4NAXA

Crystal structure of glutathione transferase pput_1760 from pseudomonas putida, target efi-507288, with one glutathione disulfide bound per one protein subunit
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
ELSAFPITRKWPAKHPERLQLYSLPTPNGVKVSIMLEEIGLAYEAHKVSFDNDDQLSPEFISLSANNKIPAILDPNGPGGQPLPLFESGAILQYLAEKSGQLLSQDPAQRYQTLQWLMFQMGGIGPMFGQVGFFHFFAGKEYEDKRPRDRYVNESKRLLGVLDRHLKGRQWMAEEYSIADIAIFPWVRNLVERYNARDLVGFDQFKEVQRVLANFLERPAVQHGLKIPGAENLYFQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of glutathione transferase Pput_1760 from Pseudomonas putida, target EFI-507288
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase, N-terminal domain protein
molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas putida
total genus 86
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4naxA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4naxA01
4BVYB 2QSIA 5AISA 1XFLA 1KBNA 4WEYA 4YAVA 3M3MA 3IA1A 4N10A 2H0IA 1OC3A 1GTAA 3WT1A 8GSSA 1OC9A 3G7YA 2B1KA 4AF2A 4EXJA 4J57E 4ZBAA 5B8AA 2I3YA 4G0KA 4POBA 2V6KA 2H75A 3G9BA 4H86A 5B8BA 1SKRB 4MP4A 1YF0A 1ERVA 2GVPA 4PTSA 4TOPA 3MAKA 3VLNA 3HYPA 3EMXA 4KAEA 3LXTA 3KGKA 5GSSA 2FCHA 1NHOA 2OADA 4NV5A 4MJCA 1WWJA 3QAWA 1DUGA 1X9SB 2H73A 2JACA 4F82A 5IM9A 5CRHA 4EE0A 3IBHA 4KSOA 4ZXGA 1XWGA 2X8CA 1VF1A 3IR4A 1ML6A 5ECIB 3NOFA 3ZYWA 4N0ZA 5FT3A 1W89A 4GRFA 4JBBA 3A5WA 4DSQA 5JCUA 3C71A 2R6KA 4KX4A 2VLVA 2VOCA 3UIWA 2BMXA 4HI7A 1SYXA 3E9JB 3WYWA 2V32A 4I6XA 4ZBDA 4YQUA 1GSFA 1VGLA 4WBJA 3N5OA 3DMLA 1ST9A 5KN2A 4F9ZA 2YV9A 2MMAA 1G7EA 3KXOA 5J5NA 4IQ1A 2GZZA 3GHAA 4WXTA 1G0TA 1EV4A 1XWCA 5LD0A 2WRTA 4HJMA 5IMFA 1OVNA 1SENA 2HYXA 1XCCA 1NM3A 2YCDA 1B8XA 3M9JA 3CTFA 1A24A 2FD3A 14GSA 4BVYA 1QQ2A 4QL7A 1PKZA 3N9JA 2WB9A 5IPGA 2C4JA 1GSSA 3I43A 4K9ZA 3IAM2 3LFLA 5F8BA 3M9KA 1A2LA 3I6AA 3KH9A 4ID0A 2VCWA 1DBYA 3IK7A 4OCFA 3FYGA 4I8BA 18GSA 5HFGA 1Z6MA 4KSMA 1B4PA 4WETA 5GSTA 5A4VA 3CRUA 1O7UA 1GSEA 4MZWA 2C0GA 2HE3A 2LS5A 2RM5A 4G0IA 4G0LA 3ISOA 3TRQA 2LJAA 3UARA 3C73A 2C3QA 2MMOA 2V1MA 2HSHA 3F63A 1AQVA 2X64A 4J56E 1OE8A 1PQNA 5A4WA 2VCZA 1SYRA 1TRWA 3WD6A 2ZNMA 2UZ8A 1BEDA 2VL2C 2XPEA 3DKSA 3ZLPA 4HU9A 3PR8A 5ECOB 4K7NA 1ABAA 1NSWA 4K0NA 5DQYA 5GAPD 4IVFA 2DIYA 4IN0A 4PX1A 4L0WA 4NXIA 4IGJA 3CXGA 5CRGA 3TJGA 2AB6A 2HRAA 1OKTA 3CSIA 1JZRA 1ON4A 1K3LA 4OO4A 2M72A 4MZBA 1U87A 1PKWA 5DVBA 5ECRB 2KP1A 7GSSA 2GSQA 1THOA 4WF4A 3DD3A 3UJ1A 4DSRA 1K3YA 1K0AA 1LBKA 1VF3A 4MDCA 4MA9A 3LG6A 1GWCA 4KCEA 4E8HA 1MEKA 1FAAA 4TR0A 4KB3A 4JU5A 2V41A 4ZBBA 2CA8A 3F0IA 4PGTA 2EC4A 5JCWA 2B1LA 3GH9A 2JL4A 4WKWA 4HQSA 4IP1A 5IMDA 2IMKA 4ZIJA 4YAPA 3HD5A 1V98A 5D96A 5G5FA 3H8QA 2BTOT 1X9WB 2IN3A 3F4TA 3FR6A 2MMNA 5IPHA 5DALB 3F3QA 1XZOA 4PURA 2WDUA 5IMZA 4I97A 2ON5A 3ZVJA 2ZCTA 2NVLA 4E8EA 2K9FA 4N30A 3VURA 3GL5A 4WBRD 3CYNA 1NW2A 2AYTA 2WZ9A 4ZL8A 4KGIA 1RW1A 2ALBA 4KDXA 4WR5A 5L71A 2C8UA 3LWAA 4AJ8A 3P8WA 3KMOA 3GKNA 5CO3A 1I9DA 4GSTA 3FKFA 4PNFA 2FGXA 1EWXA 5F07A 3CTGA 5CNWA 2VD1A 3R3EA 3EC3A 1BQ7A 2L4QA 2LJRA 4HS1A 4XIHA 2AUVA 5DCHA 4F03A 3GSTA 3UAPA 2V2GA 2C3NA 5C04A 2FA4A 3HDCA 1U6TA 5IMVA 3APSA 1IYHA 5G30A 6GSSA 1SK1A 1TRUA 2FWEA 2LEGA 2REMA 3BD2A 5IMAA 3TKRA 4KCAA 2H76A 1GUKA 3TKSE 5GZZB 1WOUA 3BBYA 1JLWA 1EV9A 4HU7A 3NIVA 1WIKA 3ZFBA 3RPPA 1S3CA 3ME7A 2IMDA 1PRXA 1FO5A 2H66A 3C8EA 4KW6A 4IQAA 5IO0A 1SJZA 1EOGA 4K7IA 5G31A 4L5LA 3W8SA 1SU9A 3BCIA 2NDOA 1A23A 5F0GA 1CQHA 3VWXA 3DVWA 4ML6A 2CZ3A 5J4UA 4EVMA 3PINA 1N8JA 1ZYQB 5DALA 1SK0A 1JZOA 2H6YA 3ERWA 4IKHA 3Q19A 5ECSA 3GYKA 2KHPA 3RPNA 3W6GA 20GSA 3IPZA 1PX6A 3LEFA 3J7Yk 1J0FA 1GLQA 2H0GA 1TDIA 2HNLA 1K0OA 3UOMA 2O7KA 4EC0A 1MDIA 6GSWA 4QL9A 4TR1B 5F06A 1V2AA 1HQOA 3FEUA 1T1VA 3P2AA 4PUAA 1UVZA 1TXXA 5ECPB 3ZREA 4K8MA 4CW9A 2IIYA 3QAVA 5CP1A 1MD4A 4JE1A 2CVDA 2IMIA 2IMEA 1C72A 5ECHB 1X5EA 4XS1A 5GAND 1O73A 2DMMA 1K0CA 4FH8A 2VM2A 2VAFA 1YEPA 3EURA 4OFMA 3APOA 5DAKB 3UMAA 3M1GA 2YV7A 2E7PA 2X8HA 3US3A 4Q5FA 5AN1A 2KUCA 3GN3A 4I2UA 4TXOA 1OE7A 3D6IA 3WGDA 2WGRA 5ELAA 4POKA 5E4WA 2OBKA 3RHCA 1CQGA 1XWBA 1O8WA 2YWMA 1YEXA 2L4CA 3D4MA 5CRDA 1R5AA 2HZEB 2F3MA 6GSXA 2VCQA 3TKSC 2HSMB 5JWRB 3J7Yb 1OKDA 5EVOA 3FHKA 3VFIA 3A2WA 4V2MA 4XCSA 1ZL9A 1MD3A 1ACVA 1PMTA 4GSNA 3QOUA 3LYKA 1MTCA 3QCPA 3QFBC 3C7MA 5IQYA 3EINA 2C80A 1M2BA 3ZTLA 4FYBA 5D93A 2GLRA 5G2ZA 1YY7A 4HUAA 1ERWA 4BWSA 3I69A 4V1Ag 2DSAA 2X8GA 4CHSA 4ML1A 3Q6OA 3QDNA 4IJIA 3O3TA 4Q5RA 1EP7A 3UL3A 4TR1A 4GCIA 2VCVA 4X0XA 4IS0A 4EF0A 1VF4A 4MMMA 3TUEA 2B7KA 1WMJA 1R7HA 2CT6A 2H0HA 1JZDA 3FK8A 4ACSA 3GKKA 1Z9HA 5BMUA 5D9XA 2D2ZA 3UBLA 2HI7A 3F9UA 3BJ5A 4EKZA 2R37A 4LL1B 1JLVA 3PPUA 2DLXA 2YWOA 1Y6EA 1X5DA 5HFIA 3HXSA 2GZPA 3GMFA 2LNSA 3E0UA 2B3SA 2RM6A 4NPBA 3E3EA 5ECNB 3ZMLA 5ECQB 3ZRDA 4JR6A 3CBUA 1XOBA 5E59A 3GA4A 2VLUA 1GSYA 1X9MB 3HZ4A 4HZ2A 5D8IA 5DAKA 2QGVA 4JRRA 2R3XA 1B9YC 4RI6A 3APQA 2L5OA 1GUHA 4KE3A 2GSTA 1O85A 2L6DA 1Q4JA 2H6ZA 2FUG2 2HRFA 1EOHA 1WE0A 3ZIJA 3Q18A 1F6MC 2K8VA 3I9V2 2P31A 3U5RE 2C1YA 1F37A 3GFKA 4AJ7A 1V57A 2FWFA 1FW1A 3RHBA 2A2SA 4ECBA 2EIOA 4RQXA 2FLSA 1THXA 2ES7A 5G5EA 3ERGA 2OE0A 2HZEA 2HSMA 1O6JA 1A2MA 1TK8B 16GSA 2C0EA 2M46A 2TRCP 1PN9A 1SK2A 2YWIA 3IE3A 2YANA 4ECIA 1S3AA 2HSNB 3LYPA 2IMFA 2HRKB 1EZKA 2IPAA 2N5AA 5HR2A 2H1AA 1EEJA 2P0GA 5EL8A 2H71A 1AXDA 4KDUA 2CVBA 2LSTA 1XWKA 3H93A 1FG4A 2B6MA 1USBA 1TW9A 4ULXA 3BOAA 4V2NA 4OFTA 3D4TA 2CZ2A 3OR5A 2HQTA 2M80A 9GSSA 2VL2A 3FZ4A 1K0MA 1V40A 3SBCA 1M0UA 3H4KA 4NMUA 3F8UA 3CSJA 1XVWA 2NPBA 3GL3A 5AIXA 5EY6A 2TIRA 4LMVA 1R4WA 2R5GA 4IP6A 1M9BA 5A4UA 4XRAA 2GQKA 1GNEA 4DVCA 4KNDA 4LMWA 3TKQA 5D73A 5J9CA 5DJMA 2B5EA 3FZ9A 1YDKA 5ABRA 4MH3A 5IOWA 2DJ0A 3ZFLA 2CX3A 2PERA 2GSRA 1EP8A 1QXHA 2OE1A 2WCIA 2IFQB 2GGTA 5KN3A 3L4NA 2H01A 4MK3A 1T7PB 4GSSA 4BL7B 3EMPA 1F9MA 2I9HA 2H30A 5COHA 4TXVA 1PL2A 2RUEA 1H75A 5AIVA 4TR3A 4L5OA 4KA0A 4NWYA 1OYJA 3IC8A 4OCEA 4DEJA 2PVOC 1KEBA 1MDJA 4TVEA 5IIZA 2L5LA 4PXOA 4GTUA 3DWVA 3TGZA 2H1DA 3M0FA 1E2YA 3HA9A 3TOTA 4J2FA 1TRVA 4ECCA 3C1RA 3TRXA 2ON7A 2DMLA 22GSA 2P5RA 2K18A 4PNGA 3IDVA 2PGTA 4IBPA 2BJXA 1TU8A 4CDOA 2HLSA 3ED3A 1UC7A 2OACA 2HRKA 3WT2A 3W8JA 4AGSA 2E0QA 2R2JA 1ZOFA 4YQVA 4QQ7A 4MPGA 1GTUA 3LXZA 4HEA2 4LA1A 2GZYA 2NBSA 1OAZA 1T4ZA 3GNJA 1Z6NA 1XWAA 2IL3A 2GS3A 2I81A 1BJXA 2AAWA 1SKSB 2V6OA 4X1UA 1A8YA 3GH6A 4F0BA 3KIJA 3LSZA 1SJIA 3Q74A 4OFNA 2H74A 1T00A 3DEXA 4PQ1A 2MZCA 4JZQA 2KLXA 2E2MA 3A2XA 3S9FA 4N0VA 1MDKA 3D21A 2VCTA 1Q98A 4JR4A 2H8LA 4O7HA 3EYTA 1GL8A 5J3RA 5ECLB 3KTLA 3QAGA 2DC5A 3HCZA 1HNBA 1UA5A 2TRXA 3D22A 1QFNA 4MLYA 1SD8A 4G2EA 2PVQA 3EU4A 3ERFA 2VL3A 4XHMA 5G1KA 4EUYA 1PSQA 2YOIA 4TXOB 4O5RA 1TP9A 5IO2A 1URMA 4AJ6A 17GSA 2B5XA 1WPIA 1TK0B 2F8AA 3IHQA 1OC8A 5INYA 5KN1A 2IFQA 2VLTA 5H5RA 2FA8A 2CV4A 4BL7A 2CVKA 1YKCA 3D5JA 3SWLA 1EGRA 2EIQA 2H6XA 1Z5YE 3HJPA 1DSBA 1KNGA 1G7OA 5HR3A 3TJBA 5A5KA 3IOSA 4TKYA 3AY8A 3KM6A 2AV4A 4TN8A 3TDGA 4LL4B 5CREA 2RIIA 5C00A 1GSUA 1U88A 1TKDB 3MWHA 3GIXA 2JZSA 1X0RA 5DDLA 2DBCA 3GKMA 4RUVA 3UBKA 3TOUA 2C0FA 2E2GA 3KEBA 3F6DA 2XPDA 4FYCA 2GSSA 4TR4A 3F6FA 3GV1A 4Z7XA 4V2LA 1SL1B 4IW9A 3EWLA 3UEMA 3VI7A 1HYUA 3KP9A 2GT5A 2WULA 2X99A 3HVVA 1H4OA 2OE3A 1K0DA 5CAXA 1V58A 3FR3A 1FVKA 1AQXA 2CX4A 1DE2A 4MABA 4ZILA 3ZVJD 1QUWA 3QPMA 1GLPA 2R4VA 2A2RA 3TB2A 2G2QA 1N2AA 2H19A 2LTKA 4ZL7A 4OD7A 4OWYA 5ECMB 4FYUA 2GDRA 2VUPA 3ME8A 3HZ8A 3QR6A 2VO4A 4NV2A 4P3YB 1PGTA 3IC4A 2HXKA 2EIRA 5D9TA 3F4SA 1TI1A 5KEJA 4EL1A 2ZUPA 2L6CA 1FOVA 2B7JA 2LQOA 2MYGA 1BX9A 1YQ1A 1T4YA 5ENUA 4HDEA 2JZRA 2PBJA 4Q5NA 1GUMA 5FHIA 1FVJA 3ZZXA 5ID2B 3DRNA 4FQUA 4F0CA 3TKSA 1GSQA 4O32A 4GF0A 3BCKA 3EVIA 2LKUA 2PWJA 3RAZA 4ZB9A 2YNXA 3FZAA 2WJUA 3DIEA 4MH2A 3GRXA 1M2DA 3QD9A 4BA7A 1TTZA 2YZUA 1R26A 2DJ3A 1M99A 2O8VB 3LJRA 4EO3A 2LRTA 4GLTA 1GULA 3TJKA 1XW5A 2OA7A 2F8FA 1HD2A 3VPQA 3FRCA 4O92A 1JHBA 2NTOA 6GSUA 1K0BA 3IAS2 1J9BA 3A2VA 2H1GA 1BAYA 2DIZA 3P7XA 4F2IA 2I4AA 2Z9SA 4X43A 5H5SA 2MMZA 3V1WA 5IMCA 1AIUA 3CSHA 3NZNA 1K0NA 2C0DA 4G9HA 1VRSD 3KCMA 1F3BA 5J41A 2FNOA 4K6XA 2PPTA 1G6YA 3L0HA 1ZZYA 2F9SA 1B9XC 1G6WA 4KH7A 2OJLA 5JCGA 1A2JA 3IV4A 1FHEA 4IELA 4EDYA 5HR1A 4RQRA 5KN0A 1UN2A 2FWHA 5DQSA 4ILFA 4MJEA 4RI7A 4EDZA 4PUFC 1ERUA 2G0FA 1XBSA 2VD0A 5HFKA 5FWGA 2DJKA 4GQCA 3DGQA 4FO5A 4IJ3A 1KTEA 2RUFA 4KUNA 3LORA 1K3OA 1XW6A 3A3TA 5B7CA 3PGTA 2AHEA 1O81A 1VF2A 1XIYA 1SJ6A 2LQQA 4KF9A 1XVQA 5ID2A 3KP8A 2OBIA 4XRDA 3VWWA 3M8NA 5G1LA 3TRPA 1B48A 2L57A 1ZCPA 3TCOA 19GSA 3TJFA 2YPMA 1SL2B 1YF1A 2QKEA 4MZCA 3CRTA 3RDWA 5B6MA 2H1BA 1LU4A 2DJJA 2C3TA 2J23A 1NHYA 2YP6A 1I5GA 5D9WA 5DJLA 3G7IA 4I2TA 4OO5A 2WFCA 4K2DA 2GQMA 3GX0A 5J9BA 1GP1A 4LLRA 2I1UA 4MF5A 4MPFA 2CQ9A 3EU3A 3TKPA 1BG5A 2K6VA 3GUSA 3L9SA 4XS6A 2PUKC 2HFDA 3KJYA 3R2QA 3KH7A 1EEMA 4ISDA 4ZB8A 3RBTA 1BYEA 4HOJA 4WR4A 2O87A 2HSYA 1RK4A 2HZFA 4MF7A 2HT9A 3EE2A 3HVSA 1T3BA 4NHWA 4K7OA 5JWQB 4GWRA 3GX8A 4GQFA 4TW5A 1T8EB 3F3RA 3VWVA 4WF5A 3TJJA 1U3AA 2FHEA 3IK9A 1Z3EA 2VL9A 5DCGA 1M7TA 3MNGA 1YZXA 1ZMAA 1HNCA 2IWTA 1QMVA 2DJ2A 2JADA 2L59A 2YN1A 1PA3A 1F3AA 3H79A 4PQIA 3DXBA 3JCML 4ECJA 1GNWA 5CYYA 3QMXA 2XHFA 4D73B 1TI3A 3P90A 2CAIA 4TRXA 3LGCA 1M9AA 1S3DA 3O6TA 1TK5B 11GSA 2GQLA 2B5YA 3UVHA 4ZB6A 3IRAA 1GTIA 1A0FA 4POLA 2JU5A 1WP0A 4HQZA 2XBIA 3KTBA 1WRYA 5AGYA 3HJMA 3L78A 3WGEA 4FIWA 1RQMA 4N11A 1TOFA 1Z7PA 4YH2A 3PH9A 1ZYEA 3CMIA 2LRNA 2LUSA 2DJ1A 3GSSA 5DBQA 1HNAA 1AC1A 2YWNA 5ECKB 3K8NA 1ILOA 2XBQA 1Z7RA 1JFUA 2FY6A 3L9UA 4BVXB 2FWGA 4V1Ap 4I5QA 1AQWA 2CAQA 3KZQA 4JEDA 3HKRA 1M2AA 1SKWB 4BWQA 2LNTA 3MDKA 4L8EA 3VI5A 2H70A 3FZ5A 6GSVA 1B4QA 3QFAC 5EPFA 1FB0A 4OMVA 3DYRA 3ZIVA 3WGXA 3DVXA 3VWUA 3HJOA 1ZGNA 1AAZA 1JZWA 6GSYA 2MBSA 3LQ7A 2N5FA 1AUCA 3GKXA 4POMA 2K8SA 1PL1A 1YJ6A 2VCXA 1V9WA 5H5QA 4DSSB 2OKAA 4XS4B 2MBTA 2O85A 1GSDA 4GXZA 4MJBA 13GSA 1WJKA 1F2EA 4D73A 3GTUB 3ZITA 4XTSA 3KMNA 5IOXA 2KP2A 4HZ4A 3HY2A 4MJAA 2A4VA 1TJDA 1OC9B 4K0GA 6GSTA 2GTUA 1A8LA 3FR9A 4USSA 4K1FA 1GTBA 1PD21 1XOAA 5CRWA 3MSZA 1XW9A 2XC2A 2RLIA 2PMTA 3D0ZA 2LV3A 4NHZA 3HVXA 5D9VA 3FY7A 3GURA 4HJ2A 3U6VA 4NAXA 5ELGA 3ZMKA 2GT6A 1YKAA 4Q5QA 1PX7A 1QGVA 3H1NA 3C1SA 3UVTA 5HR0A 2LJKA 4PQHA 2PN8A 1U3IA 5F05A 2VM1A 2YZHA 10GSA 2IJYA 1LJRA 5B6NA 4BVXA 2HRNA 4G19A 5HQPA 1DE1A 1W4VA 2LRCA 3ZL5A 4IHUA 4MCUA 5LCZA 3O76A 2VIMA 2J9HA 1X5CA 2JSYA 3IXRA 3KD0A 1GRXA 1IYIA 5JWOB 1Y25A 4KDYA 1R5PA 1XPVA 2H72A 4BPYA 1TRSA 2KOKA 1J08A 3L9VA 1AW9A 1QK8A 2JZTA 2F51A 2YJ7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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