4NHTA

X-ray structure of the complex between hen egg white lysozyme and pentachlorocarbonyliridate(iii) (6 days)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Interaction between proteins and Ir based CO releasing molecules: mechanism of adduct formation and CO release.
pubmed doi rcsb
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4nhtA00
3WVXA 4NWHA 1JKDA 4DD3A 1T3PA 1FDLY 2YSSC 1HEMA 2HEAA 4WM4A 4NHPA 5KJ9A 4L41A 1QIOA 4HV1A 3A3RX 4B49A 4BAFA 1XFPL 5I4WA 1JTTL 5A3ZA 1DI3A 3A8ZA 4XENA 3LYTA 2DQHY 2F2NA 1CJ8A 1D6PA 1GE4A 3A6BY 3EO5A 1IP3A 2DBTA 1OUIA 3AJNA 3WW5A 1B5UA 1LZEA 4NHIA 1B5VA 4AGAA 1B7SA 3WULA 1BVXA 1B7QA 2XJWA 1H6MA 5AMYA 1GBYA 1I56A 3A95A 2BQKA 1LSFA 4MSTA 1BB3A 5FEKA 1G7JC 2Z38A 4NGOA 4XJFA 1LJKA 1EQEA 5DL9A 5D5CA 1EL1A 4H91A 1LAAA 1YROA 5IELA 1PZYA 1GXXA 1IEEA 3W3EA 4DYGA 1JUGA 1AKIA 1VAUA 2F4AA 1DPWA 4XJGA 3A91A 3RZ4A 1LZ1A 3GXRA 3ZEKA 4DDAA 5F16A 1B5ZA 1CNSA 1OQMA 1GE1A 1RE2A 1IP2A 2BPUA 1MELL 1UIEA 2MEIA 4MCKA 2HEEA 1ALCA 4ETBA 4CJ2A 4G4HA 1OP9B 1UICA 4PGJB 3P68A 4NSIA 2CJLA 1BB5A 5APCA 1O23A 2D4JA 2BQAA 3CSQA 1HEOA 1C46A 2YBJA 5F14A 4NWEA 1IY3A 5FELA 1RI8B 4P2EA 1QQYA 1YANA 4NSJA 5E4PA 2Y8PA 1YL1X 4XN6A 4KL7A 1DPXA 4DDBA 2Z39A 1HELA 1JISA 1OUCA 2DQCY 3QNGA 2HEDA 3LZTA 2BQMA 1NQIA 3B0KA 4ZEEA 5EBHA 4AXTA 1C45A 4IATA 1HMKA 2DQAA 4GCFA 1REZA 4WLTA 1LKRA 1LZGA 4H9FA 1IR7A 5HLLA 5I53A 4TSCA 4H9HA 5HMVA 5KXYA 1UIBA 1V7SA 2MEBA 3AGIA 3EBAB 1GXV2 2CGIA 4H90A 5LIOA 4CHXA 1GFEA 1BB4A 1LSDA 4H8ZA 3LZ2A 5K7OA 4TSBA 1XGTC 1KIRC 1BGIA 1IOSA 1GB6A 4PPOA 2BQBA 2IFFY 4YOPA 5B06A 4B0DA 153LA 1WTNA 3A67Y 4BAPA 4LYTA 1LSAA 4WLYA 1LSGA 4XJBA 3AZ7A 3TXEA 1KIPC 4H1PA 4LT3A 1GFHA 2A7FA 2LZ2A 4NG8A 1OUJA 4UWVA 2ZNWY 1HSWA 1OUEA 5L3HA 1B7NA 1TAYA 2WARA 1B7PA 5JENB 4N1EI 4LT2A 1NDMC 4ETAA 4Z98A 4H92A 1HFYA 1WQPA 4LGKA 3WXTA 1B7RA 1LJHA 1GE3A 4PJ2C 4RDSA 1IOQA 1HEWA 4LZTA 4NIJA 4DDCA 2EPEA 1GE0A 1VATA 1IP4A 1AZFA 4LYOA 3LYOA 1GBOA 1GF0A 1GB5A 1FLUA 2DQGY 2X0AA 1TCYA 5J7CA 4YENA 4ET8A 3LHMA 4PHIA 1TDYA 4HTNA 1GB9A 1QUSA 4NGWA 1GFVA 1IC4Y 1F10A 1WVUA 2DKVA 2YVBA 2Q0MX 4I8SA 4LYCA 1UUZC 2G4NA 5LXWA 1T6VL 2ZILA 4ANRA 194LA 1V7TA 4BADA 1GDWA 2LHMA 4DD2A 3WU9A 1UA6Y 4YEMA 4DD0A 2BQFA 4U3XB 4H9AA 2Z12A 1LJ4A 1LSPA 2N5ZA 4HJVA 4WM6A 5KXZA 1AT5A 1IX0A 4ZFPA 4NHTA 2XTHA 5KXPA 3WPKA 2NWDX 5HNLA 4NY5A 1B2KA 1GD6A 4TWSA 3F6ZA 4XJDA 1LKSA 4WLDA 3W6CA 5LYMA 1WQNA 1JIYA 1LJ3A 3HBEX 3WL2A 5E9RA 1SQ2L 4GN3A 5F81A 1VDQA 5L3IA 1G7IC 3A96A 3WXUA 1XEKA 1ZVHL 1LZNA 4LFXA 1FLWA 1LMPA 1GHLA 2HU3A 4HJZA 1I1ZA 3G3BB 4N5RA 4A7DA 1D6QA 1GEVA 1LCNA 4GCCA 3A94A 3ATNA 1CJ9A 4G4BA 4LFPA 1BWIA 1MLCE 1JPOA 154LA 4ET9A 3VWOA 1J1OY 1YAPA 1P2CC 4OW1A 1IOCA 4WL7A 1LSZA 3FE0A 3N9CA 1KXWA 2H9JA 3A92A 4G49A 7LYZA 1LYZA 1QDRA 1UIFA 1RJCB 2D4IA 3IJVA 1GF5A 1HMLA 3W6BA 1H87A 1LZDA 3P64A 5LVHA 4EMNA 1D0LA 3B72A 1LSCA 207LA 4HTKA 1IWXA 2MEGA 1DXJA 5DLAA 3TXHA 2ZYCA 4LYBA 1IO5A 1YAOA 3B6LA 1N4FA 4GN4A 5DN4A 5APFA 1IWUA 1OUBA 4B4IA 4TUNA 1BWJA 4D9ZA 1G7HC 1JWRA 4ETCA 3WU8A 4IASA 3AYQA 5I4YA 1JHLA 1OUAA 4H93A 3GXKA 4YF2A 4H94A 1DI5A 1GFRA 4H9EA 4OOOA 1QUTA 1IR9A 134LA 1UACY 2MEDA 5B07A 1IY4A 1CKCA 4RW2A 3KAMA 5IDDA 4ML7A 1B9OA 5LA8A 4PRUA 3AGHA 3RT5X 1IWYA 4C3WA 5HQ1A 4XYYA 3ZVQA 5II3A 1JJ0A 5M1YA 4E3UA 3E3DA 2G4PA 1LOZA 3LYMA 1XEIA 3AB6A 3N9AA 5T3FA 1BQLY 1YAMA 2HECA 5D5FA 2BQDA 1W08A 5B59A 1A4VA 1WQQA 1IOTA 1GF8A 1LTMA 4KXIA 4G9SA 4XJIA 4DWXA 2FYDA 4QEQA 5LYZA 2AUBA 2Z2FA 4H9CA 1VFBC 1YKXX 1VDSA 5LVJA 2BQGA 1NMMA 2HEFA 2DQIY 4IJ4A 1LZTA 5KXNA 8LYZA 1UCOA 2HU1A 3WMKA 1WTMA 5HNCA 4WO6A 3WVYA 2D4KA 2BQJA 4RLMA 1CJ6A 4N9RA 1NKHA 5LVKA 2YBHA 2BLXA 2B5ZA 1B5YA 1IC5Y 1DI4A 2BQOA 3A3QA 2MEFA 1D0KA 1E8LA 3CT1A 4ZIXA 4KPMA 3TXIA 1LZ8A 6LYZA 3WW6A 1GBXA 2I26L 1ZV5L 5LA5A 4YM8A 1JTPL 1TEWA 1BB7A 3TMUA 3BKVA 4Z3MA 1LYSA 1NF5A 5ILFA 4ETEA 5KKIA 1LZ9A 1LSEA 2BAAA 1WQMA 3ATOA 1GB8A 1HEQA 1XGUC 2XBRA 4WM2A 3WUMA 9LYZA 1LZ4A 5LYTA 1GF6A 3AW6A 3HBDA 1I20A 2BQCA 3K3TA 1YKZX 4GCBA 5APDA 1XGPC 4GN5C 4QY9A 1HENA 3A90A 3B0OA 4OWCA 4M4OA 5APEA 5C6JA 5KXLA 4DD7A 1LHIA 5KXTA 4RW1A 2I6ZA 3G3AB 4GLAA 2ZIJA 1LMOA 1YL0X 2D91A 1PS5A 2H9KA 3D9AC 4KT3A 3TXDA 1LSBA 1AT6A 2YBLA 2LYMA 4HPEA 5DN5A 5C6LA 1LMAA 5KXSA 1GF9A 3TMWA 1GB2A 4ETDA 5B1FA 3RW8A 1QSAA 6LYTA 1GB3A 1NWGA 1GEZA 4PRQA 3IWRA 3AZ5A 2Z37A 4NGYA 3TXBA 1VDPA 3BKHA 1JKAA 5C6IA 4Z41A 4HPIA 1IORA 4WMGA 5FSTA 1GAYA 2G4QA 1B0DA 4HSFA 2H5ZA 3WUAA 2BQNA 4OOTA 4QGZA 1C10A 5KKJA 3J4GA 4QDNA 4J0LA 1CJ7A 4HP0A 5LVGA 2D6BA 5B1GA 4CFPA 4OWHA 3P4ZA 4EOFA 193LA 1IR8A 4LYZA 4II8A 4RLNA 1F0WA 1LHJA 2A7DA 4NEBA 4DD9A 1LHKA 3RNXA 1XGRC 2BQIA 5DM9A 1LZYA 3IJUA 4N0JA 1D0MA 2Z2EA 1FKQA 1DZBX 1JSEA 3WPLA 1B7LA 1KIQC 2BQLA 1RFPA 3LYZA 4TX7A 2HTXA 4B4JA 4G4CA 1F6SA 1FKVA 1YQVY 1IP5A 2EQLA 5LAFA 3HFMY 2W1MA 4LT1A 1LYYA 2Z19A 5I4XA 1LJFA 1OUDA 3QY4A 4BS7A 1FBIX 1LMTA 3D3DA 2ZNXY 3OJPA 2XBSA 135LA 4NHQA 4WOAA 1EQ4A 2LZTA 1FN5A 3M3UA 4B4EA 3W6DA 1LJGA 1JJ1A 1NBYC 1LYOA 1RCMA 4O34A 4XADA 1LZSA 2DQDY 1NBZC 4WLXA 2GV0A 2LYOA 5KXKA 1GPQC 1OUGA 4WM5A 3CT5A 1LJNA 4R0FA 4GCEA 1CKFA 2DQJY 4UWUA 1HERA 2YBNA 2ZIKA 5F9UA 1YAQA 3AGGG 1AM7A 3T6UA 2EIZC 4M6DA 4CFOA 1D9UA 3CQLA 2HEBA 1QTEA 3ULRA 1HF4A 1HFZA 1REMA 3A6CY 1DKKA 3P66A 1JEFA 2W1LA 3RU5A 5LINA 1B7MA 1LZ5A 1JKBA 1GF3A 3WH1A 1IP7A 5F9XA 1C43A 2LYZA 3FI7A 1BB6A 2DQFC 2VB1A 3EMSA 5FHWA 2MEAA 3MGWA 3OK0A 1LSMA 5KXRA 1UIDA 1CKDA 4J1AA 2MECA 2PC2A 5B05A 4GCDA 132LA 2DQEY 3CB7A 1LSYA 4Z46A 4NGZA 1INUA 3TMVA 1HSXA 1GBWA 1VDTA 2CDSA 4NFVA 4UWNA 4WG1A 1UC0A 4NGLA 5FCPA 3AZ4A 1TBYA 1UIHA 2W1XA 1ZVYB 1UIGA 4WL6A 3WU7A 1QSWA 2ZYPA 3B0IA 3CT0A 5KXMA 4DC4A 1VEDA 4HTQA 4OWEA 1LZRA 1GB7A 1LHLA 2BQEA 1LJJA 4H9BA 1G7LC 1QTKA 1IWWA 1G7MC 1EQ5A 1GE2A 4HV2A 5KXOA 1CKGA 1GFAA 4W96A 1GDXA 4NSGA 1IIZA 1HFXA 4C5FA 2F4GA 1ZMYL 5LVIA 1LMQA 1HHLA 1LSNA 1NHEA 1OUHA 208LA 1B5WA 2C8OA 4H9IA 5IHGA 4GLVA 4J1BA 4WG7A 1LZBA 1KXXA 5I54A 4NGIA 3WUNA 1J1PY 1WVVA 2MEHA 2IHLA 2ZQ4A 4R6CA 5A3EA 1Z55A 1C08C 1GFUA 1J1XY 1CKHA 1BWHA 4NGJA 4FDYA 4B1AA 1YKYX 1LZ6A 4DD1A 3WYHA 3SP3A 1HC0A 1B5XA 2FBBA 2C8PA 3EXDA 1UBZA 1XEJA 3AW7A 4OWBA 3TXKA 1IVMA 1GWDA 3P65A 4FJRA 4MR1A 3W6AA 1LHHA 1KXYA 1IWTA 1SLYA 4NG1A 1C7PA 1GBSA 4H8XA 5HMJA 4NHSA 3T36A 3HBHA 1LJIA 1LHMA 1FLYA 2BQHA 4OWAA 1WQRA 4NSHA 1B7OA 4N8ZA 2CWIA 2ZWBA 1GF7A 1REYA 3TXJA 4W94A 4WM1A 4DT3A 1LPIA 1GAZA 2EKSC 1GBZA 1HNLA 1JSFA 3N9EA 2YDGA 3A34A 1A2YC 2RSCA 1QDTA 3M18B 1GFJA 1IP6A 1LZCA 3QE8A 1JKCA 4I0CA 5ILCA 1NDGC 3TXFA 1GFTA 4N1CC 3TXGA 1LZAA 3WPJA 1JITA 1JJ3A 3AZ6A 1YILA 1DQJC 1GFKA 1IC7Y 5KXWA 3CSZA 1UIAA 3W6EA 5KY1A 1GB0A 1IP1A 1LJEA 3TMXA 4NGVA 3W6FA 1LMCA 1IWVA 1GFGA 2FBDA 2YBIA 1GF4A 4LT0A 2HUBA 4YEOA 1HEPA 4LYMA 1F6RA 3A93A 4WM3A 4NGKA 4CGEA 2W1YA 2Z18A 1REXA 1IWZA 1WQOA 1LMNA 1XSFA 4X3BA 2MEEA 1OUFA 2YBMA 2BLYA 3LN2A 1YIKA 4XJHA 1DKJA 1JTOL 4J7VA 5L9JA 133LA 5I5QA 1BVKC 3ZVQB 4HJYA 1BHZA 2FYCA 4TTDA 1XGQC 1FLQA 3J6KA 2ZQ3A 4H8YA 5KXXA 4WO9A 2F30A 3CSRA 5LAGA 5FDJA 2I25L 1W6ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NWHA 4DD3A 1FDLY 2YSSC 1DI3A 2LC9A 5LZMA 1L35A 1D6PA 3EO5A 1IP3A 1P3NA 130LA 3WW5A 1LZEA 1B5VA 4LDOA 1CV5A 219LA 1I56A 2BQKA 3GUKA 1L45A 5FEKA 1EL1A 197LA 1YROA 1ZURA 5IELA 201LA 2O7AA 1JUGA 1VAUA 3RZ4A 3ZEKA 4DKLA 5F16A 1G0JA 182LA 1UICA 4G4HA 1L49A 1L07A 249LA 1BB5A 183LA 1C46A 1JTMA 4EKPA 1YANA 4NSJA 2Y8PA 4DJHA 1DPXA 4DDBA 3B0KA 160LA 1C45A 1QTCA 198LA 4WLTA 4H9FA 4TSCA 5HMVA 1OVHA 1LSDA 1L38A 3LZ2A 1GB6A 4YOPA 233LA 4B0DA 1WTNA 4YXCA 220LA 3G3XA 4WLYA 1LSGA 1KIPC 4H1PA 4LT3A 1GFHA 1OUJA 4I7MA 1OUEA 1L52A 2WARA 1B7PA 1SWYA 4Z98A 4LZTA 1GE0A 3LYOA 4ET8A 3LHMA 3HT9A 1TDYA 4PHIA 1GB9A 1QUSA 127LA 1F10A 4W55A 1T6VL 2ZILA 4ANRA 218LA 168LA 2LHMA 3WU9A 1UA6Y 4DD0A 2B73A 1LJ4A 1LSPA 2N5ZA 190LA 4NHTA 4NY5A 1L36A 4I7RA 4WLDA 1JIYA 3WL2A 1VDQA 3DMZA 3K2RA 2A4TA 3C82A 3G3BB 4W51A 2LCBA 4I7KA 3L2XA 1JPOA 1J1OY 187LA 1P2CC 1YAPA 1IOCA 221LA 4E97A 1QDRA 2D4IA 1C6NA 1H87A 232LA 1LZDA 4HTKA 1L76A 165LA 3SB8A 1IO5A 1IWUA 4D9ZA 4TUNA 1BWJA 3UONA 4EKRA 3AYQA 1C6BA 5I4YA 1JHLA 175LA 2OU8A 1GFRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3WVX A;  4NWH A;  1JKD A;  4DD3 A;  1T3P A;  1FDL Y;  2YSS C;  1HEM A;  2HEA A;  4WM4 A;  4NHP A;  5KJ9 A;  4L41 A;  1QIO A;  4HV1 A;  3A3R X;  4B49 A;  4BAF A;  1XFP L;  5I4W A;  1JTT L;  5A3Z A;  1DI3 A;  3A8Z A;  4XEN A;  3LYT A;  2DQH Y;  2F2N A;  1CJ8 A;  1D6P A;  1GE4 A;  3A6B Y;  3EO5 A;  1IP3 A;  2DBT A;  1OUI A;  3AJN A;  3WW5 A;  1B5U A;  1LZE A;  4NHI A;  1B5V A;  4AGA A;  1B7S A;  3WUL A;  1BVX A;  1B7Q A;  2XJW A;  1H6M A;  5AMY A;  1GBY A;  1I56 A;  3A95 A;  2BQK A;  1LSF A;  4MST A;  1BB3 A;  5FEK A;  1G7J C;  2Z38 A;  4NGO A;  4XJF A;  1LJK A;  1EQE A;  5DL9 A;  5D5C A;  1EL1 A;  4H91 A;  1LAA A;  1YRO A;  5IEL A;  1PZY A;  1GXX A;  1IEE A;  3W3E A;  4DYG A;  1JUG A;  1AKI A;  1VAU A;  2F4A A;  1DPW A;  4XJG A;  3A91 A;  3RZ4 A;  1LZ1 A;  3GXR A;  3ZEK A;  4DDA A;  5F16 A;  1B5Z A;  1CNS A;  1OQM A;  1GE1 A;  1RE2 A;  1IP2 A;  2BPU A;  1MEL L;  1UIE A;  2MEI A;  4MCK A;  2HEE A;  1ALC A;  4ETB A;  4CJ2 A;  4G4H A;  1OP9 B;  1UIC A;  4PGJ B;  3P68 A;  4NSI A;  2CJL A;  1BB5 A; 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 3WYH A;  3SP3 A;  1HC0 A;  1B5X A;  2FBB A;  2C8P A;  3EXD A;  1UBZ A;  1XEJ A;  3AW7 A;  4OWB A;  3TXK A;  1IVM A;  1GWD A;  3P65 A;  4FJR A;  4MR1 A;  3W6A A;  1LHH A;  1KXY A;  1IWT A;  1SLY A;  4NG1 A;  1C7P A;  1GBS A;  4H8X A;  5HMJ A;  4NHS A;  3T36 A;  3HBH A;  1LJI A;  1LHM A;  1FLY A;  2BQH A;  4OWA A;  1WQR A;  4NSH A;  1B7O A;  4N8Z A;  2CWI A;  2ZWB A;  1GF7 A;  1REY A;  3TXJ A;  4W94 A;  4WM1 A;  4DT3 A;  1LPI A;  1GAZ A;  2EKS C;  1GBZ A;  1HNL A;  1JSF A;  3N9E A;  2YDG A;  3A34 A;  1A2Y C;  2RSC A;  1QDT A;  3M18 B;  1GFJ A;  1IP6 A;  1LZC A;  3QE8 A;  1JKC A;  4I0C A;  5ILC A;  1NDG C;  3TXF A;  1GFT A;  4N1C C;  3TXG A;  1LZA A;  3WPJ A;  1JIT A;  1JJ3 A;  3AZ6 A;  1YIL A;  1DQJ C;  1GFK A;  1IC7 Y;  5KXW A;  3CSZ A;  1UIA A;  3W6E A;  5KY1 A;  1GB0 A;  1IP1 A;  1LJE A;  3TMX A;  4NGV A;  3W6F A;  1LMC A;  1IWV A;  1GFG A;  2FBD A;  2YBI A;  1GF4 A;  4LT0 A;  2HUB A;  4YEO A;  1HEP A;  4LYM A;  1F6R A;  3A93 A;  4WM3 A;  4NGK A;  4CGE A;  2W1Y A;  2Z18 A;  1REX A;  1IWZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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