4NE4A

Crystal structure of abc transporter substrate binding protein prox from agrobacterium tumefaciens cocrystalized with btb
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
281
structure length
281
Chain Sequence
AQVVVSSKIDTEGGVLGNIILAVLNQNKIETTDRIQLGATPVVRKAITAGEIDIYPEYTGNAAFFFSKADDPLWKDAAKGYEEAKTLDYDANKIVWLAPSPANNTWAIALRKDVADKNNLKTLSDFGKYVAGGGTVVLAASSEFVNSAAALPAFQTTYGFTMKPDQLITLSGGDTAATIAAAANQTNNANAAMVYGTDGGIAPSGLVVLEDDKHVQPVYQPAPIIREEVLKKHPNIEELLKPVFEKLDLATLQDLNARVQVGGEQAKTVAMDFLTKNGFAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Agrobacterium fabrum
publication title Crystal structure of ABC transporter substrate binding protein ProX from Agrobacterium tumefaciens cocrystalized with BTB
rcsb
molecule keywords ABC transporter, substrate binding protein (Proline/glycine/
total genus 102
structure length 281
sequence length 281
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ne4A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 4ne4A02
3W9WA 1SYHA 4XXUA 5BWJA 1YAEA 4X1DA 4X1BA 3SEVA 3IB2A 4YKJA 2Q89A 4F3GA 2YPNA 3T9UA 3LC8A 2RCAA 1UTBB 1B0LA 1L5TA 4NF6B 4KHZE 5DVIA 2H4IA 1MRPA 5ISUA 4O3CA 2GFEA 2HZLA 5I2KA 3SEWA 1N04A 4JWXA 1VFEA 1IEJA 1B3HA 2I4CA 5FTHA 2OJTA 4LQ2A 5B70A 4M1VA 4P11A 5DYHA 2UVJA 1Y3NA 1DSNA 1SVXB 2FYIA 3IL1B 2DVCA 1UQWA 2ZNTA 4G4PA 4DXCA 4BDLA 3MWBA 3TCGA 2F36A 1XS5A 4ELPA 1TXFA 4G8HA 1MXVA 4JWYA 1OLAA 5TU0A 3CIJA 1LCTA 5L9SA 1NH8A 4RYAA 1B46A 3G3HA 3K0VA 3P7IA 3TKDA 4G68A 3RGYA 1M5CA 3EQ1A 2OBGA 1R6ZA 4I1DA 3RLFE 5K2YA 2AL5A 2ESNA 4OFLA 2VGQA 3C32A 2B3FA 5JK4A 4JSDA 4KCDA 5AA3A 2F7BA 5I57B 3TQWA 4XIGQ 2F8DA 3QUFA 1D9YA 4FJPA 3OSRA 4YB7A 3ONMA 2HAUA 4KI0E 2XXXA 3SEUA 3KOTA 1SW2A 1IUDA 4UACA 4BDQA 2V25A 4F22A 4Q30B 3HSTA 1SW1A 3K00A 4RK9A 3KJ7A 2Y7IA 4LUBA 2OLBA 3MJNA 1B7HA 4LATA 3OXNA 2P1SA 3RT6B 3KG2A 5H8NA 5IAIA 3HHFA 4OERA 1O63A 1QULA 5F7VA 1URGA 1M5BA 2R9JA 5JTYB 3FVOA 4QSDA 4G77A 1GV8A 4YKIA 1A8EA 1JW1A 1YTVA 1MQDA 2ABHA 1NFTA 4L17A 2XXYA 5M2VA 3V89B 2OWSA 2PYYA 2XXPA 2Z8DA 1J1NA 1JW5A 3I5OA 3IK6B 4U22A 1M5DA 1LAGE 1IXCA 1I6AA 1RYOA 4IO7A 3RPWA 3MZ9A 1RKMA 2E0SA 1LLSA 2F6PA 1YPNA 2ZYMA 4QRZA 4F3SA 3H6WA 1N7XA 2I49A 5AA2B 1MXUA 3VV5A 1Z7ME 4EQ9A 5ICQA 4KD5A 4KFQA 4G8MA 2NUVA 4F19A 4O3BA 1PC3A 3EN3A 3Q26A 4JWOA 3EF7A 3OEMA 4EUOA 4NF8A 3KSJA 3SEYA 2X7PA 5I59A 5CBRA 4ZZAA 3SEXA 3D4GA 4OTEA 2XXIA 1TWYA 1VE4A 4IY5A 1US4A 1FQCA 4M4GA 2P2AA 2Q8JA 4PFUA 1I6QA 3PUZE 1NH7A 1FTJA 2QSXA 3LR1A 3H06B 1LFGA 4R75A 2DP8A 1R9QA 3C36A 5I2NA 3T96B 1PBPA 3QYTA 4PE5B 3GBBA 1LSTA 3IB0A 1WDNA 3CFXA 3JZJA 3RTFB 2IEEA 4U23A 1TFDA 1GTKA 4GF8A 4EXKA 3CSGA 4YU0A 4NF4A 4E0XA 1B4HA 3PUYE 4NE4A 3UGWA 5CC2A 1IIWA 4H67A 4C0RA 3C34A 1MH3A 3EHSA 1MY2A 1B7UA 3CFLA 4DIGA 5ITPA 3TELA 3IAZA 2FNCA 4U1ZA 2OZZA 2UYFA 3T9HB 1UIUA 2UXAA 3K6VA 3TCFA 5I56B 1URSA 2O1LA 3B7DA 2DXYA 1QUIA 3H3GA 3CG3A 4H1XA 2DOJA 1B40A 3Q25A 2QJEA 1JVXA 2A5TB 1XVYA 3EHTA 4R72A 2I3VA 4R9GA 1LGBC 2UYEA 3O2AA 5EYFA 4AB6A 1MDQA 4BDOA 5TP9B 3U1OA 2HXWA 4OETA 3T9XB 5FHOA 3RUMA 1EU8A 1JEVA 1A55A 2F35A 5DVJA 3FXUA 1P1UA 2O69A 3FZVA 4DLDA 3QUJA 4H5GA 3LSLA 3W15C 2H9BA 4ZE9A 3KSXA 1MY4A 3LUYA 4KR5A 2V3UA 5CMMA 3K1PA 3RNNA 4TLMB 3VFJA 2DE4A 3MQ9A 3MW0A 4ZE8A 3S9NC 4OENA 1UTBA 3DELB 1PB8A 4IY6A 3SKPA 5KCJB 1P1QA 2QS1A 4OYVA 4DCYA 3KN7A 3TTNA 1ZMGA 3WAEA 3S2VA 5H8QB 1MY3A 3A09A 4ELQA 5ITOA 3JYRA 1T0KA 3K6WA 4DDDA 4BDRA 3EPEA 3TTRA 1UTHB 5CMCA 3QSLA 3N26A 2F78A 1EZ9A 1AMFA 3OD7A 2D21A 4JXIA 2B3BA 3FV2A 4F2QA 1OVTA 3G3FA 5ICTA 5J1DA 1POY1 1ANFA 1OQGA 3IOVA 3W9VA 4KYSA 3K2DA 1MXYA 2H98A 5AE4A 3I3VA 1B3LA 4POWA 3V8XB 4ESWA 4FE8A 2NOOA 2DSFA 3TTMA 4WKMA 1FW0A 3O6HA 3SETA 1Y20A 3KN3A 3FVNA 1ATGA 2NWJA 1D3KA 1NKXA 4LZ5A 2QS3A 3PPPA 3BFUA 5K2XA 3H7MA 1EZPA 2I48A 3MBPA 2R71A 1N76A 4NEDA 1XT8A 4N13A 4YICA 2V93A 2DXRA 4YMAA 2I0BA 4IGRA 3N6UA 2OCUA 4RY1A 4LONB 5CI5A 2RCBA 5I57A 3IR1A 4F1YA 4F2OA 1POTA 1PBQA 3LBSA 1XOCA 1GVCA 2XHDA 3QK6A 1AIVA 3PMVA 2DYXA 4P0IA 3R7XA 4X48A 1MM6A 2YLNA 4PP0A 4ISUA 5CRYA 2O84X 3Q28A 2V3TA 3T9VA 1GR2A 4LZ8A 1P1NA 3S9LC 1TT1A 3O6IA 4I8CA 4ELOA 2GRVA 3FD3A 1NMUA 3L6GA 3EHUA 3E9XA 4YB6A 3OOAA 3IO4A 4I9DA 1AL3A 1IZ1A 2GHAA 2ZYOA 3M8UA 3F11A 1RYXA 1FQEA 1H43A 1ZJLA 1H76A 1FCKA 4KCCA 3OO8A 4OWDA 2RKMA 1BLFA 2PBWA 4U4XA 1QJMA 1B7ZA 3D4CA 3VDFA 3ZKLA 4IGTA 1MH4A 3VE1B 2Z23A 4YKPA 3Q27A 1O7TA 1DTZA 3IORA 4F31B 2REJA 1XVXA 2D3IA 3TZAA 5FHNA 4ZEDA 2QS4A 4ONYA 5F1QA 2GHBA 1FQBA 2XD2A 3PPRA 4G8NA 4GVOA 3O6GA 3CRBA 1IITA 2Y7KA 5DEXB 2H5YA 3SERA 4YKKA 2OK2A 4EXLA 3FXQA 4YZZA 3VVFA 3GBAA 4C1UA 4GRKA 4NWDA 1A99A 3TAJA 2UVIA 5HBCA 4LZ7A 2F6GA 1FQAA 1SW4A 1LB8A 4ZEIA 1B5IA 5A5XB 3DP6A 3VXBA 2RF1A 2NXOA 4MBPA 4PQJA 1WVJA 2Y7RA 1IQ7A 1BKAA 3PPQA 4YB5A 3G3IA 3R6UA 4JDFA 1Y3QA 1FQDA 2UVGA 1FQFA 3M3KA 2G29A 3HN0A 4NF5A 1B6HA 3K6UA 1N3WA 3B6QA 3OMBA 1DTGA 3KN8A 4QHQA 3OO7A 4QFPA 2PT1A 1OVBA 2W7YA 3IB1A 2RC7A 4XKPA 3PPNA 1DPEA 4OHNA 4RPNA 3IO6A 4R9FA 1OLCA 4GOTA 4ZEFA 5TPAB 2QRYA 3IOUA 3MVZA 3UK4A 3C9HA 4F39A 1FTKA 4U21A 2Q88A 4LVQA 4RXLA 1MPDA 3FATA 4QF9A 1LFHA 1B9JA 5I56A 5CMKA 4Q0CA 1Y4TA 3T22A 2QPQA 3KZGA 3USDA 4DXUA 5BUUA 1PB9A 2VD3A 4GFRA 3OSQA 2A5TA 3FXRA 3CFZA 5H8NB 4F18A 1B32A 3OO9A 1LAXA 5TP9A 3PV0E 1B5JA 3PUXE 2Y84A 3K1NA 2XXWA 4LP2B 3SESA 1PB7A 3PUWE 1B5HA 3H6UA 2F5XA 3E13X 2ZYKA 3HHGA 1A54A 1IXIA 1MY1A 3WAFA 2PX1A 5EHMA 3FUZA 4GL8A 2GH9A 4YAHX 3PMWA 5AA4B 3VLVA 1JVYA 4AB5A 4Z7EA 3QIMA 2HCAA 2HFBA 3O28A 1UIVA 1IXHA 4RPOA 2DS9A 3ILUB 1Y9UA 3MVWA 3N5LA 3G3JA 3O29A 5DVFA 1TFAA 4OVJA 3MUQA 2ZXTA 5FHMA 1QKAA 1MDP1 3MP1A 5H8SA 1IXGA 1B52A 3MP8A 3H03A 3TMGA 3G7WA 2QL3A 2F97A 1ZTYA 3FGSA 2HQ0A 3H6TA 1R1NA 2VHAA 3S9MC 1SBPA 1UTHA 4HS7A 3MZBA 1ZU0A 4HCWA 3N94A 4NMYA 1USYE 2PT2A 1WODA 1VR5A 4R6YA 4EDPA 1OIBA 3ODBA 3GLBA 2ZNSA 2PVUA 1MXXA 3ZKKA 2Z8FA 1B3GA 1QVSA 1Y4CA 3K01A 4HCYA 1JQFA 3PPOA 3TFLA 4ZZEA 2X7QA 4MFIA 4UA8A 1URDA 4QSCA 2DWIA 4ECFA 4PFTA 1FTLA 2X26A 4LA9A 3PGFA 4GL0A 3R26A 4OFOA 2D5WA 3H6VA 1LBBA 1OMPA 3CVGA 4NF4B 1S7YA 3MVXA 4FEDA 4GWOA 4NF6A 2I4BA 5H8HB 2A5SA 4H5FA 4HTGA 4F3BA 1YCJA 3DP8A 4FAJA 3T93B 4JB7A 5I58B 3ZSFA 3U93A 2REGA 3CG1A 3TUSA 4PFYA 1SQYA 5CMBA 3TQLA 4OEUA 1MY0A 4C1TA 4FORA 4ZECA 5AA1A 1II5A 1OQHA 1ZKBA 3VLWA 1MQIA 2ANJA 3C4MA 3KFMA 2AL4A 3O9PA 2QMWA 3VXCA 4O3AA 5AA2D 2XX8A 1N84A 4WXJA 4OXVA 4WEDA 3VVEA 1QUKA 2F7CA 2H25A 4QFKA 4H0WA 4XTCQ 2CMOA 1LCFA 1NNTA 1Z7NE 3U92A 1BP5A 3HO7A 3KBRA 1XC1A 5HPQA 2H99A 1P1WA 3KGCA 3MPLA 3TYHA 4OFJA 1LFIA 4R73A 3C35A 2ZNUA 4Z0IA 3E4RA 1LB9A 1KWHA 4BDNA 4ND9A 1B58A 4AQ4A 1VSOA 4QFLA 5CM6A 4EQ7A 3RN8A 4ZEBA 3FJGA 2XX7A 4KYDA 1P1OA 4P0GA 3U8QA 1HSLA 1Y1MA 5I84A 4JSOA 2I0CA 3LSWA 3RQTA 2THIA 3O97A 1XHYA 4Q8RA 3GXAA 1MQJA 3DP4A 4OQOA 5KDTB 1MQHA 4N6PA 1A40A 3OENA 4U1OA 5DEXA 3UA8A 5LOMA 3A3CA 4MH5A 1B1XA 4KQPA 4OZ9A 4ZS9A 4H8IA 4GXAA 2ONRA 2M8CA 1JW4A 3TEPA 1H44A 2RINA 5L9MA 1I6BA 5A5XA 2G93A 2DWAA 2FA7A 3HCQA 4FECA 3I6VA 4F1VA 3E3KA 5H8FB 5JTYA 1B1HA 3QXMA 2ALUA 1FTOA 1MQGA 4KPTA 2Z22A 3UORA 2VP1A 4E0WA 4TLLB 5CBSA 2Q9TA 3PD9A 1QW0A 1MXWA 3TPAA 3UP9A 3G3GA 3MP6A 4U4SA 3OELA 2I58A 2O1MA 3IOWA 1US5A 2AYSA 3T66A 1MM7A 3O66A 3DLNA 3PMXA 1N3XA 4R2FA 3B6WA 3IX1A 4NTLA 5AA2A 2O6AA 3MVYA 3B6TA 4GLIA 1M5FA 5I2KB 1CE2A 3K4UA 4OMBA 4DXBA 4Q5TA 3THIA 5TPAA 3FIRA 2BJJX 4X9TA 4IO2A 2QMXA 2F34A 4XKRA 1S9TA 3OEKA 1FTMA 3V5AA 3M3FA 5B7DA 1SDXA 4G68C 1Y3PA 1BIYA 1B3EA 4KYEA 3CR9A 4U2RA 1PEBA 5FTIA 4EF2A 1M5EA 2XX9A 3HV1A 1LAHE 2B65A 2RC8A 2HEUA 1QKBA 3FV1A 4HW8A 2I6EA 1BTJA 1ZLQA 1USYH 3S4UA 2XXUA 1SI0A 4XKQA 3RY3A 4G68B 4GXSB 2P0SA 4TOZA 3IJXB 2O7UA 1ZIUA 1B05A 4BDMA 4MLVA 1MS7A 1LBCA 2DE2A 1Q35A 4R6HA 4IO3A 5AA4A 3VLUA 2R6GE 3BFTA 1P99A 1HSJA 5HM4B 4RA1A 1A8FA 4QFOA 1R9LA 1NL5A 4MF3A 1AH5A 1DPPA 1N7WA 1F9BA 2XXHA 2V84A 3AXFA 2VOZA 5ELVA 5KZTA 2XD3A 4OESA 4FATA 4F3PA 3C31A 2NVUB 2Q2AA 2O7IA 1B3FA 4R74A 1Q1KA 2HZKA 4EF1A 1JNFA 4IO6A 3V83A 3N6TA 4FEBA 4PETA 1B4ZA 3FJ7A 1SYIA 1SI1A 4DE8A 1CB6A 2XXVA 1EZOA 4NWCA 1B2HA 1I69A 3ZS6A 2LAOA 3FVKA 3KOSA 1N0TA 1ELJA 4LQ5A 3U94A 4NF5B 1MXZA 2Z8EA 4EQBA 3HPIA 2E1SA 4DZ1A 1D9VA 2HAVA 2XXRA 3S9EA 4I62A 1NNFA 2F7AA 2DQVA 3MPKA 3IJOB 4RNSA 1SW5A 1AOVA 1D4NA 2ONSA 3ECRA 4ELRA 2WKYA 3CI8A 3RTWB 1S50A 3K6XA 5KCJA 3H4ZA 5H8HA 1O64A 2I3WA 2ZMBA 5H8QA 3TTLA 4DCXA 5I58A 3UIFA 2Y7WA 4JBZA 1DMBA 4NF8B 1SD3A 3QAXA 5I59B 4POXA 1DOTA 4H8JA 2UVHA 3VVDA 3LSFB 3DM0A 1NNPA 5L8DA 4F1UA 3IOTA 3FVGA 3KJTA 3OO6A 4BLAA 1QUJA 4QFNA 4FIMA 4IO5A 3L6HA 4R6KA 4QSEA 4RK2A 2QS2A 1PDAA 3K1MA 1B0HA 1GGGA 3C33A 2IA4A 2OWTA 3PU5A 2XXTA 2ONKE 2O68A 4IO4A 2O51A 4N07A 1ZBMA 4WEPA 1MPCA 1H45A 3FASA 5I2NB 1JETA 3U72A 1LAFE 3M3LA 5DT6A 4YMBA 1Y1ZA 2YJPA 3MAMA 2DWJA 4ESXA 5IKBA 4GD5A 4K3FA 3K02A 2RC9A 3KEIA 3G3KA 4H65A 4GIZA 3Q29A 1A7LA 4THIA 3MZ1A 1H3DA 2DWHA 4G2ZA 3TCHA 4GQOA 4R2BA 2Y7PA 3SDFA 2CZLA 3RT8A 1MPBA 1NNKA 5L9OA 4ZEKA 1JEUA 2VD2A 3UN6A 2DE3A 3JV9A 2PMSA 5KDTA 3TDJA 3PUVE 4TQUQ 3BBRA 3FJMA 2KLFA 5EHSA 3TODA 3PD8A 4F29A 3TTKA 4ZDMA 4MLQA 2AIXA 4OEVA 1B51A 3LSXA 1HSEA 2XXQA 1EH3A 5JEIA 3MC2A 2Q2CA 3A3UA 2DVZA 3GZGA 3BKIB 3CSBA 4H6DA 5H8FA 2V3QA 2ZYNA 1MG1A 4XKNA 3ILTB 4RJZA 1VFDA 5DTBA 4PFWA 4IB2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3W9WA 1SYHA 4XXUA 5BWJA 4X8RA 1YAEA 5EQ9A 4X1DA 4X1BA 3SEVA 4XF5A 3IB2A 4QXDA 4YKJA 2Q89A 4F3GA 2YPNA 3T9UA 3LC8A 2RCAA 1UTBB 1B0LA 1L5TA 4NF6B 4KHZE 5DVIA 1FBHA 2H4IA 4GWYA 1MRPA 5ISUA 4PAFA 4O3CA 4LN5A 1G0HA 2GFEA 2HZLA 5I2KA 3SEWA 1IMBA 1N04A 4JWXA 2FBPA 1VFEA 1IEJA 1B3HA 2I4CA 5FTHA 2OJTA 4LQ2A 5B70A 4M1VA 4P11A 5DYHA 2UVJA 1Y3NA 1DSNA 1SVXB 2FYIA 3IL1B 2DVCA 5ET7A 3CHGA 1UQWA 5EQ8A 2ZNTA 4G4PA 4DXCA 5F24A 4BDLA 3MWBA 3TCGA 2F36A 1XS5A 4ELPA 1TXFA 4N15A 4G8HA 2QVUA 1MXVA 4FBPA 4JWYA 1OLAA 2Q74A 5TU0A 3CIJA 1LCTA 5L9SA 1NH8A 4RYAA 4NG7A 1B46A 1JP4A 3G3HA 3K0VA 3P7IA 3TKDA 3E79A 4G68A 3RGYA 1M5CA 3EQ1A 4NF0A 2OBGA 1R6ZA 4I1DA 1FBGA 3RLFE 5K2YA 2AL5A 2ESNA 4OFLA 4P1LA 2VGQA 3C32A 2B3FA 5JK4A 4JSDA 4KCDA 5AA3A 2F7BA 4HXVA 5I57B 3TQWA 4XIGQ 2F8DA 3QUFA 1D9YA 4FJPA 3OSRA 4YB7A 3ONMA 2HAUA 4KI0E 5ET5A 2XXXA 1FSAA 2R8TA 4PCDA 3SEUA 3KOTA 1RDYA 1SW2A 1IUDA 4UACA 4BDQA 2V25A 4F22A 4Q30B 1G0IA 4N81A 3HSTA 1SW1A 3K00A 4RK9A 4MAGA 3KJ7A 2Y7IA 4LUBA 1K9ZA 2OLBA 3MJNA 1B7HA 4LATA 3OXNA 1FJ9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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