4NSIA

Carboplatin binding to hewl in 20% propanol, 20% peg 4000 at ph5.6
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Carboplatin binding to histidine.
pubmed doi rcsb
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4nsiA00
4HJVA 4WL7A 1C46A 1LZDA 2ZNWY 4DD7A 4YF2A 5KJ9A 1LSPA 4U3XB 5HNLA 1HMLA 1YAOA 4KL7A 1MLCE 4GLVA 1DI5A 1RI8B 4WO6A 5KXRA 1SQ2L 2MEHA 4LT2A 3CB7A 4XJGA 4WMGA 5J7CA 1GBSA 1LJGA 3WL2A 4NGLA 2DQCY 1NQIA 4YENA 5E9RA 132LA 2YBJA 5K7OA 1HELA 4B4IA 3W6CA 3MGWA 1LMAA 4ETCA 2A7DA 1HNLA 5I4XA 1I1ZA 2MECA 2HEEA 3P65A 1C10A 1IWVA 1TDYA 1BB4A 3WH1A 1FLUA 4RW2A 1KIQC 3TMXA 3WXTA 1YILA 4M4OA 1H6MA 1NBYC 4NHPA 6LYTA 2N5ZA 1LMQA 1YL1X 3A34A 1LZEA 4J1BA 5B59A 1YQVY 1SLYA 4H9BA 4XJDA 1V7SA 1IO5A 1YL0X 4NFVA 1VDQA 207LA 1NKHA 1IWXA 2XBRA 2BQGA 3A93A 1JHLA 4CGEA 4UWNA 4NSHA 1IOTA 1LSZA 3N9AA 4OWBA 3CSQA 1DKKA 1OUBA 1AT5A 2BQAA 4QDNA 3TXIA 2GV0A 4P2EA 2ZIJA 4H9HA 4CHXA 4ETDA 2Z19A 3WU8A 1XEKA 4ZEEA 1UIHA 4OWHA 4LZTA 1GF8A 3W6BA 1GFKA 3N9EA 4YEMA 3LYMA 1XGPC 2ZQ4A 4N0JA 2XBSA 3A67Y 4MCKA 5T3FA 4DYGA 1JISA 2MEAA 4H91A 5LAFA 1XGQC 5FDJA 4G4CA 2LHMA 2MEFA 1LSDA 2G4NA 4GCEA 3A90A 3TMUA 3TXDA 1FLYA 1IP5A 4OWAA 3B72A 3N9CA 4LYCA 4WM3A 3WVYA 6LYZA 5HLLA 4H9EA 4NSGA 1UIEA 5C6JA 3CSRA 4Z3MA 1HFZA 1NHEA 3ZVQB 2G4QA 5F9XA 1GB9A 5II3A 1LKSA 4DC4A 4J1AA 4NSIA 193LA 4WL6A 2LZ2A 3HBDA 3RU5A 2YBMA 2DQGY 4RLMA 3OK0A 4PGJB 1GF3A 2IHLA 1BHZA 2CWIA 4BAPA 1XGUC 4B4EA 2BQMA 1VAUA 4LFXA 1JSEA 2DQDY 1GEVA 1NMMA 2DQAA 4WM6A 3SP3A 1C08C 2DQFC 2YDGA 4DD3A 4NY5A 4H8ZA 4H9AA 1V7TA 8LYZA 1LJEA 2WARA 3EXDA 1LJJA 5KXZA 2YVBA 1B5WA 3QE8A 5A3ZA 1JIYA 2BLYA 5AMYA 5HQ1A 2Z18A 4X3BA 1WQPA 2H9KA 4GCCA 5KXSA 1TAYA 1KXWA 3D3DA 1GXV2 1G7HC 1WQMA 2BQDA 3M3UA 4WLDA 3A94A 1ZVYB 4UWVA 1NF5A 1F0WA 4HV2A 4R0FA 4XENA 1HENA 4E3UA 1F6RA 4Z41A 1UUZC 4D9ZA 1GEZA 1LZBA 1INUA 2Y8PA 1GXXA 5ILFA 3W6FA 4H9IA 1IR9A 3WXUA 194LA 1WQNA 1BVXA 4NHTA 3W6EA 3WUAA 1REYA 1YAMA 4C3WA 1VATA 2BLXA 3IJVA 2DQHY 4PRQA 1GDXA 3A8ZA 3K3TA 5IHGA 4QGZA 1WTMA 2W1MA 4N1CC 1G7IC 3AB6A 1YAQA 4WM2A 1OUAA 1UICA 1FLQA 1LJNA 4XJHA 5KKJA 1QSWA 5FEKA 4N1EI 3T6UA 1D0KA 2NWDX 1GF9A 1WQQA 2BQFA 2FYDA 4LT3A 4MSTA 1Z55A 4LT1A 1FKQA 1XGTC 3TXKA 4Z46A 4H1PA 5E4PA 4J7VA 1UIGA 1AKIA 4J0LA 2A7FA 5LA5A 1CKHA 5HMVA 4YM8A 4N9RA 1LZ9A 5I4YA 1QTKA 4NGKA 5LINA 2HEBA 5EBHA 2BAAA 5APDA 2BQKA 1BQLY 1IP3A 2DKVA 4GCFA 4CFOA 1DQJC 3A92A 1GB6A 4G9SA 4XJIA 4H92A 3AGGG 1BB3A 4XJFA 4XN6A 2BQNA 1UBZA 1KXXA 1B7RA 1VFBC 3WULA 2MEEA 5L9JA 5DLAA 4AGAA 1AT6A 3RT5X 5LXWA 5KXNA 3AZ5A 2C8OA 1LHJA 4WG7A 4WLYA 2F4GA 5F81A 5FCPA 1J1XY 1BWJA 1LSEA 3ZVQA 1YAPA 1LJFA 1A4VA 2RSCA 4NHIA 1EQ5A 1NDMC 1OUEA 1VDTA 4LFPA 3RW8A 2ZNXY 133LA 1REMA 5LYZA 1LZYA 1IP2A 1OUCA 1GBOA 2I6ZA 4I8SA 1EQ4A 4W94A 1HEMA 3FI7A 3M18B 1LZSA 5I53A 2PC2A 5FSTA 4HV1A 4DDBA 4GN3A 1LZ5A 7LYZA 1XEIA 4WM5A 1B9OA 1GBZA 5LIOA 1HEWA 5L3HA 4FDYA 1DPWA 2FBDA 3AGIA 4NG1A 2ZQ3A 3E3DA 1LSCA 5APEA 1IR7A 1MELL 1JKDA 5KY1A 3AW7A 4LT0A 2HEDA 1XFPL 2I26L 1HHLA 3EMSA 1GB8A 4IATA 1B7PA 4ANRA 5LYMA 2BQCA 2D4KA 2MEBA 1LHHA 5F14A 4LYTA 1JTPL 1WQOA 1HEOA 1LHLA 2ZIKA 4A7DA 1GFTA 2HEAA 1EL1A 2YBHA 1UIAA 1OUGA 4XJBA 5D5FA 5LA8A 1HEQA 1B5XA 4HPEA 5IDDA 5LVIA 2F2NA 5KXOA 2LYZA 4NWHA 1IOCA 3VWOA 1LJ3A 1UIDA 1GPQC 1ZVHL 4W96A 3WW5A 1LZNA 1LAAA 1FDLY 4BADA 4RW1A 4QY9A 1OQMA 3P64A 1GF5A 1GF4A 3AZ6A 1BWHA 1NWGA 1CKGA 1W08A 4MR1A 1NBZC 2BQJA 1I56A 4N8ZA 1AM7A 2D91A 2HUBA 4PHIA 4OWEA 2HEFA 1JJ0A 1GAYA 1HEPA 3ATOA 2D4IA 1JJ1A 5APFA 3RNXA 1GFEA 1B7SA 3P66A 4NGWA 1QIOA 5C6LA 3KAMA 1JITA 4O34A 1IWWA 1B0DA 2CJLA 1CJ7A 3TXJA 3EO5A 5KXYA 135LA 4ETBA 1CJ9A 1IWYA 2VB1A 1GF6A 2C8PA 1GB0A 4M6DA 3WMKA 2F4AA 4PJ2C 3FE0A 1G7MC 3OJPA 1IP1A 1GB2A 4LYMA 4ETAA 2YBIA 5F16A 1CKDA 4RDSA 3TMVA 3A3RX 3CQLA 4N5RA 5LVKA 1OP9B 1UC0A 3WW6A 1HSWA 3W6DA 1AZFA 1CJ6A 1GB7A 4G49A 5KXMA 1IP6A 4G4HA 5M1YA 4HJYA 1JPOA 1LJHA 2H5ZA 2Z38A 4NHSA 5LYTA 1WVVA 2DQEY 3ZEKA 1LZAA 1C7PA 1LZ4A 1DXJA 4HP0A 5F9UA 1KIPC 3IWRA 1WQRA 1LJIA 4OWCA 3P68A 1QUSA 3IJUA 2ZILA 1I20A 1JKCA 1KXYA 1OUDA 4ML7A 1YANA 5JENB 3TXEA 4ET9A 1B7QA 1D9UA 4NIJA 4TX7A 5B1FA 3T36A 3BKHA 2FYCA 1LJ4A 1GBWA 1RFPA 2DQJY 2G4PA 4WM4A 1GE4A 1DPXA 3ATNA 4HTNA 1GE1A 3WVXA 3LZ2A 1TEWA 2AUBA 1HMKA 4FJRA 3TXBA 5DM9A 5HMJA 2YBNA 4HTKA 3CT1A 5FHWA 1BWIA 1LPIA 4G4BA 1LMTA 1D0MA 5B07A 2BQIA 1JUGA 1QDTA 3TXHA 3WU7A 1GFRA 4UWUA 4PRUA 4B4JA 4HSFA 1IY3A 4GCBA 1IVMA 1BGIA 1UIBA 4TSBA 3WPLA 4DT3A 1GE2A 2I25L 4NGJA 1DZBX 3AZ7A 5LVHA 1B2KA 4HTQA 1REZA 208LA 1LZGA 1REXA 1CKFA 1DKJA 1GB3A 1T6VL 1VDPA 3TXFA 2ZWBA 1JWRA 1HFXA 2H9JA 1PS5A 1IC5Y 4WG1A 3QNGA 4OOTA 2HU3A 2Z39A 4DD2A 1HFYA 1LSAA 3B0KA 3BKVA 1GD6A 1RJCB 2BQOA 1BB5A 2ZYPA 2CGIA 3TMWA 2Z2EA 4DD1A 3LYTA 1J1PY 2BQHA 1HC0A 5B06A 3W3EA 5C6IA 2MEGA 2XTHA 1GE0A 3LHMA 3A6BY 4IJ4A 1B5YA 2MEIA 1GFJA 1LSNA 1LSGA 1PZYA 3G3BB 4Z98A 4H8YA 4WO9A 1QTEA 5HNCA 2Z2FA 2BQEA 3AW6A 3A96A 5KXLA 153LA 1JTTL 5APCA 1IX0A 1FLWA 3LYZA 1JKAA 1GHLA 1FKVA 1LMCA 3GXKA 1OUHA 5B1GA 1IC4Y 1OUJA 1IWTA 1C45A 2LYOA 1B7LA 1C43A 3WPJA 4OW1A 1VEDA 4KT3A 2YBLA 1G7JC 1GB5A 4GN5C 1LHKA 4ZFPA 3J6KA 3WUMA 1GBXA 1YKXX 2D4JA 1LYZA 4L41A 4NGZA 9LYZA 2IFFY 1LMPA 1GDWA 5ILCA 4DD9A 1OUFA 1DI3A 2Q0MX 1YIKA 2CDSA 1QDRA 3EBAB 1LYOA 4XYYA 5DN4A 4ET8A 1GFVA 1JEFA 1W6ZA 4I0CA 1NDGC 1IOQA 2EQLA 1LSYA 3WU9A 4H93A 4HPIA 3LZTA 4BS7A 3B0IA 1D6QA 4NGYA 4NGOA 5KKIA 4QEQA 4WLTA 5I5QA 3A91A 1CKCA 1JKBA 3TXGA 1LZ6A 5L3IA 1LOZA 1QQYA 1KIRC 1JTOL 2MEDA 4R6CA 4WOAA 4DWXA 3QY4A 1IR8A 1FBIX 1B7NA 1B7OA 2HTXA 1GAZA 1B5VA 2ZYCA 4OOOA 4H90A 4DDAA 1D0LA 1JJ3A 1IWUA 3G3AB 1LMNA 1UA6Y 1LZTA 5LAGA 4GCDA 1UCOA 1YROA 4XADA 1IOSA 1BB7A 4LYOA 1GBYA 2W1YA 4TSCA 3CT0A 3HBEX 2D6BA 3WUNA 3AJNA 3WYHA 1GFAA 1F10A 2Z12A 1TCYA 1GFUA 1B5UA 1T3PA 4II8A 4NG8A 1QUTA 1LHMA 1WVUA 3HFMY 1A2YC 2HECA 1LJKA 1LCNA 1UIFA 5I54A 5KXWA 1HF4A 1RE2A 1LKRA 1IC7Y 1IIZA 2LYMA 3F6ZA 5KXXA 2EIZC 1LZCA 1EQEA 4AXTA 5B05A 1CJ8A 1QSAA 2W1XA 154LA 4CFPA 4NSJA 4DDCA 1B5ZA 1IEEA 4C5FA 4B49A 1XSFA 4DD0A 2Z37A 5IELA 1O23A 4NWEA 1LMOA 4YEOA 3ULRA 1ZV5L 1IWZA 1DI4A 2X0AA 2YSSC 4IASA 4KPMA 2BQLA 3AYQA 4B0DA 4H9FA 5D5CA 4TWSA 5FELA 1H87A 1GF0A 1GFHA 1IP4A 1IP7A 5LVGA 4LYZA 2DBTA 4GN4A 1B7MA 3CSZA 4CJ2A 1N4FA 1LZ8A 1HERA 3A3QA 2BPUA 1WTNA 4EOFA 1D6PA 1F6SA 5DN5A 3B0OA 4HJZA 1LZ1A 3P4ZA 3J4GA 4H9CA 4EMNA 1LSBA 2DQIY 4ETEA 3W6AA 2FBBA 4NGVA 134LA 1UACY 3WPKA 1JSFA 1YKZX 1TBYA 2EKSC 3RZ4A 1LSFA 1LYYA 1ZMYL 3CT5A 2F30A 2XJWA 4WM1A 1RCMA 1XEJA 1CNSA 1HSXA 1OUIA 5A3EA 1G7LC 2W1LA 5KXTA 3AGHA 4LGKA 4NEBA 1XGRC 1J1OY 3A95A 3B6LA 3D9AC 1LTMA 4YOPA 4WLXA 1YKYX 2EPEA 3A6CY 1GWDA 1GE3A 2B5ZA 1IORA 1LYSA 4RLNA 4B1AA 4BAFA 4NHQA 3LYOA 5KXKA 4KXIA 5DL9A 1VDSA 4GLAA 4NGIA 1GFGA 4H94A 5LVJA 1LZRA 1GF7A 1LHIA 1BVKC 5I4WA 2HU1A 1IY4A 3HBHA 3GXRA 3LN2A 2LZTA 4TUNA 1FN5A 1LSMA 1ALCA 3AZ4A 4PPOA 4LYBA 1BB6A 5KXPA 4ZIXA 1E8LA 4TTDA 1P2CC 4H8XA 2BQBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LYJA 4DD7A 1L91A 5HNLA 4KL7A 1MLCE 1DI5A 4K5YA 2MEHA 1LJGA 2O4WA 3WL2A 161LA 5E9RA 132LA 2YBJA 1HELA 3MGWA 1LMAA 3F9LA 2MECA 2OEAX 2RBNA 2HEEA 1C10A 1TDYA 1D3JA 1FLUA 1L04A 3WXTA 4NHPA 1L54A 6LYTA 155LA 1LZEA 4J1BA 4XJDA 171LA 199LA 1V7SA 1IO5A 4NFVA 1VDQA 1IOTA 3N9AA 137LA 255LA 3CSQA 1DKKA 1G0PA 2BQAA 4I7SA 4QDNA 3HH6A 1DYCA 1UIHA 1CU6A 2HUMA 3W6BA 177LA 1XGPC 3A67Y 4MCKA 4DYGA 4LDEA 2MEAA 1XGQC 1QT4A 5FDJA 2MEFA 4EKSA 1IP5A 1P3NA 3WVYA 1UIEA 1NHEA 1L94A 4NSIA 4WL6A 1L16A 2DQGY 4RLMA 4PGJB 4B4EA 1VAUA 4LFXA 237LA 1C6EA 2DQAA 4WM6A 4NY5A 4S0WA 3EXDA 3QE8A 5HQ1A 1WQPA 1TAYA 1LYEA 2BQDA 1ZVYB 4UWVA 1F0WA 4HV2A 1L57A 3HT8A 1F6RA 261LA 1LZBA 150LA 4EKPA 158LA 224LA 1JTMA 1L87A 4PRQA 3A8ZA 3K3TA 5IHGA 4QGZA 2W1MA 4N1CC 142LA 1QSWA 5FEKA 3SB7A 4LDOA 2NWDX 1GF9A 4LT3A 4MSTA 3G3VA 139LA 205LA 218LA 1L98A 4ARQB 3VW7A 4J0LA 1LWGA 5LA5A 1QTKA 3V2YA 113LA 4NGKA 2BQKA 1WTHA 1IP3A 4CFOA 1DQJC 3A92A 4XJFA 3AGGG 3EMLA 1L69A 4AGAA 3GUMA 1AT6A 1L12A 1T8AA 2C8OA 4EJ4A 1LHJA 4OO9A 4WLYA 5FCPA 1LSEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4HJV A;  4WL7 A;  1C46 A;  1LZD A;  2ZNW Y;  4DD7 A;  4YF2 A;  5KJ9 A;  1LSP A;  4U3X B;  5HNL A;  1HML A;  1YAO A;  4KL7 A;  1MLC E;  4GLV A;  1DI5 A;  1RI8 B;  4WO6 A;  5KXR A;  1SQ2 L;  2MEH A;  4LT2 A;  3CB7 A;  4XJG A;  4WMG A;  5J7C A;  1GBS A;  1LJG A;  3WL2 A;  4NGL A;  2DQC Y;  1NQI A;  4YEN A;  5E9R A;  132L A;  2YBJ A;  5K7O A;  1HEL A;  4B4I A;  3W6C A;  3MGW A;  1LMA A;  4ETC A;  2A7D A;  1HNL A;  5I4X A;  1I1Z A;  2MEC A;  2HEE A;  3P65 A;  1C10 A;  1IWV A;  1TDY A;  1BB4 A;  3WH1 A;  1FLU A;  4RW2 A;  1KIQ C;  3TMX A;  3WXT A;  1YIL A;  4M4O A;  1H6M A;  1NBY C;  4NHP A;  6LYT A;  2N5Z A;  1LMQ A;  1YL1 X;  3A34 A;  1LZE A;  4J1B A;  5B59 A;  1YQV Y;  1SLY A;  4H9B A;  4XJD A;  1V7S A;  1IO5 A;  1YL0 X;  4NFV A;  1VDQ A;  207L A;  1NKH A;  1IWX A;  2XBR A;  2BQG A;  3A93 A;  1JHL A;  4CGE A;  4UWN A;  4NSH A;  1IOT A;  1LSZ A;  3N9A A;  4OWB A;  3CSQ A;  1DKK A;  1OUB A;  1AT5 A;  2BQA A;  4QDN A;  3TXI A;  2GV0 A;  4P2E A;  2ZIJ A;  4H9H A;  4CHX A;  4ETD A;  2Z19 A;  3WU8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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