4NE4A

Crystal structure of abc transporter substrate binding protein prox from agrobacterium tumefaciens cocrystalized with btb
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
281
structure length
281
Chain Sequence
b'AQVVVSSKIDTEGGVLGNIILAVLNQNKIETTDRIQLGATPVVRKAITAGEIDIYPEYTGNAAFFFSKADDPLWKDAAKGYEEAKTLDYDANKIVWLAPSPANNTWAIALRKDVADKNNLKTLSDFGKYVAGGGTVVLAASSEFVNSAAALPAFQTTYGFTMKPDQLITLSGGDTAATIAAAANQTNNANAAMVYGTDGGIAPSGLVVLEDDKHVQPVYQPAPIIREEVLKKHPNIEELLKPVFEKLDLATLQDLNARVQVGGEQAKTVAMDFLTKNGFAK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of ABC transporter substrate binding protein ProX from Agrobacterium tumefaciens cocrystalized with BTB
rcsb
molecule keywords ABC transporter, substrate binding protein (Proline/glycine/
source organism Agrobacterium fabrum
molecule tags Transport protein
total genus 102
structure length 281
sequence length 281
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ne4A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 4ne4A02
1JW1A 5I57B 3PPRA 5AA2A 1B4ZA 2HXWA 1SI1A 4FAJA 1MS7A 3QXMA 1A40A 3UGWA 1LAXA 4U4XA 1TXFA 4KPTA 3RQTA 2Q89A 1MXXA 1MXYA 2E1SA 5AA4B 4F2QA 5FTIA 1LLSA 3N94A 3HPIA 1WDNA 3CI8A 4JXIA 1QUIA 1IQ7A 3H6VA 2H25A 3CSGA 4F22A 2PYYA 1B3HA 1ZTYA 2Z22A 4JWXA 4LONB 4F29A 3O6GA 3K6WA 4P11A 3S9LC 2R9JA 1QKAA 2A5TB 4H0WA 2THIA 3V5AA 3UA8A 1POTA 3VLUA 1B7HA 1MQGA 4KCDA 5DEXB 1VR5A 3K00A 3KEIA 3UK4A 4BDRA 5F7VA 3PPPA 1B6HA 4R74A 3C9HA 3MBPA 1NH7A 3PUXE 4EQBA 5CM6A 3O6HA 3HV1A 4MBPA 4P0IA 3GBAA 5LOMA 1XHYA 5H8FB 4KFQA 4DZ1A 2GHBA 1A7LA 5ISUA 1SW2A 1LAHE 4U21A 1XVYA 3T22A 3TODA 4X1BA 2O84X 2XXHA 1SW1A 2I0CA 4H65A 3BBRA 3EF7A 2OWTA 4U23A 2G93A 4DXBA 3SKPA 1MM7A 2B3FA 2I48A 1DTZA 3M3LA 1BIYA 4FECA 5FTHA 2GFEA 2OLBA 3VV5A 5H8HB 3CFLA 1DPEA 1M5EA 5CBRA 3EPEA 3OD7A 3TMGA 5I59B 1LAGE 1R9LA 2AL4A 2XXIA 3ILUB 3BFUA 4KD5A 4WXJA 4ESXA 3GBBA 4YKPA 4LQ5A 4JSDA 1B1XA 4GQOA 4YAHX 1S50A 2ZMBA 1JEUA 1OVTA 1M5CA 2XXYA 1WVJA 4KYDA 4IO7A 1MPCA 3OELA 4MFIA 4LQ2A 5AA1A 2OCUA 1CE2A 4G77A 4IGTA 3K1NA 5K2XA 1GR2A 3PUYE 3A3CA 4NWCA 3U92A 4P0GA 3H03A 3I6VA 3IO4A 4F39A 3LR1A 1B46A 4OVJA 3T9UA 3VXBA 3Q27A 2DOJA 2F36A 3K2DA 3TAJA 3DM0A 4JBZA 3KN8A 1RYXA 3BFTA 3MW0A 3RGYA 4XIGQ 3C33A 2XXPA 3RTWB 4IGRA 4R6KA 3TTRA 3LSFB 4N07A 2ALUA 1A99A 5F1QA 1BP5A 5FHMA 1OLAA 1HSEA 1QUJA 3T9VA 2PBWA 1PBQA 1US4A 1PB8A 1PC3A 4DIGA 2I4CA 2OJTA 1USYE 3PGFA 4OMBA 3B6TA 2ZXTA 1Z7NE 3IB2A 1D9YA 2UYFA 5I2KA 1P99A 5CC2A 4FJPA 3KG2A 3MPKA 3QUJA 4JB7A 3RTFB 4QFLA 1LFHA 5H8QA 1FCKA 1OQGA 1ZKBA 4GL8A 4THIA 1FQBA 1P1OA 1N7WA 1KWHA 4F31B 2VOZA 1LB9A 3HSTA 2OZZA 3ODBA 3FATA 4GXSB 1URDA 3IR1A 4U2RA 3TELA 4G4PA 2YLNA 5H8NA 2R6GE 1N3XA 1OVBA 5HBCA 4NF5A 3TTMA 3CRBA 1Y1MA 3MJNA 4RPOA 1F9BA 2O7UA 4OESA 3IB1A 1D3KA 2XD3A 4KQPA 3KN3A 1NNKA 2DVZA 3U94A 2XD2A 3VFJA 3V83A 3SESA 2DQVA 1OQHA 3OENA 3KJ7A 1O7TA 4Q0CA 1MH4A 5I2KB 1FQAA 4IB2A 3UP9A 1MY2A 2OWSA 5H8QB 1DSNA 3IOUA 4F1UA 4X1DA 4L17A 4KHZE 5DTBA 4U1OA 2F97A 4AB6A 4LVQA 1IXGA 2PT2A 4F18A 2QMWA 3PPQA 3ILTB 1LBCA 5CMCA 5H8NB 4UA8A 4I62A 3KSJA 4NF5B 1MG1A 1ZIUA 4IY5A 1NH8A 2F6PA 3H7MA 4QHQA 1SI0A 4XKRA 4R9GA 3SERA 4IO4A 3EHUA 4M4GA 3CR9A 2CMOA 1LCFA 2X7PA 2VHAA 1MPDA 1XS5A 4IO6A 3S2VA 5TP9A 2DXRA 2REGA 4GVOA 2DE4A 4OERA 3V89B 5KCJA 1A8FA 4OEUA 3OMBA 4YU0A 1MXVA 1R6ZA 5I2NB 3TCFA 4RK9A 1IIWA 4OQOA 3PD8A 3TCGA 2WKYA 3RY3A 2O6AA 3G3KA 4NF4A 1B0LA 2Z23A 1B5IA 1EZPA 3C36A 1LFGA 4YZZA 1FQFA 4TQUQ 1LSTA 2PX1A 4ELOA 3T96B 4TLLB 2NXOA 3IAZA 1FTOA 1OLCA 1ZLQA 2P1SA 3OXNA 2Z8FA 4FORA 3O2AA 1SVXB 4RXLA 1MY3A 1M5FA 4JWYA 1JVYA 2RC7A 2ONKE 2R71A 3TCHA 3MZ1A 4HTGA 1UIVA 5DEXA 2VD3A 4RJZA 1URSA 2DS9A 1JW5A 3T93B 3T9HB 3MQ9A 4DCXA 2NOOA 1ELJA 1SBPA 3IOWA 1AL3A 1NFTA 3MVWA 4GL0A 1AMFA 5H8FA 4PP0A 2RKMA 4EXKA 4ZEFA 3E4RA 4E0XA 2RCBA 5KDTA 1JQFA 2XXVA 4NF4B 2UVHA 1B1HA 3K6VA 4OTEA 2ZYKA 1PDAA 1MQIA 3RT6B 3SEUA 4FEBA 3CSBA 3LSLA 4HCWA 3ZKLA 4POXA 1XT8A 5H8HA 1SYHA 3VLVA 1JETA 3FGSA 4EXLA 1AH5A 4QRZA 4LZ7A 4ELRA 1MY0A 3Q29A 3H4ZA 3BKIB 4RPNA 5TPAA 5I59A 4NMYA 3TYHA 1IXCA 3OEMA 4ISUA 4X48A 3U8QA 3TKDA 5HM4B 2V3UA 5HPQA 4PFYA 2ZYMA 4ELPA 4ESWA 1PEBA 3N26A 3FVGA 5L8DA 3VVEA 3IB0A 3FXRA 3FUZA 4HW8A 1SDXA 1ZJLA 2HCAA 1NNTA 3EHSA 4H8IA 3O66A 3R26A 3S4UA 4R9FA 3LC8A 5KDTB 1YAEA 3C35A 1UTHB 3DP6A 1Y9UA 1N76A 3FJGA 2I58A 2Z8EA 4OZ9A 4QSCA 3VE1B 2QSXA 4G68C 1JNFA 1XC1A 3JYRA 4M1VA 1HSLA 2VP1A 4U1ZA 3RPWA 2O69A 3FVOA 1IZ1A 5AA3A 4F1YA 1B0HA 4FEDA 4NEDA 3PMXA 4OETA 4F2OA 3FASA 1H43A 1CB6A 3CG3A 4G8MA 1A8EA 2V3QA 2DWIA 3FV2A 3OO6A 3IK6B 2DYXA 3C34A 4I9DA 1GVCA 4G2ZA 5TPAB 1USYH 3LUYA 4LZ5A 1P1QA 3PUWE 1TWYA 2OK2A 2Y84A 4MLVA 4R2FA 3EQ1A 1GTKA 1NMUA 4OFOA 2ZNTA 1B3LA 5L9MA 3TQLA 3MVZA 1FQCA 4H67A 1S7YA 1PB9A 4LP2B 4YMBA 1Y3PA 2Y7KA 3M8UA 3FJ7A 1Z7ME 4YB6A 5BUUA 2QS2A 3THIA 2NUVA 1B7UA 4KYEA 4ZZAA 4U22A 1B05A 3PMVA 3ECRA 4YICA 4OHNA 2GRVA 4C0RA 4GWOA 3D4GA 4BDQA 4PETA 1Q1KA 4ZS9A 3H6WA 2VD2A 2AL5A 3VLWA 4BLAA 3OSQA 3ZKKA 3H3GA 2QPQA 1BLFA 3N6TA 3P7IA 1P1WA 4OXVA 2DWAA 2UVJA 2NWJA 3K4UA 3MUQA 4GD5A 4R75A 3ZS6A 3PU5A 1N0TA 3OSRA 4F3GA 2H99A 3GZGA 4Z7EA 2PVUA 4OFLA 1VFEA 4ZZEA 2F7AA 2YPNA 1BKAA 1HSJA 3FV1A 3O9PA 4QFOA 2DSFA 3DP8A 3IO6A 3O29A 3S9EA 1PBPA 4NTLA 3AXFA 3QUFA 3IOVA 3G3GA 3E3KA 4EUOA 3K6XA 4RY1A 4F3SA 3IL1B 3DELB 3TEPA 1II5A 1VE4A 2F6GA 3PPOA 4OWDA 1I69A 2I4BA 1LB8A 2YJPA 1URGA 1US5A 3SDFA 2Q2AA 4OYVA 1WODA 4N13A 2UVGA 4WKMA 1B7ZA 2UXAA 1UIUA 4EQ9A 4KCCA 3LBSA 1EH3A 1SW5A 4NF6B 4DXCA 3KGCA 1FQEA 4Q8RA 2HEUA 3PUVE 2ZNSA 1SW4A 2F7BA 1EZOA 3FJMA 4LUBA 2HZLA 3OOAA 4O3CA 3A3UA 1NL5A 4PQJA 1ZBMA 3LSXA 2E0SA 1JEVA 3U93A 1FTLA 2DWHA 1MQDA 3K1MA 5I2NA 4GXAA 4ZEDA 4BDLA 2RC9A 3R6UA 5ELVA 2V25A 4IO5A 2XXUA 5JTYA 2B3BA 4FATA 2A5SA 3JZJA 2I0BA 2XX7A 4PFWA 4K3FA 1IUDA 5I56B 2ESNA 4R73A 3B6WA 1LBBA 3CFXA 4OEVA 1B40A 3LSWA 4TOZA 3MVXA 3OO7A 3SEXA 1SYIA 3G3JA 3WAEA 2QS4A 2Y7IA 4NF8B 3KSXA 1IXHA 4G8HA 3RLFE 2O1MA 4GIZA 2PT1A 1FTKA 1Y3NA 2H5YA 2Q8JA 4DE8A 1EU8A 4F1VA 3RN8A 1ATGA 1OIBA 3TTNA 5ICTA 1M5DA 3JV9A 1Y4CA 1B32A 3HCQA 4ONYA 5FHOA 5CBSA 4QSDA 2UYEA 3IORA 1LFIA 1P1UA 1MQJA 2VGQA 4EF2A 1O63A 4Q5TA 3Q26A 1T0KA 2H4IA 3DP4A 3G3IA 5JTYB 2FYIA 1SD3A 3FIRA 2V3TA 1I6AA 2F5XA 3CIJA 1L5TA 1H44A 3KBRA 1OMPA 2H9BA 4ELQA 1B3FA 4MF3A 5DYHA 1AOVA 3R7XA 1PB7A 2XHDA 5KZTA 2RF1A 1P1NA 5EHSA 2I3WA 3PUZE 3IJOB 3KOTA 2O1LA 3MP1A 3C31A 1MXZA 5CI5A 3SEYA 2XXXA 3O28A 2QL3A 1B3EA 3RT8A 4JSOA 3TUSA 2XXQA 1VSOA 2G29A 3H06B 4QFPA 5B70A 3OEKA 2IA4A 3HN0A 5ICQA 4BDMA 4GLIA 4HCYA 3K6UA 3FVNA 1R1NA 2ZNUA 1Q35A 4F19A 4MLQA 4ZEBA 1TFAA 3G3HA 2Q88A 3DLNA 4MH5A 3H6UA 4PFTA 5A5XA 1UTHA 2BJJX 3MAMA 1N3WA 2W7YA 4G8NA 4FE8A 1QKBA 3FXQA 4RA1A 1UQWA 1GV8A 1H3DA 4PFUA 1RKMA 3T66A 4I1DA 2KLFA 4AB5A 1FTMA 5M2VA 1S9TA 3L6HA 3HHGA 4EQ7A 4XXUA 4KI0E 1Y4TA 1MDQA 3ZSFA 2DWJA 3SEVA 4YMAA 2RINA 1NNPA 4TLMB 3WAFA 4IO3A 5AA2D 1H76A 3KZGA 3E9XA 2XX8A 4EDPA 3USDA 3QK6A 3MP8A 3MPLA 2V93A 1LGBC 1TT1A 2HZKA 3G3FA 1B5HA 2QS1A 2FNCA 4XTCQ 4O3BA 2LAOA 2Y7WA 3I3VA 2ANJA 1ANFA 4NE4A 3GXAA 3MP6A 2PMSA 3TTLA 5A5XB 4KR5A 3QIMA 3RUMA 3H6TA 1Y3QA 3SETA 1MY1A 1XOCA 5AA2B 1DTGA 4H6DA 4JDFA 3M3FA 2XXTA 1JVXA 4HS7A 4JWOA 2P2AA 5CMBA 2X7QA 5IAIA 1ZMGA 4LZ8A 3MVYA 1J1NA 3MC2A 2ONRA 3PD9A 1O64A 1D4NA 2XXWA 3CFZA 4FIMA 2O51A 1EZ9A 4RYAA 1FTJA 1B5JA 3L6GA 1IITA 2RCAA 3K0VA 2QJEA 3CVGA 1RYOA 4ZECA 3MZBA 4IY6A 4ZEIA 3TDJA 1MDP1 1MRPA 1B2HA 4U4SA 4NWDA 1LAFE 3EHTA 3Q25A 5J1DA 3TFLA 4C1UA 1QW0A 1XVXA 2REJA 2Z8DA 1NNFA 3TQWA 4G68A 4GF8A 3C4MA 2D5WA 2Y7PA 2OBGA 5AE4A 3W15C 3OO9A 1GGGA 3E13X 1D9VA 3ONMA 3B6QA 4YKKA 1N84A 3VVFA 1MPBA 2GH9A 5EYFA 2D3IA 1ZU0A 2M8CA 1POY1 1MM6A 5DVJA 2QRYA 5I84A 4I8CA 5IKBA 3V8XB 4ND9A 3UIFA 4WEDA 1IEJA 3UN6A 1N7XA 3HHFA 5ITOA 4NF6A 4EF1A 4XKNA 1UTBA 1I6BA 3U72A 4YKIA 3K01A 3PMWA 5BWJA 3OO8A 3VDFA 2I49A 2QS3A 3PPNA 2CZLA 4DXUA 4G68B 3HO7A 3N5LA 1Y20A 2P0SA 5DVIA 3S9MC 5H8SA 4R6HA 3PV0E 5CMMA 3O6IA 3TPAA 4LATA 3FVKA 4R72A 2F34A 1B52A 1DMBA 2F78A 3I5OA 2Q2CA 4H1XA 5I56A 4IO2A 5EHMA 2F8DA 3W9WA 4GFRA 1BTJA 2UVIA 2ONSA 2DXYA 4KYSA 4NF8A 1YPNA 2V84A 1QJMA 2ABHA 3B7DA 4R2BA 3UORA 2D21A 4H5GA 4H5FA 1UTBB 3F11A 3IX1A 4BDOA 5L9SA 5K2YA 3U1OA 4O3AA 1B3GA 1Y1ZA 2I6EA 3KN7A 2XXRA 1SQYA 3QSLA 2QMXA 2O68A 1MY4A 1B9JA 4BDNA 1DOTA 4DDDA 1JW4A 2H98A 4PE5B 2AIXA 4LA9A 2XX9A 5CRYA 3FZVA 4E0WA 2HAUA 3W9VA 2F7CA 2DP8A 4RNSA 4X9TA 4N6PA 2X26A 3O97A 3KOSA 3N6UA 4GOTA 3CG1A 1FW0A 4R6YA 2ZYOA 5ITPA 4QFNA 3KJTA 4QFKA 3FXUA 5L9OA 2DE3A 4UACA 1IXIA 3K02A 1NKXA 4Q30B 5TU0A 1VFDA 1B58A 4POWA 3VXCA 1A54A 2ZYNA 3MWBA 3G7WA 4ZE8A 2O7IA 3D4CA 3M3KA 1MXWA 2Y7RA 3TTKA 2HAVA 2DE2A 4QSEA 1MH3A 4XKPA 2B65A 4F3BA 5B7DA 3VVDA 3GLBA 4WEPA 4H8JA 2HQ0A 3K1PA 1I6QA 4YB5A 1QVSA 4DCYA 3A09A 3Q28A 1AIVA 5I58A 4YKJA 4ECFA 4C1TA 3EN3A 1TFDA 5I57A 4ZDMA 1LCTA 2GHAA 4QF9A 5FHNA 5DVFA 2RC8A 1B51A 2FA7A 1A55A 3QYTA 2DVCA 3TZAA 1QUKA 5AA4A 2HFBA 5DT6A 1FQDA 1DPPA 4OENA 2F35A 4YB7A 3IJXB 4ZE9A 4XKQA 5JEIA 1H45A 4AQ4A 4ZEKA 3FD3A 4GRKA 1YTVA 3IOTA 2A5TA 1M5BA 1N04A 3RNNA 1B4HA 5JK4A 3C32A 4F3PA 2Q9TA 4OFJA 1R9QA 2AYSA 3T9XB 1MXUA 4DLDA 4Z0IA 5TP9B 4RK2A 2I3VA 1QULA 1MQHA 2NVUB 3MZ9A 5CMKA 5I58B 5KCJB 3SEWA 3KFMA 3QAXA 1YCJA 3S9NC 2IEEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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