4NWFA

Crystal structure of the tyrosine phosphatase shp-2 with n308d mutation
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
531
structure length
489
Chain Sequence
SRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDGDPVSDYINADIIMPEKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with N308D mutation
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
total genus 158
structure length 489
sequence length 531
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2013-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4nwfA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4nwfA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4nwfA03
1PTTA 1C83A 3O3LA 3EAZA 2QBRA 3K2MA 4NNDA 4QAPA 2CI9A 1OHEA 4PYHA 2CR4A 3VS5A 3D44A 1O41A 2H4VA 2B4PA 4D3QA 2H04A 3TL0A 2HNQA 2NT2A 3V0JA 4RDDA 1O4MA 1BFIA 1O4DA 1OPLA 1GRIA 1Q6SA 3EACA 1Q6NA 3RGOA 4F5BA 3S8LA 3VRZA 5I6VA 2F6ZA 2I4EA 1QCFA 1SPRA 2EOBA 4D3RA 4A4CA 3QCGA 1A1CA 3QCIA 1WAXA 2PT0A 3RO1A 1C88A 2HUWA 1WRMA 2HB1A 1O4CA 5MMZB 1Q6MA 3H2XA 4FBNA 3ZM0A 2IMGA 1BF5A 2EKXA 2HDVA 1PICA 1OO4A 1ZFPE 2KNOA 1K9AA 1JLNA 2F70A 1T49A 1NRVA 3D42A 1V3AA 4QBWA 4JGHA 1SUGA 4WOHA 4WTYA 2P6XA 3BLTA 1NO6A 2GJTA 3I7ZA 2SHPA 2YU7A 4QUMA 3ZM3A 1O4AA 3C7IA 2CRHA 5AULA 2CJZA 2WGPA 5KA9A 1BHFA 1LKLA 4RHGA 2MK2A 1OEUA 2KK6A 1FPZA 3OB2B 4M4ZA 1Q1MA 3V0DA 1KSWA 2FCIA 5GJIA 3A5KA 2F46A 1QZ0A 1AOTF 1FU5A 1U26A 2I6MA 2OOQA 1YWFA 4ZRTA 4IKCA 2B4SA 4D8KA 1AD5A 3O4SA 1O4EA 1BZJA 1G1HA 2PA5A 3EAXA 1O4LA 1NNYA 2NV5A 1C87A 1LUNA 5BUGA 1XM2A 3RGQA 3WA4A 4BPCA 3IMDA 3BM8A 5EHPA 2PQ5A 2C0TA 3EZZA 4F59A 4RKKA 1L8KA 2CMBA 1M27A 2HC1A 1RXDA 5KA8A 2CNIA 2VEXA 2AHSA 2NZ6A 2CNHA 4ZI4A 4GWFA 4OHHA 2CM2A 4HJQA 1NWLA 5KA3A 3CD3A 2BZLA 1P15A 2I3RA 1JYUA 2ABLA 2CIAA 3F81A 1XXPA 2K7AB 3ZM1A 5DF6A 2QBPA 4QAHA 1PTUA 2I6IA 1X0NA 4B04A 1MILA 1Q6PA 4JEGA 4OHDA 3GXXA 2CS0A 1C85A 1OHDA 4F5AA 4Y2EA 2C9WA 4K2RA 3QWXX 4FL2A 5HKWA 3KFJA 2J16A 1RQQC 4RH9A 1O4QA 2MRJA 4AZ1A 1Y57A 2YDUA 1SPSA 1A1AA 2PBNA 3D1QA 1YN9A 4JMJA 1XBOA 1R1SA 4JNBA 3CBLA 1U25A 2QBQA 1X27A 2NLKA 1KC2A 4ROJA 4Y14A 1AYCA 3M7FA 3QCEA 1A1BA 1D4WA 1I9TA 3O5XA 2I1YA 3V0HA 2I6OA 2IUGA 3PLFB 2VEVA 2L3TA 2Y1NA 5EEQA 5KA0A 4QSYA 1ONYA 3BKBA 1O4FA 1YGRA 2MRKA 3OB1B 1QG1E 2EYVA 1YPTA 1O4BA 4H1OA 1IS0A 4LUEA 5K23A 2ETZA 1ZZWA 5KADA 4GL9E 2PLEA 2HDXA 4K45A 2L6KA 4EY0A 2MBCA 1A1EA 5KA4A 1ONZA 1O47A 4R30A 2CFVA 2I6PA 3QCBA 2F6WA 2PTKA 2ZN7A 1JWOA 1A5YA 3AWFA 2HVLA 1O4HA 1FBVA 5AWXA 5J8RA 2DXPA 2B4UA 1AAXA 2E0TA 2DM0A 4BJOA 4K11A 3VRPA 3EB1A 1F2FA 3GXGA 1YGUA 5IBMA 4NWGA 2I4GA 2I42A 2FJNA 2Y2FA 1I9SA 1I57A 1Q6TA 2F6YA 3I80A 3B7OA 3QCCA 1NZVA 1O4OA 1O43A 1TZEE 1XA6A 2SRCA 5KAZA 3VS2A 4ICZA 1WCHA 5BZZA 1SHBA 1J4XA 3VRNA 3VS1A 1VHRA 3N8MA 4GRYA 1R6HA 3LJ8A 1XRIA 2RF6A 3BRHA 1YVHA 3MOZA 3QCKA 3ZM2A 1FBZA 1Y1UA 2BGEA 1LUMA 5KABA 1M61A 4U1PA 4GE5A 1MKPA 2G6ZA 2Y1MA 1GHUA 2H02A 1OEVA 2QBSA 3F99A 2XP1A 3GXHA 3QKPA 1O4PA 1YZ4A 2LQWA 2I3UA 1PXHA 1SKJA 4OHLA 5BX1A 2QDCA 3T04A 1RPMA 4QBEA 4KYQA 5GTJA 1OHCA 2NTAA 4HRFA 4JMKA 1HCSB 4GPLB 1AYBA 4RI4A 1O4GA 1T48A 1NZ7A 4P9VA 3U96A 2F6VA 1ZCLA 1CSYA 1BG1A 4NWFA 1KA6A 2H03A 3QWYA 3VS4A 1PTVA 1ZCKA 2PNAA 3AWEA 1G4US 1PH0A 2ESBA 5HKYA 2VIFA 4QUNA 3ZMQA 2A3KA 2CNFA 1A07A 3UYOA 4WWQA 1YVLA 2MC1A 2PNBA 4OHEA 5KAAA 3CWGA 1AOUF 4KYRA 1H9OA 5LXQB 3BUMB 1ECVA 2VEWA 3V0FA 5GJHA 2GSBA 1KAKA 3M4UA 2OUDA 1YFOA 2P4DA 3PSKA 3N7YA 3SR9A 5M43A 3ZV2A 3BUOB 1FMKA 1Z3KA 3VROA 3PFVA 1EEOA 3QCJA 4U17A 4EIHA 1D4TA 2DX0A 4I8NA 3HCKA 2GP0A 3BUNB 1QXKA 5BO4A 3F9AA 5IBSA 3OVEA 3D9CA 2OZ5A 3QCMA 3V0EA 3VS3A 2H4GA 2C0OA 3N0AA 2HNPA 3VRQA 1BHHA 2EYZA 1O42A 3QCNA 2QMSA 3A5JA 4YR8B 4DGXA 5J3XA 5EHRA 5KA1A 2EYYA 3VRYA 5K22A 1LARA 3VS6A 4Z6BA 1O49A 2C7SA 3IMJA 1TCEA 2PSZA 4GFUA 4HJPA 3VRRA 2RMXA 1BM2A 3BUXB 2Y96A 3MXCA 2DLZA 1EENA 3VS7A 2OZOA 1OETA 4GFVA 2Q05A 1G7FA 3QCLA 1LUIA 4WU3A 1G7GA 2AOAA 2LNWA 3D1HA 2Y3AB 2CM7A 2QDMA 2EO6A 3HHMB 1CWDL 3GXWA 2F6FA 1OEOX 1JF7A 2M3VA 2H46E 4E93A 1O4IA 2NT7A 3SMEA 1JU5A 1LCJA 3MXYA 2JJDA 2ECDA 1A09A 1PA9A 5DC0B 5HDEA 1O4RA 4GRZA 3OMHA 3QKQA 1BMBA 4TZIA 3F9BA 2LQNA 2H5KA 2HY3A 2H4KA 1PTYA 1YTSA 4J51A 1BZCA 4MBBA 2HMHA 3V0GA 3CWEA 5KA7A 2I4HA 1LYVA 3US4A 3CXLA 3VGOA 2L4KA 1OEMX 1BFJA 1O48A 2CMAA 2CNGA 4K44A 1RPYA 1A08A 1NWEA 1OESA 1BKMA 1LUKA 2C0IA 2FH7A 3D1OA 2HC2A 3VS0A 3S8OA 2HXPA 1X24A 4OHIA 3ZMPA 4L1BB 1BLJA 2Q47A 2HCMA 5EG3B 1T4JA 2B3OA 3GQIB 3UF4A 1CJ1A 1MW4A 2BGDA 2CM3A 2CMCA 1G83A 1YTWA 2F6TA 4GE6A 2K79B 1AB2A 4GE2A 3TKZA 1KA7A 3IN8A 2MQIA 3QCHA 3BUWB 2I6JA 2HCKA 1SHDA 2F71A 1O45A 4S0GA 1NL9A 1D1ZA 3S3EA 4X6SA 2QCTA 4D3PA 1GWZA 1OPKA 1L8GA 1D5RA 4RI5A 5EELA 1SHAA 1QADA 3ZNIA 3I36A 2G59A 1ZC0A 1A81A 1YTNA 1O4KA 1OO3A 4FL3A 3QCFA 2DLYA 4R0TA 3N84A 1FPRA 2GE9A 3QCDA 3MOWA 1IJRA 1F1WA 2PLDA 2J17A 1R1PA 2R0BA 4E68A 2RVFA 1BLKA 1PYNA 2AZRA 2IUHA 3HIZB 2I5XA 2VEUA 5AXIA 1FQ1A 4R0SA 3S3KA 1O4NA 4DGPA 2DVJA 1B47A 1BZHA 2B07A 2JYQA 1C86A 5K9VA 3S9KA 2OQ1A 2I75A 3S4OA 2CBLA 3BLUA 2FO0A 2ZMMA 4JBCA 4TVVA 1LCKA 4LUDA 2C46A 5D0JA 1Q6JA 5DC9A 3MAZA 2BIJA 4A4BA 4GS0A 4XZ0A 2DCRA 3IN7A 3PQZA 1PA1A 2GWOA 2QDPA 3CM3A 1RJAA 4JE4A 5HKZA 2CM8A 3OLRA 5K25A 1BKLA 3V0IA 2IUIA 2B4OA 3OV1A 1JYRA 1AYDA 1NZLA 2PI7A 3AWGA 3S3FA 3EU0A 1CWEA 3OP0A 3S8NA 1LQFA 5BZXA 2EO3A 1P13A 2AOBA 1UUSA 5CDWA 1LKKA 2FJMA 2CI8A 2J16B 3F41A 1X6CA 5KA2A 5KACA 5K24A 2B49A 4ERCA 2QCJA 1C84A 2LCTA 3RZ2A 1JYQA 2LNXA 2RORA 3S3HA 1AYAA 1FYRA 2RSYA 1U24A 4XZ1A 2AUGA 5DC4A 2OC3A 2IZVA 3NHNA 3PJPA 4H34A 1KAVA 1O4JA 2YSXA 3PSJA 2EU0A 2BV5A 2A8BA 5K9WA 4P9ZA 3MMJA 2BBUA 4PVGA 3S4EA 1R1QA 2EL8A 1HCTB 1G1FA 2CNEA 1CSZA 1BHHB 1I3ZA 4WU2A 1GFYA 2QEPA 3O4UA 4YAAA 4ZN5A 1FU6A 3NMEA 1O44A 1O46A 1XXVA 1G4WR 3PS5A 3O4TA 1M3GA 4RH5A 1WQUA 2H8HA 4NX8A 2VEYA 3EMUA 1UURA 1G1GA 1FHSA 4KI9A 4NYHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1PTTA 1C83A 3O3LA 3EAZA 2QBRA 3K2MA 4NNDA 2Y1OA 4QAPA 2CI9A 1OHEA 4PYHA 2CR4A 4BUCA 3VS5A 3D44A 1O41A 2H4VA 2B4PA 4D3QA 2H04A 3TL0A 2HNQA 2NT2A 3V0JA 4RDDA 1O4MA 1BFIA 1O4DA 1OPLA 1GRIA 1Q6SA 3EACA 1Q6NA 3RGOA 4F5BA 3S8LA 3VRZA 5I6VA 2F6ZA 2I4EA 1QCFA 1SPRA 2EOBA 4D3RA 4A4CA 3QCGA 4CVMA 1A1CA 3QCIA 1WAXA 2PT0A 3RO1A 1C88A 2HUWA 1WRMA 2HB1A 1O4CA 5MMZB 1Q6MA 3H2XA 4FBNA 3ZM0A 2IMGA 1BF5A 2EKXA 2HDVA 1PICA 1OO4A 1ZFPE 2KNOA 1K9AA 1JLNA 2F70A 1T49A 1NRVA 1JBVA 2VTDA 3D42A 1V3AA 4QBWA 4JGHA 1SUGA 4WOHA 4WTYA 2P6XA 3BLTA 1NO6A 2GJTA 3I7ZA 2SHPA 2YU7A 4QUMA 3ZM3A 1O4AA 3C7IA 2CRHA 5AULA 2CJZA 2WGPA 5KA9A 1BHFA 1LKLA 4RHGA 2MK2A 1OEUA 2KK6A 1FPZA 3OB2B 4M4ZA 1Q1MA 3V0DA 1KSWA 2FCIA 5GJIA 1E0DA 3A5KA 2F46A 1QZ0A 1AOTF 1FU5A 1U26A 2I6MA 2OOQA 1YWFA 4ZRTA 4IKCA 2B4SA 4D8KA 1AD5A 3O4SA 1O4EA 1BZJA 4CVLA 1G1HA 2PA5A 3EAXA 1O4LA 1NNYA 2NV5A 1C87A 1LUNA 5BUGA 1XM2A 3RGQA 3WA4A 4BPCA 3IMDA 3BM8A 5EHPA 2PQ5A 2C0TA 3EZZA 4F59A 4RKKA 1L8KA 2CMBA 1M27A 2HC1A 1RXDA 5KA8A 2CNIA 2VEXA 2AHSA 2NZ6A 2CNHA 4ZI4A 4GWFA 4OHHA 2CM2A 4HJQA 1NWLA 5KA3A 3CD3A 2BZLA 1P15A 2I3RA 1JYUA 2ABLA 2CIAA 3F81A 1XXPA 2K7AB 3ZM1A 5DF6A 2QBPA 4QAHA 1PTUA 1J6UA 2I6IA 1X0NA 4B04A 4UAGA 1MILA 2GC6A 1Q6PA 4JEGA 4OHDA 3GXXA 2CS0A 1C85A 1OHDA 4F5AA 4Y2EA 2C9WA 1UAGA 4K2RA 3QWXX 4FL2A 5HKWA 2WTZA 3KFJA 3HN7A 2J16A 1RQQC 4RH9A 1O4QA 2MRJA 4AZ1A 1Y57A 2YDUA 1SPSA 1A1AA 2VOSA 2PBNA 4C12A 3D1QA 1YN9A 4JMJA 1XBOA 1R1SA 4JNBA 3CBLA 1U25A 2QBQA 1GG4A 1X27A 2NLKA 1KC2A 4ROJA 4Y14A 1AYCA 3M7FA 3QCEA 1A1BA 1D4WA 1I9TA 3O5XA 2I1YA 3V0HA 2I6OA 2IUGA 3PLFB 2VEVA 2L3TA 2Y1NA 5EEQA 5KA0A 4QSYA 1ONYA 3BKBA 1O4FA 1YGRA 2MRKA 3OB1B 1QG1E 4HV4A 2EYVA 4QDIA 1YPTA 1O4BA 1FGSA 4H1OA 1IS0A 4LUEA 5K23A 2ETZA 1ZZWA 5KADA 4GL9E 2PLEA 2HDXA 4K45A 2L6KA 4EY0A 2MBCA 1A1EA 5KA4A 1ONZA 1O47A 4R30A 2CFVA 2I6PA 3QCBA 2F6WA 2PTKA 2ZN7A 3K2TA 1JWOA 1A5YA 3AWFA 2HVLA 1O4HA 1FBVA 5AWXA 5J8RA 2DXPA 2B4UA 1AAXA 2E0TA 2DM0A 4BJOA 4K11A 3VRPA 3EB1A 1F2FA 3GXGA 1YGUA 3LK7A 5IBMA 4NWGA 2I4GA 2I42A 2FJNA 2Y2FA 1I9SA 1I57A 3NRSA 1Q6TA 2F6YA 3I80A 3B7OA 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 1GFY A;  2QEP A;  3O4U A;  4YAA A;  4ZN5 A;  1FU6 A;  3NME A;  1O44 A;  1O46 A;  1XXV A;  1G4W R;  3PS5 A;  3O4T A;  1M3G A;  4RH5 A;  1WQU A;  2H8H A;  4NX8 A;  2VEY A;  3EMU A;  1UUR A;  1G1G A;  1FHS A;  4KI9 A;  4NYH A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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