4NRAA

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with compound-6 e11322
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Targeting low-druggability bromodomains: fragment based screening and inhibitor design against the BAZ2B bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
total genus 42
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nraA00
4UYFA 5DLXA 4BW4A 5H1VA 2DVQA 5HM0A 3Q2FA 4MR5A 3IU6A 5EVAA 2L85A 2R10A 5II1A 5F25A 4LYSA 5CFWA 4XYAA 4ZW1A 5DKHA 5BT4A 4YC9A 4QYLA 3AADA 5HRWA 5EA1A 4O71A 4TT2A 2RO1A 5F2PA 4HBWA 5EM3A 4A9LA 5CRZA 4PY6A 5LJ2A 3JVKA 4NRBA 4QYDA 4QR3A 4QZSA 5LVQA 5HLSA 4LRGA 5HQ5A 5FE6A 4O7EA 4CL9A 5FE5A 5F1LA 4ZQLA 5E3DA 5EWHA 4UYGA 4TT4A 5ENGA 3MQMA 2RNWA 4PS5A 5CQTA 4WHWA 4CUPA 5A5QA 4NS5A 3U5NA 2RNYA 5ENJA 4HBYA 3QZTA 2RS9B 5CP5A 3TLPA 5KHMA 2OO1A 5CUDA 5DYAA 4NYXA 4QSUA 5H1UA 5KTUA 4UYEA 3UW9A 5F5ZA 4BW2A 5BT3A 5A5PA 4UIUA 5CUEA 2L5EA 4NQNA 2RI7A 5FFYA 4NR7A 4YBSA 4Z1QA 4YAXA 5KO4A 4PTBA 4Q0OA 4QR5A 5L8UA 4A9IA 4HXPA 4X2IA 5J0DA 5HRVA 4J0SA 3U5OA 5IG6A 3P1EA 4TT6A 3UV2A 5ENCA 5HFRA 4MR3A 5FG5A 5BT5A 5DFBA 5E9IA 3U5LA 2R0VA 4LZ2A 5C7NA 2N9GA 4Z6IA 3P5OA 4MR4A 3UV5A 4CUSA 5K29A 5LKZA 5CQ8A 3HMEA 4A9HA 5I88A 3MB3A 2GRCA 5L96A 3O34A 5IGMA 5ENEA 5FE2A 5AMEA 5H1TA 5E74A 4QUTA 5FH6A 5A85A 5F62A 2YW5A 4O72A 5FFWA 4F3IA 4UITA 5I83A 4TZ8A 4LC2A 5FB0A 4NUCA 4MEPA 4O75A 4OGJA 5HQ7A 4A9FA 2E7OA 4N4GA 5I86A 2KTBB 4A9KA 5F3AA 4HXMA 3LQHA 4NR8A 3JVJA 5E9KA 5I7XA 4O77A 2G4AA 3P1DA 1ZS5A 5D3JA 4CLBA 4YY4A 2L84A 5C87A 5D24A 2I8NA 4YH4A 4LZRA 4NYVA 3U5MA 5A7CA 5I1QA 5JI8A 2DATA 4BJXA 5CZGA 5C89A 4MENA 4YBTA 3IU5A 5FB1A 4YYDA 4IOQA 2OUOA 4HXKA 3O36A 4A9JA 5EPBA 5EWDA 5C85A 5LJ1A 3QZSA 2RFJA 4N4IA 5FE7A 4QSVA 4IR6A 2E7NA 5EICA 5L8TA 1WUGA 5EWWA 5EWVA 4QSPA 3UVWA 5DYXA 4HXOA 5CUGA 3SVFA 2WP2A 5D7XA 2YYNA 1JM4B 4NXJA 5CY9A 2R0YA 5D3RA 5TCMA 5D3HA 4NR4A 4YH3A 4YATA 5I80A 4TZ2A 5COIA 2DKWA 5IGLA 5CQ6A 5A81A 5LKTA 2YQDA 3ONIA 1X0JA 3MULA 5D3PA 3HMFA 4KCXA 5D3LA 5DW2A 3ZYUA 4QSTA 4XUBA 5L98A 4O7BA 5HEMA 5FE9A 3DWYA 5AD2A 5DBMA 3LJWA 2YEKA 5ETBA 5FE0A 5HRXA 5LJ0A 5ENHA 4YABA 4QSWA 5II2A 3S92A 3O35A 5CUBA 5EPRA 5HENA 5FE1A 5IBNA 3RCWA 4CFKA 1JSPB 2R0SA 5D3NA 5L97A 2F6JA 5DLZA 5ENBA 5EPSA 5KU3A 4O7CA 4YYKA 3U5KA 4HXSA 4XY8A 5A5RA 3U5PA 2DVRA 4CURA 3U5JA 4Z93A 4LYWA 5EP7A 4J3IA 4YYMA 5I29A 2LSPB 5CQAA 4KV4A 3P1FA 5I7YA 4NUDA 5F36A 5CUAA 3FKMX 4IR4A 4A9MA 4QC3A 5IGKA 3MXFA 3P1CA 4IORA 4UIXA 5DX4A 5DFCA 4A9NA 3SVGA 3SVHA 5EK9A 4YK0A 5FBXA 4YBMA 5EISA 2YEMA 5D3SA 4FLPA 3MB4A 4MR6A 2YDWA 5A5SA 5LKUA 3JVMA 4NRAA 4KV1A 5E9LA 4LDFA 4PKLA 5HELA 5HQ6A 5CS8A 1WUMA 4LYIA 3QZVA 3UVDA 4YYNA 3G0JA 5DKDA 4TU6A 4IOOA 4YY6A 4QUUA 4BW3A 5CUCA 3O37A 4QB3A 3K2JA 5EQ1A 4OGIA 4NYWA 5LUUA 4N4FA 4UYHA 5FE3A 5A5NA 4YYHA 4QEWA 4E96A 5ENFA 5CGPA 4HXNA 3MUKA 4O7FA 2WP1A 3UV4A 4AKNA 4QSXA 4ALGA 5E73A 2FSAA 5D26A 5H85A 5E0RA 4MEOA 5A83A 5FFVA 4J0RA 4NUEA 3Q2EA 4GPJA 4Y03A 3LQIA 4TTEA 2NXBA 4RVRA 5FE8A 5C8GA 4TU4A 4QBMA 4Q0NA 5E9YA 5CQ7A 5HJCA 2I7KA 3O33A 4HXRA 5C4QA 5EWCA 5ACYA 4IR5A 4UIZA 3I3JA 5F60A 4NRCA 3HMHA 5EI4A 5FE4A 5DYUA 5KTXA 4IR3A 5CQ5A 4QC1A 5KTWA 4PCEA 4O7AA 4PCIA 4UIVA 5AMFA 2DWWA 5EV9A 5F61A 5FG4A 4HBVA 4WIVA 2RNXA 5DKCA 1EQFA 5D0CA 4QEVA 5HFQA 3LXJA 5F1HA 4Z1SA 4DONA 4J1PA 4TS8A 4A9OA 4O74A 2YELA 4A9EA 1F68A 4C67A 5I89A 4HXLA 3UVXA 4CFLA 2OSSA 3UVYA 5L99A 4NR6A 2H60A 5FG6A 4QR4A 5CRMA 4QY4A 4XUAA 4ZC9A 2F6NA 5F63A 5CPEA 5FH8A 5E3GA 5I40A 4O76A 5D25A 4YYJA 4OUFA 4WHUA 2MJVB 5G4RA 5TB6A 4Z6HA 4BW1A 3G0LA 5D3TA 4N3WA 5DFDA 3LQJA 5LKXA 4NQMA 5IIDA 4QSRA 5FH7A 4NR5A 2DVVA 5JWMA 5A5OA 5HCLA 4YYIA 4CUUA 5E7DA 4NR9A 4LR6A 5E9MA 4TQNA 4C66A 5DW1A 4UYDA 3JVLA 3AQAA 5A82A 2E3KA 4XY9A 3NXBA 4TYLA 5ETDA 4QNSA 2DVSA 5FDZA 4BHWA 3D7CA 4YADA 3S91A 5DY7A 1E6IA 5IGNA 5CQ4A 4QEUA 5G4SA 2D82A 5ENIA 5E9VA 4LZSA 5EGUA 4O78A 4MEQA 3GG3A 4CUTA 1N72A 5EU1A 4UYFB 5LVRA 3DAIA 5CQ3A 4O70A 4HBXA 2D9EA 4N4HA 4UIYA 4QSQA 4CUQA 5CU8A 4YYGA 4ALHA 4UIWA 5AD3A 4QSSA 5CTLA 5DYCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UYFA 5DLXA 4BW4A 5H1VA 2DVQA 5HM0A 3Q2FA 4MR5A 3IU6A 5EVAA 2L85A 2R10A 5II1A 5F25A 4LYSA 5CFWA 4XYAA 4ZW1A 5DKHA 5BT4A 4YC9A 4QYLA 3D1BA 3AADA 5HRWA 5EA1A 4O71A 4TT2A 2RO1A 5F2PA 4HBWA 5EM3A 4A9LA 5CRZA 4PY6A 5LJ2A 3JVKA 4NRBA 4QYDA 4QR3A 4QZSA 5LVQA 5HLSA 4LRGA 5HQ5A 5FE6A 4O7EA 4CL9A 5FE5A 5F1LA 4ZQLA 5E3DA 5EWHA 4UYGA 4TT4A 5ENGA 3MQMA 2RNWA 4PS5A 5CQTA 4WHWA 4CUPA 5A5QA 4NS5A 3U5NA 2RNYA 5ENJA 4HBYA 3QZTA 2RS9B 5CP5A 3TLPA 5KHMA 2OO1A 5CUDA 5DYAA 4NYXA 4QSUA 5H1UA 5KTUA 4UYEA 3UW9A 5F5ZA 4BW2A 5BT3A 5A5PA 4UIUA 5CUEA 2L5EA 4NQNA 2RI7A 5FFYA 4NR7A 4YBSA 4Z1QA 4YAXA 5KO4A 3VKGA 4PTBA 4Q0OA 4QR5A 5L8UA 4A9IA 4HXPA 4X2IA 5J0DA 5HRVA 4J0SA 3U5OA 5IG6A 3P1EA 4TT6A 3UV2A 5ENCA 5HFRA 4MR3A 5FG5A 5BT5A 5DFBA 5E9IA 3U5LA 2R0VA 4LZ2A 5C7NA 2N9GA 4Z6IA 3P5OA 4MR4A 3UV5A 4CUSA 5K29A 5LKZA 5CQ8A 3HMEA 4A9HA 5I88A 3MB3A 2GRCA 5L96A 3O34A 5IGMA 5ENEA 5FE2A 5AMEA 5H1TA 5E74A 4QUTA 5FH6A 5A85A 5F62A 2YW5A 4O72A 5FFWA 4F3IA 4UITA 5I83A 4TZ8A 4LC2A 5FB0A 4NUCA 4MEPA 4O75A 4OGJA 5HQ7A 4A9FA 2E7OA 4N4GA 5I86A 2KTBB 4A9KA 5F3AA 4HXMA 3LQHA 4NR8A 3JVJA 5E9KA 5I7XA 4O77A 2G4AA 3P1DA 1ZS5A 5D3JA 4CLBA 4YY4A 2L84A 5C87A 5D24A 1PUOA 2I8NA 4YH4A 4LZRA 4NYVA 3U5MA 5A7CA 5I1QA 5JI8A 2DATA 4BJXA 5CZGA 5C89A 4MENA 4YBTA 3IU5A 5FB1A 4YYDA 4IOQA 2OUOA 4HXKA 3O36A 4A9JA 5EPBA 5EWDA 5C85A 5LJ1A 3QZSA 2RFJA 4N4IA 5FE7A 4QSVA 4IR6A 2E7NA 5EICA 5L8TA 1WUGA 1ZKRA 5EWWA 5EWVA 4QSPA 3UVWA 5DYXA 4HXOA 5CUGA 3SVFA 2WP2A 5D7XA 2YYNA 1JM4B 4NXJA 5CY9A 2R0YA 5D3RA 5TCMA 5D3HA 4NR4A 4YH3A 4YATA 5I80A 4TZ2A 5COIA 2DKWA 5IGLA 5CQ6A 5A81A 5LKTA 2YQDA 3ONIA 1X0JA 3MULA 5D3PA 3HMFA 4KCXA 5D3LA 5DW2A 3ZYUA 4QSTA 4XUBA 5L98A 4O7BA 5HEMA 5FE9A 3DWYA 5AD2A 5DBMA 3LJWA 2YEKA 5ETBA 5FE0A 5HRXA 5LJ0A 5ENHA 4YABA 4QSWA 5II2A 3S92A 3O35A 5CUBA 5EPRA 5HENA 5FE1A 5IBNA 3RCWA 4CFKA 1JSPB 2R0SA 5D3NA 5L97A 2F6JA 5DLZA 5ENBA 5EPSA 5KU3A 4O7CA 4YYKA 4AI6A 3U5KA 4HXSA 4XY8A 5A5RA 3U5PA 2DVRA 4CURA 3U5JA 4Z93A 4LYWA 5EP7A 4J3IA 4YYMA 5I29A 4AKIA 2LSPB 5CQAA 4KV4A 3P1FA 5I7YA 4NUDA 5F36A 5CUAA 3FKMX 4IR4A 4A9MA 4QC3A 5IGKA 3MXFA 3P1CA 4IORA 4UIXA 5DX4A 5DFCA 4A9NA 3SVGA 3SVHA 5EK9A 4YK0A 5FBXA 4YBMA 5EISA 2YEMA 5D3SA 4FLPA 3MB4A 4MR6A 2YDWA 5A5SA 5LKUA 3JVMA 4NRAA 4KV1A 5E9LA 4LDFA 4PKLA 5HELA 5HQ6A 5CS8A 1WUMA 4LYIA 3QZVA 3UVDA 4YYNA 3G0JA 5DKDA 4TU6A 4IOOA 4YY6A 4QUUA 4BW3A 5CUCA 2EJNA 3O37A 4QB3A 3K2JA 5EQ1A 4OGIA 4NYWA 5LUUA 4N4FA 4UYHA 5FE3A 5A5NA 4YYHA 4QEWA 4E96A 5ENFA 5CGPA 4HXNA 3MUKA 4O7FA 2WP1A 3UV4A 4AKNA 4QSXA 4ALGA 5E73A 2FSAA 5D26A 5H85A 5E0RA 4MEOA 5A83A 5FFVA 4J0RA 4NUEA 3Q2EA 4GPJA 4Y03A 3LQIA 4TTEA 2NXBA 4RVRA 5FE8A 5C8GA 4TU4A 4QBMA 4Q0NA 5E9YA 5CQ7A 5HJCA 2I7KA 3O33A 4HXRA 5C4QA 5EWCA 5ACYA 4IR5A 4UIZA 3I3JA 5F60A 4NRCA 3HMHA 5EI4A 5FE4A 5DYUA 5KTXA 4IR3A 5CQ5A 4QC1A 5KTWA 4PCEA 4O7AA 4PCIA 4UIVA 5AMFA 2DWWA 5EV9A 5F61A 5FG4A 4HBVA 4WIVA 2RNXA 5DKCA 1EQFA 5D0CA 4QEVA 5HFQA 3LXJA 5F1HA 4Z1SA 4DONA 4J1PA 4TS8A 4A9OA 3ERRA 4O74A 2YELA 4A9EA 1F68A 4C67A 5I89A 4HXLA 3UVXA 4CFLA 2OSSA 3UVYA 5L99A 4NR6A 2H60A 5FG6A 4QR4A 5CRMA 4QY4A 4XUAA 4ZC9A 2F6NA 5F63A 5CPEA 5FH8A 5E3GA 5I40A 4O76A 5D25A 4YYJA 4OUFA 4WHUA 2MJVB 5G4RA 5TB6A 4Z6HA 4BW1A 3G0LA 5D3TA 4N3WA 5DFDA 3LQJA 5LKXA 4NQMA 4AKHA 5IIDA 4QSRA 5FH7A 4NR5A 2DVVA 5JWMA 5A5OA 5HCLA 4YYIA 4CUUA 5E7DA 4NR9A 4LR6A 5E9MA 4TQNA 3D1DA 4C66A 5DW1A 4UYDA 3JVLA 3AQAA 5A82A 2E3KA 4XY9A 3NXBA 4TYLA 5ETDA 4QNSA 3VKHA 2DVSA 5FDZA 4BHWA 3D7CA 4YADA 3S91A 5DY7A 1E6IA 5IGNA 5CQ4A 4QEUA 5G4SA 2D82A 5ENIA 5E9VA 4LZSA 5EGUA 4O78A 4MEQA 3GG3A 4CUTA 1N72A 5EU1A 4UYFB 5LVRA 3DAIA 5CQ3A 4O70A 4HBXA 2D9EA 4N4HA 4UIYA 4QSQA 4CUQA 4AKGA 5CU8A 4YYGA 4ALHA 4UIWA 5AD3A 4QSSA 5CTLA 5DYCA
chains in the Genus database with same CATH topology
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