4O5FA

Crystal structure of type iii pantothenate kinase from burkholderia thailandensis in complex with pantothenate and phosphate
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
MSGVCLLIDAGNSRIKWALADTGRHFVTSGAFEHADDTPDWSTLPAPRGAWISNVAGDAAAARIDALIDAHWPALPRTVVRACAAQCGVTNGYAEPARLGSDRWAGLIGAHAAFPGEHLLIATFGTATTLEALRADGRFTGGLIAPGWALMMRSLGMHTAQLPTVSIDAATSLLDELAANDAHAPFAIDTPHALSAGCLQAQAGLIERAWRDLEKAWKAPVRLVLSGGAADAIVRALTVPHTRHDTLVLTGLALIAHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Type III pantothenate kinase
publication title Crystal structure of Type III pantothenate kinase from Burkholderia thailandensis in complex with pantothenate and phosphate
rcsb
source organism Burkholderia thailandensis
molecule tags Transferase
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o5fA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o5fA02
3SMPA 2Q0UA 1KXPA 3SJHA 5BPLA 3RSEA 2CH5A 5EX5A 4XH1A 1K8KB 3I33A 1RGIA 3AARA 5KPZA 2AP1A 5BPNA 4ISEA 1MA9B 4FOIA 2QWRA 3KHYA 1NGFA 3UKUB 5BRDA 2NZTA 3R6MA 3J8AA 2I7NA 3VGKA 4KBOA 5KQDA 2BUPA 2QWOA 2IVOA 4H0YB 3WT0A 1X3MA 3AAPA 3A5LC 1BOTO 2YHYA 4MO4A 3R9PA 2CGKA 1SZ2A 4BRMA 2Q1NA 4GNIA 4CZEA 2E2NA 3VGMA 4CZGA 2I7PA 2E20A 3ATUA 4PKHA 4BGAA 3H3OB 1QZ5A 2W40A 1NGEA 4K43A 3FZHA 1IJJA 5AQRA 4BR7A 3LM9A 3VESA 2GUPA 1TUUA 2FXUA 1WOQA 5AQUA 3MN7A 3WEEA 4B1VA 3DWLA 1T6CA 5KQ8A 4PKGA 2FSKA 5AQPA 3WXJA 3CETA 2V52B 4QS7A 3ENOA 4BGBA 4IJAA 2P9IB 2HF3A 3L0QA 3GE1A 2YJFA 3L6QA 1RDWX 3FFKB 2A3ZA 3C0BA 4A2BA 1E4FT 3GOIA 4MLHA 2ASOA 4ISFA 4DQ8A 1NLVA 4NO7A 1TUYA 4BRGA 3AY9A 4CBUA 5I9EB 2P9LB 4BC2A 3JXUA 1U2VB 3KVGA 5AQSA 2HF4A 4PL7A 4BG9A 3IFRA 3O80A 1D4XA 3CQYA 5AQGA 3RSEB 1P8ZA 1NGHA 2Q36A 4BR5A 4MO5A 5FPMA 1NGAA 5LJWA 1U6ZA 5AQQA 5AZIA 4BRHA 3ZX3A 2CGLA 3LL3A 4CJ7A 1HJOA 1HLUA 2D0PA 3D7EO 4BR9A 1GLLO 4A62A 4BROA 4H0PA 1CZAN 2QXLA 5EVZA 3GBTA 3QFPA 1T6DA 2E2PA 4GY2B 5F0XA 3S41A 3JS6A 4A61A 2QWNA 1ATSA 3LDPA 1XUPO 2E2OA 3WEEB 3H46O 5BN9A 4QS9A 3KZBA 4BR2A 3A8YA 4FWKA 4CD3A 1ZXOA 4XEIA 4BRCA 3U9ZA 4L3QA 3UKRA 4Z94A 4AM7A 2YJEA 3WXKA 1JCGA 2A42A 4JAXA 5JMVA 2H3GX 3VF4A 4LC9B 5AQHA 1QHAA 3HM8A 2ZGZA 5AQXA 3ZX2A 5LJVA 3IMXA 4ISGA 3EO3A 3HZ6A 3M3ZA 2D1KA 3R8EA 1NGIA 4FWQA 3O4WA 5FPNA 3U8XA 5BRHA 2ASMA 4WQ5A 5AQFA 2CH6A 4WQ5C 1T44A 2VYPA 1HKBA 2GTDA 3FR0A 4K25A 4M7YA 1GLCG 2WUSA 2V51B 2A40A 4YDUA 5AQLA 3WUHA 1GLJO 1J6ZA 5AQNA 1JCFA 2BTFA 3DXMA 5EY4A 1HUXA 1KAZA 4BRQA 4CZKA 1EQYA 3VF2A 2W41A 5AZIB 1MDUB 3D2EA 4H0OA 3QDKA 4CI6A 1NWKA 4BRKA 3BEXA 1ATRA 4EHTA 1OKJA 2J4RA 3I8BA 5BPMA 2PAVA 1SAZA 4H5VA 3IDHA 4JN4A 1BUPA 1HPMA 4B9QA 3CJAA 4FWSA 3EN9A 3VETA 2ZGYA 5AQWA 3VEOA 4H0XB 4K41A 3H6EA 3SK3A 3FGUA 3EL2A 4H0VB 3BF1A 1TYQA 3QBWA 4DCHA 3LM2A 1ZC6A 4IWVA 5AQIA 3UB5A 2D0OA 5AQOA 3B8AX 2OANA 4O8KA 4B1WB 4M63C 4DB3A 4C23A 2GWJA 3VEVA 2VWBA 3FE1A 4PL8A 3H45C 1YUWA 2QWPA 5E26A 3ZEUA 1NGDA 4CZMA 1LCUA 4FWOA 4IXCA 4RCHA 3QB0A 3A5NC 3H1QA 3O1BA 3CJ9A 4RTFD 3GG4A 3LDNA 4O5FA 1YVNA 3VERA 2YHWA 5BN8A 3DXMB 5AQZA 3VOVA 3MK6A 3L4IA 1ESVA 2Q31A 4BG8A 2DPNA 4BC5A 4CD1A 2YCHA 3CIPA 4FWRA 3MDQA 3D2EB 2PBDA 4H5RA 2E2QA 3MMVA 1BA1A 2CGJA 4RWTA 1WUAA 4HWIA 3UE5A 3BUZB 3CJ7A 1DEJA 5F2RA 3EKSA 1V4SA 2P9KA 4BVOA 2E1ZA 3WQTA 1NGJA 4B1ZA 3FZKA 3VEZA 4JD2A 1S22A 4FWPA 2P9PA 3BF3A 3H3NO 5F1XA 4IZ9A 5JICA 3A5OC 3DXKA 4M7XA 3VEXA 5AQVA 4F9OA 1C0GA 1X9JA 1TYQB 3AAQA 3QICA 5FPEA 4H5NA 5AQMA 4H5TA 5CE3A 4B1YB 2EWSA 3CJ1A 1DKGD 3P4IA 5AQJA 1QZ6A 1QQOA 2P9IA 4FWNA 3W3DA 4XH4A 4B1XB 1QQNA 1BDGA 2GELA 2AA4A 4FO0A 1GLDG 5ELZA 3IUCA 4I6MA 4BC4A 3QMLA 3CQXA 3M1FA 4WQ4A 4YDUC 3VEWA 5EXWA 4BRLA 3F9MA 4WYBA 1X3NA 3ZEUB 2IVNA 4EIAA 3MN5A 2F9WA 3DAWA 2KHOA 2FLOA 2HOEA 1IG8A 4MLEA 1GLBG 2Q0RA 3MN9A 4DHYA 1RFQA 3H1VX 1ZBSA 4E1JA 1KAYA 3HI0A 1BA0A 1HKGA 2NRHA 2P9UA 5LY3A 3EKUA 2GEMA 4FPBA 3FZLA 2QM1A 4H0TB 5JLHA 2QWQA 3CJCA 4BRFA 4CZFA 2QWMA 1NM1A 4FPAA 2UYTA 3O5BA 4BC3A 1KAXA 4NB4A 5BR9A 4K42A 2ASPA 5AFUA 3O8MA 3ZETA 3CI5A 1S3XA 3FLCO 3HTVA 4CZLA 5KPRA 2P9NA 1NGBA 3O6WA 4BR0A 2P9KB 2Q2RA 3VENA 1R59O 1NBWA 4H5WA 3UKRB 2E8AA 3D2FA 4JD2B 3HBTA 1Z05A 3CERA 4EAHD 5JLFA 1XC3A 1DGKN 2P9PB 4FWLA 5AFUH 2P9SA 3DXKB 3TU5A 5AZJA 1LOTB 3O08A 5E84A 1ATNA 3BP8A 3FZMA 3DJCA 3A0IX 2QWLA 3C7NA 2ITMA 2HMPA 1NMDA 3OHRA 2IVPA 3GDQA 1C0FA 4JHDA 4BRPA 4H03B 1YAGA 3MN6A 2A6AA 1HKCA 3U4LA 2E1YA 2YI1A 4FSVA 2V7YA 3O1WA 4EFHA 4I6MB 4A2AA 2V7ZA 1JCEA 2QW9A 3EZWA 3TPQA 3ULEA 1GLAG 4CBWA 1H1VA 3A5MC 3QFUA 4FWMA 4BREA 2ZWHA 4B1UB 4BQZA 3W0LA 5BREA 4HTLA 3WQUA 3ATVA 1G99A 4BQLA 1GLEG 1K8KA 4BRNA 1BG3A 1XQSC 2F9TA 2YHXA 3LDLA 4J8FA 3ZX0A 3WXIA 5KPTA 4JNEA 3UKUA 5BRFA 1GLFO 1MWKA 1BO5O 2FSJA 2VCPA 5ADXA 1MWMA 2P9UB 1Y64A 2A5XA 2FF3B 4EHUA 5FPDA 1SQKA 1NGCA 4CBXA 4BR4A 3MCPA 1V4TA 3QBXA 4CZHA 2FF6A 1BWFO 2ZF5O 5AQKA 1BU6O 1NGGA 4FL9A 4IJNA 4IO8A 1E4GT 3ZETB 2E88A 3WXLA 2IIRA 4Y0WA 5ADXH 3HSCA 2P9NB 3SMSA 3CJBA 4BRDA 4FOEA 4QS8A 4XH5A 3M6GA 5B8HA 3VGLA 3FZFA 2NLXA 3VF6A 3D2FB 4AM6A 1YXQA 1HX1A 2A41A 3CHWA 3GL1A 5AQYA 3SLCA 2P9SB 5AQTA 5AZJB 1QQMA 2Q97A 5TKYA 2FSNA 4BRIA 3C7NB 3G25A 3LDOA 1Z6RA 4BRAA 3VPZA 2D4WA 3VEYA 3LDQA 4JHDB 4WQ4C 2GWKA 4PKIA 3ID8A 5EOYA 5AR0A 2P9LA 4BVPA 4CZJA 4CZIA 1U2VA 3U9DA 1Q18A 3ENHA 3ULEB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VWKA 3OJSA 3SJHA 4DLGA 4XH1A 5KRTA 1RBVA 5KGWA 3WXMB 1A5WA 3J7AP 2RHKA 4ISEA 4KAZA 4JRPA 2QWRA 2BANA 3UKUB 2NZTA 3R6MA 3HL8A 2YNIA 3AVFA 4KBOA 4PUOA 3TSUA 2BUPA 2QWOA 1VQPN 1X3MA 3AAPA 1SZ2A 3EY1A 4JS4A 4DQSA 2E2NA 2QI2A 4NCGA 1ASVA 4PKHA 3CCEN 5IT9O 3WNHA 3NH1A 2W40A 2X6SA 1NGEA 4DR5K 3TANA 4M3WA 4BR7A 3LM9A 1E3MA 5J2NA 3MECA 4DQRA 2UUBK 3SV4A 1CXUA 4KHYA 1T6CA 3V6DA 1T05A 1HNVA 3KK1A 1UA1A 3WXJA 3THYA 4KHQA 3TAEA 4O0IA 2HF3A 3U3GA 3CFRA 4FLVA 4LF4K 4JKFA 3C6HA 4JYAK 1VQON 4B9UA 4GV3A 4DTUA 1EX4A 3CCRN 1OVYA 2WBNA 4B8AB 4FM0A 3GOIA 4DQ8A 3AY9A 3EE8A 3L2UA 3QO9A 5I9EB 1QSYA 2P9LB 3HPOA 5D3GA 4F2RA 4BC2A 3PV8A 3KVGA 5AQSA 1NU0A 2HF4A 2QXFA 3U3YA 1JLCA 1NG9A 1RT3A 4JI8K 4Z0UA 3V9UA 1JLQA 1D4XA 4NXMK 3RSEB 1P8ZA 2KQ2A 1XNQK 5C15A 3NCIA 3DYAA 3M8SA 4MDAA 2YKNA 3OYLA 5FRNA 5AZIA 1S72N 3ZX3A 3ITHA 1Q7YO 1JL1A 3SQ1A 1KFSA 2UXBK 1HJOA 1HLUA 4U7BA 2XO7A 3ZT3A 4HUEA 4BROA 3DLKA 3I8DA 1VSIA 3QFPA 4DF4A 5GIPA 4IOAL 3CC4N 2DFEA 4C1NI 4B3OA 3CMEN 3HPGA 1RDBA 4A61A 4WFBL 4W5NA 3SYZA 1XUPO 2E2OA 3H46O 4W5OA 3AA2A 3QERA 4BR2A 5DM6L 1LAVA 3M8QA 1FXXA 1O13A 1KD1O 1HQEA 1KQSM 4AM7A 3QEIA 3V9XA 4JAXA 1WN7A 1I39A 5JMVA 4DV7K 1DTTA 2VG5A 3SUQA 3HM8A 2ZGZA 3HZ6A 2O8FA 2E6LA 3QEPA 4N76A 1KVBA 3C65A 2ASMA 5AQFA 1C0UA 4W5QA 4DSIA 2VYPA 3FR0A 4K25A 4M7YA 3T7ZA 3JSMA 5DM7L 3K0SA 2V51B 1S5JA 2VQEK 3K9JA 2HHUA 2KKZA 4Y1CA 3OYBA 1RILA 3DXMA 4FZXC 4BRQA 4BDPA 3SQ2A 3DLHA 4A5AA 1L3UA 4KFBA 3D0PA 3D2EA 3LPTA 3HPHA 4KB0A 3QDKA 1NWKA 5C12A 4HCBA 4CHOA 1IO2A 1NK7A 2J4RA 5BPMA 4DTPA 1SAZA 4BE1A 4EZ9A 4DR7K 1RBSA 2OZMA 4F3OA 2F4VK 3EN9A 2HNDA 5J1EA 3VEOA 4H0XB 4K41A 4ZHRA 2PFUA 4E7KA 4LF6K 3Q7BA 1W0HA 4GV9A 4H0VB 2HBLA 4K8ZA 3NF7A 4B9VA 1NJXA 2KZMA 4BDZA 4FLUA 5IWAK 4KKOA 1BCOA 2BE2A 2D0OA 5AQOA 1SKWA 2OANA 2NUBA 4MDBA 4M63C 4Z4GA 4C23A 1SKSA 3H45C 4LY7A 4ELUA 3G10A 2ZD1A 1NGDA 4CZMA 4B9MA 1LCUA 4YOUA 3A2FA 2HNZA 4IFVA 2FBTA 3ASMA 3V81A 3T1HK 1YVNA 1T3VA 3NAEA 5BN8A 5AQZA 3VQCA 4M42A 3VOVA 3L4IA 3NE6A 4BG8A 1ILYA 4CD1A 2D5RA 3LDSA 1S9EA 3MDQA 1YTUA 3G0ZA 1O1WA 2CGJA 4X64K 4DV0K 2P51A 1IKWA 4C8KA 1EETA 4IDKA 4NCAA 2WTUA 4KREA 3UE5A 1RDDA 1DEJA 3RRGA 5C2FA 3NBPA 5F2RA 1EP4A 2P9KA 4CECA 3F9KA 4JS5A 3THWB 4JK9A 4IFEA 1WSJA 4CEZA 4AHUA 1S22A 3SBGA 2QA4N 4FWPA 1U04A 3OW2M 1RCHA 3BF3A 5F1XA 3DXKA 3MXMA 1YJ9N 3VEXA 1X9JA 4CFBA 2KFNA 4WFAL 4JKDA 4B1YB 3TSQA 4FWNA 4B3TK 4XH4A 3NHGA 2GELA 1NKCA 5ELZA 3IUCA 2RF2A 3M1FA 4ZTFA 2FBYA 4BRLA 4C8OA 1X3NA 3G4SN 2G8FA 2KHOA 3TR8A 4DG1A 3KWGA 1ZBHA 5HBMA 1WSIA 1RTIA 5H1SQ 4DHYA 3OYMA 2ZJQL 1L3SA 4CZFA 1Q82O 1NM1A 2UYTA 4CGGA 4CF9A 2GBZA 4DWIA 2ITGA 2ASPA 3HTVA 1U49A 1WLJA 3O9SA 1D8YA 1TL1A 2OPSA 3NVKA 3V9SA 1NGBA 3OYNA 1REVA 3KLIA 1R59O 4H5WA 1NJYA 4CF0A 4GVEA 3HT3A 3L2QA 5JLFA 3NDKA 3CM6A 2P9SA 1VSHA 5TKWA 1LOTB 3O08A 4Q5VA 1ATNA 5J2QA 2BH1A 3OHRA 3AVLA 3TAQA 2UUCK 4JHDA 4H03B 1YAGA 2O4GA 2O8EB 2P5OA 2YI1A 4FSVA 1NJIO 2HSTA 2YHAA 1SUQA 3O4NA 3ZSXA 2QW9A 1DLOA 4OPAA 3OYJA 1J5OA 4FJ9A 3TPQA 3ULEA 1ZBLA 3QFUA 4IOXA 1B9FA 1JL2A 1NK8A 4GKKK 4HTLA 3WQUA 3ATVA 1G99A 2Q3SA 1GLEG 1W9HA 4YOWA 4FJLA 2QK9A 4CHZA 2OTLN 4CJKA 4I2PA 1GLFO 1HNZK 5ADXA 2ZJRL 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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