4NEDA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with fenoprofen at 2.1 angstrom resolution
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal STRUCTURE OF C-LOBE OF BOVINE LACTOFERRIN COMPLEXED WITH FENOPROFEN AT 2.1 ANGSTROM RESOLUTION
rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 113
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2013-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nedA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nedA02
4Z0IA 3TUSA 1Y9UA 2GFEA 3OEMA 3PD9A 3VVDA 3TCGA 3A09A 1LLSA 4ELRA 3HSTA 2QRYA 2IEEA 2ZNTA 1LB9A 3PD8A 3UA8A 5H8NB 1B6HA 1MH4A 1SW1A 4Q0CA 4WXJA 4ZEKA 3MP1A 3UK4A 2OWSA 3KN3A 3SDFA 1QVSA 3N6UA 4OERA 5TU0A 1WVJA 3E9XA 1FTKA 3KBRA 1USYE 4KFQA 2NVUB 1A8EA 3BKIB 4AB6A 4R2BA 3G3FA 3M3FA 2M8CA 3I5OA 4YAHX 1UTBA 3R7XA 3SERA 4EXKA 1N3XA 4N13A 3F11A 1KWHA 4TLMB 4C1UA 1B52A 2G29A 2QS1A 4EQ7A 3N5LA 1BIYA 1NNKA 2O1MA 2FA7A 5H8HB 2I58A 3TELA 3FV1A 1PB8A 2DWJA 4OENA 5CRYA 1Z7NE 2DXRA 3MPLA 3U92A 1BKAA 1MXWA 1VR5A 2W7YA 3MBPA 4OFJA 4G68B 4OYVA 4ZZAA 4BDQA 2RKMA 3N26A 4G8HA 4GF8A 4OTEA 4U22A 4ECFA 2RINA 3H6WA 5I84A 5A5XB 2YLNA 3THIA 4JSOA 4PFYA 4F1YA 1A54A 1P1WA 1A8FA 3H3GA 5IAIA 1FQEA 1PEBA 1SW5A 1B0HA 2DP8A 3QIMA 3ZSFA 4NWCA 4FIMA 2WKYA 1RYOA 1FCKA 3K6UA 3PMWA 3DM0A 3ILUB 4ZZEA 3PV0E 2I3WA 1DMBA 3A3CA 4C1TA 1MXXA 1A7LA 3MUQA 5DT6A 1QW0A 3Q28A 5KCJA 2NOOA 4NF4A 1NMUA 1O7TA 1OIBA 1B9JA 1MXZA 3LSWA 1IZ1A 1MXUA 4GXAA 1FQCA 3TYHA 1CB6A 3T93B 4F18A 4NF8A 3IORA 2ESNA 2KLFA 3IOUA 1EZ9A 5HBCA 2AYSA 5H8NA 4EQBA 4F19A 1Z7ME 3W9VA 3C34A 4R6KA 3RUMA 1ATGA 3WAFA 1ZBMA 3QUJA 1B4ZA 1FQDA 2Y7PA 2VGQA 3PUYE 4PFUA 1I6BA 2QSXA 3IOWA 1VSOA 3CSBA 1UTBB 1DPPA 3BFUA 3AXFA 3FATA 1B3LA 3MC2A 1SDXA 2RCAA 3K00A 1EZOA 3PUZE 3PMXA 4NE4A 3RTFB 2OCUA 2E1SA 3IAZA 4DDDA 4ZE9A 3UORA 1EZPA 1UIVA 1ZU0A 3N94A 4EF1A 4IO2A 1R6ZA 5IKBA 2H9BA 1B05A 3HO7A 1JQFA 1QUJA 1PBQA 2GRVA 4PETA 5AA2A 4O3AA 3U94A 4DIGA 3S9MC 3IOTA 2UVIA 4TLLB 4FORA 1NNTA 4ZDMA 2RC8A 3O29A 5CMCA 3RT8A 1MM6A 1MPCA 3N6TA 2HAVA 3KJTA 1A55A 3Q26A 4MFIA 4MH5A 4QFNA 3OEKA 4MBPA 3UIFA 4F31B 1GGGA 3HCQA 3D4GA 3BBRA 3KG2A 4LZ5A 1AIVA 3IOVA 1HSEA 2F8DA 2Q9TA 3UGWA 3L6GA 2PMSA 1XC1A 2ZXTA 4NF5A 1MQJA 2I48A 1DTZA 5KCJB 2XHDA 4ELPA 1SVXB 4YKIA 3TTRA 5DTBA 1QUKA 2Y7RA 4R72A 4ONYA 1NKXA 2XX9A 1JVXA 2ANJA 3FVGA 1B3EA 3Q27A 1TWYA 4QF9A 4ELOA 1OVBA 3GZGA 4X1BA 5H8FB 3TAJA 3WAEA 4U4XA 2D21A 4U21A 3VLVA 3U93A 3MJNA 1XOCA 1B3GA 4OEVA 5I2KB 2F7BA 1O64A 1OVTA 5DVIA 4BLAA 4XIGQ 2F34A 2F7AA 3G3JA 2H25A 3M3KA 5EHMA 1LFHA 1BLFA 2FYIA 2Z23A 3DP8A 4H5FA 5BUUA 4RJZA 5I58B 4XKRA 1N0TA 3PPQA 1B3HA 4R75A 5K2YA 1SYIA 2I0BA 4I1DA 5J1DA 1AH5A 3O66A 2I0CA 4ZEDA 3TKDA 2YJPA 4ZEFA 4G77A 2RCBA 4YB5A 3Q29A 3FVKA 1US5A 4OZ9A 4RPOA 3VXBA 1JW1A 3UN6A 3C33A 4HS7A 4NWDA 3T96B 4NF6A 2DE2A 2F6GA 2RC9A 5FHMA 2H98A 3MVYA 1FTOA 3TTKA 2DSFA 4E0WA 4FECA 1SYHA 1SI1A 1JEUA 2V3QA 3ONMA 4ZEBA 2XD3A 4JSDA 3IB2A 4EF2A 3UP9A 1FTJA 1OLAA 3VV5A 4NF5B 3KN7A 1F9BA 4Z7EA 3CVGA 5AA1A 2XXQA 2R9JA 3CG1A 2F78A 3KOTA 2PVUA 3MZBA 3OSQA 1FQAA 4Q30B 3FASA 1YCJA 3SEUA 4O3BA 1MPDA 2H4IA 1LFGA 4BDMA 3BFTA 3QXMA 4OEUA 3T22A 1RKMA 2XX7A 3OSRA 3B6TA 4G4PA 1ZKBA 4GXSB 3FXUA 2XD2A 4LVQA 1M5BA 3K6WA 1UIUA 4YKKA 2XXVA 3EHTA 1GTKA 4DE8A 4OFLA 1H3DA 4YMBA 1ANFA 5I2KA 2NXOA 3O6IA 2OLBA 4F22A 3MQ9A 1WDNA 1LFIA 1PBPA 2XXHA 2I3VA 4DLDA 4R2FA 4KD5A 2Z8FA 3KSJA 2V3UA 1M5FA 2XXPA 3FUZA 3L6HA 3CG3A 3ZS6A 1B3FA 2R71A 3SEXA 2HZKA 4QFLA 3B6QA 3K1MA 3O2AA 1LSTA 2PYYA 3PGFA 4LZ7A 3PUWE 5ISUA 2E0SA 3OO8A 5M2VA 5H8QA 5AE4A 4EXLA 1Q1KA 2B3FA 2QPQA 5H8SA 4KR5A 4AB5A 1FW0A 2Z8DA 4RA1A 3KN8A 3TTNA 4XXUA 4Q8RA 1XHYA 1HSJA 1N76A 4EUOA 5KZTA 1MY2A 1IITA 1ZMGA 4OXVA 3SETA 4YMAA 3JYRA 1SW2A 4P0GA 4WEDA 1MQGA 1AOVA 2OZZA 1JNFA 3C36A 1Y3PA 1LCFA 4HTGA 5H8FA 4M4GA 1MRPA 4RNSA 4YB7A 4YKPA 1B46A 4IO4A 3H6UA 4JWYA 3DP6A 4UACA 4YB6A 4HW8A 4FE8A 3C4MA 4LZ8A 4XTCQ 5CBSA 5CM6A 2VP1A 5I2NA 3IB1A 1A99A 1B1HA 3FJMA 1MDQA 4ISUA 5ITPA 3EHSA 4LONB 4OETA 5FTHA 4X9TA 1IUDA 5I58A 1FQFA 3RPWA 4U23A 1T0KA 1D9YA 3VFJA 3H6VA 3H4ZA 2DE4A 3MVWA 4O3CA 5L9OA 1H45A 2O7IA 5EYFA 3ILTB 4I9DA 4PFTA 3K1NA 4PE5B 4U2RA 4MLVA 2QS3A 1Q35A 1ZLQA 2OJTA 2V25A 4GL0A 4F29A 1MG1A 1MY0A 4R9FA 5HM4B 2OWTA 1PC3A 3A3UA 3QAXA 1NL5A 2A5TA 2LAOA 4NF6B 3H03A 4QHQA 5FHNA 1R9LA 3P7IA 3RN8A 1MDP1 5JTYB 1PDAA 1I6AA 3OMBA 4FEBA 3SESA 1L5TA 3JV9A 4BDRA 1MM7A 2UXAA 3RT6B 1XT8A 2ZYNA 2F35A 3T9XB 2HQ0A 1D9VA 1UQWA 4IGTA 5ITOA 4FAJA 5ICTA 2DOJA 2H99A 3FIRA 5CI5A 5FTIA 3SKPA 3S9LC 2AL5A 1SD3A 4GWOA 1Y1MA 4LQ5A 3TQLA 2CZLA 3O6HA 1BTJA 3MVZA 4ZEIA 1FTLA 2Q8JA 3VXCA 1B40A 3CRBA 5I56B 4FEDA 4PQJA 2NWJA 2RC7A 2HFBA 5CMBA 4E0XA 2O68A 3LR1A 3MAMA 3IR1A 3IO6A 3MP8A 2UYFA 4JB7A 4GIZA 4QFPA 4U4SA 2Q2AA 2QMWA 4YU0A 2ONSA 1NFTA 1B0LA 4MF3A 3TTMA 1WODA 5JEIA 3RY3A 3RGYA 5ICQA 3PPPA 5I57B 1NH8A 2P1SA 3K6VA 3CFZA 5B70A 4IO6A 2ONKE 3G7WA 2DVCA 3LBSA 2I4CA 4U1ZA 3MWBA 4G8MA 3VLWA 1LAHE 3O28A 2XXTA 3O6GA 2D5WA 1LAXA 2HEUA 4GRKA 1IIWA 4KQPA 2AIXA 2OK2A 4ESWA 2DS9A 3IJXB 4ZECA 5I59B 4F3PA 1VFDA 1A40A 5JK4A 3V83A 4LQ2A 3K6XA 4GL8A 5H8QB 5LOMA 3CIJA 4OQOA 2ZNUA 3OO9A 3M8UA 2QS2A 3SEVA 4QRZA 2Y84A 4DZ1A 5B7DA 1P99A 3C32A 5ELVA 1LBBA 3C35A 3HHGA 2AL4A 1N04A 3I3VA 5DVJA 1LBCA 5FHOA 3SEYA 5I57A 1J1NA 1QULA 1B5HA 2HXWA 1N84A 2UVHA 3EPEA 3V89B 4DXUA 1B7UA 2A5SA 1MQIA 2QS4A 3K01A 3OO6A 4X48A 1JEVA 3MP6A 4IY6A 1IXGA 3G3KA 3PMVA 1LGBC 3K2DA 4R73A 2X7PA 1CE2A 5K2XA 3RTWB 5I56A 3VVFA 3FV2A 3C9HA 4LP2B 4R6HA 4QSDA 3OELA 4N07A 2X7QA 4R6YA 1URSA 5I2NB 1B7HA 3TQWA 2DWAA 3VDFA 1US4A 2BJJX 4H67A 4RYAA 4YZZA 4KYSA 1QUIA 4R9GA 2DWHA 3W9WA 5F1QA 1URGA 2UYEA 2Y7WA 4IB2A 3U1OA 4H0WA 5CMKA 4UA8A 4P0IA 1IXHA 1II5A 3FVOA 1OLCA 1POTA 3LSXA 4L17A 2Z22A 2ONRA 1UTHA 2PT1A 1YTVA 4GVOA 4IO7A 4JXIA 4BDLA 4GD5A 1B1XA 4F39A 4JWXA 1IXCA 1ZTYA 2CMOA 2VHAA 2DYXA 3PPOA 3VLUA 1S9TA 1XS5A 4OESA 3MVXA 1D4NA 1XVYA 2I4BA 2VOZA 2O1LA 4LUBA 1GV8A 1ZIUA 2A5TB 3CSGA 1AL3A 3S9EA 1P1OA 5JTYA 3MZ9A 3KFMA 1MY3A 3RLFE 5L9SA 1MQDA 2XXUA 1TFAA 2RF1A 4KI0E 3S4UA 2GHBA 1Y4TA 4JDFA 1I69A 3ZKKA 4H5GA 1B32A 3B6WA 2HAUA 1R9QA 2O7UA 3ECRA 2P0SA 3EF7A 3O9PA 1AMFA 4ESXA 4QFOA 3O97A 3TEPA 4WEPA 4NEDA 4RK2A 4K3FA 1IEJA 1M5CA 2XX8A 3TODA 4H1XA 4XKPA 5TPAB 4FJPA 1SW4A 1EU8A 1NH7A 4BDNA 4IO3A 3E3KA 3Q25A 3T9VA 4P11A 1M5EA 4H6DA 1HSLA 1LAGE 3E4RA 4JBZA 3IB0A 4KYEA 2THIA 3LSFB 3QK6A 1SI0A 2NUVA 5CC2A 1NNFA 2F36A 1OQGA 3GBAA 4HCWA 4RY1A 4F1VA 5BWJA 1M5DA 1POY1 2DXYA 1QKBA 2I49A 2D3IA 2OBGA 3FGSA 1B5JA 1JW5A 1B7ZA 3KEIA 2O6AA 3T9HB 4IGRA 2ABHA 2DVZA 1Y1ZA 3LC8A 4HCYA 1IXIA 4BDOA 3OD7A 1QKAA 2QL3A 5KDTB 3TCFA 1UTHB 1Y20A 2DQVA 4H8JA 1Y3QA 1JVYA 3JZJA 4OHNA 3H06B 4GQOA 4H8IA 4F3SA 1P1UA 5CMMA 4TOZA 2YPNA 1H44A 3CI8A 2HZLA 3FVNA 4I8CA 2P2AA 4THIA 5L8DA 4FATA 5CBRA 1VFEA 5HPQA 2QMXA 1TT1A 3R6UA 4MLQA 5DEXB 3ODBA 4RXLA 5AA2D 3B7DA 3I6VA 4LATA 4KCCA 4F2OA 2V84A 2G93A 3FZVA 1MQHA 2I6EA 3GLBA 2UVJA 3DP4A 2PX1A 3H6TA 4G2ZA 2X26A 2V93A 2UVGA 2XXRA 2PT2A 1NNPA 1H43A 2F6PA 2O69A 4OMBA 5TP9A 1D3KA 2VD2A 3IO4A 1MH3A 3K0VA 3LUYA 4GFRA 4ND9A 4H65A 4G68C 2ALUA 1BP5A 1DSNA 3CFXA 4KCDA 5F7VA 4WKMA 3G3GA 1B58A 5TPAA 2FNCA 1GR2A 4NTLA 1JW4A 2Q88A 3KOSA 4C0RA 1XVXA 3CR9A 4JWOA 1S7YA 3K1PA 4IY5A 3SEWA 2Z8EA 3DELB 1EH3A 1B2HA 3OOAA 1SBPA 3HV1A 3PPNA 4RPNA 4AQ4A 5I59A 3PUXE 3MPKA 3G3HA 1P1NA 1TXFA 2QJEA 3FD3A 3TZAA 2R6GE 3PU5A 4F3GA 5DVFA 1R1NA 1DOTA 3K4UA 1N7XA 4G68A 1JETA 2XXXA 5EHSA 5AA3A 1OQHA 4EQ9A 2DWIA 3U8QA 1MY4A 1LAFE 2GHAA 4ELQA 1B51A 1PB9A 1DTGA 2REJA 3IK6B 5DYHA 3EHUA 3T9UA 3M3LA 2B3BA 3FJ7A 5AA4B 5KDTA 4KYDA 4ZE8A 1SQYA 1VE4A 4DXBA 3H7MA 4GLIA 1MY1A 3KGCA 3FJGA 4U1OA 3TDJA 1YAEA 1N3WA 1URDA 2B65A 2IA4A 1N7WA 4XKNA 1GVCA 3V5AA 4Q5TA 2V3TA 4DCXA 2ZYMA 4GOTA 5L9MA 4F3BA 5DEXA 3LSLA 3MZ1A 3QSLA 3OENA 4NF4B 4N6PA 3FXQA 4YKJA 3TFLA 3S2VA 1Y3NA 1B5IA 4I62A 3T66A 2PBWA 4DCYA 1PB7A 4NF8B 2Y7KA 3IX1A 1ELJA 2XXIA 3GXAA 4NMYA 2F97A 3IL1B 1P1QA 1B4HA 3QUFA 4KPTA 4OVJA 4QSEA 5TP9B 3CFLA 3RQTA 4PP0A 2ZNSA 4IO5A 2XXYA 4G8NA 4R74A 3V8XB 4TQUQ 1QJMA 2GH9A 3C31A 3KZGA 3QYTA 3TTLA 3ZKLA 3TMGA 2O51A 1OMPA 3S9NC 1USYH 5H8HA 3HPIA 4LA9A 4X1DA 2O84X 3GBBA 3PUVE 2Y7IA 2F7CA 2F5XA 3MW0A 4XKQA 3FXRA 4OFOA 3USDA 2REGA 3DLNA 3OXNA 1FTMA 1MS7A 4PFWA 1MXYA 4QSCA 1I6QA 1FQBA 3HHFA 3K02A 4OWDA 1MXVA 1RYXA 4POWA 3IJOB 1LCTA 3PPRA 3TCHA 3U72A 1O63A 4YICA 2XXWA 1ZJLA 3R26A 3E13X 1Y4CA 1TFDA 2ZMBA 5A5XA 1MPBA 1S50A 3EQ1A 3VE1B 3KSXA 5AA2B 4DXCA 2DE3A 4POXA 1H76A 2H5YA 3OO7A 4RK9A 2HCAA 3W15C 3TPAA 2Q2CA 3G3IA 4ZS9A 1DPEA 3EN3A 5AA4A 1IQ7A 4F1UA 2Q89A 1YPNA 3HN0A 4M1VA 4QFKA 3KJ7A 4KHZE 4F2QA 3D4CA 2ZYKA 2VD3A 3RNNA 3VVEA 4EDPA 1LB8A 2ZYOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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