4NF6A

Crystal structure of glun1/glun2a ligand-binding domain in complex with glycine and ppda
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
287
structure length
278
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Insights into Competitive Antagonism in NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
total genus 82
structure length 278
sequence length 287
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf6A02
3PMXA 4NF8A 4XKNA 1SVXB 1S7YA 5H8HB 3L6GA 4G68A 3ONMA 3A09A 4ZEKA 2E1SA 3DM0A 5F7VA 5L9OA 4IO5A 2Z8FA 2XXIA 3PMWA 4GFRA 4NF5A 2DE3A 2ZYNA 1QKBA 4PFTA 1BTJA 4QSEA 3K6XA 3QUJA 4YMBA 3B6WA 2P0SA 4R9FA 1IXHA 4PETA 2XD2A 1XS5A 3CRBA 3MAMA 4YKJA 3FZVA 1PBPA 2DSFA 1N0TA 3OMBA 3K6WA 4H6DA 4WEPA 4BDMA 4JWXA 2B3BA 2XX9A 4ESWA 2M8CA 4U1OA 2O7IA 3F11A 2QL3A 4N07A 3IJXB 3W9WA 5KCJA 3H6UA 1Y20A 1A8EA 3R6UA 1FQDA 1MQGA 3SEUA 3HHGA 3IR1A 1IEJA 4JSOA 1VE4A 4NEDA 1JW4A 3CI8A 5DEXB 1SW2A 1JVYA 3TCHA 2F35A 1LAXA 4TOZA 1XHYA 4MF3A 4ZEFA 3MWBA 4U23A 5I56B 1TXFA 3V8XB 4KYEA 3EN3A 1URSA 3CR9A 1B1HA 2CMOA 2ZNUA 2Y7KA 1N7XA 3THIA 4FORA 3M8UA 2ZNSA 4PFUA 5EHSA 3CVGA 3FVNA 4NF8B 3MVXA 4NMYA 4R73A 3C31A 4G68B 3SETA 4GQOA 3E13X 3TTLA 4F1YA 3TMGA 1MXZA 2R9JA 2F7AA 3MQ9A 4NF5B 4GRKA 5CRYA 1DPEA 3KFMA 3O66A 4KCCA 5FHNA 1NH8A 1OQGA 1OLAA 3LSXA 4OFOA 4LZ7A 2DQVA 3O6GA 4EXKA 1P99A 3C36A 1UTBA 3RTFB 2OK2A 3OO8A 3U94A 3TTNA 4FATA 2A5TA 1QUJA 1UQWA 5H8NA 3O6IA 1PB7A 4R2BA 5A5XA 4OEUA 2QRYA 2VHAA 4JBZA 4BDNA 3PPOA 2Z8DA 3TDJA 2ZMBA 3FV1A 3UIFA 4FECA 2O51A 2VD2A 2VGQA 1TFAA 2B3FA 1JEVA 2G93A 5L8DA 4C0RA 3KZGA 5KCJB 1MXXA 4PFWA 1XT8A 1GR2A 4GWOA 3KN8A 4K3FA 5M2VA 4YKKA 5B70A 2VD3A 3IL1B 1ZJLA 2Z22A 4OESA 3N6UA 3MZ1A 3S4UA 1UIUA 3LSWA 3FXRA 4KHZE 4JXIA 1O7TA 2RCBA 2QS3A 3IAZA 1L5TA 1VFDA 4G8NA 1URGA 4I1DA 1JQFA 1B5IA 1B3HA 4M4GA 3PUYE 4BDOA 5FHMA 4NTLA 2Z8EA 4TLLB 3MJNA 1MPDA 3SEXA 3KJTA 2H4IA 1LFHA 2UYFA 4H5FA 2DVZA 4IO3A 3T9HB 4AB6A 1T0KA 3KN7A 3FATA 5CMMA 1FQEA 1H76A 1IXCA 4ZECA 5KDTA 2G29A 3L6HA 1H43A 5CMCA 1H44A 2E0SA 2OWTA 4Q5TA 4ELOA 4DZ1A 1FW0A 3H06B 3CSGA 1B5HA 5CM6A 1NNFA 2Q9TA 4X1DA 4YZZA 3RY3A 1QUKA 1SD3A 1LB8A 1BP5A 4RK9A 1S9TA 5I57A 1UTBB 4ONYA 1I69A 4FJPA 2A5TB 5H8NB 4LZ5A 5A5XB 3FVOA 3QAXA 3OO6A 1MQHA 1FTLA 3OEMA 1B0LA 4OWDA 4MH5A 1MPCA 2W7YA 4AQ4A 1FTJA 1RYXA 1R6ZA 1MH4A 3A3CA 3G3HA 1OQHA 1MXVA 2NUVA 2XXRA 2O84X 5DT6A 4KYDA 5H8FB 3VV5A 3QIMA 5DTBA 2CZLA 5IAIA 3TCFA 1M5CA 1P1QA 2DVCA 4R9GA 1Y1ZA 2ZYOA 3BBRA 4G68C 3O2AA 3U92A 1AMFA 1MM7A 3UN6A 5JEIA 2FA7A 3KJ7A 1N76A 5HBCA 2F5XA 2OZZA 1NH7A 2RKMA 2BJJX 3T96B 1YTVA 5FTHA 4BDQA 3MP8A 3FXQA 4EQ7A 4QFOA 4WEDA 3AXFA 4YU0A 1O64A 1ZTYA 1FQCA 4I62A 5ISUA 3H3GA 2PT1A 4ZEDA 4POWA 1M5DA 1FTKA 1Y4CA 5AA4A 5KDTB 3PPPA 1FQBA 1R9QA 1FTOA 4NWCA 4EQ9A 4IO4A 5DVFA 1MPBA 1XVXA 3OXNA 5CBRA 2XXHA 2Q2CA 3VXCA 1BKAA 4UACA 2OJTA 4MBPA 3T22A 4O3AA 5JK4A 4F3GA 4OENA 4F3PA 4G8HA 5I58A 1NMUA 4ZZAA 4TQUQ 3T9VA 4NE4A 1B46A 4M1VA 5EYFA 5I57B 1N7WA 3R26A 3VVEA 1Y1MA 1A54A 4ZE9A 1DMBA 4H67A 4OVJA 4DXUA 3IK6B 4G8MA 1TT1A 4XTCQ 2F7BA 5BWJA 2F6PA 3OELA 1OVBA 4LA9A 3SDFA 3M3LA 2Q2AA 1B32A 1IZ1A 1MQDA 3I3VA 1QVSA 2P1SA 3EPEA 2Q8JA 3IORA 3N94A 2GFEA 1P1NA 3K2DA 3BFTA 3GZGA 1B9JA 1J1NA 2GRVA 3KBRA 5AA3A 3G3IA 3Q29A 4KCDA 1BIYA 3IO6A 3HHFA 1Y4TA 5TPAA 3Q26A 4RYAA 4GD5A 5TU0A 3ZKKA 3MBPA 2XX7A 3UA8A 4GXAA 3WAEA 3MPLA 3I5OA 3B7DA 1Y9UA 2HEUA 2QJEA 3TQWA 1ZIUA 5HPQA 1H45A 4LP2B 3MPKA 2A5SA 1TFDA 1B05A 1IUDA 5AA4B 2I3WA 4XKPA 4IO6A 4LONB 3KGCA 1AH5A 4XIGQ 4IO7A 4HS7A 4U2RA 1B40A 1B3FA 5K2YA 2D3IA 3HN0A 3H6WA 2I3VA 3RUMA 1A55A 3K01A 3VLUA 1N3XA 4YMAA 4LVQA 3H6TA 3PUZE 4HCWA 5I58B 4G4PA 4QRZA 1MXUA 3FJGA 4GL8A 4H8IA 1XVYA 4ZDMA 3T93B 3PUWE 1OMPA 2NOOA 3OO7A 3MVWA 2D5WA 2QS4A 3V83A 2XHDA 4YKIA 3C9HA 4F2QA 1ZMGA 2DWJA 3ILTB 4GLIA 4P11A 2XXTA 4MFIA 4LZ8A 5AA2D 3PGFA 2QSXA 2NVUB 2F97A 1JNFA 3K6VA 3H03A 3LSFB 4U21A 4GL0A 4GIZA 4F1VA 2Y7IA 4C1UA 1MY4A 3RT6B 3IO4A 2OLBA 4LQ5A 3K02A 1AOVA 4UA8A 3C32A 4BDRA 4I8CA 2V93A 4EQBA 4NF4A 4G2ZA 2RC8A 3U72A 3ZSFA 4ZZEA 3MP6A 5TPAB 4OFJA 2DP8A 3EHTA 1S50A 1TWYA 1PDAA 2H99A 1AL3A 2V25A 1NKXA 4H5GA 1II5A 2O1MA 4OTEA 3T66A 2VOZA 1LBBA 4X9TA 4R75A 3S2VA 4FAJA 3ZKLA 1OIBA 2DYXA 3CFZA 3OOAA 1Y3NA 4OETA 1N3WA 4U22A 4IGRA 1N04A 3FIRA 3PV0E 1IQ7A 4QFNA 2UVIA 5IKBA 1QULA 1B7UA 2V3TA 2O6AA 3DP8A 4XKRA 4U1ZA 2WKYA 1NFTA 4ZE8A 1DTZA 5EHMA 1SW4A 1O63A 2XXQA 2QMWA 2THIA 4DDDA 3DELB 3G7WA 3C35A 3BKIB 4FIMA 1WDNA 1QJMA 4QFKA 4MLQA 1ZLQA 3FJMA 3LUYA 3QYTA 5H8FA 2DWIA 1SYIA 3DP6A 4DCYA 2I4BA 5CBSA 4N13A 4ELQA 4JB7A 4F3SA 3PPNA 2UYEA 4N6PA 1USYE 3PU5A 1POY1 3TEPA 1EZOA 1RYOA 2NWJA 3KSXA 4THIA 1B4ZA 4IB2A 1A7LA 4RJZA 1MH3A 4GF8A 1MQJA 4Z0IA 4DXBA 4QFLA 1VSOA 1PEBA 2I6EA 1MQIA 3O28A 3RN8A 3MP1A 4EF1A 4NF4B 4OXVA 3TZAA 1B52A 3KEIA 1B5JA 2ALUA 2DE2A 4R74A 3TELA 1HSJA 3CG1A 1IIWA 3T9UA 2PYYA 2Q88A 3TTMA 3CFLA 3CFXA 3CIJA 4OERA 3IJOB 1H3DA 1LFIA 3C4MA 3JYRA 2X7QA 2QS1A 4R2FA 5CC2A 3G3FA 1SW5A 4L17A 4NF6A 4GXSB 3CG3A 3EF7A 2ZXTA 3LBSA 5H8SA 4H65A 4QHQA 2DE4A 2QPQA 2RCAA 3IOVA 4X48A 3K0VA 3Q27A 3OSQA 4IY5A 1LGBC 4BDLA 3SEWA 2F7CA 2IA4A 4X1BA 4Q30B 3TCGA 3N6TA 2I58A 4F3BA 1MY3A 2PMSA 4WKMA 2XXYA 2DWHA 2HZLA 3LR1A 3S9LC 1US4A 1USYH 3A3UA 4ZS9A 2F8DA 1JW1A 2PVUA 4YAHX 3RPWA 1XOCA 1VR5A 3VLWA 1Z7NE 2PX1A 3OEKA 4Q8RA 3TYHA 3SERA 5I2KA 2H25A 4H8JA 3H4ZA 2GHBA 3HO7A 3TTRA 4P0GA 3FVKA 2YJPA 2F6GA 3K4UA 1MDP1 3N26A 5B7DA 3SESA 4DCXA 1A99A 2UXAA 4IO2A 3KSJA 3MC2A 3V89B 1ATGA 4QF9A 4R72A 3MVYA 3G3KA 1PB9A 2REJA 5JTYA 2I48A 4FEDA 2XXUA 4NF6B 2Y7RA 3SEVA 1MXWA 3EHSA 2HAUA 1AIVA 4AB5A 3UP9A 1LB9A 3FUZA 1MDQA 3KOSA 5DVJA 1JEUA 1ZBMA 3O6HA 3WAFA 3IX1A 3KG2A 1B3GA 4DXCA 3O97A 4QSCA 5CMKA 4IGTA 4HW8A 4RK2A 2DXYA 1SI1A 3MZBA 2AYSA 3ODBA 1WODA 4O3BA 1MRPA 1A8FA 4EUOA 4ELPA 1OVTA 4JWYA 3VE1B 4F2OA 3G3GA 4YB6A 2KLFA 4RA1A 5FHOA 2ZYKA 3TAJA 4Z7EA 4KD5A 1MY2A 1Q35A 1QUIA 4DIGA 5DYHA 1IITA 5I2KB 4ZEBA 1NNTA 1XC1A 3R7XA 1MS7A 1FQAA 5L9MA 4HCYA 3M3KA 3ILUB 5AA2A 1POTA 4HTGA 3PMVA 2HCAA 1B0HA 3KOTA 1ZKBA 5FTIA 1GTKA 4ELRA 3E3KA 4QSDA 5TP9A 1KWHA 4F39A 1EH3A 2H9BA 1I6AA 1DTGA 3OO9A 1EU8A 2GH9A 1DSNA 5JTYB 1HSEA 3FVGA 4EDPA 4RPOA 2RC9A 3DLNA 3TPAA 4PE5B 1P1OA 5H8QA 1D9VA 1DPPA 3S9MC 1EZPA 4G77A 3PD9A 4O3CA 1PBQA 4YB7A 4F22A 4MLVA 1HSLA 4U4SA 1SYHA 2HAVA 1Z7ME 2XX8A 3PUVE 3TFLA 1ELJA 2X7PA 1NNPA 3GLBA 1B3EA 4OFLA 3FASA 3JV9A 5I2NA 1MXYA 3IOTA 3TTKA 4E0WA 2Y84A 3QXMA 4F1UA 2OBGA 1SQYA 4XKQA 1LFGA 5ICTA 2V84A 2ABHA 1UIVA 1YPNA 1SDXA 1P1UA 4PFYA 3U8QA 1B7ZA 1LCFA 3RT8A 3MZ9A 3TODA 2B65A 1QW0A 3C33A 3KN3A 1SBPA 2XXWA 4KPTA 4DE8A 4Q0CA 1SI0A 2AL4A 1LSTA 1M5FA 3OSRA 2XXVA 1I6QA 2ESNA 5AA2B 2Z23A 2XD3A 1WVJA 4KR5A 3RTWB 1US5A 3UK4A 3HV1A 4OHNA 2UVGA 3G3JA 3K1PA 2O69A 5TP9B 3PUXE 4EF2A 2YPNA 1Y3QA 5KZTA 4JWOA 1ANFA 2HFBA 3VVFA 2I0BA 2NXOA 4F18A 2RC7A 1IXIA 1A40A 2ONKE 4POXA 3W15C 2AIXA 4LQ2A 5H8QB 3K1NA 1LLSA 3PPQA 4OYVA 2PBWA 4RPNA 2I4CA 2R6GE 5I59A 1M5EA 3EQ1A 4C1TA 1FQFA 3H6VA 3VFJA 5F1QA 4DLDA 1GGGA 4H0WA 3IOWA 3HPIA 1QKAA 5L9SA 4JDFA 3U1OA 4YICA 2Y7PA 1JW5A 2LAOA 3LC8A 5ITOA 5I2NB 2V3QA 2O68A 1LAFE 4ESXA 5J1DA 2F36A 4I9DA 4RY1A 3UORA 1F9BA 2DS9A 3TKDA 4ECFA 1UTHA 1I6BA 3TQLA 1MM6A 3E4RA 4OQOA 2H5YA 2IEEA 2H98A 3Q28A 5ELVA 2I0CA 2XXPA 4TLMB 3USDA 3UGWA 3RGYA 1LBCA 3H7MA 4PQJA 1CE2A 2Y7WA 2RINA 2HXWA 2QS2A 1MY1A 4IY6A 1YAEA 4FEBA 1Q1KA 3FD3A 3ZS6A 3S9NC 2DXRA 5LOMA 3E9XA 2X26A 3B6QA 1BLFA 3ECRA 3W9VA 4GVOA 4ISUA 3PD8A 2ANJA 4YB5A 2F78A 2HZKA 1MY0A 3TUSA 2HQ0A 1B7HA 3GXAA 1R1NA 4PP0A 5K2XA 1RKMA 2YLNA 5HM4B 3FGSA 3HSTA 1D9YA 5CMBA 5I59B 2ONSA 2FYIA 1R9LA 1PB8A 3VLVA 4OEVA 5ICQA 1ZU0A 1URDA 3MW0A 2R71A 3JZJA 3LSLA 1B2HA 1JVXA 3EHUA 5ITPA 4YKPA 2FNCA 3SEYA 3MUQA 3M3FA 2UVJA 2UVHA 4RXLA 2VP1A 3FXUA 1NL5A 1CB6A 4F19A 3N5LA 4JSDA 4GOTA 1N84A 4OZ9A 3CSBA 1IXGA 1D4NA 4LUBA 1UTHB 3OENA 1FCKA 2I49A 1DOTA 3QSLA 3FV2A 1P1WA 4OMBA 4LATA 5BUUA 1PC3A 3D4CA 1D3KA 4BLAA 3IOUA 3IB1A 4FE8A 1LAHE 5CI5A 3PPRA 1FTMA 3GBBA 3GBAA 3RNNA 3O29A 1GV8A 4F29A 2O1LA 1MG1A 1GVCA 5H8HA 4H1XA 5AA1A 3V5AA 4XXUA 3SKPA 3I6VA 3VDFA 4P0IA 3RLFE 1B6HA 4R6YA 2REGA 3C34A 4EXLA 3K6UA 2P2AA 2RF1A 2ZYMA 3BFUA 4R6KA 1YCJA 2QMXA 4E0XA 3DP4A 2DWAA 4KFQA 3IB2A 3QK6A 1NNKA 4NWDA 3IB0A 4RNSA 1B1XA 3HCQA 4QFPA 3S9EA 1OLCA 4WXJA 4U4XA 3VVDA 3FJ7A 1M5BA 3VXBA 3B6TA 2ZNTA 4ZEIA 3QUFA 3P7IA 5DVIA 3T9XB 3U93A 2D21A 2PT2A 3MVZA 4ND9A 4F31B 2DOJA 2AL5A 2O7UA 1SW1A 2F34A 1VFEA 2Q89A 3K1MA 1B58A 3RQTA 3O9PA 1Y3PA 5DEXA 3OD7A 3D4GA 5AE4A 2V3UA 1B3LA 2OWSA 1EZ9A 4KYSA 1LAGE 5I56A 2GHAA 4R6HA 1JETA 3K00A 2ONRA 5I84A 1LCTA 3Q25A 2OCUA 4KQPA 1B51A 1B4HA 2XXXA 4KI0E
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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