4NRSA

Crystal structure of glycoside hydrolase family 5 mannosidase (e202a mutant) from rhizomucor miehei in complex with mannobiose
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
416
structure length
416
Chain Sequence
SEFAFVKIASDGKGFTRYGEPYLIRGANYWQGMNLGADDCSGGDRKRMELEIKQMAEMGINNLRVMASSEGPDDQPYRMRPSMMPQPGKYNEGVFVGLDYLLDTMDRYNMTAVMTLGNFWQWSGGFGQYVAWITGNQTIPYPVGDVTYDEFTQFAARFYNDSEIAPKANKLFKDHIYTVQNRRNTVNGKIYKEDPVIMSWQIANAPQEAPASWFEEISTFIKKGAPKHLVSAGLESKLDEYDFDRAHDHKNIDYTTCHCWVENWGIYDPADPDGLPHANEYMHDFLESRSKWAAQLNKPIVMEEFGMARDAWRNPEDETYKYLPSTPTSHKDEYYQKAFNQIVSLASNRSFSGSNFWAYGGEGRSTYPPNPYGMVWLGDPPHEPHGWYSVYSNDTTVQIIKDYNANLLKVQKELSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Rhizomucor miehei
publication title Structural insights into the substrate specificity and transglycosylation activity of a fungal glycoside hydrolase family 5 beta-mannosidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Exo-beta-1,4-mannosidase
total genus 157
structure length 416
sequence length 416
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.25: Beta-mannosidase.
pdb deposition date 2013-11-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4nrsA00
4U2YA 4AEEA 1HJWA 1TMQA 4HPGA 2V5DA 2ZUMA 3RJXA 5HOSA 3CZGA 1WNOA 3GBEA 1DWJM 3ZSTA 2X0HA 2YJQA 2D0GA 2WZIA 3UCQA 3WH6A 1K9FA 2ZX7A 5BCAA 1Z32X 1TZ7A 3AISA 3L4TA 4DUXA 1G0CA 1SFSA 1SMAA 1MW0A 5ABEA 1HJUA 1J9YA 3L2LA 5DT7A 4ML4A 3POHA 3QHNA 4D1IA 4W8AA 1JZ7A 1QPKA 3AIEA 3WD0A 3HN3A 3EMQA 3FNDA 2J8GA 1UR9A 1HF6A 3WF3A 2EPKX 8A3HA 1WZKA 3ZM8A 3M6DA 3VDHA 3VD3A 5HBFA 4LYPA 3K8KA 1KWGA 1QHZA 2WVVB 1EDQA 1JDDA 4UFHA 2DGAA 4Z2KA 5A2CA 2CITA 4J3XA 1ODUA 1VFMA 5GNXA 3NSXA 1GORA 4HTYA 3WFLA 5I2UA 1E73M 4CU8A 1VRXA 3VIPA 4HMDA 4NF7A 4GQQA 2WMGA 3WQWA 1KXQA 1NWRA 1OIFA 1XV8A 1UKPA 4MJ4A 4W8BA 3MUZ1 1NOUA 3LPPA 1AQ0A 4DWSA 3L4UA 3CLWA 2G4FA 2G3NA 3AFBA 3BAIA 1VFUA 3VOCA 3LPFA 4W89A 1ZJBA 2JIWA 1E6PA 1E71M 5D8ZA 3DYMA 4UOZA 2ZX6A 4GINA 5CGTA 4GZIA 3WH8A 5D9OA 4CKQA 1JDAA 2XFRA 1DWIM 1QNSA 4MB1A 2E9MA 3AHVA 4LYQA 2QPSA 2WMFA 1PIGA 4GI9A 4JFSA 4MAZA 4ACYA 4MADA 3CGTA 1R85A 4HU0A 1LL6A 3O9NA 1W3LA 5BRQA 4CGTA 1NWSA 2FGLA 2Z1KA 3VGDA 3MMWA 4EANA 1FP8A 5I0DA 1OIMA 4Z2GA 1XC6A 2VZVA 1UR2A 4FF5A 1KGUA 3WH5A 5CSYA 2FHCA 2TAAA 5DEZA 5AY7A 1E6QM 3AMKA 1TUXA 3MKKA 3CZJA 4AW7A 4KGLA 4KWUA 2WHLA 1H09A 1R7AA 1Q4NX 1BPLB 3M46A 3PZVA 1UR1A 4M8UA 3W24A 1UA7A 3VIJA 3AOFA 2WLZA 4F66A 1ZBVA 4BCEA 2XIIA 3PZ9A 1B31A 3CZLA 2XFFA 3F5KA 3GBDA 3VNYA 1C7TA 5CG0A 1RD6A 4UQAA 4OKDA 2YBTA 2VRJA 4U5IA 1BQCA 2WMHA 2CBIA 1LLOA 4FLRA 2V3EA 3HMCA 3N1AA 2JF7A 4UTFA 1V0LA 1AQHA 1XHGA 3BGAA 1X6LA 1MXGA 2IXUA 2D0HA 3NYDA 1MVYA 5HXMA 2J7BA 1CXLA 5A6BD 1C91A 2E8ZA 2XSBA 1QI0A 2ZXDA 4W86A 4AZCA 2CERA 1F4AA 5GNYA 1RP9A 1EGZA 4H04A 3WF2A 1M01A 3WH9A 1KWKA 1CLXA 5AYBA 1E0XA 4H41A 4WSJA 1WDQA 3CUFA 3AMLA 3BXWA 3CHCA 1AQMA 3RJYA 5HNNA 3WQ8A 3F4VA 4W5UA 1FFRA 2WC7A 1Q6GA 1CXIA 2VR4A 2DT2A 3WDHA 1SYTA 4LXFA 1UOKA 4PTXA 3B8SA 2XM2A 4H8HA 4XX6A 3VO0A 1JZ3A 1ISVA 1A3HA 4OOUA 4MB5A 2YBUA 2WHJA 3E1F1 1ECEA 4HA1A 2PWEA 4UFJA 3A4WA 1V6XA 2VR5A 4JFVA 4AD4A 3PZQA 3II1A 1W9BM 3WBEA 1B3ZA 2UWFA 5A69A 3M07A 1JNEA 2DH3A 4J3WA 1B9ZA 1JZ2A 4MPKA 5CJ5A 4W85A 3VIFA 1KR0A 3BLKA 4UCFA 4AISA 1UUQA 2Y8KA 3WIJA 2UY3A 2WC4A 1HKIA 1JI2A 1QI2A 1IV8A 2YDRA 4UOJA 3T0BA 1HKJA 5CSUA 1XH0A 1E0VA 1B30A 5CPSA 4X9YA 3DYPA 3TTOA 2WWCA 5LA0A 3AMDA 4M81A 3MU7A 5KZ6A 2CYGA 1KBKA 1NH6A 4JHOA 4XV0A 2Y24A 1JZ5A 2CBJA 4FK9A 4ZE4A 5ABFA 4JZ5A 5GPRA 5JIPA 2CPUA 3TP4A 5D4YA 2PB1A 4TVUA 1C93A 4GI6A 5HDRA 5I78A 3AIBA 1V6YA 1E40A 3ZO9A 3SCWA 2C0HA 1NWUA 3RO8A 3B9AA 1QI4A 3EMCA 4D6GA 1XRVA 4W5ZA 4E8DA 3WMBA 4CN1A 1H3GA 3W26A 2UY5A 1Q6DA 4OIFA 2EPNA 3WNPA 1V6VA 4C7DA 2VTFA 1XCXA 4TX8A 1XCWA 1ISZA 1C8QA 4AIUA 3WNMA 1OGSA 4MTVA 4A4AA 4QDMA 4WSKA 2DT0A 4PTVA 2Y4SA 3GM8A 4LPCA 2FH8A 1GQJA 5FIPA 1JZ8A 1GOIA 2BVTA 5IFPA 1K9EA 1V3LA 4CN4A 4AZBA 4UQ9A 1B3XA 1GW1A 1H49A 3WEZA 4B9ZA 1H11A 1I1WA 3W37A 3AIWA 4MNJA 5LA1A 4ATDA 2WWDA 3L2MA 4J3VA 3M7SA 4HP5A 2WCAA 2BY2A 1GHSA 1C8YA 3NIYA 3RM4A 1HNYA 3ARXA 3ALGA 4EKJA 4QCFA 4N42A 2ZUSA 2Z1SA 1CYGA 2O9TA 1ISXA 4WKAA 5E6YA 3S6TA 2ZUVA 1FH8A 3VPLA 3ZT6A 2BHZA 3LPOA 3RMEA 2J74A 5CPTA 3WNNA 1UZ1A 1DWFM 1W1TA 5C70A 2PWFA 1HKMA 2XVNA 1BG9A 4X0VA 3GH7A 4P7QA 3UEQA 4BS0A 4P8WA 1SMDA 5D9PA 1UD5A 2VZSA 1CENA 1ZS2A 4AIOA 1CGVA 2FHBA 3NCOA 1ISWA 1M53A 1V0MA 2G3MA 1W9XA 2PWHA 5EFDA 3AS0A 3B9EA 1EOMA 2AAAA 1VFFA 2D3LA 3ZT7A 4TVDA 4M24A 1QW9A 2WBGA 2DH2A 1VEOA 4RE2A 3W38A 2VX7A 3IJ9A 2WZHA 1KGWA 3BAJA 3PZOA 1NM9A 3AS3A 2AOSA 4AXNA 2A3BA 5C8BB 1W9VA 4Z2HA 1G9HA 2ZUTA 3J7HA 4ATWA 3N18A 2F8QA 3MUY1 2A3HA 3QOKA 2VI0A 3ARYA 1ZL1A 2PF0A 4Z2JA 3CMGA 4OJYA 5JIWA 1VEMA 4U2ZA 2G3IA 3PZNA 4H7VA 3BAKA 3UETA 5CQ1A 4J7RA 2O9OA 4QLKA 2Y2WA 1J0KA 3WEOA 2PC8A 2J7CA 4UZUA 3A4AA 1WO2A 2ZXQA 3T08A 3WUBA 3ZQ9A 4UOQA 1WZAA 2WVUA 1JZ6A 2V3GA 2XUCA 2B31A 4ACZA 3VM7A 5IFTA 4S3KA 3VTRA 3N9KA 3ZMRA 5FL1A 1V08A 3N11A 1QNOA 3VIKA 5F7UA 5M3WA 4KRTA 1O6IA 1OT1A 2WW5A 1FFQA 3MV01 3BMWA 4BQ4A 3FXYA 3T09A 2VCAA 3W82A 3VINA 1CECA 1HIZA 4JFTA 5TD4A 4PMYA 3AIQA 2FHFA 4EK7A 2HISA 2CKRA 3GNRA 3AI0A 1MXDA 3OZPA 5CLWA 1SR0A 3PZGA 3F5LA 1JYVA 3BSGA 1EH9A 1TA3B 2GJRA 3OLDA 1US3A 1MW3A 1JI1A 1XYZA 2GJXA 1UR4A 2EQDA 1DHKA 2J77A 3VD5A 4TX6A 3U5UA 1V3JA 5JUVA 3AYRA 4A3HA 2O9PA 4D72A 5LA2A 1W3KA 2VQTA 5A2AA 1UD2A 5A8MA 2GJPA 5M03A 3EDFA 3ARQA 3NSMA 4K68A 4W84A 3WUGA 2ZWYA 3AYSA 1H41A 4JL1A 3PZUA 1JAKA 2D0FA 4WKFA 1JF5A 1HT6A 4JKKA 2O9RA 3GNPA 3W4RA 1LQ0A 1BYAA 3FY1A 4JAWA 4W93A 1F4HA 2ZXAA 2J4GA 3NSNA 3UERA 1H4PA 1DP0A 3GH5A 4DWSB 4MDOA 4PSPA 3ARSA 1US2A 1LWJA 3THCA 1EIBA 1GPFA 3HU7A 5BROA 4PMOA 2J47A 4AIEA 3AJ7A 4DWSC 3VM5A 2F2HA 3CHEA 3RDKA 1H2JA 3SUWA 1EHNA 2E9BA 3BH4A 1JZ4A 1FH7A 1J0HA 2X2YA 4CCEA 4KMQA 1Q6EA 2E40A 1GOMA 1PX8A 4F8XA 1GHRA 1GJWA 4U5KA 1E0WA 2DEPA 2GK1A 3NDZA 1ZBKA 2G8ZA 1W9UA 3SCPA 1PX4A 4UNIA 3G6MA 6A3HA 3VMOA 3ZJ6A 3B9DA 2ZICA 1ZBWA 4JFWA 2WKGA 4UQBA 4MNLA 2W91A 4JHZA 1BHGA 2ZIDA 2VCBA 4J3UA 4PRWA 2JEQA 2WC3A 1KFWA 3L4VA 2X0YA 1TR1A 1CPUA 2WNWA 3RM8A 3NDYA 3ZJ8A 1E5NA 1E5JA 3VX0A 3EDEA 1G1YA 1HJQA 3WUFA 1EOKA 2A3EA 1B2YA 4LGXA 3CIVA 2FDMA 1E4LA 4Z2IA 2JALA 4GXPA 1V0NA 1C90A 1LF1A 4MNMA 3IANA 1GQKA 4WK9A 1HX0A 4R5EA 3L4YA 5A6JA 4B15A 5A6KA 1VENA 4D71A 1KR1A 2WMKA 2WVVA 1XD1A 1UR0A 1GVIA 4DUWA 3U7BA 2XIBA 1EO7A 4TVCA 4P7NA 2GSJA 1GCYA 3ARVA 4AZCB 2VZUA 1LG2A 1ZB5A 2QHAA 2AMGA 3OB8A 4KGJA 3EDJA 1WAWA 5EMYA 3BSHA 4W7WA 1CDGA 1CIUA 4Q22A 4BA0A 4OZOA 1J0YA 1UA3A 3BAXA 2VNCA 3AS2A 3WY1A 2ZUUA 1R8LA 1JDCA 3MMUA 3PZIA 3WL1A 4DM2A 2G41A 4U33A 1BTCA 3AXIA 3CBWA 5D9MA 3ARTA 3I3EA 5JBDA 1GUVA 2VJXA 1UWTA 5IDIA 1FOBA 2BNJA 4QLJA 4PMDA 4HOZA 5FKYA 1OWQA 1V6WA 3PHAA 3AXHA 1J12A 4NRSA 3VU2A 2D2OA 2J75A 2WLYA 1NWTA 4HZ6A 4CD6A 3O2LA 2WYSA 1E6SM 3WDJA 5I6SA 1EQCA 4AZHA 3WUEA 1UWQA 4TXEA 4W8LA 1E72M 1BYBA 3WH7A 5C71A 2XWDA 3GXDA 5BXTA 4GI8A 3OGSA 3OBAA 3NJ3A 4HZ8A 4UQCA 1E6RA 1UWSA 1J18A 4AZ5A 3OLGA 4QFUA 4QP0A 3OGRA 4B9YA 4JCMA 5CZKA 4GO8A 2CBVA 3VIGA 4CUCA 1LJYA 2ZWZA 1U30A 4XZWA 5HPOA 1N82A 5ABFB 1WDRA 1D2KA 1C92A 1EHAA 1Y7VA 1L8NA 1HVXA 4QCEA 1M7XA 4B3LA 1V02A 3TONA 1V03A 3L4ZA 1CNVA 1V3KA 2XTKA 4XUYA 2WMIA 1O7AA 2XGBA 5M17A 4D6JA 3LPGA 3WF1A 1JYXA 1UH4A 1PEZA 2XVKA 1Q6CA 4D6CA 3VDAA 2J7EA 3QR3A 4UQDA 1CGXA 4PMXA 1C8XA 4HU8A 5A3HA 3K4AA 4MB3A 1UKQA 1ISYA 1FHDA 3ZJKA 4ZXOA 2DSKA 5I24A 5I79A 2PWDA 1ODZA 1ZBCA 1HJSA 2VX6A 2ZX8A 1JD7A 1K9TA 3DHUA 2W63A 4DWSD 3PZTA 3MMDA 4V2XA 6TAAA 1JFHA 2ZUWA 5FCZA 3WDQA 3K1DA 1WZLA 3VDCA 3GTNA 1E1FA 1BGAA 1E3XA 3MO4A 3PZMA 3RPMA 1V02E 3ALFA 2W67A 3OG2A 3W53A 1E6ZA 1QNPA 1WZMA 3AICA 3NUKA 2JFEX 5A6MA 3WDRA 1E3ZA 1KCKA 2VZOA 1J0ZA 3FHQA 4F9JA 3T0DA 4WIWA 1JAEA 1I1XA 3BMVA 5BRPA 1J11A 4P8XA 1WPCA 2OSYA 3N04A 3N13A 3SCVA 5ABGA 3AMGA 2Y8VA 1E15A 1CXFA 3W6MA 2OYMA 4AY1A 1S46A 3CHFA 3FAXA 5LYRA 4R27A 4D6DA 1GOQA 2YDSA 1JXKA 5DF0A 2JIEA 1OD8A 4H8VA 3WKZA 2W4XA 1WB0A 2EPMX 3AROA 2D22A 3AIRA 3SCSA 5DFAA 1TVNA 2BVDA 4U31A 4D6FA 3MV11 1KXTA 3N15A 1NP0A 3IAPA 4A3YA 5BXRA 3WD4A 2VOTA 2D23A 4UR9A 5A8OA 2CEQA 3BAWA 1ITCA 1KGXA 1CWYA 3OZOA 1M03A 3IK2A 3CZEA 1H1NA 4UFKA 2XVLA 4FLOA 3WF4A 3GNOA 2WSKA 2WBKA 4B16A 2VMFA 1JG9A 4AEFA 1B3VA 4GQRA 4Z2LA 1FP9A 3UESA 5A6AA 1DWAM 3VIIA 4GZEA 4AD3A 1VBRA 2D20A 5I5RA 3D5HA 2YIHA 3CHDA 4TUFA 5ABHA 1W91A 2CHNA 4HA4A 4H8UA 1LL4A 3CUHA 1HN1A 2Y5EA 2XGIA 4HMCA 2DT3A 4IUGA 2WMJA 3OA5A 1W9DM 1CGYA 3WBAA 3FW6A 1MQQA 1VEPA 3AMCA 1QVBA 1K6AA 1JFXA 5IHRA 1UZ4A 5BXPA 1JXJA 2FGZA 1E6XM 2BXYA 1MYRA 5D8WA 1TFVA 2NW0A 1I75A 3GZAA 2XYLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4U2Y A;  4AEE A;  1HJW A;  1TMQ A;  4HPG A;  2V5D A;  2ZUM A;  3RJX A;  5HOS A;  3CZG A;  1WNO A;  3GBE A;  1DWJ M;  3ZST A;  2X0H A;  2YJQ A;  2D0G A;  2WZI A;  3UCQ A;  3WH6 A;  1K9F A;  2ZX7 A;  5BCA A;  1Z32 X;  1TZ7 A;  3AIS A;  3L4T A;  4DUX A;  1G0C A;  1SFS A;  1SMA A;  1MW0 A;  5ABE A;  1HJU A;  1J9Y A;  3L2L A;  5DT7 A;  4ML4 A;  3POH A;  3QHN A;  4D1I A;  4W8A A;  1JZ7 A;  1QPK A;  3AIE A;  3WD0 A;  3HN3 A;  3EMQ A;  3FND A;  2J8G A;  1UR9 A;  1HF6 A;  3WF3 A;  2EPK X;  8A3H A;  1WZK A;  3ZM8 A;  3M6D A;  3VDH A;  3VD3 A;  5HBF A;  4LYP A;  3K8K A;  1KWG A;  1QHZ A;  2WVV B;  1EDQ A;  1JDD A;  4UFH A;  2DGA A;  4Z2K A;  5A2C A;  2CIT A;  4J3X A;  1ODU A;  1VFM A;  5GNX A;  3NSX A;  1GOR A;  4HTY A;  3WFL A;  5I2U A;  1E73 M;  4CU8 A;  1VRX A;  3VIP A;  4HMD A;  4NF7 A;  4GQQ A;  2WMG A;  3WQW A;  1KXQ A;  1NWR A;  1OIF A;  1XV8 A;  1UKP A;  4MJ4 A;  4W8B A;  3MUZ 1;  1NOU A;  3LPP A;  1AQ0 A;  4DWS A;  3L4U A;  3CLW A;  2G4F A;  2G3N A;  3AFB A;  3BAI A;  1VFU A;  3VOC A;  3LPF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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