4O5FA

Crystal structure of type iii pantothenate kinase from burkholderia thailandensis in complex with pantothenate and phosphate
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
MSGVCLLIDAGNSRIKWALADTGRHFVTSGAFEHADDTPDWSTLPAPRGAWISNVAGDAAAARIDALIDAHWPALPRTVVRACAAQCGVTNGYAEPARLGSDRWAGLIGAHAAFPGEHLLIATFGTATTLEALRADGRFTGGLIAPGWALMMRSLGMHTAQLPTVSIDAATSLLDELAANDAHAPFAIDTPHALSAGCLQAQAGLIERAWRDLEKAWKAPVRLVLSGGAADAIVRALTVPHTRHDTLVLTGLALIAHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Burkholderia thailandensis
publication title Crystal structure of Type III pantothenate kinase from Burkholderia thailandensis in complex with pantothenate and phosphate
rcsb
molecule keywords Type III pantothenate kinase
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o5fA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o5fA02
2F9TA 3W3DA 1DKGD 2VCPA 3VF4A 3P4IA 3ZX2A 3FZMA 1HKGA 2YHXA 3DXMB 2A5XA 5BPLA 1SAZA 2NLXA 4PL7A 3VF2A 3H46O 4MLEA 3KVGA 4BRAA 5AQMA 1D4XA 5AQKA 4A61A 1SQKA 3EKSA 4CBXA 2BUPA 4JAXA 4BRNA 3RSEB 2FSNA 2GUPA 2D0OA 2A3ZA 2QWOA 4CD3A 1U2VA 2GELA 1DEJA 1NGAA 4J8FA 4PKHA 5AZIA 3UKRB 3VESA 1NM1A 3WXLA 3TPQA 1T6CA 3HSCA 3FE1A 5KQ8A 5EOYA 3L0QA 4FWOA 3VGMA 2IVPA 5ADXA 4PKGA 1ZBSA 3C0BA 3FFKB 4BRMA 4BG8A 4BR2A 2Q2RA 3BEXA 3LDQA 3QDKA 4B9QA 3A5MC 4BC3A 4IWVA 1BWFO 1NGJA 2D4WA 3W0LA 1BUPA 4A2BA 1U2VB 4H0OA 4XH1A 4O5FA 3DXKA 5F2RA 5AZIB 1X9JA 3MK6A 1E4FT 1YXQA 3ZX0A 4EHUA 1U6ZA 2ITMA 3BP8A 2EWSA 3O80A 2YJFA 4FWRA 4M7XA 3EL2A 2AA4A 4FO0A 4CZHA 2YHWA 3BF1A 4FWQA 5JMVA 1TUYA 4FOIA 3M6GA 5TKYA 4CZGA 2YJEA 1S3XA 4AM6A 3WXJA 2ZWHA 4BGAA 2P9KA 2QWLA 2Q0RA 2Q0UA 3FR0A 3MN6A 3O4WA 4RTFD 4FWKA 3IMXA 4BRIA 1YUWA 2D0PA 1JCEA 3EO3A 4BC4A 3A8YA 5AQOA 3DXKB 1GLBG 3HM8A 4CBWA 3CJCA 4BRQA 4O8KA 1WUAA 4CJ7A 3CIPA 2QW9A 2P9LA 4CBUA 4CD1A 4ISFA 4HTLA 5ELZA 4EHTA 4DQ8A 1NGFA 2A42A 4FPAA 2W40A 1LOTB 3C7NA 2P9KB 3A0IX 3I33A 1HPMA 5BRFA 2YCHA 2OANA 3FZFA 1MWMA 1NBWA 3QB0A 1IG8A 3GE1A 1XC3A 1QZ5A 2CH5A 1KAYA 2DPNA 4B1XB 4IJNA 1ATNA 5KPRA 3CQXA 2P9LB 3O5BA 1NGHA 1H1VA 5KPZA 2QWNA 3QMLA 2P9SA 3VEOA 1ZC6A 4CZFA 4JNEA 1GLDG 3CJ9A 5AQHA 3CJ7A 4BVPA 5I9EB 5LJWA 1V4TA 1NWKA 2CGLA 2V52B 3C7NB 5EVZA 4BC5A 2QWMA 4BROA 4RWTA 2ZGZA 3FGUA 3GDQA 4I6MA 2ZGYA 4EAHD 3WQTA 3HZ6A 2IIRA 3A5NC 1Z6RA 2GTDA 3QFPA 2P9NA 3CERA 3HBTA 1RGIA 4MO4A 1G99A 4FWNA 4FL9A 4B1VA 1NMDA 2V7ZA 1GLEG 4B1YB 4FWSA 5BN8A 5E26A 2E2NA 4WQ4C 5AQZA 4K41A 4BREA 3H3OB 4RCHA 3ENOA 5AQIA 2P9SB 2PBDA 4NB4A 5FPMA 4QS7A 2F9WA 1ESVA 4JHDA 4K42A 2I7PA 4H03B 4BRFA 2A41A 2E20A 3ATVA 1X3MA 5BRDA 4I6MB 5AQLA 1XUPO 1LCUA 1GLLO 5BPNA 2IVNA 2P9NB 3U9DA 4Z94A 1WOQA 4H0XB 2FSKA 1YVNA 3WQUA 2H3GX 1Y64A 1GLCG 3FLCO 3LL3A 4YDUA 4K43A 4BG9A 3ULEA 1ATSA 5BREA 4H0YB 4BR7A 4HWIA 4H0PA 4MLHA 1ATRA 1E4GT 1NGIA 4FWMA 4M63C 4JHDB 2V7YA 3OHRA 1HKBA 4B1UB 1K8KB 4BRPA 5EX5A 4FSVA 3R9PA 4QS8A 4QS9A 3GG4A 4H5WA 5AQYA 3LDPA 3ZETA 3ULEB 3HI0A 5AQRA 3MMVA 1C0FA 3IFRA 1JCFA 4H0TB 1QQMA 2J4RA 4DHYA 3CJAA 1IJJA 2BTFA 3VEVA 4XH4A 4Y0WA 3VENA 2GWKA 3L6QA 4BVOA 1GLAG 1RFQA 5AQNA 5KQDA 3O08A 4BRHA 2A40A 3FZHA 3KHYA 3LDOA 1P8ZA 2VWBA 2P9PA 5AQWA 4CZKA 2I7NA 3ZETB 2HMPA 3QFUA 4WQ5C 3UKUA 5LY3A 1HUXA 2P9IA 3GBTA 3AAPA 3EZWA 5FPEA 1BOTO 4JN4A 3O8MA 4CZLA 5LJVA 1S22A 4H5NA 3VEWA 3IDHA 3GOIA 1MA9B 1QHAA 2P9PB 3S41A 5E84A 3QICA 4K25A 3UKUB 3O6WA 4LC9B 2HOEA 1NGDA 5BPMA 2P9IB 2YHYA 4BRLA 4BRGA 1OKJA 5AQVA 4EFHA 3LM9A 3IUCA 2QWQA 1KAZA 1ZXOA 3A5OC 1T44A 1BDGA 3LM2A 2WUSA 5AR0A 5BR9A 4XH5A 3CJBA 4M7YA 4H0VB 3MN9A 5BN9A 2Q31A 1NLVA 3F9MA 3BUZB 2IVOA 3G25A 4IXCA 1NGGA 2ASPA 3DWLA 2QXLA 1C0GA 3EN9A 3VERA 1HX1A 4WYBA 2AP1A 3ATUA 3SMSA 4A2AA 5F0XA 3SJHA 1XQSC 4BR9A 1MWKA 4PKIA 3R6MA 4MO5A 4NO7A 1K8KA 3VEZA 2QWPA 1QQOA 4BQZA 3MN5A 4H5TA 2QWRA 3DJCA 1BO5O 4ISEA 3CI5A 4DB3A 5CE3A 2GEMA 3GL1A 3UB5A 2ASOA 3ENHA 3AARA 5EY4A 4BQLA 1GLJO 2GWJA 2NRHA 1BG3A 4EIAA 3QBWA 2PAVA 4ISGA 3U9ZA 3H6EA 3CQYA 1T6DA 2CH6A 4FWLA 1NGEA 3U4LA 2E88A 3L4IA 4CZIA 5JLFA 1JCGA 4JD2A 5KPTA 2FLOA 3WXKA 4CI6A 1KAXA 3FZKA 1HLUA 1Q18A 3CJ1A 3H1QA 5BRHA 1NGBA 2HF4A 2FXUA 3H1VX 3M3ZA 5B8HA 5AQQA 2P9UA 3D2FA 4BR5A 3O1WA 2W41A 3CETA 4BR4A 2Q97A 2V51B 2FF6A 2HF3A 2UYTA 2CGJA 3VPZA 3BF3A 2QM1A 3UE5A 5AQSA 4BRDA 2FF3B 3VEXA 2E2PA 3JXUA 3U8XA 4C23A 4WQ4A 3B8AX 3VETA 1SZ2A 3TU5A 5AZJA 1RDWX 3H3NO 2D1KA 2E1ZA 4IO8A 4JD2B 3VGKA 3MDQA 1EQYA 3A5LC 3J8AA 4B1ZA 4BR0A 1NGCA 4BC2A 4GNIA 3WT0A 3KZBA 4KBOA 5AQFA 1R59O 1QZ6A 2P9UB 1YAGA 3D2FB 1BU6O 1TUUA 5FPNA 1KXPA 3CHWA 1HJOA 2ZF5O 1X3NA 3D2EA 3ZX3A 4CZMA 5AFUA 3HTVA 5AZJB 1J6ZA 2E8AA 4PL8A 4E1JA 2E1YA 2Q36A 1QQNA 4FPBA 1HKCA 4IZ9A 1CZAN 4H5RA 1BA0A 2A6AA 5JLHA 4XEIA 4BRCA 3I8BA 4CZEA 1V4SA 3QBXA 3D2EB 3D7EO 5ADXH 5AQGA 3EKUA 5AQPA 3ID8A 3AAQA 5AQTA 4F9OA 2NZTA 3FZLA 4GY2B 3O1BA 1BA1A 2YI1A 3H45C 2FSJA 3SK3A 2KHOA 3DAWA 5AQUA 1TYQA 4A62A 4YDUC 2ASMA 3JS6A 4B1WB 3ZEUA 2CGKA 4BGBA 4DCHA 3LDNA 3WEEA 5FPDA 5F1XA 4L3QA 3VOVA 5AFUH 4FOEA 4WQ5A 4IJAA 3WXIA 3DXMA 5AQJA 3SLCA 3WUHA 5EXWA 1Z05A 5JICA 3VF6A 1GLFO 3M1FA 3LDLA 3VGLA 4BRKA 3SMPA 1TYQB 3R8EA 2E2OA 3RSEA 3AY9A 4AM7A 4H5VA 3VEYA 3ZEUB 5AQXA 3WEEB 2E2QA 1DGKN 1MDUB 2Q1NA 3MCPA 3MN7A 4CZJA 2VYPA 3UKRA 4FWPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HYFA 2F9TA 3VF4A 5M1PA 3P4IA 3ZT3A 1HKGA 3BZKA 3ID6A 4CERA 3U3YA 2HHVA 1HYVA 3VF2A 3DLBA 4Z4HA 3OYIA 3KKSA 4FLVA 5AQKA 1KRPA 4CBXA 1S6QA 4BRNA 1HQUA 1BI4B 4DU1A 5CR4A 2FBTA 3L2UA 3KK7A 2B4JA 4E1MA 4PKHA 1NU0A 5AZIA 3UKRB 1N33K 4KPYA 2HHWA 4M3XA 1T6CA 3AO2A 3PSFA 3FE1A 5EOYA 3L0QA 3ZSYA 3MXMA 4OLBA 4FWOA 3QNNA 3PX6A 1ZBUA 2IVPA 4JKGA 1ZBSA 5HLFA 1U04A 4JI5K 4DSKA 1JLFA 1S6PA 3E1YA 1XWLA 1BCOA 3CCUN 5DMRA 4IWVA 1NGJA 1K9MO 2EHGA 3CCQN 3VQDA 4YHHK 4O5FA 3DXKA 5F2RA 4PWDA 3MK6A 2O8DB 1YXQA 1RDCA 1U6ZA 2YKNA 1VQKN 2ITMA 1NKCA 3O80A 2HNYA 2P5GA 4CZHA 3QIPA 5BR8K 4BDPA 1TV6A 4FOIA 3M6GA 4CZGA 1NJWA 4ZHRA 3WXJA 3JAMO 2RE2A 3THXB 2ZWHA 4BGAA 3NAEA 3ZSVA 3TAEA 3TSPA 4W5TA 3O4WA 2Q0RA 2Q0UA 3FR0A 4BRIA 1UAXA 3OBYA 1YUWA 3HO1A 3EO3A 3A8YA 5C42A 1GLBG 5KTQA 3T7ZA 1FW6A 1VQ6N 4JV5K 1Q86O 1CXQA 2HVHA 2P9LA 4CBUA 4E7JA 3DRSA 4HTLA 1NOZA 5CYQA 1NGFA 4FPAA 2W40A 3KKRA 4FLZA 2RN2A 2NRRA 3C7NA 2P9KB 3I33A 5FDLA 1WSJA 5BRFA 1B9DA 2KFZA 3ZT2A 4O0JA 1IG8A 1XC3A 1QZ5A 1S72N 4CEBA 2DPNA 3O5BA 1S5JA 1NGHA 3SAFA 2QWNA 3QMLA 3VEOA 2PZSA 4BVPA 1TKXA 1VRTA 4CFDA 1ZBFA 4B9SA 4BROA 4CFBA 1RILA 4KTWA 1WAJA 3OYLA 4EAHD 2QI2A 3A5NC 3ZSOA 2GTDA 2ETJA 1NG9A 2P9NA 3CERA 3CCRN 4B1YB 1HJRA 3QERA 4E7IA 4JI8K 4DTSA 4WQ4C 3K58A 4K41A 3K5MA 4DR1K 5AQIA 4OLAA 4NB4A 5FPMA 4QS7A 3VTIA 3J7ZO 4K42A 4Y1DA 3P5JA 4CJRA 1JL1A 4BE1A 4IKFA 1RDDA 1LWCA 3M8RA 4JLHA 4Z94A 2UXBK 3PUFA 1S1UA 1WOQA 4H0XB 4NYFA 1IBKK 4LF8K 4CFAA 2H3GX 4YDUA 3LL3A 3TABA 1W2BM 3WNHA 1RDBA 4BR7A 3I8DA 3EEQA 3V1OA 3OS2A 4CE9A 1E4GT 4JRQA 4JHDB 3OYGA 4CJLA 1ZBHA 1HNIA 1K8KB 2AJQA 3R9PA 4HHTA 5KI6A 1ZBLA 3SPYA 1P90A 5AQYA 1JL2A 3LDPA 3ULEB 4LFCK 5AQRA 3IFRA 3T69A 2VQEK 2O8BA 1QQMA 4Q0BA 3ALYA 3VEVA 1S9GA 2KKZA 4KI4A 4O55A 2GWKA 4BVOA 1GLAG 3MCAB 5AQNA 1NK7A 1L3SA 5HROA 3ZLJA 4ILGB 5LMUK 4KHWA 2KLAA 3AVGA 4DV6K 3NH1A 3CF5L 4CEQA 2HMPA 3LPTA 4LFBK 4M45A 5LY3A 1X1PA 4N47A 5GAGP 3SV4A 2P9IA 4DTUA 3V9WA 3AAPA 4M3WA 4KHUA 5FPEA 5J2MA 4KHPK 2DFHA 3C6HA 2HBMA 2GUIA 4YOTA 3ZT1A 4B3OA 1YJNN 3L3VA 5E84A 3CFOA 3QICA 2E6MA 3O6WA 2X6NA 3C6UA 2ZM6K 3O3HA 1ZYQA 1IH7A 5FROA 4OGEA 5SWMA 4CEOA 5AQVA 3LM9A 1S9EA 4JI2K 4OPKA 1EETA 1VAZA 1VQ5N 3KD5E 1EKEA 1BDGA 3KJVA 2WUSA 3IS9A 5BR9A 3C6AA 4QCLA 5BN9A 2Q31A 1NLVA 2IGIA 3SAGA 1GOBA 2Q3SA 2P5OA 1TK5A 4CJSA 1NGGA 2ASPA 2QXLA 2XY8A 3BZCA 1WSHA 3ZCMA 1OH8A 1HX1A 5DM6L 4WYBA 3SMSA 4BACA 1KC8O 1EXQA 1RTHA 4CHYA 1D9FA 1YTAA 4WE1A 3VEZA 2QWPA 1QQOA 2NNWA 1BQMA 4FXDA 5CE3A 3LAKA 3UB5A 5GAHP 2ASOA 2UU9K 3MAQA 1VQLN 1J53A 3S3NA 2P1JA 4EIAA 3LWMA 3H6EA 3THYB 4A59A 3AGKA 4MQ3A 3BY5A 4E3SA 3DRRA 1YIJN 1IV0A 2E88A 4CZIA 5JLFA 1JCGA 5KPTA 3WXKA 2VWJA 3RR7A 4PUOA 1BIZA 2ZJPL 3S3OA 2LSNA 3H1QA 5BRHA 1CXUA 2HF4A 4YOUA 3H1VX 3M3ZA 3DLEA 5AQQA 2O8EA 3OYCA 2Q97A 3SYZA 2FF6A 4LF7K 3WNFA 4CJKA 1R0AA 4BRDA 4N76A 1YITN 3B8AX 3VETA 1SZ2A 3TU5A 4HCBA 1W9HA 2HHSA 3H3NO 2VQFK 2D1KA 4IO8A 4CGGA 1WBDA 4YFUA 4E89A 3HJFA 4B1ZA 3KK1A 4LD0A 3AA3A 1UWBA 3KZBA 3QLHA 3TTCA 3K0SA 1BU6O 1VQPN 5M1QA 3SPZA 3PO4A 5DM7L 3CC4N 3THWB 1ILYA 2ZF5O 1X3NA 1DTTA 3D2EA 4AH9A 4CZMA 5AFUA 1IG9A 4QAGA 5C15A 3DI6A 5J2NA 4ILHA 4CGFA 1QQCA 1NK6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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