4NPBA

The crystal structure of thiol:disulfide interchange protein dsbc from yersinia pestis co92
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
ADDSAIQQTLKKLDIQQADIQPSPIPGISTVMTESGVLYISADGKHLLQGPLYDVSGDQPINVTNQALLKKLEALSSEMIVYKAPEEKHVITVFTDITCGYCRKLHEQMKDYNALGITVRYLAFPRQGLSSQAEKDMRSIWCMADRNKAFDDAMKNNDISPATCKTDISKHYQLGVQFGIQGTPAIVLQNGTIVPGYQGPKEMLQMLNAHQASLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The crystal structure of thiol:disulfide interchange protein DsbC from Yersinia pestis CO92
rcsb
source organism Yersinia pestis
molecule tags Isomerase
molecule keywords Protein disulfide isomerase II
total genus 59
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 4npbA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4npbA02
2FGXA 4LL1B 2CT6A 4Q5RA 1R26A 1T1VA 6GSWA 2DJKA 2R6KA 1SL1B 5KN0A 3KTBA 2RUEA 4XS4B 2AV4A 4KDYA 5GSTA 3W8SA 3LYPA 5CNWA 2HSHA 1GUMA 4TR0A 5DJLA 1USBA 3M8NA 2B1KA 1ERTA 1MD4A 3H93A 5A4WA 4IQAA 3DD3A 2FLSA 4O5RA 1TI1A 4ZB6A 4NHZA 4HEA2 2ES7A 4WBRD 3I9V2 1GWCA 3MWHA 2DIZA 1FVKA 4RI7A 2P0GA 2C0FA 2VAFA 3ZFLA 1A8YA 1B9XC 2HFDA 4HS1A 1PL1A 5J3RA 4IHUA 3GMFA 4AJ8A 1X9MB 3ERWA 3CSIA 2LQQA 2F51A 2VUPA 2H1AA 3R2QA 3IOSA 3M3MA 3L9UA 6GSVA 1G0TA 4PXOA 2QKEA 3IPZA 2YANA 5DQSA 4WEYA 1PA3A 1WE0A 1AAZA 4PURA 2LNSA 1EP7A 2X64A 3AY8A 1OAZA 1HNCA 2GLRA 2DJJA 4LMWA 1FG4A 3KH7A 3VLNA 6GSXA 4ECCA 1SK1A 3TKSA 3QFAC 3A3TA 4J56E 1F6MC 4HJMA 1O7UA 3TOUA 5JCUA 4V2LA 5G1KA 2LRNA 3P7XA 3ZRDA 3GX0A 3QCPA 3ZREA 1FHEA 9GSSA 2OE3A 1LBKA 1RK4A 2L57A 3TGZA 2VOCA 4ZXGA 2K8VA 1T3BA 2H6ZA 4MH2A 1TOFA 3G7YA 5DBQA 2DIYA 2I1UA 2JACA 3ISOA 1Y25A 1GLPA 4ULXA 4PQHA 3C7MA 3IV4A 2FWHA 1M2BA 1UVZA 1O8XA 5B6MA 1DUGA 5IM9A 1Q4JA 2L6CA 2VCXA 4IP1A 5KN1A 2K8SA 2DC5A 4K1FA 2NDOA 3CRUA 2PN8A 5KEJA 1B9YC 2H71A 4IJIA 3J7Yk 4MABA 2N5FA 3UAPA 5IMZA 4NWYA 4KSMA 1BAYA 2YWMA 2H70A 2LRTA 1TKDB 5EY6A 4HQZA 1JZDA 3DKSA 1DE1A 3GSTA 2GZZA 2H73A 2F3MA 4TKYA 1SD9A 3BCIA 1A2LA 1OC8A 4PNGA 4TW5A 3GNJA 1U3AA 2CV4A 3APOA 2VLUA 2R2JA 2VLTA 3CBUA 3HYPA 3UL3A 2WFCA 3VURA 2PERA 4DSSB 4JZQA 1J08A 1TI3A 2LJRA 3MNGA 1XWBA 3GKNA 2VO4A 5COHA 5IQYA 4O32A 4XRAA 5DCGA 2HLSA 4L5OA 4G10A 1UC7A 2YCDA 4OFTA 1GTAA 4OMVA 4OCEA 4I2TA 3D22A 1F37A 4ZILA 1XW9A 1I5GA 2H0HA 2V1MA 2VLVA 2LS5A 1SYXA 3IAM2 5E4WA 1O85A 3DXBA 3DWVA 2VCWA 2X99A 1X5DA 4TOPA 4EF0A 1R5PA 1EZKA 5LNKe 3HXSA 2GVPA 2H74A 1OKTA 2YZHA 2WB9A 1T8EB 2CQ9A 3ZVJA 2XBQA 5JWOB 3NOFA 2B7JA 1PD21 2IMIA 2ALBA 4AF2A 4F9ZA 4WF5A 1XBSA 2MBTA 3WGEA 2AHEA 3RHCA 4GLTA 5DAKA 3D5JA 3UVHA 3GTUA 1GRXA 2N5AA 4WXTA 4JE1A 1O73A 1V98A 5A4UA 22GSA 3FZ4A 2IFQA 4KDUA 3KH9A 4XHMA 2IIYA 3F4RA 1GLQA 3PINA 2G2QA 4MK3A 5G1LA 2X8HA 2OE1A 2CVDA 1AQXA 3CRTA 3BD2A 2R4VA 2AAWA 3HKRA 3VK9A 4RQRA 2C3QA 5KN3A 1IYIA 4E8HA 1GSYA 4CDOA 3GIXA 3K8NA 14GSA 3FEUA 3HZ8A 4EXJA 5HFIA 5ENUA 2ON5A 4EE0A 1YF1A 2EIRA 3GV1A 1J0FA 3UBKA 4KUNA 2TRCP 2IFQB 5AISA 2WGRA 4TR1B 2VCVA 1EGRA 5FT3A 1JLWA 1X5EA 2K9FA 5D9WA 2ZNMA 2I3YA 4EO3A 1FW1A 3Q18A 2HZFA 3FR9A 18GSA 1PSQA 2HZEB 2F8AA 3KMOA 4TN8A 2REMA 3A5WA 2H1BA 3IAS2 3L9VA 4ZBAA 2RLIA 13GSA 4TXOA 1SL2B 3Q19A 2JSZA 12GSA 5J41A 2NPBA 4FYCA 3TKSC 5IOXA 3IDVA 2KOKA 1AW9A 1JLVA 3VWUA 1MTCA 1K0CA 1O8WA 3MDKA 2P5RA 2CZ2A 2VM2A 4K6XA 5AN1A 4QL9A 1NHYA 2P31A 2PVQA 5DALA 4F03A 3GSSA 2PPTA 4EL1A 3RDWA 2B7KA 3FR6A 5H5SA 1PKWA 4YQMA 1Z9HA 3L9SA 2FHEA 5ECRB 1Z6NA 3ZFBA 4MJBA 1FO5A 2C4JA 3WGXA 4V1Ap 3M0FA 5CO3A 1OYJA 3P90A 3QR6A 1GUKA 1GNWA 3D0ZA 2JU5A 1H4OA 3IXRA 4MCUA 3GRXA 2DLXA 1K0AA 4K0GA 4QL7A 1YEXA 4J57E 1SJZA 5F05A 3BBYA 3H4KA 4ECJA 1JZOA 4PQ1A 2L59A 5AGYA 2O87A 4GRFA 2DSAA 3VWXA 5DQYA 4HI7A 1QXHA 2GT5A 3DGQA 1FAAA 3FR3A 1HNAA 2C8UA 2O8VB 1Z6MA 1SYRA 3UBLA 2LRCA 4EC0A 3I6AA 4WKWA 3WGDA 2O89A 3TKPA 2OACA 4V2MA 1A24A 2YNXA 1EGOA 2LUSA 3CMIA 1KNGA 1SK2A 5D96A 1DE2A 4PNFA 6GSSA 1KEBA 3DYRA 4KX4A 2FA4A 3F0IA 2HYXA 3N9JA 2B5XA 2DBCA 4EUYA 1NHOA 5INYA 6GSYA 2QC7A 2F8FA 2LEGA 1ZGNA 4NV2A 4NV5A 3RPPA 1S3AA 5A5KA 2XPDA 3GX8A 4PUAA 1F9MA 5FWGA 4ZBBA 3HDCA 2J23A 4GSSA 3QAVA 1TTZA 1THXA 1CQGA 2GQKA 2ZUPA 2HZEA 2R3XA 1CQHA 3QD9A 3EMPA 5D9XA 3VI5A 3TCOA 5HQPA 4HUAA 1QK8A 1EEJA 1OE7A 2OJLA 2IMKA 5IOWA 4DVCA 3IRAA 3QPMA 2JSYA 1MDJA 1T4ZA 4OD7A 2I81A 1ZOFA 3E9JB 4TXVA 2V6OA 1OC9A 3DVXA 2YV9A 2CVBA 3UJ1A 4XS4A 1DBYA 4KB3A 2B1LA 3GN3A 3US3A 4F2IA 3CTFA 4RI6A 2IL3A 4KW6A 1GULA 2N5BA 4IGJA 3LQ7A 3IA1A 1W4VA 4Q5NA 3TB2A 2C0EA 2C3NA 1PL2A 1YDKA 1SKWB 4PGTA 2XC2A 2HNLA 2YWNA 1QQ2A 1TRUA 4POBA 2AJQB 5EL8A 3RHBA 4Q5FA 5IIZA 1GSSA 16GSA 2XPEA 1TRVA 1R5AA 1SJ6A 4I97A 3FZAA 5G5FA 1M99A 4D73B 1K0OA 2H1DA 1URMA 2L4QA 4KGIA 1F2EA 1GUHA 3HD5A 4YQUA 1C72A 5ECIB 5ECOB 3O76A 1VF4A 1TU7A 2V6KA 1W89A 5IMDA 3EE2A 1N8JA 4L5LA 4BL7A 1LU4A 2VCQA 2OE0A 2R5GA 5JWRB 3QOUA 2OBIA 3GA4A 3F63A 3ZMLA 1XVWA 3GKKA 1XVQA 1ON4A 3UMAA 2F9SA 3PR8A 5CP1A 1YKCA 1V2AA 4XRDA 3L78A 1OVNA 1PMTA 5JWQB 1WOUA 2LNTA 3QDNA 4I2UA 5F8BA 3DMLA 2GQMA 2YWIA 3ERFA 2H76A 1JZRA 5EVOA 17GSA 3HVXA 4JU5A 2D2ZA 2LJKA 4L0WA 5DDLA 2YZUA 3HZ4A 4OCFA 5G31A 1KBNA 2MMNA 1EP8A 1E2YA 3TJBA 1T4YA 4MMMA 2IMDA 4POMA 4LLRA 1B4QA 4XS6A 2PU9C 5GZZB 4GSNA 1FVJA 4XTSA 4X43A 1HNBA 4PQIA 3NIVA 4XS1A 5F06A 4ZL7A 3VWVA 2DJ3A 2YP6A 3HVSA 2DJ0A 3VI7A 3GH6A 1SJIA 3TUEA 2HI7A 1QFNA 2JZSA 4POKA 2C3TA 4N11A 1ILOA 3H8QA 1R4WA 2WJUA 4L8EA 5IPHA 5DJMA 3LWAA 3MSZA 1PN9A 3P8WA 11GSA 2O85A 4BPYA 2J9HA 2CAIA 3FKFA 3A2WA 3TRXA 1YF0A 3FW2A 1GH2A 2VCZA 1VF1A 3CXGA 3APQA 3F4SA 5ECPB 5ID2B 4WR5A 2GSSA 1S3CA 4LL4B 2IMFA 2HT9A 4V2NA 3ZYWA 1XIYA 4DSQA 3GFKA 4Z7XA 4EVMA 5F0GA 4KCEA 3JCML 1XWAA 1WPIA 2MMZA 4KSOA 1GSQA 2FUG2 2LJAA 3C71A 3EURA 5CAXA 2C80A 2KP2A 5B8BA 2R37A 4MZWA 5HFGA 2K18A 3ZIVA 2WDUA 3FYGA 4IW9A 4MH3A 4MLYA 2H01A 2VCTA 3SBCA 5ECKB 2H6YA 4PX1A 2C0DA 2FNOA 3LGCA 3ME8A 2GTUA 3O6TA 20GSA 1M0UA 3LYKA 2TRXA 3WD6A 1YY7A 5D93A 3CYNA 1AC1A 1YJ6A 3OR5A 3GURA 4TR3A 1ZCPA 5ID2A 2WS2A 1BX9A 3Q74A 3EYTA 2PGTA 3N5OA 4NHWA 4OFMA 4ECBA 1LJRA 2WULA 1TP9A 1SL0B 2E7PA 5CREA 2PVOC 4YH2A 5AIVA 2NBSA 4KA0A 4BVYA 3M9JA 3V1WA 1F3AA 3GKMA 3PGTA 4Q5QA 4TRXA 1A2MA 3F9UA 3LXZA 1K3LA 4HU9A 1ERWA 3G7IA 1A0RP 4IQ1A 4F0BA 1T00A 5CRWA 2NVLA 2CX3A 1QGVA 4LA1A 3KD0A 5ECQB 2H72A 2IY2A 1XZOA 4X1UA 1ACVA 4IP6A 3P2AA 2VD0A 10GSA 1E6BA 2JADA 4KNDA 5DVBA 4XCSA 5ECHB 2CX4A 4JEDA 1NSWA 2K6VA 4WETA 3HY2A 3GL3A 3APSA 4P3YB 1A23A 1ZZYA 3KMNA 2V2GA 3DVWA 5ABRA 5CYYA 1MEKA 1U3IA 1T7PB 1XOAA 2MZCA 3KIJA 2E2GA 1M2DA 3TJFA 2RIIA 4EDZA 1I9DA 3KJYA 4JRRA 4G19A 1SKRB 3KM6A 5LD0A 3TKSE 5CRDA 1BJXA 2MMAA 2L4CA 2CVKA 4HQSA 1S3DA 4HZ4A 4XIHA 5GAND 4MP4A 4GWRA 1XXUA 2IN3A 4MPFA 2A2RA 1K0BA 1G6YA 2JZTA 3LJRA 1GTBA 5AIXA 1U87A 4CHSA 2IMEA 3W8JA 1A2JA 3C8EA 4K7NA 2LKUA 4K7IA 4G9HA 1TRSA 3ZIJA 1B8XA 2KLXA 1XFLA 3FHKA 3KCMA 2GSQA 2YPMA 3I69A 5IMAA 3VPQA 4MA9A 1BEDA 1X9WB 1XW5A 5IPGA 1O81A 2YJ7A 1GSUA 4FYUA 1M9AA 2WZ9A 3IE3A 4DSSA 1AUCA 3CSHA 3D21A 3DIEA 1WP0A 3ZVJD 4EKZA 4QQ7A 3GHAA 3E3EA 4MDCA 4ZL9A 5G5EA 3GL5A 2PWJA 4KE3A 1UA5A 3H79A 1OKDA 2DJ1A 1WJKA 4X0XA 5H5QA 2M80A 2FWGA 4PUFC 5GAPD 3HJMA 4ZL8A 2V32A 4NXIA 2WCIA 5CRHA 3D4MA 3FZ9A 1EV9A 2FCHA 2GS3A 3C1RA 1XWKA 4YQVA 1XWCA 5ECMB 2XBIA 3ZMKA 2H66A 2VL3A 1ZMAA 1O6JA 1ERVA 4K9ZA 1GTIA 3LSZA 1VRSD 3RPNA 2IYJA 4ML1A 1EOGA 8GSSA 3DEXA 3D4TA 3G7JA 2AYTA 4KCAA 1RQMA 2OBKA 2CAQA 5A4VA 1HD2A 5HR0A 4OFNA 2VL2C 4MF5A 3GUSA 4TVEA 1BYEA 1XPVA 1PQNA 4DSRA 3ZZXA 1WWJA 3TOTA 3M1GA 3SWLA 4KAEA 1WRYA 5D73A 5C00A 4FO5A 4NAXA 3BJ5A 3EINA 1YEPA 2OKAA 1M7TA 1FB0A 3KZQA 3NZNA 3TKQA 4HU7A 3A2XA 4IELA 2E0QA 3LG6A 5KN2A 2C1YA 1JHBA 1B48A 5GSSA 2HE3A 1SKSB 1SD8A 1HYUA 1OE8A 2YWOA 1ZYQB 3TRPA 5ELAA 2VM1A 2YN1A 4I5QA 3F3QA 3HJOA 4POLA 3EU3A 2DJ2A 4YAVA 5ECNB 1H75A 2YJHA 4F82A 4OWYA 2QSIA 7GSSA 1XWGA 1EOHA 5EPFA 3F8UA 2I9HA 3HA9A 5IMCA 2YOIA 3CTGA 2BTOT 4JR6A 5IO0A 2M72A 1KTEA 1PRXA 1TDIA 1WMJA 1Y6EA 2FD3A 2RM6A 4MF6A 2I4AA 3TJKA 3VFIA 3FY7A 2CA8A 2FWFA 2GQLA 2GDRA 3HJPA 2H30A 2EIQA 3ZLPA 3S9FA 4TR1A 2OADA 2B6MA 3TJGA 3RBTA 1PX6A 2MMOA 4TXOB 1FB6A 1TW9A 3GH9A 5IO2A 5D9TA 4BWQA 1K0MA 4GXZA 3F3RA 4AJ6A 4BA7A 2NTOA 3EWLA 4O7HA 1ML6A 4IJ3A 2L6DA 2CZ3A 1A8LA 4ZB8A 4GSTA 3RAZA 2IPAA 4JR4A 2Z9SA 2VIMA 4E8EA 1TXXA 4N30A 5JCGA 3IK7A 2LQOA 4ISDA 2QGVA 5HR3A 1K3OA 1TK0B 4JBBA 3WT1A 5D8IA 1NW2A 2GGTA 1K3YA 3IHQA 1V58A 5DAKB 5J5NA 3E0UA 4BVXA 1EV4A 1HQOA 1B4PA 4MJCA 3ZTLA 5D9VA 1TK8B 2VD1A 4I8BA 1ABAA 3L4NA 3MAKA 2DMMA 4IBPA 3EMXA 2LSTA 2PBJA 3KP9A 3IC4A 4OO5A 3FRCA 5IMFA 4LMVA 3M9KA 1ZL9A 2HSYA 4AGSA 2A2SA 3HVVA 1XW6A 3EU4A 2H6XA 3FZ5A 4KH7A 3BOAA 1OC3A 3UEMA 3ZL5A 2JL4A 4EDYA 4HOJA 3FK8A 4ZBDA 3DRNA 4GCIA 2PMTA 4WF4A 3UIWA 2VL2A 2C0GA 1J9BA 3EVIA 3QAWA 2HXKA 2A4VA 1OC9B 1AQWA 3QMXA 6GSUA 4ZIJA 5F07A 4K2DA 1G7OA 3TKRA 1QUWA 5J9CA 4HZ2A 4MJAA 1TK5B 3ED3A 3VWWA 2MBSA 2GZPA 2B5EA 2FY6A 2GZYA 4NPBA 5L71A 1U88A 5HFKA 3TDGA 5G2ZA 1TU8A 4IKHA 2H0GA 4O92A 4K8MA 1V40A 4G2EA 2EIOA 4L0UA 3H1NA 3HHVA 4GTUA 1SENA 1U6TA 2KP1A 4I6XA 4DEJA 1MDIA 2PUKC 1VF2A 4FYBA 1XCCA 5HR1A 1GSFA 3LEFA 3QAGA 2ZCTA 5FHIA 2LV3A 4YAPA 1GNEA 4KDXA 4MF7A 1A0FA 5B8AA 2H8LA 4HJ2A 3BCKA 1VGLA 3PH9A 5J4UA 3C1SA 1M9BA 4HDEA 1TJDA 5E59A 3CSJA 3LORA 4K0NA 3HCZA 1WIKA 3J7Yb 2L5OA 3ERGA 5JCWA 1GSDA 2AUVA 1TRWA 4FIWA 4ID0A 3GKXA 4AJ7A 1JFUA 1FOVA 3F4TA 3ME7A 2H0IA 3WYWA 3KEBA 3EC3A 2H19A 2OA7A 3F6DA 4GF0A 2WRTA 2IWTA 1K0NA 3IBHA 3KP8A 1AQVA 3L0HA 6GSTA 5IMVA 1GSEA 1XOBA 2AB6A 4OO4A 2X8GA 1Q98A 1N2AA 4MPGA 1QMVA 5CRGA 2YV7A 2FWEA 1PKZA 1ZYEA 4NMUA 4ML6A 1EWXA 3WT2A 1IYHA 1MDKA 4N0ZA 3C73A 1THOA 1GL8A 4RQXA 4H86A 5J9BA 5ECLB 1AIUA 3LFLA 3I43A 1V9WA 1X5CA 3UOMA 3ZITA 4WR4A 4FH8A 1SU9A 1JZWA 1Z7RA 2P5QA 5B6NA 2L5LA 5DALB 2IJYA 2FA8A 2GSRA 1YZXA 3W6GA 2DMLA 4IN0A 3TJJA 2BJXA 4V1Ag 4GQFA 1ST9A 2ON7A 1G7EA 1GP1A 1Z5YE 2XHFA 2VL9A 4MZBA 4IS0A 3QFBC 2RM5A 2TIRA 3IR4A 1YKAA 4F0CA 3KGKA 1EEMA 5ECSA 1BQ7A 4ECIA 4WBJA 1BG5A 1MD3A 1X9SB 2EC4A 1K0DA 2H1GA 2E2MA 2G0FA 1ERUA 2RUFA 1F3BA 1V57A 3U5RE 3O3TA 3G9BA 4RUVA 5LCZA 3UVTA 19GSA 3IK9A 3D6IA 2X8CA 1YQ1A 2KHPA 4N10A 1R7HA 5C04A 5G30A 1PGTA 3A2VA 3GYKA 4N0VA 3GTUB 2B3SA 5H5RA 2HRNA 4ACSA 3LXTA 1M2AA 2MYGA 1Z7PA 2JZRA 2B5YA 2GT6A 2V41A 2H75A 4D73A 2LTKA 1DSBA 3U6VA 4IVFA 3TRQA 2O7KA 2BMXA 2M46A 1GTUA 1PX7A 1UN2A 2GSTA 4MZCA 1NM3A 2HRFA 5DCHA 4J2FA 4CW9A 1AXDA 1VF3A 3F6FA 5ELGA 5HR2A 3Q6OA 3KXOA 4GQCA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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