4NHTA

X-ray structure of the complex between hen egg white lysozyme and pentachlorocarbonyliridate(iii) (6 days)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title Interaction between proteins and Ir based CO releasing molecules: mechanism of adduct formation and CO release.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4nhtA00
4M4OA 1LZAA 4DT3A 1HFXA 3HFMY 4LGKA 1KXYA 3TXKA 5F81A 3WXUA 2G4QA 3WU7A 4W96A 3AJNA 4H93A 1WTMA 2Z2EA 4NGIA 1DQJC 1FLQA 1WTNA 1GF0A 2BLYA 4NSJA 1LHIA 2FBBA 5B1GA 2MEHA 1LHKA 1ZVHL 4E3UA 5FELA 1OUJA 5C6JA 3WUNA 4OWBA 1GF5A 1GBYA 4FJRA 1O23A 3A90A 3E3DA 1QTKA 4NY5A 5KXLA 4DD9A 1IWVA 4ET8A 1CKCA 3AB6A 1XEIA 4NHSA 1QTEA 4MSTA 1BQLY 1IWTA 1KIQC 4NEBA 1GF7A 4RDSA 4DDAA 2W1LA 5LINA 1OUCA 1VAUA 1OUDA 1LHLA 2YBHA 4YOPA 2DBTA 3HBEX 1LMTA 4OOOA 4PPOA 5D5FA 3RW8A 1D0KA 4GCFA 3WW5A 3ZVQA 4ETEA 6LYTA 5A3EA 1HSXA 4N8ZA 2ZILA 4LYBA 1UBZA 3EMSA 4ET9A 1LSZA 2BQOA 1GAYA 3WU9A 1AT6A 1MELL 2D4JA 1XGUC 1GE4A 1YL0X 4WL7A 2VB1A 1FLUA 1GD6A 1YILA 4G4CA 3W6EA 1I56A 5HLLA 1LTMA 1GF8A 1LZEA 4HPIA 4NHIA 1OUFA 1SQ2L 3P65A 4TWSA 3A95A 4U3XB 5APCA 1GAZA 4B4EA 4NGZA 3B6LA 4EMNA 2BQMA 1KXWA 1C7PA 1IP6A 1BWJA 1BWIA 1GBXA 3LZ2A 1OUEA 4HPEA 3WUMA 5LAFA 2Z39A 2BQNA 4WL6A 5DLAA 3W6BA 1LAAA 3WH1A 1HMKA 4ETAA 1QSWA 4OWEA 1FLWA 1GDXA 4CGEA 5LA8A 2RSCA 1CJ8A 4HJVA 1LZDA 4II8A 4H8YA 5APDA 1CKDA 1LZ5A 3ATNA 1HEOA 1LJ3A 4GN4A 4WM1A 5C6IA 2LZTA 1AKIA 5B06A 1HNLA 1IX0A 4N5RA 1LHHA 3HBHA 4XJHA 3A91A 1IP2A 1YROA 2FYCA 2PC2A 1VATA 1TDYA 4LT1A 1ALCA 4LYCA 1J1PY 4GN5C 5B07A 1CNSA 4Z3MA 5LA5A 1OP9B 4R0FA 1GFVA 9LYZA 4XJIA 3N9CA 1B5YA 1GB0A 1HEMA 5K7OA 5E4PA 4NFVA 2LZ2A 4QDNA 4NGVA 1LSCA 3KAMA 3TXHA 3T36A 2BAAA 1BGIA 1HFYA 3EBAB 1TCYA 5E9RA 4QGZA 1VFBC 4GCDA 4GLVA 1LJ4A 1LSFA 2Q0MX 2DQCY 4WO9A 4NHTA 4TSCA 3CT5A 2MEBA 1B2KA 1LSNA 4XJDA 4XJFA 1QQYA 2AUBA 3HBDA 4C5FA 1GFAA 208LA 2BPUA 5AMYA 2ZIKA 5KXTA 1AT5A 1LMCA 3A8ZA 3N9AA 5FDJA 4ML7A 7LYZA 1KIPC 2MEAA 1GF4A 5LVKA 1DPXA 1GB6A 4WM5A 5HNLA 2H5ZA 1LJNA 1JKCA 1PS5A 5ILFA 3G3AB 1YANA 1HSWA 3AW6A 4HTNA 5M1YA 1IP3A 1DI3A 4NG8A 1D6QA 3AW7A 1JJ3A 4HSFA 1BB6A 1ZV5L 5DL9A 2EKSC 1JHLA 4NGJA 5APFA 4UWUA 4N1EI 1GB5A 2BLXA 3LYZA 1B7OA 1HEPA 3AZ7A 3GXKA 1BWHA 1UICA 1YAPA 132LA 4WLYA 5LIOA 1GB3A 1LHMA 134LA 2DQEY 4WM4A 1C43A 1QIOA 1WVUA 1Z55A 4OWCA 1A2YC 2YBNA 1IP7A 5ILCA 1V7SA 2HU3A 1LZGA 1H6MA 2BQJA 1J1OY 2F4AA 4LYMA 1KIRC 2C8PA 3WL2A 1C46A 4LZTA 4BAPA 4TX7A 4LFPA 3W6AA 4WLDA 4PGJB 5DM9A 4WLTA 4NSHA 4B4IA 4YEMA 1GFGA 1JEFA 2BQHA 4IASA 4P2EA 2ZIJA 1GF6A 5I53A 5I4WA 3N9EA 1REZA 4KXIA 1DKKA 1B7RA 4A7DA 4I8SA 4MR1A 4H9AA 5KXRA 4M6DA 2HEEA 133LA 2A7DA 2HTXA 1WQMA 1ZMYL 2N5ZA 3A6CY 3K3TA 4LYTA 3QNGA 1OUIA 2Z18A 2DQAA 1HEQA 1GFRA 4D9ZA 1GEZA 1IWUA 2MEFA 1C45A 1HMLA 5I54A 4Z41A 1XSFA 1B7PA 1I1ZA 2BQGA 2Z2FA 3IWRA 4Z46A 3WW6A 4WO6A 1C08C 1FLYA 1UIDA 2Z19A 2GV0A 4H92A 4ETDA 1UUZC 4DC4A 1DKJA 5KXPA 5LYMA 4B0DA 1UIEA 4LFXA 2DQIY 3CQLA 1IY4A 1LJGA 1NBZC 2D4IA 1VDPA 3D9AC 3WXTA 2YBIA 1GHLA 1LSGA 1YKXX 1WVVA 1G7HC 1P2CC 1JSFA 5D5CA 1IR9A 5KXZA 4RW2A 1GE0A 1YAQA 4B49A 3FE0A 1HF4A 4N0JA 2HUBA 3WU8A 4J1AA 3P66A 1NKHA 1W6ZA 4HV1A 1QUTA 4H1PA 4DD1A 1GFKA 1GFHA 4UWVA 1LYZA 3G3BB 1YIKA 4CJ2A 3AZ4A 1GFJA 1LZBA 5I5QA 1B5VA 2ZYCA 1LYOA 4EOFA 3ZVQB 1GB9A 4KPMA 2LYOA 2DKVA 1I20A 2D6BA 1BB5A 1EQ4A 3M18B 4G9SA 4GLAA 1IC5Y 1IVMA 1GB2A 1NDMC 2HU1A 1JJ0A 194LA 1WQOA 1YQVY 1LZSA 3WPLA 1LZ4A 5HNCA 2XTHA 2YBMA 1IP4A 3W3EA 1LSBA 1UIAA 5FHWA 1HELA 1BB3A 3TXFA 3GXRA 1UIFA 1CKGA 3W6DA 1EQEA 4OW1A 1JPOA 2FYDA 2BQCA 3A6BY 1GBOA 4GCBA 1GB7A 5LVGA 1CJ7A 3WULA 4YF2A 1WQRA 5A3ZA 4IATA 8LYZA 1LZ6A 1LMPA 2YDGA 1QDTA 4YEOA 4ZEEA 4QEQA 3A94A 1LMOA 2IHLA 1GDWA 2H9JA 3AZ5A 4HJYA 1LKRA 3A92A 1LSDA 1LZYA 1G7LC 4DYGA 2HEAA 1JTOL 4HJZA 5F9XA 1XGRC 2MEGA 2ZNXY 1XGQC 4DDCA 1JKAA 3CSQA 5JENB 4J7VA 1IC7Y 2HEFA 1IWZA 5DN5A 1LJJA 2BQAA 3TXDA 1LMAA 1LKSA 1XGPC 1LZRA 3WPJA 5HQ1A 2Z37A 3P4ZA 2LHMA 4WLXA 1OUAA 207LA 4KT3A 1LMQA 5KXXA 1IOSA 2ZQ3A 1B5WA 5KXWA 1QUSA 1RE2A 4N9RA 5J7CA 2A7FA 3AZ6A 2ZNWY 2ZYPA 1UACY 2D4KA 3A67Y 1LJKA 1B7NA 3TXGA 1LSMA 5LVIA 1CJ6A 5B1FA 1B7QA 2I6ZA 4LYOA 3A93A 1GBSA 1JUGA 1UIHA 2I26L 4PJ2C 4CFOA 4PRQA 3WVYA 1CKHA 1B0DA 1LZCA 1NHEA 3BKHA 3IJVA 1T3PA 3IJUA 1INUA 4G4BA 2EIZC 1IOQA 4B1AA 4XJGA 2DQGY 3TXJA 4ETBA 4YM8A 3T6UA 1F6SA 3WVXA 4IJ4A 1GFTA 4OWAA 1JIYA 1TBYA 4XADA 1XGTC 5DN4A 1LMNA 1IC4Y 1V7TA 1IOCA 2XBSA 3B0KA 5L9JA 1LCNA 3W6FA 4N1CC 2F30A 5L3HA 4Z98A 6LYZA 1XEJA 5KXNA 1GB8A 1SLYA 1GF9A 1XFPL 4TTDA 4WM3A 1IWYA 3WYHA 4ZIXA 2CWIA 4H9BA 4H8XA 4NG1A 3AGHA 3P64A 1JTPL 4G49A 5IELA 3VWOA 1D6PA 1KXXA 4PHIA 2W1YA 3ZEKA 1IP5A 1F0WA 1DI4A 2BQKA 4ETCA 4QY9A 1IWXA 1QDRA 3TMVA 5KXOA 4KL7A 2ZWBA 4H91A 1B5UA 1IEEA 5KXMA 2FBDA 1NWGA 1JTTL 2W1XA 5IDDA 4DDBA 1DPWA 1GFUA 1YAMA 1IR8A 1BB4A 2CJLA 4LT2A 1OQMA 1UCOA 4DD7A 2F4GA 1J1XY 2MEIA 1EL1A 5F16A 5II3A 3M3UA 1D0LA 5FEKA 4H8ZA 1VDQA 4L41A 4RLMA 5LVHA 1LZ1A 1LZ9A 1HC0A 1IORA 2DQFC 5APEA 1B7MA 4WG1A 3LYOA 3EO5A 1CKFA 2MEDA 1LYSA 5F9UA 4DD3A 1PZYA 3CSRA 4NWEA 2DQJY 2YBLA 1HENA 3EXDA 3MGWA 1IO5A 3CB7A 1OUBA 2BQLA 2BQFA 3B0OA 3WMKA 3FI7A 4J1BA 1LJIA 4MCKA 1GE1A 3B72A 3W6CA 4H94A 1LHJA 1LSAA 2ZQ4A 4NHQA 1JISA 2EPEA 1GE3A 1GFEA 2DQHY 2BQDA 2G4NA 1B7SA 1BVXA 4AGAA 4RW1A 1BVKC 2HEDA 5KKJA 1JWRA 1WQQA 1OUHA 3B0IA 1HFZA 3D3DA 5IHGA 1OUGA 2DQDY 5LVJA 1IWWA 3TXIA 4NSIA 2BQBA 2WARA 3LYMA 3AYQA 2Z38A 3LHMA 4H9HA 4LYZA 4UWNA 3J6KA 1REYA 1D0MA 5FSTA 1GXV2 4HV2A 1BB7A 1REXA 1TEWA 1JKBA 4NGOA 1RI8B 1D9UA 1UIGA 4NGWA 4NGKA 4NIJA 4WM2A 4HP0A 4B4JA 4WOAA 1F10A 4J0LA 1LJFA 4XN6A 5C6LA 5KXKA 1GBZA 1LSPA 1YKZX 4YENA 5KXSA 5LXWA 4WMGA 2MECA 2BQIA 1G7IC 1C10A 154LA 1WQPA 5I4XA 4HTKA 3RNXA 1JJ1A 4AXTA 3TXEA 1LJHA 5KY1A 1GE2A 1TAYA 1HEWA 3AGGG 3CT1A 4DWXA 5I4YA 1F6RA 2LYMA 1IR7A 4PRUA 1GBWA 1FKVA 1W08A 4O34A 4XENA 4GCCA 3RU5A 4BAFA 1LOZA 1LZNA 1RCMA 1GPQC 2CDSA 1LZTA 5KJ9A 3CSZA 1LSYA 3QY4A 4OWHA 3RZ4A 2CGIA 2Y8PA 2HEBA 4XYYA 1DZBX 4HTQA 2XJWA 1UC0A 1B9OA 1YAOA 5F14A 3OJPA 1IP1A 5B59A 3CT0A 4GCEA 1LJEA 3J4GA 4NWHA 4RLNA 1GF3A 4NGLA 4TUNA 1JSEA 1BHZA 3ULRA 3WPKA 3A34A 4NHPA 5KXYA 1AM7A 1DI5A 4NGYA 3A3RX 1G7MC 4WG7A 1FBIX 1H87A 5EBHA 1YL1X 3P68A 2EQLA 4NSGA 3TMWA 1REMA 1N4FA 5FCPA 1LYYA 3ATOA 3TMUA 1VEDA 1LSEA 3WUAA 3AGIA 3SP3A 2D91A 4OOTA 2X0AA 4CHXA 4ZFPA 1RFPA 1LPIA 2NWDX 4CFPA 5HMJA 1VDTA 1HERA 4W94A 1HHLA 4ANRA 1RJCB 1B5ZA 1IOTA 1ZVYB 3TMXA 2IFFY 4BS7A 3BKVA 2HECA 4FDYA 3TXBA 153LA 1B7LA 1UA6Y 3LYTA 3RT5X 5LYTA 5LYZA 4X3BA 4G4HA 2H9KA 1IIZA 1NF5A 1JKDA 3LN2A 4XJBA 1EQ5A 135LA 4WM6A 1MLCE 1A4VA 1YKYX 4H9IA 5B05A 5KKIA 1FDLY 4H9CA 4TSBA 1LZ8A 1GWDA 5HMVA 4H9FA 4BADA 3LZTA 5LAGA 4DD0A 2Z12A 1GEVA 3QE8A 1AZFA 1WQNA 1GXXA 1XEKA 5T3FA 1QSAA 2MEEA 4I0CA 1UIBA 2F2NA 1DXJA 1NMMA 2G4PA 2YVBA 3F6ZA 2B5ZA 2W1MA 5L3IA 2YBJA 4LT0A 1NDGC 4GN3A 4H9EA 1E8LA 3A96A 4H90A 1NBYC 1VDSA 4R6CA 1T6VL 4DD2A 1JITA 1IY3A 2BQEA 2YSSC 1NQIA 2C8OA 1CJ9A 1B5XA 2I25L 2LYZA 3A3QA 193LA 1G7JC 4C3WA 2XBRA 4LT3A 1FKQA 3OK0A 1FN5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4E97A 3TXKA 3WXUA 4H93A 2Z2EA 2F2QA 1DQJC 4NSJA 4DJHA 2FBBA 1DYCA 1LGUA 4LZMA 3WUNA 258LA 4FJRA 1O23A 4I7MA 1IWVA 2F32A 178LA 1IWTA 1KIQC 4RDSA 4DDAA 4YOPA 2HULA 1C6DA 4ETEA 1HSXA 1L76A 4ET9A 1L31A 1G0GA 4DKLA 2D4JA 1XGUC 1YL0X 1QT6A 2VB1A 3L64A 3W6EA 1I56A 5KXRA 1LZEA 1OUFA 1XJTA 3P65A 3A95A 218LA 1LWKA 1IP6A 4I7KA 1BWIA 3CDTA 3LZ2A 3WUMA 2BQNA 1P37A 1HMKA 188LA 1QSWA 4AQNA 1GDXA 2RSCA 4HJVA 1C6IA 4II8A 3ATNA 1HEOA 1L84A 4GN4A 5B06A 1LHHA 3HBHA 4I7PA 4ARQA 4GN5C 1CNSA 9LYZA 1GB0A 3DN6A 1L53A 2BAAA 1BGIA 1L86A 3NYAA 4PJZA 4GLVA 1CV0A 4TSCA 1L51A 172LA 4XJFA 4C5FA 131LA 1GFAA 2BPUA 1AT5A 1LMCA 3N9AA 3DMVA 5LVKA 174LA 1DPXA 1L0KA 1P7SA 1YANA 128LA 4HSFA 2EKSC 5APFA 4UWUA 4N1EI 1GB5A 5LIOA 1L23A 1ZWNA 2QB0B 1WVUA 1Z55A 4OWCA 1L63A 1QTHA 1L58A 1IP7A 1V7SA 3GUIA 160LA 2BQJA 1H6MA 184LA 1J1OY 2F4AA 3WL2A 1C46A 3W6AA 4B4IA 4ARJA 4YEMA 4WLTA 1REZA 1B7RA 4H9AA 2HTXA 225LA 3K3TA 3QNGA 4ARPA 2Z18A 2DQAA 1HEQA 4D9ZA 223LA 5I54A 4Z41A 1L07A 2BQGA 166LA 1FLYA 236LA 3HH6A 4DC4A 5KXPA 4B0DA 1L01A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4M4O A;  1LZA A;  4DT3 A;  1HFX A;  3HFM Y;  4LGK A;  1KXY A;  3TXK A;  5F81 A;  3WXU A;  2G4Q A;  3WU7 A;  4W96 A;  3AJN A;  4H93 A;  1WTM A;  2Z2E A;  4NGI A;  1DQJ C;  1FLQ A;  1WTN A;  1GF0 A;  2BLY A;  4NSJ A;  1LHI A;  2FBB A;  5B1G A;  2MEH A;  1LHK A;  1ZVH L;  4E3U A;  5FEL A;  1OUJ A;  5C6J A;  3WUN A;  4OWB A;  1GF5 A;  1GBY A;  4FJR A;  1O23 A;  3A90 A;  3E3D A;  1QTK A;  4NY5 A;  5KXL A;  4DD9 A;  1IWV A;  4ET8 A;  1CKC A;  3AB6 A;  1XEI A;  4NHS A;  1QTE A;  4MST A;  1BQL Y;  1IWT A;  1KIQ C;  4NEB A;  1GF7 A;  4RDS A;  4DDA A;  2W1L A;  5LIN A;  1OUC A;  1VAU A;  1OUD A;  1LHL A;  2YBH A;  4YOP A;  2DBT A;  3HBE X;  1LMT A;  4OOO A;  4PPO A;  5D5F A;  3RW8 A;  1D0K A;  4GCF A;  3WW5 A;  3ZVQ A;  4ETE A;  6LYT A;  5A3E A;  1HSX A;  4N8Z A;  2ZIL A;  4LYB A;  1UBZ A;  3EMS A;  4ET9 A;  1LSZ A;  2BQO A;  1GAY A;  3WU9 A;  1AT6 A;  1MEL L;  2D4J A;  1XGU C;  1GE4 A;  1YL0 X;  4WL7 A;  2VB1 A;  1FLU A;  1GD6 A;  1YIL A;  4G4C A;  3W6E A;  1I56 A;  5HLL A;  1LTM A;  1GF8 A;  1LZE A; 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 4NGL A;  4TUN A;  1JSE A;  1BHZ A;  3ULR A;  3WPK A;  3A34 A;  4NHP A;  5KXY A;  1AM7 A;  1DI5 A;  4NGY A;  3A3R X;  1G7M C;  4WG7 A;  1FBI X;  1H87 A;  5EBH A;  1YL1 X;  3P68 A;  2EQL A;  4NSG A;  3TMW A;  1REM A;  1N4F A;  5FCP A;  1LYY A;  3ATO A;  3TMU A;  1VED A;  1LSE A;  3WUA A;  3AGI A;  3SP3 A;  2D91 A;  4OOT A;  2X0A A;  4CHX A;  4ZFP A;  1RFP A;  1LPI A;  2NWD X;  4CFP A;  5HMJ A;  1VDT A;  1HER A;  4W94 A;  1HHL A;  4ANR A;  1RJC B;  1B5Z A;  1IOT A;  1ZVY B;  3TMX A;  2IFF Y;  4BS7 A;  3BKV A;  2HEC A;  4FDY A;  3TXB A;  153L A;  1B7L A;  1UA6 Y;  3LYT A;  3RT5 X;  5LYT A;  5LYZ A;  4X3B A;  4G4H A;  2H9K A;  1IIZ A;  1NF5 A;  1JKD A;  3LN2 A;  4XJB A;  1EQ5 A;  135L A;  4WM6 A;  1MLC E;  1A4V A;  1YKY X;  4H9I A;  5B05 A;  5KKI A;  1FDL Y;  4H9C A;  4TSB A;  1LZ8 A;  1GWD A;  5HMV A;  4H9F A;  4BAD A;  3LZT A;  5LAG A;  4DD0 A;  2Z12 A;  1GEV A;  3QE8 A;  1AZF A;  1WQN A;  1GXX A;  1XEK A;  5T3F A;  1QSA A;  2MEE A;  4I0C A;  1UIB A;  2F2N A;  1DXJ A;  1NMM A;  2G4P A;  2YVB A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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