4NTLA

Crystal structure of a lipoprotein, yaec family (ef3198) from enterococcus faecalis v583 at 1.80 a resolution
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
DKEITVAVQLESSKDILEIAKKEAEKKGYKINIMEVSDNVAYNDAVQHDEADANFAQHQPFMEMFNKEKKADLVAVQPIYYFAGGFYSKEYQDAKDLPENAKVGIPSDPTNEGRALAILNANGVIKLKEGVGFNGTVADVVENPKNITFESIDLLNLAKAYDEKDIAMVFCYPAYLEPAGLTTKDAILLEDKEASKHYALQVVTRKGEKDSEKIKVLKEAMTTKEVAEYIKKNSKGANIPAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Lipoprotein, YaeC family
publication title Crystal structure of a lipoprotein, YaeC family (EF3198) from Enterococcus faecalis V583 at 1.80 A resolution
rcsb
source organism Enterococcus faecalis
molecule tags Transport protein
total genus 69
structure length 242
sequence length 242
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03180 Lipoprotein_9 NLPA lipoprotein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ntlA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ntlA02
3MJNA 1R6ZA 2FNCA 2OBGA 2O7UA 4H8JA 1B6HA 4NF6A 1XT8A 3P7IA 2Q2CA 3KEIA 3K1NA 3UIFA 4FAJA 3KGCA 2P2AA 1DOTA 4OFLA 4U1OA 4EF2A 3MVXA 4UACA 2F7BA 3VLVA 3SEVA 2DWIA 4OZ9A 3OENA 1OVBA 1FTLA 4H5FA 4F18A 3KN3A 1D3KA 4EF1A 1BTJA 1BP5A 1B9JA 3QAXA 3S9NC 1N84A 2VGQA 4KR5A 3BFTA 4GIZA 1KWHA 3DP8A 1AH5A 5A5XA 1USYE 3CR9A 3SERA 1DPPA 4IO5A 4GL8A 3UN6A 4N6PA 4QFOA 2UVJA 2DP8A 2ABHA 2XXXA 4JWYA 1D4NA 3VV5A 5AA4B 1MQHA 2QSXA 1ZU0A 3KBRA 1B46A 2AL4A 4R72A 3E13X 1YCJA 4R6KA 3FXQA 5I59A 2A5TA 2RINA 2NOOA 4LATA 1MPDA 4BDOA 2VP1A 2R9JA 1MY4A 2DE4A 5ICTA 3TPAA 4ZDMA 4YICA 4C0RA 1XHYA 2DWJA 2PMSA 3KJTA 3TQLA 2XXTA 1MY2A 1MXWA 3R26A 3KOTA 1I69A 1UTBA 5TP9A 2FYIA 1LFHA 4DCXA 3TELA 3HCQA 3FJGA 2B3BA 3GLBA 4PQJA 2ONSA 4TQUQ 5K2YA 2GH9A 3M3FA 1AOVA 3FXUA 3LSWA 1LAXA 4QFPA 4X1BA 2V3QA 1OQGA 4PFTA 3QUJA 4IB2A 1Y9UA 2Q2AA 1YTVA 2PYYA 1JVYA 2PVUA 2UVHA 3MW0A 4PFWA 1FTMA 3PUYE 1I6BA 2XXIA 4OMBA 1S7YA 1SW4A 1DTZA 3O9PA 4K3FA 1LCFA 5KZTA 1EH3A 5B70A 4IGRA 3N26A 4EUOA 5CRYA 4H5GA 1IXGA 1B1XA 4JB7A 2I49A 2NXOA 2Y7PA 5BWJA 3VDFA 3K6VA 5H8NA 3K01A 1JVXA 4POWA 5TU0A 4DXUA 4U2RA 3JZJA 5L8DA 3T96B 3CFXA 3W15C 1MXZA 3KSJA 4U23A 3IR1A 3QXMA 1VSOA 3L6GA 4FIMA 3TTMA 2WKYA 3OD7A 3SESA 3VLWA 4GD5A 4AB6A 1AMFA 3OO6A 5I2KB 1QJMA 3AXFA 1LAGE 1Q1KA 5AA1A 2P0SA 3Q27A 3UP9A 2F5XA 3I6VA 5KDTB 1ZTYA 2HZLA 2HEUA 1YAEA 4G4PA 1EZ9A 2F34A 4F22A 1B0LA 1P1WA 1P1UA 4RJZA 1N7WA 1H76A 3IOUA 2DS9A 2F36A 4F29A 1GGGA 4QSEA 1M5BA 1FQCA 3PUVE 3FJMA 3T9HB 3HN0A 3MVWA 4ND9A 4RPOA 4YKIA 4ELRA 4KFQA 1B1HA 5DT6A 2XD3A 2OCUA 3PPPA 3K6WA 3LSLA 4Q5TA 4NF5B 1JW1A 1O63A 3C31A 2GFEA 1GTKA 2PT1A 1IQ7A 2ONKE 3C36A 1MQIA 4PFUA 4I1DA 5AA4A 3LSFB 1HSEA 1MPBA 4F39A 4PETA 3N6UA 4R73A 1MQGA 5I58B 4YZZA 4YB6A 4F3BA 3USDA 2F7AA 4IO7A 4TOZA 4YKPA 4OFJA 2OJTA 2UVGA 2QMWA 1QVSA 4NF8B 3PMXA 4HTGA 3LC8A 1URSA 4U4XA 1N3XA 4LONB 2REGA 1Q35A 4QSCA 1N76A 2AL5A 1NL5A 2Y7WA 1B32A 1MH4A 4JBZA 2ZYKA 3K00A 2ESNA 5DEXB 2DQVA 4KPTA 2NVUB 2QS4A 2UXAA 3F11A 1ZKBA 1HSLA 2I58A 2F6GA 3FJ7A 3VXBA 3SEYA 2YLNA 4OQOA 3B7DA 1B4ZA 3CIJA 2XXHA 3FVNA 3MQ9A 1JNFA 1MXYA 4GXSB 5I57B 5DYHA 3O6GA 2DXRA 4NWCA 4F3SA 3UGWA 2KLFA 4THIA 3GXAA 4Q8RA 3ZS6A 3QIMA 4PE5B 4H1XA 1OIBA 3IAZA 4HCYA 1LFGA 4N13A 4KCDA 5M2VA 3VVDA 1MQDA 2O84X 1MXUA 3PPQA 4YB5A 2Y84A 1Y4CA 3E4RA 2HFBA 4F1UA 4FATA 2H25A 3HSTA 4ELPA 2DYXA 4AB5A 4OXVA 3IX1A 3QSLA 5B7DA 2V3TA 1SI0A 3PMWA 4G77A 3H06B 2D3IA 4DDDA 3PUWE 1UIVA 4OTEA 2E0SA 2ZNTA 3IJOB 4OESA 3MVYA 4RK2A 5KDTA 1A55A 3RY3A 4IGTA 1GV8A 3O2AA 3FASA 3D4GA 3UA8A 5FTHA 1WVJA 3DP4A 5CMBA 3FV1A 1CE2A 1JEVA 3RQTA 5AE4A 3VXCA 4F2QA 3ZSFA 1QKBA 2XXVA 1EU8A 1B52A 4R9FA 2Y7RA 2F6PA 3D4CA 3OEKA 5EYFA 1H45A 1FQFA 4NF5A 2F97A 4DXCA 3K1PA 3H6TA 4FEDA 1LBCA 3Q29A 4IO2A 4WEDA 3IO4A 3PV0E 1M5DA 2E1SA 3U8QA 4DE8A 5AA3A 3EHTA 1TWYA 5DTBA 1QUIA 2VD2A 5I58A 5H8HA 4WEPA 3WAFA 3SDFA 2ONRA 3KG2A 1NH7A 1QUJA 1MY3A 3IJXB 4MLQA 1FQBA 5CBSA 4NF8A 1MDQA 1WODA 2IA4A 3ONMA 3CFLA 2H4IA 3PUXE 1A8EA 3KFMA 5DVIA 3THIA 2ZXTA 2B3FA 1ZBMA 4KQPA 1N7XA 3M3KA 4NTLA 2I48A 4XKRA 5DEXA 2V84A 1B5IA 2XHDA 1QW0A 3WAEA 3IB2A 3VLUA 2G29A 4G2ZA 5LOMA 1XOCA 4TLLB 1B0HA 2AIXA 2CMOA 4R75A 3KOSA 1SDXA 4RPNA 5I57A 5L9MA 1IXCA 5CM6A 4ONYA 4F3GA 3A09A 5HM4B 2Q8JA 1NNTA 2B65A 1US5A 3RT8A 2A5SA 1PC3A 5CI5A 3HPIA 1H3DA 2I4BA 3TZAA 3U92A 4ELQA 1XVYA 1PB8A 3DM0A 2VOZA 4KYEA 4JWXA 4O3BA 4DIGA 4MBPA 4GRKA 1H44A 3R6UA 3Q28A 1P1NA 2I0BA 3A3CA 3LSXA 4JSOA 3L6HA 4R74A 3N94A 4KI0E 2V25A 3CG1A 3CRBA 2DXYA 2NWJA 4I8CA 2V3UA 2R71A 4O3CA 4U4SA 2O1MA 1D9VA 3IL1B 4U1ZA 1B7UA 3C4MA 3VFJA 3TDJA 5EHSA 3FIRA 1LB8A 4QRZA 1B5JA 3IOWA 4C1UA 2UYEA 3U93A 4F31B 3K02A 3EF7A 4ZEKA 1MRPA 2I3WA 1OVTA 1OMPA 4ESXA 4NF4B 3SEUA 3VE1B 1UIUA 4E0XA 3H3GA 4MFIA 2M8CA 1P1OA 4GQOA 3TCGA 4YMAA 1MS7A 3JYRA 1LB9A 1B7HA 1IITA 4IY6A 4WKMA 4EDPA 1XVXA 2H5YA 1BIYA 1LAFE 1Y3PA 3H7MA 4NMYA 3H6VA 5I56B 1GR2A 2GRVA 3TCHA 5JK4A 4U22A 1JEUA 3C34A 4R9GA 3O6HA 1LGBC 3IOTA 4ZZAA 4EQ7A 3O6IA 1NH8A 4NEDA 2QL3A 4X1DA 2YPNA 3FUZA 2IEEA 1MXVA 3T93B 3MZBA 2CZLA 1B4HA 3ZKLA 5TPAB 3S4UA 3VVEA 5CBRA 1JETA 3UK4A 1S50A 4XKNA 4ZEIA 2G93A 2RC9A 1IZ1A 2OK2A 3V83A 5EHMA 3VVFA 4ZS9A 4ESWA 3Q25A 2VD3A 3G3HA 4OEUA 3BBRA 4XKPA 1URGA 3OSQA 2QJEA 4JWOA 4KHZE 1P1QA 4NWDA 2RC7A 3V5AA 1PEBA 1B2HA 1FQAA 1F9BA 2HZKA 2ZYMA 3I3VA 4OYVA 5H8HB 4F19A 1A8FA 1S9TA 3N5LA 2XX7A 1Y4TA 4YB7A 1FTJA 3C35A 2XXPA 1LAHE 3V8XB 3O97A 4AQ4A 4Q0CA 3EQ1A 4MH5A 1TXFA 1B3EA 3I5OA 3HV1A 4P11A 2H9BA 2AYSA 3ODBA 2X7QA 4YKJA 3M8UA 4RY1A 4OETA 3TAJA 1A40A 2DVCA 2Y7KA 4BLAA 1ZIUA 2PBWA 5CMCA 1NNFA 1DMBA 4GF8A 1HSJA 4I62A 1LLSA 3OXNA 4QF9A 1SBPA 4H65A 1VR5A 1NNPA 2DVZA 3SEXA 1FCKA 5ITPA 1ANFA 1ZLQA 3JV9A 2RKMA 4OFOA 1A7LA 3QYTA 1UTHB 4NF4A 3S9MC 1SYHA 3E3KA 1JW5A 3TTKA 4OHNA 4ZEDA 5FHOA 1R9QA 3DELB 4GXAA 3G3JA 1POTA 1NMUA 3MPKA 3FV2A 4FEBA 1N3WA 5I56A 1FQDA 2O51A 1PB7A 3RUMA 3IK6B 2FA7A 3IO6A 3PPNA 4LUBA 4ZEFA 3RTFB 1NKXA 4XXUA 4H8IA 3EHUA 3K1MA 3PD8A 1M5CA 2DWAA 3ILUB 3G3KA 3HHFA 3K6XA 2O1LA 4GLIA 3TQWA 4QSDA 3T22A 5TPAA 3MP1A 5F7VA 1MH3A 4JDFA 5HPQA 1O64A 2OWSA 2HCAA 4GVOA 2QS2A 4X9TA 2QMXA 4H67A 4RYAA 1PBQA 3KJ7A 3R7XA 1US4A 4F1VA 2OWTA 5IAIA 1QULA 2XX8A 1MDP1 4IO3A 1SQYA 1EZPA 4YAHX 2Z8FA 2LAOA 4ZE8A 3H03A 4GFRA 5JTYB 3OSRA 4KD5A 1PB9A 1M5FA 3MUQA 4XTCQ 4BDLA 2P1SA 3G3FA 3O66A 1SW2A 4F1YA 2VHAA 1MQJA 4QHQA 1SW5A 5I2NB 4PP0A 4LA9A 3LUYA 3N6TA 2V93A 2XXRA 4GL0A 2PX1A 3CG3A 1IUDA 3H6UA 2HAUA 3QK6A 1A54A 3GBBA 3G3IA 5AA2D 3MVZA 4LZ5A 3B6TA 4YMBA 1MY0A 2RF1A 4RK9A 3IOVA 5FTIA 3OO9A 1SYIA 4LP2B 3G7WA 1AL3A 2XXUA 2DE3A 1L5TA 1B58A 1MXXA 3FZVA 1MPCA 1LSTA 4RA1A 1IIWA 4NE4A 1CB6A 4QFLA 2O68A 4EXKA 5J1DA 5ICQA 4Z7EA 2XX9A 4HS7A 1SW1A 4P0IA 1MY1A 1FW0A 3TCFA 1SD3A 2QS1A 3OMBA 4Z0IA 5H8SA 3U1OA 4G68B 1Y3NA 1JW4A 3FD3A 5I84A 2ANJA 1TT1A 2OLBA 3B6WA 4MF3A 4G68C 3OOAA 3SKPA 2Z23A 1I6AA 3PMVA 4R2FA 3S2VA 1Y1ZA 2Y7IA 4KYSA 3CI8A 1UTHA 5ISUA 4JXIA 4GOTA 1A99A 4EQ9A 2QRYA 3W9WA 4I9DA 4G8HA 2R6GE 1H43A 3EPEA 4DXBA 5DVJA 4MLVA 3CFZA 3ECRA 4FORA 1EZOA 1IXHA 3PGFA 4FECA 1XS5A 1B3HA 2GHAA 2Q9TA 3MZ1A 3FXRA 1UQWA 1VE4A 1MG1A 4G8NA 3OO8A 2Z8DA 4FJPA 1BLFA 1N04A 2HQ0A 2ZNUA 2THIA 1FTOA 1PBPA 1Y1MA 4LZ8A 4WXJA 2Z8EA 4N07A 1RKMA 4L17A 4G8MA 2O6AA 5HBCA 3TTLA 4F3PA 3TMGA 1YPNA 2PT2A 4FE8A 1N0TA 5H8FB 3T9VA 3UORA 1B51A 2XXWA 4ZZEA 3BFUA 3TFLA 3U94A 1NNKA 5H8QB 4DLDA 5ELVA 1ZJLA 2D21A 5JEIA 3OEMA 3W9VA 2UYFA 1PDAA 2Z22A 5JTYA 3B6QA 4OENA 1AIVA 3S9LC 5FHMA 4O3AA 5BUUA 4HW8A 3C33A 3TTNA 3MP6A 4BDNA 5I2NA 3CSGA 3E9XA 3U72A 3RT6B 3HO7A 1VFDA 5KCJB 5DVFA 5CMMA 3KN8A 4Q30B 4H0WA 3K2DA 2F35A 3MBPA 1Z7NE 2HXWA 1IEJA 2RCBA 1WDNA 1D9YA 3K0VA 1B5HA 2DSFA 5AA2B 3MWBA 3OO7A 4ZE9A 2QPQA 1B3FA 2HAVA 1LCTA 3BKIB 2O7IA 3RLFE 3RGYA 1ZMGA 4UA8A 2I6EA 1O7TA 3DLNA 4LVQA 3TUSA 4X48A 3FVGA 1POY1 2ZNSA 1M5EA 2DWHA 4G68A 3TYHA 3KSXA 3A3UA 4OEVA 3RPWA 1IXIA 1Z7ME 4QFKA 2RC8A 3GZGA 3ILTB 2QS3A 5L9SA 4EQBA 4KYDA 4IO6A 1II5A 3T66A 5CC2A 4NF6B 4BDRA 4M4GA 3SEWA 2XXYA 3M3LA 3KN7A 2ZMBA 1MM7A 1XC1A 1T0KA 1USYH 2XXQA 4ECFA 5F1QA 3T9XB 4PFYA 4U21A 4R6HA 3IB1A 4QFNA 3SETA 3TKDA 5L9OA 3MP8A 3K6UA 1TFDA 4H6DA 1P99A 3MC2A 1J1NA 4F2OA 3TODA 2X7PA 3G3GA 2I4CA 4GWOA 1SI1A 4OWDA 1JQFA 5A5XB 4DCYA 5ITOA 2H99A 2DOJA 3C32A 3KZGA 2F7CA 4IO4A 4LQ5A 3HHGA 2ZYOA 4XIGQ 1OQHA 3Q26A 1B3LA 3K4UA 3MPLA 4ZECA 2DE2A 3C9HA 3MZ9A 3EHSA 3CVGA 5I59B 2A5TB 3O28A 3O29A 3PU5A 4YKKA 5H8FA 3S9EA 1I6QA 1Y3QA 4POXA 2XD2A 1LBBA 3RTWB 4R6YA 3H6WA 4OERA 1R9LA 2RCAA 5H8QA 1FQEA 1ELJA 2ALUA 3V89B 1LFIA 3TTRA 1TFAA 2GHBA 2OZZA 3DP6A 3GBAA 3FVOA 4ELOA 1OLAA 2W7YA 1UTBB 4P0GA 5TP9B 1SVXB 1OLCA 2UVIA 1B05A 3PUZE 3PD9A 3OELA 2O69A 2NUVA 3ZKKA 4OVJA 3PPRA 1MM6A 3QUFA 2F8DA 4BDQA 3TEPA 4KCCA 2I3VA 2Q89A 2X26A 2F78A 3LBSA 1DTGA 4LZ7A 1DSNA 3IORA 4LQ2A 4JSDA 5KCJA 4RNSA 5I2KA 4C1TA 4XKQA 1Y20A 1ATGA 1QUKA 2Q88A 1RYOA 3MAMA 5K2XA 3T9UA 1B7ZA 4M1VA 5IKBA 3IB0A 5FHNA 4EXLA 3LR1A 5AA2A 1DPEA 1B40A 5H8NB 4TLMB 3FVKA 2ZYNA 1QKAA 3FGSA 1RYXA 4IY5A 4HCWA 2D5WA 2BJJX 1NFTA 4RXLA 4YU0A 3EN3A 1R1NA 2H98A 1GVCA 5CMKA 1VFEA 1URDA 4DZ1A 3RN8A 1B3GA 3CSBA 4ISUA 4ZEBA 4E0WA 1BKAA 1FTKA 2YJPA 2REJA 3H4ZA 4R2BA 3RNNA 2I0CA 4BDMA 3FATA 3PPOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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