4O34A

Room temperature macromolecular serial crystallography using synchrotron radiation
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Room-temperature macromolecular serial crystallography using synchrotron radiation.
pubmed doi rcsb
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4o34A00
2Z12A 4KT3A 5DL9A 3G3BB 1V7SA 1LSZA 4HV2A 4DC4A 1GBYA 5M1YA 1TAYA 1REMA 1LCNA 2W1YA 2Z2EA 2G4NA 1LHKA 1RCMA 1F10A 2ZIKA 1JIYA 2MECA 2HEEA 4WLYA 1NMMA 3ZEKA 1GB3A 1KIPC 4NY5A 2BQKA 4RW2A 2LYZA 1QSAA 5LVIA 2W1XA 4R0FA 3ZVQA 2DQEY 2BQOA 2YBIA 5APFA 2DBTA 1MELL 4U3XB 1XGQC 1UIEA 1C43A 4I8SA 1OQMA 5LVHA 1HF4A 1IWWA 4LT2A 1OUGA 1UC0A 1GE4A 3ZVQB 1QTEA 1C7PA 5KJ9A 4W96A 4QEQA 2MEHA 4HJVA 1G7HC 4H93A 3TXEA 2FBBA 2W1MA 4G49A 4CHXA 4NGOA 5B1GA 1IR7A 1OUFA 4DD9A 1N4FA 1GF4A 1VATA 5LVJA 1LZAA 4H9CA 1HENA 5F9UA 4ML7A 1B2KA 1JKAA 1JSEA 1LJ4A 3W6AA 1REZA 1NBYC 1LHHA 3HBDA 4LT1A 1D0KA 1D6QA 3QE8A 3W6EA 2H9KA 4H94A 4D9ZA 1JJ1A 1NDMC 1CKGA 5B05A 1ZV5L 2G4QA 3RNXA 1GB8A 3WU7A 3W3EA 2NWDX 1IP5A 4ET8A 4NGLA 1LZNA 4XADA 5F14A 5IDDA 1VFBC 1B7PA 4I0CA 1AZFA 1GB0A 1WQQA 1UICA 2CGIA 1DQJC 1CJ8A 2PC2A 4OWAA 1BVKC 1ZMYL 1LSCA 3LYMA 4L41A 3GXKA 4GCDA 1DPXA 2DQHY 1UIAA 3WPJA 4BAPA 1UIHA 2XTHA 1RFPA 1WVVA 1P2CC 1LSYA 4B4JA 1JHLA 3LYTA 4WG7A 1GEVA 2N5ZA 2MEEA 1IOQA 4C3WA 3WMKA 2BQBA 1GFVA 2HTXA 4WO9A 1YAOA 1Z55A 5DLAA 4YEMA 5DN4A 1G7LC 3OJPA 4DD0A 5L3IA 2BQLA 1B0DA 3A34A 3T36A 1HERA 1GF6A 4II8A 1B7OA 1XGUC 8LYZA 4XJHA 2I25L 2YBLA 1XGTC 2I26L 5F81A 2MEBA 2RSCA 4N9RA 3WPKA 3IJVA 1C45A 2BQEA 3IWRA 2DQAA 1DI5A 3B6LA 3D3DA 4GN3A 4OOTA 1CKHA 5ILCA 4TSBA 2YSSC 4DYGA 1HFXA 1TBYA 2ZNWY 4NG1A 2DQGY 3AGHA 4DD2A 1J1XY 1IIZA 194LA 1GDWA 2BPUA 2DQFC 4IJ4A 5IHGA 1VDPA 1IP1A 1HEQA 1LTMA 3T6UA 1GB5A 4YF2A 2Z18A 3A6BY 1B5YA 2Y8PA 4H9EA 2Z38A 2DQJY 4MR1A 4NWHA 4OWEA 1E8LA 4NEBA 2YBNA 4PRQA 1GE1A 1IWVA 1BWJA 1PS5A 2X0AA 2YDGA 4IATA 1LPIA 4J0LA 4ETBA 1GPQC 5C6IA 4BAFA 2MEGA 1GB2A 3BKVA 1LKRA 3BKHA 1FLWA 1LJIA 5KXTA 3K3TA 208LA 1IWTA 4LGKA 4LYZA 5B06A 4DT3A 5D5CA 4ETDA 4YM8A 4HV1A 4DD1A 1UCOA 5IELA 4NHQA 3LYOA 4LYMA 1DKJA 1BB4A 2ZILA 5E4PA 1A2YC 1HFYA 5KXMA 1I20A 2A7FA 5EBHA 1FLUA 1W6ZA 1B5VA 4M4OA 1YKXX 5ILFA 5T3FA 4GCFA 4WG1A 2MEIA 4H9AA 4Z3MA 1B7NA 1GXXA 3TMUA 1LSPA 1LZRA 1GFEA 1UBZA 3ATNA 1EL1A 1BVXA 3TMWA 1NDGC 1BWHA 1REYA 1F6RA 2GV0A 4PGJB 135LA 4WOAA 1GF9A 2YBMA 3RT5X 1LMTA 4C5FA 1NBZC 1H87A 6LYTA 4TWSA 4NGJA 1LSNA 4FJRA 4KPMA 4N1CC 4XJDA 5DN5A 1FBIX 5L3HA 4RLMA 1SLYA 2BQGA 4WM1A 3EXDA 1LJEA 1UA6Y 3WULA 4MCKA 4YENA 1IX0A 3A3RX 4HTNA 4O34A 1B7LA 1OUAA 3QY4A 4HTQA 3WUNA 1QUTA 3CB7A 3AZ5A 1GFAA 3WUMA 3WVXA 1AKIA 1C08C 1ALCA 5FSTA 1C10A 3A96A 1BQLY 3AGIA 1INUA 3EBAB 2Z19A 2HEFA 1JPOA 4LT0A 1YANA 1JTOL 1OP9B 1GDXA 3HFMY 1XSFA 4PRUA 5E9RA 1IOTA 2C8OA 2FBDA 2HU3A 4XN6A 5KXXA 3AB6A 2AUBA 1D0LA 5FEKA 4WM2A 4ETAA 1RJCB 1HEWA 3TXKA 4NHTA 2BQCA 1JTTL 4DWXA 5LINA 5B1FA 3FI7A 1QSWA 5I5QA 4QDNA 1LJNA 3AZ4A 3LYZA 4R6CA 4LT3A 2DQCY 3LHMA 4M6DA 5KXRA 1KIQC 1HEOA 4LYCA 5FHWA 4WL6A 1LZ1A 4KL7A 1DXJA 1QIOA 1V7TA 2VB1A 4BS7A 5F16A 1VDTA 1OUEA 1YAQA 4OWBA 1IY4A 4NSIA 1F6SA 5KXYA 1J1PY 5LXWA 1GFJA 1GFKA 5KY1A 5APCA 1UACY 1EQ4A 1LSMA 3B0IA 3KAMA 1HMLA 5A3EA 3WW5A 2EQLA 1OUJA 5K7OA 2CDSA 4TSCA 3RW8A 1GBZA 4TUNA 5KXSA 4PPOA 1HEMA 4OWCA 5F9XA 3HBHA 1WQPA 2F30A 5FDJA 2HUBA 1JSFA 4WMGA 1DKKA 3P66A 2B5ZA 4GCBA 2W1LA 1WVUA 2ZYCA 4P2EA 2BQNA 1VDQA 5KXNA 5A3ZA 1UIGA 4A7DA 1T3PA 5HLLA 1LHJA 3WH1A 1IVMA 1GFRA 1JKDA 1GBOA 3TXHA 1IWYA 1GF3A 1NF5A 2Z39A 4GN4A 4GCCA 3P68A 4HPIA 5LVKA 3A95A 4Z41A 2BLYA 2H5ZA 4G4BA 5DM9A 1WQOA 3WXUA 3N9CA 1PZYA 4HPEA 4OW1A 5KXKA 4G4HA 1LZ9A 1XGRC 1LHLA 4NGVA 1GE2A 1LYYA 3TXIA 3OK0A 2ZQ4A 3B72A 4NHSA 1OUCA 4WM6A 3WW6A 1NQIA 1SQ2L 4G4CA 4EMNA 5KKJA 5KXPA 1GWDA 1HNLA 4CFOA 5J7CA 1LZTA 3D9AC 7LYZA 1OUDA 1WQRA 1AM7A 2BQJA 1CKDA 4NGKA 1JWRA 3RZ4A 4H9FA 4LFXA 1LSFA 5LIOA 2D4IA 3CQLA 1LZ6A 3TXFA 1IR8A 4AGAA 1LSDA 2YBHA 1GAYA 4WLDA 2DQDY 4CJ2A 5HNCA 2C8PA 1QQYA 153LA 3AW6A 3A94A 2HEAA 3WUAA 2MEFA 1GHLA 3A6CY 4AXTA 4WM3A 4ETCA 1HFZA 3W6BA 3J4GA 4NHIA 1OUBA 1REXA 1LZ8A 1JJ3A 3M18B 1JITA 1GB6A 3TXBA 5JENB 1TDYA 4PHIA 6LYZA 1RI8B 1VAUA 1H6MA 5HNLA 1MLCE 3LN2A 1IWXA 4CFPA 3AYQA 1WQMA 4QGZA 5I54A 3A67Y 4NSHA 1KXWA 1LJFA 2EKSC 1LZGA 2BQMA 2EIZC 3IJUA 3VWOA 4X3BA 1HSWA 4XYYA 4RLNA 1LJGA 1XEIA 1GEZA 3LZ2A 1O23A 2HEDA 1NKHA 2DKVA 2XJWA 3LZTA 4OOOA 3WVYA 4YOPA 2I6ZA 4N8ZA 1LZBA 5C6LA 4H9HA 2F4GA 3AZ7A 4XJBA 3WXTA 5KKIA 5LA8A 4NGZA 1LAAA 1LYSA 4N5RA 3TXDA 1LYOA 1ZVHL 1GF5A 1YIKA 2LZ2A 2ZWBA 4RDSA 1FN5A 5LYZA 1XFPL 1LJ3A 1D9UA 207LA 4B4EA 1LMQA 1BB6A 1GF0A 4XJIA 1JISA 1GB7A 4EOFA 2WARA 1IORA 1KXYA 1IP2A 4DDBA 1LZDA 3J6KA 3AGGG 1CJ6A 133LA 1GBSA 1OUIA 1YROA 1LSGA 4ET9A 1BB3A 1NWGA 1LZEA 1IC4Y 4WLXA 4DD7A 1C46A 1LKSA 2LYOA 1CKFA 4H92A 2LHMA 2HECA 4H8XA 1B5XA 2A7DA 4DDCA 1B7QA 1IY3A 1IC5Y 2CWIA 1IWZA 3W6CA 2ZYPA 1DZBX 4B0DA 4ZIXA 1FDLY 3ATOA 4NWEA 1UIDA 1FKVA 1LMAA 2Z2FA 4NFVA 3RU5A 1GFHA 1HEPA 1YAMA 2XBSA 5B07A 1GBWA 1T6VL 3A92A 4HTKA 4YEOA 5II3A 1B5UA 1G7JC 1GXV2 3B0OA 5KXLA 1B5WA 3AZ6A 4XENA 4UWUA 3G3AB 5HQ1A 1LJJA 1CJ9A 5C6JA 4UWVA 3TXJA 5KXWA 3WPLA 4XJGA 4B4IA 2ZNXY 5I53A 1LOZA 1LMNA 4LFPA 1RE2A 3CSRA 3CSZA 1VEDA 3QNGA 1YKZX 5I4YA 1CKCA 1VDSA 3GXRA 4WM5A 3P4ZA 1LMOA 2D4KA 5FCPA 2Z37A 4J7VA 1GFGA 2HEBA 4ANRA 1CJ7A 1IOCA 4QY9A 4ZEEA 154LA 1QDRA 5I4XA 3AJNA 4GLVA 2D91A 1GF8A 4MSTA 2G4PA 3P64A 1WQNA 1LZ4A 2IFFY 4ETEA 4XJFA 1LSAA 4B49A 3WL2A 3F6ZA 1QTKA 3A90A 3CT5A 3MGWA 4H91A 4H90A 4W94A 3WYHA 3TMXA 2LYMA 5LVGA 1DI4A 2Q0MX 3P65A 4NGIA 4LYOA 3TMVA 1XEJA 1UIBA 5APEA 4CGEA 1YKYX 5LAGA 1BHZA 2BLXA 1HELA 1LHMA 1WTNA 3HBEX 4GN5C 1IO5A 1QUSA 4HP0A 4WL7A 2ZQ3A 1EQ5A 1LSBA 1LJHA 1A4VA 1I1ZA 1EQEA 2MEAA 1XGPC 2BQHA 4NGWA 4NGYA 1IP4A 1IP7A 5AMYA 5HMJA 3W6DA 2MEDA 4TTDA 1BB7A 1IP3A 1YAPA 1GF7A 3CSQA 3CT0A 3M3UA 4J1AA 5LAFA 1AT6A 4N0JA 5L9JA 3A93A 2BQFA 1JTPL 1TEWA 3N9AA 3EO5A 1GE0A 1LMCA 2F2NA 4E3UA 5B59A 3FE0A 1J1OY 1OUHA 134LA 3A3QA 1B9OA 4LYTA 5KXOA 1D0MA 3TXGA 1LZCA 4NSJA 3ULRA 5D5FA 1XEKA 1HMKA 1I56A 2BQIA 4H9BA 1JKBA 4J1BA 1GFTA 4KXIA 4DDAA 1AT5A 1BWIA 4WM4A 4PJ2C 1JKCA 5FELA 4H8ZA 3WU8A 4Z46A 1UIFA 4ZFPA 4WO6A 4IASA 132LA 4FDYA 2D4JA 4NSGA 1LZSA 1LZ5A 1B7MA 4H1PA 1GD6A 1W08A 2HU1A 1LZYA 3E3DA 4G9SA 1CNSA 1JJ0A 4H9IA 3AW7A 2FYCA 4HJYA 2H9JA 3SP3A 9LYZA 2EPEA 4BADA 1IOSA 1HC0A 2D6BA 4TX7A 2DQIY 1YILA 2BQAA 4GLAA 1TCYA 2F4AA 4H8YA 2IHLA 3W6FA 1BGIA 2XBRA 1BB5A 1FLYA 1DI3A 3WU9A 1HHLA 5I4WA 1B7RA 1JUGA 4DD3A 1LMPA 2FYDA 1LHIA 1YL1X 2BQDA 1GB9A 2ZIJA 4LYBA 4NHPA 1G7MC 1QDTA 1DPWA 1NHEA 3A8ZA 1IWUA 5HMVA 4NG8A 5LYTA 1GBXA 2CJLA 1ZVYB 1FLQA 1LYZA 1HSXA 3N9EA 1B7SA 4WLTA 1B5ZA 193LA 4Z98A 1KXXA 4OWHA 4NIJA 5LA5A 1FKQA 1LJKA 1D6PA 1LSEA 1YQVY 1GE3A 2YVBA 3B0KA 1IP6A 1IC7Y 4N1EI 1IR9A 4UWNA 2LZTA 3EMSA 1WTMA 4LZTA 2BAAA 3A91A 1UUZC 4HJZA 5LYMA 1GFUA 1YL0X 1GAZA 5KXZA 2YBJA 3CT1A 4HSFA 5APDA 1F0WA 4GCEA 1G7IC 4RW1A 4B1AA 1JEFA 1KIRC 1IEEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Z12A 199LA 3LZMA 1LSZA 4DC4A 2Z6BA 1TAYA 1LCNA 2W1YA 2Z2EA 2G4NA 206LA 2MECA 2HEEA 3ZEKA 4NY5A 2BQKA 254LA 2LYZA 1QSAA 2W1XA 4R0FA 3ZVQA 3SB6A 2YBIA 1OWYA 1L36A 3HH6A 1UIEA 3DMZA 1HF4A 1UC0A 4LDLA 7LZMA 1P7SA 252LA 4QEQA 4H93A 4G49A 1IR7A 1OUFA 3OE8A 1VATA 1L89A 5F9UA 4H9CA 4ML7A 3W6AA 2XQOA 4H94A 1CKGA 4ET8A 4XADA 1OV7A 1VFBC 4I0CA 1L46A 1UICA 2CGIA 1CJ8A 2PC2A 4OWAA 1ZMYL 1L15A 4L41A 2HUMA 1UIHA 2XTHA 1RFPA 1P2CC 188LA 1QT8A 2MEEA 1YAOA 4DD0A 3T36A 1L01A 2I25L 214LA 2YBLA 5F81A 1QS5A 3HH4A 1L00A 1L58A 3D3DA 4OOTA 5ILCA 1QTDA 149LA 4NG1A 1TBYA 2ZNWY 3DMXA 2DQGY 1J1XY 1C64A 194LA 2DQFC 4IJ4A 5IHGA 1VDPA 4H9EA 1E8LA 4OWEA 3SB9A 1BWJA 4ETBA 1QUGA 4LYZA 5B06A 4ETDA 4DD1A 217LA 1LGXA 1DKJA 4W53A 143LA 1B6IA 1QUDA 1LI2A 1CUPA 1FLUA 166LA 4I7MA 247LA 1LSPA 1UBZA 1NDGC 2GV0A 1D3JA 1L44A 4WOAA 1L27A 2YBMA 4C5FA 3K2RA 1H87A 4N1CC 4XJDA 104LA 4WM1A 1G07A 159LA 4YENA 4HTNA 1XJUA 3CB7A 3WUMA 170LA 3EBAB 1L92A 1P3NA 2F32A 1JTOL 1L67A 125LA 1XSFA 1IOTA 2C8OA 2AUBA 5FEKA 1HEWA 3TXKA 1L11A 1L65A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2Z12 A;  4KT3 A;  5DL9 A;  3G3B B;  1V7S A;  1LSZ A;  4HV2 A;  4DC4 A;  1GBY A;  5M1Y A;  1TAY A;  1REM A;  1LCN A;  2W1Y A;  2Z2E A;  2G4N A;  1LHK A;  1RCM A;  1F10 A;  2ZIK A;  1JIY A;  2MEC A;  2HEE A;  4WLY A;  1NMM A;  3ZEK A;  1GB3 A;  1KIP C;  4NY5 A;  2BQK A;  4RW2 A;  2LYZ A;  1QSA A;  5LVI A;  2W1X A;  4R0F A;  3ZVQ A;  2DQE Y;  2BQO A;  2YBI A;  5APF A;  2DBT A;  1MEL L;  4U3X B;  1XGQ C;  1UIE A;  1C43 A;  4I8S A;  1OQM A;  5LVH A;  1HF4 A;  1IWW A;  4LT2 A;  1OUG A;  1UC0 A;  1GE4 A;  3ZVQ B;  1QTE A;  1C7P A;  5KJ9 A;  4W96 A;  4QEQ A;  2MEH A;  4HJV A;  1G7H C;  4H93 A;  3TXE A;  2FBB A;  2W1M A;  4G49 A;  4CHX A;  4NGO A;  5B1G A;  1IR7 A;  1OUF A;  4DD9 A;  1N4F A;  1GF4 A;  1VAT A;  5LVJ A;  1LZA A;  4H9C A;  1HEN A;  5F9U A;  4ML7 A;  1B2K A;  1JKA A;  1JSE A;  1LJ4 A;  3W6A A;  1REZ A;  1NBY C;  1LHH A;  3HBD A;  4LT1 A;  1D0K A;  1D6Q A;  3QE8 A;  3W6E A;  2H9K A;  4H94 A;  4D9Z A;  1JJ1 A;  1NDM C;  1CKG A;  5B05 A;  1ZV5 L;  2G4Q A;  3RNX A;  1GB8 A;  3WU7 A;  3W3E A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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