The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFKKFKHLKTEAEMKASEKLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAKLKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Crystal structure of Horse heart ferric myoglobin; D44K/D60K/E85K mutant
rcsb |
| source organism |
Equus caballus
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| total genus |
62
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-11-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4N7N A; 1O1O A; 3FH9 B; 5CND A; 3AQ8 A; 1O1J A; 2NSS A; 1UIW A; 3ZJJ A; 3A5G A; 1MOC A; 1XZU B; 3BJ2 A; 5EE4 C; 3OZV A; 3PI2 A; 2W72 C; 1A3O B; 1S5X A; 1Y4B A; 3A9M A; 4HBI A; 4G51 A; 2R1H B; 1CO9 A; 2LHB A; 1YE0 A; 2DN1 B; 1QXE B; 3R5I B; 4AVD A; 1LFL B; 1C7B B; 2BW9 M; 1DUK A; 4F6D A; 3QJD A; 4MQG A; 3UHX A; 3ZJN A; 3H57 A; 4PQC A; 3R0G A; 5CNB A; 4AVE A; 1HCO B; 4FH6 A; 3WCW C; 1A4F B; 1LUE A; 5HBI A; 1I3E A; 1K0Y B; 1B0B A; 3VRF A; 3MBA A; 1CG5 A; 4NI1 B; 3AT5 A; 1T1N A; 3GOU B; 1J7S B; 1FSX A; 1A0Z A; 1O16 A; 2G3H A; 1K1K A; 4MPM A; 3AG0 A; 3ASE A; 1OUT B; 4FWX A; 5EYJ A; 1O1I A; 1GLI A; 5SW7 B; 1J3Y A; 1FN3 A; 1XYE A; 2MGE A; 2PEG A; 1RQ4 B; 1MYJ A; 3V2Z A; 3K8B B; 1NPF A; 1CH1 A; 1DXT A; 1J7W B; 1GDI A; 1YMB A; 2W72 B; 3KUN A; 3SZK A; 4XS0 B; 106M A; 3QQQ A; 2HZ2 A; 2QLS B; 3OO5 B; 1DWS A; 2ZSQ A; 1YGF B; 4MQI A; 4NI0 B; 3UHZ A; 1HJT A; 2HBE A; 1DUO A; 1O1N B; 110M A; 6HBI A; 1MLK A; 1YCB A; 3G4Y A; 2MGL A; 3UH7 A; 3VRE A; 2OHB A; 1RSE A; 3G53 A; 4B3W A; 3WCW B; 1Z8U B; 3G4U A; 1YVQ B; 3UHQ A; 4MQJ A; 1XXT B; 1MLU A; 1CIO A; 3PIA B; 3ONZ A; 5IKS A; 3WCT B; 2R4W A; 3QJC A; 1RPS A; 5CN8 A; 3VHB A; 3MOU A; 1YH9 A; 1C40 A; 1HBR A; 3WCT A; 1H97 A; 1COH B; 1JPB A; 3ZOL A; 2ZSX A; 1YEN A; 3EDB A; 5EQM A; 1Y5K B; 4DWU A; 1XZ2 B; 2ZFO B; 2G12 A; 4ROL B; 4DC7 A; 1BAB B; 1MLF A; 1Y5K A; 3QJE B; 1O1P B; 1XZ2 A; 3OJ1 A; 5E83 A; 3OGB A; 1M9P B; 5CNG A; 5ILE A; 1Y5J A; 3TM3 A; 5M3S A; 2LH2 A; 2DXM A; 2GKN A; 3IC2 A; 5HLU A; 3NL7 A; 2B7H B; 2W6X A; 1MGN A; 4F6G A; 3OVU C; 2G14 A; 2PGH B; 3GKV A; 3A59 A; 3IXF A; 5HY8 B; 1IRC A; 1YEQ B; 4YU3 B; 1Y0C B; 4H2L A; 3ZJI A; 1RQ3 B; 3UGZ A; 1YEU B; 1Y4P A; 1IBE B; 2MGK A; 4ESA A; 4YU4 A; 5C6E B; 3O7N A; 3KUO A; 1LH5 A; 2HZ1 A; 2OH9 A; 2BKM A; 1HBA A; 2AUO A; 4F6I A; 4MQH B; 3G4W A; 2AUQ A; 1HAB A; 3GQR B; 1YHR B; 1S5Y B; 1S0H A; 3B75 A; 1YVT B; 1QXD B; 2ZS1 C; 4ZVA A; 1Y7Z B; 1HLB A; 4X0L B; 4H0B A; 2D2M C; 1G08 A; 1MYI A; 3UHG A; 2W6Y A; 3UHR A; 1Y31 B; 1NXF A; 1KD2 A; 4HSX A; 2AUR A; 3D1A B; 2ZLU A; 3DUT B; 3PT8 A; 2ZLW A; 1ECO A; 1GCW A; 1Y8W B; 2ZS1 D; 1MOB A; 2EVK A; 1UFJ A; 3IC0 B; 1CH4 A; 2D2N B; 3RJ6 A; 1IWH A; 1W92 A; 5CHR A; 3UHS A; 3ECL A; 1J41 B; 2NRM A; 1MTK A; 1Y7D B; 1BBB B; 4MQK A; 2WTG A; 1HRM A; 1IOP A; 2AA1 B; 1HDS A; 3GK9 A; 5CMV A; 3D7O A; 1Y7C B; 3LQD B; 2MGG A; 2H8D B; 4MXL A; 4HRT B; 5HU6 A; 4M4A A; 1G0B B; 3UHW A; 2HHE B; 1YG5 B; 1FAW B; 1YZI A; 3EOK B; 1YGD B; 5EUI A; 2D60 B; 103M A; 1FLP A; 1DO7 A; 2SPL A; 2D2M B; 3CY5 A; 1SI4 A; 3HXN A; 2IN4 A; 3S66 A; 1JEB A; 1WMU B; 1MCY A; 2ZSY A; 1HBH A; 1CBL A; 2MHB A; 2R50 A; 3WCP B; 2XYK A; 4TWU A; 1LJW A; 1G09 A; 1KR7 A; 2V1F A; 1YHU D; 4F4O B; 1LH1 A; 3D4X B; 4ODC B; 1HGC B; 1X9F C; 2GL3 A; 1N9F A; 1AJ9 B; 2OH8 A; 107M A; 5EV5 A; 2Z6S A; 1N9H A; 3KMF A; 4HHB B; 2LH6 A; 4U8U D; 3QZX A; 1QPW A; 1GDK A; 1JP9 A; 1J40 B; 1LFQ A; 3AQ7 A; 1FHJ A; 1A3N B; 1Y35 B; 3GQG A; 1Y09 B; 2ZLV B; 3GYS A; 1YEO B; 3PI4 A; 2VYY A; 2VYW A; 1HHO B; 2EB9 A; 1C7D A; 5MBA A; 4O1T A; 1YOI A; 1MYG A; 1OUU A; 1SHR A; 4NXA A; 3QM7 A; 2EKT A; 1Y0T B; 2Z6N A; 3WTG A; 2QFK A; 1HV4 B; 3UHV A; 1U7R A; 3PT7 A; 5E29 B; 1HLM A; 2DN2 B; 1O1L B; 1CMY B; 3DHT A; 4FC3 B; 3WCV A; 1BVC A; 1MOD A; 1G0A B; 3DHR B; 4FWY A; 2MGB A; 1QI8 B; 6HBW B; 1X9F B; 2GTL B; 3UH3 A; 4TWV A; 1IRD A; 3HC9 A; 1JL6 A; 1ECD A; 4PNJ A; 1EBT A; 1OBM A; 1YIE A; 3A0G A; 2HCO A; 1VWT B; 5EET A; 2BK9 A; 2HHD A; 3PEL A; 2MGJ A; 1YFF B; 4MQC B; 1VWT A; 1NIH A; 1NZ3 A; 1SPG B; 1YIH A; 5CN9 A; 4KN3 A; 1GDL A; 4MQC A; 1BJE A; 3BCQ B; 3WHM A; 1LFY A; 1SDL B; 2QU0 B; 2AV3 A; 2HBF B; 1SWM A; 3PI9 B; 1OFJ A; 2O58 X; 1DM1 A; 1SDL A; 2HBF A; 2VEB A; 1Y4F A; 2ZSN A; 3ZJH A; 1DKE B; 1G9V A; 2ZSZ A; 2ZS0 A; 1XCH A; 1R1Y B; 3U3E A; 3MJU A; 1J7Y B; 1NQP B; 1NS9 B; 1Y8K A; 1Y4R B; 3OO4 A; 1HGA B; 4TYX A; 2H35 B; 1PMB A; 1MLO A; 1LTW A; 4XDI A; 1FCS A; 3EDA A; 4BJA A; 1CG8 A; 3RJN B; 1BZ1 A; 2BNL A; 2MGF A; 3ZJS A; 3E4N A; 5KER B; 3MVC A; 5ILM A; 2HHB A; 1HAC B; 1Y2Z A; 1NGK A; 1Y5F A; 3M39 A; 5CNF A; 2HBS A; 4MU5 A; 3OK5 A; 1YE2 A; 2AUP A; 4N7N B; 1O1O B; 2ZLT A; 1O1J B; 2MYE A; 1UIW B; 2GNV A; 5JDO C; 1XZ4 A; 2G0X A; 3BJ2 B; 1PBX A; 2MYB A; 1J52 A; 1S5X B; 2ZSO A; 3EU1 A; 1Y4B B; 4C44 A; 4G51 B; 1YE0 B; 2O5Q X; 2V1H A; 3D17 A; 2GKM A; 3QJD B; 4MQG B; 2DHB A; 2VRY A; 3NG6 B; 1MNI A; 2ZLX A; 3H58 A; 1MYM A; 1GZX A; 2NSR A; 3HEO A; 1ECN A; 3NG6 A; 1VRE A; 1HGB A; 5EE4 D; 2DN3 A; 3VRF B; 1CG5 B; 1CO8 A; 3AT5 B; 1T1N B; 1Y4V A; 7HBI A; 1FSX B; 1A0Z B; 3WCT C; 1D8U A; 1K1K B; 2NRL A; 1I3D A; 3AQ9 A; 3WCU A; 1JP6 A; 3O89 A; 1V9Q A; 1O1I B; 1YMA A; 1MBI A; 1GLI B; 1J3Y B; 1FN3 B; 1XYE B; 2PEG B; 3ARL A; 3WCW D; 3NMM A; 2ZFO C; 2YRS A; 1MNK A; 1DXT B; 5HAV A; 2KSC A; 5CN4 A; 4QAU A; 3SZK B; 1AZI A; 1B86 A; 1LH2 A; 5CNE A; 1XY0 B; 4MQI B; 3MKB A; 1CH7 A; 2ZSR A; 2HBE B; 5AZQ A; 1GCV A; 2R80 A; 1XY0 A; 1R1X A; 3ZJL A; 1CLS A; 1TES A; 3VRE B; 2ZFO D; 3M3A A; 1JDO A; 1YOG A; 4MBN A; 2W6V A; 1HBS A; 4KMW A; 3HF4 A; 4MQJ B; 1DWT A; 3S48 C; 2VLY A; 3ONZ B; 3HHB A; 3QJC B; 1RPS B; 1A01 A; 2JHO A; 4KMV A; 3UHY A; 1JF3 A; 1YH9 B; 1C40 B; 1HBR B; 3ED9 A; 1VRF A; 1FSL A; 1YEN B; 1GBV A; 1CH9 A; 3M3B A; 2EF2 A; 3UBV A; 1BZZ A; 1DXC A; 5CHQ A; 5E83 B; 1UC3 A; 1V75 A; 1NWN A; 1OFK A; 5D1V A; 1IT3 A; 2FRK X; 1Y5J B; 1O1K A; 1Y83 A; 4UIQ A; 4N7O A; 1NPG A; 2DXM B; 2ZT4 A; 2RI4 A; 1MLH A; 3IC2 B; 3NL7 B; 2FRI X; 1Y8H A; 1CP5 A; 2R4Z A; 2QMB A; 1V07 A; 2D5Z A; 1CPW A; 1NZ2 A; 3GKV B; 3A59 B; 1V4W A; 1RTE A; 4H2L B; 1ABY A; 1F63 A; 1MKO A; 1F65 A; 2Z85 A; 3RGK A; 1MBS A; 1Y4P B; 2D2N C; 1Y85 A; 4JAC A; 4ESA B; 1YDZ B; 1YHE A; 4O4T A; 3WFU A; 2O5O X; 4YU4 B; 1S56 A; 1XZ5 A; 1BZ0 B; 1MTI A; 3S1J A; 1NWI A; 1YDZ A; 4NK2 A; 1MYF A; 2D6C A; 1JY7 A; 2HBD A; 1BZ0 A; 1HBA B; 1Y8I A; 2ZSP A; 2VYZ A; 1LH7 A; 4N7P A; 3W4U B; 1HAB B; 3UHI A; 2D2N D; 1S0H B; 2ZT3 A; 4HSW A; 3B75 B; 3W4U A; 2R4Y A; 1ECA A; 4DWT A; 1MTJ A; 1Y0A A; 4O2G A; 1G08 B; 1MLN A; 1HDA A; 3FS4 A; 3UHU A; 3VAU A; 2MGM A; 1KD2 B; 2LH7 A; 3K3U A; 3BJ3 A; 2ZLU B; 3PT8 B; 2ZLW B; 1GCW B; 2G10 A; 1YOH A; 2FRF A; 1Y4Q A; 4M4B A; 1KFR A; 1IWH B; 4ROM A; 1CQ2 A; 3ECX A; 1MWB A; 1MBO A; 2O5L X; 3PI8 A; 3KMF C; 2D2M D; 4MQK B; 4N8T A; 2LH3 A; 1HBB A; 3ZHW A; 1HDS B; 2BLJ M; 3D7O B; 3ORD A; 5HU6 B; 1VXG A; 2QSP A; 4VHB A; 4M4A B; 1YZI B; 1VXC A; 5EUI B; 3TM9 A; 3BOM B; 1L2K A; 1U7S A; 5CN6 A; 4UUR A; 3UHE A; 2V1G A; 3CY5 B; 1SI4 B; 1C7C A; 3HXN B; 3S66 B; 2VLX A; 1JEB B; 1GBU A; 3BOM A; 3S65 A; 1HBH B; 4F69 A; 3LB1 A; 1QSH A; 4UZV A; 4C0N A; 2MHB B; 3UHK A; 3WCV C; 3MJP B; 1LJW B; 1G09 B; 3OZW A; 1HBI A; 1QSI A; 3UHH A; 3MJP A; 1MLJ A; 2ZS1 A; 108M A; 2G0V A; 4OOD A; 1VXH A; 2RAO A; 1LA6 A; 2GTL C; 1QPW B; 3DR9 A; 1X46 A; 3WR1 A; 1VHB A; 1LFQ B; 1FHJ B; 102M A; 3GQG B; 3D1K A; 1BUW A; 4HRR A; 3GYS B; 1A6N A; 1WVP A; 4PQB A; 1NZ4 A; 1DXU A; 1C7D B; 3AT6 A; 2MB5 A; 1JL7 A; 1X9F D; 1A00 A; 2GTL D; 2QFN A; 1OUU B; 1SHR B; 1A9W E; 1BZP A; 3CIU A; 1MYT A; 1MOA A; 1LH6 A; 1THB A; 1XZV A; 3E5O A; 2QRW A; 5JGG A; 1DXV A; 2MGI A; 2Z6N B; 3WTG B; 1MBA A; 3WFX A; 2BMM A; 3ZJR A; 4F68 A; 1XZ7 A; 3PT7 B; 3UGY A; 3GDJ A; 1FDH G; 3DHT B; 3LB2 A; 3WCV B; 1BIJ A; 2FAL A; 4ILZ A; 4WCH D; 5ILP A; 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3ECZ A; 3FH9 A; 1HGB B; 1N9I A; 2CMM A; 3MYM A; 2DN3 B; 5B85 A; 1VXA A; 3LR9 A; 1LH3 A; 1XZU A; 5JDO F; 2BLI A; 5JDO E; 1Y4V B; 1A3O A; 1Y46 B; 4O35 A; 3LB4 A; 112M A; 3WCU B; 1S69 A; 2R1H A; 2O5M X; 1TU9 A; 1Y46 A; 2DN1 A; 1QXE A; 2FRJ X; 3R5I A; 1LFL A; 1NS6 B; 1F5O A; 1C7B A; 4G1V A; 1MNH A; 3NMM B; 2YRS B; 1NS6 A; 1S61 A; 1HCO A; 109M A; 2ZT2 A; 3UHC A; 3LB3 A; 1B86 B; 1A4F A; 3HEP A; 4FH7 A; 3MKB B; 1K0Y A; 3WCT D; 1GCV B; 2R80 B; 2V1E A; 1R1X B; 4NI1 A; 1CLS B; 4DC8 A; 3OZU A; 3GOU A; 1J7S A; 2GRF A; 2BWH A; 4WJG 1; 2WTH A; 1OUT A; 2W6V B; 1HBS B; 5SW7 A; 3HF4 B; 3HHB B; 1OJ6 A; 1RQ4 A; 1A01 B; 3K8B A; 5HLX A; 1J7W A; 2IG3 A; 2W72 A; 5AZR A; 4XS0 A; 1X3K A; 2QLS A; 3OO5 A; 1YGF A; 2SPM A; 4NI0 A; 1GBV B; 1MBD A; 3MYN A; 1O1N A; 1MYZ A; 3UH6 A; 3IA3 B; 3ZJP A; 1BZZ B; 1CH3 A; 3UHD A; 1VXF A; 1V75 B; 3WCW A; 1MLL A; 1Y45 B; 104M A; 1YVQ A; 3ARK A; 1O1K B; 2MGC A; 1XXT A; 1Y83 B; 4N7O B; 2HZ3 A; 1Y45 A; 3PIA A; 2RI4 B; 4H07 A; 1Y8H B; 1COH A; 1EW6 A; 2QMB B; 105M A; 2D5Z B; 2FAM A; 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