4O5FA

Crystal structure of type iii pantothenate kinase from burkholderia thailandensis in complex with pantothenate and phosphate
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
MSGVCLLIDAGNSRIKWALADTGRHFVTSGAFEHADDTPDWSTLPAPRGAWISNVAGDAAAARIDALIDAHWPALPRTVVRACAAQCGVTNGYAEPARLGSDRWAGLIGAHAAFPGEHLLIATFGTATTLEALRADGRFTGGLIAPGWALMMRSLGMHTAQLPTVSIDAATSLLDELAANDAHAPFAIDTPHALSAGCLQAQAGLIERAWRDLEKAWKAPVRLVLSGGAADAIVRALTVPHTRHDTLVLTGLALIAHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Type III pantothenate kinase from Burkholderia thailandensis in complex with pantothenate and phosphate
rcsb
molecule keywords Type III pantothenate kinase
molecule tags Transferase
source organism Burkholderia thailandensis
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o5fA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o5fA02
4B9QA 5FPEA 4RCHA 3A5LC 4H5NA 4XH4A 1NGFA 1E4FT 5AQUA 4H0TB 5AQKA 4BR4A 5BPLA 3CHWA 4H0VB 2HF4A 4L3QA 5AQSA 2Q1NA 2Q97A 5AFUH 3ZETA 1TUYA 2YI1A 3ATUA 3A5MC 3U4LA 3TU5A 1LCUA 2E2OA 3ZX0A 1JCFA 1BG3A 5AQVA 5EOYA 1GLDG 1IJJA 3AAQA 4DB3A 3SLCA 2PAVA 3TPQA 4H0YB 1K8KA 4DHYA 1DKGD 3HI0A 4FWRA 3VGKA 4BRMA 4PL8A 4CZFA 2CGJA 2FSKA 1KAXA 2A5XA 3B8AX 1HKBA 1DEJA 3LM9A 1NWKA 1BUPA 3QBWA 2CGLA 3M1FA 1NGDA 5KPZA 1ZBSA 5AQYA 2NRHA 3VENA 4M7XA 3FLCO 3ZX3A 3JXUA 2HMPA 3A0IX 1QQOA 4H0XB 5KPTA 3LDOA 3P4IA 4H5WA 3WXLA 4MLEA 5FPMA 1Z05A 4QS8A 3VERA 2V52B 2CH5A 3UKRB 4E1JA 5BPNA 3MDQA 4BRCA 2HF3A 2V51B 4BR5A 2QWMA 3MMVA 4WYBA 3L4IA 4B1YB 4CZIA 3ENHA 3U9ZA 5F0XA 3VF2A 2A41A 1NGGA 4NO7A 1KAYA 3WXJA 3W0LA 5AQGA 3WQTA 4C23A 1QQNA 2IIRA 4FWLA 3O4WA 5AQJA 3GE1A 3CJAA 3U9DA 3GBTA 1GLCG 1YAGA 2W41A 5LY3A 1ATRA 4J8FA 1Q18A 3D2FA 3QMLA 2P9KA 4FPBA 3ZETB 1QQMA 5AR0A 5AQWA 4DCHA 4FWKA 4FPAA 1J6ZA 4H0PA 2AA4A 4B1ZA 5LJWA 2VWBA 1YVNA 3ZEUB 4M7YA 4WQ4A 3H3NO 3FR0A 1RGIA 2D0OA 2FF3B 2OANA 1OKJA 1T6CA 5KQDA 2E2QA 4BRFA 5ADXH 1K8KB 2HOEA 5KQ8A 4CBWA 3D2EA 3HZ6A 1RDWX 3WUHA 1JCGA 4CBXA 2P9UB 2QWQA 4BRGA 4FWQA 3U8XA 1NGIA 3G25A 2ASMA 2A40A 2IVOA 4BRKA 1SQKA 2GWKA 3DXKB 5BRDA 1NGJA 1XUPO 3CJ1A 3J8AA 4JAXA 2D0PA 5EY4A 4F9OA 3RSEB 5JLFA 3AARA 5AQHA 2YJEA 4BROA 4MO4A 3HM8A 3LDNA 4HTLA 2E1YA 4WQ5A 1KAZA 3FFKB 4BG8A 1HJOA 1HUXA 3CIPA 3W3DA 3GDQA 1C0GA 1SAZA 4FO0A 1XC3A 2ASPA 3DXMA 1NGEA 1KXPA 1NGAA 1BA1A 1XQSC 1ATNA 1MDUB 2FXUA 1R59O 1HPMA 2E1ZA 2Q0RA 2YHWA 2QXLA 5BPMA 2I7NA 3I8BA 5ELZA 4B1WB 4BQLA 3C7NA 4H03B 4XH1A 3MK6A 3MN7A 3D2FB 3L6QA 4EIAA 5BN9A 4CZEA 3FZFA 2IVNA 1BOTO 4JD2A 1GLLO 4MLHA 2P9SA 4I6MA 4BRHA 4IJAA 4H5VA 5AZIB 4B1UB 2GUPA 2NZTA 3EL2A 1NM1A 3JS6A 3H46O 1SZ2A 2Q36A 3IDHA 4ISFA 1NLVA 4CZKA 4BVPA 4EFHA 5AFUA 4JHDA 3O1BA 2GELA 3CJCA 3H1VX 1ATSA 4A2BA 1QZ5A 3O8MA 2ITMA 5AQFA 4A62A 4EHUA 2Q2RA 5EVZA 1P8ZA 3M6GA 4FWMA 1V4SA 2I7PA 4CI6A 2GWJA 1E4GT 3L0QA 4IWVA 1GLJO 3QFUA 3LM2A 4WQ4C 5AQRA 4IJNA 4NB4A 4CZMA 5F2RA 2ZGZA 4JNEA 3QICA 2P9IA 5KPRA 4CZLA 1ZXOA 4B1XB 2FLOA 3CQXA 4BR0A 4BC2A 5AQOA 1U6ZA 2Q0UA 3KVGA 3EKUA 1X3NA 4ISEA 3VEOA 4M63C 3GL1A 2ASOA 3CJBA 5AQNA 4K42A 1EQYA 3VGMA 3BP8A 1IG8A 3WQUA 1JCEA 2F9TA 2H3GX 3DXMB 3FE1A 2UYTA 2BTFA 3WT0A 4IO8A 3BF3A 3MN6A 3CJ7A 3O08A 4CBUA 4CD3A 1GLAG 4BRLA 4BR9A 3IMXA 2D4WA 2FSJA 3ATVA 5BN8A 5AQPA 5AQQA 3FZHA 4QS7A 5E26A 5AQZA 3VPZA 3QBXA 4CD1A 5EXWA 5FPDA 2QM1A 4AM6A 3CI5A 1QZ6A 3HTVA 1T6DA 1HX1A 3DJCA 4FWNA 1U2VA 1V4TA 3O1WA 1HLUA 3BUZB 4FWSA 4FWOA 5AQIA 3EO3A 2VYPA 1RFQA 1WUAA 4FSVA 4JHDB 2YHYA 4RTFD 1NGBA 3UKUA 1DGKN 3SJHA 4FL9A 3FGUA 3FZMA 4FOEA 1YUWA 2P9NA 1WOQA 4BR2A 4CZHA 4BC5A 4LC9B 3VF6A 1GLFO 5I9EB 4EAHD 4K25A 4Z94A 3KHYA 3SK3A 5BRHA 5ADXA 5AZJA 2A6AA 3IUCA 3VF4A 3WXKA 4MO5A 1GLBG 2P9IB 1LOTB 3VEXA 3A5NC 3CETA 4HWIA 5JLHA 2A42A 2IVPA 3LDPA 1T44A 3O5BA 2WUSA 4IXCA 2GEMA 4K43A 4RWTA 4BGBA 4BRNA 2A3ZA 1ZC6A 3A8YA 2V7ZA 2E20A 1X3MA 4BR7A 3R6MA 4DQ8A 3EZWA 3FZKA 3OHRA 3ZX2A 2CH6A 3VEVA 2E2NA 2P9KB 5AQXA 5TKYA 1H1VA 4XH5A 4H5RA 3D7EO 3VEYA 4EHTA 2ZF5O 4BRQA 3WEEA 3H45C 3IFRA 1HKGA 3MN5A 4CJ7A 3CERA 3HBTA 2QW9A 3UB5A 4YDUA 3QB0A 3LDQA 1D4XA 1GLEG 1U2VB 3D2EB 3ULEA 4CZJA 3MN9A 3O6WA 5BREA 2BUPA 2P9LA 2E8AA 2P9PA 3H6EA 3ZEUA 5B8HA 3S41A 2CGKA 1NBWA 4CZGA 3UKUB 2QWOA 3FZLA 5AQTA 1TYQA 3I33A 3HSCA 3SMPA 2FF6A 2P9NB 3ID8A 4BQZA 2AP1A 3MCPA 4BC4A 5LJVA 5BR9A 1ESVA 2P9UA 4GY2B 5AZJB 2YCHA 3ENOA 1QHAA 3SMSA 4FOIA 3BF1A 3DXKA 4BRIA 4BC3A 4B1VA 1BO5O 4PKGA 2E88A 1BDGA 2YHXA 3KZBA 3RSEA 4PL7A 4BG9A 1S3XA 4A61A 2ZWHA 2QWNA 2VCPA 3C0BA 3R9PA 4H0OA 5E84A 3UE5A 4BVOA 3BEXA 5JICA 4WQ5C 2GTDA 3C7NB 1X9JA 3DAWA 1MA9B 2ZGYA 2QWLA 4O5FA 5JMVA 4XEIA 2FSNA 5AQLA 3R8EA 4JD2B 3WXIA 5CE3A 2P9SB 4I6MB 2KHOA 2DPNA 3WEEB 1YXQA 2E2PA 2F9WA 4K41A 1CZAN 1Z6RA 1TUUA 3F9MA 2EWSA 3ULEB 3VETA 5FPNA 3VEZA 2QWPA 2P9LB 4KBOA 3LL3A 1NGCA 5AZIA 3CQYA 2P9PB 2NLXA 3LDLA 4QS9A 3CJ9A 4PKIA 1NGHA 3GOIA 1BWFO 2W40A 1NMDA 1TYQB 4JN4A 3H3OB 2Q31A 3EKSA 4IZ9A 5EX5A 3VOVA 4GNIA 3QDKA 1BA0A 1S22A 3DWLA 1Y64A 3A5OC 4YDUC 5F1XA 1C0FA 4BREA 1G99A 3VEWA 2J4RA 4PKHA 3H1QA 2PBDA 3AAPA 4FWPA 4H5TA 3VGLA 4O8KA 4BRAA 3AY9A 2D1KA 5AQMA 2YJFA 3GG4A 4BGAA 1MWKA 1BU6O 4Y0WA 1MWMA 3O80A 3UKRA 3QFPA 4BRPA 3M3ZA 4A2AA 3EN9A 2QWRA 4BRDA 2V7YA 3VESA 4AM7A 4ISGA 1HKCA 5BRFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F8RA 3NH1A 1EO1A 3A5LC 4H5NA 5AQUA 4E0DA 3OYLA 3C94A 5AQKA 5BPLA 3J7AP 3LAMA 2IOCA 2B5JA 3CM6A 3O9SA 4CEFA 3ZETA 4Y1CA 3I55N 4CK1A 1LAVA 1ZBFA 4IFYA 3ZX0A 1JCFA 5EOYA 4E1NA 1SKRA 1IV0A 4DB3A 2O8FA 3MXIA 3K5MA 3ZSZA 3D45A 1A5XA 4H0YB 3CMEN 1F21A 2NRVA 2NRWA 4PL8A 1B9DA 4KHWA 3LM9A 1K9MO 2WONA 3O9QA 4AF1A 3AVCA 1BUPA 1LWFA 3QBWA 2CGLA 1NGDA 1L3TA 3CCMN 5KPZA 4BDPA 3KD1E 4IBNA 4KV8A 4PUOA 3ZCMA 3MEDA 5D3GA 4DQQA 3N4PA 1C0MA 1QQOA 2E4LA 3MWPA 2R7YA 3LDOA 3P4IA 4MLEA 3NVMA 3LALA 1NK0A 4O0IA 3CD6N 2ZQBA 1Z05A 2VWJA 3UKRB 2CH5A 5BPNA 4B3MK 3J7ZO 4AHSA 4FXDA 4BR5A 2QWMA 5C42A 4DTNA 1WBDA 2O8CA 3L4IA 3ENHA 3VF2A 2A41A 1DLOA 1CXQA 3R3LA 3C65A 5AQGA 4KTWA 3WQTA 1RT1A 2IIRA 4FWLA 3O4WA 5LMUK 4FLXA 1GLCG 3D2FA 1W9HA 2P9KA 3QMLA 5AR0A 4FWKA 4JKEA 4FPAA 3ZYYX 1JL2A 1X1PA 2RF2A 2AA4A 5LJWA 3TARA 3M8QA 2VWBA 4M7YA 2Q3SA 4O4GA 3DLBA 3IAYA 1RGIA 2D0OA 2FF3B 3OYFA 4IOAL 2E2QA 2UXDK 1FKOA 4DV6K 3D2EA 4JK7A 2NNWA 3NFAA 4GVEA 4KH5A 4PHTX 2FBTA 5HRNA 4Q5VA 3MEGA 4CJFA 1NOZA 3QESA 5IT9O 1NGIA 2IVOA 2WTUA 1SQKA 2GWKA 1JKHA 4JS4A 3CJ1A 3J8AA 1WAFA 3S9HA 1ZBIA 3KLHA 4EZ6A 5JLFA 1B9FA 2YJEA 1NK4A 1U49A 3HM8A 2YHBA 4B9MA 4N76A 4KRFA 3IG1A 5J1EA 3HP9A 3TSQA 3ZT1A 1RT2A 1SAZA 4CFDA 4N5SA 4FO0A 3ZSOA 1NGEA 3K2PA 4E19A 3HRGA 2YHWA 1Q9YA 2EX3A 4JK8A 5ELZA 1OH5A 4DWIA 4CJ4A 4XH1A 3MN7A 1YVUA 3L6QA 4C1NK 3T7ZA 4CZEA 4CGFA 2IVNA 1GLLO 4A59A 4KAZA 4FJKA 4KTZA 4FK2A 4B1UB 2HHHK 4LD0A 1QVFM 4M42A 2ZJRL 2NZTA 3EL2A 3TAEA 3U3YA 5FRNA 1N6QA 2NUBA 2KW4A 3ZSQA 3V9XA 4YOVA 2GELA 4LFBK 3CJCA 3AVJA 1WSGA 5AQFA 4EHUA 2PY5A 1RTJA 3RR7A 4KKOA 3ZSWA 1VRUA 1KD1O 3NF7A 3OY9A 1X9WA 2WC9A 1E4GT 3AA3A 1GLJO 3G0ZA 5CZ2A 2XO7A 3J7YP 1BGXT 4WQ4C 3E9LA 3B6OA 4NB4A 4JNEA 3EY1A 3KK7A 3SZ2A 3QEVA 2XRIA 3DRRA 5HRPA 3TANA 2HBKA 5AQOA 2QK9A 1U6ZA 3VEOA 1QSSA 3L2QA 1UA0A 3CG7A 4DV2K 5LL6Z 4NCBA 2VG5A 3BP8A 1IG8A 3WQUA 2H3GX 5FDLA 3DXMB 2BTFA 5DMRA 2HBMA 3C6HA 1NK5A 2KQ2A 1WSHA 3HPGA 3O08A 4CBUA 4IO9L 2GUIA 4JI1K 1S1TA 4M3YA 3ATVA 5BN8A 1WSEA 4J2AA 1HYZA 1W7AA 1L3SA 5M1OA 4QS7A 4N56A 3SCXA 3MX5A 3VPZA 5EXWA 2XY6A 1T6DA 3THVA 1K73O 3KK1A 1TKTA 1S1VA 4MDAA 4B9SA 1V4TA 3O1WA 4ELTA 3HP6A 4B9UA 2JLEA 1A5VA 4JHDB 1NJYA 1TKXA 2VWKA 2YHYA 3VQCA 1DGKN 4CEZA 3SJHA 3AVGA 4KPYA 2ATQA 3OYJA 1YUWA 4NLBA 2P9NA 4BC5A 4WFBL 4W5QA 4ELUA 4LC9B 3RR8A 4PY5A 5J2NA 5I9EB 4CJVA 3WNGA 4Z94A 3SK3A 5AZJA 2QEXN 3IUCA 3VF4A 4M3ZA 1YTUA 4YOWA 1LOTB 3HPHA 2A42A 3T19A 2IVPA 1JXBA 1FXXA 5I3UA 4DR5K 4KB1A 5GINA 3VQ7A 1IBMK 4IXCA 4CEBA 2GEMA 3JSMA 4RWTA 4NYNA 3KWIA 4LSNA 3PX4A 4WE1A 4FJ5A 4DQ8A 3R6MA 4KHNA 3EZWA 4CW7B 3FZKA 3V1QA 3ZX2A 4FJ8A 3L2WA 2CH6A 4JKDA 2KZZA 5AQXA 1LW0A 1TL3A 5GIOA 1L3UA 4M3UA 3CCQN 3D7EO 1IKWA 1N8RO 3K5OA 4BY9C 4C1NI 1N5YA 4BRQA 3KK2A 3AV9A 3G6EN 1HKGA 5TKWA 2G8FA 3UB5A 1TAUA 4E7KA 1D4XA 1RTHA 1U2VB 1U47A 3EE8A 2P9PA 3V6DA 4ILGB 2X78A 4CF9A 4RG8A 4CHZA 1QQCA 1HNVA 4O5BA 1J53A 5SWMA 2QWOA 5AQTA 3HO1A 4KO0A 3I33A 3AVAA 4KHYA 2FF6A 4OKKA 4KREA 5C25A 5BR9A 5CHIA 5HRSA 3TSPA 4C8OA 1EP4A 4GY2B 3ENOA 3LAKA 3SUPA 2QKKA 2YX6A 4CIGA 1VQPN 4CEAA 4KH4A 4BC3A 1TK5A 5HROA 2P5OA 5K14A 1G15A 4DV0K 1L5UA 4H4OA 4PL7A 3LP3A 4BG9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1NKC A;  3L2R A;  1QE1 A;  3OJU A;  3ITH A;  4DU4 A;  4F2R A;  5EU7 A;  4W5O A;  2HHT A;  2VCP A;  1EET A;  2FBX A;  4H0O A;  4IG0 A;  4WFN L;  4CEO A;  2DFE A;  4IKF A;  3OYM A;  3DAW A;  4J2D A;  5AJ3 K;  5JMV A;  1HJR A;  1RBU A;  4A5B A;  5IWA K;  2LSN A;  3K0S A;  1CZA N;  1Z6R A;  3TAB A;  1RDA A;  1W97 L;  1HNZ K;  2G8W A;  2HST A;  4ID5 A;  2QWP A;  2P9L B;  3TAF A;  5AZI A;  3CQY A;  4RW7 A;  3O4N A;  4DTU A;  4CJ3 A;  1IG9 A;  2NRR A;  4PKI A;  1VQO N;  3GOI A;  3V1O A;  1IBK K;  3QER A;  1TYQ B;  3H3O B;  3L2U A;  4DLE A;  3SBT A;  4CES A;  1KVC A;  4NLC A;  4GNI A;  4Z4E A;  3TTC A;  1S22 A;  3DWL A;  1Y64 A;  5F1X A;  4FK4 A;  1IKV A;  1G99 A;  3VEW A;  3MEE A;  1XNR K;  2WBN A;  3MAQ A;  3H1Q A;  1VRT A;  4O8K A;  3KTQ A;  4NXN K;  4BGA A;  5HBM A;  1JLE A;  1WAJ A;  4FCY A;  3QFP A;  4BRD A;  5LMN K;  4AM7 A;  4DQS A;  3SUQ A;  5BRF A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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