4O32A

Structure of a malarial protein
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
89
structure length
89
Chain Sequence
NTVIVLYFFAKWCQACTMQSTEMDKLQKYYGKRIYLLKVDLDKNESLARKFSVKSLPTIILLKNKTMLARKDHFVSSNDLIALIKKHLV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure and solution characterization of the thioredoxin-2 from Plasmodium falciparum, a constituent of an essential parasitic protein export complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
source organism Plasmodium falciparum
molecule tags Oxidoreductase
total genus 29
structure length 89
sequence length 89
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4o32A00
3CTFA 5IMZA 3GURA 3IRAA 1OYJA 4N10A 5KEJA 1A23A 4MJBA 4V1Ag 2LV3A 3LXTA 1JZDA 4GQCA 2OBKA 2PUKC 1IYIA 1O8XA 4N11A 1A2MA 3C8EA 4D73A 4TW5A 4POLA 5KN0A 1NHYA 4PGTA 4KA0A 3WGDA 2DJ0A 3QOUA 1XVQA 4KH7A 4HI7A 3ZREA 1JHBA 4NAXA 3ZFLA 4DSSA 3DMLA 1K0DA 4ID0A 3P8WA 2HE3A 2MMAA 3E3EA 4JE1A 1WOUA 2V2GA 3QD9A 4F0BA 4MABA 2E0QA 1ZL9A 4ACSA 1GSYA 1EGRA 1SKRB 3ERGA 3TKSA 3VWVA 3EU4A 1SYXA 3TB2A 5E59A 2DBCA 1LU4A 4KCAA 1TI1A 3PINA 4ZB9A 1EEJA 4HUAA 1AQXA 1EV9A 4K6XA 3LG6A 1SKWB 2ZNMA 3FYGA 4AJ6A 3HYPA 1BG5A 3CTGA 5F06A 2WB9A 2HSHA 2V41A 2AAWA 4XRAA 1RW1A 4HEA2 2X99A 2YWMA 2B5YA 1S3AA 1EWXA 1K3OA 3VI7A 2GTUA 5IMCA 1TK5B 2VUPA 1YY7A 4IS0A 1PA3A 2O85A 2A4VA 3ZL5A 4G19A 1DE2A 1A0RP 3LYPA 1XWKA 3UJ1A 1HD2A 2L59A 3RPNA 4O32A 3IV4A 3H8QA 1OC9A 5KN3A 3ISOA 4V2LA 1AIUA 3TRQA 4RI7A 7GSSA 1SL2B 4ML6A 1AXDA 2H1GA 4QQ7A 18GSA 2CX4A 2LQQA 4QL9A 3VK9A 1ZOFA 3GKMA 4GXZA 4H86A 3H93A 3GIXA 3Q74A 1WWJA 2QSIA 2LS5A 1PD21 4EL1A 1WJKA 2I1UA 1TKDB 2VD0A 1XWAA 1M9BA 1FB6A 2YV7A 2VM2A 3KGKA 4J2FA 3Q6OA 2B5EA 2TRXA 3GL3A 4ZL9A 2FHEA 1XWCA 2JADA 1ZYQB 5HFIA 2NDOA 2PPTA 2B6MA 1G6WA 3HVXA 1T00A 3IE3A 2D2ZA 1MTCA 3GH6A 4HU7A 2FCHA 2GSSA 5IMVA 4WR4A 2WZ9A 4Z7XA 2KOKA 3D4MA 4KNDA 4XS4A 1VF2A 3L9UA 4RI6A 4HZ2A 3O6TA 4MLYA 4HDEA 1GUMA 5CREA 1R5PA 1NW2A 1GP1A 5B8BA 3O76A 2RM5A 4L0UA 6GSVA 1XOAA 1K0BA 2FD3A 1Z7PA 5JWRB 1TK8B 4F03A 3C7MA 4AGSA 5ELAA 2L5LA 3I69A 3KH7A 3TCOA 3L0HA 3TOUA 5AGYA 1JFUA 1V9WA 1KNGA 5AISA 4IQAA 3FKFA 3TUEA 4EF0A 1QK8A 2EIOA 3DYRA 4XRDA 1NM3A 2GQKA 1K0MA 3QCPA 3DEXA 1OKTA 1ZZYA 3KZQA 1YQ1A 5IIZA 2C3TA 4PURA 1PKZA 5AIVA 5D96A 3BOAA 2LRTA 4XHMA 2DJ1A 1GTAA 5HFGA 2N5FA 3IDVA 4ZILA 1SD8A 2CAIA 1K0CA 2MMOA 3QFBC 1XPVA 2VL3A 4EDYA 4Q5RA 2H72A 2O89A 4NV5A 5DCGA 1GTBA 2A2SA 3DKSA 4WR5A 1XW6A 3UL3A 3J7Yk 4WEYA 4TRXA 4ECCA 1GTIA 2GZPA 3ME7A 4K9ZA 3BJ5A 2H70A 1T4YA 5IPHA 3C73A 1AC1A 1N2AA 3GN3A 3FK8A 4F82A 1Y6EA 1F9MA 1YDKA 2C3QA 4HQSA 6GSXA 4RQRA 3KTLA 1OKDA 3DGQA 3A2XA 4L0WA 3EVIA 1HNCA 3VFIA 1X9SB 2DLXA 2L6CA 3EYTA 1XXUA 1THOA 1AQWA 1GSSA 2XHFA 4ZBAA 1FOVA 5GSTA 3OR5A 2K8SA 2H01A 4JBBA 3WYWA 3RBTA 3KEBA 2CVBA 3F9UA 5A4UA 3KMOA 4CHSA 2O8VB 2VL2C 4Q5FA 2GQLA 3UIWA 3KIJA 4RQXA 2M72A 5HR0A 2YJ7A 4BWQA 5DQYA 1FHEA 3IAM2 3KH9A 4DSQA 1V57A 1EP7A 1K3LA 5J9CA 1LJRA 2B7JA 1SJZA 3UARA 4JR6A 16GSA 2Z9SA 2HZFA 1BAYA 2LNSA 4GCIA 1JZOA 8GSSA 2CQ9A 4MJAA 4KE3A 2FLSA 5LCZA 3HXSA 2XBIA 5CYYA 4TR1B 4G2EA 5ECKB 2GGTA 5A4VA 4YQMA 5B7CA 5INYA 3VURA 1XOBA 2PMTA 3LJRA 3E0UA 2B7KA 3ZFBA 1XW5A 2GZZA 4HJMA 14GSA 4AJ8A 1M9AA 2X8CA 3NZNA 4V2NA 1XWBA 3GKNA 3ERWA 1YKCA 2G0FA 5JCUA 4HQZA 4X1UA 2ON7A 2VLTA 3GSTA 4BWSA 2LKUA 4N0ZA 1OAZA 1W89A 3I43A 4HZ4A 5ECLB 2PBJA 2I81A 1AQVA 1SK2A 3HJMA 6GSYA 5CAXA 3DRNA 3QFAC 1XVWA 3GFKA 5HR1A 3IR4A 2YV9A 3IPZA 4TOPA 3LGCA 1DBYA 4ZBDA 1Z9HA 2GZYA 5EPFA 1U6TA 3QAWA 4ISDA 1O7UA 2MBTA 1PX6A 2F8AA 3A2VA 1EGOA 4TN8A 3ZVJD 3GH9A 4WBJA 5IMFA 4KAEA 3AY8A 2LEGA 3LYKA 4MH2A 4IQ1A 1G7OA 5L71A 1QFNA 5ECOB 2AB6A 2YN1A 3IXRA 3LQ7A 4MF7A 2H73A 1BJXA 2C4JA 2CX3A 2DJJA 5CNWA 4BL7A 3N9JA 1UC7A 1YF0A 2VO4A 2GT5A 2H75A 1WE0A 3GKKA 4P3YB 1ST9A 3C71A 3S9FA 2KUCA 4POKA 3VLNA 1LBKA 1VGLA 3LXZA 2YZUA 2K9FA 1RK4A 3A2WA 4ZXGA 4GSNA 1K0NA 3IK9A 4IVFA 1GSDA 5G5FA 3MNGA 1U87A 4KDYA 2ZUPA 2PERA 6GSWA 2H76A 5GAPD 3KP9A 5E4WA 1VF1A 3CRUA 2OE3A 3F0IA 1T3BA 3F4RA 2O87A 2O7KA 5HR2A 2X64A 2FY6A 2HFDA 2RUEA 1BQ7A 4E8EA 4E8HA 3MSZA 1GNWA 4PUFC 1ERWA 1M7TA 2HXKA 2IFQB 3F3RA 2DSAA 1PN9A 5DALB 2VCZA 4HS1A 1ACVA 1YJ6A 1W4VA 1SJIA 1VF3A 2H6YA 1X9WB 1ZGNA 4ZL8A 6GSTA 1VRSD 3KMNA 1B9XC 2M80A 1A8LA 2F51A 3UBKA 2FWHA 3TJBA 4K8MA 3PGTA 2CA8A 2JACA 4EUYA 3FZ9A 5ECSA 4JEDA 5EL8A 4PUAA 4YQUA 4K0GA 4EO3A 2GQMA 4KW6A 4GF0A 2V1MA 3MDKA 10GSA 2K18A 2TIRA 2FA8A 1XCCA 3DD3A 3APQA 2X8GA 2LSTA 3EURA 3BCKA 3ZTLA 3C1SA 2LUSA 4MPGA 1QUWA 4OWYA 5B6MA 4F9ZA 4OFNA 4TR4A 3KXOA 20GSA 1TU8A 3KTBA 1M2BA 5ECPB 1EOHA 3VPTA 1JLWA 1YEXA 4PNFA 3LWAA 3HZ4A 4PXOA 1NHOA 3HJOA 5ELGA 3EWLA 4ZL7A 1TRUA 2X8HA 2I4AA 1GTUA 4X43A 2FWFA 3EMXA 4MP4A 5ABRA 1V2AA 2H74A 1U3AA 3M1GA 4QL7A 3CXGA 4ULXA 3GX8A 4I2UA 2OA7A 4Q5NA 1FVKA 4PNGA 4TR3A 4RUVA 1X9MB 4LMVA 3LFLA 3R2QA 1GLQA 1ZCPA 1G6YA 2CZ3A 5F05A 1XFLA 1BEDA 1ON4A 1SJ6A 2N5BA 2HYXA 1OE7A 2L6DA 2OJLA 3Q18A 3LORA 4YH2A 1XIYA 1R26A 4J57E 2C0GA 1X5EA 3ZMKA 3W8SA 1SL1B 1K3YA 3W6GA 2VCTA 5IMDA 5C04A 2AJQB 2E2GA 3QR6A 4N30A 3EC3A 3J7Yb 3IC4A 5JCWA 2R2JA 3D6IA 4WBRD 5D73A 1B48A 4OO4A 2L4QA 1OE8A 5H5SA 3F3QA 1GH2A 4JZQA 4MZBA 5JCGA 2E2MA 4TXOB 5G5EA 3TJFA 1GRXA 2PVOC 5AN1A 4FYCA 4MK3A 3L78A 4EE0A 4HJ2A 2HT9A 4IHUA 1WRYA 1OC8A 2EIQA 5FWGA 2H0IA 2V6KA 3TRPA 3IK7A 3BD2A 1O8WA 2DIZA 1M2AA 5G30A 1TRVA 2EIRA 2QKEA 2IMKA 1M0UA 2HLSA 1FG4A 5H5RA 5G2ZA 5DAKB 3GNJA 4BA7A 4OD7A 4MZWA 3HJPA 1GSUA 2LRNA 2NTOA 4PX1A 4POBA 2WJUA 2XPDA 2CZ2A 5FT3A 5J41A 3DIEA 3DXBA 2H1DA 2LQOA 1Z6NA 3E9JB 5FHIA 4XS1A 2H6XA 5IQYA 1CQGA 2VLUA 3FR6A 5ECMB 4HOJA 2VIMA 3HDCA 3FEUA 4IJIA 4MJEA 2H8LA 2HRFA 2GSTA 2PGTA 3APSA 3CSJA 3DWVA 3L9VA 3TJGA 2B1LA 1J0FA 3KM6A 4MMMA 1TP9A 4IJ3A 4GSTA 1GL8A 2VCXA 1T4ZA 3GMFA 3G9BA 3US3A 1DUGA 5GAND 2G2QA 2MBSA 3GSSA 3D21A 3D4TA 4IP6A 3KD0A 2IMIA 3F63A 5DBQA 1FVJA 5IM9A 3MWHA 4BVXA 4GWRA 3PR8A 1ML6A 3HA9A 3TDGA 1O81A 3UBLA 1K0OA 2OE0A 4KUNA 4ECIA 2DMLA 5IOXA 3D5JA 5GSSA 1MDJA 1G7EA 5D8IA 4NHWA 3UAPA 5F0GA 1EV4A 5ECQB 1S3CA 3VWUA 1JZWA 3TRXA 1M2DA 3V1WA 2IIYA 3FRCA 3JCML 5B6NA 2K8VA 2L5OA 4WF5A 3TJKA 4JRRA 2C3NA 4K7NA 3UVHA 3ZZXA 1GUKA 1A0FA 4MCUA 2H1AA 5D93A 4IW9A 2C80A 2AYTA 5CRDA 5AIXA 3RPPA 1T1VA 3VI5A 4KDXA 4DEJA 2MYGA 3GA4A 2E7PA 1JZRA 2M46A 1U3IA 2OACA 1A8YA 1G0TA 2KHPA 1Z5YE 4V1Ap 3WGXA 1TRWA 3M0FA 2YOIA 1MDKA 4X0XA 4TXOA 1PL2A 5J9BA 2PN8A 3L9SA 4YAVA 3HVVA 1Q4JA 2WDUA 2DIYA 1TJDA 4NPBA 5IMAA 2MMNA 4NWYA 5ECIB 5KN1A 2VL9A 12GSA 1F3BA 2DJ2A 4ILFA 2WFCA 2H19A 5IPGA 4OFMA 3CRTA 1K0AA 4WKWA 1T8EB 2HZEB 4LL1B 1RQMA 3QPMA 2YJHA 4XTSA 2OKAA 5DCHA 3WGEA 1QXHA 2FNOA 1F6MC 4EXJA 19GSA 13GSA 3QAGA 1MEKA 2NBSA 1GNEA 5LD0A 6GSSA 2L57A 2IPAA 4K2DA 2H6ZA 5JWOB 4ZB8A 2YNXA 2P31A 2IMDA 3RAZA 5ID2B 3D0ZA 5DDLA 4IP1A 2FWGA 1SK1A 1V98A 4ZB6A 2VL2A 2H0GA 5ECRB 1OC9B 2HI7A 5LNKe 3IHQA 4HU9A 3GX0A 1SD9A 2H1BA 2HSYA 3KP8A 4GQFA 2ON5A 1YEPA 3TKSC 4LMWA 5G1LA 1TTZA 5IOWA 4OMVA 2V32A 3GHAA 4ZBBA 4CW9A 2WRTA 1BX9A 1YZXA 2CVDA 3C1RA 4ML1A 3U5RE 4MF6A 1SENA 5D9XA 3VWWA 1MDIA 3U6VA 2VLVA 1HNAA 2IN3A 1V40A 2C1YA 3F6FA 3K8NA 3FHKA 1PL1A 1UVZA 11GSA 3D22A 3UMAA 4FYUA 2H66A 4MDCA 1XZOA 3TOTA 2F3MA 4IELA 2VCVA 4G9HA 1DSBA 3FZ5A 3EE2A 4XS4B 3TKQA 1O73A 2OADA 3LSZA 4LA1A 1U88A 1TXXA 1PQNA 4V2MA 3HKRA 3QDNA 3ZIVA 3HY2A 1FB0A 5GZZB 2JSZA 1YF1A 2DMMA 3FZ4A 3F4SA 2QGVA 1AAZA 1I5GA 3GRXA 3SWLA 3EU3A 4ECBA 3ZVJA 1F3AA 4KSOA 5ECHB 4O92A 3M3MA 1THXA 3RHCA 4EVMA 5ECNB 1PGTA 4KDUA 3G7YA 1ABAA 4I6XA 4OCEA 2F9SA 1JLVA 2K6VA 2R6KA 4FIWA 3FW2A 2LJAA 2L4CA 2J9HA 2NPBA 4TR1A 3H1NA 1SKSB 2AHEA 1PRXA 3ZYWA 2GSQA 5A4WA 4NHZA 2I9HA 1C72A 3TGZA 2HNLA 3HCZA 1EEMA 2LJKA 1EZKA 5D9TA 3IA1A 4DVCA 3FR3A 2MZCA 4MJCA 4EKZA 4TVEA 3L4NA 4I2TA 2YZHA 1HYUA 4YAPA 3HZ8A 3IOSA 3GV1A 2CV4A 4JR4A 2I3YA 5IO2A 1R7HA 2HRNA 1ERVA 4K7IA 3WD6A 2ES7A 2BJXA 2GVPA 2HZEA 3QMXA 3CSIA 1O6JA 1ERUA 2YCDA 1GUHA 1H75A 2VM1A 1A24A 4I8BA 4CDOA 1J08A 4PQ1A 2H30A 4EDZA 3GUSA 2C8UA 2TRCP 2C0FA 3VWXA 1Z3EA 4XS6A 4N0VA 2R3XA 2JL4A 1QMVA 4TR0A 4FYBA 5DVBA 4POMA 1Z7RA 4GRFA 4XCSA 3ED3A 5ID2A 5CRHA 3IBHA 3ZRDA 2PU9C 2CVKA 5IO0A 3ZMLA 4Q5QA 4K1FA 2YWNA 2RM6A 1KBNA 2FA4A 2AV4A 3BCIA 1SU9A 4ZIJA 3FZAA 4F0CA 2FGXA 1USBA 2YP6A 3GYKA 2YPMA 3CMIA 2FWEA 1B9YC 1M99A 2P0GA 2R4VA 2C0DA 2BMXA 3ZIJA 3EINA 3GL5A 1UN2A 3EMPA 1A2JA 3Q19A 1MD4A 4JU5A 1IYHA 2P5QA 1B4PA 1X5DA 1XWGA 2JZRA 3CYNA 1AW9A 4TXVA 2J23A 4BVYA 1A2LA 3M9KA 1OVNA 4LL4B 5DJMA 5CRGA 2BTOT 2RIIA 4MF5A 1WPIA 2R5GA 3G7IA 3W8JA 1GULA 5DJLA 3HVSA 3WT2A 2GS3A 1E2YA 1TRSA 1Y25A 3M8NA 3GTUB 2IFQA 2RLIA 17GSA 1N8JA 4IGJA 4IKHA 3A5WA 4OCFA 5DALA 1SYRA 3HHVA 4WETA 3I6AA 1SL0B 1E6BA 3A3TA 1HNBA 4PQIA 3UVTA 2B5XA 2LJRA 2WS2A 3UEMA 4G10A 1Q98A 1URMA 2VCWA 4IBPA 4MPFA 2PVQA 2H71A 2DJKA 1ZMAA 2XPEA 5HQPA 3VPQA 4MA9A 3SBCA 3KJYA 3APOA 2PWJA 1H4OA 3H4KA 5CRWA 4K0NA 1V58A 2REMA 1T7PB 2JSYA 2IMEA 4MZCA 4OFTA 1ZYEA 2N5AA 2OE1A 3TJJA 2LNTA 2YWOA 1NSWA 1X0RA 3N5OA 2GDRA 2XBQA 4DSRA 3F8UA 1WIKA 3H79A 5D9WA 2JU5A 4BPYA 1VF4A 1GSFA 3IAS2 3BBYA 1TK0B 1FO5A 1WP0A 1EOGA 4ECJA 5J3RA 1GSEA 5J5NA 2XC2A 5B8AA 5H5QA 2OBIA 3UOMA 3M9JA 4FH8A 5G1KA 4OO5A 1TU7A 2LTKA 1YKAA 5DQSA 2GSRA 3DVWA 1SK0A 1KEBA 4NXIA 3PH9A 5EY6A 1XBSA 2B3SA 1EP8A 2CT6A 1TDIA 4TKYA 1UA5A 1R4WA 5G31A 1I9DA 1O85A 5CP1A 1ERTA 4PQHA 4O7HA 3MAKA 2YWIA 4FO5A 2JZSA 1S3DA 3KCMA 4GLTA 4D73B 1ILOA 4NMUA 3TKRA 1B8XA 4L8EA 6GSUA 2A2RA 4DSSB 5EVOA 5ENUA 5F8BA 2WCIA 1TI3A 4O5RA 3WT1A 2IWTA 2IL3A 3HD5A 3FY7A 2VAFA 3P90A 3ZITA 2GT6A 2IJYA 2DC5A 2VD1A 2DJ3A 4KB3A 2NVLA 5F07A 4AF2A 4IN0A 4WF4A 1GSQA 4L5LA 1OC3A 1Z6MA 4KX4A 1TOFA 1R5AA 3GTUA 4EC0A 4GSSA 4AJ7A 1QGVA 1PSQA 3DVXA 4NV2A 2VOCA 4XIHA 2GLRA 1HQOA 4LLRA 2LRCA 3RDWA 2P5RA 1XW9A 3GKXA 3LEFA 3P7XA 4F2IA 5DAKA 1F2EA 2ZCTA 3NIVA 3NOFA 2H0HA 5HR3A 2FUG2 4GTUA 5J4UA 5CO3A 4K7OA 3ZLPA 5KN2A 2VCQA 5C00A 1TW9A 1FW1A 1B4QA 5HFKA 1J9BA 2R37A 3O3TA 4KCEA 1GLPA 3G7JA 2CAQA 3CSHA 4KSMA 4KGIA 2MMZA 5A5KA 3ERFA 2KLXA 4MH3A 1BYEA 2KP1A 3P2AA 2WULA 1WMJA 4I97A 4L5OA 2YANA 2JZTA 5JWQB 4WXTA 1PKWA 3QAVA 2KP2A 3I9V2 3CBUA 2QC7A 3ME8A 2WGRA 3TKPA 1PMTA 3F4TA 5COHA 1FAAA 2RUFA 1GWCA 1X5CA 1F37A 2V6OA 3FR9A 1KTEA 4J56E 1MD3A 2ALBA 2IMFA 2EC4A 5D9VA 3F6DA 1AUCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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