4NF5A

Crystal structure of glun1/glun2a ligand-binding domain in complex with glycine and d-ap5
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
283
structure length
272
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Insights into Competitive Antagonism in NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
total genus 80
structure length 272
sequence length 283
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf5A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf5A02
2ZYOA 3H6TA 4QFPA 4HTGA 3PMWA 3ZKLA 4NMYA 1SD3A 3TEPA 3PPQA 4OXVA 1N3XA 5AE4A 2DE3A 2OCUA 2OZZA 1QW0A 4JSDA 5FTIA 3QIMA 3PPPA 3O29A 5JK4A 3JZJA 4ZEKA 4NF8A 1Z7NE 4F3BA 4F3GA 3FXRA 2HZLA 1JETA 2XD2A 3H4ZA 4NF5B 4R6KA 3OO9A 2DYXA 4PETA 2FA7A 3C34A 3W15C 3H3GA 1Q35A 1Y9UA 5HBCA 4RPOA 3DP6A 1YTVA 2V25A 4GXAA 4NF4B 1QKAA 3G3FA 2OJTA 2RC8A 5L9MA 1MY2A 1XOCA 4AQ4A 3FVNA 1H43A 3OO6A 3UIFA 3FJ7A 3DM0A 4WEPA 4LQ5A 4U1OA 1A40A 3IB0A 2F6GA 1H45A 3KN8A 3S9NC 4IO3A 1DSNA 5KDTA 4XKRA 4XKPA 3VXCA 3O6HA 2DP8A 3VVDA 1FTJA 5JTYB 1DTZA 4ONYA 1N76A 4U2RA 5AA4B 2V3TA 3VLUA 3ILTB 3HCQA 3K6VA 4ND9A 1N7WA 2O69A 3D4GA 3CIJA 1HSJA 2O84X 2UVHA 4QF9A 4R2BA 1B5HA 3ZSFA 3Q28A 2D5WA 1FTOA 3KOSA 2PBWA 4LATA 3IX1A 4GFRA 3LSFB 1LB8A 4R75A 1MXXA 2W7YA 1PC3A 3U94A 2XXYA 4PFUA 4LQ2A 3A3UA 3KBRA 2D3IA 3V5AA 1LCFA 4QSEA 4XKNA 5EHSA 1A54A 3FIRA 1IIWA 3LSXA 2KLFA 3T22A 2B65A 4EDPA 1VSOA 4ZEBA 3E9XA 1OQGA 1JEVA 1VFEA 3G3JA 2HZKA 5I2KB 2DQVA 3PUWE 4ISUA 2ABHA 4TLLB 2HCAA 1ATGA 3HN0A 1P1QA 4Q0CA 4KFQA 5CC2A 4R6HA 2Y7KA 5I2NB 3TKDA 5KZTA 3OD7A 3MC2A 1B6HA 4BLAA 5FHOA 1A8EA 3RLFE 1LCTA 4NF5A 3C4MA 1US4A 3CRBA 3VVFA 1NH8A 3N26A 2DS9A 1AMFA 3H6WA 4QHQA 3H6UA 3ZS6A 4RJZA 2XXRA 4EQ9A 4ZEIA 1TWYA 2Y7PA 1EZ9A 3TQWA 4AB6A 2HEUA 1ZBMA 3B6TA 2OBGA 3C9HA 3RY3A 4Z7EA 2VHAA 3G3KA 3JYRA 4XIGQ 3BFUA 3SEUA 4H5FA 4F31B 5DVFA 2I0BA 4DDDA 2YJPA 5H8FB 1BIYA 3VE1B 2UVJA 4TQUQ 2NXOA 5H8HB 3ECRA 3MVZA 2NWJA 4LZ7A 1S9TA 1PB7A 4OFJA 5K2XA 2G93A 1VR5A 5JTYA 1Y20A 5AA4A 2ONRA 3FASA 2I49A 3N5LA 4DE8A 4OHNA 5LOMA 1R1NA 1TXFA 2VD3A 4F39A 3MWBA 4U23A 1B58A 2NOOA 3FV1A 3IO6A 1MPDA 1JVXA 4F29A 1ELJA 1MS7A 3BKIB 2DWIA 4KD5A 3M3FA 4OWDA 2PVUA 2QS4A 3Q29A 4U4XA 1OLCA 3V83A 2QJEA 1Y4TA 1BKAA 3MBPA 1MPBA 4G2ZA 4LUBA 4P0GA 5BUUA 4FE8A 1OVTA 4ELRA 4YKJA 3OMBA 4BDRA 4M1VA 2H99A 3WAFA 2A5TB 3RT6B 4OESA 1GR2A 1GV8A 1O64A 4IY6A 1NL5A 3CSGA 3LR1A 2HAUA 5I2KA 4N13A 1JQFA 3T9XB 2GHAA 4P0IA 1LBBA 4QFOA 1LAHE 3O6GA 3G3IA 1B5IA 2P1SA 5KCJB 4KQPA 1LSTA 3N94A 4GVOA 4IO6A 4F22A 2Y7IA 4MBPA 1Q1KA 5TP9B 2UVGA 4PE5B 2H9BA 2F5XA 2DXRA 4H6DA 2RC7A 3FVKA 4G8HA 1B0LA 3AXFA 3VDFA 4RPNA 4JB7A 4ZEDA 2X26A 1CB6A 1P1NA 3PUXE 3H03A 4OFLA 1MY4A 5B7DA 1B0HA 5H8NB 2RKMA 1MXYA 4XKQA 4IO7A 2UYFA 1BTJA 4MLVA 4FEDA 2ZMBA 1NNPA 1ANFA 1XVYA 1MRPA 1TFDA 3IOWA 4JWXA 1B32A 1N7XA 2RINA 1JEUA 1B3EA 3FVOA 3K1MA 2Y7WA 2B3FA 4RK9A 2AL5A 1I6AA 4MF3A 2VGQA 2XXVA 4KHZE 1IITA 1AH5A 5DYHA 4GF8A 4FEBA 5I84A 4LZ8A 3HSTA 3O97A 1YAEA 3TTLA 5A5XA 1USYH 3U72A 4I1DA 5TPAB 3LBSA 2F7BA 3MJNA 2QPQA 1KWHA 1M5BA 3OO8A 3WAEA 3RQTA 4PFWA 5AA2B 1SYIA 1M5CA 1ZKBA 3KEIA 1FQFA 1R6ZA 3JV9A 4IY5A 4U1ZA 1XVXA 2E0SA 3SESA 3T9UA 4F1VA 1H3DA 4YMBA 5AA2D 2RCAA 2A5TA 1IZ1A 4M4GA 1P1OA 3IOVA 2XX9A 5IAIA 5ISUA 3I6VA 3FJMA 3TDJA 1IUDA 2ZNTA 3E13X 2O51A 3MVYA 4QSCA 2Q2AA 4OFOA 4DIGA 4O3BA 1GGGA 1M5DA 2ZYNA 2O1LA 3IJXB 4GQOA 5I57B 3FV2A 1EU8A 4F2OA 1FTLA 4RA1A 1SW5A 2Q9TA 1WODA 2LAOA 4IO5A 5KCJA 1MQIA 3TZAA 4EF2A 1VFDA 1T0KA 3V8XB 3TCFA 1P1UA 3C33A 5TP9A 3LSLA 2DVZA 2DE2A 5I58B 2I4CA 2R6GE 3MVXA 5DTBA 1N04A 1EZPA 2V3QA 4G8NA 4AB5A 4X48A 4JXIA 3UP9A 3K6XA 4ZECA 3PUVE 1LBCA 4H67A 2DE4A 3TTMA 4HW8A 2Q2CA 4G4PA 1B3LA 2ZYKA 3Q26A 2ONKE 4GL0A 1XT8A 5CMKA 4WXJA 2XD3A 3UA8A 1QUIA 3N6UA 4OMBA 3RTFB 3MVWA 4F3SA 3QYTA 1UTBB 1PBQA 2XXIA 1M5FA 5H8QB 2Q89A 3H7MA 1SYHA 4OVJA 5CBRA 2REJA 1LFGA 1URGA 4RNSA 1H44A 2XX7A 1B3GA 1TT1A 1JNFA 4C1UA 3MP6A 1IXCA 3OELA 2CMOA 2DOJA 4KYDA 1MY1A 1IXGA 3C36A 3QXMA 3EHSA 1MY0A 3KSXA 1HSLA 4LZ5A 2O1MA 3SKPA 2I4BA 1BLFA 4U22A 4RK2A 2ZNSA 4R72A 5TPAA 1Y4CA 4HS7A 1J1NA 2O7IA 3TUSA 3U92A 2XXTA 4FORA 1FQCA 4FECA 1OVBA 3KN7A 5AA2A 3MP8A 4NF6B 4BDLA 3K2DA 3HV1A 2PT1A 4WEDA 1LAXA 4QRZA 1VE4A 4ELOA 1NNKA 2I3VA 4GIZA 4QFKA 4GOTA 1NKXA 1NMUA 4TLMB 3SETA 1FTKA 3KJ7A 2H5YA 2H25A 1RYOA 4G68C 4N07A 3K00A 1MPCA 3K6UA 3FXUA 4ZEFA 1S50A 3CG3A 4F2QA 3UN6A 3VV5A 1CE2A 4MLQA 4NF4A 1ZIUA 3TODA 2QL3A 1YCJA 5I57A 3IORA 4NEDA 3SEXA 1JW5A 5ITPA 3VXBA 4HCWA 1MM6A 1MH3A 1URDA 1PB8A 2I0CA 4H8JA 3KN3A 1ZJLA 4TOZA 4F1UA 1FTMA 3USDA 5I58A 2F34A 2O7UA 2AIXA 5CI5A 1L5TA 4YMAA 3CR9A 3K4UA 1IXHA 2CZLA 4I62A 3C35A 1A99A 1A55A 1AOVA 3RT8A 4XTCQ 1WVJA 4KYEA 1MH4A 1NNFA 5EYFA 3IAZA 3B7DA 2OLBA 1URSA 5HPQA 1SVXB 2F35A 3S9LC 3R6UA 3CSBA 4KCCA 2F78A 1UTBA 3THIA 3PD9A 1LGBC 4ECFA 4XXUA 5H8QA 4F18A 1JW1A 3FD3A 1MQHA 3HHFA 2V84A 4JBZA 2DSFA 5CBSA 3GBAA 2XXWA 3BFTA 5FHNA 4LVQA 1FCKA 2Z8DA 5DVJA 4I8CA 1B52A 2XXQA 2RC9A 4ELQA 3N6TA 1QJMA 3IR1A 2D21A 2Q8JA 3O2AA 2M8CA 4KCDA 2ZYMA 3DP8A 3KFMA 4GLIA 2F8DA 1YPNA 3TTKA 3MQ9A 2HXWA 1Y1MA 3PPRA 4U4SA 4BDMA 4DXBA 3RPWA 3SDFA 4THIA 2PYYA 3KGCA 2ONSA 5TU0A 4IGTA 1OQHA 3F11A 4OQOA 3W9VA 4NF6A 2GFEA 5I2NA 1OMPA 3KZGA 1B05A 1B9JA 4ESWA 2QMWA 4OZ9A 1MDP1 2ESNA 2WKYA 2XXPA 5ELVA 4FAJA 5I56B 3H06B 3OENA 4DLDA 4K3FA 5H8SA 1SI0A 1LLSA 2UVIA 2GH9A 3FXQA 1I6BA 3S9EA 2P0SA 2F97A 3CG1A 4RY1A 1POY1 3TTNA 2B3BA 2PMSA 1GTKA 1AIVA 3VLVA 2REGA 3H6VA 3FVGA 3DELB 3IB2A 3MW0A 1QUKA 1RYXA 4DXCA 3C31A 4LP2B 4NWDA 2OWSA 1D4NA 4ZE8A 1BP5A 1XHYA 5L9SA 5H8FA 3ODBA 3VLWA 4WKMA 1USYE 5H8HA 1MM7A 2H4IA 3R26A 1OLAA 4IGRA 3W9WA 1D9YA 3HHGA 4EQ7A 3GLBA 1POTA 4RYAA 3S4UA 5CRYA 1B4ZA 3T9VA 1EZOA 3OO7A 4ZE9A 1B7HA 3ZKKA 3Q27A 3FJGA 1PB9A 2BJJX 2DWJA 3E4RA 4YKPA 2FNCA 4KYSA 4GRKA 3L6GA 3OSQA 2RF1A 3G3HA 3TQLA 4BDOA 1Z7ME 1SQYA 2Z8FA 3MUQA 5F7VA 4PFTA 2I3WA 1MXVA 1B2HA 1P99A 3EF7A 1DMBA 3FATA 2E1SA 3B6WA 2O6AA 1JVYA 2R71A 3K02A 4NE4A 3T96B 1B46A 1LB9A 4Q5TA 1LAGE 2Y7RA 2UYEA 3HPIA 1A7LA 1MXWA 1H76A 4R6YA 4NTLA 3UORA 3MZ1A 1UTHB 3IOTA 1SW1A 4YU0A 3U93A 1PDAA 3LSWA 3FGSA 3EN3A 4YICA 2ALUA 4IO2A 2ZXTA 3K01A 2NVUB 3R7XA 1TFAA 3OOAA 1WDNA 1QVSA 2OWTA 2R9JA 3C32A 4Z0IA 3PGFA 1R9LA 3EHUA 4H5GA 4E0XA 2XHDA 1JW4A 3O6IA 1US5A 4QFLA 4L17A 1UIVA 3LC8A 4FJPA 5I56A 2THIA 3TCGA 2DVCA 3LUYA 5JEIA 3I5OA 3G7WA 4ZZEA 1SDXA 2I58A 3PD8A 1B4HA 3IK6B 2Y84A 5DEXB 4OYVA 5EHMA 1HSEA 3BBRA 4RXLA 1Y3QA 1A8FA 1FW0A 3A09A 2X7QA 3ILUB 1MDQA 4O3AA 5IKBA 1AL3A 4GD5A 5H8NA 4OTEA 1SI1A 3L6HA 3KOTA 3O28A 2DXYA 3S9MC 4UA8A 1MG1A 3VVEA 1SW2A 5BWJA 4DXUA 1LFIA 1ZLQA 3UK4A 4OERA 3TFLA 2RCBA 3M8UA 4YB5A 2UXAA 2O68A 2QMXA 1N3WA 2I48A 3PPNA 2F7CA 4X9TA 1NH7A 2YLNA 3HO7A 1B7ZA 4R9FA 1B3HA 4QSDA 1IEJA 4PFYA 4YZZA 3MZ9A 1Y3NA 2QSXA 3UGWA 3PUZE 2DWHA 3TAJA 4MH5A 1MQDA 1B51A 1B7UA 4JSOA 2IEEA 3TYHA 4H8IA 4EXLA 2G29A 2HQ0A 4R73A 5CMCA 1MXUA 4ZS9A 1MQGA 5FHMA 3A3CA 4I9DA 3PPOA 4YKKA 2XXUA 2V3UA 3KSJA 4YAHX 3RGYA 2QS3A 3EPEA 4YB7A 4EXKA 3MPLA 3OXNA 1PBPA 5DT6A 1DPPA 3PUYE 4C1TA 3M3LA 2X7PA 4ZDMA 1R9QA 3FUZA 4POWA 2P2AA 2V93A 4MFIA 1B1XA 1UTHA 4BDQA 1FQAA 1SW4A 4KR5A 3PMVA 5ICQA 3TCHA 4EF1A 3TTRA 4OETA 2HFBA 1MY3A 2GRVA 4F1YA 3PMXA 1Y3PA 1EH3A 4QFNA 3B6QA 3OEKA 2VOZA 4PQJA 4E0WA 3QUJA 3VFJA 5DVIA 1N0TA 4YB6A 3OSRA 4Q8RA 1I6QA 3CI8A 5K2YA 1N84A 3TPAA 5CM6A 4OEUA 5ICTA 3PU5A 4PP0A 2QS2A 3GBBA 2GHBA 3U1OA 5DEXA 3O66A 5I59B 1LAFE 3FZVA 3I3VA 4BDNA 3SEYA 3K0VA 2OK2A 5AA3A 4EUOA 4FIMA 1ZMGA 3QK6A 5L9OA 2F6PA 1XC1A 2Q88A 1MXZA 5J1DA 1I69A 4UACA 1DTGA 3O9PA 1P1WA 4DCYA 1B40A 2XXXA 3K1NA 4JWYA 5M2VA 2PT2A 3MAMA 4OENA 1QULA 4C0RA 5HM4B 3D4CA 4N6PA 3QSLA 4JWOA 2XX8A 5A5XB 3RUMA 4DZ1A 4GL8A 4G68B 4EQBA 4R2FA 5L8DA 4DCXA 4KPTA 4ESXA 2IA4A 4NWCA 3CFLA 4GWOA 4F3PA 1ZU0A 1QUJA 1UQWA 3T66A 2ZNUA 1PEBA 4ZZAA 3V89B 3SERA 2HAVA 4ELPA 2AL4A 4NF8B 3T93B 1D9VA 2DWAA 4U21A 3K6WA 3CFZA 1QKBA 2VD2A 1Y1ZA 3GZGA 1F9BA 3S2VA 1NFTA 3K1PA 4POXA 1LFHA 3TELA 3QAXA 3IJOB 2XXHA 1IXIA 1M5EA 1B5JA 1II5A 4KI0E 4O3CA 3MP1A 4FATA 3PV0E 1ZTYA 5F1QA 4LA9A 1XS5A 3Q25A 3MPKA 1O7TA 4LONB 5B70A 4P11A 1FQDA 1D3KA 4H65A 3M3KA 4OEVA 2H98A 2F7AA 2FYIA 1DPEA 2NUVA 1OIBA 3GXAA 1DOTA 1UIUA 5CMMA 3U8QA 5KDTB 3IB1A 2YPNA 3G3GA 1FQBA 2Z22A 3TMGA 3ONMA 4R74A 3KG2A 1S7YA 3DP4A 5FTHA 3OEMA 4Q30B 2I6EA 3QUFA 1GVCA 4G77A 4JDFA 3KJTA 4H1XA 3RNNA 4IO4A 3IOUA 4IB2A 3RTWB 5ITOA 3RN8A 4X1DA 2AYSA 3P7IA 1RKMA 3SEVA 1FQEA 3DLNA 5I59A 5CMBA 2A5SA 2VP1A 3EQ1A 1IQ7A 3IO4A 4H0WA 2PX1A 1B1HA 2QS1A 3T9HB 2ANJA 3E3KA 2F36A 3EHTA 3MZBA 1O63A 4R9GA 3SEWA 2QRYA 2Z23A 4F19A 4YKIA 1NNTA 1B3FA 3IL1B 5AA1A 1SBPA 4X1BA 4G8MA 4HCYA 3CFXA 4GXSB 3CVGA 1MQJA 2Z8EA 4G68A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZYOA 3H6TA 4QFPA 4HTGA 3PMWA 3ZKLA 4MJOA 4NMYA 1SD3A 3TEPA 3PPQA 4OXVA 1FBHA 1N3XA 5AE4A 2DE3A 2OCUA 2OZZA 1RDYA 1EYJA 1QW0A 4PAFA 1FBFA 2BJIA 4JSDA 5FTIA 3QIMA 3PPPA 3O29A 5IZ3B 5JK4A 3JZJA 4ZEKA 4NF8A 1IMBA 1Z7NE 4F3BA 1NV5A 4F3GA 3FXRA 2HZLA 1JETA 2XD2A 3H4ZA 4NF5B 4R6KA 3OO9A 2DYXA 4PETA 2FA7A 3C34A 3W15C 3H3GA 1Q35A 1Y9UA 5HBCA 4RPOA 3DP6A 1YTVA 2V25A 4GXAA 4MCOA 4LN5A 3MYUA 4NF4B 1QKAA 4PE3A 3G3FA 2OJTA 2RC8A 2P3VA 5L9MA 1MY2A 1LBXA 5ET7A 1FPKA 1XOCA 4AQ4A 3FVNA 1H43A 3OO6A 3UIFA 3FJ7A 3DM0A 4PFRA 4WEPA 4LQ5A 1LBVA 4U1OA 1A40A 3IB0A 2F6GA 1FTAA 1H45A 3KN8A 4N15A 3S9NC 2ZZWA 4IO3A 1DSNA 4MNIA 5KDTA 4XKRA 4XKPA 3VXCA 3O6HA 2DP8A 3VVDA 1FTJA 5JTYB 1DTZA 4HXVA 4ONYA 1N76A 4U2RA 5AA4B 2V3TA 3VLUA 3ILTB 3HCQA 4NF0A 3K6VA 4ND9A 4N4UA 1FPIA 1N7WA 2O69A 3D4GA 3CIJA 1HSJA 2O84X 2UVHA 4QF9A 4R2BA 1B5HA 3ZSFA 3Q28A 2D5WA 1FTOA 3KOSA 4PF8A 2PBWA 4LATA 3IX1A 4GFRA 3LSFB 1LB8A 4R75A 1MXXA 1IMDA 1G0IA 2W7YA 1PC3A 3U94A 2KQZA 2XXYA 4PFUA 3QMFA 1AWBA 4LQ2A 3A3UA 3KBRA 2D3IA 3V5AA 1LCFA 4QSEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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