4N9RA

X-ray structure of the complex between hen egg white lysozyme and pentacholrocarbonyliridate(iii) (1 day)
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Interaction between proteins and Ir based CO releasing molecules: mechanism of adduct formation and CO release.
pubmed doi rcsb
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4n9rA00
1BGIA 5A3ZA 1LYOA 5FDJA 1QSWA 5KXZA 3MGWA 4ETAA 1DI4A 2CGIA 4H90A 1NHEA 4NSGA 4PRQA 5FCPA 3LZTA 3A3RX 1DPWA 1HNLA 1P2CC 1WQOA 3P66A 1IP4A 2RSCA 2Q0MX 2BQBA 1LZ1A 1NDGC 4I8SA 1GPQC 3WW6A 1JEFA 1GBYA 4DD3A 1GFUA 1XGRC 1OUAA 1J1PY 1LHIA 193LA 2ZIJA 2DQGY 1B5UA 2LZTA 1E8LA 5HNLA 1TCYA 4B49A 4H9AA 1LCNA 1WTNA 4IJ4A 4HJVA 2YBNA 1GAZA 3P64A 3D3DA 1IP5A 3AZ5A 1GB0A 5K7OA 2ZYCA 4ETBA 5E4PA 3B0IA 3CT1A 1LMAA 2X0AA 4TWSA 4J0LA 3WPLA 4PGJB 4DD9A 1IP2A 4NIJA 1IOQA 5AMYA 1IWYA 1LSPA 1DXJA 2BQEA 3A34A 4NEBA 1HENA 2C8OA 5I53A 5LA8A 5JENB 4H9BA 1HFYA 4GCFA 1LJ4A 4LZTA 3AJNA 1F6SA 2D4KA 2YBLA 3P65A 2Z39A 4LYMA 2Y8PA 3WPKA 2CWIA 4HTNA 2DQAA 1FLUA 1VDPA 2D91A 1DPXA 4O34A 4DYGA 5LYZA 5DL9A 1B7OA 5KXPA 1YANA 1TDYA 208LA 4RDSA 1AZFA 1B9OA 1QQYA 1QUTA 2ZNXY 1G7LC 1J1OY 2XTHA 1CKDA 2Z2EA 1GBOA 3TXEA 2NWDX 2ZILA 3A6BY 2W1YA 3WU7A 4NSJA 1UIEA 3OJPA 1GFTA 1WQRA 3ULRA 3WVYA 2H5ZA 2I6ZA 3TXGA 5I54A 4OOOA 1IWUA 2FBDA 3CSQA 2YBHA 3G3AB 4OOTA 1B5WA 3TXHA 1XEIA 4ETCA 1ALCA 3EMSA 1HMKA 1YKZX 3M3UA 3WU8A 7LYZA 1DI5A 2MEAA 3W6EA 1REXA 1VFBC 4QEQA 3KAMA 1YROA 1RI8B 4NWHA 1SLYA 1HERA 3LYMA 4NGZA 3HBDA 2BLYA 4HSFA 4AGAA 1GF7A 1GDWA 1UBZA 3LYTA 1WTMA 3A3QA 4HP0A 1QIOA 1ZVYB 2G4PA 2YBJA 4DDCA 4NGIA 3W6BA 1LJEA 1LZ6A 1RE2A 1WQNA 1CJ8A 3RW8A 1LZ5A 3AZ7A 2XBRA 2VB1A 4BAPA 2EQLA 4RW1A 3W6CA 1JJ1A 5KXLA 2HEAA 1LJIA 4GN4A 1YIKA 4NG1A 4NWEA 3W3EA 4WLTA 2LYMA 4MCKA 1JUGA 2XJWA 1UUZC 4WLDA 1LZDA 2I26L 4A7DA 1LZ4A 2ZIKA 5C6IA 1UA6Y 2WARA 2ZQ4A 4H9CA 1OUFA 4WO9A 1NKHA 4NGLA 1MELL 1JKAA 2F4GA 4H8ZA 1LHLA 4WOAA 4FDYA 3CSRA 2BQIA 1LMOA 1SQ2L 1LZ9A 1OUEA 1YAMA 4G9SA 3K3TA 1KIQC 1LSDA 5I4WA 4ML7A 1LZBA 3TMUA 1JKDA 1DZBX 1GB2A 1W08A 1I20A 1W6ZA 3AGGG 5B1FA 4M6DA 3GXRA 4NY5A 1REMA 3G3BB 3IJUA 1GFEA 5L9JA 3WMKA 1LMTA 2EIZC 3HFMY 1IY3A 2BQGA 3TXFA 4H9HA 5LINA 1IP3A 135LA 3A91A 4ETDA 1HSWA 5I4YA 2MECA 1C45A 4YOPA 5F9UA 4GLVA 3WUNA 4GN5C 1HEPA 4CGEA 3A93A 1LYZA 1HEWA 3SP3A 5APFA 1GFKA 1I56A 1HFXA 3AZ6A 4Z41A 1PZYA 1GB5A 3ATNA 4W94A 2F2NA 3A6CY 1JWRA 1LJGA 5KXXA 1HEQA 3TMWA 5LYTA 3BKVA 5HLLA 2DQEY 4N1EI 5T3FA 4BS7A 4B4JA 5ILFA 4Z46A 2HEBA 4KPMA 4QY9A 1BB4A 1C46A 3AYQA 1LAAA 2HEEA 3FE0A 4WL6A 2ZNWY 4HTQA 3FI7A 2I25L 5LVKA 1OP9B 153LA 4XADA 1RFPA 4MR1A 5J7CA 4E3UA 5KXNA 3N9AA 2BQKA 2DQJY 4GCEA 4QDNA 4LT1A 5B1GA 4GLAA 4OW1A 1B2KA 4H9EA 3TMXA 1XFPL 2MEBA 5B06A 3IJVA 2YBMA 4LT2A 4TTDA 3M18B 1JSFA 4LYTA 1IORA 1F6RA 1NMMA 1NQIA 1UIHA 2F4AA 5KXYA 5C6JA 1JHLA 1IP1A 1FN5A 3AGHA 2HU1A 2HEFA 5LXWA 4HJZA 4N5RA 1HELA 4XJFA 5DLAA 1EQ4A 1JSEA 4NGYA 4HPEA 5C6LA 4OWAA 2EKSC 4NHIA 1GF5A 4OWCA 3WU9A 1GF8A 1ZMYL 2D4IA 1LJJA 3RZ4A 1N4FA 4KL7A 3ZVQB 2A7FA 1XGQC 1XGUC 4YEOA 1GFRA 1LSMA 1OUBA 1GE0A 4TX7A 4OWHA 4WM3A 1KXYA 2MEGA 1OUDA 1IWZA 1YL1X 1GB7A 6LYZA 4H91A 4ZFPA 5I4XA 5KXOA 1B7SA 2IHLA 1QTKA 4ET9A 3IWRA 4J1AA 1GDXA 1LZSA 1VDTA 4RLNA 1YILA 3CT5A 1JTTL 1IO5A 1QDRA 1INUA 1JJ3A 1YAPA 2HU3A 1OUHA 2MEDA 1LKRA 1WQPA 2H9KA 4NGJA 4ZIXA 1GF6A 2LYZA 4J1BA 3WUMA 2Z2FA 2PC2A 4HV2A 4NHQA 2YBIA 3ATOA 4DDAA 2Z38A 1D6QA 1EQ5A 2ZQ3A 4TUNA 4WMGA 1VAUA 3AW6A 3A96A 1LSFA 1MLCE 2DQDY 4I0CA 5KXMA 3WULA 1UACY 5LVJA 4YEMA 5HQ1A 4NSIA 4II8A 4LFPA 1BQLY 2BQNA 1KIRC 1GXXA 1OUCA 1CKCA 1C7PA 5IDDA 1JTPL 4NHTA 3QNGA 1GE1A 1BWJA 1LYYA 4RW2A 2FYDA 1UCOA 2N5ZA 1CKGA 1H6MA 4X3BA 1GBXA 3A95A 4NGVA 132LA 1UC0A 3B72A 4DT3A 4EMNA 1LZ8A 1NBYC 3B6LA 1LSYA 194LA 2Z37A 1LSGA 2G4QA 3ZVQA 3GXKA 1D0LA 4PPOA 9LYZA 1D0MA 1IC5Y 1OUGA 2BQOA 4XJBA 4YENA 1BB6A 4N1CC 3WL2A 4WO6A 1V7SA 1JJ0A 1IVMA 4TSBA 1EQEA 2D6BA 5HMJA 1QUSA 1WQQA 3RU5A 5KXWA 5LVHA 2XBSA 2HEDA 1AT5A 3LYZA 1LZEA 133LA 4WM5A 1CKHA 4WG1A 2YDGA 1IOSA 1LHMA 1C43A 1LSEA 1BB7A 2BQAA 1IOCA 5D5CA 4XENA 1JISA 1LJHA 4GCCA 1LZCA 5APEA 2AUBA 1FDLY 2W1MA 4B4IA 1B7QA 3J4GA 1DKJA 4LT3A 3HBEX 4OWBA 3CB7A 1LMCA 3A92A 1ZV5L 2HECA 5KY1A 4PJ2C 1LZAA 1HHLA 1LJKA 2BPUA 2LZ2A 4B4EA 1IOTA 2D4JA 3HBHA 3OK0A 1CKFA 1LZNA 4HJYA 4LYZA 1F10A 4LFXA 5ILCA 2EPEA 4C3WA 4NGKA 1YAOA 5EBHA 5FEKA 1IC7Y 2BQLA 1IR8A 4QGZA 3WH1A 4D9ZA 1GE3A 207LA 4H9FA 1BVKC 1DKKA 2Z18A 1LHJA 4AXTA 5KXKA 4NGWA 1BWHA 4H9IA 2BQHA 4LYOA 2LHMA 3CSZA 4NHSA 3WPJA 5LIOA 1GF3A 1GFVA 4MSTA 5KXSA 4DD7A 4H8YA 1GWDA 4WLXA 1WQMA 1G7HC 4H94A 1GHLA 1T6VL 1GD6A 4H92A 1GB9A 1YKXX 1XEJA 5LVIA 2HTXA 4U3XB 4HV1A 4WL7A 4TSCA 3W6AA 1C10A 2BQJA 4N8ZA 5M1YA 1VATA 5KXTA 5FHWA 1QTEA 4DD1A 1GB6A 4RLMA 1F0WA 1LMQA 1B7MA 1B5VA 3TXJA 8LYZA 5B05A 3AGIA 1B5ZA 1GBSA 1JIYA 1WVVA 1LSCA 1Z55A 1IEEA 1LJ3A 5DN4A 4DD2A 4L41A 1HEMA 3TXBA 4LGKA 1NWGA 1GEZA 3P68A 4IATA 1HC0A 1GBWA 4HTKA 1GFAA 1H87A 2BQDA 3WXUA 4P2EA 1FKQA 3WXTA 1IWXA 4CFOA 5I5QA 1QSAA 1DQJC 1G7IC 2ZWBA 1RCMA 6LYTA 5KJ9A 2MEHA 1IWTA 1FKVA 4C5FA 1IWWA 1YAQA 4HPIA 4UWVA 2F30A 4WM4A 3QE8A 5D5FA 3QY4A 5B07A 5B59A 5II3A 154LA 1B5YA 2DQCY 4UWNA 4DD0A 3AZ4A 5KKJA 1BB5A 1HSXA 1UIAA 1YQVY 3A90A 3EBAB 4NSHA 2C8PA 1FLQA 4LYBA 3ZEKA 4G49A 1LSAA 3N9EA 2W1XA 4J7VA 1J1XY 5F9XA 4YM8A 2BQMA 5DN5A 4GN3A 1I1ZA 1HMLA 3A67Y 1IR7A 5KXRA 4BADA 1CJ7A 4KT3A 3P4ZA 4ETEA 5FSTA 1CNSA 3LYOA 3WUAA 3RNXA 1GEVA 4DC4A 1GE2A 1LZTA 4WG7A 1D9UA 1HEOA 2DBTA 4NFVA 3T36A 1IR9A 5APCA 5E9RA 1UIFA 5F81A 3E3DA 1LZGA 1LYSA 1UIDA 1IX0A 3EO5A 5IHGA 1LSNA 1YL0X 1AKIA 2FBBA 4DDBA 2LYOA 4NHPA 4H93A 3LN2A 4WLYA 2DKVA 5APDA 1QDTA 4ZEEA 4DWXA 2A7DA 4PRUA 1VDQA 4R6CA 1BWIA 2G4NA 3A8ZA 1AT6A 1LSZA 2HUBA 3CQLA 1B0DA 1XGPC 1IY4A 4NG8A 4Z3MA 3WVXA 1PS5A 1FLWA 2MEIA 1LJNA 3LZ2A 4ET8A 5DM9A 3TXIA 1OUJA 4XJHA 1OUIA 3BKHA 1KXWA 4BAFA 1LPIA 4XJDA 4EOFA 1TEWA 4G4HA 4XJIA 3VWOA 4IASA 1TBYA 5A3EA 1IP7A 2BQFA 4H8XA 5LAGA 1C08C 3A94A 5FELA 5L3HA 1GE4A 1JITA 1GB8A 5LAFA 1UICA 1UIBA 2H9JA 1TAYA 1YKYX 1CJ9A 1XSFA 1GF9A 4KXIA 5F16A 3CT0A 5LA5A 4N9RA 3T6UA 4B1AA 1LTMA 1LJFA 1VDSA 1OQMA 1KIPC 2MEEA 1JPOA 5HNCA 3D9AC 134LA 4N0JA 2CDSA 2GV0A 1GB3A 2DQFC 3J6KA 5L3IA 4G4CA 3AW7A 2BQCA 1BB3A 1LHHA 1NBZC 1UIGA 1B5XA 1AM7A 1IP6A 4FJRA 1IIZA 1IWVA 2BAAA 3W6FA 4CJ2A 5LYMA 4OWEA 1LHKA 1B7NA 1DI3A 4M4OA 4PHIA 1GF0A 1GF4A 4LYCA 1GFGA 4H1PA 1G7MC 4WM1A 4GCDA 1GBZA 1LSBA 3WYHA 4W96A 4NGOA 1B7PA 1A2YC 3RT5X 4LT0A 1WVUA 4XN6A 3B0OA 3N9CA 2CJLA 5IELA 1ZVHL 2BLXA 1HFZA 1JTOL 1LZYA 1REZA 4XJGA 4WM6A 1JKBA 1RJCB 1GAYA 2MEFA 4ANRA 1LOZA 4CFPA 2W1LA 1EL1A 1FLYA 5F14A 2YSSC 4WM2A 1LMPA 3W6DA 3F6ZA 3TXDA 1G7JC 3LHMA 4B0DA 1LZRA 1VEDA 4Z98A 5HMVA 1V7TA 1LMNA 3AB6A 1BVXA 4UWUA 1BHZA 3EXDA 1NDMC 1B7LA 2Z19A 1GFHA 2DQIY 2ZYPA 2DQHY 2B5ZA 2YVBA 1NF5A 1XEKA 2IFFY 4CHXA 1KXXA 4G4BA 1CJ6A 1HF4A 1O23A 5LVGA 1GFJA 4GCBA 4XYYA 1B7RA 1JKCA 3B0KA 1IC4Y 1GXV2 1LKSA 3WW5A 3TMVA 1A4VA 1FBIX 5KKIA 1T3PA 4R0FA 4YF2A 1D0KA 1XGTC 3TXKA 2Z12A 1D6PA 1REYA 2FYCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BGIA 5A3ZA 1L91A 1LYIA 1QSWA 1LWKA 3MGWA 2CGIA 1L0JA 4PRQA 3A3RX 1P2CC 1WQOA 2Q0MX 1NDGC 188LA 1JEFA 1GFUA 1XGRC 3C7YA 209LA 3AZ5A 1GB0A 1LMAA 129LA 159LA 2B75A 5JENB 4H9BA 1HFYA 1LJ4A 4LZTA 2YBLA 1L09A 3P65A 2Z39A 1L00A 1ZURA 4I7MA 4O34A 208LA 2B72A 1C6EA 2HUKA 2Z2EA 2NWDX 3WU7A 1UIEA 2CUUA 3OJPA 2RAZX 4EXMA 1G0GA 1C6IA 1IWUA 4OOOA 1ALCA 3WU8A 3C8RA 1C63A 4QEQA 1L77A 1RI8B 3HH4A 1SLYA 1QTDA 2BLYA 3DN6A 4DDCA 3A3QA 2G4PA 2YBJA 1L82A 1LJEA 1CJ8A 1CU6A 255LA 244LA 4RW1A 4GN4A 1JUGA 4A7DA 1UUZC 1C69A 213LA 1UA6Y 2F4GA 1LHLA 3HTFA 4ARJA 182LA 3CSRA 1D3JA 1LZ9A 1OUEA 236LA 141LA 4ML7A 1JKDA 1DZBX 1CTWA 5B1FA 4NY5A 1REMA 1GFEA 1QUOA 184LA 145LA 3HFMY 3TXFA 1L53A 2BQGA 5LINA 165LA 135LA 2MECA 257LA 4GN5C 3CDVA 1I56A 1HFXA 4Z41A 1C6NA 1L25A 3HUQA 3A6CY 1LJGA 1L38A 4N1EI 5T3FA 4B4JA 1OWYA 3L2XA 4KPMA 4Z46A 3AYQA 1LAAA 4HTQA 1NHBA 1OV5A 5LVKA 1OP9B 4MR1A 4E97A 4GCEA 4LT1A 5B1GA 1QS5A 4OW1A 2QARC 1C6KA 4H9EA 4YXCA 1L70A 205LA 2YBMA 3IJVA 118LA 1IORA 1F6RA 1NQIA 5C6JA 2HEFA 4HJZA 4NGYA 4OWAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1BGI A;  5A3Z A;  1LYO A;  5FDJ A;  1QSW A;  5KXZ A;  3MGW A;  4ETA A;  1DI4 A;  2CGI A;  4H90 A;  1NHE A;  4NSG A;  4PRQ A;  5FCP A;  3LZT A;  3A3R X;  1DPW A;  1HNL A;  1P2C C;  1WQO A;  3P66 A;  1IP4 A;  2RSC A;  2Q0M X;  2BQB A;  1LZ1 A;  1NDG C;  4I8S A;  1GPQ C;  3WW6 A;  1JEF A;  1GBY A;  4DD3 A;  1GFU A;  1XGR C;  1OUA A;  1J1P Y;  1LHI A;  193L A;  2ZIJ A;  2DQG Y;  1B5U A;  2LZT A;  1E8L A;  5HNL A;  1TCY A;  4B49 A;  4H9A A;  1LCN A;  1WTN A;  4IJ4 A;  4HJV A;  2YBN A;  1GAZ A;  3P64 A;  3D3D A;  1IP5 A;  3AZ5 A;  1GB0 A;  5K7O A;  2ZYC A;  4ETB A;  5E4P A;  3B0I A;  3CT1 A;  1LMA A;  2X0A A;  4TWS A;  4J0L A;  3WPL A;  4PGJ B;  4DD9 A;  1IP2 A;  4NIJ A;  1IOQ A;  5AMY A;  1IWY A;  1LSP A;  1DXJ A;  2BQE A;  3A34 A;  4NEB A;  1HEN A;  2C8O A;  5I53 A;  5LA8 A;  5JEN B;  4H9B A;  1HFY A;  4GCF A;  1LJ4 A;  4LZT A;  3AJN A;  1F6S A;  2D4K A;  2YBL A;  3P65 A;  2Z39 A;  4LYM A;  2Y8P A;  3WPK A;  2CWI A;  4HTN A;  2DQA A;  1FLU A;  1VDP A;  2D91 A;  1DPX A;  4O34 A;  4DYG A;  5LYZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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