4NTLA

Crystal structure of a lipoprotein, yaec family (ef3198) from enterococcus faecalis v583 at 1.80 a resolution
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
DKEITVAVQLESSKDILEIAKKEAEKKGYKINIMEVSDNVAYNDAVQHDEADANFAQHQPFMEMFNKEKKADLVAVQPIYYFAGGFYSKEYQDAKDLPENAKVGIPSDPTNEGRALAILNANGVIKLKEGVGFNGTVADVVENPKNITFESIDLLNLAKAYDEKDIAMVFCYPAYLEPAGLTTKDAILLEDKEASKHYALQVVTRKGEKDSEKIKVLKEAMTTKEVAEYIKKNSKGANIPAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of a lipoprotein, YaeC family (EF3198) from Enterococcus faecalis V583 at 1.80 A resolution
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Enterococcus faecalis
molecule keywords Lipoprotein, YaeC family
total genus 69
structure length 242
sequence length 242
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03180 Lipoprotein_9 NLPA lipoprotein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ntlA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ntlA02
1FTMA 5KCJB 2XXUA 3ZKLA 1WODA 3MZBA 5ISUA 2DP8A 1A54A 4QFKA 4RK2A 4KYDA 3G3GA 1MH3A 1BIYA 3TCFA 2ZXTA 5ITOA 2XXPA 3TFLA 3OO6A 3CR9A 3K02A 3JV9A 3ODBA 2F35A 1VE4A 5H8FA 3FATA 3TCHA 1B1XA 2B3FA 1A55A 1DTGA 1DPEA 4OESA 2V3TA 1Y3QA 4PFTA 1O64A 5A5XA 5L9OA 1I6BA 1D9YA 4NF5B 1B3HA 2Y84A 2D3IA 2F8DA 3Q25A 1KWHA 3IJOB 4KCDA 2PX1A 3TDJA 4I8CA 3W15C 2B3BA 3B6WA 1USYE 3C36A 4JDFA 1A8EA 3RPWA 2VP1A 3CG1A 4FEBA 1LCFA 4WXJA 3PUVE 5FHNA 3TTKA 1MY0A 3V5AA 2RCAA 4R6HA 4L17A 4RPNA 1Q1KA 4R6YA 2Z8DA 2DWJA 1SQYA 3IR1A 3TZAA 1QVSA 1LAXA 4FAJA 3FXUA 1BP5A 3IB0A 1MPCA 1Z7NE 1UTBB 2F7BA 3T9VA 1B0HA 2OWSA 2A5TB 4EF2A 2THIA 3MP1A 2DE3A 4MFIA 3KJ7A 1IZ1A 3MVXA 5I59A 4OETA 1AMFA 3VXBA 3BFTA 3PMVA 3H6WA 2F34A 1AL3A 5BUUA 3MQ9A 2ONKE 1MXUA 4JWXA 2O7IA 2Z8EA 4U1ZA 1TFDA 3TQWA 3MBPA 3SEYA 2O1MA 1IIWA 3SEXA 1GR2A 1QULA 2PT1A 3SERA 4OYVA 4P0IA 2NOOA 3KJTA 3LUYA 4OERA 1ZLQA 3MC2A 5CMKA 2W7YA 1A40A 1B7ZA 4FATA 1B5IA 4NMYA 2X26A 3MP6A 3T96B 3VVEA 1I69A 3LSXA 3I5OA 1ATGA 2HFBA 3OEMA 2Q2AA 2ZYOA 4KR5A 4AB5A 4C1UA 2H9BA 3L6HA 2QRYA 5FHMA 4F1UA 3HO7A 3UORA 3W9VA 1P1OA 2RC9A 3H6UA 1PB8A 4GOTA 3FV2A 3T9XB 3TTNA 2F7AA 3G3FA 3OENA 4H1XA 4E0XA 4YMBA 3OSRA 2XXQA 3PD9A 4KI0E 5L9MA 4U21A 3PUZE 3QK6A 5DTBA 5I2KA 1SI1A 4HS7A 3ILUB 4MLVA 2V25A 1BLFA 2VGQA 5TPAA 4MH5A 1NL5A 4WKMA 1QUIA 1S7YA 2GFEA 2G29A 3K4UA 2I0BA 4LA9A 2XXHA 3E13X 1VFDA 1FTKA 3THIA 3EPEA 4NF8A 3G7WA 1GTKA 1AIVA 3OO8A 3U92A 3KBRA 1OIBA 3IORA 4OHNA 3DELB 1B51A 4N13A 2XXYA 1B7UA 1ZU0A 4O3CA 4AB6A 1URGA 1M5CA 4LUBA 1UIUA 5I2NA 4GL0A 3FASA 3IOUA 1EZ9A 3TQLA 2UVHA 1VR5A 4HTGA 2RC7A 3VXCA 3CVGA 3HCQA 3UA8A 1M5EA 4QFOA 1IITA 4GWOA 2ANJA 4X48A 1JVXA 2PBWA 5IAIA 2I48A 4KHZE 3U72A 4G68A 2XD2A 3OXNA 5K2YA 3IO4A 1NFTA 3EF7A 3Q27A 4IO4A 4DXUA 3H03A 5CRYA 1MH4A 1I6AA 3M3KA 5AA2D 1R6ZA 1YTVA 4GXAA 2RF1A 3E3KA 2XXXA 1H44A 2Q88A 5FHOA 2AL5A 3UP9A 4BDOA 5TP9A 3S2VA 1LFGA 3T22A 3QXMA 4EF1A 3K0VA 4GLIA 3OO7A 1LB9A 1UQWA 3CFXA 1R1NA 1MY4A 4ZDMA 1Y4CA 3KSJA 2BJJX 3DLNA 3KN8A 5JEIA 4BDMA 3MUQA 4Q30B 4BDRA 5LOMA 1Q35A 1URSA 1JW1A 1POTA 3C34A 1FQEA 4U22A 3MAMA 4HCYA 3IB1A 2DWHA 3B6TA 3VLUA 4Q0CA 2NWJA 3H06B 1MQGA 4QFPA 3S9NC 1XC1A 4ZE9A 1IQ7A 4N6PA 5DT6A 3MPLA 4DXBA 4GRKA 1H3DA 1OLAA 4ZEKA 4IO6A 2F7CA 3FIRA 1B52A 4RK9A 4F1YA 1N04A 1LBCA 4H65A 4XIGQ 2XX7A 3K00A 1N3XA 1M5BA 3CFZA 3L6GA 3DP4A 4F31B 4QFLA 4RJZA 3KEIA 5AA4A 1YCJA 5H8HB 2ABHA 3Q26A 2G93A 3ONMA 1N84A 1FQBA 3O9PA 2H25A 1LFIA 1MQDA 2QS2A 1NMUA 2F78A 2NUVA 3HHFA 1ZKBA 3TCGA 4JSDA 5KDTA 3M3LA 1L5TA 1MXVA 1LAFE 1LCTA 2ONSA 2UYFA 2WKYA 2OBGA 3FVNA 1A99A 1J1NA 3CI8A 3MPKA 3SKPA 5I56B 1IXGA 3OO9A 3T66A 4IO3A 2V3UA 5CMCA 3OELA 2XX8A 3A3UA 3WAFA 4IY6A 1LB8A 4XKNA 3C4MA 5H8SA 3TTMA 2QMWA 3TUSA 2VD3A 4IO7A 1EZPA 4PFUA 1DPPA 5HM4B 3VDFA 4RPOA 3LBSA 5AA3A 3TYHA 1SDXA 4KYSA 1MS7A 2Z23A 2VHAA 2REJA 1B4HA 1LBBA 5HPQA 1BTJA 3SEUA 4F19A 2V93A 1ZJLA 3T93B 4I1DA 4NWCA 3IO6A 1PBPA 3C31A 3K1NA 4YKJA 3G3HA 1B6HA 2O1LA 3R6UA 1LAGE 4RXLA 2RKMA 3FUZA 4PETA 2I4BA 2OJTA 1H43A 1GGGA 2QPQA 1N76A 3MP8A 5H8FB 3MW0A 1R9LA 4H5GA 4GIZA 2DXYA 1N7WA 2PT2A 2UVIA 2FA7A 4OTEA 5A5XB 2PMSA 4OFLA 1US4A 1JVYA 1RYXA 1SI0A 1MRPA 2F6PA 4C1TA 4H0WA 4M4GA 4GVOA 3TAJA 3N94A 3P7IA 1MXYA 3LSWA 3PUWE 1JW4A 2F6GA 2H4IA 5IKBA 1NNPA 4G2ZA 1UTBA 4EXKA 2HEUA 4JSOA 2HQ0A 4KD5A 2AL4A 1JQFA 2NVUB 4ELOA 4KCCA 3RY3A 4POWA 2R6GE 3DP6A 4Z7EA 3OEKA 3O66A 4NF6A 4EQBA 2ZYKA 3M8UA 3VFJA 4R74A 5L9SA 1R9QA 1XT8A 4QHQA 5I58A 2QS3A 4KFQA 3K1MA 1TWYA 4LVQA 2ZNTA 1PB7A 3U93A 4DCYA 3EHTA 1HSEA 5I59B 3H6VA 4YZZA 1MDP1 2ZYNA 4QSCA 1B5JA 1Y1ZA 2DXRA 3RNNA 2IA4A 4P0GA 3WAEA 4FORA 5M2VA 4G8NA 1NNTA 4THIA 2I6EA 3FJMA 3FV1A 1WVJA 2XXTA 4OMBA 5HBCA 4U1OA 3CSGA 2I4CA 4RA1A 1FQDA 4P11A 1QW0A 3RTWB 4ELQA 3KN7A 4MF3A 3M3FA 2O84X 1O63A 5ICTA 4ONYA 3KFMA 4DE8A 1AOVA 3IK6B 4U2RA 4DIGA 2Z8FA 2HXWA 4H8IA 1UTHA 4AQ4A 2FNCA 4LQ5A 4IB2A 2RC8A 2Q8JA 2Z22A 2RINA 1FTOA 2HZLA 3DP8A 4QSEA 4F3SA 1P1QA 4FIMA 1NNKA 3KG2A 5H8NA 2UVGA 5ELVA 2V84A 5JTYB 4OEUA 4OVJA 1PB9A 1FQAA 5I2KB 1RYOA 1PEBA 2I58A 4IO5A 2DE2A 2DWIA 4GFRA 3FXQA 2D21A 2OCUA 5TPAB 1OMPA 1BKAA 3CSBA 4LZ7A 3ILTB 4QFNA 2O51A 1H76A 3TELA 4YB7A 3O2AA 1MQHA 2ZNUA 5FTIA 4YMAA 1Y3PA 2GHAA 2ESNA 1FTLA 2XXRA 1XVXA 4ZEIA 1D9VA 4NF8B 2XX9A 5DVFA 5F7VA 4GXSB 2P2AA 1PC3A 3BBRA 4NF4A 4ZEFA 1MQIA 3UIFA 1Y9UA 3S9LC 1CB6A 5CM6A 3V83A 2E1SA 1P1NA 5I2NB 5JK4A 4H67A 5FTHA 3IOVA 3LR1A 4WEDA 2R71A 3E4RA 1M5FA 2M8CA 2Y7WA 4FEDA 3PPQA 2H99A 4EXLA 2DSFA 1N7XA 4Q8RA 3VVDA 3H6TA 3H3GA 5AA2A 2Y7IA 3LSLA 3RGYA 4YB5A 4YKPA 3UK4A 1B32A 1SYIA 1SD3A 1NNFA 5H8QA 4E0WA 3R26A 2O69A 2KLFA 3QIMA 2DWAA 4XKRA 4BDQA 3G3IA 1PDAA 4Z0IA 2P0SA 3B7DA 2YPNA 3FVOA 5CMBA 3QSLA 2A5SA 4XTCQ 1US5A 2GHBA 3IB2A 3RUMA 2Q89A 3OMBA 4KQPA 1MM7A 3H4ZA 4IY5A 2ALUA 3FJGA 4G8HA 2XXVA 1SBPA 5DYHA 3W9WA 4R9GA 3IOWA 1NKXA 1JEUA 5EHMA 3K6UA 1QKBA 3TKDA 2FYIA 3TMGA 2DYXA 2DE4A 4U4SA 4F29A 3ECRA 3JZJA 4OFOA 1P1WA 3BFUA 4NTLA 4WEPA 2I49A 4ECFA 3KSXA 1DSNA 1MXZA 4C0RA 3PPPA 3PD8A 1O7TA 4XXUA 2HCAA 5H8HA 4YU0A 4IGRA 3PPNA 3N6TA 3VV5A 1LLSA 4ESWA 2R9JA 4TQUQ 3PMWA 3PMXA 4GD5A 4F18A 1OQHA 3QAXA 4EUOA 2LAOA 1XOCA 3N26A 3IJXB 3CG3A 3O29A 5AE4A 1MPBA 1SW5A 2QL3A 4Q5TA 4IGTA 3SETA 4G68C 1IEJA 2I3WA 1A7LA 3HSTA 3U1OA 3CRBA 2B65A 3G3KA 3GXAA 4QRZA 3PV0E 3H7MA 1OQGA 3V89B 4K3FA 3S9MC 4NE4A 1ZMGA 5DEXA 5I57A 3RN8A 2O6AA 5KDTB 2D5WA 3MVWA 2RCBA 3BKIB 5KCJA 3TTRA 3S9EA 3K1PA 1B7HA 4ZEBA 4TLLB 3VLWA 3U94A 3GBBA 3UN6A 2F5XA 4XKQA 1F9BA 3FXRA 3MWBA 2CMOA 2HAVA 3KOTA 1OVTA 4ESXA 1TFAA 2DQVA 4LATA 3TODA 1VSOA 1MPDA 2F97A 3U8QA 3SEWA 1B1HA 3F11A 4X1BA 4DZ1A 3FJ7A 3C33A 3IX1A 4G4PA 3A3CA 5CMMA 1WDNA 4O3BA 2OK2A 2QS1A 1I6QA 4NF5A 1B0LA 1S9TA 2XD3A 4ZECA 5EYFA 4R72A 1DOTA 3SEVA 3LSFB 4YB6A 4QSDA 3RLFE 4UACA 4DLDA 2CZLA 2DVCA 3CFLA 2ZYMA 2AIXA 3RTFB 1B5HA 1MY1A 2I3VA 3D4GA 1M5DA 4JXIA 3TTLA 3MZ9A 1SVXB 2VD2A 1LFHA 3VE1B 4F2QA 1YAEA 3K01A 4ND9A 4PP0A 2QS4A 3I6VA 1A8FA 1LAHE 1XVYA 1Y4TA 4U23A 3IOTA 4DDDA 4DXCA 3T9UA 2ZNSA 2A5TA 1SW1A 4F3BA 4IO2A 3ZSFA 3RQTA 3C32A 3VVFA 4I62A 4R2BA 1IXHA 3FVKA 3K6XA 4F22A 4R2FA 2UYEA 4TLMB 2V3QA 2O68A 4HW8A 3KOSA 4YKIA 2REGA 1OLCA 4NF6B 2ONRA 4BDNA 1CE2A 2VOZA 5I84A 4LZ8A 3KN3A 1EH3A 4I9DA 1IUDA 5I58B 2QSXA 2QJEA 4F1VA 4OQOA 3E9XA 3K6WA 1T0KA 3EHUA 3HHGA 1B58A 2YJPA 4ZZAA 1B3LA 1FQFA 5DVJA 4JWOA 1MDQA 1P99A 1FW0A 3K6VA 4H5FA 3RT8A 3A09A 4DCXA 3HPIA 2OZZA 1EZOA 5B7DA 3FGSA 3KGCA 1SW2A 2DS9A 4ISUA 4TOZA 3IL1B 4GL8A 1ZBMA 4OENA 2HZKA 1B40A 4R6KA 2NXOA 1B46A 4JB7A 1B3GA 3SDFA 5ITPA 3S4UA 5F1QA 4R73A 1RKMA 1LGBC 1D3KA 2P1SA 1YPNA 3ZKKA 4H6DA 4R9FA 1ZIUA 3IAZA 2Y7RA 5JTYA 3TEPA 2H5YA 3OSQA 1UTHB 2Y7KA 2UXAA 3HN0A 4PFWA 4JBZA 4U4XA 4ZE8A 3PU5A 1Y3NA 3Q29A 4F2OA 4GQOA 3LC8A 2DOJA 4UA8A 5BWJA 4YICA 1PBQA 2Q2CA 5H8NB 3MZ1A 2HAUA 1FCKA 1Y20A 4OEVA 3VLVA 1XHYA 1EU8A 1B9JA 1HSLA 4QF9A 3C9HA 3GZGA 1USYH 4F39A 2QMXA 1QUKA 5K2XA 4MBPA 4MLQA 4YAHX 3B6QA 1FQCA 1FTJA 4JWYA 1Z7ME 5DVIA 3EQ1A 3USDA 5B70A 5CBRA 4ELRA 2ZMBA 1ANFA 3FD3A 3UGWA 3V8XB 2AYSA 1P1UA 3TPAA 4NEDA 1LSTA 3MVZA 3MVYA 1N3WA 4ZZEA 3EN3A 1MXXA 3O6IA 3RT6B 2F36A 2Y7PA 4G77A 5CI5A 4NF4B 4XKPA 1HSJA 1JNFA 1JETA 1S50A 1MQJA 3O97A 4HCWA 3PPRA 4G68B 2PVUA 3N5LA 3JYRA 2PYYA 3KZGA 3R7XA 4BLAA 1B05A 5CC2A 1MY3A 2H98A 5AA2B 4H8JA 1ELJA 3MJNA 3PUXE 4OFJA 1DTZA 4F3GA 1II5A 2OLBA 3GLBA 5ICQA 1D4NA 2DVZA 5CBSA 5H8QB 3FZVA 5KZTA 5TP9B 3AXFA 4EQ7A 4ZS9A 1Y1MA 4KYEA 4LQ2A 5L8DA 1MG1A 1IXCA 5J1DA 4KPTA 4G8MA 4EDPA 3FVGA 3DM0A 3G3JA 4LZ5A 1QUJA 2O7UA 2X7PA 2X7QA 3Q28A 3D4CA 4OXVA 4PFYA 3N6UA 1SYHA 1B2HA 3SESA 3C35A 3O6HA 1B3EA 2GH9A 4OZ9A 3O6GA 1GV8A 1MM6A 2I0CA 1AH5A 3QUFA 4ZEDA 3OOAA 4FECA 1VFEA 1DMBA 3CIJA 3HV1A 2Q9TA 3GBAA 2XXIA 2XHDA 1NH8A 2IEEA 2XXWA 1TXFA 1QJMA 1ZTYA 4ELPA 2UVJA 4R75A 3EHSA 1URDA 4LONB 5TU0A 4RY1A 1NH7A 1TT1A 3QUJA 1OVBA 4EQ9A 1H45A 1UIVA 4LP2B 2YLNA 3PPOA 1N0TA 4N07A 3OD7A 4O3AA 1QKAA 1B4ZA 4OWDA 5AA4B 1IXIA 3K2DA 4POXA 5I56A 4X1DA 5AA1A 4RNSA 4FE8A 1B3FA 4M1VA 2OWTA 4PE5B 1JW5A 1JEVA 4YKKA 4RYAA 1XS5A 4BDLA 1POY1 1MXWA 3T9HB 4X9TA 2E0SA 3I3VA 4GF8A 5EHSA 3O28A 4NWDA 4PQJA 2GRVA 1GVCA 1MY2A 1SW4A 3PGFA 5DEXB 3PUYE 4F3PA 4FJPA 5I57B 3QYTA 3ZS6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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