4NEDA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with fenoprofen at 2.1 angstrom resolution
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
publication title Crystal STRUCTURE OF C-LOBE OF BOVINE LACTOFERRIN COMPLEXED WITH FENOPROFEN AT 2.1 ANGSTROM RESOLUTION
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 113
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2013-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nedA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nedA02
4TLLB 3H6UA 1M5DA 3VVEA 2XXWA 3K6WA 2HEUA 1SVXB 3IJOB 1RYOA 2X7QA 4EXKA 3OXNA 4U23A 4NF6A 1MM6A 4FE8A 1SW2A 4UA8A 1F9BA 3S4UA 1I6AA 3RGYA 4MF3A 3TPAA 1XT8A 2ONKE 4GL0A 4OWDA 3RNNA 2Y7IA 2REGA 2ESNA 1B1XA 1QKAA 2DXRA 1EZ9A 4I62A 1ZMGA 2PX1A 4OTEA 4ELRA 5ISUA 4R2FA 1DOTA 4JWXA 4H67A 1LB8A 4YICA 3VVDA 1M5CA 3KFMA 4FEBA 1WODA 2F7CA 4GQOA 1UIUA 5A5XB 5H8FB 4WXJA 3MVXA 2F7BA 4NWCA 1SW4A 3V5AA 3QIMA 4F3BA 2DWHA 3UP9A 4GXAA 4ONYA 2Q88A 5FTIA 4R6YA 4G68B 4QFPA 1GVCA 1BP5A 3M8UA 1ZTYA 4THIA 4OFJA 3H7MA 4R2BA 4FEDA 2OWTA 1IUDA 3VE1B 4U21A 5JEIA 1UTBB 2HAVA 3CSGA 2F36A 5A5XA 4JXIA 5CRYA 4OEUA 4JWOA 4RK2A 3BFTA 3C33A 1DMBA 5I2KB 1FQEA 4KYDA 2R6GE 5AA2B 4OYVA 3OO8A 4JWYA 3RN8A 4RY1A 1SW1A 4G68A 3RTFB 1MPDA 5CM6A 3FZVA 1LAFE 4IO4A 4GD5A 4R72A 1MXVA 2XXTA 1UTBA 2Q8JA 2HXWA 1QW0A 3O28A 5I57A 3UK4A 1B5JA 3WAFA 5I2KA 3RLFE 2DVCA 4HW8A 5AA2A 4PFYA 2H9BA 4TOZA 2DS9A 4EXLA 5FTHA 4EQ9A 4G4PA 3QUJA 3JYRA 3HSTA 4FAJA 3KG2A 5DT6A 3TCFA 2O1MA 2F6GA 1UQWA 2ZNTA 3TAJA 1ELJA 4MH5A 4NF5B 2I6EA 3PUYE 3SEXA 4AQ4A 3K1PA 3TTRA 3FVNA 1S50A 1MH3A 2XD3A 3PPOA 1PBQA 2XXPA 2D5WA 5IAIA 2ONRA 4GL8A 1LFIA 1TWYA 3CFXA 3O6HA 1A55A 3ODBA 4H1XA 2HQ0A 3K02A 4GF8A 5CBSA 2VD2A 3OEMA 4G2ZA 2DWAA 3TKDA 3MZ9A 3H6TA 5HBCA 1QUKA 3CFLA 2VGQA 4OVJA 4OFLA 1A8EA 1N0TA 4N6PA 1FQCA 5H8QB 3K0VA 5L8DA 3IB0A 5AA2D 3OELA 4XKQA 3KN7A 4YKPA 4XXUA 3S9MC 1MPBA 4ZEDA 2PMSA 3TCGA 4R9FA 1S9TA 4F3SA 1D9VA 3EHSA 1B58A 1HSJA 3E13X 3P7IA 4N13A 1B0LA 4M4GA 3AXFA 1SDXA 3MVWA 4LP2B 5H8QA 4MBPA 4DXUA 2Y84A 2A5TB 3BKIB 2I48A 2V93A 2NWJA 5KCJB 3DELB 3Q29A 3IOTA 2BJJX 4NWDA 3PUZE 3PV0E 1GTKA 3CI8A 4ZEIA 2O68A 1MH4A 3SEVA 1B7ZA 2GHAA 3VV5A 1P1QA 2UXAA 4YKJA 4UACA 1JVYA 4RXLA 1B51A 3HHGA 1LB9A 4ZEKA 3HHFA 4X48A 1FQDA 1EH3A 3K4UA 4C0RA 2F34A 3G3HA 3GZGA 2D21A 1URGA 5IKBA 4KCDA 2Z8DA 1JVXA 2QL3A 2NUVA 3I5OA 2FNCA 3OO7A 1VE4A 3ZS6A 5CMMA 1NNPA 1LAHE 2Q9TA 3B6TA 4Q8RA 3OEKA 3N5LA 1PC3A 3EF7A 3UGWA 2Z22A 4ZDMA 1RKMA 2OJTA 4RA1A 5TU0A 5I2NA 1MS7A 2E1SA 3IO6A 3LSXA 1XHYA 1DTGA 2YJPA 2X7PA 2OK2A 3FATA 4XIGQ 3TQWA 3FXRA 1JEUA 2QS4A 1FCKA 3U92A 4NE4A 1I69A 2W7YA 4U2RA 1PB7A 5B70A 3PMXA 2H98A 4BDLA 3I3VA 3FJ7A 3VLUA 1R9LA 1ZJLA 3G3FA 2HZKA 2P2AA 2Y7RA 3S9LC 3LSWA 2ZYMA 4GWOA 1ZKBA 2XXHA 5K2XA 1B3EA 3UORA 3ZKLA 4F19A 4EF1A 3K6VA 1MDQA 3H6WA 5H8HB 5I59B 5F1QA 3PD9A 3O97A 2ZYNA 1TT1A 2AYSA 1NNKA 4R6HA 1B52A 2F8DA 2F6PA 4G8NA 3SEYA 4G8HA 4C1UA 3G3JA 4F2OA 5CMBA 1JW4A 1NFTA 3V89B 5L9SA 5ICQA 1UIVA 3PMVA 3O6IA 1Z7NE 4ESWA 1EU8A 4EDPA 4N07A 2XX9A 4YKIA 4RJZA 4DLDA 2HCAA 3PD8A 5DVIA 5BWJA 1IIWA 4QFNA 3RTWB 2V3UA 1OVTA 3ILUB 4IGTA 3TMGA 2XX8A 3QSLA 3PUWE 3KSJA 4I8CA 1PBPA 3TEPA 1XVXA 1SQYA 3TTKA 2UYEA 3IAZA 3ZSFA 3SKPA 1FQBA 4FORA 1FTKA 1B7UA 3MZBA 4HTGA 2WKYA 3SDFA 1MDP1 1MQIA 3CG3A 3R26A 2THIA 3MP1A 4OESA 4XKNA 3FIRA 3MC2A 4G8MA 1R1NA 4DE8A 4KHZE 2X26A 5F7VA 2NVUB 1R6ZA 3H3GA 2O69A 1PB9A 4DCYA 3GXAA 1OQGA 4U1OA 1NMUA 2VHAA 1I6QA 1OQHA 3T96B 1D3KA 1XC1A 2KLFA 4IO2A 3N94A 1SBPA 2RCBA 2XXUA 5TPAB 4ND9A 3IX1A 1POTA 1D4NA 4ISUA 2HZLA 4GFRA 4F22A 1POY1 4JB7A 4MLQA 3MW0A 1Y1MA 2UVJA 1BKAA 5AA1A 1B3FA 3FVGA 1LFHA 5EHMA 2ZNUA 1XOCA 3PGFA 4OEVA 4POXA 4NMYA 3WAEA 3PUXE 3DP8A 3TTNA 5H8SA 2DYXA 4ZE9A 1AL3A 5TPAA 2ZXTA 4RK9A 4NEDA 1NH8A 5I57B 1US4A 2VP1A 4X9TA 1IITA 1BIYA 1MPCA 1FW0A 1B4ZA 2OLBA 2DQVA 1P1OA 3KN3A 3RUMA 3N26A 2F5XA 2DXYA 4DCXA 5KDTB 4HS7A 4TLMB 4AB5A 1QJMA 1GV8A 1AH5A 5FHNA 3GBBA 4OERA 3CVGA 3EN3A 3FGSA 2IA4A 2XD2A 3MVZA 1B5HA 1MQDA 3B7DA 4QSEA 3SERA 4GOTA 5CMKA 1WVJA 3B6QA 3L6GA 4OMBA 3TELA 3U1OA 4JSDA 4YAHX 3PPQA 3T9UA 5KDTA 3K6UA 4OHNA 3PPPA 3CFZA 1SI1A 5FHMA 2QMXA 1UTHB 1B1HA 2GH9A 4R74A 3N6UA 3BFUA 2RC7A 4KYEA 3C36A 2RC9A 1SYHA 3KJTA 4U1ZA 1B4HA 1M5FA 3GBAA 2PYYA 4KQPA 4GVOA 3PU5A 5CBRA 3IOVA 3T22A 5CC2A 4RNSA 4ZZAA 4Q0CA 1FQFA 2RKMA 4F1YA 3VLWA 3C35A 1D9YA 1USYE 1A40A 1NH7A 2G29A 2ZMBA 1UTHA 3A09A 4ELQA 3THIA 4NTLA 1OLAA 4IO6A 2ZYKA 3VDFA 3MPLA 4QSDA 4JSOA 3IB2A 3O6GA 3TZAA 1A7LA 4DZ1A 4P11A 4EQ7A 3S9EA 5DVJA 1ANFA 1LSTA 2OCUA 4EF2A 3C9HA 3PPRA 2P0SA 4OZ9A 3C34A 1IXGA 1IXIA 1ZLQA 2H99A 4LZ7A 1MY0A 5L9MA 4KI0E 4KFQA 4PFWA 1PEBA 1CB6A 3G3IA 1N7WA 3E4RA 4R73A 4GIZA 5BUUA 2F78A 3H4ZA 2B65A 4KCCA 2NOOA 4H8JA 3W9VA 4X1BA 2RINA 1FQAA 4YMAA 1MY2A 1BTJA 3MJNA 3MUQA 4BDQA 4ESXA 3HV1A 4PFTA 5KZTA 1YAEA 3KZGA 2DVZA 1LFGA 1ZBMA 3FJMA 3G7WA 4FIMA 3SETA 3MVYA 1Y4CA 4QFKA 2UVGA 4OFOA 3BBRA 1MM7A 4OENA 2E0SA 2DOJA 4AB6A 1SYIA 1SD3A 5M2VA 1MXUA 4TQUQ 4F29A 3SESA 1NL5A 4FECA 2HFBA 4ZECA 5I2NB 2QS1A 4ELOA 5ITOA 1ZIUA 3FV2A 2O6AA 4QHQA 5CI5A 4LONB 3H03A 1JQFA 3V8XB 4E0WA 1Y20A 1P1NA 1S7YA 4KD5A 3D4GA 2PT2A 3IJXB 2O7UA 3M3FA 4QF9A 2F35A 1URSA 4ELPA 4K3FA 4ZEBA 4LVQA 5HM4B 4O3BA 2VOZA 4P0GA 3HPIA 3LSLA 3U93A 1B40A 4I1DA 4QFOA 2DE4A 2B3BA 3PPNA 3FD3A 1QULA 1YTVA 5DEXB 4R9GA 4PP0A 3A3UA 4EUOA 3O66A 2ONSA 1Z7ME 2R9JA 3VXCA 5HPQA 4IY5A 4XKPA 4G68C 1H45A 3T9VA 4OETA 3EQ1A 3W15C 5B7DA 1MG1A 1YPNA 5DEXA 3EHUA 2AIXA 3R6UA 1A8FA 1M5BA 4IGRA 4Z7EA 2DWJA 3KJ7A 4H65A 2VD3A 2O1LA 2PVUA 3A3CA 3EPEA 4BLAA 1B5IA 3CIJA 1JW5A 4LUBA 5DTBA 4YZZA 4DIGA 4NF8B 5JTYA 2P1SA 3K1NA 3ECRA 4NF4A 1T0KA 2IEEA 3MBPA 2PT1A 4WKMA 1H3DA 2AL4A 3I6VA 2QSXA 4H8IA 2V84A 4WEDA 4L17A 3TCHA 3H06B 2YLNA 4U4SA 1FTJA 1FTLA 4QRZA 3B6WA 4JDFA 1B3HA 2XX7A 4YU0A 4NF8A 2DE2A 2A5SA 2NXOA 4YKKA 1EZPA 4POWA 4YB7A 4ZZEA 3DP4A 2QS2A 1N7XA 4F31B 2I3WA 4XTCQ 1VFDA 2ALUA 1N3XA 1TFDA 1O7TA 4KR5A 3S9NC 3K01A 1FTMA 2QRYA 2Y7KA 1B05A 1HSLA 1LGBC 1I6BA 3R7XA 3TODA 3H6VA 3IOWA 3CRBA 4G77A 1LAGE 3TFLA 3VFJA 2O7IA 2QPQA 1B46A 2Q2AA 2XXYA 3SEUA 2GHBA 4R6KA 1LBBA 1QVSA 3W9WA 3KEIA 1LAXA 2ABHA 3T93B 5H8NA 3VXBA 3RY3A 3O29A 5I84A 3FXUA 4YMBA 3OSQA 3Q26A 3QK6A 3OO6A 5AE4A 2GRVA 3K00A 3U72A 2O51A 4IB2A 4IO3A 3MP6A 1B6HA 3VLVA 4F39A 1QKBA 1PDAA 1O64A 2YPNA 4Q5TA 3IK6B 1LBCA 4LQ5A 3QXMA 3OO9A 1URDA 3S2VA 2I0BA 1DPEA 3ONMA 4U22A 1AIVA 2I49A 1IZ1A 4E0XA 5L9OA 2REJA 4IO5A 1H76A 3V83A 1N3WA 3CSBA 2G93A 2DSFA 1BLFA 3CR9A 1QUIA 3EHTA 1MXXA 2V3QA 3HO7A 2XXXA 3K6XA 2Z23A 3TUSA 5EYFA 2LAOA 4OXVA 2OBGA 5H8FA 1MY3A 4Z0IA 1NNFA 2I0CA 4ZS9A 3DP6A 1MQHA 3KN8A 3T9HB 1MRPA 2UVHA 1MXYA 1P1UA 4DDDA 3FV1A 3FXQA 1RYXA 1Q35A 3HN0A 2UVIA 2F97A 1LLSA 3Q27A 3M3KA 1SI0A 4LATA 1FTOA 3RQTA 2UYFA 1P1WA 2OWSA 1ATGA 3CG1A 4P0IA 2AL5A 3JV9A 4YB6A 4GXSB 3K2DA 4ZE8A 3IOUA 4GLIA 3HCQA 4OQOA 1OVBA 1Q1KA 4DXCA 1B9JA 3RT8A 3FUZA 4PETA 5CMCA 1N76A 1PB8A 2R71A 1GGGA 1MXZA 4QFLA 4Q30B 3OMBA 5TP9B 4R75A 2XXRA 4F1UA 2ZNSA 5LOMA 2GFEA 3KOSA 5ICTA 3G3KA 4JBZA 2D3IA 2F7AA 2Z8FA 2HAUA 4WEPA 3FVKA 1DTZA 2I58A 1DSNA 4RPOA 4FATA 4YB5A 1Y3PA 2PBWA 5TP9A 3UA8A 4NF5A 3L6HA 3MZ1A 3IB1A 5DVFA 3DM0A 3PMWA 3Q28A 1HSEA 2RC8A 3E9XA 1TFAA 2XXQA 3OSRA 4BDNA 5ITPA 3PUVE 1YCJA 3DLNA 1TXFA 1O63A 3ZKKA 2Y7WA 3Q25A 1H43A 3UIFA 3O9PA 1GR2A 4ECFA 3TYHA 1WDNA 1QUJA 3U94A 3MQ9A 5AA4B 3MPKA 3E3KA 3KBRA 4PE5B 3USDA 1IXCA 3IORA 1OLCA 4O3CA 1XVYA 2H5YA 2RCAA 1AOVA 1J1NA 3QUFA 3MWBA 4RYAA 3QYTA 1OMPA 4LZ5A 4ZEFA 2XXIA 5DYHA 4HCWA 3VVFA 3TDJA 3OOAA 2V25A 1N84A 1DPPA 1A99A 3F11A 3FVOA 2A5TA 2V3TA 3C31A 3LR1A 4PFUA 5AA4A 5KCJA 3IL1B 3O2AA 1N04A 1B32A 2RF1A 1LCFA 1CE2A 3C32A 1JEVA 4BDMA 5I56B 2CZLA 2DE3A 4M1VA 1XS5A 2O84X 3KGCA 4KYSA 2FYIA 4H5FA 2M8CA 1LCTA 4LZ8A 2ANJA 4LQ2A 3SEWA 1JNFA 1MY1A 2QMWA 2I3VA 5AA3A 1R9QA 3M3LA 1VR5A 4H0WA 4BDOA 5J1DA 1USYH 3N6TA 5I56A 4H6DA 3RT6B 3OENA 1Y4TA 3U8QA 4MLVA 2DP8A 1EZOA 3TTLA 1AMFA 1NNTA 4U4XA 2H4IA 1MQJA 3RPWA 4IO7A 2Y7PA 3UN6A 4F3GA 1OIBA 5JTYB 1MQGA 2I4CA 4GRKA 2I4BA 3GLBA 1MXWA 4NF4B 3LSFB 1A54A 1II5A 1Y9UA 1B0HA 1VSOA 5EHSA 1Y1ZA 3IR1A 1JETA 3OD7A 1M5EA 1MY4A 3QAXA 1P99A 3MP8A 4X1DA 1L5TA 4F2QA 2ZYOA 1SW5A 5JK4A 4C1TA 4HCYA 1B3GA 5ELVA 3LBSA 1B2HA 4XKRA 1H44A 3MAMA 5I58B 1Y3NA 2CMOA 2FA7A 2B3FA 1ZU0A 4LA9A 4IY6A 4BDRA 3G3GA 3FASA 2OZZA 2Q89A 1VFEA 3LC8A 1Y3QA 3TTMA 2QJEA 3JZJA 2DWIA 4F18A 1US5A 5FHOA 3TQLA 4H5GA 3KOTA 3K1MA 1IQ7A 2QS3A 4O3AA 4RPNA 4FJPA 5K2YA 3KSXA 5H8HA 5I59A 3C4MA 3LUYA 1IXHA 4DXBA 5I58A 3D4CA 1B3LA 4I9DA 5H8NB 2XHDA 4EQBA 3FJGA 2H25A 4MFIA 4F1VA 4QSCA 2Q2CA 3ILTB 4NF6B 3IO4A 3T9XB 1KWHA 1NKXA 3T66A 4F3PA 1JW1A 2Z8EA 4KPTA 1IEJA 2XXVA 1B7HA 4PQJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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