4NWHA

Lysozyme under 30 bar pressure of xenon
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title Crystallographic Studies with Xenon and Nitrous Oxide Provide Evidence for Protein-dependent Processes in the Mechanisms of General Anesthesia
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4nwhA00
2BQAA 2D4KA 1HNLA 1P2CC 2W1LA 5DM9A 1IOSA 4WM2A 4FJRA 4DT3A 1B5YA 1B2KA 3FE0A 1REXA 1VFBC 5I5QA 5L9JA 4NGZA 2X0AA 1W6ZA 1GE3A 1LSCA 4J1AA 4WG1A 1HMKA 2DQJY 2F4AA 1B0DA 4BADA 2MEDA 1OUHA 3A67Y 4WLYA 5KXLA 5KKJA 1G7HC 4H9AA 4NGIA 1QIOA 2ZIJA 4NHIA 2LZ2A 2XBRA 3LHMA 1SQ2L 1GF8A 4LT1A 4OOTA 1LZ6A 1NWGA 4X3BA 5D5FA 1FDLY 2HEBA 1EQEA 1B7QA 1IVMA 1DPWA 1LHKA 1OP9B 1W08A 1WVVA 4NFVA 4ETCA 1BB7A 4LT2A 3WU9A 4RLMA 1BVXA 1JEFA 1D0MA 1HEPA 153LA 4DC4A 1LSPA 3A34A 1INUA 3OK0A 1UIDA 1B7RA 4R6CA 4XJHA 4IATA 3AGIA 4ETDA 1B7OA 5HMVA 2DQFC 1B5XA 1WTNA 1F0WA 1IP4A 2RSCA 3LZTA 3SP3A 1LZDA 1TBYA 1G7LC 4KPMA 5B06A 2NWDX 4HTQA 2HEEA 1DI3A 5FSTA 1UBZA 5IELA 1IWVA 5C6JA 1GPQC 4LYBA 5KXYA 2N5ZA 4Z46A 4LZTA 5APFA 2AUBA 3RU5A 5LVGA 1WQQA 4MR1A 4TX7A 5B1FA 5LAGA 2C8OA 1DXJA 4WM5A 2MEBA 1BB3A 3GXRA 3WULA 1C7PA 4H8YA 3EBAB 1OUBA 3A93A 4NGLA 2BQLA 1F10A 3CT0A 4C3WA 3EMSA 8LYZA 1E8LA 1B7LA 1GD6A 1B7PA 1B5UA 1QTEA 4G4BA 1B5ZA 1IWYA 4C5FA 4QGZA 1GE1A 1XGQC 3E3DA 207LA 3CT1A 4OWEA 1LJIA 2D91A 4DD0A 3LYOA 4H90A 4IJ4A 1JJ1A 2DQEY 2YBHA 1CNSA 4KXIA 4NEBA 2LHMA 1KXYA 4LYMA 3WXUA 4WG7A 1LSMA 1HC0A 1YAOA 3A6CY 2W1YA 4ETAA 5HMJA 1QTKA 1HERA 3P68A 2HUBA 1H6MA 4N5RA 1XGRC 4I0CA 1XEIA 4LT3A 4DD3A 1LMTA 1LCNA 1DI4A 1LSFA 3WU7A 5KXTA 1GFEA 1JTPL 1IWTA 1BWHA 1LMQA 1QDTA 2ZYCA 1TAYA 2D6BA 3B6LA 194LA 2H5ZA 4YM8A 1GB5A 2Z2EA 4HJYA 4XJDA 208LA 1C46A 4QY9A 2FBDA 1BB5A 2I26L 4J0LA 1LPIA 1XGTC 4E3UA 1JSEA 2PC2A 1EQ5A 4RW2A 2ZWBA 3WPLA 4AGAA 193LA 3P65A 3TXGA 4G4CA 5KXNA 4HP0A 4N1EI 3EO5A 4RDSA 4XJIA 1YKZX 2HTXA 4B4JA 1GB0A 1VDSA 2DQIY 1EQ4A 1DQJC 1JKAA 1XSFA 2I25L 4ET8A 4XENA 4ETBA 1KXXA 5AMYA 1GB7A 1NMMA 4LYZA 5HNLA 5L3HA 3LZ2A 3G3AB 2BQKA 1LKSA 1IIZA 2MEIA 1UICA 1B9OA 2YBNA 4NG1A 3T36A 1YL0X 3TXBA 1GFVA 3HBEX 3M3UA 2YBMA 4WM6A 4DYGA 1XFPL 3M18B 4GCDA 3B0IA 1PS5A 1IP3A 4G9SA 1HHLA 2LZTA 3A96A 5IHGA 3B0KA 4WO6A 1D0KA 4ML7A 1IR8A 4HSFA 2C8PA 4WM3A 4G49A 4HV1A 4B4EA 2CDSA 4NHPA 1LJ3A 1IOQA 4N1CC 5F14A 3CQLA 1LZRA 1GF7A 1KXWA 3A6BY 1G7IC 1JJ0A 4H9IA 1B7SA 1UIEA 1OUJA 4YOPA 1LZAA 2Z39A 1PZYA 2BLYA 1OUAA 5LVJA 3TMVA 4ZIXA 1IWUA 3W6FA 1GB9A 1GAZA 1IORA 2LYMA 3AZ7A 4RLNA 2BPUA 3J6KA 4XJGA 4NWHA 1HFXA 1IX0A 1J1PY 3TMXA 1QUTA 1HSWA 1LHHA 1CKDA 2BQEA 1GE4A 4WMGA 2EIZC 2Z18A 5F9XA 1UCOA 1A2YC 5KXOA 4OWAA 4XN6A 3TXFA 4Z3MA 1LOZA 1IP1A 1J1XY 1V7TA 2MEAA 2ZQ4A 4HPIA 5E9RA 5I53A 4NGVA 1LMNA 1GEVA 4NY5A 4II8A 1JJ3A 3A8ZA 1LYOA 3AGGG 4NHTA 4BAFA 4OOOA 2FBBA 1I20A 4O34A 5DN5A 1GF3A 4XJBA 4H8ZA 4J1BA 4LFPA 4PRUA 4B1AA 1JPOA 2MEGA 1JISA 1GBSA 1AT6A 2YBIA 3W3EA 2YBJA 3WUAA 4CFPA 4DWXA 5KXWA 1JHLA 1ZV5L 5B1GA 5KXSA 1YAQA 2DQGY 1C45A 1HFZA 1UA6Y 4H9BA 4KL7A 2HU1A 2ZNWY 1NBYC 1LSBA 4NIJA 1MLCE 1YIKA 1YKYX 3F6ZA 5HNCA 4WM4A 3LN2A 1JTOL 2G4NA 3RW8A 1BHZA 3WXTA 6LYZA 1V7SA 3A90A 2A7DA 4OWBA 1LJNA 3MGWA 5M1YA 1LZ5A 3VWOA 5JENB 2MEHA 1VAUA 2HECA 3K3TA 1NBZC 4H93A 3TXIA 3WPJA 1LHIA 1BVKC 1LMPA 1UIGA 4LFXA 4XJFA 3IJUA 4PRQA 3A95A 1B7NA 2YVBA 1LJGA 5LVIA 2BLXA 2ZQ3A 4NSIA 2BQIA 1CKFA 1LZ9A 2EQLA 1LAAA 2H9KA 1ZVYB 1C10A 4P2EA 4BS7A 4DD1A 1LJFA 4OWHA 4UWNA 4IASA 4NWEA 7LYZA 3WYHA 1GXV2 1YANA 1UIBA 3AZ4A 1DPXA 4A7DA 5J7CA 1QSWA 1WQRA 4H1PA 2Z19A 4HJZA 2BQDA 3HFMY 1GBXA 4HJVA 1WQNA 2LYZA 2XJWA 4RW1A 3AZ6A 5FCPA 1GWDA 2FYDA 1IWXA 1LYZA 1IOTA 1GXXA 1LJKA 4H9FA 4CJ2A 5I4YA 4UWVA 4M4OA 135LA 1LMCA 1LHMA 1SLYA 2ZIKA 1AM7A 1CJ8A 1XGPC 1BWJA 1LSNA 4W94A 1HEOA 5LA5A 3QNGA 2I6ZA 4TUNA 3TXHA 4GCEA 1GB2A 5KXRA 4B49A 1UIAA 1LMAA 1BQLY 1XEJA 1YROA 1IO5A 3AYQA 5KXZA 1IP6A 2CJLA 3T6UA 1UIHA 1B5WA 1LJ4A 2GV0A 5K7OA 2IHLA 2Z12A 2CGIA 6LYTA 1YL1X 4QEQA 5LVHA 5DN4A 1GAYA 4GLVA 1AT5A 5II3A 1HEMA 134LA 4DD7A 1JUGA 1F6SA 3WW6A 1LJHA 4KT3A 1IY3A 2BQGA 2IFFY 2BAAA 4GCFA 1CJ7A 1LJEA 2W1XA 1TDYA 4Z41A 1QSAA 3N9AA 2MECA 4J7VA 1GF0A 3EXDA 4WLXA 4M6DA 3QE8A 1LJJA 5LYTA 5LA8A 5KKIA 4B4IA 2HEFA 1ZVHL 2DQDY 1D6QA 2BQOA 5I4XA 1LZYA 5T3FA 1REZA 1HF4A 3BKVA 2LYOA 1OUGA 1TEWA 1VDTA 4HPEA 4DD2A 2Q0MX 1VATA 3WVXA 5KY1A 1KIQC 1T6VL 1BWIA 1LZGA 2D4JA 1YILA 3N9EA 1LZEA 1UUZC 3IWRA 1LKRA 3N9CA 4QDNA 1GF9A 1FLWA 1C08C 1NHEA 1BB4A 2XTHA 3W6CA 1GFHA 3AB6A 2BQFA 2F2NA 1O23A 2BQNA 3A3RX 3QY4A 4GLAA 4WOAA 4NGJA 4D9ZA 5I54A 4TTDA 4DDAA 4WO9A 4CHXA 3WU8A 4DDCA 4EOFA 1UC0A 1B5VA 1CJ9A 1OUDA 2G4PA 5IDDA 1IWWA 3D9AC 5ILCA 4HTNA 1LSYA 4NG8A 3A94A 3P66A 5LYMA 1VEDA 1IWZA 1JSFA 1D6PA 1GHLA 1NDGC 3TMWA 1HEQA 1JWRA 3WH1A 4ZFPA 1FLUA 1LZ1A 1RE2A 132LA 4ANRA 1G7MC 4N8ZA 4R0FA 1GBWA 2DKVA 5KXPA 4H8XA 4GN4A 1GBOA 1WQMA 5B07A 4G4HA 1CJ6A 3A3QA 2D4IA 3WPKA 1KIRC 1IR7A 2VB1A 1GB3A 4YEOA 2CWIA 2W1MA 2ZILA 1WVUA 5L3IA 1RFPA 4LYTA 1JKBA 3ULRA 1IY4A 4FDYA 2FYCA 1FLQA 1LSDA 3CT5A 5E4PA 5LVKA 1QQYA 1GE2A 1YAMA 1AKIA 4H9CA 5A3EA 1LMOA 1LZBA 2H9JA 2A7FA 3ZEKA 1EL1A 4H91A 3RZ4A 1JITA 1OUIA 5HLLA 2DQCY 3W6AA 1VDQA 5LINA 1GBYA 1LZTA 1C43A 3GXKA 4L41A 4GCBA 4LYOA 4H9HA 5I4WA 1FKQA 1CKGA 3TXJA 2Y8PA 1JKDA 5APCA 1CKHA 5EBHA 4LGKA 2BQCA 3ATOA 1BB6A 3FI7A 2B5ZA 4NSHA 1GFKA 3B72A 4Z98A 1OUCA 4W96A 133LA 1FKVA 3P64A 4UWUA 5KXMA 3TMUA 1GFGA 3CB7A 1IC4Y 3J4GA 5DL9A 5B59A 1LZCA 2Z38A 4ZEEA 2BQBA 2DQHY 1G7JC 1DKJA 4PJ2C 1IP5A 1OUEA 4NHQA 5LAFA 1H87A 3WL2A 1GF6A 1LZNA 1TCYA 3RNXA 5FHWA 1RI8B 4PGJB 4NGYA 1IP2A 1GFJA 4LT0A 1I56A 4PPOA 1ALCA 2BQJA 1DI5A 1GF5A 1GFUA 1T3PA 1LHJA 1LTMA 1IEEA 1LSZA 1JTTL 1IC5Y 5FDJA 4WL7A 5LIOA 4CGEA 2BQMA 3W6BA 1LSGA 1HSXA 2EKSC 1GE0A 2G4QA 4DD9A 1LZ8A 3RT5X 1GB6A 3AGHA 3ZVQA 5C6IA 2MEFA 2BQHA 1GEZA 3LYZA 4N0JA 4NSGA 5D5CA 4H92A 4YENA 3P4ZA 1B7MA 4DDBA 4YF2A 1OUFA 4U3XB 4H94A 1AZFA 1YAPA 3B0OA 2F4GA 4EMNA 4WLDA 4CFOA 3CSQA 5KXKA 1GFRA 1I1ZA 2EPEA 1GFTA 3LYMA 1LZ4A 4NHSA 1JIYA 1YQVY 5LYZA 1JKCA 2Z2FA 4MSTA 1LHLA 5A3ZA 4NGOA 1HMLA 1KIPC 5HQ1A 1XGUC 2HU3A 1GBZA 1NQIA 4AXTA 5KJ9A 1HELA 1QDRA 1UACY 3LYTA 4NGWA 1F6RA 4XADA 2Z37A 5F81A 3AW6A 3WUNA 1HENA 2YSSC 3AW7A 5C6LA 2XBSA 154LA 3KAMA 1WQPA 5KXXA 1RJCB 4BAPA 1NKHA 1YKXX 2WARA 2ZNXY 3TXKA 1IOCA 4LYCA 1GDXA 1ZMYL 1DZBX 3WVYA 2DBTA 3G3BB 3CSRA 1A4VA 1LYYA 1GFAA 3HBHA 1FBIX 4PHIA 5F9UA 3W6DA 9LYZA 1VDPA 2DQAA 3BKHA 3A92A 4I8SA 1NDMC 1NF5A 2HEAA 4N9RA 4ET9A 1WTMA 3WW5A 3AZ5A 4GCCA 3WMKA 3HBDA 2ZYPA 5DLAA 1IC7Y 1HEWA 1LSEA 3W6EA 5F16A 4B0DA 2F30A 2HEDA 4TSBA 1QUSA 1BGIA 1DKKA 4HV2A 5APDA 4YEMA 3CSZA 1GB8A 4WLTA 5APEA 1D9UA 3D3DA 1GF4A 1FN5A 1HFYA 4MCKA 4OW1A 1D0LA 3TXDA 1GDWA 1LSAA 1UIFA 4NGKA 4TSCA 3WUMA 4GN3A 1CKCA 4GN5C 4XYYA 4H9EA 5ILFA 5FEKA 5B05A 1IP7A 3AJNA 1LYSA 1FLYA 3ATNA 1RCMA 4NSJA 1N4FA 2MEEA 4TWSA 3ZVQB 5LXWA 4WM1A 1REYA 1REMA 2YDGA 3TXEA 2YBLA 4HTKA 1XEKA 1OQMA 4ETEA 1J1OY 3OJPA 4OWCA 5FELA 1IR9A 1MELL 1Z55A 1WQOA 3IJVA 4WL6A 1LZSA 3A91A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1P2CC 4WM2A 4LDLA 4DT3A 1PQJA 5L9JA 1VFBC 5I5QA 2X0AA 1W6ZA 4WG1A 1HMKA 4PK0A 4BADA 3A67Y 5KXLA 1G7HC 4H9AA 4NGIA 184LA 4NHIA 2QARC 1SQ2L 223LA 1LZ6A 1FDLY 1LHKA 1JEFA 1INUA 4R6CA 5HMVA 2DQFC 1WTNA 2OE4X 2RSCA 3LZTA 1LZDA 1G7LC 2NWDX 1L96A 4HTQA 1DI3A 5IELA 2O4WA 5KXYA 1CU0A 3RU5A 1L57A 1D9WA 3FI5A 2Q9EA 1L10A 1GD6A 4C5FA 4W56A 1CV1A 2D91A 4DD0A 3GUIA 2YBHA 3WXUA 3A6CY 4DD3A 1EPYA 1L95A 1C63A 1L22A 1L15A 5KXTA 3EMLA 1QS9A 1L37A 1GB5A 4HJYA 4XJDA 1C46A 2FBDA 1KW5A 2I26L 2B70A 4W55A 1OVHA 228LA 4RW2A 193LA 3P65A 5KXNA 4HP0A 3RZEA 1L62A 249LA 1L73A 1YKZX 4B4JA 1XSFA 4ETBA 1KXXA 1NMMA 4LYZA 5HNLA 5L3HA 3LZ2A 1LKSA 2MEIA 3T36A 1YL0X 1P2RA 1ZWNA 3M18B 4GCDA 3B0IA 1KY1A 1QT8A 4WO6A 1D0KA 2C8PA 164LA 4G49A 1L20A 2CDSA 4I7NA 1LZRA 1G7IC 1B7SA 1UIEA 198LA 1PZYA 2BLYA 167LA 4ZIXA 1IWUA 1CV3A 1GB9A 1KS3A 3AZ7A 4RLNA 2BPUA 1IX0A 4DKLA 2OE7X 1GE4A 3DN0A 5F9XA 1QTHA 5KXOA 1IP1A 2MEAA 3JR6A 4NGVA 1LYOA 4OOOA 1I20A 4ARJA 4XJBA 3HUAA 4H8ZA 4J1BA 4EJ4A 1JPOA 4DWXA 2YBJA 237LA 3L2XA 1P36A 4KL7A 5HNCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2BQA A;  2D4K A;  1HNL A;  1P2C C;  2W1L A;  5DM9 A;  1IOS A;  4WM2 A;  4FJR A;  4DT3 A;  1B5Y A;  1B2K A;  3FE0 A;  1REX A;  1VFB C;  5I5Q A;  5L9J A;  4NGZ A;  2X0A A;  1W6Z A;  1GE3 A;  1LSC A;  4J1A A;  4WG1 A;  1HMK A;  2DQJ Y;  2F4A A;  1B0D A;  4BAD A;  2MED A;  1OUH A;  3A67 Y;  4WLY A;  5KXL A;  5KKJ A;  1G7H C;  4H9A A;  4NGI A;  1QIO A;  2ZIJ A;  4NHI A;  2LZ2 A;  2XBR A;  3LHM A;  1SQ2 L;  1GF8 A;  4LT1 A;  4OOT A;  1LZ6 A;  1NWG A;  4X3B A;  5D5F A;  1FDL Y;  2HEB A;  1EQE A;  1B7Q A;  1IVM A;  1DPW A;  1LHK A;  1OP9 B;  1W08 A;  1WVV A;  4NFV A;  4ETC A;  1BB7 A;  4LT2 A;  3WU9 A;  4RLM A;  1BVX A;  1JEF A;  1D0M A;  1HEP A;  153L A;  4DC4 A;  1LSP A;  3A34 A;  1INU A;  3OK0 A;  1UID A;  1B7R A;  4R6C A;  4XJH A;  4IAT A;  3AGI A;  4ETD A;  1B7O A;  5HMV A;  2DQF C;  1B5X A;  1WTN A;  1F0W A;  1IP4 A;  2RSC A;  3LZT A;  3SP3 A;  1LZD A;  1TBY A;  1G7L C;  4KPM A;  5B06 A;  2NWD X;  4HTQ A;  2HEE A;  1DI3 A;  5FST A;  1UBZ A;  5IEL A;  1IWV A;  5C6J A;  1GPQ C;  4LYB A;  5KXY A; 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 1HML A;  1KIP C;  5HQ1 A;  1XGU C;  2HU3 A;  1GBZ A;  1NQI A;  4AXT A;  5KJ9 A;  1HEL A;  1QDR A;  1UAC Y;  3LYT A;  4NGW A;  1F6R A;  4XAD A;  2Z37 A;  5F81 A;  3AW6 A;  3WUN A;  1HEN A;  2YSS C;  3AW7 A;  5C6L A;  2XBS A;  154L A;  3KAM A;  1WQP A;  5KXX A;  1RJC B;  4BAP A;  1NKH A;  1YKX X;  2WAR A;  2ZNX Y;  3TXK A;  1IOC A;  4LYC A;  1GDX A;  1ZMY L;  1DZB X;  3WVY A;  2DBT A;  3G3B B;  3CSR A;  1A4V A;  1LYY A;  1GFA A;  3HBH A;  1FBI X;  4PHI A;  5F9U A;  3W6D A;  9LYZ A;  1VDP A;  2DQA A;  3BKH A;  3A92 A;  4I8S A;  1NDM C;  1NF5 A;  2HEA A;  4N9R A;  4ET9 A;  1WTM A;  3WW5 A;  3AZ5 A;  4GCC A;  3WMK A;  3HBD A;  2ZYP A;  5DLA A;  1IC7 Y;  1HEW A;  1LSE A;  3W6E A;  5F16 A;  4B0D A;  2F30 A;  2HED A;  4TSB A;  1QUS A;  1BGI A;  1DKK A;  4HV2 A;  5APD A;  4YEM A;  3CSZ A;  1GB8 A;  4WLT A;  5APE A;  1D9U A;  3D3D A;  1GF4 A;  1FN5 A;  1HFY A;  4MCK A;  4OW1 A;  1D0L A;  3TXD A;  1GDW A;  1LSA A;  1UIF A;  4NGK A;  4TSC A;  3WUM A;  4GN3 A;  1CKC A;  4GN5 C;  4XYY A;  4H9E A;  5ILF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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