4NAXA

Crystal structure of glutathione transferase pput_1760 from pseudomonas putida, target efi-507288, with one glutathione disulfide bound per one protein subunit
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
b'ELSAFPITRKWPAKHPERLQLYSLPTPNGVKVSIMLEEIGLAYEAHKVSFDNDDQLSPEFISLSANNKIPAILDPNGPGGQPLPLFESGAILQYLAEKSGQLLSQDPAQRYQTLQWLMFQMGGIGPMFGQVGFFHFFAGKEYEDKRPRDRYVNESKRLLGVLDRHLKGRQWMAEEYSIADIAIFPWVRNLVERYNARDLVGFDQFKEVQRVLANFLERPAVQHGLKIPGAENLYFQG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of glutathione transferase Pput_1760 from Pseudomonas putida, target EFI-507288
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase, N-terminal domain protein
source organism Pseudomonas putida
molecule tags Transferase
total genus 86
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4naxA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4naxA01
1AQXA 4MF5A 2CAIA 1Q98A 1GSSA 1XWGA 5BMUA 5HR2A 3LYKA 4HJMA 1XW5A 2R37A 3ERWA 2DSAA 2HFDA 3GSTA 1DE1A 4LLRA 5COHA 1TDIA 14GSA 2H75A 3WT2A 4NXIA 4POLA 3IAM2 1FVKA 5IIZA 4CHSA 1PQNA 4G0IA 1EZKA 1HNBA 1ON4A 2OA7A 3F6FA 4Z7XA 3F4TA 3WGDA 3SWLA 4AJ7A 5LD0A 2B1KA 4XS6A 5B7CA 1HYUA 3VPTA 5CYYA 3M3MA 4RQXA 1T00A 4I2UA 3QCPA 4EE0A 5E59A 1OAZA 3VFIA 5GAND 3A2VA 4X43A 1AQWA 5D93A 3F9UA 2ZNMA 3PH9A 1JZWA 3GKKA 5ENUA 1VF2A 4LL4B 4TVEA 3M1GA 1URMA 2C0FA 3DMLA 3GL5A 5HQPA 2YZHA 1XCCA 2YV9A 2P0GA 3GL3A 4POMA 1Y25A 2D2ZA 4O5RA 1DUGA 4BWSA 3IC4A 2B5YA 2CZ3A 1Z6MA 3EC3A 8GSSA 2HLSA 2L4QA 3GYKA 3FR3A 3IA1A 1YDKA 3C1SA 4NHWA 5FWGA 2JU5A 3N9JA 1M2DA 2N5BA 4IP1A 4ZILA 1TOFA 3GTUB 5DCGA 1F6MC 2HRFA 2HSNB 1O8WA 2WCIA 4DVCA 5CO3A 4IW9A 1H4OA 2L6DA 1S3AA 3UBKA 4H86A 2B1LA 1OC3A 3HXSA 1X5DA 3GH9A 1YZXA 2XPDA 2YJHA 3GX0A 4N30A 1EV9A 2EC4A 4V1Ag 4HDEA 1E2YA 3VPQA 3KGKA 4G19A 3VWVA 5INYA 4GWRA 2IMKA 3UAPA 1A2MA 4GLTA 3MDKA 2FGXA 3BJ5A 3HZ8A 3QPMA 5HR1A 2P31A 2X64A 4DSRA 4HUAA 1A23A 3D4TA 3IPZA 3QFAC 1FAAA 3UVTA 1SL1B 5AGYA 2KUCA 3D0ZA 3KZQA 3F0IA 1B9XC 4O92A 1F37A 4L5LA 1TRWA 1SL0B 5G2ZA 3C71A 2EIRA 3IRAA 2IPAA 1YF0A 3QD9A 1TJDA 4MF6A 2LJRA 5J5NA 2GSQA 1GTBA 5CRGA 1HNAA 4YQMA 1FG4A 1FW1A 2FA8A 2H70A 1XFLA 5HFKA 2YPMA 4XTSA 4AGSA 4G10A 2O85A 3TJKA 2X8HA 1OYJA 1N8JA 5DQSA 2O7KA 1V40A 5GSTA 4MH2A 2GLRA 1TRVA 4O32A 2GSTA 3GSSA 1JZDA 1GL8A 4TXVA 3ED3A 2HSYA 6GSXA 1TXXA 2HSHA 1AAZA 4G0LA 1YKCA 1XWKA 2H1DA 4KCEA 1ST9A 2LUSA 1XXUA 4MZWA 1O7UA 6GSTA 3TKSC 1VF1A 2C0GA 3BOAA 5G5EA 1U88A 1BG5A 5ECOB 4OCEA 4POKA 1EP8A 5JWRB 6GSSA 1AQVA 3FZAA 2LSTA 4TXOB 4JU5A 2LV3A 1G0TA 4PNFA 2E0QA 1VRSD 3ZZXA 4IP6A 1W4VA 1K0AA 1X9MB 2C1YA 3TRXA 1M0UA 2PVQA 3F63A 1F3BA 1K0DA 3GFKA 1WP0A 4X0XA 2FNOA 7GSSA 4DSQA 2O89A 1G6YA 3ZITA 2GDRA 1MDJA 2VLVA 3MSZA 3I43A 1F3AA 1SYXA 4GSSA 1CQHA 3U5RE 3M9KA 2B3SA 5EL8A 3QAVA 2PVOC 1TW9A 3TGZA 2H30A 4GQFA 1FHEA 3KTBA 2MBTA 1FO5A 2AV4A 2IMEA 3TKSE 4NWYA 5J41A 1NW2A 4I97A 2RUFA 1GSEA 1MDKA 1M2AA 2H19A 3HD5A 1GUMA 1XWAA 3D22A 5DALA 5LCZA 5ELAA 3DWVA 2VL2C 2DJ2A 2VM1A 3NZNA 4TR1A 5B6MA 4GQCA 5ECMB 2XHFA 4EUYA 4HQSA 4GRFA 2H01A 4ZBBA 2TRXA 1X5CA 1GTIA 3DYRA 4KDUA 12GSA 1TKDB 4MJEA 4V2LA 5KN0A 2IFQB 3FEUA 3L9SA 1Z5YE 3P7XA 1B9YC 4EL1A 4BL7A 4KCAA 3WYWA 2C3TA 1PKZA 4N11A 1WRYA 2N5FA 1I9DA 5IM9A 1FOVA 2R5GA 2B6MA 2LS5A 4TR4A 2BTOT 3LWAA 4K7OA 3UEMA 4POBA 2LNTA 1Z6NA 3ZVJA 4KF9A 4V1Ap 1JZRA 3VI7A 2KP2A 4JBBA 4HQZA 3IOSA 2QKEA 2V6KA 3D6IA 4Q5FA 1N2AA 2R3XA 3PPUA 2LJKA 3TB2A 1QXHA 2GZPA 1FB6A 3P2AA 1K3LA 4BVYB 1BQ7A 2DMLA 2JL4A 3TRQA 3CXGA 4K1FA 2HNLA 1W89A 5D8IA 5IMDA 4F2IA 3W8JA 3HA9A 1B4PA 5IMVA 3QOUA 3H1NA 3FR6A 1F9MA 2LRCA 5C00A 4ULXA 1K3OA 4KA0A 1I5GA 2C4JA 3ME7A 3KH7A 1T8EB 1M7TA 4OFNA 5A4UA 4EO3A 4IHUA 4FH8A 5ECPB 2ALBA 3KCMA 5F07A 1M9BA 1V57A 2O87A 4RI6A 1BJXA 1K3YA 3RPPA 1X9SB 4F0BA 2L4CA 3FZ5A 3KH9A 3ZREA 2FA4A 3EE2A 3CTGA 2B7KA 3GURA 4IELA 4HI7A 2R2JA 3G7IA 2HSMA 5FT3A 2MBSA 1BYEA 4OO5A 5B6NA 3BCKA 2PU9C 3HZ4A 2VLUA 3UJ1A 4ECIA 5AIVA 3EURA 4WF4A 5GZZB 5DAKB 3TJFA 4YAVA 1B48A 2YV7A 5IMCA 1SYRA 2PMTA 5ECSA 2PPTA 3GNJA 2PGTA 4GF0A 3UL3A 1JLWA 2NBSA 4PTSA 1GNEA 4XIHA 3EWLA 2CX3A 3MNGA 2F8FA 2VLTA 3TJJA 4D73A 2K8SA 3ZIVA 2Z9SA 4K6XA 3HHVA 3DVXA 5FHIA 1K0MA 1BEDA 2DBCA 2DIZA 4YAPA 5ELGA 1EEJA 1PMTA 2KP1A 4XS4A 1PKWA 3LEFA 2H1BA 4LA1A 1T1VA 1JZOA 4WBJA 4ZB6A 2HRKB 1UVZA 3D4MA 4K2DA 2H0GA 1WWJA 2V6OA 4G0KA 1GUKA 4CDOA 5AN1A 2MMOA 2V2GA 2RLIA 1GSFA 4XHMA 2FWEA 2HQTA 4GCIA 3G7JA 4NMUA 4NPBA 1V9WA 5G5FA 5D9XA 1SD9A 1NHYA 1R5PA 3BBYA 3E0UA 3PINA 4FYBA 13GSA 1SJIA 3F3QA 16GSA 2KLXA 3HVSA 2XBIA 2L5OA 3O6TA 1GRXA 1GLQA 2QSIA 4J56E 1PSQA 2CVKA 4KH7A 2KOKA 2VCWA 1AUCA 2KHPA 3E9JB 2ON5A 3KP8A 3F6DA 2YZUA 4XCSA 5CAXA 3DXBA 3IDVA 1DBYA 4EDZA 2R4VA 5LNKe 3TCOA 3GTUA 1ERVA 3J7Yb 3QFBC 3M8NA 3LSZA 4ECBA 1JFUA 2R6KA 2K6VA 2OE0A 4IQAA 1KEBA 5B8AA 4EF0A 4IS0A 4AJ6A 3EYTA 1M99A 3KM6A 2L59A 5AISA 3KEBA 2P5RA 1BAYA 3N5OA 5G30A 1TRUA 1GULA 1OVNA 3J7Yk 4RQRA 4WBRD 4IKHA 2X99A 3GN3A 4K7NA 2VAFA 1YEXA 2WZ9A 5KN2A 1NM3A 3ZTLA 2F3MA 2QGVA 4KDXA 1J08A 3GKMA 2K8VA 17GSA 3A2WA 2C3QA 4N0ZA 3GV1A 4ZB9A 3U6VA 1X5EA 4ZBDA 1OKTA 1XIYA 4MLYA 5CRWA 3QR6A 1QK8A 2C0EA 4YQUA 3FK8A 1ERWA 1XW6A 2YP6A 1C72A 4DEJA 2H71A 2HZEA 4LMVA 1XWBA 4BVXB 3CSHA 1K0CA 2C80A 4RUVA 2WGRA 4GXZA 2LEGA 3C1RA 5JCUA 4OD7A 3FRCA 1MTCA 4K7IA 4MK3A 3DRNA 5ECLB 3R2QA 3HDCA 1RW1A 2EIQA 3RAZA 4QL7A 3EMPA 4AF2A 3ERGA 3CRTA 4KAEA 5D73A 2IMIA 3APOA 3ZL5A 2VIMA 2B5XA 10GSA 3ZYWA 4GSNA 1XVQA 4MJBA 1GSUA 4GTUA 2AAWA 4TRXA 5ID2B 2YN1A 2L6CA 2H76A 5DVBA 5L71A 3TJBA 2RIIA 1GSYA 2QC7A 2OADA 1XOBA 3QMXA 2IIYA 4MMMA 3CBUA 1PGTA 2JZSA 3ERFA 4YH2A 2HZFA 3V1WA 2FWGA 2WDUA 1USBA 3WGEA 2RM6A 5HR3A 1ZZYA 3WD6A 2E2GA 1O6JA 3LGCA 4BPYA 3DEXA 4N0VA 2HRAA 4J2FA 1QQ2A 2FWFA 4JE1A 4ISDA 4K8MA 1X0RA 3LJRA 1PN9A 3DIEA 3VK9A 4O7HA 4JEDA 1WOUA 2H6XA 3ZRDA 1X9WB 1XVWA 4K0NA 4IJIA 3ISOA 3CSIA 1OC9B 1T3BA 1LBKA 3IV4A 2X8CA 2JSZA 2JZTA 2A2SA 3K8NA 3EMXA 2VL3A 1PD21 4XRAA 5HR0A 1SJZA 2YNXA 1THXA 5CP1A 2NTOA 1YJ6A 3MAKA 5GSSA 4J57E 1R7HA 1SD8A 4TKYA 1Z7RA 1UA5A 2LTKA 2MMAA 3MWHA 3VI5A 4HS1A 2AYTA 1ML6A 1PRXA 1YF1A 1GTAA 2AJQB 4PUAA 1VGLA 4KB3A 2GSRA 4GSTA 1ZGNA 4MPGA 3FZ4A 2WB9A 1PA3A 1YEPA 1PX7A 5ECQB 5IQYA 1OE7A 1TI1A 3GX8A 1O85A 3HKRA 1GUHA 3GKXA 4K0GA 1ERTA 3RHBA 3IR4A 2LRNA 3HYPA 5DALB 1GSQA 2IFQA 2REMA 5D96A 2C3NA 3I9V2 4ZIJA 4TR1B 1XBSA 2CZ2A 2F51A 1EOHA 1SU9A 1WPIA 4TOPA 3GA4A 3DVWA 4DSSB 3GIXA 3FZ9A 2PERA 3CSJA 20GSA 1BX9A 1QFNA 3CRUA 1KNGA 1TK0B 3IC8A 4BL7B 1A24A 1TI3A 3EVIA 4NV5A 4MP4A 2AB6A 3C7MA 2WFCA 2PBJA 5E4WA 3HVXA 2YOIA 1K0NA 3ME8A 1PL2A 2L57A 5H5QA 4WKWA 2CT6A 1OKDA 2LQQA 3DD3A 5JCGA 4G2EA 2HRNA 1EV4A 4E8HA 4BA7A 2K18A 1TK5B 3FYGA 4JZQA 4FO5A 1CQGA 4HEA2 2VOCA 4I6XA 1SKSB 1EGOA 3HCZA 3TDGA 4IGJA 1SJ6A 1QGVA 2OACA 2OE1A 5F0GA 4ZL7A 5JWOB 2GZZA 2DLXA 2GQLA 5IOWA 5G1KA 2B7JA 2IN3A 2HXKA 2VL2A 1V2AA 2VUPA 3WT1A 3EU4A 3IXRA 4KUNA 5F06A 5ECIB 4PUFC 4NV2A 3Q74A 3FR9A 1IYIA 3RHCA 1VF3A 2ZCTA 3IHQA 1EP7A 2I81A 4ZB8A 1TTZA 5EY6A 3SBCA 4IBPA 5F8BA 6GSWA 1A8YA 3A5WA 2VCVA 5IMFA 2YANA 2M72A 5G1LA 3KXOA 3L0HA 3KP9A 3WGXA 2DJKA 1Z3EA 4ML6A 2A4VA 5DAKA 1MEKA 2RM5A 9GSSA 2C0DA 3VURA 1M9AA 3LXZA 5F05A 3Q18A 1U87A 1NHOA 3KTLA 2HSMB 4XRDA 3TRPA 3FW2A 5A4WA 3W6GA 3HJMA 4ZL9A 2GT6A 4L0WA 4HU9A 5AIXA 5IPGA 1ZCPA 4K9ZA 4WR5A 3PR8A 5D9WA 2WS2A 1ILOA 3VLNA 1A2JA 2I4AA 2HI7A 3L4NA 1YY7A 2L5LA 4ILFA 3NOFA 3P90A 4KGIA 4ECJA 3R3EA 2JADA 1LU4A 2AUVA 5ABRA 4MH3A 1GSDA 3VWUA 3I6AA 3TKPA 1FB0A 4D73B 1G7EA 1R4WA 4ML1A 3CYNA 3LQ7A 1Z9HA 4WETA 5CREA 5JWQB 1QUWA 3O3TA 1SK1A 4OCFA 4I5QA 2HRKA 1RQMA 1XOAA 4XS4B 2WJUA 3QAGA 3ZMKA 4TW5A 1QMVA 1A0RP 2PUKC 1E6BA 4HJ2A 4MJCA 5A5KA 4MDCA 2YWMA 1MD4A 2XPEA 3BCIA 1JHBA 2MZCA 2H1GA 4PX1A 3UIWA 4KDYA 3GH6A 3ZMLA 2HE3A 5DDLA 3IE3A 1JLVA 2G2QA 3UMAA 2DJJA 1EEMA 4F9ZA 4QQ7A 1KTEA 3LORA 4N10A 5D9VA 3KIJA 2WRTA 3DKSA 3F3RA 4MZCA 2XC2A 3F8UA 1SKRB 1XWCA 1G7OA 3VWWA 1ZL9A 3ZFBA 4KE3A 4TR3A 4MZBA 2FWHA 3L9UA 1PL1A 3RPNA 2GZYA 1Y6EA 3L78A 2E7PA 3QAWA 5H5SA 4FIWA 3E3EA 4KNDA 4TN8A 4AJ8A 2GS3A 2BJXA 4ZBAA 3FHKA 4OO4A 1ABAA 4ZXGA 2I3YA 1MDIA 4PGTA 1XZOA 2GT5A 1T4ZA 1A0FA 3TUEA 3DGQA 2LNSA 2FUG2 4OFTA 5H5RA 4EC0A 3UBLA 3VWXA 4FQUA 4OWYA 3HVVA 2CQ9A 3RBTA 4KSOA 3W8SA 3TKRA 2YJ7A 2YWNA 2H74A 2ZUPA 3GHAA 1S3CA 2CV4A 4ACSA 2H0IA 2CAQA 1M2BA 2FY6A 4LL1B 5HFIA 3BD2A 5ECNB 2YWOA 2J9HA 1SENA 2HT9A 3FKFA 3QDNA 4PQ1A 3LFLA 1T4YA 4ID0A 4OFMA 2JSYA 3C8EA 3GRXA 4IQ1A 18GSA 5DQYA 5EVOA 3TKQA 2UZ8A 3GKNA 2H8LA 1KBNA 3H8QA 4JR6A 2OBIA 3RDWA 1UC7A 2FLSA 4HZ4A 2N5AA 1U6TA 4NAXA 1SKWB 4BVXA 4EXJA 2LJAA 2I9HA 3A3TA 1K0BA 4MA9A 2IWTA 2F8AA 4USSA 5A4VA 4HOJA 2DJ1A 2J23A 4V2NA 2JZRA 5GAPD 2HZEB 4PQHA 3LG6A 5JCWA 3UOMA 2C8UA 3C73A 2VCQA 1ZMAA 2CX4A 4EDYA 4FYCA 2DMMA 3GUSA 1V98A 2GVPA 2GQMA 4PNGA 4I2TA 1WJKA 4HU7A 5KN1A 5ID2A 5IMZA 1A2LA 2H72A 3TOUA 1ZOFA 4Q5NA 4IJ3A 2OBKA 4E8EA 4EKZA 2K9FA 1R26A 1WMJA 3Q6OA 1A8LA 1GH2A 1Z7PA 4TXOA 1U3IA 4PQIA 1R5AA 2TRCP 4KX4A 3L9VA 4L0UA 3ZLPA 3APSA 5CRDA 2VM2A 2B5EA 1EOGA 1K0OA 1AW9A 2OJLA 4PXOA 2FHEA 3UVHA 1J9BA 1GNWA 5J9CA 1SL2B 5DBQA 3HY2A 4L5OA 1B4QA 1AXDA 2F9SA 1IYHA 2ON7A 2GTUA 1OC9A 5IO0A 5HFGA 1RK4A 1SK0A 2AHEA 5J3RA 1OC8A 2PN8A 2LQOA 4MJAA 5CRHA 1T7PB 5J4UA 2EIOA 2H73A 3G7YA 2VD1A 1EWXA 2VL9A 4F0CA 1GLPA 2DJ3A 3CTFA 1VF4A 3F4RA 1TK8B 3D21A 2VCZA 1TU8A 3US3A 2A2RA 3TOTA 2DC5A 5G31A 3ZFLA 2FCHA 4XS1A 3LYPA 2YCDA 4TR0A 2GGTA 2BMXA 3JCML 3G9BA 3A2XA 1XPVA 2H6YA 3IK9A 2NVLA 1MD3A 1ZYQB 2VCXA 1TRSA 4I8BA 4ECCA 4MF7A 3EU3A 6GSYA 11GSA 1ACVA 3TKSA 4G9HA 1GWCA 4OMVA 4YQVA 2P5QA 5ECKB 1HD2A 2H6ZA 2OE3A 5EPFA 4BWQA 1LJRA 3FY7A 4F82A 4KW6A 3CMIA 2M46A 3IK7A 2NDOA 3M0FA 1TP9A 3KMOA 22GSA 3NIVA 4NHZA 5D9TA 4DSSA 1YKAA 2H66A 2H0HA 3F4SA 4IVFA 4WXTA 1O8XA 5C04A 4CW9A 1TU7A 1AC1A 4IN0A 1ZYEA 2HYXA 2X8GA 5J9BA 4MCUA 2MYGA 2FD3A 3KMNA 2MMZA 1F2EA 4KSMA 1H75A 2WULA 4P3YB 3H4KA 3OR5A 2VO4A 1O73A 2H1AA 4BVYA 3UARA 5DCHA 3HJPA 2V41A 4Q5RA 1S3DA 4PURA 2DJ0A 4RI7A 4Q5QA 2G0FA 1J0FA 3O76A 1Q4JA 2O8VB 2GSSA 2IMFA 1EGRA 1THOA 2DIYA 3S9FA 3KJYA 2VCTA 1UN2A 3I69A 5KEJA 1PX6A 1GTUA 1B8XA 1WIKA 2VD0A 3D5JA 1HQOA 2CA8A 6GSVA 2M80A 1OE8A 3P8WA 3LXTA 1ERUA 3H79A 3AY8A 1DE2A 5ECHB 3EINA 4JRRA 5DJMA 2NPBA 2LKUA 2ES7A 1DSBA 4LMWA 1V58A 2JACA 1U3AA 1O81A 2MMNA 3IAS2 2CVDA 1AIUA 4JR4A 5IO2A 1FVJA 2LRTA 4QL9A 2IJYA 5IMAA 4WR4A 1G6WA 3H93A 2E2MA 3APQA 2RUEA 4EVMA 2IMDA 5CNWA 4MABA 3PGTA 4V2MA 2XBQA 1YQ1A 4X1UA 3GMFA 5ECRB 3IBHA 4WF5A 2OKAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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