4O5FA

Crystal structure of type iii pantothenate kinase from burkholderia thailandensis in complex with pantothenate and phosphate
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
MSGVCLLIDAGNSRIKWALADTGRHFVTSGAFEHADDTPDWSTLPAPRGAWISNVAGDAAAARIDALIDAHWPALPRTVVRACAAQCGVTNGYAEPARLGSDRWAGLIGAHAAFPGEHLLIATFGTATTLEALRADGRFTGGLIAPGWALMMRSLGMHTAQLPTVSIDAATSLLDELAANDAHAPFAIDTPHALSAGCLQAQAGLIERAWRDLEKAWKAPVRLVLSGGAADAIVRALTVPHTRHDTLVLTGLALIAHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Type III pantothenate kinase from Burkholderia thailandensis in complex with pantothenate and phosphate
rcsb
source organism Burkholderia thailandensis
molecule tags Transferase
molecule keywords Type III pantothenate kinase
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o5fA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o5fA02
4Y0WA 2QWOA 3QB0A 4I6MB 1NM1A 3BF3A 2CGKA 4CZEA 1GLAG 3JXUA 4JN4A 4FWOA 1MDUB 5AQRA 3VEOA 1P8ZA 5AZJB 2ZGYA 1U2VA 3WQUA 4MLEA 4LC9B 3EKSA 3CQXA 2CGLA 4XH4A 4M7YA 3C7NB 1V4TA 1HKGA 4JAXA 1YVNA 1MA9B 1BOTO 1BDGA 5KPRA 4BRQA 2YHXA 1GLCG 5EXWA 1CZAN 5EVZA 4B1YB 4H0PA 4K42A 3VF4A 5BN9A 3DJCA 2P9PA 3CIPA 2P9NB 3ULEB 3EL2A 5AQMA 4JD2B 2E1YA 1IG8A 2E2OA 3JS6A 2OANA 1WUAA 4IXCA 2ZGZA 2QXLA 3FZFA 3BUZB 5AQWA 3AAQA 4IZ9A 1HLUA 4H0OA 1NBWA 2P9IB 4XH5A 3A5MC 5EX5A 3SLCA 3L6QA 1DGKN 3O8MA 1BA0A 4K25A 2J4RA 3OHRA 2KHOA 5LY3A 3ENHA 5TKYA 4NO7A 3H6EA 5F1XA 1QZ6A 5F0XA 4BVPA 2F9TA 2PAVA 3UKUA 1XC3A 3SJHA 4H0VB 3FFKB 4KBOA 2HMPA 5FPDA 4BR5A 3H45C 4WQ5A 2FLOA 1S22A 4CZGA 4BRAA 2ZWHA 3ZX0A 4CD1A 1X3NA 1KAYA 1WOQA 2Q0RA 5AFUA 5AQKA 3D7EO 1IJJA 2FSNA 3O08A 5E84A 2P9IA 1GLJO 4ISEA 4RCHA 2FXUA 4WYBA 5B8HA 4A62A 3J8AA 4H5VA 4MO5A 4DHYA 5FPNA 1J6ZA 3F9MA 3MN9A 5AZJA 3TU5A 1QQMA 1QQOA 5AR0A 3EO3A 3HZ6A 1ESVA 4BR7A 5I9EB 5F2RA 4DCHA 2HF3A 2YCHA 3C7NA 5ELZA 4CZIA 4FWKA 1Y64A 4BR9A 4RTFD 4A2AA 3ULEA 2DPNA 1RDWX 3CQYA 3BEXA 2QM1A 1QQNA 1MWMA 4BRMA 5BN8A 2NZTA 5EOYA 4BGAA 5BRHA 4H0YB 4JNEA 3GDQA 5JLFA 4FWMA 4GNIA 3KVGA 4JD2A 1HKBA 5EY4A 3VETA 4Z94A 4BROA 3UKRA 3DWLA 3FZLA 1KAXA 1NGFA 2V7ZA 3RSEB 4H0XB 1MWKA 3VERA 2P9SB 3AARA 4B1WB 4XEIA 2QWRA 4I6MA 2V51B 3H46O 4CZJA 1HKCA 3CJBA 4BRIA 2I7NA 4WQ4A 5AZIB 3VEVA 5BREA 2D0PA 4AM6A 5AQPA 3IFRA 3WUHA 1Z05A 2Q97A 3GE1A 1TYQB 2NLXA 4PL8A 3ZX3A 3KHYA 4FWRA 2GUPA 3VENA 2HOEA 4GY2B 4FL9A 3LL3A 4BC3A 3ATVA 2ASPA 4O5FA 3VGMA 4EAHD 3VOVA 1BUPA 2YJFA 1R59O 3H1QA 3A8YA 3QICA 1T6CA 5AQVA 1U6ZA 4IWVA 3R8EA 4CBXA 3QFUA 3L4IA 5BPLA 2H3GX 5ADXH 3GOIA 3A5OC 5FPEA 5AQSA 1GLDG 3FZKA 1JCFA 2A40A 2Q0UA 2W40A 3CJ7A 3CJAA 4BREA 3WXIA 2CH5A 3CETA 1BG3A 3QMLA 4EHUA 2GWJA 3UE5A 5AQJA 3FLCO 3VESA 4EHTA 4NB4A 2IVPA 4QS9A 1E4GT 2Q36A 5AQGA 3O4WA 2FF6A 3WT0A 4PKHA 1BWFO 1BO5O 4EFHA 2QWQA 2E1ZA 4FOIA 2UYTA 2NRHA 3GG4A 1RFQA 2V7YA 3AY9A 4JHDA 5LJVA 1X3MA 5AFUH 1K8KA 2F9WA 4A2BA 3LM9A 3A5LC 2QW9A 4BC5A 2P9KB 2Q2RA 3BF1A 3CHWA 4XH1A 4PKIA 3CJ1A 2P9NA 1OKJA 3HM8A 2Q31A 5AQFA 3EN9A 1Q18A 3EKUA 3ZEUB 3D2FA 2P9KA 1ATRA 2AA4A 1GLLO 3D2FB 3VF2A 2FF3B 3WEEA 4H5TA 1HPMA 2YI1A 3IUCA 4B1ZA 4FWPA 3FE1A 3L0QA 4L3QA 5BR9A 2ASOA 2QWNA 5CE3A 1C0FA 4FWSA 3M6GA 2VWBA 1GLEG 5BRFA 4M63C 4BQLA 3I33A 4BC2A 2A5XA 2CGJA 3O1BA 1K8KB 4BRDA 1SAZA 4A61A 1EQYA 4BR2A 4F9OA 4K41A 5AQIA 3HI0A 3VPZA 2A3ZA 4FPBA 1NGDA 1C0GA 4B1XB 3LDQA 4BR4A 3HTVA 2P9LB 1ATSA 3SMPA 4IO8A 2FSKA 5AQZA 4CZFA 4E1JA 2QWPA 2E2NA 3SMSA 3VEZA 5JMVA 3WQTA 5ADXA 4H5NA 3H1VX 4HTLA 3M1FA 1S3XA 2GELA 4BRLA 4AM7A 2PBDA 1KAZA 3O5BA 5AQOA 3R9PA 4B1VA 1TYQA 4CD3A 5BRDA 5FPMA 3SK3A 4H5WA 2E2QA 3QBWA 1D4XA 2P9UA 3VEXA 4BRHA 2W41A 4PL7A 3WXKA 2D1KA 3VGKA 3HSCA 4BVOA 4BC4A 3QBXA 1Z6RA 3A5NC 2IIRA 4CZLA 4BGBA 3IDHA 3H3OB 1LOTB 4BQZA 1QHAA 3VGLA 4DB3A 2BTFA 4B1UB 4CZKA 1NGGA 2I7PA 2YHWA 1NGCA 4FO0A 4FWNA 4M7XA 4ISGA 3P4IA 2QWMA 3FZMA 3DXMB 3WXLA 3FR0A 3FGUA 3MK6A 4QS7A 2E88A 4EIAA 4MLHA 3MN6A 1ZBSA 3DXKB 4YDUA 4BR0A 3LM2A 3MCPA 2QWLA 3S41A 1NGIA 3LDNA 3O1WA 1NGJA 2ZF5O 3O80A 4HWIA 5LJWA 1NGBA 3CJCA 1T44A 3O6WA 4CZHA 5JLHA 2D0OA 1JCGA 4O8KA 3WEEB 2HF4A 3QDKA 4YDUC 1YUWA 4BG8A 3AAPA 3U9DA 1HJOA 5KQ8A 1U2VB 1DEJA 3MMVA 3TPQA 2P9UB 1TUYA 3VF6A 4JHDB 3ZETA 4IJAA 5AQUA 2E20A 5JICA 1NLVA 5AQTA 4CBUA 3MDQA 4WQ5C 4B9QA 2P9PB 1V4SA 3ZX2A 3UKRB 5E26A 1NGHA 2E2PA 2E8AA 2P9SA 3VEWA 1BA1A 4BRKA 4QS8A 1X9JA 4H03B 1BU6O 2CH6A 2FSJA 1NMDA 4CZMA 3EZWA 4FOEA 3U8XA 3ID8A 4CI6A 2ITMA 3ENOA 3M3ZA 5KQDA 3U9ZA 5KPZA 1T6DA 5AQHA 2VCPA 4BRFA 2WUSA 1XUPO 4BRNA 2GEMA 4BRGA 4K43A 3QFPA 2A41A 1G99A 4DQ8A 3UB5A 3W0LA 3DAWA 2VYPA 2D4WA 3GBTA 3HBTA 1NGAA 1SZ2A 3UKUB 4FSVA 3H3NO 3A0IX 2YHYA 2GWKA 3DXMA 1NGEA 1TUUA 1NWKA 2IVOA 2P9LA 1XQSC 4FPAA 4MO4A 3DXKA 4H0TB 4FWQA 3G25A 1DKGD 3CERA 4H5RA 2AP1A 3U4LA 3W3DA 2GTDA 1HX1A 3FZHA 5AZIA 1QZ5A 2A42A 1RGIA 3D2EB 2V52B 3R6MA 3LDOA 3B8AX 4FWLA 4WQ4C 4PKGA 2Q1NA 1YAGA 4ISFA 5AQXA 3CI5A 3RSEA 1H1VA 3D2EA 4J8FA 2EWSA 1ATNA 3IMXA 1SQKA 4RWTA 1GLFO 5AQQA 4BRCA 3VEYA 5BPMA 3BP8A 3LDLA 5AQLA 3ATUA 4BG9A 4CJ7A 3KZBA 3ZETB 1YXQA 1JCEA 2A6AA 2IVNA 5KPTA 3CJ9A 1KXPA 3I8BA 1ZC6A 1GLBG 2BUPA 4CBWA 1HUXA 1ZXOA 3LDPA 1E4FT 3MN5A 3GL1A 5BPNA 4C23A 3ZEUA 4BRPA 1LCUA 3MN7A 5AQNA 3C0BA 4IJNA 5AQYA 2ASMA 2YJEA 3WXJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5GAGP 4I6MB 1O13A 2UUCK 4B08A 3O9RA 1GLAG 4JN4A 1WAFA 3VEOA 3LANA 1U2VA 1NOYA 4MLEA 5CY4A 4HUFA 1N33K 3L2VA 1V4TA 2A1SA 4JAXA 3VA0A 4CGJA 1BDGA 2YHXA 4Z4GA 3PO4A 5EXWA 4YOWA 4LF5K 4B1YB 5EVZA 3SUOA 4DQRA 3NF7A 4H0PA 1W0HA 5BN9A 4LY7A 1N32K 3O9QA 2BDPA 1IBLK 3NE6A 1WUAA 1SUQA 2Z1GA 3OBYA 1CXQA 4CF1A 4DR6K 2P9IB 3TSQA 1RDAA 3ALYA 3L6QA 4IKFA 4DTRA 4JI6K 4CHNA 2J4RA 3OHRA 3G6EN 1YVUA 4J2EA 3ENHA 3ZLJA 2G8VA 4B9VA 2HNDA 5F1XA 5CR4A 2F9TA 2PAVA 4LFCK 1U49A 3SJHA 4F3OA 3OYIA 3M8SA 2HMPA 4JKHA 5FPDA 4YOTA 4WQ5A 3HL8A 4NYNA 3QEVA 4CD1A 3ZSWA 4KHUA 1HR0K 1L5UA 3OYLA 3MX2A 1OVQA 2KFNA 3LP1A 1GLJO 4ISEA 4BE2A 4AH9A 4A62A 3J8AA 2PYLA 3FFIA 4B3OA 3K58A 3TU5A 4DR2K 1QVGM 4ID5A 1GOCA 4FLVA 1NK7A 1EWQA 3K5MA 4BR7A 5C24A 2HBLA 2YCHA 5ELZA 1RTDA 4O5BA 2P51A 4RTFD 2DPNA 3NFAA 1QQNA 4NLCA 4BRMA 2NZTA 3HP6A 2O8DB 5LMUK 4JNEA 3THXB 1RBVA 4GNIA 3RWUA 1KTQA 2WBNA 3DWLA 1IV0A 3RSEB 4AHUA 1IKXA 2WC9A 2P9SB 4B1WB 1GOBA 4YOVA 1OH7A 4IG0A 1NKEA 3H46O 1ASWA 2D0AA 3DRPA 4CK3A 2HHHK 3VEVA 4OX9K 2D0PA 4AM6A 3WUHA 3ZX3A 4FWRA 2GUPA 3E1YA 3WXMB 5FRNA 3OVNA 1YIJN 4CGHA 4FL9A 3LL3A 3ATVA 3AVKA 3VGMA 3TSUA 4PA1A 3VQ9A 4EAHD 1VQON 2YJFA 1LAWA 3H1QA 3AVIA 3EZ5A 2VQFK 1T6CA 2VG6A 2HHSA 3M8RA 1VRTA 3QFUA 3L4IA 5BPLA 1BIZA 1TK8A 3A5OC 2PY5A 5AQSA 3BY5A 4OPHA 4DSFA 3PSIA 2CH5A 3WXIA 4FJ7A 4DS5A 3CETA 4M3UA 3PY8A 1NK9A 3FLCO 2B6AA 2ZJRL 4QS9A 4E7LA 3TAEA 1VK0A 4E19A 3CCUN 2OA8A 2YNIA 3PLAA 1BWFO 2B5JA 1Q82O 1J54A 2QWQA 2HMIA 2UYTA 2FBTA 3KWIA 1C0TA 1J53A 4JS5A 1J5OA 2F96A 3GG4A 4NXNK 1U45A 1RFQA 2V7YA 5A2QO 2HVIA 1Q86O 1X3MA 3MXMA 1RTHA 2ZJPL 1K8KA 4O0JA 3EE8A 2F9WA 1TK0A 3BF1A 3KK7A 2P9NA 3OBWA 3QNOA 1OKJA 4RW6A 1SL2A 4GMJB 3ZEUB 4Z4CA 3Q7CA 3R3LA 1LV5A 5C2FA 3CCRN 1XMQK 4JLHA 2OYQA 3IUCA 3RVCA 4FWPA 3FE1A 4ILJA 1LAVA 4L3QA 4CEFA 1A5VA 4CGGA 4B9UA 4PWDA 4FLTA 4KRFA 1VHXA 1VSFA 1C0FA 4FWSA 4EZ6A 3M6GA 2VWBA 3K2PA 2B4JA 4FJMA 4BQLA 1RDCA 3I33A 4BC2A 2WFBA 1VSKA 3O1BA 3K59A 3TTDA 3VQBA 4A61A 1HNVA 2YHAA 3NBPA 5AQIA 4JKBA 3HI0A 1BL3A 2WONA 4ELVA 4HCBA 4FPBA 4X66K 1C0GA 4KH4A 3HTVA 2YV0X 3AVNA 3HRGA 4OKJA 2E6MA 4Z0UA 5AQZA 2QWPA 3SMSA 1VQLN 5JMVA 4DV1K 3P83D 1RT7A 4H4MA 3M1FA 1S3XA 3NDKA 3C6UA 3ZSRA 2NNWA 4RW7A 4CF8A 2BE2A 4BDYA 1TYQA 5BRDA 5FPMA 3SK3A 3SNNA 4H5WA 2W41A 4PL7A 1D5AA 4NXMK 4CESA 3J7ZO 4RW8A 3DRSA 1BQMA 1Z6RA 3A5NC 1OVYA 5FROA 1N36K 3NMUA 1Z25A 1QHAA 2YHWA 1NGCA 1Q9XA 3L2WA 1SL0A 4KAZA 2UXBK 3S3NA 3DXMB 1BISA 3OJUA 4FLUA 2E88A 4EIAA 3MN6A 1NKCA 3OJSA 2GUIA 2QWLA 4K0KK 1NGIA 4HWIA 2O8EA 1NGJA 2XO7A 1NJXA 1T44A 3OW2M 2JGUA 2D0OA 4B9TA 1JCGA 1DLOA 4YDUC 4DR7K 3U9DA 5KQ8A 4DR1K 4FJ5A 5DK5A 4CJTA 3NH0A 4CFDA 1RT1A 2RN2A 1NLVA 4KH5A 3ZSQA 1CLQA 1JL2A 5IWAK 4B8CA 1HMVA 3K9JA 1QTMA 4E7IA 1QSSA 1SKWA 4DU4A 5HLFA 4BRKA 4QS8A 3F5TA 2FSJA 1R0AA 1FKPA 4MFBA 3VQCA 5CYMA 2ITMA 3ENOA 3M3ZA 3P1GA 5KQDA 2Z1IA 5KPZA 1HYZA 3SAFA 5AQHA 1CZBA 2WUSA 1VQNN 1DT9A 1EP4A 4M45A 1KQSM 4K43A 3ZYYX 5C25A 4JKAA 1LWCA 2VYPA 2O8FB 2D4WA 5TKWA 3MAQA 1NGAA 4JI7K 4CHQA 2QKKA 3UKUB 4CF2A 2GWKA 1EXQA 1Z26A 2IVOA 4FJLA 2IC3A 2RHKA 5IT9O 3KLHA 2AP1A 3U4LA 3SI6A 2GTDA 1HX1A 5AZIA 4JS4A 2V52B 1X9MA 4FWLA 1S9GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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