4O0Z | Genus

Total Genus 168

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	168
sequence length	480
structure length	471
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structural and biochemical analyses of the catalysis and potency impact of inhibitor phosphoribosylation by human nicotinamide phosphoribosyltransferase. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	168
structure length	471
sequence length	480
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2013-12-14

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4o0zA02

2YSWA 3CU2A 1DORA 1W3NA 4MFEA 3S5YA 4LC8A 2DZWA 4GUGA 4NNBA 5FEZA 3VNDA 1RPXA 1W8SA 3HPXA 3MHFA 1HO1A 4HIBA 4KFOA 2J9ZA 3W83A 4MFDA 3G1YA 5EBUA 4FX6M 4G1KA 3PB2A 3S9YA 3LBCA 2PRMA 4RZ4A 4A21A 3GLCA 1H7XA 2J27A 4QAIA 3B8DA 4JYDA 4NQ1A 3C2OA 4ZL1A 4H3DA 2B4GA 4LVDA 1SZNA 5AFDA 2B7PA 3TIMA 5A8GA 2P0OA 4QSHA 1MEWA 1OABA 3TQ0A 3DFSA 1ME9A 5D2WA 5C55A 5KZDA 3W9ZA 3TXVA 2NX9A 5G2WA 2NXHA 1GWJA 4NVTA 1S5VA 5AB3A 5K9CA 5KMYA 1KM4A 4JY9A 2CWNA 2QCMA 5AHEA 3P61A 3G24A 5D2VA 2CZ5A 1Z42A 1MZHA 1KA9F 4UFMA 3WJYA 4ICNA 4BK9A 4LT9A 1FBAA 3W76A 3FKKA 1GTHA 1XI3A 4FNPA 4X9SA 5HJLA 2QDGA 4FEZA 3M47A 4NJGA 1TRDA 5HR6A 4MYXA 3NQFA 4UTJA 2VFIA 2PRLA 3GAYA 4Z1AA 2PRHA 5DCBA 4O53A 3EX3A 4UTIA 5HQEA 3TR2A 5TBOA 2B7QA 2YDAA 1QFEA 3PUDA 3NPWA 1WOAA 3UWVA 2J6XA 2QCHA 3L0GA 4FNQA 3BPWA 4CCCA 1Q6OA 1L2UA 3NL6A 3P84A 1R2SA 1YDNA 1BWLA 3P80A 2ZZ7A 4PL1A 1NSJA 1L6YA 4BR1A 1SFLA 3GNNA 5D2TA 3KXQA 1KBJA 3HPSA 1IIGA 3C6CA 4QJ1A 1OYBA 2DJLA 3GZ3A 3PB0A 2ISSA 3C4UA 3LLFA 4K7VA 5G1YA 1GVFA 4FIRA 1C29A 4LV9A 5BRBA 3L0KA 3CEUA 2ZCGA 3DZ1A 2QF7A 1LCOA 2CLFA 5CPMA 2J9YA 3W7DA 1G7VA 2H8ZA 3UWWA 4A22A 3G1VA 3TX9A 1IXOA 1O60A 1GG0A 3DGRA 1H7PA 3BW3A 5F4XA 1LOLA 3BO9A 3M7WA 1I2QA 2NXGA 2E09A 2QUUA 4Z1DA 4KFPA 4OU1A 2R91A 3GDMA 4HT3A 4O0KA 5K9XA 3T7VA 4FO4A 5KTLA 3T55A 1S3HA 4KFNA 2X16A 1TQXA 4UNLA 3HMJG 2TPSA 1WX0A 4MOZA 1JUBA 3QYQA 1ZNNA 3LRLA 4LU0A 4POCA 3ZR4A 4YMZA 4E2BA 1YXDA 1W56A 1YXYA 3ZWTA 1NF0A 3BLIA 4H6KA 1PCKA 4GXMA 3W7MA 1X7FA 1VC4A 4M5PA 4O0ZA 2BLEA 1SO3A 3TA6A 1TO3A 4P61A 1YPFA 1PCWA 2Y88A 4Z1BA 3E12A 3QQ1A 4IOTA 4DO6A 3MHGA 2H8XA 5EMUA 4WY0B 2D73A 3MP5A 2ZZ1A 3MP3A 2CLMA 3O6CA 4GRSA 1D9EA 1K7FA 1LOSA 3PWAA 3M0ZA 2DP3A 2RH9A 2AQWA 1IXQA 1HFBA 4WY0A 3NQ6A 5I3FA 3O6DA 1IF2A 3DFOA 2JGYA 3THAA 3LM7A 1L6WA 1A5AA 2QCFA 1LDCA 3B03A 3UWYA 2XN0A 3TE9A 1SPQA 3MI3A 4QM1A 4K38A 3FFSA 1H1ZA 3GNDA 3O8AA 1YYAA 3FJ6A 3JRKA 1RD5A 3R13A 1VJIA 1HUVA 3UPWA 1KM2A 4WJEA 3EXTA 3PVFA 1EP3A 1SO4A 2E6AA 3A5VA 1X8FA 3BGGA 2ZRXA 3PAJA 4CQ8A 4M6QA 1EWDA 3G8RA 1HG3A 1VHCA 3W7EA 2J24A 2P1FA 2CZEA 2JBMA 2QAPA 4ZQNA 2CU0A 2C3ZA 2FPVA 1P1XA 2YFNA 5EL1A 2EPHA 3I7QA 3M5YA 3O16A 4RR4A 1AMKA 5AHIA 2EHHA 4N02A 1JCNA 2YX0A 1QPNA 4GWEA 3PG8A 3QPZA 3VI2A 3EEGA 2FLIA 3CT7A 1ZY9A 2ZZ3A 4PTNA 3QC3A 4Q4KA 2PC4A 3KFTA 1W54A 3MJYA 2CFFA 3NQMA 3LHZA 4MY1A 3TU9A 2OZ0A 3SIZA 4WUIA 1I2NA 3EXRA 4Y9AA 4XBKA 3CM4A 4I7WA 2AAMA 2NWRA 1H61A 3RLVA 3NQ2A 5AHLA 5HUOA 3GXNA 3P8IA 5C54A 2YZRA 1QO5A 1KM5A 2OCZA 3C2EA 5T26A 4UTKA 3W1LA 3VKJA 1I45A 3LXCA 1VCVA 1I2OA 4ADUA 2B7NA 3D0CA 1IGSA 1TPC1 1RQEA 1WBHA 1A53A 2A6LA 3A5FA 5HWMA 4IPIA 5LKYA 4IGHA 3C2VA 4QIUA 4FXRA 1RVGA 4ZZ9A 1ALDA 4O19A 4Z1CA 4GC4A 1N55A 1TPFA 2FFCA 3S5ZA 5D38A 1AG1O 1ICPA 4EF9A 3QF0A 5L6UA 1LZOA 2WNNA 3G0SA 3EKZA 4WXYA 4FF7A 2W0UA 2V9DA 3SFKA 1TTIA 3Q37A 4EVZA 4OWGA 1XBZA 2A4AA 3B06A 5DXYA 1B3OA 3W2UA 1YLVA 3HB9A 1DQXA 1TTJA 4WY0F 3LHTA 3HGOA 4O52A 1XXXA 4O16A 2EKCA 4JX6A 4N9BA 2R8WA 1TCDA 3W1MA 2VFDA 3NQAA 3QMRA 4FNUA 1M6JA 3IGXA 3O15A 3LTPA 4OE7A 3BARA 4X3ZA 5BOOA 2GQ9A 1WYIA 3HGSA 1WQ5A 3L9CA 2YR1A 1KM1A 2F84A 3P82A 5FF0A 1DQWA 3K30A 4JGDA 3M5XA 1SUXA 1LBFA 3G1DA 1K8XA 1GVRA 1OF8A 2XFWA 1PVNA 5D04C 3G3DA 3MWAA 4IJBA 1GYLA 3UQNA 2Y7DA 1PS9A 1YADA 3WFAA 5AC7A 4UTHA 3B0PA 2EF9A 3T78A 5D32A 3TJLA 5D03A 2X1UA 1KTBA 1H7NA 3TDFA 5MHBA 1EX5A 1FDZA 5AHMA 4OV9A 2A7PA 4FNRA 2Z6JA 3LCLA 4O1BA 4HKPA 1H1YA 4ZQCA 4K36A 4UFKA 1SW7A 2BWGA 2BSLA 3W1QA 1FUYA 3G3MA 5AHFA 4O1CA 2ZTJA 2CLOA 3QM3A 4O4WA 3NDOA 3R8RA 3RFAA 4RXFA 4MIMA 5DLCA 2OJPA 3G1FA 4HNNA 3NNTA 3WK0A 1FCVA 1DOSA 3KVJA 1GOXA 5TIMA 3ABOA 2J88A 2E6FA 3LCFA 1UJPA 3AO0A 5D37A 2TRSA 3N3MA 1KM6A 3P67A 5KINA 4S2BA 1MEHA 1K8YA 4E38A 2YYUA 2HS6A 2CLHA 2VEIA 3NVTA 3QSRA 5KZMA 3NL5A 3A22A 3YPIA 1B4KA 1HO4A 5HMSA 1U5JA 3CIXA 4K37A 1G4EA 3PBYA 1DJNA 3TNOA 3KX6A 4A3UA 1FQ0A 1VRDA 3KHJA 3F1QA 3GXTA 1UASA 4TMCA 2QCDB 3NM1A 4UTUA 3W7OA 1JQXA 2HSAA 3GDLA 4O54A 3LCHA 2PURA 4XUGA 4ALDA 3N9RA 4EF8A 4MZ8A 5DBTA 1LORA 4WOQA 4WX2A 5LHFA 3LBMA 1KTCA 2QCDA 3W74A 5AN7A 3OG3A 2ZRUA 3L65A 4M19A 3KOFA 5G4WA 5FEWA 4LVFA 3B0UX 1XBYA 4HPXA 4N6EA 2RHGA 3HBLA 3S1VA 3GVGA 4UIOA 3DKJA 4CLMA 1N7KA 5E1QA 3S5OA 1YTEA 4I9AA 4MKNA 1OJXA 5SWUA 2ALDA 1VGAA 2VEPA 2GUUA 1WA3A 4HSNA 3TQVA 4KKXA 3F03K 1A5CA 4JTTA 1VZWA 3OVRA 5HWJA 4TIMA 4AHOA 1FWTA 3NL3A 1H63A 2OT0A 2TSYA 4NZFA 4O18A 3W2LA 1I2RA 3FYPA 3F4WA 1BKSA 5D2YA 1OFQA 3W2JA 1T8XA 4YCOA 4BFAA 2W6RA 1RZMA 1XDMA 4JY8A 2C1HA 4UFJA 3EB2A 3W1TA 2QCGA 1WAUA 1Y0EA 4MZYA 1ZENA 3P5YA 2Z2UA 3NGJA 3UZJA 1W0MA 3BW2A 4K8HA 5H2ZA 1EB3A 2WNZA 3FA5A 5F4WA 4O28A 1QWGA 2HTMA 4ADTA 4LUJA 4QISA 4M7SA 3AJXA 1W5MA 2WO5A 3ABRA 3S8HA 3P60A 3GKAA 3W2MA 2QCCA 1DBTA 3QPYA 4UCGA 3V75A 2E68A 7TIMA 2Y63A 3W7GA 1TMHA 2A7NA 1TV8A 1M5WA 3IRDA 3PULA 4JEQA 2DZXA 4Y90A 3NQVA 3KVKA 2NV1A 2VOMA 2V0TA 5HULA 3RNDA 4AWUA 4UTWC 5G2HA 1TPB1 4N9DA 1J4EA 2E5CA 1KV5A 4RZ6A 3W7IA 1RR2A 2E6DA 1MSSA 4O57A 3ELFA 2C14A 5DN1A 3CEPA 5G2IA 3NAVA 1EA0A 3UY7A 5EPDA 2JKAA 1OFRA 1ICSA 3BG3A 4NJKA 2YYTA 4FHAA 4ADSA 1ZCOA 3MW7A 1P5BA 2WSQA 1L9WA 2B0MA 3NYZA 1AL7A 5FF2A 5L9FA 1OFOA 3IV3A 3U8GA 5TQLA 1KFLA 4LVBA 3DI0A 1CI1A 3L5MA 3IIVA 3E02A 1GYNA 1XL9A 1TTQA 4JD4A 3G1XA 3LRMA 4E2DA 1UB3A 4IMDA 1GTEA 3VE7A 1R2TA 3PG9A 1I8JA 1U83A 5FF3A 3LRKA 1FDYA 3LV6A 1W5QA 2NUXA 2V8ZA 2VFGA 1FCQA 1ONRA 3MO7A 4M7TA 2AGKA 5J5RA 3LV5A 1A5BA 2CLLA 4IMGA 4O1AA 2ZDRA 1KM0A 1LROA 2FTPA 1FWRA 4JR5A 4PH6A 1XDLA 3DXIA 4CCEA 2QCNA 2YXGA 1P0NA 3W75A 2YCEA 5CKSA 3TW6A 4HNUA 3DHFA 1H5YA 1JQVA 1JULA 1NF7A 2XN2A 3BVJA 3M44A 5CPOA 2QEZA 4DF0A 2FJKA 4RLIA 3IIXA 3H54A 3W2KA 1TB3A 3CB8A 2V2CA 1OFAA 3C61A 3BG5A 3G0UA 3PBUA 4AWTA 5IBXA 4JYFA 4L4LA 1YTDA 3EWYA 4UMBA 3S1WA 4GNJA 4B5NA 2ABAA 1NAL1 2Y62A 3OBKA 4KWWA 5D05A 2CZFA 4K7YA 4R33A 4Q32A 5LNSA 2O7SA 1CX9A 5HINA 4S2CA 2GVJA 6ALDA 4W9TA 3B05A 3W7KA 2TYSA 3STEA 3NQ8A 5G4EA 1OYAA 3NM3A 1KM3A 1KFKA 4NZJA 3GR7A 2VENA 5K9DA 5LNRA 2V81A 3ABQA 4GUJA 3W3OA 3DHDA 4JTHA 2ZRZA 4MPQA 4UTTA 2YFOA 2NZLA 1V5XA 1XCFA 4UFLA 3A9IA 1DVJA 4LC6A 1G4TA 2RFGA 2NX1A 2YW3A 3LHYA 3GDKA 4ORMA 1OHLA 2Q8ZA 3M9YA 3EWWA 1SFJA 4RZ5A 2QAFA 3G1SA 4LS0A 2I1OA 3G1HA 3NQDA 3V1PA 4JX5A 1DV7A 3L67A 1OYCA 2OMAA 4N4QA 4WXZA 3L0NA 3EX4A 2NX3A 3DFQA 3USBA 5LNUA 1OX4A 3INPA 3TC7A 2VXNA 1LM1A 5A5WA 4FX7A 3SGZA 2FDSA 5FI8A 1F76A 4HNTA 3UWUA 1B57A 1XM3A 2BXVA 1LRTA 3IIPA 4IXXA 5U7SA 3MMTA 4QQ3A 3JS3A 2GQAA 4DF1A 1VR6A 3LCWA 3H53A 5DBUA 3GDTA 4I7VA 5E0KA 2F7FA 1G6CA 1Q3NA 3MHUA 4A2SA 4R7JA 4PC8A 2RKXA 3LOTA 3B04A 4JTGA 5K4XA 2GVLA 1LLZA 1TPUA 3O6YX 3TAOA 2OT1A 3LHUA 5G5IA 3P5ZA 3QFEA 4RX0A 3CIWA 3W1NA 1T99A 3P7YA 1QCWA 3UD6A 1D3HA 5D02A 2Z6IA 3DKLA 3MP4A 4JTLA 1VH7A 2A21A 4K6AA 3U2OA 4EIVA 1F6KA 2ZYFA 4BWLC 3EWXA 3NXFA 3QW3A 1UBSA 4NNAA 2DZPA 3W1UA 3Q94A 2E6YA 4O50A 4OQVA 5AOUA 2I9EA 4JTIA 4A29A 4XTDA 4C1LA 3PBWA 4K39A 3FKRA 1QPOA 3G0XA 3DFTA 4XKYA 3W71A 1G67A 1ZALA 4XQ6A 1RQHA 4QNWA 1A5SA 1PHWA 4U4MA 4LVAA 3NZ1A 4N9EA 3WK3A 4GE8A 2YGYA 4LY8A 5CPNA 1H60A 2ZBTA 3L21A 2JKPA 2RDTA 3DFNA 1TJPA 2DZVA 3W7QA 4IX0A 1AW1A 2Q8LA 2PCQA 3ANYA 4RKAA 4JXCA 4DPQA 3FEMA 1EP1A 3IGSA 3CLMA 3WK2A 2ZZ4A 5DY3A 1W5NA 2P10A 5KZEA 4PFMA 1SSGA 3WJSA 3BW4A 3MBFA 3L2IA 3C56A 4ZQOA 3E0IA 4CNNA 1ZFJA 1F6PA 3I68A 1EEPA 1FY6A 4YCPA 3FJLA 1LTDA 3KVMA 2ZRWA 2ZZ2A 3SSJA 1TRIA 1UUOA 4RV8A 4UR7A 4FXSA 3N9SA 3DU0A 2RDWA 3G1AA 2H3BA 3M6YA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4O0ZA

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