4O34A

Room temperature macromolecular serial crystallography using synchrotron radiation
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title Room-temperature macromolecular serial crystallography using synchrotron radiation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4o34A00
1GFRA 4A7DA 5L3HA 1GBSA 1JTOL 2BPUA 5HLLA 3A3QA 1DZBX 4DD1A 1LYYA 4GN4A 1WQPA 1KIPC 1UICA 2BQMA 3QNGA 3TXIA 1J1PY 1A4VA 4N9RA 1GB0A 1MELL 2MEAA 4NSJA 3WMKA 4WM4A 7LYZA 2EKSC 1YAQA 4X3BA 4GN5C 4Z41A 4NHQA 1OUCA 1IWZA 1HEMA 1FLYA 1JHLA 3A67Y 3ATNA 5ILFA 1IWUA 1TEWA 4HPEA 4LYTA 4IATA 4B0DA 1G7IC 1WQQA 1LMCA 4TSCA 1JITA 1OQMA 5IHGA 1LJHA 1BB7A 3N9AA 1CJ6A 5T3FA 4CFOA 5KXWA 1LOZA 4NGZA 3WYHA 4OWHA 1LZTA 1NQIA 5DN5A 1LJEA 3TXJA 5C6LA 2D4KA 4NIJA 2ZILA 1LSNA 3AW6A 3M18B 1B5ZA 1LZ5A 1O23A 4I0CA 4WM3A 4HV2A 5KXLA 2YBLA 2C8OA 4BAPA 1LJFA 1IP2A 2VB1A 1GE4A 4NGWA 2DQCY 1UCOA 1GF9A 1WTMA 3CSQA 1HERA 3A6BY 4MSTA 1YANA 2Z39A 5KXYA 3WW6A 1AM7A 5E4PA 1J1XY 1CNSA 4ML7A 5E9RA 4HV1A 4Z46A 1IIZA 3WULA 4ZEEA 4WO9A 4YM8A 2D4IA 4H9CA 1LHLA 1HHLA 1AT5A 1YILA 4B1AA 1GBYA 4YEMA 1INUA 3P66A 1LKSA 3AGGG 2MEFA 4OOTA 2LYOA 3WU9A 132LA 1D0LA 1LMQA 1B2KA 5B06A 1CKFA 3A91A 1HF4A 5LIOA 1UIEA 4KT3A 1B7MA 1NDGC 1IOSA 1RI8B 1LMNA 2HECA 1B7SA 4Z3MA 1KXWA 1YIKA 4CJ2A 3J4GA 2F2NA 1VDQA 2Z37A 3HBDA 1HNLA 1LSDA 1OUEA 2BLXA 2LYMA 1GFTA 1GFUA 1VAUA 4TUNA 5DL9A 2F4AA 1QSWA 4LYOA 1HENA 4YF2A 5FCPA 4HTNA 4W94A 1LZ4A 4G4CA 1C46A 2FBBA 1LHMA 1GF5A 3WXUA 3W6FA 4LFPA 4DD3A 1D0KA 2MECA 5FDJA 1ZMYL 1IR8A 1UIFA 1HSWA 1B5YA 1IWYA 1XEJA 4HJVA 3AGHA 1DXJA 1F10A 1LJIA 1UIHA 3WUAA 1QUSA 2W1MA 3LHMA 3A3RX 4WOAA 1HFZA 5KKJA 1KXXA 2BQLA 4RDSA 1OUJA 4WM1A 4G9SA 208LA 135LA 4FDYA 4DD7A 5FEKA 1LHHA 3A8ZA 4TTDA 4ET9A 5D5FA 2ZYCA 4NG8A 4H9HA 5D5CA 1B5WA 3A95A 3B0OA 1IOTA 2DQHY 4GCFA 5KXZA 2B5ZA 1B5UA 4PGJB 3A96A 3CT1A 3EMSA 4U3XB 1BWJA 5FELA 1C45A 1DPWA 1UIGA 1AT6A 3RW8A 4OWAA 4ZIXA 1LSPA 3P65A 1LZ8A 3GXKA 3AW7A 153LA 3ZEKA 4B4JA 3F6ZA 1Z55A 2MEBA 3J6KA 1LJ3A 5I4YA 1LSGA 1LJNA 1JEFA 1QTEA 1AZFA 5LVGA 4OWEA 1GB5A 4KPMA 2BQAA 1ZVYB 1GEZA 1W6ZA 2Z18A 1C7PA 4HJYA 3WPJA 1HEPA 4B49A 5J7CA 2YBMA 4M4OA 4QEQA 1BGIA 1LZYA 4XJFA 1B5VA 1B5XA 1LZCA 5KXTA 5LYMA 4G49A 4XADA 134LA 1GBOA 1NMMA 4NGLA 2BQNA 1UIDA 5KY1A 1KIQC 1LZRA 1PZYA 5KXPA 5C6JA 1JPOA 1GPQC 5LXWA 2BQBA 2EQLA 5EBHA 4TWSA 1PS5A 4IJ4A 4B4EA 1QUTA 2BQOA 2DQEY 3CT0A 1FDLY 1JSEA 4L41A 4N0JA 6LYTA 2D6BA 1V7TA 2A7FA 4N1EI 1LZEA 1GHLA 1OUBA 4H9AA 1LHJA 5I54A 4H8XA 4KXIA 2LZTA 5B05A 1NBZC 1IWVA 1DI5A 1LSYA 2GV0A 4H90A 5ILCA 2ZQ4A 1GE3A 4H9IA 4ETBA 1GFVA 1QIOA 207LA 1QQYA 4NGJA 1GE2A 4YEOA 1LJJA 4DC4A 1YKXX 9LYZA 5APDA 4M6DA 1DKJA 2YBHA 3WH1A 1LYSA 4OWCA 4CHXA 4WLTA 1LZAA 4HJZA 5M1YA 1GF0A 1XGRC 5F16A 4UWVA 4LYBA 4UWUA 3ATOA 2H9JA 3SP3A 1GF4A 1GF6A 2D91A 2MEGA 1DI4A 1GXXA 3HBEX 4NGYA 4WMGA 4BAFA 1LMOA 4DDAA 4QGZA 4H9BA 1UBZA 1UC0A 4MR1A 4NEBA 4NSGA 3A90A 2G4NA 4NHPA 1IEEA 3K3TA 1NF5A 5K7OA 1LSMA 1GB8A 3BKVA 1D6PA 4LZTA 1D6QA 1HFYA 1G7JC 5B1FA 5LYTA 1LMAA 1ALCA 2D4JA 5IELA 4R0FA 4DD2A 1EQ4A 4ETCA 3CSRA 1LZ9A 4NY5A 1WVUA 8LYZA 3A94A 5I53A 5KXRA 1B7LA 1B7PA 4Z98A 1OUFA 1XGQC 4NGOA 1FBIX 2YVBA 3B72A 1EQ5A 2ZWBA 1LMPA 5LAFA 1GD6A 3T36A 1CKGA 1YKZX 3LYOA 5LVIA 5KXMA 1GFGA 4NWEA 4H91A 3WU8A 1WQOA 1OUHA 1I56A 3LZTA 3CT5A 1TAYA 4WL7A 4H1PA 2Z2FA 1C08C 1GWDA 3AZ6A 4WLYA 1VDSA 3P64A 4XJGA 3WPLA 2BQDA 3LYMA 3KAMA 1WTNA 1IR9A 1V7SA 1IC4Y 5APFA 1T6VL 3RNXA 3TXBA 5KXKA 3IJUA 2DQFC 2Z38A 4NWHA 3WW5A 3TXKA 4H9EA 1UA6Y 1NKHA 1I20A 2Z19A 1FLWA 1GFEA 1ZV5L 5HMJA 1HEWA 3TXHA 4DT3A 1B0DA 4RLMA 2HUBA 5APCA 3TMXA 3TXFA 2DBTA 5HNCA 2IFFY 4ANRA 4UWNA 4NG1A 4J7VA 3CSZA 1OUAA 4GLAA 1DKKA 3TXEA 1GAYA 2ZYPA 2YSSC 5AMYA 4ZFPA 2BQHA 1F0WA 1JJ3A 4QDNA 4E3UA 5KKIA 1CKCA 5A3EA 3AZ4A 1B7OA 2FYDA 4DD0A 1HMKA 1WQRA 5I4XA 4OW1A 3WUNA 1JUGA 2BQEA 4ETEA 2PC2A 3FE0A 2XTHA 1BB6A 1I1ZA 3E3DA 3CQLA 1LJKA 1HELA 4B4IA 1IC5Y 3W6DA 5B59A 2Z12A 5LAGA 2W1XA 4DWXA 1XGPC 5HMVA 1YAPA 1LSCA 1FKQA 2C8PA 5F9UA 193LA 4BADA 1UIAA 5DM9A 5FSTA 1BQLY 3HBHA 1C10A 2DQAA 4HSFA 4HTQA 1GDXA 1BB3A 1QDTA 2Q0MX 3RT5X 1GB2A 1CJ9A 2FYCA 3D9AC 4DYGA 4TSBA 2EIZC 1HEQA 1JKDA 2HEAA 4XJBA 1TCYA 1LZDA 4RW1A 2EPEA 4WLDA 1LHKA 1GE0A 4PHIA 1WQMA 3N9CA 1H6MA 1F6RA 2HEEA 3WXTA 1RE2A 4GCBA 1JKAA 2BAAA 5I5QA 5DN4A 1IORA 4GCCA 1D0MA 4IASA 4XJIA 2HU3A 1UUZC 2XJWA 1N4FA 1TDYA 4H8ZA 1D9UA 1LZGA 4O34A 2XBSA 1W08A 1JJ0A 2ZNXY 3P4ZA 4NSIA 4OOOA 1LHIA 3WPKA 3ULRA 2G4QA 2G4PA 3B0IA 3TMVA 2BQJA 2CDSA 3EBAB 1IOCA 2W1YA 4H92A 2DQIY 1XEKA 2BLYA 3AGIA 5B07A 1GXV2 2ZIKA 1IY3A 4WO6A 2FBDA 2I25L 2LHMA 4HPIA 4FJRA 3W6CA 2BQFA 1BB5A 4ETAA 4LT2A 2YBNA 3W3EA 5HQ1A 1ZVHL 1CKDA 1LSFA 1A2YC 2F30A 1JJ1A 1BWHA 5LINA 2BQIA 3A93A 3LZ2A 4YENA 1IP3A 1LMTA 3A34A 4LGKA 3OJPA 1SLYA 3AZ5A 1G7MC 4C5FA 1LZ6A 1IP6A 1VDTA 4NHSA 4WG7A 4DDBA 1LZSA 1YQVY 1NWGA 3EO5A 1HSXA 4GCDA 1GE1A 1BVXA 1GFHA 4NGIA 5LYZA 5L3IA 5HNLA 1YL0X 1IP1A 1VFBC 4WM6A 3FI7A 1LYOA 3A92A 1GBXA 3TXDA 3AB6A 2YDGA 2MEEA 4WM2A 4H94A 3G3BB 4I8SA 1FN5A 1REXA 2AUBA 3WUMA 1YAMA 1IY4A 5KXSA 1EQEA 1MLCE 1KIRC 2WARA 3B6LA 4GLVA 4WLXA 1HFXA 2F4GA 1JWRA 4LFXA 4XJHA 3T6UA 4LT1A 1LKRA 4R6CA 5F9XA 1LAAA 5KXOA 5LVKA 3WL2A 4CGEA 1IVMA 5APEA 3TXGA 4DDCA 4TX7A 2ZQ3A 2W1LA 4LYMA 1JIYA 1TBYA 1OP9B 1VATA 4H9FA 2ZNWY 1B9OA 3D3DA 1RCMA 4C3WA 4XYYA 4KL7A 2X0AA 1E8LA 1GBWA 4CFPA 1OUDA 4GN3A 1DI3A 1RJCB 2DQJY 4GCEA 5C6IA 2HEDA 1BVKC 1DPXA 2YBIA 3LYTA 3ZVQB 5I4WA 5DLAA 1T3PA 4RLNA 4N5RA 1YL1X 1GB3A 3P68A 3W6AA 1JKCA 3WVXA 2I26L 1NBYC 1VEDA 1XGTC 3B0KA 4J1BA 4PPOA 1IP7A 1LCNA 4NHIA 5LVJA 1LJ4A 4H93A 1FKVA 1IOQA 4J1AA 3G3AB 4II8A 2IHLA 1G7LC 3LN2A 4PRUA 1REYA 5F14A 1C43A 4AXTA 3A6CY 4N1CC 5KJ9A 154LA 1HC0A 1B7RA 2HEBA 2Z2EA 1OUGA 1FLUA 1LZBA 1IWXA 1LPIA 1VDPA 3CB7A 3LYZA 1NDMC 4HP0A 4PRQA 1IR7A 2I6ZA 2HEFA 1EL1A 4PJ2C 1HEOA 5FHWA 6LYZA 1P2CC 3IWRA 3AYQA 3OK0A 3QY4A 1GB6A 4W96A 1JISA 3AZ7A 1JTPL 2RSCA 1OUIA 1SQ2L 1IWWA 1JKBA 1F6SA 1GEVA 2CJLA 1QDRA 2MEDA 3AJNA 1BHZA 4EMNA 1J1OY 2HTXA 4NFVA 2LZ2A 4J0LA 3VWOA 2A7DA 1HMLA 3BKHA 2Y8PA 4G4BA 4NGVA 2CGIA 4LT0A 1GBZA 4WM5A 2LYZA 1GFKA 4AGAA 1LSAA 4WG1A 3TMUA 1IO5A 4LYZA 1YKYX 2BQKA 1LSBA 3GXRA 4DD9A 5LVHA 1IP5A 1QTKA 5LA8A 5KXNA 1LSEA 1JSFA 3MGWA 1XFPL 133LA 1WVVA 1G7HC 1GF3A 4LYCA 5A3ZA 2HU1A 4XENA 1CKHA 2BQGA 1H87A 1KXYA 4HTKA 1XSFA 1BWIA 3EXDA 4N8ZA 1AKIA 1CJ8A 1GF7A 1QSAA 2YBJA 3ZVQA 1LZ1A 1UIBA 1IC7Y 2CWIA 1FLQA 2MEHA 1CJ7A 5B1GA 5IDDA 2DQDY 4NGKA 1GF8A 1RFPA 3IJVA 4NSHA 3QE8A 1GFJA 2N5ZA 5KXXA 1GFAA 1XEIA 2DQGY 4QY9A 4YOPA 1GB9A 1REZA 3WVYA 4RW2A 3RU5A 2H9KA 3M3UA 1UACY 1GDWA 4EOFA 1REMA 1DQJC 1LTMA 2XBRA 4MCKA 1LJGA 4LT3A 1XGUC 1GAZA 1JTTL 4WL6A 3W6BA 2BQCA 2MEIA 1YAOA 5II3A 4G4HA 1IX0A 1YROA 1GB7A 3HFMY 5F81A 2H5ZA 4P2EA 1LSZA 4NHTA 4BS7A 1B7QA 5LA5A 1WQNA 3N9EA 3RZ4A 1LYZA 1BB4A 4H8YA 4OWBA 1B7NA 3W6EA 2DKVA 1NHEA 5JENB 194LA 4XJDA 1LZNA 2ZIJA 4D9ZA 5L9JA 4XN6A 1IWTA 3WU7A 3TMWA 2NWDX 4ET8A 4ETDA 1IP4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C6HA 1DZBX 1LYYA 1KIPC 3TXIA 4WM4A 4DQJA 4HPEA 4IATA 1L87A 1LMCA 1LYFA 1C67A 1JITA 4CFOA 4NGZA 1L70A 1LJEA 4NIJA 3L2XA 3M18B 1B5ZA 1CV0A 4I0CA 4BAPA 4LDOA 1IP2A 1L0KA 2DQCY 1WTMA 3CSQA 4MSTA 1YANA 5E4PA 1J1XY 3C7ZA 1K28A 1XEPA 3HTFA 1YILA 3P66A 4OOTA 3NYAA 1LMQA 3SB8A 1QSBA 1NDGC 2HECA 1YIKA 3J4GA 2F2NA 1VDQA 1L10A 1OVHA 1GFTA 1VAUA 4YXAC 1HENA 4HTNA 4G4CA 4DD3A 1L51A 5FDJA 3CDQA 1CV4A 171LA 1DXJA 1F10A 4WOAA 5KKJA 2BQLA 1P37A 4FDYA 3GUJA 1L01A 1OVKA 4NG8A 5D5CA 1C6GA 3C82A 1IOTA 3DMZA 1PQOA 3GUOA 3CT1A 5FELA 1CTWA 1LZ8A 153LA 1LYHA 4B4JA 244LA 1LJNA 1QTEA 1C6PA 4KPMA 5J7CA 127LA 4DQ5A 2YBMA 1BGIA 4XJFA 2ANXA 5LYMA 1G06A 4G49A 4XADA 4NGLA 240LA 1LZRA 1JPOA 1GPQC 5EBHA 1PS5A 4IJ4A 1D2YA 4GBRB 108LA 2DQEY 4N0JA 243LA 2A7FA 1XJUA 4DAJA 3F8VA 2GV0A 4H90A 4ETBA 1GFVA 4NGJA 3HT6A 3HU9A 4DC4A 3DN0A 1DKJA 2YBHA 3WH1A 1LZAA 1G1VA 4UWUA 1GF4A 4NGYA 3HBEX 1GXXA 4BAFA 1L57A 4NEBA 176LA 223LA 2G4NA 1XJTA 260LA 3C8QA 5B1FA 2OTYX 4DD2A 1L94A 4DKLA 3CSRA 5I53A 1B7LA 1OUFA 1FBIX 2YVBA 1L93A 2NTGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GFR A;  4A7D A;  5L3H A;  1GBS A;  1JTO L;  2BPU A;  5HLL A;  3A3Q A;  1DZB X;  4DD1 A;  1LYY A;  4GN4 A;  1WQP A;  1KIP C;  1UIC A;  2BQM A;  3QNG A;  3TXI A;  1J1P Y;  1A4V A;  4N9R A;  1GB0 A;  1MEL L;  2MEA A;  4NSJ A;  3WMK A;  4WM4 A;  7LYZ A;  2EKS C;  1YAQ A;  4X3B A;  4GN5 C;  4Z41 A;  4NHQ A;  1OUC A;  1IWZ A;  1HEM A;  1FLY A;  1JHL A;  3A67 Y;  3ATN A;  5ILF A;  1IWU A;  1TEW A;  4HPE A;  4LYT A;  4IAT A;  4B0D A;  1G7I C;  1WQQ A;  1LMC A;  4TSC A;  1JIT A;  1OQM A;  5IHG A;  1LJH A;  1BB7 A;  3N9A A;  1CJ6 A;  5T3F A;  4CFO A;  5KXW A;  1LOZ A;  4NGZ A;  3WYH A;  4OWH A;  1LZT A;  1NQI A;  5DN5 A;  1LJE A;  3TXJ A;  5C6L A;  2D4K A;  4NIJ A;  2ZIL A;  1LSN A;  3AW6 A;  3M18 B;  1B5Z A;  1LZ5 A;  1O23 A;  4I0C A;  4WM3 A;  4HV2 A;  5KXL A;  2YBL A;  2C8O A;  4BAP A;  1LJF A;  1IP2 A;  2VB1 A;  1GE4 A;  4NGW A;  2DQC Y;  1UCO A;  1GF9 A;  1WTM A;  3CSQ A;  1HER A;  3A6B Y;  4MST A;  1YAN A;  2Z39 A;  5KXY A;  3WW6 A;  1AM7 A;  5E4P A;  1J1X Y;  1CNS A;  4ML7 A;  5E9R A;  4HV1 A; 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 4NFV A;  2LZ2 A;  4J0L A;  3VWO A;  2A7D A;  1HML A;  3BKH A;  2Y8P A;  4G4B A;  4NGV A;  2CGI A;  4LT0 A;  1GBZ A;  4WM5 A;  2LYZ A;  1GFK A;  4AGA A;  1LSA A;  4WG1 A;  3TMU A;  1IO5 A;  4LYZ A;  1YKY X;  2BQK A;  1LSB A;  3GXR A;  4DD9 A;  5LVH A;  1IP5 A;  1QTK A;  5LA8 A;  5KXN A;  1LSE A;  1JSF A;  3MGW A;  1XFP L;  133L A;  1WVV A;  1G7H C;  1GF3 A;  4LYC A;  5A3Z A;  2HU1 A;  4XEN A;  1CKH A;  2BQG A;  1H87 A;  1KXY A;  4HTK A;  1XSF A;  1BWI A;  3EXD A;  4N8Z A;  1AKI A;  1CJ8 A;  1GF7 A;  1QSA A;  2YBJ A;  3ZVQ A;  1LZ1 A;  1UIB A;  1IC7 Y;  2CWI A;  1FLQ A;  2MEH A;  1CJ7 A;  5B1G A;  5IDD A;  2DQD Y;  4NGK A;  1GF8 A;  1RFP A;  3IJV A;  4NSH A;  3QE8 A;  1GFJ A;  2N5Z A;  5KXX A;  1GFA A;  1XEI A;  2DQG Y;  4QY9 A;  4YOP A;  1GB9 A;  1REZ A;  3WVY A;  4RW2 A;  3RU5 A;  2H9K A;  3M3U A;  1UAC Y;  1GDW A;  4EOF A;  1REM A;  1DQJ C;  1LTM A;  2XBR A;  4MCK A;  1LJG A;  4LT3 A;  1XGU C;  1GAZ A;  1JTT L;  4WL6 A;  3W6B A;  2BQC A;  2MEI A;  1YAO A;  5II3 A;  4G4H A;  1IX0 A;  1YRO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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