4NRCA

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with compound-3 n01186
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Targeting low-druggability bromodomains: fragment based screening and inhibitor design against the BAZ2B bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 41
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nrcA00
4HXLA 3UVXA 3UVWA 3HMFA 4HXOA 5DKDA 5BT5A 4UYGA 5I29A 3QZTA 5ENBA 2F6NA 2YQDA 3UV2A 5AMFA 4NUDA 5I7YA 4A9MA 4CLBA 4QYLA 4NYVA 4TZ8A 4PS5A 5D26A 5LJ0A 5ENEA 5E9LA 5CY9A 5C89A 5EK9A 4O75A 2F6JA 4PTBA 5TCMA 3JVJA 4UIVA 5DLZA 3O35A 5FE0A 5E73A 3S92A 3LQJA 4A9EA 3P1DA 3HMHA 5C87A 4YYJA 3JVMA 5D3HA 5FH8A 5CUGA 5EQ1A 4QC1A 2E7NA 4WIVA 5FE6A 5F2PA 3DWYA 5CQ5A 5JI8A 5DFBA 5E9IA 5A7CA 4A9NA 5IGKA 4LC2A 4KV1A 5D3RA 3AQAA 4ZC9A 2WP2A 5FE1A 5IG6A 4HBVA 4QEUA 4Z1QA 5C8GA 5IGNA 2DATA 4NR4A 2H60A 5A83A 4NR9A 5E0RA 4QYDA 5EVAA 4CUPA 3G0JA 2DVVA 5ENIA 2YDWA 4FLPA 2L85A 5AMEA 3UW9A 5A82A 5LUUA 5HRWA 4NQNA 1ZS5A 2R10A 4O77A 2DVQA 5H1VA 4QEVA 5HQ5A 5IIDA 3P5OA 2G4AA 4Z1SA 5I86A 2FSAA 3D7CA 4YYHA 5LKXA 2L84A 4O78A 5FFYA 4YBSA 2RNYA 4TU4A 5A5QA 5FE9A 3O36A 4IR5A 4QZSA 5E9YA 5FE3A 4UIWA 4NR8A 5ACYA 2RS9B 1EQFA 4YATA 5TB6A 4NR7A 4A9IA 4HXPA 5A5NA 5CUCA 4CFLA 4UIYA 2YYNA 4N4IA 3UVYA 4QC3A 3MULA 4YYMA 4ALGA 4TTEA 4NRBA 5CZGA 4CUUA 5F3AA 3MB4A 5F60A 5H85A 4IR3A 4MENA 4LZSA 4CUTA 5F1LA 3QZVA 4YYKA 5EP7A 2L5EA 4HXKA 4UITA 4IR6A 5ETBA 4A9OA 3P1EA 5A85A 2D9EA 5L8TA 2DVSA 3LXJA 4LYIA 5ENGA 4YH4A 4QNSA 5F25A 5HQ6A 4HXSA 4QSVA 4KV4A 4ZW1A 2LSPB 5CQ3A 5KO4A 3JVLA 2MJVB 4UYHA 4O70A 5ENCA 2YEKA 3O33A 5EWCA 4WHUA 5I80A 5ETDA 5C4QA 5CP5A 4A9FA 3MB3A 5BT4A 4ALHA 2DVRA 4CL9A 4BW2A 4HBWA 5FE7A 5CRMA 5CQ6A 5E3GA 5EWVA 4LYWA 5L98A 2RNWA 5K29A 2YW5A 4O76A 5D3LA 4QSWA 4LZ2A 4A9HA 5DFCA 4BW4A 4Z6IA 5KHMA 5LJ2A 4MEQA 5LKZA 4E96A 5CFWA 4XYAA 5CQ4A 5FG4A 4NYWA 3UV4A 5AD3A 5I88A 4QUUA 4IOOA 4RVRA 5E9MA 4OUFA 5DYCA 4UYDA 5L96A 3ZYUA 5CUEA 5CUAA 5H1UA 5HENA 2DWWA 3I3JA 4O7EA 5DLXA 4QR3A 3ONIA 5I40A 4HXRA 5HELA 5DYUA 5E9VA 4TT4A 4UYEA 5D3PA 4HBYA 4BJXA 5HCLA 5EWHA 5EU1A 4YC9A 4QSRA 5CPEA 5FE8A 4C67A 5HRXA 5I83A 5LVRA 4CURA 4HBXA 4MEPA 5FE2A 5FG5A 4XUBA 5FFWA 5HRVA 5L99A 4NRCA 5E9KA 5LKUA 5J0DA 5IGLA 4CUSA 4PCIA 4TT6A 5C85A 4N4FA 4XY8A 4UIZA 5CUBA 5DFDA 4QBMA 5LJ1A 4LDFA 4CFKA 4OGJA 4XY9A 4PKLA 3Q2FA 4BW1A 3MUKA 4NYXA 4YBMA 3U5JA 5I89A 4QSQA 3NXBA 5I1QA 3QZSA 5DYAA 5EA1A 5KU3A 5LKTA 5E7DA 3UV5A 3O37A 5DX4A 4TU6A 5D3SA 1JSPB 3U5MA 5KTWA 5CRZA 4HXMA 2RO1A 4YAXA 5FE4A 5HFQA 4Y03A 4MR5A 4O7FA 4YADA 5CQ7A 4Q0OA 4F3IA 5HEMA 5ENJA 5HQ7A 3DAIA 5IBNA 3TLPA 4QSPA 5DKHA 4O7BA 4TZ2A 5A81A 4DONA 4IORA 5EISA 5D3JA 5G4RA 4YBTA 5DY7A 5HJCA 4KCXA 3LQIA 5EGUA 3IU5A 4O74A 4WHWA 5F61A 5FB0A 5F62A 4IR4A 1WUMA 4O72A 4QR5A 4TT2A 5FDZA 4LYSA 4QY4A 5CS8A 2R0SA 4UYFA 5DW1A 5KTXA 3K2JA 4J0RA 5FB1A 4A9JA 5HM0A 4Q0NA 4YYNA 4NUEA 5E3DA 5EV9A 5CQ8A 3P1FA 4YY6A 2RI7A 4QR4A 5ENHA 3U5PA 3LQHA 4BHWA 4QSTA 5EICA 5HFRA 4MEOA 5H1TA 1WUGA 4CUQA 4LZRA 4QSSA 2DKWA 5EM3A 3Q2EA 4QSXA 4NR5A 3P1CA 3SVHA 5D3TA 5D3NA 5G4SA 1N72A 5I7XA 2RFJA 5COIA 4O71A 3S91A 4YYGA 5FH7A 4NQMA 2YELA 4TS8A 4YABA 5IGMA 4MR4A 4LRGA 3HMEA 3U5LA 2I7KA 5DKCA 5EWWA 4QEWA 2N9GA 3RCWA 4O7AA 4N4GA 4AKNA 3G0LA 4A9LA 3JVKA 4BW3A 1F68A 4N3WA 5D0CA 1JM4B 5AD2A 4J0SA 4NUCA 4YYIA 4QUTA 4NRAA 5D24A 5EPBA 2OUOA 3FKMX 5A5PA 5F63A 5BT3A 4NR6A 2YEMA 5DYXA 5E74A 2E3KA 2I8NA 4YY4A 4YYDA 5D25A 5FH6A 2WP1A 5CQTA 3SVGA 3U5OA 5D7XA 5KTUA 4J1PA 4YK0A 3AADA 5A5RA 5CQAA 3LJWA 4N4HA 5FFVA 3UVDA 4C66A 5A5OA 4PCEA 5CTLA 3MQMA 4IOQA 5CU8A 1X0JA 5F5ZA 5DBMA 4QB3A 5JWMA 5CUDA 2KTBB 5C7NA 4QSUA 4OGIA 5II2A 2R0VA 4NXJA 5F1HA 3MXFA 5FBXA 2NXBA 3GG3A 5FE5A 5FG6A 5EPSA 5L97A 2E7OA 1E6IA 5ENFA 4GPJA 4UYFB 5L8UA 5A5SA 4MR6A 4UIUA 2GRCA 5EI4A 3U5NA 4MR3A 5F36A 4XUAA 2R0YA 4TYLA 2OSSA 4UIXA 4Z93A 4TQNA 2D82A 2RNXA 3SVFA 4HXNA 3O34A 4X2IA 4A9KA 4O7CA 5EPRA 4NS5A 4Z6HA 4J3IA 5DW2A 3U5KA 4ZQLA 5LVQA 5II1A 3IU6A 4LR6A 5EWDA 4PY6A 5HLSA 5CGPA 2OO1A 4YH3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HXLA 3UVXA 3UVWA 3HMFA 4HXOA 5DKDA 5BT5A 4UYGA 5I29A 3QZTA 5ENBA 2F6NA 2YQDA 3UV2A 5AMFA 4NUDA 5I7YA 4A9MA 4CLBA 4QYLA 4NYVA 4TZ8A 4PS5A 5D26A 5LJ0A 5ENEA 5E9LA 5CY9A 5C89A 5EK9A 4O75A 2F6JA 4PTBA 5TCMA 3JVJA 4UIVA 5DLZA 3O35A 5FE0A 5E73A 3S92A 3LQJA 4A9EA 3P1DA 3HMHA 5C87A 4YYJA 3JVMA 5D3HA 5FH8A 5CUGA 5EQ1A 4QC1A 2E7NA 4WIVA 5FE6A 5F2PA 3DWYA 5CQ5A 5JI8A 5DFBA 5E9IA 3VKGA 5A7CA 4A9NA 5IGKA 4LC2A 4KV1A 5D3RA 3AQAA 4ZC9A 2WP2A 5FE1A 5IG6A 4HBVA 1ZKRA 4QEUA 4Z1QA 5C8GA 5IGNA 2DATA 4NR4A 2H60A 5A83A 4NR9A 5E0RA 4QYDA 5EVAA 4CUPA 3G0JA 2DVVA 5ENIA 2YDWA 4FLPA 2L85A 5AMEA 3UW9A 5A82A 5LUUA 5HRWA 4NQNA 1ZS5A 2R10A 4O77A 2DVQA 5H1VA 4QEVA 5HQ5A 5IIDA 3P5OA 2G4AA 4Z1SA 5I86A 2FSAA 3D7CA 4YYHA 5LKXA 2L84A 4O78A 5FFYA 4YBSA 2RNYA 4TU4A 5A5QA 5FE9A 3O36A 4IR5A 4QZSA 5E9YA 5FE3A 4UIWA 4NR8A 5ACYA 3VKHA 2RS9B 1EQFA 4YATA 5TB6A 4NR7A 4A9IA 4HXPA 5A5NA 5CUCA 4CFLA 4UIYA 2YYNA 4N4IA 3UVYA 4QC3A 3MULA 4YYMA 4ALGA 4TTEA 4NRBA 5CZGA 4CUUA 5F3AA 3MB4A 5F60A 5H85A 4IR3A 4MENA 4LZSA 4CUTA 5F1LA 3QZVA 4YYKA 5EP7A 2L5EA 4HXKA 4UITA 4IR6A 5ETBA 4A9OA 3P1EA 5A85A 2D9EA 5L8TA 2DVSA 3LXJA 4LYIA 5ENGA 4YH4A 4QNSA 5F25A 5HQ6A 4HXSA 4QSVA 4AKGA 4KV4A 4ZW1A 2LSPB 5CQ3A 5KO4A 3JVLA 2MJVB 4UYHA 4O70A 5ENCA 2YEKA 3O33A 5EWCA 4WHUA 5I80A 5ETDA 5C4QA 5CP5A 4A9FA 3MB3A 5BT4A 4ALHA 2DVRA 4CL9A 4BW2A 4HBWA 5FE7A 5CRMA 5CQ6A 5E3GA 5EWVA 4LYWA 5L98A 2RNWA 5K29A 2YW5A 4O76A 3D1DA 5D3LA 4QSWA 4LZ2A 4A9HA 5DFCA 4BW4A 3ERRA 4Z6IA 5KHMA 5LJ2A 4MEQA 5LKZA 4E96A 5CFWA 4XYAA 5CQ4A 5FG4A 4NYWA 3UV4A 5AD3A 5I88A 4QUUA 4IOOA 4RVRA 5E9MA 4OUFA 5DYCA 4UYDA 5L96A 3ZYUA 5CUEA 5CUAA 5H1UA 5HENA 2DWWA 3I3JA 4O7EA 5DLXA 4QR3A 3ONIA 5I40A 4HXRA 5HELA 5DYUA 5E9VA 4TT4A 4UYEA 5D3PA 4HBYA 4BJXA 5HCLA 5EWHA 5EU1A 4YC9A 4QSRA 5CPEA 5FE8A 4C67A 5HRXA 5I83A 5LVRA 4CURA 4HBXA 4MEPA 5FE2A 5FG5A 4XUBA 5FFWA 5HRVA 5L99A 4NRCA 5E9KA 5LKUA 5J0DA 5IGLA 4CUSA 4PCIA 4TT6A 5C85A 4N4FA 4XY8A 4UIZA 5CUBA 5DFDA 4QBMA 5LJ1A 4LDFA 4CFKA 4OGJA 4XY9A 4PKLA 3Q2FA 4BW1A 3MUKA 4NYXA 4YBMA 3U5JA 5I89A 4QSQA 3NXBA 5I1QA 3QZSA 5DYAA 5EA1A 5KU3A 5LKTA 5E7DA 3UV5A 3O37A 5DX4A 4TU6A 5D3SA 1JSPB 3U5MA 5KTWA 5CRZA 4HXMA 2RO1A 4YAXA 5FE4A 5HFQA 4Y03A 4MR5A 4O7FA 4YADA 5CQ7A 4Q0OA 4F3IA 5HEMA 5ENJA 5HQ7A 3DAIA 5IBNA 3TLPA 4AKIA 4QSPA 5DKHA 4O7BA 4TZ2A 5A81A 4DONA 4IORA 5EISA 5D3JA 5G4RA 4YBTA 5DY7A 5HJCA 4KCXA 3LQIA 5EGUA 3IU5A 4O74A 4WHWA 5F61A 5FB0A 5F62A 4IR4A 1WUMA 4O72A 4QR5A 4TT2A 5FDZA 4LYSA 4QY4A 5CS8A 2R0SA 4UYFA 5DW1A 5KTXA 3K2JA 4J0RA 5FB1A 4A9JA 5HM0A 4Q0NA 3D1BA 4YYNA 4NUEA 5E3DA 5EV9A 5CQ8A 3P1FA 4YY6A 2RI7A 4QR4A 5ENHA 3U5PA 3LQHA 4BHWA 4QSTA 5EICA 5HFRA 4MEOA 5H1TA 1WUGA 4CUQA 4LZRA 4QSSA 2DKWA 5EM3A 3Q2EA 4QSXA 4NR5A 3P1CA 3SVHA 5D3TA 5D3NA 5G4SA 1N72A 5I7XA 2RFJA 5COIA 4O71A 3S91A 4YYGA 5FH7A 4NQMA 2YELA 4TS8A 4YABA 5IGMA 4MR4A 4LRGA 3HMEA 3U5LA 2I7KA 5DKCA 5EWWA 4QEWA 2N9GA 3RCWA 4O7AA 4N4GA 4AKNA 3G0LA 4A9LA 3JVKA 4BW3A 1F68A 4N3WA 5D0CA 1JM4B 5AD2A 4J0SA 4NUCA 4YYIA 4QUTA 4NRAA 5D24A 5EPBA 2OUOA 3FKMX 5A5PA 5F63A 5BT3A 4NR6A 2YEMA 5DYXA 5E74A 2E3KA 2I8NA 4YY4A 4YYDA 5D25A 5FH6A 2WP1A 5CQTA 3SVGA 3U5OA 5D7XA 5KTUA 4J1PA 4YK0A 3AADA 5A5RA 4AKHA 5CQAA 3LJWA 4N4HA 5FFVA 3UVDA 4C66A 5A5OA 1PUOA 4PCEA 5CTLA 3MQMA 4IOQA 5CU8A 1X0JA 5F5ZA 5DBMA 4QB3A 5JWMA 5CUDA 2KTBB 5C7NA 4QSUA 2EJNA 4OGIA 5II2A 2R0VA 4NXJA 5F1HA 3MXFA 5FBXA 2NXBA 3GG3A 5FE5A 5FG6A 5EPSA 5L97A 2E7OA 1E6IA 5ENFA 4GPJA 4UYFB 5L8UA 5A5SA 4MR6A 4UIUA 2GRCA 5EI4A 3U5NA 4MR3A 5F36A 4XUAA 2R0YA 4TYLA 2OSSA 4UIXA 4Z93A 4TQNA 2D82A 2RNXA 3SVFA 4HXNA 3O34A 4X2IA 4A9KA 4O7CA 5EPRA 4NS5A 4Z6HA 4AI6A 4J3IA 5DW2A 3U5KA 4ZQLA 5LVQA 5II1A 3IU6A 4LR6A 5EWDA 4PY6A 5HLSA 5CGPA 2OO1A 4YH3A
chains in the Genus database with same CATH topology
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