4O5FA

Crystal structure of type iii pantothenate kinase from burkholderia thailandensis in complex with pantothenate and phosphate
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
MSGVCLLIDAGNSRIKWALADTGRHFVTSGAFEHADDTPDWSTLPAPRGAWISNVAGDAAAARIDALIDAHWPALPRTVVRACAAQCGVTNGYAEPARLGSDRWAGLIGAHAAFPGEHLLIATFGTATTLEALRADGRFTGGLIAPGWALMMRSLGMHTAQLPTVSIDAATSLLDELAANDAHAPFAIDTPHALSAGCLQAQAGLIERAWRDLEKAWKAPVRLVLSGGAADAIVRALTVPHTRHDTLVLTGLALIAHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Type III pantothenate kinase from Burkholderia thailandensis in complex with pantothenate and phosphate
rcsb
source organism Burkholderia thailandensis
molecule tags Transferase
molecule keywords Type III pantothenate kinase
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o5fA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o5fA02
5F0XA 2P9SB 4FOIA 3LDOA 4CZLA 2GEMA 4JHDA 2ZGZA 1NMDA 2ZWHA 3JXUA 4K41A 4YDUC 2Q31A 4PKIA 3VGLA 3WXJA 4KBOA 2E1ZA 4FWSA 4XEIA 3HBTA 3IFRA 3P4IA 3O80A 3GL1A 1XUPO 4BC3A 2Q1NA 1RFQA 4F9OA 3L4IA 1XQSC 3DWLA 3O08A 5AQPA 4FWQA 1TYQA 5EX5A 1ZC6A 4BVOA 4CBUA 1GLEG 2ASOA 3W3DA 4EFHA 2P9UB 3RSEA 3W0LA 5AQWA 3HM8A 4BC2A 1IJJA 3MDQA 2A6AA 4FWRA 2FF6A 4H03B 4B1YB 3O1BA 2HF3A 3DXMB 4YDUA 2VCPA 4AM6A 1LOTB 4BRFA 2QXLA 3AY9A 3ENHA 5BPNA 2P9NB 2D4WA 2YJEA 1DEJA 5BRFA 1QQMA 2KHOA 2QWMA 4IZ9A 2YJFA 4J8FA 4M63C 4DQ8A 1LCUA 3WXIA 1HUXA 3FGUA 3FZKA 4BGAA 3FZHA 1U6ZA 4EAHD 3LDQA 2P9LB 2QWPA 4JD2B 2UYTA 4L3QA 4BR2A 1DKGD 1D4XA 1J6ZA 3VERA 3LM2A 4GY2B 3LDPA 1BOTO 5BN9A 3KHYA 5E84A 4CJ7A 3DXMA 1KAZA 3ULEA 2BUPA 3BP8A 3FE1A 3B8AX 4PL8A 1Q18A 4O8KA 2ZF5O 2J4RA 4H5TA 3EKSA 2ZGYA 1RDWX 3IMXA 4FWLA 4CZIA 3D2FA 2CH6A 4MO4A 2I7PA 3EKUA 5AQGA 4A2BA 2VWBA 4PKGA 5BPLA 3AAPA 3SMSA 3ZETA 4H5RA 1Z6RA 2FF3B 3CJBA 5AQSA 3D2EB 4A2AA 2E2PA 4BR0A 4CZKA 4JD2A 4BRIA 3UE5A 1MA9B 2Q97A 5AQFA 3ZEUA 4BRCA 2ITMA 1QZ5A 3SK3A 4A62A 5EOYA 1NGAA 1QQNA 3LDLA 4WQ5A 2P9PB 3KVGA 1RGIA 5EY4A 4K43A 1BG3A 4B1ZA 2W40A 4FWKA 5F2RA 2VYPA 2YI1A 3SLCA 2E20A 1YVNA 3MCPA 3M3ZA 4JNEA 1GLJO 1H1VA 1NGCA 4K42A 3U8XA 4BQLA 3MN9A 3UKRB 2IIRA 3EL2A 3LDNA 4WYBA 4QS8A 1HKGA 1HKCA 3M1FA 5AQMA 1GLDG 2CGJA 3CQYA 5AQTA 4BQZA 3H3OB 3C7NA 4CZFA 5AQJA 3S41A 2I7NA 5BRHA 1QZ6A 2W41A 2QWQA 4MLHA 3D7EO 1C0FA 2QWNA 4CD3A 1X3MA 3A8YA 2QWOA 5FPDA 1YXQA 1WOQA 4Z94A 1NGBA 4CZGA 2Q36A 3GDQA 4NB4A 2HOEA 4H5WA 1QHAA 4JAXA 5BR9A 4BRKA 4XH1A 5JLFA 3GOIA 1MWMA 4BC4A 2FLOA 4WQ4C 3I33A 1YAGA 2ASMA 1BWFO 3DAWA 4FWNA 1EQYA 2NRHA 3WT0A 5KPRA 2YHWA 2P9IB 4XH4A 3DXKB 5LJWA 1BA0A 5AQKA 1WUAA 4FO0A 4HTLA 2E1YA 3BF1A 2P9KA 3A0IX 3O8MA 2CGKA 4IWVA 1KXPA 3R8EA 3QFUA 4EHUA 3FZMA 3BUZB 3SJHA 4H0VB 1JCEA 4BR7A 1X9JA 4FPAA 1OKJA 4MO5A 4WQ4A 4DCHA 4JHDB 1MDUB 3D2FB 3BEXA 4BG8A 4FOEA 3AAQA 1K8KA 1HPMA 1P8ZA 3FR0A 4Y0WA 3U4LA 4BRDA 3WEEB 3VEYA 3CJ7A 4M7YA 3JS6A 3A5OC 3H1QA 3EN9A 4ISGA 4M7XA 3FFKB 3ZX0A 4CBXA 1TUUA 1ATRA 5LJVA 3D2EA 1QQOA 2YCHA 1V4SA 5JICA 1NGGA 5AZIB 4EIAA 5BPMA 4BROA 4BRPA 2A3ZA 2EWSA 3VEWA 4B9QA 1XC3A 2AA4A 2Q0UA 2CH5A 2FSKA 3CJ9A 1NGJA 4BR4A 1IG8A 3MN7A 1C0GA 5KQ8A 5FPNA 4BREA 3WXLA 2FSNA 1NBWA 3MK6A 1BU6O 3AARA 5AQRA 2P9UA 3M6GA 1HKBA 2ASPA 1HX1A 1JCFA 1BA1A 5AR0A 3FZLA 2E8AA 3WQUA 1E4FT 3CQXA 2DPNA 5FPEA 2HMPA 1Z05A 5ADXA 3U9DA 1S22A 4BGBA 4I6MB 1GLFO 3TU5A 5AFUH 4CI6A 2D0OA 3A5NC 5I9EB 1YUWA 1TUYA 1NGDA 1V4TA 3IUCA 3R9PA 3VF4A 5AZJB 3GG4A 3DXKA 4IO8A 4BRHA 5AZIA 3LM9A 3O1WA 3VEZA 1MWKA 3IDHA 1BO5O 4FWPA 3ZETB 5AQLA 1GLAG 3DJCA 2NLXA 4BRQA 5AQQA 2Q0RA 2GTDA 4AM7A 3UKUA 4BG9A 5AQIA 2D0PA 3QDKA 3TPQA 4CZJA 1HJOA 1BUPA 1NM1A 4PKHA 3CI5A 4B1XB 4K25A 5JMVA 3WXKA 5JLHA 3QICA 4C23A 3H3NO 4E1JA 1U2VB 3VGKA 3CIPA 3SMPA 1R59O 2FXUA 4RTFD 1NWKA 2GWKA 2V52B 1T6DA 4BRMA 4CZEA 3MMVA 3MN6A 3O5BA 4H0TB 5AQYA 4FL9A 3CJ1A 4O5FA 5BRDA 4B1WB 2A42A 3VPZA 4IJAA 3GE1A 3KZBA 3I8BA 2HF4A 5E26A 4XH5A 4BC5A 4IXCA 2YHXA 2P9KB 5AQVA 2GUPA 1NLVA 1X3NA 3J8AA 1S3XA 3HSCA 3R6MA 1NGIA 4CD1A 3ZX2A 2FSJA 3QB0A 2F9WA 4RCHA 4BRAA 3H6EA 1SQKA 4H0OA 3HZ6A 2QWRA 3VOVA 2P9NA 1ZBSA 5TKYA 5AQNA 3HTVA 3HI0A 5ADXH 4ISEA 4H5VA 4CZHA 4FWMA 5B8HA 2QM1A 4FPBA 4CBWA 1ATSA 2GWJA 4DHYA 2P9SA 1NGHA 2YHYA 3VEOA 2NZTA 3QFPA 5AQOA 3L0QA 5KQDA 1NGEA 4B1UB 3O4WA 5CE3A 2E2NA 3G25A 4BR9A 5BN8A 2E88A 3UKRA 4EHTA 2A40A 3H45C 1E4GT 3VESA 3QMLA 3ZX3A 3UB5A 3F9MA 4BRGA 1GLBG 5AQZA 3UKUB 3WEEA 2Q2RA 2V7ZA 3ATUA 3EO3A 3ULEB 4FSVA 4HWIA 1HLUA 1KAXA 1JCGA 3MN5A 2PBDA 2V7YA 5AQXA 5KPTA 4ISFA 4H5NA 3VGMA 3WQTA 1K8KB 1ATNA 2P9IA 3LL3A 3VF2A 1GLCG 4BVPA 1GLLO 2IVOA 4JN4A 1ESVA 1T44A 4QS7A 4BR5A 3QBXA 1NGFA 2A41A 3A5MC 3U9ZA 2H3GX 4A61A 5LY3A 2F9TA 3H1VX 3CJAA 1T6CA 3VEXA 2IVPA 3EZWA 4NO7A 4LC9B 2P9LA 4BRNA 3A5LC 4BRLA 5EXWA 3RSEB 1U2VA 3FLCO 5AQUA 3CETA 4H0YB 1CZAN 2BTFA 2CGLA 1DGKN 2AP1A 2E2OA 2GELA 2QW9A 3FZFA 4B1VA 2V51B 4I6MA 4H0PA 3BF3A 3H46O 5ELZA 4CZMA 2WUSA 3WUHA 3VF6A 3OHRA 2D1KA 5FPMA 1ZXOA 3CJCA 4H0XB 2OANA 3ID8A 5EVZA 3ATVA 3VETA 3QBWA 4RWTA 1SZ2A 3C7NB 1G99A 3VEVA 5AFUA 5AZJA 2E2QA 3L6QA 5KPZA 5AQHA 4WQ5C 1SAZA 4IJNA 1BDGA 3VENA 3GBTA 2PAVA 2IVNA 2QWLA 2A5XA 4PL7A 1Y64A 4GNIA 1TYQB 4QS9A 4MLEA 5BREA 3ZEUB 3ENOA 1KAYA 3CHWA 4FWOA 3C0BA 5F1XA 4DB3A 3CERA 3O6WA 2P9PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Q82O 4B3TK 3CC2N 3E01A 5GINA 2GV9A 3M8QA 4JHDA 4A57A 3CCSN 3QEXA 3MXIA 3KIOA 2W6KA 3OS1A 4KBOA 3ALYA 4FWSA 1X1PA 4XEIA 3HBTA 3P4IA 3O80A 4JS5A 3OYEA 3ZLJA 2G8VA 1BISA 3DLKA 3O08A 4YOUA 1TYQA 5EX5A 3K5NA 1ZC6A 4BVOA 2ASOA 5AQWA 4M45A 1IJJA 3AO4A 3P1GA 1BCMA 4KHUA 3O1BA 4YDUA 3DXMB 4AM6A 4BRFA 1RT5A 2KW4A 3AY9A 3ENHA 2YNHA 3O3FA 5AJ3K 4M3XA 2P9NB 3DLGA 3SZ2A 1RBRA 4IFEA 2KHOA 2G8IA 4FLWA 4WFNL 4AQYK 3K9JA 4UQGA 3KKRA 3FGUA 3WXIA 5SZTA 4DFJA 3ZT4A 2BDPA 3LP0A 3FZHA 3LP2A 1L5UA 4DTNA 3LDQA 1JXEA 4FJLA 4I7FA 2RE2A 3NVMA 3VERA 1D4XA 3VQAA 4GY2B 1BOTO 3KHYA 2KTQA 4DQQA 1JLQA 4IDHA 4CIFA 5E84A 3AA4A 4JLHA 3ULEA 1OH8A 2D0BA 4FLUA 1Q18A 4OPJA 2ZF5O 2J4RA 2Z1JA 4H5TA 3ZSYA 1RDWX 1S6QA 3D2FA 2O8EB 4CEBA 4FXDA 3EKUA 2B5JA 3ZSXA 3SAHA 3CCLN 3CJBA 4JV5K 3QEVA 5AQSA 3AGRA 3NMUA 4I2PA 4JI1K 5J1EA 4BR0A 1VRTA 2QK9A 1JLEA 4JD2A 2D0CA 1MA9B 3E9PA 1VHXA 2ITMA 5HL7L 1NGAA 1QQNA 3LDLA 3V9XA 1U45A 5EY4A 1BG3A 4FZXC 2W40A 4B9NA 4H4OA 1C0UA 3CQ8A 3SLCA 3RMDA 3J80O 4QOZB 2DFHA 3KWIA 4QS8A 1HKGA 5AQMA 1GLDG 3LDSA 3CQYA 3V1QA 5AQTA 5AQJA 3S41A 4CIGA 3WNHA 3HPHA 1QZ6A 4KTZA 2QWQA 3LZIA 1X3MA 1XMOK 2HNZA 1RT4A 1YI2N 3LPUA 4M3ZA 2Y1JA 4CZGA 3VQ5A 3KKSA 4O0JA 3PY8A 1QHAA 4BRKA 4OPHA 5JLFA 3OYMA 3SJJA 2FLOA 3AVAA 4CGFA 1K73O 4JK7A 1VQMN 3VTIA 4M41A 4FWNA 2NRHA 3WT0A 3MWPA 1SL2A 4DV1K 5LJWA 1BA0A 5M1FA 5HRSA 3UIQA 3A0IX 3NH2A 4AHTA 3DOLA 1KXPA 3QFUA 4HUFA 3BUZB 3SJHA 1JCEA 1VSDA 1TK8A 3NGZA 1RT2A 4WFAL 1QSLA 2UXBK 3PIOL 1ZYQA 2FBTA 4FJIA 3D2FB 3MCAB 4FOEA 4DV7K 3TAQA 1K8KA 1HPMA 4Y0WA 3VTHA 5JVGL 4BRDA 3CCRN 3P83D 1S1WA 3VEYA 3NVKA 4M7YA 3A5OC 1IKYA 5DMRA 4M7XA 3VQ9A 2WC9A 1TUUA 4FCYA 4LF6K 3HK2A 1ITGA 4I2QA 1NJXA 4DTPA 2RPIA 4JRPA 1JLFA 2IC3A 3AVBA 3L3UA 1XC3A 5FRMA 2CH5A 2XY8A 4FYDA 5KQ8A 4DTSA 1I39A 4E89A 5DK5A 1XWLA 3P39A 1TK5A 3BY5A 3ITHA 3MK6A 5IT9O 3V4IA 1J5OA 3I56N 4DLGA 1HX1A 1JCFA 1BA1A 2E4LA 1NJZA 2NRWA 2O8DB 4K8ZA 3T1HK 3VA0A 4J2AA 5KRSA 3ZT0A 1XMQK 1YUWA 3L8BA 4AILC 1NGDA 5FROA 5AZIA 2QA4N 3O1WA 1MWKA 1RDDA 4BE1A 3IDHA 1BO5O 4OKEA 1GLAG 3HYFA 4CFCA 3AVIA 4OKKA 4CCHA 4RW8A 1C0MA 3ZYYX 4YOXA 4DSJA 3IKMA 3TPQA 1NM1A 3SUOA 1O1WA 3O3GA 4A5AA 1JXBA 2DY4A 1HQUA 3CCMN 2VQFK 1QSSA 3EEQA 4CZEA 2V52B 3DRPA 3MN6A 2G8WA 1S1VA 4FL9A 4LFCK 4E7JA 4IFVA 3VPZA 3KZBA 3J7YP 4W5TA 2HF4A 1U48A 1J54A 4FJ8A 4LSLA 2BANA 1Q86O 3QNNA 4IXCA 3M8RA 3WXMB 3LZJA 1XHXA 3QEWA 4Z4CA 1HNZK 1X3NA 4OPAA 3MX5A 4JKEA 4W5QA 4BDPA 4Q5VA 4DV2K 4FLXA 2FBVA 1T7PA 2F9WA 4BRAA 1C1BA 1KCFA 1KC8O 3QESA 2HHXA 4U7BA 5TKYA 1VQLN 2P5GA 3HI0A 3VQQA 1BIZA 4FM1A 5M1PA 3LPTA 1KFSA 5AQOA 4KHWA 1WAFA 1SL0A 3PX0A 5CE3A 2WBNA 2YV0X 3G25A 4KKOA 3F73A 2UU9K 3H45C 3VESA 3QMLA 1T8EA 4KH4A 3TR8A 4LF5K 3UKUB 5AQZA 1GLBG 2WFBA 4ICLA 1O13A 2Z1GA 1N36K 2VG7A 3HPGA 2PY5A 1KAXA 2V7YA 5KPTA 4OVLA 1CZ9A 3VGMA 3WQTA 4JEPA 1K8KB 1NOZA 3DLLL 1YVUA 4OGCA 3NF8A 3CFPA 1GLCG 1L3TA 3HP6A 3EE8A 2E6LA 3M8PA 4PUOA 3ULDA 1NGFA 3O9UA 2A41A 2JLEA 3H1VX 4TSXA 5LY3A 4IEEA 2QKBA 1NK7A 1YT3A 2HNDA 2IVPA 3EZWA 4NO7A 3CM5A 4DR3K 3E9OA 3LALA 1YJWN 3J7ZO 4NYFA 4BRLA 3D6RA 1RT3A 3RSEB 4CJUA 3FLCO 5AQUA 3SYZA 3LANA 3OY9A 1CZAN 2AP1A 1XNQK 2GELA 2QW9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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