4O5FA

Crystal structure of type iii pantothenate kinase from burkholderia thailandensis in complex with pantothenate and phosphate
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
b'MSGVCLLIDAGNSRIKWALADTGRHFVTSGAFEHADDTPDWSTLPAPRGAWISNVAGDAAAARIDALIDAHWPALPRTVVRACAAQCGVTNGYAEPARLGSDRWAGLIGAHAAFPGEHLLIATFGTATTLEALRADGRFTGGLIAPGWALMMRSLGMHTAQLPTVSIDAATSLLDELAANDAHAPFAIDTPHALSAGCLQAQAGLIERAWRDLEKAWKAPVRLVLSGGAADAIVRALTVPHTRHDTLVLTGLALIAHS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Type III pantothenate kinase
molecule tags Transferase
source organism Burkholderia thailandensis
publication title Crystal structure of Type III pantothenate kinase from Burkholderia thailandensis in complex with pantothenate and phosphate
rcsb
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o5fA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o5fA02
4FWMA 3QFUA 1MA9B 5AFUH 1BUPA 4QS9A 4CD3A 5BR9A 3VGMA 3A5MC 3GG4A 3CETA 4H5TA 1ATRA 1YVNA 4BR5A 1HX1A 3MN7A 3ID8A 4PL7A 1NWKA 1JCFA 3C0BA 5BPLA 4WYBA 3O4WA 4CZIA 5BREA 4M63C 2P9PA 5ADXA 1ZBSA 4HTLA 4H0TB 2F9TA 4BRLA 4JD2A 3O1BA 3L0QA 1KAXA 1U2VB 2D4WA 1Y64A 3LDNA 1P8ZA 5CE3A 3ZX2A 2QXLA 3CJAA 1TUUA 1LOTB 4FO0A 3WEEB 4EHTA 3CQYA 5KQDA 3O8MA 4H0PA 2P9NA 1BDGA 1MDUB 3ZETB 4BR2A 4EIAA 3VEVA 4GNIA 4QS8A 2QWQA 2P9KB 4EHUA 3LDQA 3WUHA 2P9UA 2VWBA 1S22A 2VCPA 3CERA 4BVOA 1XC3A 1NGBA 5BRDA 3KHYA 2QWNA 4FWLA 3VETA 1ATNA 1G99A 4WQ4C 1E4GT 4FWRA 4ISGA 2P9SA 3I33A 4IXCA 4M7XA 4CZMA 5AQFA 4BG8A 1NGDA 1R59O 1SZ2A 5AFUA 1HPMA 2Q0RA 1OKJA 1C0FA 3MDQA 3H45C 3TPQA 2E1YA 3OHRA 1KXPA 1K8KA 1MWKA 1NGIA 4BGAA 2P9LA 3UE5A 3O08A 4HWIA 2NRHA 3UKUB 5AQQA 3ULEB 3VGLA 2EWSA 1WUAA 3VERA 1MWMA 2V51B 5ADXH 2NLXA 5FPMA 5LY3A 4FWQA 2YHXA 2GWKA 4BQLA 4A2BA 4CBWA 2QM1A 5LJWA 3SJHA 4Z94A 1BO5O 4BRHA 4MLHA 1QQOA 2YCHA 4FWOA 1Z6RA 2FSJA 1JCGA 1GLFO 3WXJA 4B1WB 4H0YB 3GBTA 3L4IA 5AQGA 3DAWA 1YAGA 4YDUA 2I7NA 2ZWHA 1NGJA 3H3NO 5BRFA 4FPAA 4JN4A 4FWSA 1ZC6A 3VESA 3FR0A 5FPEA 3EKSA 2QWMA 3KVGA 4H5WA 4CD1A 2CGKA 3RSEB 3CIPA 4H0VB 4RCHA 3QB0A 4PKHA 5AZIA 3BF1A 1D4XA 1GLEG 4GY2B 4B9QA 1NGFA 3D2FB 3L6QA 5KPRA 2P9UB 5JLHA 5AZJA 3GDQA 5EVZA 3SK3A 1NGEA 5EXWA 4DB3A 3P4IA 4I6MB 4AM7A 3A5LC 4BRAA 3CQXA 3WXLA 4B1ZA 4NB4A 2QW9A 3IDHA 4BRNA 3AAQA 3TU5A 2P9SB 3BF3A 4K43A 4BRQA 2D0OA 1IG8A 3CI5A 3SMSA 3D2EB 4B1XB 2GUPA 3FZMA 3ENOA 3QBXA 3FZFA 2WUSA 2A5XA 1T6CA 5AQTA 1K8KB 2V7YA 1J6ZA 5AQOA 3VF4A 1TYQB 3EKUA 2V52B 4AM6A 3ULEA 5BRHA 2NZTA 3U9DA 4JHDA 2IVOA 3ZX0A 4IWVA 4PL8A 4BRCA 1CZAN 4H0XB 3FFKB 4BRPA 4IJAA 4BROA 1NGHA 5B8HA 5LJVA 1GLLO 3UB5A 2DPNA 3HZ6A 3BP8A 5AQHA 3UKRB 2P9IB 2Q1NA 3O5BA 2IVPA 1RGIA 1BWFO 3EZWA 3EO3A 5AQYA 2YJFA 1QHAA 3LDPA 2IIRA 2P9NB 4BRKA 2A3ZA 5AQPA 1NLVA 3SMPA 4IO8A 3VEWA 4E1JA 4F9OA 2OANA 1BA1A 3VF2A 2FSNA 1WOQA 3MMVA 3WQUA 3FZKA 4XH5A 1U2VA 3J8AA 4K25A 3DXKA 2Q97A 4B1UB 3IFRA 5I9EB 5AQKA 1X3MA 2P9PB 1HLUA 1NGCA 4ISFA 1QQMA 3LM9A 2Q2RA 1T6DA 5AQWA 3W0LA 2W40A 4WQ5A 2Q31A 4BRGA 2V7ZA 2ASPA 4JAXA 3HSCA 4BRMA 2ITMA 2ASOA 3O80A 4FWPA 4K41A 4CZHA 1NMDA 3U8XA 3U9ZA 2ASMA 2J4RA 3ENHA 3VPZA 3VEYA 4H5RA 4BC3A 1NM1A 3C7NB 4BR4A 5EX5A 1HKBA 1V4SA 3B8AX 3BEXA 2FXUA 3H46O 4A62A 5F1XA 3A5NC 5EY4A 1E4FT 3ZEUB 3LDOA 4C23A 4KBOA 2HMPA 4J8FA 4DQ8A 4FWNA 4XEIA 4WQ4A 1H1VA 5FPDA 2A40A 4PKGA 4EAHD 4M7YA 4BVPA 3H1QA 1LCUA 2E88A 2Q0UA 4BGBA 5TKYA 1TUYA 3HBTA 4JNEA 3MCPA 4BRDA 3CHWA 3A8YA 3QBWA 2E1ZA 4O8KA 3ZX3A 1S3XA 2FF3B 3I8BA 3QFPA 5AQSA 4A61A 1QZ6A 2GELA 5E26A 5AQIA 3U4LA 4B1YB 2E20A 4EFHA 3FGUA 3DXMA 3AY9A 3WXIA 2HF3A 3WT0A 5JLFA 2H3GX 3ZETA 4L3QA 2FLOA 4BC4A 2E2NA 1GLDG 2AA4A 3S41A 3WEEA 3ATUA 4A2AA 1QZ5A 4RWTA 1DGKN 3EN9A 3AAPA 2BTFA 4H5VA 2CH6A 5FPNA 2E2OA 3O6WA 3VGKA 4BR7A 4Y0WA 1NGGA 2CGJA 3M3ZA 3QICA 3AARA 1TYQA 1HKGA 1KAYA 2CGLA 4FOIA 4BRFA 4CZJA 1GLAG 2FSKA 2CH5A 3LM2A 3RSEA 3VEXA 4RTFD 2E8AA 5BN8A 3JXUA 2GWJA 3R8EA 1YUWA 1BG3A 1GLCG 4DHYA 4MO5A 3FZHA 2GTDA 2ZGYA 3O1WA 3R6MA 3VEZA 3VF6A 5AZJB 2QWOA 5BPNA 3UKRA 2I7PA 2ZGZA 4CZFA 2P9IA 3UKUA 4K42A 4BC5A 3ZEUA 5AQVA 5AR0A 3HM8A 5KQ8A 1DEJA 4FWKA 3DWLA 3EL2A 4CJ7A 1DKGD 3FLCO 4NO7A 2QWLA 5AQNA 3GL1A 2P9KA 2E2QA 2QWRA 3G25A 3R9PA 3A5OC 3D2EA 5ELZA 1QQNA 2D1KA 4O5FA 3H6EA 5E84A 3CJBA 2ZF5O 1BOTO 2A41A 2YHYA 4BG9A 2IVNA 3MK6A 3MN6A 4YDUC 3CJ9A 2YJEA 4WQ5C 3JS6A 3HTVA 1NBWA 1XQSC 3GE1A 4H0OA 1GLJO 1HJOA 3F9MA 5JMVA 1EQYA 1JCEA 4JHDB 1YXQA 4H03B 5F2RA 3VOVA 4BR0A 2E2PA 1BA0A 2D0PA 2W41A 3QDKA 4H5NA 5AQLA 4CBXA 2AP1A 3GOIA 2YHWA 3QMLA 2Q36A 2P9LB 2HOEA 4MO4A 4CZKA 4CBUA 1ATSA 1ZXOA 1ESVA 2VYPA 3M6GA 5AZIB 4CZLA 3M1FA 4IJNA 3VEOA 1BU6O 1RFQA 1Z05A 3W3DA 3CJ1A 4JD2B 3IMXA 2PAVA 4BC2A 1IJJA 4CZGA 1Q18A 2UYTA 2A6AA 2QWPA 3H3OB 3DXKB 5KPTA 4B1VA 1C0GA 1RDWX 5AQZA 4BRIA 4PKIA 1X3NA 3LL3A 5BN9A 2A42A 2FF6A 4I6MA 3VENA 4LC9B 2GEMA 5EOYA 1SQKA 4BREA 4XH4A 1KAZA 5AQMA 4FPBA 3CJCA 1V4TA 4QS7A 4XH1A 3ATVA 3FZLA 5AQUA 5KPZA 1HKCA 1XUPO 5JICA 2BUPA 2HF4A 4IZ9A 4FL9A 1GLBG 3A0IX 2YI1A 5AQXA 3KZBA 3BUZB 4ISEA 3CJ7A 3H1VX 3D7EO 3FE1A 3LDLA 4BQZA 1HUXA 1U6ZA 4BR9A 1X9JA 3C7NA 4CI6A 4FSVA 4DCHA 3D2FA 3SLCA 1SAZA 1T44A 3MN5A 2KHOA 5AQJA 2F9WA 4FOEA 3MN9A 4MLEA 4CZEA 1NGAA 3WXKA 3DJCA 5F0XA 3HI0A 3WQTA 3IUCA 5AQRA 5BPMA 2PBDA 3DXMB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NK4A 1Q82O 4DSFA 1QVFM 3DM2A 5BR9A 3VGMA 3A5MC 3QESA 2O8DA 3E9OA 1YVNA 4JYAK 3ID8A 4PL7A 4N56A 4NXNK 3EE9A 4GV9A 1NWKA 2GBZA 1D9DA 5BPLA 3K5NA 3UIQA 3AA3A 1XC9A 4G9ZA 3IKMA 4WYBA 3O4WA 4CZIA 1KQSM 2P9PA 4N47A 5ADXA 4BE0A 4HTLA 4H0TB 4LH5A 4BRLA 5DM6L 5H1SQ 3KLIA 1HR0K 1RT2A 1Y64A 3LDNA 1P8ZA 3E1YA 4CEZA 1QTMA 5J2MA 4DTOA 3CJAA 2HBJA 2XY6A 2WOMA 4OKJA 4CHZA 2WTUA 1C6VA 3KJVA 3TAQA 3SAGA 3VEVA 2A1SA 2P9KB 1Q7YO 2P9UA 1YHQN 4CEAA 2KLAA 1NGBA 5BRDA 4JRQA 2QWNA 4DTUA 3TTFA 3SV4A 4C1NI 4DKWA 1HRHA 1T3VA 4FWRA 4WF9L 4M7XA 3AVGA 4O0JA 3MDQA 3ZT1A 3TPQA 1KXPA 3P5JA 1MWKA 4YY3K 4BGAA 3SQ4A 4V19S 3UKUB 4E19A 3J80O 2JLEA 2E6MA 2ZJRL 1M90O 3VGLA 2W6LA 2EWSA 5M1PA 3VERA 1QS4A 1UWBA 5FPMA 3MXIA 3PUFA 3LWLA 4FLVA 3FFIA 4BQLA 4A2BA 2WONA 3HOTA 3EYZA 3LALA 5LJWA 2QM1A 1EXQA 2DTUA 1QQOA 1VQMN 4H8KA 3WXJA 1LV5A 1U04A 4W5NA 5BR8K 1QVGM 3THYB 3TAMA 1YAGA 4FPAA 4FWSA 2RE2A 5LMUK 1SV5A 1ZBFA 4B3TK 3CPEA 1LW2A 1TKDA 4XIUA 3BF1A 4GY2B 4DQIA 4ZTJA 4A59A 3L6QA 2P9UB 4DG1A 2NRTA 3T1YK 3ZSOA 1NGEA 5EXWA 3TTDA 4DB3A 3S3NA 3P4IA 4I6MB 4AM7A 4JRPA 2DFEA 2HB5A 3WXLA 4K0KK 5KRTA 1VSEA 4NB4A 4JI7K 3TU5A 2YKNA 2G8UA 4BRQA 1IG8A 3CI5A 4A5AA 1HQUA 3SZ2A 3SMSA 5JS1A 3OYBA 1BI4B 4FYDA 3FZMA 4DFPA 1FW6A 1C0UA 3QBXA 1KVAA 4DQSA 1NNEA 2WUSA 4CEBA 5KI6A 1JLGA 1RT1A 1YJNN 3Q7CA 3KIOA 2NRVA 4M3YA 3T1AA 1RTJA 4JHDA 4DV6K 2X74A 1CZAN 3F5TA 1IKWA 2QKKA 4BROA 5DM7L 3UB5A 5FRNA 1EETA 5M1QA 4BWMA 4Z4FA 4RW6A 4N5SA 1JL1A 2IVPA 1RGIA 3OYAA 3EZWA 3EO3A 4IEIA 1YTUA 3LZIA 2IIRA 3L3VA 5M1KA 3NE6A 4BE1A 3SMPA 4IG3A 2HBKA 4C8NA 3VEWA 2B6AA 4IG0A 2KFZA 3V4IA 4E7HA 2B4JA 1U2VA 4LF5K 3MECA 5AQKA 2YV0X 2JWLA 1QQMA 3LM9A 4Z4CA 4E3SA 1T6DA 3VQPA 4QOZB 3BDPA 4KH4A 2ASPA 2QEXN 1Q86O 2XY7A 4FWPA 1NMNA 2FBVA 4FLZA 3KK1A 4LSNA 2J4RA 3C6TA 3VQ5A 3ENHA 1L3TA 1IKXA 3KD1E 3C7NB 3AVIA 3RRGA 3OYFA 1V4SA 2FXUA 4ZHRA 1OH8A 1A5VA 3A5NC 1KFDA 3LDOA 3R1XA 4H4MA 3LP3A 5EU7A 1ZBHA 4DQ8A 4FWNA 4XEIA 4JKAA 2VG5A 5FPDA 3QNOA 2A40A 3NH0A 4QAGA 4DFMA 2OPPA 4E89A 3H1QA 3NVMA 2E88A 2Q0UA 5HROA 1TUYA 4YOYA 4NCBA 3MCPA 3QBWA 4JEPA 4O8KA 1S3XA 1GOAA 3QFPA 4JKDA 3KD5E 1UOCA 3BZCA 4WCEL 1QZ6A 3U4LA 3VQQA 4Z0UA 4EZ9A 2OCEA 3ZSYA 1D5AA 4DR2K 3ZETA 1T7PA 1VSDA 3CF5L 4EP5A 4M41A 3ATUA 1OH7A 3IS9A 1QZ5A 2OZSA 4FLXA 3EN9A 1SL0A 2E2OA 1J53A 3CD6N 3OYGA 3M3ZA 1U49A 4DSJA 3AARA 1EWRA 1KAYA 3DYAA 1W97L 3QEIA 3QEXA 1S9EA 3HM9A 2GWJA 4BACA 3OS2A 4KHNA 1GLCG 2IOCA 4J2DA 3FZHA 3VF6A 4RG8A 1U45A 5HOOA 1BCOA 2I7PA 1S1WA 2ZGZA 4CZFA 4LFBK 2HBLA 4ZTFA 5KQ8A 1JLEA 4FWKA 3DWLA 5IWAK 4NO7A 3FLCO 4FVMA 4IKFA 3PO5A 3GL1A 2PYJA 2P9KA 3SJJA 3R3LA 4CF2A 2F4VK 3ITHA 1VHXA 2HHXA 1UA0A 5JS2A 3RR7A 2A41A 3VQ7A 4YDUC 3HOSA 1BGXT 3ZSWA 1XQSC 3TAEA 1HNWK 3F9MA 1KLMA 1EQYA 4JI1K 5JMVA 3VQDA 3QNNA 4JKFA 4OX9K 4BR0A 2E2PA 1NJWA 4CBXA 1N8RO 3K9KA 2ZJPL 3D45A 2YHWA 2Q36A 2P9LB 3IG1A 4CGDA 2Z1JA 4BY9C 4MDAA 1VRUA 4ICLA 3J81O 2VYPA 3M6GA 4PHTX 4NLBA 4QCLA 3AVFA 4FM0A 4CJ5A 4JK9A 3OYDA 3W3DA 4JD2B 1VQON 3RMAA 1T8EA 5CYQA 3BY5A 1HMVA 1VQLN 2UXDK 2FC0A 4CZGA 3H3OB 3V1OA 3DXKB 2OA8A 4CJTA 1C0GA 4B3OA 4PKIA 2A42A 3V9UA 4KTWA 3TWHA 3ZCMA 4E1NA 5EOYA 4XH4A 5AQMA 4DLEA 4FZYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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