4O5FA

Crystal structure of type iii pantothenate kinase from burkholderia thailandensis in complex with pantothenate and phosphate
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
b'MSGVCLLIDAGNSRIKWALADTGRHFVTSGAFEHADDTPDWSTLPAPRGAWISNVAGDAAAARIDALIDAHWPALPRTVVRACAAQCGVTNGYAEPARLGSDRWAGLIGAHAAFPGEHLLIATFGTATTLEALRADGRFTGGLIAPGWALMMRSLGMHTAQLPTVSIDAATSLLDELAANDAHAPFAIDTPHALSAGCLQAQAGLIERAWRDLEKAWKAPVRLVLSGGAADAIVRALTVPHTRHDTLVLTGLALIAHS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Type III pantothenate kinase from Burkholderia thailandensis in complex with pantothenate and phosphate
rcsb
molecule keywords Type III pantothenate kinase
source organism Burkholderia thailandensis
molecule tags Transferase
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o5fA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o5fA02
4BRHA 3ATUA 5AQXA 3O4WA 4CZLA 2AP1A 2E2NA 2IVOA 4H5RA 4MO4A 4BVPA 1YVNA 4BR0A 5AQWA 1NGAA 4QS9A 3WXIA 2VWBA 1LOTB 3FLCO 2ASMA 4CZMA 4FWQA 3MK6A 4GNIA 1ATSA 3H1VX 4B1YB 1Q18A 4H5WA 3ZETA 3BUZB 4CBUA 3O80A 3KHYA 1HJOA 1T6DA 2QWRA 3FZKA 4BG9A 4FWLA 5KPTA 5JICA 3UB5A 3UKRA 1GLFO 3HBTA 1S22A 3VESA 3ENHA 3L6QA 3VGKA 3O8MA 2P9LB 1MDUB 5AQKA 4K43A 4DHYA 3BF3A 2D1KA 2CGJA 2FSNA 2A40A 2QWLA 2PAVA 4B1ZA 4DB3A 1S3XA 1T6CA 1IG8A 4QS7A 4BC2A 5AZJA 2W41A 1BU6O 4FL9A 4BR4A 2P9NB 2YHYA 4YDUA 4BVOA 3CJ1A 2E2QA 3VEWA 2P9KA 3QDKA 2GELA 4F9OA 3O1WA 1NM1A 3WXLA 2CH6A 1SAZA 3H3OB 4E1JA 1ATRA 1BO5O 3ULEA 5AQRA 5B8HA 1HLUA 4IWVA 4B1WB 1C0GA 3O6WA 1NGEA 3CERA 2P9UB 5CE3A 3U9ZA 1GLAG 3J8AA 4BRMA 3LDNA 4FWSA 3IFRA 3LM2A 2A3ZA 3S41A 4BC5A 3H46O 4A61A 4B9QA 3M6GA 1QQMA 3FZLA 3VEYA 3A8YA 4C23A 1G99A 2ASPA 4GY2B 3CQYA 1DKGD 3WXKA 2ZGZA 1U6ZA 3W3DA 4CD3A 5ELZA 2AA4A 5LJWA 2QWNA 3ZX0A 4O8KA 1JCFA 4FWMA 3W0LA 3O5BA 5E84A 3ZEUA 1NGDA 5BN8A 1YUWA 1DEJA 4I6MA 1EQYA 2I7PA 4DCHA 5BRFA 3KZBA 3F9MA 3LM9A 2HF4A 3EN9A 4CZHA 4WYBA 4XH5A 3AAQA 1ATNA 3KVGA 3MN7A 4PL8A 4XEIA 3FGUA 3A0IX 5BR9A 5F0XA 3WEEB 3EZWA 2D0PA 2J4RA 2P9IA 4QS8A 2HF3A 1GLJO 4CZGA 3RSEA 4YDUC 3CJBA 4IO8A 3HTVA 5AQFA 3VENA 3VGLA 3VOVA 2A41A 5KQDA 3VEVA 5TKYA 5AQPA 3U9DA 2ASOA 3H6EA 4H0TB 5BRDA 2FSKA 2V7YA 4KBOA 2EWSA 4BREA 4JD2B 3VERA 3D2EA 1GLDG 4BRIA 3BF1A 4XH1A 1OKJA 1MA9B 1U2VB 2Q97A 2ZGYA 3QBWA 4H0OA 1QQNA 3DXKB 4BRAA 3WQTA 3VETA 5LJVA 1YAGA 2F9WA 1X3MA 5JMVA 2BUPA 5KPZA 3C7NA 1NGBA 2ZF5O 1ZBSA 1NLVA 2D4WA 1D4XA 2YHWA 1NMDA 4A2AA 2H3GX 5AFUA 1H1VA 3CJ9A 5EXWA 4H03B 3SMPA 3UE5A 5AQYA 3UKUB 2VYPA 3LDLA 1GLEG 3DWLA 5KQ8A 2E1YA 4FSVA 3MN9A 4IJAA 4BRNA 1XQSC 3SLCA 4B1VA 2QWMA 2P9LA 1LCUA 5EOYA 1DGKN 1WOQA 4H0VB 3ENOA 4J8FA 2YCHA 2P9PA 3SMSA 1X3NA 4O5FA 5BRHA 5JLFA 1ESVA 3P4IA 1Z05A 4AM6A 4PKGA 3LDOA 4BROA 3H45C 3HSCA 4JAXA 5AQGA 1E4GT 2Q0UA 4FOIA 2ITMA 3VEXA 2V7ZA 5AR0A 2Q1NA 5AZJB 4A2BA 5BN9A 5F1XA 1YXQA 2V51B 2P9KB 4BC4A 2HOEA 5ADXA 2GWJA 1NWKA 1KAZA 2CH5A 5BPMA 4RCHA 2Q0RA 2GTDA 2FSJA 2FF6A 1BUPA 3CETA 3DAWA 3VPZA 4BRDA 5I9EB 1TYQA 4PKIA 2WUSA 1KXPA 3G25A 5AQNA 1RDWX 3MMVA 2QM1A 3FZFA 5AFUH 3M3ZA 2Q36A 5AQJA 4NB4A 4H5TA 4CZKA 4IJNA 3WXJA 3WQUA 3ZEUB 5FPNA 4EFHA 2IVNA 3VF4A 1HPMA 1BDGA 1SZ2A 1V4TA 2P9UA 3R6MA 4I6MB 3ZX3A 4K41A 5AZIA 4DQ8A 5AQMA 3VEZA 2BTFA 1BOTO 1QZ6A 4WQ5C 4FPAA 1V4SA 2FLOA 4CZIA 3AAPA 5EX5A 1R59O 4EAHD 3FE1A 5FPEA 4RWTA 4H0PA 3RSEB 3ZX2A 5FPDA 1ZC6A 3A5OC 2DPNA 3H3NO 3QICA 2I7NA 2NRHA 1E4FT 1JCEA 4JHDA 2NZTA 1BA1A 3FR0A 2CGLA 1TUUA 2P9SB 3CJCA 5ADXH 3DJCA 1C0FA 3HZ6A 2F9TA 3D2EB 4CBXA 2FF3B 4ISGA 3VGMA 4LC9B 3R9PA 4FWPA 4MLEA 4FO0A 3M1FA 3OHRA 2A6AA 4HWIA 3DXMB 2GWKA 2QWQA 3BEXA 4HTLA 1KAYA 4FPBA 4K42A 4A62A 5E26A 2YI1A 1K8KA 1Y64A 3D7EO 5AQQA 4BRLA 1NGFA 4CZJA 1BA0A 4H5NA 1P8ZA 3QFPA 2E1ZA 1KAXA 2PBDA 4MO5A 2E2OA 2D0OA 4FWOA 3MN5A 5AQUA 2HMPA 3DXKA 3D2FA 3VF2A 4PL7A 3L4IA 2QXLA 2OANA 4BR7A 3A5LC 4JNEA 1TUYA 3SJHA 5JLHA 4BRPA 3ZETB 3GBTA 3HM8A 3IUCA 4H0XB 3MN6A 3EL2A 2P9PB 3GOIA 3LDPA 4FWKA 3C0BA 1NGGA 3UKRB 4EIAA 3UKUA 2GEMA 4K25A 1WUAA 4H5VA 4WQ5A 5FPMA 4BRGA 4PKHA 3AARA 3EKUA 3LDQA 4FWRA 1XC3A 1SQKA 5BPNA 3VF6A 3U8XA 4CZFA 3QBXA 3FFKB 3H1QA 3FZMA 5EY4A 5EVZA 3WT0A 4BRKA 3MDQA 4BRFA 4BRQA 3HI0A 3AY9A 1NBWA 3O08A 4NO7A 4BG8A 3VEOA 2E88A 4WQ4C 2GUPA 4BR5A 1MWMA 3ULEB 4BGAA 3U4LA 2Q31A 3IDHA 5AQZA 4CJ7A 4H0YB 4CBWA 3GL1A 4L3QA 4AM7A 1BWFO 2QWPA 2V52B 1Z6RA 5F2RA 3QB0A 2E8AA 5BREA 3EKSA 4Y0WA 4B1XB 2P9NA 1NGIA 4M7YA 1TYQB 3SK3A 1QZ5A 4ISEA 1X9JA 2YJFA 3ATVA 3QMLA 3ID8A 3I33A 1GLBG 3CIPA 1J6ZA 5AZIB 1NGCA 3JXUA 4B1UB 1BG3A 5KPRA 4CI6A 4XH4A 2IIRA 1GLCG 5AQTA 3I8BA 4BR2A 1JCGA 2P9IB 3BP8A 1HKCA 1RGIA 4FOEA 2QWOA 1IJJA 3L0QA 3TU5A 4EHUA 3B8AX 3A5NC 4BGBA 1T44A 4M7XA 4MLHA 4CZEA 2IVPA 5AQHA 3WUHA 5BPLA 3O1BA 4ISFA 3JS6A 4BQLA 5AQLA 5AQOA 4JHDB 3WEEA 2CGKA 4BC3A 1HKBA 3CJ7A 3FZHA 2NLXA 3GG4A 2A42A 2A5XA 4BRCA 2QW9A 3A5MC 3IMXA 4IXCA 3CHWA 1GLLO 2Q2RA 1ZXOA 3CJAA 1NGHA 1XUPO 3GDQA 4BQZA 3CI5A 3EO3A 2VCPA 1HUXA 4RTFD 4EHTA 2KHOA 3QFUA 2E20A 4M63C 4WQ4A 1HX1A 3R8EA 1QHAA 3C7NB 2E2PA 4IZ9A 4Z94A 1K8KB 2YHXA 3CQXA 1CZAN 2P9SA 4FWNA 4JD2A 1QQOA 3GE1A 2ZWHA 3TPQA 3LL3A 4JN4A 1MWKA 1U2VA 2W40A 2YJEA 2UYTA 5AQSA 5LY3A 1NGJA 4CD1A 1RFQA 3D2FB 5AQVA 3MCPA 2FXUA 5AQIA 3DXMA 4BR9A 1HKGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FK9A 4KFBA 4BRHA 1UA1A 5AQXA 3O4WA 2A1RA 4FLYA 5HROA 3CG7A 4OKEA 1TGOA 1YVNA 2HHQA 4N41A 2B4JA 1ASVA 3MK6A 4FJKA 1HYVA 3H1VX 4H5WA 4B3OA 1HJOA 2BGGA 3CCVN 2DTUA 1HQUA 2EHGA 3VA3A 3HPHA 3VA0A 1JLCA 3O8MA 4IOCL 4CE9A 2D1KA 1L3UA 4YY3K 2QWLA 3MXMA 4DB3A 4JKBA 2RE2A 4BC2A 3CCEN 4BR4A 1SS6A 2YHYA 3TWHA 3LAMA 2KKZA 3O9RA 2GELA 2KFZA 1SAZA 3H3OB 4E1JA 5GAGP 1QQCA 3ULEA 2HNDA 5B8HA 5CZ1A 3K0SA 2NRRA 1HLUA 1C0GA 2OTLN 3ISNC 2P9UB 3ZSXA 4FWSA 2A3ZA 5J2NA 3DOLA 4A61A 2O8FA 4B9QA 4W5OA 4FJIA 2OZSA 3E9OA 3VEYA 3A8YA 1J53A 4C23A 2ASPA 1BHLA 3CQYA 2ITGA 4JI3K 4CD3A 3KKRA 3ZX0A 4CEOA 5HRRA 3T1YK 3W0LA 3O5BA 5E84A 3ZEUA 3C94A 5BN8A 4Y1DA 3L3UA 4FK4A 3MXJA 3S3NA 1EQYA 4AHSA 4B8CA 4DUYK 4FLZA 3SAHA 3KZBA 1JL2A 3F9MA 2OTJN 3KLEA 4CHOA 4LFBK 4DQIA 4XH5A 1L3SA 4ID5A 2YV0X 3FGUA 4PUOA 5BR9A 3HVTA 1WSEA 2WC9A 2J4RA 2YNFA 4IDKA 2HF3A 1YJ9N 3AVAA 1BQNA 4DR1K 3CJBA 5GIPA 1MU2A 3AVBA 5C24A 2B6AA 2A41A 5TKWA 5KQDA 5C0YA 4FJ5A 3RR8A 2DFEA 4FW2A 4B08A 4E1NA 2PYLA 3HRGA 3QETA 2HBMA 4CHNA 4CJLA 4ELVA 3BF1A 4CHQA 1MA9B 5I42A 1FKPA 4LF9K 2ZGYA 3WNHA 3DXKB 4NCGA 1DTTA 4BRAA 3SUPA 3WQTA 3VETA 4F2RA 1YAGA 3TARA 3J7YP 2EX3A 2B5JA 3C7NA 3G6EN 2ZF5O 2D4WA 1D4XA 1NMDA 2H3GX 3NF9A 5AFUA 4W5TA 5EXWA 3RVCA 3K2PA 3NFAA 2VWKA 4DTJA 2PFUA 3LDLA 3HSTB 3DWLA 3AVIA 4FSVA 1VQ6N 4IJAA 4BRNA 1XQSC 4I2QA 3JYTA 2YNHA 1HNXK 3VQ9A 4KTZA 1X3NA 2UUBK 4CJVA 5JLFA 2X6SA 4JKGB 5MLCQ 1ESVA 1I94K 3P4IA 1Z05A 4A57A 4AM6A 4PKGA 1TK5A 1SL2A 4JAXA 4BDYA 1U4BA 5HRPA 3K58A 2Q0UA 3LAKA 4FOIA 2ITMA 2V7ZA 2Q1NA 2AJQA 5AZJB 4CJ4A 5BN9A 3G0ZA 3L2RA 4CIFA 3SZ2A 1W2BM 1RT3A 2RKIA 3P5JA 3MWTA 2GWJA 1KAZA 3PY8A 3M8RA 2Q0RA 3OYGA 1SL1A 1F21A 3J7ZO 1WLJA 3CF5L 2FF6A 4FJMA 3CETA 4DV3K 1GOAA 4Z4GA 4KTWA 3VPZA 5I9EB 4PKIA 3MMVA 4B9NA 3OVNA 2Q36A 3OYNA 4JRQA 3P38A 4IJNA 3VQCA 4L8RB 4EFHA 2IVNA 2P9UA 1UWBA 5AZIA 3CCUN 5AQMA 4C8MA 4CCHA 1JLBA 3VEZA 1BOTO 3CM5A 4FPAA 1V4SA 1NU0A 2O4GA 5FPEA 4KHWA 4RWTA 4FVMA 3CFRA 3ZX2A 2ZM6K 1CLQA 1ZC6A 2IS3A 4KHPK 3T1AA 3HL8A 3LZIA 1NKBA 1D8YA 3QICA 3SJJA 4FJGA 2YX6A 1FKOA 3CC2N 1VRTA 4J2BA 1NMNA 4FJ8A 3SQ4A 4JKHA 4K0KK 4A59A 2P9SB 4IBNA 1L5UA 1C0FA 2XRIA 3D2EB 1KRPA 4E0DA 4DS4A 2P5OA 3R9PA 1VSKA 4MLEA 2KZMA 5T7BA 4MFBA 2IOCA 4RW9A 5E26A 5AQQA 5DK5A 1KVBA 2HBKA 4DU3A 5C10A 3V6DA 2E1ZA 2WTUA 1KAXA 2XO7A 1RBTA 2HVIA 3ASMA 3VTHA 1WAJA 4MO5A 1LWFA 5AQUA 4Z4FA 3DXKA 3PLAA 2QXLA 4BE2A 4AQYK 2DY4A 4BR7A 3A5LC 5JLHA 3SJHA 1U47A 4BRPA 3GBTA 3HM8A 2O8DB 3IUCA 2P9PB 1JLEA 1IH7A 4HUEA 2HNYA 3LDPA 4FWKA 2FBTA 3RMCA 3C0BA 1YHQN 1NGGA 2ETJA 1JL1A 4JKEA 5J2QA 4Z4EA 1KC8O 4WQ5A 3ZCMA 1TKDA 4BRGA 3KLHA 5M1FA 3AO2A 4FWRA 3EY1A 3CD6N 3LPTA 1SQKA 1NOZA 5BPNA 2VQFK 3QBXA 4JKAA 1YTUA 3H1QA 3FZMA 2KW4A 3LDSA 4DMNA 4BRKA 3MDQA 3AO3A 5JVGL 1FW6A 4JKGA 4CK2A 1HPZA 1VHXA 4E7JA 4WQ4C 3AO1A 1VSFA 3IDHA 4CJ7A 5J2PA 4YOWA 3NVMA 3GL1A 4L3QA 4CJSA 1K9MO 4AM7A 1RT7A 1BWFO 2E8AA 3KK1A 1VQ9N 2P9NA 3OYLA 3R1XA 3SV3A 2BDPA 3MEEA 3SK3A 1BCOA 3M8PA 3HOSA 1XMOK 2IAJA 1GLBG 1X9MA 2ZE2A 1KFDA 3C6TA 2OYQA 4B1UB 2RHKA 3J80O 1BG3A 5KPRA 1IBMK 3O4NA 4XH4A 1GLCG 3VQ7A 1YITN 1JCGA 3PX6A 3OBYA 2P9IB 2RF2A 1HKCA 4FOEA 2QWOA 4OLBA 4JK9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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