4NPBA

The crystal structure of thiol:disulfide interchange protein dsbc from yersinia pestis co92
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
ADDSAIQQTLKKLDIQQADIQPSPIPGISTVMTESGVLYISADGKHLLQGPLYDVSGDQPINVTNQALLKKLEALSSEMIVYKAPEEKHVITVFTDITCGYCRKLHEQMKDYNALGITVRYLAFPRQGLSSQAEKDMRSIWCMADRNKAFDDAMKNNDISPATCKTDISKHYQLGVQFGIQGTPAIVLQNGTIVPGYQGPKEMLQMLNAHQASLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The crystal structure of thiol:disulfide interchange protein DsbC from Yersinia pestis CO92
rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Yersinia pestis
molecule keywords Protein disulfide isomerase II
total genus 59
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 4npbA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4npbA02
1TK5B 2B1KA 1B9YC 4BVYA 3A3TA 3FW2A 5D9VA 1TRSA 3ZFLA 3ZITA 2HE3A 2FGXA 11GSA 2FY6A 1ABAA 2OE3A 3DWVA 1ZCPA 4KA0A 3MNGA 3U6VA 3MDKA 4Q5QA 1GRXA 5CRGA 1TP9A 3O6TA 1Z7PA 4GRFA 2OJLA 2YANA 3RHBA 12GSA 2IWTA 3GKKA 1XWGA 1Z6MA 1J0FA 4TKYA 1S3DA 4GLTA 5JWOB 1URMA 3L78A 5LD0A 2LSTA 1J9BA 2B3SA 3W8JA 3WT2A 4FYCA 3K8NA 1Q98A 2A2RA 3ERWA 1G6YA 2B6MA 4KGIA 3PR8A 1T3BA 3QPMA 5B8AA 3KXOA 1GLPA 2HT9A 2PBJA 4KW6A 1YZXA 5HR1A 2V6OA 3NOFA 2H73A 3IOSA 3M9JA 2KLXA 1M2AA 3QAWA 3UIWA 4IW9A 2TRCP 3LJRA 3DVXA 3Q19A 1B4PA 3F6FA 2HSYA 3I9V2 2VIMA 4IELA 3KTBA 3RDWA 2IMKA 1ACVA 5ECRB 2DIZA 1TU8A 2FNOA 5IMCA 3BCIA 3G9BA 2HZEA 1X5EA 4DSSB 2CAQA 1NW2A 4NHWA 1JZRA 4BVXA 2VLVA 2CZ2A 1O81A 3CTGA 5DBQA 5IIZA 1TOFA 3H8QA 2WRTA 5ECOB 1DBYA 2MMZA 2IMDA 3TKRA 2HZFA 4G10A 1XVWA 2WB9A 4HJ2A 2CT6A 1TU7A 3KCMA 4LL1B 14GSA 5JCGA 2PPTA 3BCKA 3EU4A 4LMVA 2CVBA 1BQ7A 3F3RA 1N8JA 1AQXA 3HY2A 4MH2A 1PL1A 2P0GA 2RM6A 3F63A 1OVNA 4K0GA 3RBTA 3GSSA 3LSZA 5F8BA 1T00A 2XC2A 3KZQA 4BWSA 4NWYA 3GRXA 3CMIA 2WZ9A 2C3QA 3M1GA 1VRSD 3TUEA 3BD2A 4G2EA 5G1KA 1E2YA 1PX6A 2YJ7A 1VF2A 1QQ2A 2FA4A 1KEBA 4MA9A 2YWNA 5EY6A 2H66A 3GX0A 5IMVA 1G6WA 1TJDA 4EO3A 3TJJA 1HQOA 1S3CA 4TXOA 1V2AA 1USBA 1FVKA 1UVZA 1XW5A 3EU3A 3HD5A 5EL8A 2YOIA 2B5XA 3LQ7A 2GLRA 3A2WA 5ID2A 3DGQA 1FW1A 4OO4A 1XWKA 3Q18A 4BPYA 1XPVA 3FR9A 3F9UA 2ZUPA 2H1DA 2O87A 5G1LA 2CVKA 5F05A 1GSYA 3QOUA 2CV4A 1BX9A 1QFNA 1ZOFA 3KMOA 4OFTA 2H30A 3D4MA 8GSSA 3ERGA 1O7UA 5ELAA 1EEMA 1SJZA 2RIIA 4LLRA 1I9DA 4DSQA 3VURA 1M0UA 1SU9A 3M0FA 5COHA 2WFCA 4P3YB 4QQ7A 5L71A 2NPBA 5B6MA 2O89A 5ECKB 1OC3A 2GQMA 3WGDA 1GNWA 2I9HA 4ZL7A 2H72A 4EL1A 4MJEA 1ST9A 3DD3A 4CHSA 1T8EB 5KN3A 1GSDA 1K0AA 2JZRA 1EZKA 1SK2A 1AIUA 2B1LA 4O5RA 1R26A 3ZFBA 4K7NA 1EGOA 1A2LA 3M3MA 3W6GA 2F8FA 4GSSA 5G5FA 4ZB8A 2DMMA 3PH9A 4TVEA 1GP1A 3D21A 2RUEA 5A5KA 2IFQA 3F4SA 1SL2B 4XS4A 1BYEA 1RQMA 2BTOT 3TOUA 1WIKA 2MMAA 1EV9A 1V98A 2C0FA 4EDZA 4ZXGA 2C4JA 3PINA 4IP6A 4FIWA 4FYBA 5LCZA 3LYKA 1SYXA 4BL7A 4J2FA 1PRXA 1GUKA 2DIYA 5DJLA 2DC5A 3C1SA 3QMXA 2QGVA 2JSZA 1Z6NA 2O7KA 3TOTA 2X99A 3L9VA 7GSSA 5AISA 3Q74A 1X0RA 4GWRA 1DSBA 5AGYA 2CQ9A 3GN3A 4OCFA 4ISDA 5KEJA 3ZZXA 1F3AA 4JE1A 3TJFA 2ON7A 1EOHA 4ZB6A 1GUHA 4HI7A 2JADA 5ECMB 2GZPA 1Y25A 1HNAA 1PSQA 4KNDA 2VLTA 1HNCA 1SD8A 4MF7A 1ZMAA 4F2IA 1TRVA 3FEUA 3TKSE 3I69A 2LRCA 5HFIA 2K6VA 2PWJA 3C8EA 1KBNA 2E2MA 3FKFA 3HVXA 3QAVA 3KP8A 4GTUA 2NDOA 2YV7A 3KH7A 4ZB9A 3DEXA 3W8SA 4YAVA 3G7IA 3VWXA 3APQA 1JLWA 1H75A 2GT5A 5ECPB 3IAS2 5INYA 1Z5YE 4I5QA 4AJ7A 2X8CA 1A2MA 2H6YA 2RUFA 3DYRA 4IN0A 1O8WA 4TR1A 2G2QA 4ID0A 3TCOA 3BJ5A 3HVSA 2X8HA 2OE0A 2E7PA 2I81A 4YQUA 2AB6A 3EMPA 4V2LA 5EPFA 4L5OA 2HLSA 3H4KA 2OBKA 2P5QA 2WGRA 2YWIA 2EIQA 3FZAA 2J9HA 2L59A 1GSUA 5ECIB 5G5EA 3LORA 1Z7RA 4K9ZA 4XS1A 4LL4B 3VI7A 1M9AA 1A8YA 2NVLA 1ERWA 3GFKA 4IHUA 2VL2C 4TXOB 3EVIA 2GZZA 4KCAA 2H8LA 2ZCTA 6GSTA 1FVJA 2VD1A 2NBSA 5ECQB 5ID2B 4LMWA 4NV2A 4IP1A 1Q4JA 1MTCA 2CA8A 1XBSA 1PGTA 3VK9A 5ABRA 2N5FA 4WBJA 2HI7A 3P90A 2QC7A 3UMAA 1R7HA 2GSTA 2H01A 3WD6A 1SKRB 4YQVA 1YDKA 1ERUA 2LJRA 4JEDA 5C04A 3WGEA 4V1Ap 3V1WA 3TRXA 4WEYA 2B5EA 1PX7A 3GL3A 1OE7A 1XOBA 4MJCA 1T7PB 3SBCA 5IPHA 1EEJA 2R6KA 1XVQA 3UEMA 3VFIA 4E8HA 1OKDA 4MZCA 4KUNA 1GTIA 1GNEA 1TRWA 3VWUA 3C71A 1K3YA 2C0EA 4POLA 2VL2A 4N11A 3KMNA 4PNGA 1PL2A 1VF1A 4V2MA 2LNTA 3F6DA 4ILFA 3TKSC 1W4VA 5CREA 2IFQB 1U6TA 3FR3A 3UAPA 5LNKe 4X43A 4XS4B 3CRUA 1ML6A 2FWFA 4F03A 5IOXA 4HJMA 4O92A 3UOMA 5IMAA 2JU5A 2H0IA 4AJ6A 3FHKA 2QKEA 2HFDA 2LTKA 1GTBA 1M2BA 4MZWA 3GKXA 3DVWA 5GSSA 4HUAA 4EXJA 2FA8A 4I97A 4KE3A 1SL0B 1B48A 2I4AA 3GH6A 2FWGA 5CRWA 1S3AA 2L57A 1TTZA 1JHBA 1YY7A 4WR4A 3ZREA 3I43A 3GSTA 2FD3A 1TI3A 2C8UA 2C0DA 5CRHA 1NHOA 4WF5A 3HZ4A 2ES7A 2K8VA 2K9FA 3A2XA 1MDJA 1A0RP 1SJ6A 2C3TA 4HU7A 4J56E 1ZZYA 3BOAA 4JR4A 3ME7A 1EOGA 2DJJA 2LRTA 1K3LA 3TKSA 4TR3A 1AQWA 3ZRDA 3U5RE 2H19A 3HDCA 4MMMA 4KDXA 4WBRD 3H93A 2MYGA 5J5NA 3CBUA 2E0QA 1A8LA 4IJ3A 1GUMA 1BAYA 1SL1B 2RM5A 2V32A 4GSNA 1HD2A 5CYYA 2M46A 1EP7A 2VOCA 2BMXA 3GKMA 1G7EA 5DVBA 3AY8A 4GXZA 5F07A 3F8UA 3GX8A 3IC4A 1YF0A 4RQXA 1OC9B 5CO3A 4XS6A 2VUPA 1MD4A 4G19A 1GSEA 1YKCA 4TR1B 3HJOA 1TW9A 2CX4A 4ECIA 2HSHA 5IO2A 2L5OA 2KP2A 1BJXA 2LRNA 5IQYA 3GH9A 1W89A 4HU9A 1FO5A 4I2UA 3GL5A 5HR3A 2Z9SA 1DE2A 5DJMA 3ZTLA 1TXXA 5A4WA 1U3AA 2L4CA 4I2TA 3IK9A 5DCHA 6GSVA 3IXRA 2JL4A 2O8VB 2GTUA 4KH7A 5B8BA 3TKQA 4NMUA 3VPTA 2VM1A 5G30A 1K0OA 1WMJA 4YQMA 3QCPA 2HRNA 2VCZA 3G7JA 2ZNMA 4K2DA 3CSHA 4PQHA 2JACA 1LBKA 4FYUA 1TI1A 4TW5A 3TJGA 1JLVA 1MEKA 2MMOA 2TRXA 4L8EA 6GSSA 4PNFA 2BJXA 3IPZA 2DLXA 4HZ2A 2H1BA 1NHYA 3A2VA 5DAKA 3ZMKA 4KB3A 3VLNA 2VCVA 1FOVA 4EDYA 6GSWA 1DUGA 4NV5A 5GAND 1PD21 2GVPA 4D73B 2DJ0A 4MK3A 5F06A 3J7Yb 3N9JA 2QSIA 2VO4A 1XFLA 3ZVJD 1ZYQB 1SD9A 5H5SA 3FZ4A 2H71A 2VCXA 2PU9C 2OADA 3OR5A 4FO5A 3RPPA 1MD3A 4V2NA 4X1UA 1UA5A 1XWBA 5A4UA 2X64A 2AUVA 2IY2A 2LJAA 2C80A 3DXBA 3L9SA 2IMIA 1NSWA 1RW1A 1XOAA 1AXDA 2EIRA 3L0HA 5JCUA 3GNJA 2LUSA 4JR6A 3TGZA 1CQHA 5IPGA 4KX4A 3MWHA 5HFKA 3QAGA 2FWHA 3VWWA 3HKRA 3WYWA 1SENA 3E0UA 3ME8A 1M99A 4Q5NA 2LKUA 4MH3A 4ZILA 4MJAA 4POMA 4Q5RA 10GSA 5JWRB 3LXZA 16GSA 3M8NA 5H5RA 3NIVA 1K0BA 1VF4A 1U88A 2VAFA 5HR0A 1JZDA 3CSJA 2VM2A 2A2SA 2L6CA 1K0CA 1BEDA 3HJMA 4CDOA 1T4YA 1TK8B 2VCQA 4OFMA 5D9XA 1OC8A 2LNSA 1TK0B 3H79A 4WR5A 3ZIVA 3TKPA 4NXIA 2MBTA 3UJ1A 2GZYA 2DBCA 2GSQA 2HNLA 2PN8A 4F9ZA 1Y6EA 22GSA 2AV4A 2R2JA 1X5CA 1HYUA 2GDRA 4L0UA 4XCSA 5GSTA 4ACSA 1N2AA 3E9JB 4NAXA 2B5YA 3R2QA 19GSA 4BA7A 4IJIA 2DSAA 3HCZA 1WRYA 4ULXA 1GWCA 6GSXA 1O73A 2REMA 2M80A 4KSOA 3JCML 2RLIA 3N5OA 6GSYA 2XPDA 3HHVA 2G0FA 4GQCA 1LU4A 2YWMA 4JBBA 2K18A 3GYKA 2GGTA 1F3BA 1AQVA 3NZNA 2AHEA 3HA9A 2LJKA 4EVMA 2IN3A 3C73A 4K7OA 18GSA 2VL9A 1V57A 3EE2A 4MDCA 2NTOA 1OC9A 4TRXA 1WP0A 4IS0A 4MZBA 4POKA 2H75A 4BWQA 2F3MA 3J7Yk 2YZHA 5JCWA 2OBIA 1ON4A 2KUCA 3HZ8A 1R5PA 2PVOC 5C00A 2PGTA 1GH2A 4PGTA 1PKZA 1DE1A 2ON5A 4PQ1A 3D22A 3US3A 1XXUA 3KIJA 1O6JA 3CXGA 5E59A 1YEXA 3PGTA 3LXTA 3F0IA 4POBA 1UC7A 17GSA 1WPIA 1PMTA 2KOKA 4K7IA 2V6KA 5ECLB 1GL8A 1JZOA 3EC3A 2H0HA 5D9WA 1NM3A 1R4WA 3GTUA 1B8XA 4GSTA 2R5GA 1EP8A 3EYTA 5DQYA 1J08A 5D96A 4OD7A 4ECCA 2KP1A 5DALA 4WXTA 5DAKB 2GT6A 2P31A 2YCDA 3LWAA 3L9UA 1IYIA 2A4VA 5EVOA 3HVVA 3DIEA 3KP9A 2LEGA 1R5AA 2YNXA 3QFBC 4D73A 5ECHB 1M7TA 2H76A 2EIOA 3APSA 3QR6A 3LGCA 3UBKA 1F9MA 3P8WA 2CVDA 2YJHA 3HYPA 4V1Ag 3WT1A 4KAEA 3FZ9A 1A24A 2M72A 2XBQA 1A0FA 1VF3A 4Z7XA 2JSYA 3O76A 4QL7A 1JFUA 2FUG2 4K0NA 2LQOA 2DJ1A 2V41A 3FZ5A 1YKAA 2CX3A 4EF0A 2OKAA 4KDYA 4ZBAA 1MDKA 4K6XA 2C0GA 5FWGA 1XIYA 1XW6A 2H70A 4IVFA 3RHCA 3KD0A 3D6IA 4K1FA 1C72A 4TR0A 4O7HA 4PX1A 2XPEA 5G2ZA 4RI7A 1SYRA 2J23A 4DEJA 2LS5A 1XZOA 1T4ZA 5E4WA 3FRCA 4OWYA 1VGLA 1X9SB 5CRDA 4MF5A 4TR4A 1WOUA 5JWQB 2PUKC 1PA3A 1WJKA 2IMEA 3GUSA 3KEBA 4IGJA 2OACA 2EC4A 2FCHA 1FB6A 2GQLA 3QD9A 3FY7A 4IQ1A 5J9BA 4N30A 4XRDA 1QK8A 5G31A 3I6AA 3F4TA 1ZYEA 1TKDB 1GSSA 1FHEA 1V9WA 4RUVA 4ZL8A 3KH9A 1XCCA 1K0NA 2OE1A 3IR4A 5H5QA 2B7JA 4GF0A 4CW9A 4ZIJA 1X5DA 1JZWA 2L5LA 1GTUA 4ML6A 5DQSA 4PQIA 1OAZA 3EURA 2WJUA 3C7MA 2FHEA 2IL3A 4HQSA 4FH8A 3WGXA 1EV4A 3KGKA 4DVCA 1ZL9A 3ERFA 5D9TA 2XBIA 2YP6A 1HNBA 1FG4A 3DMLA 5IO0A 1YEPA 5AIVA 3IE3A 4NPBA 4OO5A 2WCIA 4PUAA 2GS3A 5FT3A 3MAKA 3GA4A 1WWJA 1AAZA 1SK1A 5DDLA 2LV3A 4DSRA 3IDVA 4K8MA 1Z3EA 4I8BA 2AAWA 2IYJA 2ALBA 2L4QA 4RQRA 5CP1A 1LJRA 3GV1A 4OMVA 1YJ6A 1AC1A 1M9BA 5ECSA 4EKZA 4IKHA 2K8SA 3RAZA 1O8XA 2VL3A 4G9HA 2V1MA 3A5WA 3TJBA 2GQKA 3GTUB 4L0WA 2VCWA 3IK7A 4GQFA 3TJKA 2WULA 5CNWA 5IOWA 3FR6A 1THOA 2AJQB 1F6MC 9GSSA 5FHIA 4X0XA 4MABA 5DALB 3DKSA 2JZSA 2WDUA 2YN1A 2F8AA 3ZL5A 4YAPA 3C1RA 4QL9A 3SWLA 3IBHA 4O32A 2X8GA 2JZTA 3CYNA 1KTEA 2E2GA 1GSQA 2IPAA 5GZZB 3ZLPA 1MDIA 5J41A 5HR2A 1V58A 2CZ3A 2XHFA 5KN1A 1ILOA 3GHAA 2YPMA 3IA1A 1OKTA 1T1VA 2P5RA 4EE0A 1TDIA 4PXOA 3IRAA 4JU5A 1QMVA 1SKWB 4NHZA 5ECNB 2MBSA 4TN8A 2R37A 3GMFA 2YV9A 5D8IA 3EINA 4F0BA 3UVHA 1TRUA 3F4RA 3MSZA 2H1GA 3LFLA 3VPQA 1OYJA 2AYTA 3ED3A 4ZBBA 1AW9A 5J9CA 1X9WB 2DJ3A 3D5JA 3QFAC 1CQGA 2HXKA 2IMFA 3Q6OA 2VD0A 1K0MA 1GLQA 5KN2A 5B6NA 3UVTA 2R3XA 3ZIJA 1ERVA 4HS1A 3UL3A 1U87A 3KTLA 1B9XC 1YQ1A 1V40A 2DMLA 5J4UA 4AGSA 3ZYWA 2PMTA 4N0VA 1M2DA 2H74A 3D4TA 1FB0A 3O3TA 3EMXA 2HYXA 3ZMLA 3IHQA 3IAM2 1IYHA 1K3OA 1XWCA 20GSA 4JZQA 2C1YA 4LA1A 2PERA 3ZVJA 2LQQA 4XTSA 3KM6A 1XW9A 4ZBDA 1PN9A 2GSRA 1SK0A 1K0DA 4WF4A 3VI5A 1G0TA 1THXA 4XIHA 1QGVA 4HOJA 3QDNA 3UARA 5CAXA 4ECJA 2KHPA 3P2AA 3KJYA 3DRNA 4MPGA 4Q5FA 6GSUA 3LEFA 2F9SA 2FLSA 1WE0A 3APOA 1OE8A 2GSSA 5KN0A 5IM9A 2HZEB 4HZ4A 2B7KA 3S9FA 3VWVA 1RK4A 4MPFA 4KDUA 2N5AA 4MJBA 5A4VA 2H1AA 4ML1A 3LG6A 2YZUA 4N10A 4L5LA 2TIRA 4DSSA 1Z9HA 3M9KA 2IJYA 2HRFA 1BG5A 2MZCA 1O85A 2D2ZA 4GCIA 1UN2A 1GULA 3HJPA 1X9MB 5DCGA 3GKNA 4WETA 4N0ZA 3UBLA 1SKSB 4HDEA 2H6XA 1PKWA 2IIYA 2N5BA 2FWEA 3D0ZA 5D93A 3F3QA 4WKWA 4TXVA 4OFNA 1U3IA 5F0GA 5J3RA 3RPNA 3FK8A 3ISOA 4PURA 5HQPA 1H4OA 3LYPA 5IMFA 1G7OA 1ERTA 2MMNA 1A2JA 3IV4A 1B4QA 1ZGNA 2PVQA 4RI6A 2VCTA 2WS2A 3E3EA 4MP4A 4KSMA 2H6ZA 1EGRA 3EWLA 3BBYA 2F51A 2DJKA 2L6DA 1F37A 1F2EA 3TB2A 4KCEA 4ECBA 4J57E 4TOPA 3FYGA 1GSFA 1E6BA 3TRPA 4MF6A 4AF2A 2YWOA 3GURA 3P7XA 1A23A 4IBPA 13GSA 1PQNA 2I3YA 2I1UA 3GIXA 1AUCA 1FAAA 1QXHA 2OA7A 3HXSA 5ELGA 1SJIA 3TRQA 5B7CA 1XWAA 4XHMA 2V2GA 5AIXA 4HQZA 4E8EA 3CRTA 3CTFA 4MCUA 3TDGA 5GAPD 3H1NA 1QUWA 3G7YA 2C3NA 1YF1A 2R4VA 5HFGA 3L4NA 4YH2A 1I5GA 4IQAA 5IMDA 4MLYA 4AJ8A 4JRRA 4ZL9A 5ENUA 4OCEA 1GTAA 5AN1A 4F0CA 1EWXA 4PUFC 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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