1W6ZA 2BQCA 1H6MA 4N9RA 5KXYA 3A90A 2NWDX 5LA5A 2I6ZA 3MGWA 2N5ZA 4HSFA 1GFJA 4QEQA 1XGTC 5FSTA 1FLUA 4DT3A 4NSHA 1LJKA 4RDSA 4O34A 1H87A 1I1ZA 1CJ7A 1ZVYB 1FDLY 4Z3MA 1LZSA 5DN4A 4KT3A 4XJHA 3WU9A 4ETDA 5IHGA 2I26L 2BQOA 1GFGA 5LAGA 1GB3A 2DBTA 3RT5X 4LGKA 1IR7A 1INUA 1WQOA 1CKCA 2ZNXY 1B9OA 2FBDA 3AZ7A 1VDQA 3AW6A 4WG1A 1LJNA 1HEQA 1CNSA 1HMKA 2IHLA 2I25L 4H94A 3WU7A 5C6LA 1AKIA 4ZIXA 4H9AA 3D9AC 1IP7A 5LYTA 5LINA 1D0LA 1GB5A 1B7MA 3RNXA 1RJCB 4OWAA 1ZVHL 2HUBA 2MEDA 1JJ0A 1HHLA 4H9FA 4NGZA 3FI7A 3WPJA 2LHMA 1GB8A 1JIYA 1LHLA 4WLTA 1VFBC 2BAAA 1XGRC 4H90A 5HMJA 1BWJA 4DD7A 4NGOA 2X0AA 1LSBA 4H8YA 2G4PA 1B5ZA 6LYTA 5LA8A 2AUBA 4H93A 4WLYA 1W08A 4BADA 1LZAA 4WO9A 1REXA 5LYZA 1YANA 4J7VA 1GF0A 5IDDA 1REZA 4XJIA 1HFYA 5KKJA 4H8XA 1IOSA 2XJWA 3KAMA 1D6QA 134LA 1HF4A 1JTPL 3WUNA 4NGYA 1BB7A 2XBSA 3TXKA 1KIRC 2DQDY 9LYZA 2CWIA 2A7FA 2FYDA 1HFXA 4LFXA 4PGJB 5F9UA 2BQFA 4XENA 4CHXA 1KXYA 3WUAA 4GCBA 1VDPA 1BB4A 5LVKA 1PZYA 1GFHA 1IWVA 4H9BA 4XN6A 1V7SA 2Z37A 3RW8A 1LTMA 2D4KA 3GXKA 1XEIA 3AZ5A 4HTKA 3W3EA 3B72A 1LZNA 2XBRA 2ZQ3A 2EPEA 1KIPC 2ZYCA 3WMKA 1LOZA 2Y8PA 132LA 3EXDA 5B1FA 1J1OY 4LYOA 1LJ3A 1GE3A 4GN5C 2Z19A 1VDTA 4PPOA 3LZ2A 1OUFA 1N4FA 4NEBA 2HEFA 3A96A 1OUJA 1DZBX 3CB7A 1WQPA 3G3BB 4BS7A 1XGQC 5FCPA 1RCMA 5F14A 1LZ1A 1A4VA 5D5FA 2Z18A 1XFPL 1LMTA 3SP3A 4FDYA 1B0DA 1FLWA 2A7DA 2BQNA 2H9JA 3LYOA 1B7PA 3AYQA 3WW5A 4XADA 4HPEA 5L3HA 3WU8A 1LZ8A 1FLYA 1GHLA 2DQJY 4NGLA 3N9CA 3TMVA 4XJDA 3WPLA 1A2YC 1JKCA 3OK0A 1VDSA 4H9IA 4WM2A 1IP5A 1ZMYL 3LYMA 1G7MC 1LHHA 2F4GA 3B0IA 1AT6A 4WOAA 2YVBA 3AB6A 1VAUA 3WW6A 5F81A 4LT3A 1LHIA 1RE2A 4WMGA 3WXTA 1BB5A 3TXDA 4KXIA 1QDTA 4NHPA 1GBWA 5B07A 1AZFA 1GF4A 4J0LA 4A7DA 1LSCA 3IJVA 4BAFA 1GE0A 1SLYA 4NG1A 2BQJA 1TAYA 5DM9A 5KY1A 1HEMA 1KIQC 1J1PY 5KJ9A 3F6ZA 1OUCA 4M4OA 2DQIY 2H9KA 4WLDA 1YIKA 5B06A 2ZYPA 1GEZA 1IO5A 2HU1A 1IX0A 2XTHA 1LZ6A 1LHKA 1GDXA 1SQ2L 2ZQ4A 4I0CA 2Z38A 4DD9A 1VATA 2ZIJA 3WVYA 1BB6A 4MSTA 2RSCA 5IELA 5KXMA 4MCKA 1XEKA 4OWEA 4NGVA 3OJPA 2DQFC 194LA 4HP0A 5K7OA 5F16A 2HU3A 3WL2A 4NGKA 2YBHA 1D6PA 4NGIA 4WM4A 1GAYA 4TWSA 3HBEX 2CGIA 1HERA 2Q0MX 3LN2A 4H92A 4DD2A 1VEDA 1IWZA 2YBLA 2YDGA 4G4HA 1LSFA 1BHZA 4J1AA 3HBDA 4EMNA 5A3ZA 2Z2FA 5I53A 4QGZA 1JJ3A 1GF3A 1JITA 4Z98A 1GDWA 1DKKA 1WVUA 4IJ4A 4DC4A 1B7QA 1BQLY 1F0WA 3A8ZA 5KXWA 1REMA 1GFAA 2IFFY 3A92A 3AJNA 3W6DA 5ILFA 1E8LA 1UIFA 1JTTL 1F6RA 2C8OA 2HEBA 4H9HA 4HJVA 1QUTA 4N5RA 1B5YA 5B05A 2DQHY 1UC0A 1LHJA 1RI8B 4PRUA 1UUZC 1FKQA 3AGGG 4ZFPA 1WTMA 5HNLA 3T36A 4XJFA 4Z46A 2DQEY 1UACY 1YAQA 1YQVY 1WVVA 1OUDA 4YEOA 3W6CA 4B4JA 5ILCA 1HFZA 2W1LA 1C46A 3VWOA 1T3PA 2HEAA 1NWGA 5B1GA 1REYA 1FKVA 4G49A 1AM7A 3ULRA 7LYZA 1CJ6A 5KXLA 1GF8A 1QUSA 1LSNA 4DDCA 3P64A 2ZILA 3QE8A 1YL1X 1LKSA 4NSIA 4XJBA 1D9UA 5FEKA 2HEEA 4NSGA 2YBNA 4NGJA 4B49A 1B7NA 1JKAA 3A6CY 3EBAB 4TSBA 5APDA 4YENA 1DKJA 4ETEA 3AGIA 1NDMC 2MEGA 5APFA 4AGAA 1CJ8A 1LMPA 4QDNA 5LIOA 1IC5Y 1IP4A 1T6VL 4W94A 4XJGA 1LYOA 3AZ4A 1JEFA 5HQ1A 4LZTA 1UIEA 1QSWA 4B1AA 4OWHA 4TX7A 5LVGA 1UCOA 2Z12A 3G3AB 1GB0A 4H8ZA 3N9EA 4B0DA 4HPIA 1NBZC 1HEPA 3TXJA 135LA 4N1EI 1IWTA 1GF5A 1IC4Y 2WARA 5LVJA 2D6BA 1UBZA 4FJRA 1DXJA 1GBXA 4XYYA 1F6SA 5E9RA 3CSRA 2MECA 2LZ2A 3EMSA 3N9AA 1TDYA 2BQEA 1B5XA 3BKVA 1LZDA 1NF5A 1IOCA 3M18B 1GE4A 4II8A 3TMXA 3WULA 1LSDA 2BQGA 1C7PA 4YOPA 1GBOA 1GB2A 3TXHA 4NIJA 4WL6A 4LT2A 5FDJA 3TXEA 1LJFA 1NKHA 4DDAA 5APEA 1GFVA 6LYZA 1GFEA 1GWDA 1OUIA 1IP2A 3A3QA 2BLXA 1PS5A 3ATOA 1LMQA 5KXNA 3B0OA 2MEIA 1B7OA 5KXRA 1UIGA 1YAMA 3WPKA 5HMVA 1D0KA 1IP3A 5I4XA 2DKVA 4U3XB 1JKBA 4IATA 2BLYA 2Z39A 4NHIA 8LYZA 2GV0A 1WQMA 4EOFA 1LJEA 1LZTA 2HEDA 2BQLA 5M1YA 2D4JA 3A6BY 1MLCE 1LJ4A 2MEBA 5LVIA 1CKDA 5DL9A 2H5ZA 1OUAA 4NHTA 3CT0A 3QY4A 1G7LC 1IWYA 5I54A 4PHIA 4GLAA 1ZV5L 4TSCA 1LSMA 1LZ4A 5EBHA 1LZEA 1DQJC 1GE1A 1UIHA 1GFRA 1WQQA 5KXKA 3A34A 5HLLA 1YILA 5APCA 5LYMA 4N8ZA 1LYSA 5C6JA 2DQCY 1Z55A 1GF9A 3QNGA 5L3IA 4UWUA 1D0MA 1LJGA 3AW7A 1IWXA 1QTEA 5KKIA 4ANRA 5B59A 1GB9A 4GCFA 3CT5A 1XSFA 2LYMA 1IR9A 4LYZA 5HNCA 2BQHA 1BGIA 5LXWA 4NG8A 3A93A 3K3TA 1DPWA 4GCDA 1LMOA 1HNLA 1LYYA 4QY9A 1LZCA 5I4WA 2MEAA 1LJHA 3E3DA 1BVKC 1G7JC 1JTOL 1NDGC 4HJZA 2DQAA 207LA 4B4IA 3WXUA 2HTXA 3EO5A 1IVMA 1RFPA 1WQRA 2EKSC 1IEEA 5LAFA 1MELL 3P4ZA 3LYZA 3WUMA 1OP9B 3B0KA 4DD3A 4M6DA 5A3EA 1GB7A 1IY4A 5KXZA 1FN5A 5L9JA 2LYZA 1I56A 5J7CA 3M3UA 1JKDA 4RW1A 4HV2A 1QDRA 1C10A 1AT5A 4B4EA 4ETAA 4X3BA 2ZWBA 1GFKA 1GE2A 4H1PA 4DYGA 1HEWA 5KXPA 4RLMA 1HEOA 4AXTA 2BQAA 2HECA 4RLNA 1J1XY 4LFPA 3W6EA 2Z2EA 1DI5A 2LYOA 1LSYA 4I8SA 3LZTA 2BQBA 1GFTA 2BQKA 1LMAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QTKA 4HV1A 1C66A 153LA 3LZMA 3CDRA 1L49A 3ZVQB 5F9XA 1GBSA 2QARC 1L37A 114LA 5I4YA 4DQJA 4ARMB 198LA 2BQMA 1JUGA 1HC0A 5KXSA 4WM5A 3RZ4A 181LA 2W1XA 3P66A 189LA 157LA 1TLAA 1LMNA 3W6AA 1IORA 4NWEA 1UICA 4BAPA 2B5ZA 3WYHA 146LA 2F2QA 4R0FA 4W53A 1LSEA 1XGPC 3TXBA 1KXWA 1B2KA 1L15A 4EJ4A 2BQIA 1B7RA 1LSAA 1G1VA 4J1BA 4AQNA 1C6JA 3SB8A 1UIBA 4HJYA 3NY8A 1LJJA 1JJ1A 1LKRA 1YKYX 2F2NA 3G3VA 1L54A 1OUBA 4I7QA 1LYZA 1L45A 3P68A 3TMUA 2B75A 4WM3A 4WO6A 1TCYA 258LA 2EIZC 3J6KA 1CU0A 1IY3A 1LMCA 4PRQA 1YKZX 5T3FA 3J4GA 1LCNA 1OWZA 1C6LA 1EQ5A 4N1CC 1CKGA 2VB1A 5LVHA 235LA 1JISA 3W6BA 1L34A 205LA 3HFMY 4TWSA 1P2CC 1B5UA 1QSQA 1HSXA 1FLQA 4TUNA 1JSEA 1P2RA 3D3DA 1CUQA 245LA 1QT4A 3DNAA 1QUGA 233LA 1BWIA 2Z6BA 1CV5A 3WVXA 4NWHA 4K5YA 5FELA 2D4IA 1LYIA 4D9ZA 4KL7A 187LA 2NTGA 3BKHA 1L14A 180LA 1EL1A 1W6ZA 2BQCA 1C69A 4HSFA 5FSTA 1XGTC 4DT3A 1LJKA 1H87A 3G3WA 1LZSA 113LA 2I26L 128LA 1DYDA 1CKCA 3K2RA 1JQUA 3D9AC 1D0LA 1GB5A 1L80A 151LA 4OWAA 3DN3A 2LHMA 1JIYA 1LHLA 111LA 2BAAA 4DD7A 218LA 2X0AA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GXV 2;  1V7T A;  4LYM A;  5D5C A;  2F30 A;  4ET8 A;  1TBY A;  1QTK A;  5KXT A;  4HV1 A;  3IJU A;  153L A;  5KXO A;  4DD1 A;  1F10 A;  3ZVQ B;  1B7L A;  4MR1 A;  1XEJ A;  2FBB A;  1GBS A;  4LYC A;  5F9X A;  4YEM A;  4NHQ A;  4GCE A;  4C3W A;  1GPQ C;  1IP1 A;  2D91 A;  5I4Y A;  5KXX A;  1YL0 X;  2BQM A;  1LZY A;  4LT0 A;  1JUG A;  4ETB A;  1IC7 Y;  4CFO A;  3A67 Y;  3CT1 A;  2LZT A;  4LT1 A;  4W96 A;  1HC0 A;  1C45 A;  1BWH A;  4OOO A;  5DLA A;  5KXS A;  4WM5 A;  4DWX A;  193L A;  3RZ4 A;  2EQL A;  1YRO A;  1IIZ A;  2W1X A;  3P66 A;  4UWN A;  4WL7 A;  1JWR A;  4GN3 A;  1YAP A;  3WH1 A;  1B5W A;  1JHL A;  4OOT A;  3TXF A;  2CJL A;  4G9S A;  1CKF A;  2PC2 A;  1OUE A;  4WLX A;  1LMN A;  4PJ2 C;  4IAS A;  3W6A A;  1KXX A;  1IOR A;  1JSF A;  2MEF A;  3A3R X;  2DQG Y;  4NWE A;  1UIC A;  1HSW A;  4BAP A;  2B5Z A;  3WYH A;  4HTQ A;  2C8P A;  4ETC A;  1OUG A;  3P65 A;  5AMY A;  1NBY C;  4H9C A;  4NFV A;  4R0F A;  1LSE A;  1GBZ A;  1XGP C;  3TXB A;  1KXW A;  1GXX A;  1CKH A;  2BQD A;  1EQ4 A;  1LSG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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