4NEDA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with fenoprofen at 2.1 angstrom resolution
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal STRUCTURE OF C-LOBE OF BOVINE LACTOFERRIN COMPLEXED WITH FENOPROFEN AT 2.1 ANGSTROM RESOLUTION
rcsb
molecule tags Hydrolase
total genus 113
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2013-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nedA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nedA02
4HTGA 2XXWA 1I69A 1M5DA 4NF5B 4YU0A 3CR9A 2NXOA 3MZ1A 2OWSA 4PE5B 1A8EA 1HSEA 2QRYA 4BDNA 5FTIA 3PD8A 5IAIA 1MH4A 2YLNA 1AIVA 1UIVA 1EZ9A 2XXTA 3LBSA 3ILTB 3OEKA 3PUVE 3UIFA 1ZJLA 3USDA 4YKKA 2DXRA 2ZNSA 3Q26A 3FVOA 3O6GA 2DOJA 1B51A 3LR1A 3SEUA 3TZAA 3ZSFA 4GXAA 3L6GA 3DP8A 4FAJA 3FZVA 4M4GA 4YKPA 4QHQA 2YPNA 5F1QA 4NWDA 3FVNA 1US4A 3FUZA 4I9DA 3ZKLA 3CRBA 4G68B 4ZEBA 1MQIA 2DWAA 2WKYA 1A99A 3FV2A 3H6VA 2F36A 4ELPA 3MVYA 4XKQA 4AQ4A 3DP6A 4ISUA 4ZEDA 4YB7A 3HHGA 2UVJA 1B3FA 2XX7A 2DE4A 1VFEA 1DMBA 2Q9TA 4C1TA 3OO8A 5FHOA 3PPPA 3S9LC 4NF8B 2HXWA 1MPCA 4JWOA 1A55A 1CE2A 3ECRA 4GRKA 4YAHX 3H7MA 3MP6A 4GQOA 5AA1A 3K01A 1SVXB 4H5FA 4YZZA 3ILUB 4U21A 1MY2A 1NNPA 3ZKKA 3Q29A 2PVUA 4L17A 1Y9UA 3K6VA 3M8UA 1SW2A 5H8FB 5K2XA 3G3FA 1IIWA 2V84A 3G3HA 1Y3NA 4DCYA 1PEBA 1LBBA 5AA4A 1SI0A 4HW8A 3K4UA 2THIA 3H3GA 5ITPA 1NFTA 4RY1A 3QUFA 2OWTA 2UXAA 3TMGA 4POXA 1MPBA 1PB7A 3T9XB 1N7WA 5TU0A 1QULA 5H8QA 1EZPA 4YB5A 4C1UA 1B58A 4EQ9A 3EPEA 2NWJA 4DIGA 3FVKA 2XD2A 2RC9A 3MW0A 5H8HB 3W9VA 3N94A 4ELOA 4FATA 5EYFA 2YJPA 2H4IA 1EU8A 3E4RA 1SQYA 1JW1A 2HAVA 2KLFA 1VR5A 3E3KA 1T0KA 2GRVA 4IO2A 1GV8A 3TTNA 4HS7A 4U4XA 4QRZA 1KWHA 1ZIUA 3MP1A 5H8NA 4JSOA 2AL4A 3FASA 5CC2A 2G93A 2XX9A 2X26A 3TUSA 2ONRA 1ANFA 5IKBA 1DPPA 4G2ZA 4POWA 4YMAA 1IQ7A 3WAFA 1LB8A 1POY1 2XHDA 4UACA 1FW0A 3LUYA 5FHMA 4FEDA 1B3GA 4U23A 3VLVA 3QIMA 3GXAA 3FXQA 3EF7A 4OMBA 1TFDA 3CG1A 4Q8RA 1XHYA 2I3VA 3KBRA 1USYE 3Q25A 2GHBA 1TFAA 2Z23A 4MF3A 2XXYA 3TTMA 4KCDA 3C32A 2XXPA 3SEWA 4R2BA 1Y1MA 3PUXE 2ZNTA 2O69A 1A8FA 4Z7EA 4ZECA 4H67A 2ESNA 3K1PA 2QSXA 3VVDA 5CBRA 1LFIA 2D3IA 3BKIB 5TPAA 1UTHB 4YKJA 4C0RA 5AA2A 3GZGA 3OD7A 3K00A 3OSQA 3S9EA 3PPOA 1LAXA 4N13A 1O7TA 3I5OA 2ANJA 3RTWB 2DVZA 3EHSA 4Q30B 3KN3A 1TXFA 3OSRA 2REJA 3RUMA 3S4UA 3VXCA 5ITOA 4QSDA 3IO6A 2F97A 1O63A 2ZNUA 3JZJA 2UYEA 3S2VA 4OETA 4LA9A 3VLUA 1URGA 3KN8A 2ZXTA 4MFIA 4GF8A 1N76A 1DPEA 2Y7KA 5CMMA 5BWJA 4R75A 4WEPA 4UA8A 4F3BA 3MBPA 3TCFA 2A5TA 3IOWA 4KHZE 1LFGA 2F78A 1IEJA 2O84X 3N6UA 5DEXA 1F9BA 5AA3A 4FIMA 4U22A 3JV9A 1I6AA 2Z8FA 1ELJA 2DWIA 4IO7A 1PB8A 3KSJA 3TPAA 3FVGA 3FIRA 1GR2A 3IJOB 1UTBB 3P7IA 3MVXA 1US5A 4X9TA 1D3KA 1PBQA 3G3KA 4IY6A 3QK6A 1NMUA 1NH7A 2Y84A 5L9MA 4IO3A 3QYTA 1JVYA 1YCJA 1H76A 3T93B 5JEIA 4EF2A 1Y20A 1M5CA 3E9XA 3WAEA 4LP2B 4F1VA 2I4BA 2VHAA 1MXUA 2NUVA 4YMBA 3OXNA 4F3SA 3TYHA 2Y7WA 1URSA 1RYXA 5ICQA 1D9YA 3O9PA 4OFJA 3DELB 4NF6B 4GD5A 1EZOA 5DVFA 3U1OA 5J1DA 3KN7A 1NH8A 2F7AA 4KFQA 5JK4A 3FGSA 3IORA 5F7VA 3B6QA 2NOOA 4ELRA 4XIGQ 4F2OA 2D5WA 2VP1A 4ZEKA 1A7LA 5I58B 1JEVA 1QVSA 4NF8A 1MH3A 4ECFA 2H25A 3PPRA 2HCAA 3TFLA 1JW5A 3V5AA 1MPDA 1QJMA 3SESA 1MRPA 1ATGA 2G29A 4G4PA 1MDQA 3M3LA 1B0LA 4DLDA 3K2DA 1B4ZA 5KDTB 4FORA 3OO9A 1S50A 3IB0A 1OVBA 3RTFB 2IEEA 2I0CA 5H8FA 5I59B 4MLVA 5LOMA 4BDOA 4DE8A 5JTYB 3Q27A 1TWYA 4ZZAA 1BTJA 4BDMA 3RLFE 2QS2A 1LFHA 3ODBA 1MG1A 1M5BA 4LZ8A 1MXZA 4ESWA 4RPOA 2QMXA 1N3XA 4Q5TA 4P0IA 4AB6A 4ZZEA 3K6WA 3KJTA 2O1MA 3O97A 3PU5A 1MS7A 4ELQA 5BUUA 4XXUA 3O28A 3K6XA 2Z8DA 1FTOA 4F2QA 4LZ5A 1MXVA 1I6QA 3HPIA 2V93A 1B7UA 3R7XA 3TTLA 3C35A 2I58A 1PDAA 5TP9B 5L8DA 3DM0A 3BFTA 4P0GA 3IOVA 4LUBA 1A54A 3Q28A 2XX8A 1OLAA 3A3CA 4NMYA 4EQBA 1JEUA 2X7QA 4EXLA 2RCBA 3C36A 1N3WA 2DWHA 5CMBA 1HSJA 3VXBA 2D21A 3K02A 1YAEA 1Y4TA 4H0WA 2Z8EA 1MQJA 2HEUA 5KZTA 1EH3A 3V89B 3EHTA 4GWOA 4XTCQ 4KYSA 2GH9A 4RYAA 3H06B 4RXLA 2I3WA 3O2AA 4LQ2A 2VD2A 1MM7A 1P1QA 4JSDA 3UA8A 1WVJA 3EN3A 1Y4CA 1YTVA 2B3FA 2F35A 3KJ7A 1H44A 2ZYNA 1OIBA 1MQHA 5L9OA 4ONYA 3EQ1A 4PFUA 3MPKA 3MUQA 2QPQA 2F8DA 1XC1A 1P1UA 4QFPA 5AE4A 5I57A 2VOZA 3C9HA 4OXVA 3I3VA 2RC8A 1SDXA 5AA2D 4PP0A 2XXVA 4K3FA 1XVXA 1FTKA 2O6AA 5A5XB 4OQOA 3CFLA 2Q88A 4LONB 3BBRA 3CFXA 3TCHA 3KG2A 2H5YA 1WDNA 4H65A 1B52A 5H8SA 3U93A 2RC7A 4GL8A 1IXCA 1LCFA 4ESXA 4U2RA 4KD5A 2H99A 3SEXA 3OELA 4OERA 4OYVA 2FA7A 5CRYA 1BLFA 1MXWA 3T9HB 1MY3A 3B6TA 4H5GA 1FQBA 4RA1A 3KSXA 3H03A 5B7DA 2F7BA 3ONMA 3UGWA 1MY4A 4GXSB 2VD3A 4IGTA 3MWBA 1ZLQA 2V25A 3PUYE 1Z7ME 4KI0E 3PPNA 1MQDA 2ZYKA 3IAZA 1B2HA 2O68A 3G3JA 3V83A 4F22A 4OZ9A 1B6HA 2I48A 1FTJA 1MQGA 3H6WA 3RGYA 3V8XB 2Y7RA 5AA4B 2I49A 4BDRA 3RN8A 5I2KA 1MY0A 1IXIA 2P0SA 5KCJA 4NF4A 1GTKA 4AB5A 4JWYA 2P1SA 2AIXA 3N5LA 4BDLA 4QF9A 4M1VA 2V3UA 2I4CA 4R74A 3LSLA 1MXXA 3FD3A 1QUJA 4JXIA 3C34A 1L5TA 1PB9A 1POTA 1AL3A 2R71A 4H8JA 3UK4A 2UYFA 4QFNA 3K0VA 1N0TA 2HZLA 3PGFA 2RKMA 4JBZA 1SYHA 1PBPA 1FTLA 4JB7A 2ZYMA 2PT1A 3G7WA 3N26A 2OCUA 1LSTA 1B4HA 4F31B 1JETA 3TELA 1R1NA 2Y7IA 1LGBC 3KOSA 3I6VA 1B5JA 3K6UA 5FTHA 1J1NA 4IGRA 3JYRA 2F6PA 3OENA 2XXXA 5I56B 3MP8A 1MDP1 1DTZA 5DVIA 3OMBA 4F39A 4QFKA 2W7YA 4GLIA 3QUJA 2I0BA 1NL5A 3M3FA 3TCGA 3QSLA 3IJXB 4RK9A 2M8CA 4R73A 2Q2AA 5CM6A 4I1DA 5CMKA 1SW4A 1B7HA 4TQUQ 2Z22A 4N6PA 1FQDA 4DXBA 3SEYA 3MQ9A 1H3DA 4LATA 2DS9A 2O51A 2LAOA 3HV1A 3HCQA 3CSGA 4QFLA 3OO6A 1SW5A 3G3GA 3G3IA 2X7PA 5HBCA 1IXGA 4KQPA 4NF5A 2PX1A 3OO7A 2R9JA 2CZLA 4G68C 2UVGA 4LZ7A 4EXKA 2ZYOA 4XKNA 3D4GA 3RY3A 1Y1ZA 3TEPA 4KR5A 4GVOA 2Q89A 3VV5A 2R6GE 5KDTA 4R9GA 1QUKA 3B6WA 3MVZA 1ZBMA 1B1HA 1II5A 3W9WA 1TT1A 3VDFA 4YICA 4ZEFA 4Q0CA 4GIZA 1B3EA 3IB1A 2OK2A 4IO4A 4I62A 1B3LA 4GOTA 1FQCA 3S9NC 4G68A 4ZDMA 4R6YA 2FNCA 4R2FA 5CI5A 3C4MA 4MBPA 1SW1A 2Q8JA 2QJEA 1NNKA 1P99A 2GHAA 4WXJA 1UQWA 1OVTA 1SBPA 3CFZA 4OFLA 3LSXA 3EHUA 4ZE8A 2H9BA 4G77A 4F3GA 1PC3A 3GBAA 4OHNA 3E13X 1CB6A 5DEXB 5TP9A 5EHMA 3U92A 4LVQA 1N84A 1SD3A 4PFWA 2AL5A 4PETA 3MJNA 4O3CA 4OWDA 1VSOA 1R9LA 3FJ7A 4MH5A 5K2YA 1AH5A 1JNFA 2IA4A 3CIJA 1H43A 3AXFA 1DOTA 5I2NB 1A40A 1B3HA 4H6DA 2DWJA 3PMWA 4NWCA 4F29A 3THIA 1OLCA 1WODA 2OLBA 3HO7A 5ICTA 3O6IA 1N04A 4NTLA 3SETA 4H1XA 1SYIA 4PQJA 4PFYA 4TLLB 2F5XA 1VE4A 4FJPA 1XOCA 1ZTYA 2HQ0A 3HHFA 1USYH 2ZMBA 4THIA 2XXRA 2XXIA 1MXYA 4X1BA 5A5XA 2QMWA 1P1OA 5H8HA 1ZU0A 1Q35A 1M5EA 3U8QA 4EDPA 4OTEA 4PFTA 1B9JA 1FQFA 1LAHE 1P1NA 4KYEA 3HN0A 3TQWA 3DP4A 3UORA 4YKIA 1B5HA 5ISUA 4G8NA 5L9SA 2O7UA 3GBBA 3FXUA 4DXCA 3IO4A 3H4ZA 3TQLA 4ZS9A 3MZBA 2F6GA 3IL1B 4FEBA 1QKBA 5HM4B 4EUOA 1QUIA 3PUZE 2UVHA 2A5SA 2UVIA 2PYYA 4FECA 2B3BA 1D9VA 2PBWA 4BLAA 4JDFA 1D4NA 3O66A 3FATA 2O1LA 1NNFA 3VVFA 1B46A 2VGQA 1DTGA 4OEUA 4U4SA 1SI1A 3T66A 3K1MA 1JQFA 1RKMA 4HCWA 4KCCA 2QS4A 3C33A 1M5FA 2DP8A 4QSCA 2Q2CA 3PMXA 4BDQA 3C31A 4WKMA 3N6TA 1QW0A 4ND9A 4WEDA 4P11A 2RCAA 4MLQA 2F34A 3FV1A 1IUDA 3FJGA 3KFMA 2PMSA 4OENA 2XXUA 5CBSA 4F18A 4H8IA 2FYIA 1B1XA 2HAUA 3T22A 4QSEA 2E1SA 1UTHA 2ALUA 3IX1A 1ZMGA 5CMCA 2ONKE 1BP5A 2DQVA 3GLBA 2DVCA 4QFOA 1B05A 3H6UA 5I56A 2PT2A 2F7CA 3CG3A 3IB2A 1JW4A 4YB6A 2XXQA 3MVWA 1B0HA 3CSBA 3U72A 4U1ZA 1BIYA 1NNTA 4ZE9A 4R6KA 4RK2A 3O6HA 2CMOA 3FXRA 1VFDA 2V3TA 3M3KA 4ZEIA 3T9VA 2OJTA 1S9TA 1R6ZA 4RNSA 2I6EA 3TDJA 4KPTA 3IOTA 3CVGA 4OFOA 1B32A 4EQ7A 3TKDA 1N7XA 1OMPA 3LC8A 1XS5A 4NEDA 1HSLA 3TTKA 3UN6A 4X48A 3SKPA 3SEVA 4N07A 1MY1A 4R72A 5H8QB 2RINA 4E0XA 4DCXA 1Y3PA 3FJMA 5I57B 3LSFB 3MC2A 4IO5A 3IK6B 5DT6A 3CI8A 4X1DA 3KEIA 3BFUA 4EF1A 5I84A 2DSFA 2OBGA 4O3AA 1FTMA 3OOAA 1O64A 3O29A 3R6UA 1H45A 2O7IA 3K1NA 2XD3A 2ABHA 3SDFA 1UTBA 3VVEA 4R6HA 3W15C 4F19A 3KOTA 4JWXA 3T96B 1Q1KA 5FHNA 3IOUA 2DYXA 3HSTA 2GFEA 4TLMB 1NKXA 2DXYA 5HPQA 5H8NB 1UIUA 1MM6A 2RF1A 4Z0IA 1IITA 1XVYA 1QKAA 1B40A 1P1WA 2NVUB 1B5IA 3TODA 4DZ1A 3RQTA 1GGGA 1FQEA 2E0SA 1IZ1A 4I8CA 1LCTA 3L6HA 1GVCA 3TTRA 4R9FA 3T9UA 1Y3QA 3RNNA 1FQAA 4NE4A 3TAJA 5I2KB 3OEMA 3PMVA 1B7ZA 5KCJB 1ZKBA 4NF4B 3D4CA 1URDA 4RPNA 4NF6A 4KYDA 3RT8A 3ZS6A 4DXUA 1R9QA 5DVJA 3RPWA 2P2AA 1LBCA 3VFJA 1Z7NE 3PD9A 1DSNA 4G8MA 1LAGE 3U94A 3MAMA 3KGCA 2DE2A 5I58A 2QS3A 5DTBA 4IB2A 3PUWE 5M2VA 2DE3A 2REGA 1FCKA 2HFBA 4G8HA 4XKPA 3F11A 5TPAB 2HZKA 1S7YA 2ONSA 4OEVA 5AA2B 2BJJX 5DYHA 1BKAA 5B70A 5I59A 1AOVA 4E0WA 5JTYA 3R26A 1JVXA 2B65A 1LLSA 3S9MC 4RJZA 3RT6B 3LSWA 2XXHA 1OQGA 1RYOA 3VLWA 1OQHA 3DLNA 4XKRA 4OVJA 5I2NA 2OZZA 3QAXA 1I6BA 4GFRA 4IY5A 3H6TA 4HCYA 4GL0A 1LAFE 2V3QA 1AMFA 3PPQA 3MZ9A 3KZGA 4OESA 3PV0E 4FE8A 3A09A 3MPLA 2AYSA 3VE1B 4F1UA 1IXHA 2QL3A 2H98A 4F3PA 3UP9A 3B7DA 1LB9A 4LQ5A 2QS1A 2A5TB 4DDDA 4O3BA 3QXMA 4F1YA 5EHSA 3A3UA 1YPNA 3SERA 3IR1A 5ELVA 4IO6A 2Y7PA 4U1OA 1XT8A 4TOZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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