4NQNA

Crystal structure of the bromodomain of human brd9 in complex with a triazolo-phthalazine ligand
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
ESTPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVANEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMSKERLLALKRSM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 9
publication title Crystal Structure of the bromodomain of human BRD9 in complex with a triazolo-phthalazine ligand
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 113
sequence length 113
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nqnA00
5L99A 5EPBA 4HBVA 5FE2A 4CUUA 4UYDA 3GG3A 4HXKA 4CUPA 5EWDA 4QSWA 5FG6A 3I3JA 5DKCA 4QZSA 3U5KA 2KTBB 4XY9A 4HXSA 5J0DA 3G0LA 5D25A 4NQNA 4CUSA 5A5OA 4NRBA 4UYEA 5FB0A 3LQIA 3LXJA 5F25A 1JSPB 4YATA 1WUGA 4QR4A 5CQAA 5E3DA 3NXBA 4QSRA 4YY6A 4A9EA 5ENBA 4CFLA 4NYWA 5JI8A 3O37A 3DAIA 3UV2A 2DVQA 5G4SA 3S91A 5FE0A 5CFWA 5I83A 4LYSA 4IR6A 5EI4A 4MEPA 4YBMA 4O72A 4QUTA 4TZ2A 4NRCA 4IR4A 5L98A 5EA1A 5CPEA 4BW1A 3UW9A 4J3IA 5C85A 5I88A 2WP1A 5CUGA 4QSUA 5I1QA 4A9OA 4IORA 4C66A 5HFRA 3D7CA 3MULA 4QY4A 5A5RA 5HRXA 5KU3A 4O77A 4OUFA 5CUBA 4O78A 5D24A 2F6NA 4QUUA 2E7NA 4TQNA 5G4RA 4HXPA 1WUMA 5EPSA 2I8NA 5A5SA 5LKUA 5FB1A 4QSQA 5KO4A 2GRCA 3O35A 4YYHA 3UV5A 5FE1A 5E73A 3JVLA 3QZSA 4CUQA 2YELA 3MQMA 5BT4A 5JWMA 3MUKA 2YQDA 4HXMA 1JM4B 5ENCA 4HBYA 4PY6A 5E0RA 4KV4A 5A85A 4UYFA 4BHWA 4CLBA 5L8UA 4LZSA 5DX4A 4YYDA 4A9FA 5HJCA 5D3NA 4QR3A 1ZS5A 2NXBA 4O7BA 4WHUA 4Z6IA 3UV4A 5L96A 5D3PA 5ETBA 5HFQA 5A81A 5A82A 4N4FA 2L5EA 5A5NA 4YYGA 3QZVA 5FFYA 4QC3A 4NR8A 5I7YA 5E74A 4TT6A 5CQ7A 5AMFA 3UVYA 3RCWA 5CQ3A 3U5NA 5CP5A 5FBXA 5DW1A 4QEWA 5DW2A 4PCEA 2RO1A 3U5PA 5DKDA 2YW5A 4YBSA 5D3SA 2OUOA 4ALGA 4TT2A 5H1TA 3JVKA 4HXNA 4TU6A 5LKTA 5I89A 2RNXA 5EICA 3S92A 4GPJA 4LRGA 5LKZA 4UIZA 4MR3A 4IOQA 5AD2A 2DATA 5EISA 5F5ZA 5D3JA 3TLPA 5EWWA 5LVRA 2LSPB 3AADA 3IU5A 4QR5A 4YYJA 5EK9A 2RFJA 4UIXA 5CUDA 4TS8A 5CS8A 5FH8A 5EWHA 5D0CA 4IR3A 5FE6A 2R10A 4BW2A 4XUAA 4Z1QA 5EP7A 4HBXA 5CQ8A 5L8TA 5IGKA 4O71A 5CZGA 3QZTA 5HCLA 4O7EA 5DY7A 5E9KA 2L84A 4BW4A 4A9IA 5FE8A 4LC2A 5EV9A 5CUAA 4NRAA 4IOOA 4PCIA 5FH7A 5AD3A 4OGJA 4QC1A 4QEUA 4NYVA 5CY9A 3FKMX 5DFBA 3HMEA 2N9GA 4ZQLA 4YH3A 2YEMA 3Q2EA 5H1UA 2OSSA 4A9LA 4O70A 4UIVA 3U5OA 5EQ1A 5HLSA 4NR4A 2RNWA 5A83A 5CU8A 2R0VA 3LQJA 5DLXA 5D26A 4UYGA 2FSAA 4E96A 4LZRA 4CURA 5F1HA 1X0JA 3HMHA 5A7CA 5H85A 5IG6A 4YY4A 3IU6A 5D3LA 5KTUA 5FE4A 5DBMA 2YYNA 4OGIA 4YK0A 4YH4A 4QBMA 4TU4A 4CL9A 4HXOA 5CQ6A 4ALHA 4Q0NA 4CUTA 4UIYA 4O75A 4N3WA 3ONIA 5H1VA 4A9JA 4J1PA 4FLPA 3UVWA 3K2JA 4YADA 5BT5A 4TT4A 5F1LA 5CQTA 3MB3A 4HXRA 4MR6A 5II1A 5LJ0A 3SVFA 5DFCA 5EWCA 5E3GA 5FH6A 5LJ1A 4UITA 4C67A 5LVQA 5C89A 3JVJA 4NR9A 3UVXA 3P1EA 4WIVA 4Z93A 5E9LA 5HM0A 5AMEA 5ENFA 5LUUA 5EGUA 5FDZA 5KHMA 4LYWA 5D3RA 4NR5A 5I86A 5I80A 3MXFA 4HBWA 5DYCA 4QSVA 4YYNA 5D3TA 2E3KA 4KCXA 5IGNA 3U5MA 5L97A 1N72A 2D82A 4A9KA 3LJWA 5E7DA 2F6JA 4UIWA 4MEQA 5ENHA 5HQ5A 5C87A 4QSPA 5COIA 4XUBA 5HRWA 5IGMA 3O33A 2E7OA 4J0SA 4UYFB 4NUCA 4TZ8A 4MR5A 5F36A 5D3HA 3JVMA 4HXLA 5E9YA 4WHWA 4O7CA 4A9NA 2YEKA 4TYLA 5LKXA 4QEVA 3O34A 4IR5A 3ZYUA 2R0SA 5I7XA 4NXJA 4YABA 5ACYA 5CGPA 4XY8A 5TCMA 2DVSA 3AQAA 4MR4A 5F3AA 5FE7A 2RS9B 4QSTA 5DYXA 5IBNA 5TB6A 5C8GA 5E9VA 5ETDA 4NYXA 5EU1A 3P1FA 4YAXA 1E6IA 4PS5A 5EVAA 2L85A 3U5LA 4YC9A 3DWYA 5E9IA 2D9EA 2G4AA 4YYIA 3LQHA 5CQ5A 5A5PA 2R0YA 4PKLA 4BW3A 4NQMA 5KTXA 4NUDA 5F63A 3SVGA 4NS5A 5I40A 4QYLA 2MJVB 5A5QA 3G0JA 4MENA 5F62A 3UVDA 4NUEA 5ENJA 4O76A 5FE5A 1EQFA 2RNYA 4A9MA 5BT3A 4AKNA 1F68A 4YBTA 4ZC9A 5EWVA 4QB3A 4XYAA 4ZW1A 3MB4A 5FFVA 4Z1SA 4Z6HA 5FG5A 4X2IA 4Y03A 5KTWA 5E9MA 5EPRA 4TTEA 4O7AA 5IIDA 4LZ2A 5EM3A 5CRZA 3HMFA 4N4GA 4J0RA 4O7FA 5HQ6A 4LR6A 3P1DA 4O74A 5IGLA 5C4QA 5I29A 2DWWA 5DKHA 4BJXA 5CUCA 4QYDA 5HQ7A 5FFWA 5F60A 5F61A 5LJ2A 4A9HA 5HELA 5CQ4A 5HRVA 2OO1A 2DKWA 5FG4A 5D7XA 5DLZA 2H60A 5C7NA 4LDFA 4QSSA 2I7KA 4PTBA 5ENGA 4NR7A 4UIUA 5ENIA 5HEMA 4MEOA 4F3IA 3Q2FA 4DONA 3SVHA 2WP2A 2DVVA 5FE3A 2YDWA 4NR6A 5DYUA 4KV1A 3P1CA 4QSXA 4LYIA 4N4HA 4YYKA 3P5OA 5FE9A 3O36A 4UYHA 5F2PA 5CRMA 5II2A 4Q0OA 5CTLA 3U5JA 2RI7A 4RVRA 5K29A 5CUEA 5ENEA 5DFDA 5DYAA 4YYMA 5HENA 4N4IA 4QNSA 4CFKA 2DVRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5L99A 5EPBA 4HBVA 5FE2A 4CUUA 4UYDA 3GG3A 4HXKA 4CUPA 5EWDA 4QSWA 5FG6A 3I3JA 5DKCA 4QZSA 3U5KA 2KTBB 4XY9A 4HXSA 5J0DA 3G0LA 5D25A 4NQNA 4CUSA 5A5OA 4NRBA 4UYEA 5FB0A 3LQIA 1ZKRA 3LXJA 5F25A 1JSPB 4YATA 3VKGA 1WUGA 4QR4A 5CQAA 5E3DA 3NXBA 4QSRA 4YY6A 4A9EA 5ENBA 4CFLA 4NYWA 5JI8A 3O37A 3DAIA 3UV2A 2DVQA 5G4SA 3S91A 5FE0A 5CFWA 5I83A 4LYSA 4IR6A 5EI4A 4MEPA 4YBMA 4O72A 4QUTA 4TZ2A 4NRCA 4IR4A 5L98A 5EA1A 5CPEA 4BW1A 3UW9A 4J3IA 5C85A 5I88A 2WP1A 5CUGA 4QSUA 5I1QA 4A9OA 4IORA 4C66A 5HFRA 3D7CA 3MULA 4QY4A 5A5RA 5HRXA 5KU3A 4O77A 4OUFA 5CUBA 4O78A 5D24A 2F6NA 4QUUA 2E7NA 4TQNA 3ERRA 5G4RA 4HXPA 1WUMA 5EPSA 2I8NA 5A5SA 5LKUA 5FB1A 4QSQA 5KO4A 2GRCA 3O35A 4YYHA 3UV5A 5FE1A 5E73A 3JVLA 3QZSA 4CUQA 2YELA 3MQMA 5BT4A 5JWMA 3MUKA 2YQDA 4HXMA 1JM4B 5ENCA 4HBYA 4PY6A 5E0RA 4KV4A 5A85A 4UYFA 4BHWA 4CLBA 5L8UA 4LZSA 5DX4A 4YYDA 4A9FA 5HJCA 5D3NA 4QR3A 1ZS5A 2NXBA 4O7BA 4WHUA 4Z6IA 3UV4A 5L96A 5D3PA 5ETBA 5HFQA 5A81A 5A82A 4N4FA 2L5EA 5A5NA 4YYGA 3QZVA 5FFYA 4QC3A 4NR8A 5I7YA 5E74A 4TT6A 5CQ7A 5AMFA 3UVYA 3RCWA 5CQ3A 3U5NA 5CP5A 5FBXA 5DW1A 4QEWA 5DW2A 4PCEA 2RO1A 3U5PA 5DKDA 2YW5A 4YBSA 5D3SA 2OUOA 4ALGA 4TT2A 5H1TA 3JVKA 4HXNA 4TU6A 5LKTA 5I89A 2RNXA 5EICA 3S92A 4GPJA 4LRGA 5LKZA 4UIZA 4MR3A 4IOQA 5AD2A 2DATA 5EISA 5F5ZA 5D3JA 3TLPA 5EWWA 5LVRA 2LSPB 3AADA 3IU5A 4QR5A 4YYJA 5EK9A 2RFJA 4UIXA 5CUDA 4TS8A 5CS8A 5FH8A 5EWHA 5D0CA 4IR3A 5FE6A 2R10A 4AKHA 4BW2A 4XUAA 4Z1QA 5EP7A 4HBXA 5CQ8A 5L8TA 5IGKA 4O71A 5CZGA 3QZTA 5HCLA 4O7EA 5DY7A 5E9KA 2L84A 4BW4A 4A9IA 5FE8A 4LC2A 5EV9A 5CUAA 4NRAA 4IOOA 4PCIA 5FH7A 5AD3A 4OGJA 4QC1A 4QEUA 4NYVA 5CY9A 3FKMX 5DFBA 3HMEA 2N9GA 4ZQLA 4YH3A 2YEMA 3Q2EA 5H1UA 2OSSA 4A9LA 4O70A 4UIVA 3U5OA 5EQ1A 5HLSA 4NR4A 2RNWA 5A83A 5CU8A 2R0VA 3LQJA 5DLXA 5D26A 4UYGA 2FSAA 4E96A 4LZRA 4CURA 5F1HA 1X0JA 3HMHA 5A7CA 5H85A 5IG6A 4YY4A 3IU6A 5D3LA 5KTUA 5FE4A 5DBMA 2YYNA 4OGIA 4YK0A 4YH4A 3VKHA 4QBMA 4TU4A 4CL9A 4HXOA 5CQ6A 4ALHA 4Q0NA 4CUTA 4UIYA 4AI6A 4O75A 4N3WA 3ONIA 5H1VA 4A9JA 4J1PA 4FLPA 3UVWA 3K2JA 4YADA 5BT5A 4TT4A 5F1LA 5CQTA 3MB3A 4HXRA 4MR6A 5II1A 5LJ0A 3SVFA 5DFCA 5EWCA 5E3GA 5FH6A 5LJ1A 4UITA 4C67A 5LVQA 5C89A 3JVJA 4NR9A 3UVXA 3P1EA 4AKGA 4WIVA 4Z93A 5E9LA 5HM0A 5AMEA 5ENFA 5LUUA 5EGUA 5FDZA 5KHMA 4LYWA 5D3RA 4NR5A 5I86A 5I80A 3MXFA 4HBWA 5DYCA 4QSVA 4YYNA 5D3TA 2E3KA 4KCXA 5IGNA 3U5MA 5L97A 1N72A 2D82A 4A9KA 3LJWA 5E7DA 2F6JA 4UIWA 4MEQA 5ENHA 5HQ5A 5C87A 4QSPA 5COIA 4XUBA 5HRWA 5IGMA 3O33A 2E7OA 4J0SA 4UYFB 4NUCA 4TZ8A 4MR5A 5F36A 5D3HA 3JVMA 4HXLA 5E9YA 4WHWA 4O7CA 4A9NA 2YEKA 4TYLA 5LKXA 4QEVA 3O34A 4IR5A 3ZYUA 2EJNA 2R0SA 5I7XA 4NXJA 4YABA 5ACYA 5CGPA 4XY8A 5TCMA 2DVSA 3AQAA 4MR4A 5F3AA 5FE7A 2RS9B 4QSTA 5DYXA 5IBNA 5TB6A 5C8GA 5E9VA 5ETDA 4NYXA 5EU1A 3P1FA 4YAXA 1E6IA 4PS5A 5EVAA 2L85A 3U5LA 4YC9A 3DWYA 5E9IA 2D9EA 2G4AA 4YYIA 3LQHA 5CQ5A 5A5PA 2R0YA 4PKLA 4BW3A 4NQMA 5KTXA 4NUDA 5F63A 3SVGA 4NS5A 5I40A 4QYLA 2MJVB 5A5QA 3G0JA 4MENA 5F62A 3UVDA 4NUEA 5ENJA 4O76A 5FE5A 3D1DA 1EQFA 2RNYA 4A9MA 5BT3A 4AKNA 1F68A 4YBTA 4ZC9A 5EWVA 4QB3A 4XYAA 4ZW1A 3D1BA 1PUOA 3MB4A 5FFVA 4Z1SA 4Z6HA 5FG5A 4X2IA 4Y03A 5KTWA 5E9MA 5EPRA 4TTEA 4O7AA 5IIDA 4LZ2A 5EM3A 5CRZA 3HMFA 4N4GA 4J0RA 4O7FA 5HQ6A 4LR6A 3P1DA 4O74A 5IGLA 5C4QA 5I29A 2DWWA 5DKHA 4BJXA 5CUCA 4QYDA 5HQ7A 5FFWA 5F60A 5F61A 5LJ2A 4A9HA 5HELA 5CQ4A 5HRVA 2OO1A 2DKWA 5FG4A 5D7XA 5DLZA 2H60A 5C7NA 4LDFA 4QSSA 2I7KA 4PTBA 5ENGA 4NR7A 4UIUA 5ENIA 5HEMA 4MEOA 4F3IA 3Q2FA 4DONA 3SVHA 2WP2A 2DVVA 5FE3A 2YDWA 4NR6A 5DYUA 4KV1A 3P1CA 4QSXA 4LYIA 4N4HA 4YYKA 3P5OA 5FE9A 3O36A 4UYHA 5F2PA 5CRMA 5II2A 4AKIA 4Q0OA 5CTLA 3U5JA 2RI7A 4RVRA 5K29A 5CUEA 5ENEA 5DFDA 5DYAA 4YYMA 5HENA 4N4IA 4QNSA 4CFKA 2DVRA
chains in the Genus database with same CATH topology
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