4O76A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with tg101209
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
b'SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/inhibitor
total genus 42
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o76A01
2DWWA 4KV4A 2R0YA 4HXPA 4YBMA 4UYHA 5D3LA 3QZTA 3P5OA 3IU5A 4HXNA 4YAXA 5BT3A 5D3RA 5DX4A 4YABA 4NR4A 5HQ6A 4BJXA 2DKWA 4YADA 5LJ1A 4OGIA 2R10A 5CUCA 2LSPB 5FE4A 4A9MA 4WHWA 4MR6A 5LKXA 5FFWA 4KV1A 3ONIA 5KTWA 4NR7A 4HXMA 5FE2A 5CQ7A 4BW3A 3IU6A 4Q0NA 1EQFA 5EM3A 4DONA 5LVQA 5I40A 5E74A 2F6JA 4QSVA 2MJVB 5CUGA 4PTBA 5DFCA 4HBYA 3O36A 5D3JA 5FE5A 4IR3A 3SVHA 5J0DA 5EPSA 4QSXA 4E96A 2OSSA 4O72A 5LKZA 5DYAA 4QEUA 5C87A 4MEPA 3P1FA 4YYHA 4O75A 4QZSA 5JWMA 4UIUA 5TB6A 5E9LA 5AD3A 5ENEA 4QSSA 5F62A 5ACYA 5F1HA 5I88A 4NR6A 5I86A 4J1PA 5IBNA 5HFRA 4NR5A 3LQIA 1F68A 5F5ZA 4UIVA 5C8GA 5DW1A 5HCLA 5FH8A 4WHUA 5FFVA 3UVYA 3P1EA 4A9KA 4CURA 3SVGA 5G4SA 5LJ0A 3LQJA 4YYNA 5FE3A 5CUBA 4QY4A 4QSPA 5L96A 4IR6A 3MULA 5FE9A 5HRVA 2NXBA 4PKLA 4PS5A 5EICA 4QEWA 3HMHA 4YATA 4LYIA 3DWYA 3JVMA 4GPJA 4QYLA 3U5MA 3MB3A 4YH3A 5FG4A 5HRWA 5A83A 5A81A 4QSWA 5KO4A 2KTBB 2G4AA 4J0RA 4ALHA 4ALGA 4N4FA 5LKUA 3QZSA 5KTXA 4HBXA 5FH7A 2YQDA 4NXJA 2R0SA 3SVFA 5C4QA 4NQNA 5IIDA 5EA1A 2DVQA 5EPBA 4UYDA 5CU8A 4QBMA 4N3WA 4XUBA 2YEKA 3P1DA 2F6NA 2D9EA 4CFKA 5C7NA 5CGPA 5EWWA 4Z93A 3G0LA 4Z6HA 2RO1A 2DVRA 5ENGA 5BT5A 5EK9A 5FFYA 4YYIA 5HLSA 3U5PA 4QSTA 4AKNA 2RFJA 3Q2EA 3DAIA 3AQAA 5EVAA 5EI4A 4TYLA 5AMEA 5EV9A 4CLBA 4QNSA 5ETDA 4PCIA 2DVSA 5E9IA 5A5RA 3O35A 3O33A 4ZQLA 4TU4A 4A9IA 4MEQA 5D7XA 5H1UA 2YELA 5BT4A 5EWHA 3UV2A 5E3DA 4Z6IA 5D3SA 2E7NA 4HXKA 2L5EA 4O76A 4NQMA 3D7CA 4X2IA 4QC3A 4LZRA 4O77A 4J0SA 4TS8A 5CUAA 2WP2A 3RCWA 3TLPA 4O74A 4TT2A 5DYUA 3I3JA 4QSUA 4YH4A 5E9YA 4O71A 5DFBA 3Q2FA 4CL9A 4BW4A 4O7EA 5FE8A 5FG5A 5FE6A 5CQ6A 4XY8A 5EU1A 4LR6A 3HMFA 4N4IA 5TCMA 4HXOA 5L97A 4OUFA 5HELA 2N9GA 5I83A 5D3NA 5DKCA 4NRBA 5FBXA 5IGLA 4C66A 3O37A 5C89A 2L85A 5E9VA 4TZ2A 5EWCA 5H1VA 4YC9A 3UVXA 4BW2A 5DLXA 5CPEA 2FSAA 4LZSA 4UYFA 3FKMX 2YYNA 4QB3A 4LYSA 4CUSA 4MR4A 4J3IA 5ENFA 3S92A 4N4HA 5IGKA 5LKTA 1X0JA 4CUTA 3UV4A 5DKDA 5DYXA 4YYKA 5LVRA 3UW9A 2H60A 4LZ2A 5E73A 4ZW1A 5D3TA 5E3GA 5FDZA 4YY6A 4NR9A 5A5SA 4UIZA 4NS5A 4TT6A 4CUPA 4RVRA 4YYGA 4NR8A 4A9NA 4O78A 5IGNA 5IG6A 1N72A 4PY6A 4TTEA 5EGUA 5HFQA 4O7CA 3UVWA 3GG3A 4TQNA 1JSPB 5I89A 4O70A 4HXLA 5FE1A 4UITA 4YYDA 4A9FA 3U5OA 5EISA 4KCXA 4Z1SA 5CUDA 5F25A 5II1A 3UV5A 4MEOA 5FH6A 4UYGA 5I7XA 2RS9B 5EWVA 3MB4A 4QR3A 4IR4A 5L99A 5F36A 5A82A 5EWDA 5F60A 4NRAA 5FB0A 4QR4A 2OUOA 5ENCA 5D25A 4Y03A 4LRGA 5HM0A 2GRCA 4QUTA 4CUQA 5C85A 2I7KA 5HQ5A 1WUGA 5F61A 5D0CA 5EP7A 5ENBA 4YBSA 2RNWA 4MENA 5E9KA 5II2A 4XY9A 3G0JA 4QUUA 5F3AA 4F3IA 4YYJA 4QSQA 4N4GA 5AD2A 5ETBA 5CQ8A 5FG6A 4WIVA 5CQ3A 5I7YA 5CTLA 3HMEA 4NUCA 5I80A 5HQ7A 2RNXA 4HBVA 3NXBA 5H1TA 5CQTA 4HBWA 5E7DA 5DLZA 4YK0A 4IORA 4NUDA 5HJCA 2E3KA 4LDFA 5FB1A 4OGJA 4IOOA 5CRMA 5F2PA 2DATA 3MQMA 4UIYA 4IOQA 4BHWA 4A9HA 5A85A 3U5NA 4Z1QA 5I29A 4IR5A 4C67A 4A9LA 2R0VA 3LQHA 3K2JA 4YBTA 5L8UA 5I1QA 2E7OA 4QR5A 5ENJA 4XYAA 4LC2A 4CUUA 5KTUA 4UIWA 5JI8A 5KHMA 5G4RA 2YDWA 4HXRA 5EQ1A 5DY7A 5A5QA 5F63A 2RI7A 5DYCA 5L8TA 5CY9A 3P1CA 4CFLA 5COIA 5CZGA 4NYXA 4BW1A 5EPRA 3U5LA 4QEVA 2YW5A 4QC1A 4UYFB 5KU3A 4A9OA 5HRXA 4UIXA 4A9EA 4NYVA 5CP5A 5ENHA 4NUEA 5CFWA 1E6IA 3U5JA 5LJ2A 5L98A 5E0RA 2L84A 4QSRA 5DFDA 2OO1A 2YEMA 4XUAA 5D3PA 5A5NA 5IGMA 3MXFA 2WP1A 4LYWA 5CUEA 5D24A 3JVKA 3AADA 4FLPA 5CRZA 4MR3A 3LJWA 5AMFA 5CQAA 3ZYUA 2I8NA 4TU6A 5CQ5A 5CQ4A 5ENIA 4A9JA 1JM4B 4PCEA 3QZVA 4NYWA 4O7BA 4QYDA 5HEMA 3O34A 1ZS5A 5HENA 3MUKA 5DKHA 3LXJA 5FE0A 5H85A 5A5PA 3U5KA 1WUMA 2D82A 3UVDA 4TZ8A 5FE7A 4O7AA 4O7FA 5DW2A 4TT4A 4UYEA 2DVVA 5A7CA 5LUUA 2RNYA 5D26A 4YYMA 3JVJA 4HXSA 4NRCA 4YY4A 5D3HA 5K29A 3JVLA 5DBMA 5E9MA 5A5OA 4MR5A 4Q0OA 5CS8A 5F1LA 3S91A 4ZC9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DWWA 4KV4A 3D1BA 2R0YA 4HXPA 4YBMA 4UYHA 5D3LA 3QZTA 3P5OA 3IU5A 4HXNA 4YAXA 5BT3A 5D3RA 5DX4A 4YABA 4NR4A 5HQ6A 4BJXA 2DKWA 4YADA 5LJ1A 4OGIA 2R10A 5CUCA 2LSPB 5FE4A 4A9MA 4WHWA 4MR6A 5LKXA 5FFWA 4KV1A 3ONIA 5KTWA 4NR7A 4HXMA 4AKGA 5FE2A 5CQ7A 4BW3A 3IU6A 4Q0NA 1EQFA 5EM3A 4DONA 5LVQA 5I40A 5E74A 2F6JA 4QSVA 2MJVB 5CUGA 4PTBA 5DFCA 4HBYA 3O36A 5D3JA 5FE5A 4IR3A 3SVHA 5J0DA 5EPSA 4QSXA 4E96A 2OSSA 4O72A 5LKZA 5DYAA 4QEUA 5C87A 4MEPA 3P1FA 4YYHA 4O75A 4QZSA 5JWMA 4UIUA 5TB6A 5E9LA 5AD3A 5ENEA 4QSSA 5F62A 5ACYA 5F1HA 5I88A 4NR6A 5I86A 4J1PA 5IBNA 5HFRA 4NR5A 3LQIA 1F68A 3D1DA 5F5ZA 4UIVA 2EJNA 5DW1A 5C8GA 5HCLA 5FH8A 4WHUA 5FFVA 3UVYA 3P1EA 4A9KA 4CURA 3SVGA 5G4SA 5LJ0A 3LQJA 4YYNA 5FE3A 5CUBA 4QY4A 4QSPA 5L96A 4IR6A 3MULA 5FE9A 5HRVA 2NXBA 4PKLA 4PS5A 5EICA 4QEWA 3HMHA 4YATA 4LYIA 3DWYA 3JVMA 4GPJA 3VKGA 4QYLA 3U5MA 3MB3A 4YH3A 5FG4A 5HRWA 5A83A 5A81A 4QSWA 5KO4A 2KTBB 2G4AA 4J0RA 4ALHA 4ALGA 4N4FA 5LKUA 3QZSA 5KTXA 4HBXA 5FH7A 2YQDA 4NXJA 2R0SA 3SVFA 5C4QA 4NQNA 5IIDA 5EA1A 2DVQA 5EPBA 4UYDA 5CU8A 4QBMA 4N3WA 4XUBA 4AKHA 2YEKA 3P1DA 2F6NA 2D9EA 4CFKA 5C7NA 5CGPA 5EWWA 4Z93A 3G0LA 4Z6HA 2RO1A 2DVRA 5ENGA 5BT5A 5EK9A 5FFYA 4YYIA 5HLSA 3U5PA 4QSTA 4AKNA 2RFJA 3Q2EA 3DAIA 3AQAA 5EVAA 5EI4A 4TYLA 5AMEA 5EV9A 4CLBA 4QNSA 5ETDA 4PCIA 3VKHA 2DVSA 5E9IA 5A5RA 1ZKRA 3O35A 3O33A 4ZQLA 4TU4A 4A9IA 1PUOA 4MEQA 5D7XA 5H1UA 2YELA 5BT4A 5EWHA 3UV2A 5E3DA 4Z6IA 5D3SA 2E7NA 4HXKA 2L5EA 4O76A 4NQMA 3D7CA 4X2IA 4QC3A 4LZRA 4O77A 4J0SA 4TS8A 5CUAA 2WP2A 3RCWA 3TLPA 4O74A 4TT2A 5DYUA 3I3JA 4QSUA 3ERRA 4YH4A 5E9YA 4O71A 5DFBA 3Q2FA 4CL9A 4AKIA 4BW4A 4O7EA 5FE8A 5FG5A 5FE6A 5CQ6A 4XY8A 5EU1A 4LR6A 3HMFA 4N4IA 5TCMA 4HXOA 5L97A 4OUFA 5HELA 2N9GA 5I83A 5D3NA 5DKCA 4NRBA 5FBXA 5IGLA 4C66A 3O37A 5C89A 2L85A 5E9VA 4TZ2A 5EWCA 5H1VA 4YC9A 3UVXA 4BW2A 5DLXA 5CPEA 2FSAA 4LZSA 4UYFA 3FKMX 2YYNA 4QB3A 4LYSA 4CUSA 4MR4A 4J3IA 5ENFA 3S92A 4N4HA 5IGKA 5LKTA 1X0JA 4CUTA 3UV4A 5DKDA 5DYXA 4YYKA 5LVRA 3UW9A 2H60A 4LZ2A 5E73A 4ZW1A 5D3TA 5E3GA 5FDZA 4YY6A 4NR9A 5A5SA 4UIZA 4NS5A 4TT6A 4CUPA 4RVRA 4YYGA 4NR8A 4A9NA 4O78A 5IGNA 5IG6A 1N72A 4PY6A 4TTEA 5EGUA 5HFQA 4O7CA 3UVWA 3GG3A 4TQNA 1JSPB 5I89A 4O70A 4HXLA 5FE1A 4UITA 4YYDA 4A9FA 3U5OA 5EISA 4KCXA 4Z1SA 5CUDA 5F25A 5II1A 3UV5A 4MEOA 5FH6A 4UYGA 4AI6A 5I7XA 2RS9B 5EWVA 3MB4A 4QR3A 4IR4A 5L99A 5F36A 5A82A 5EWDA 5F60A 4NRAA 5FB0A 4QR4A 2OUOA 5ENCA 5D25A 4Y03A 4LRGA 5HM0A 2GRCA 4QUTA 4CUQA 5C85A 2I7KA 5HQ5A 1WUGA 5F61A 5D0CA 5EP7A 5ENBA 4YBSA 2RNWA 4MENA 5E9KA 5II2A 4XY9A 3G0JA 4QUUA 5F3AA 4F3IA 4YYJA 4QSQA 4N4GA 5AD2A 5ETBA 5CQ8A 5FG6A 4WIVA 5CQ3A 5I7YA 5CTLA 3HMEA 4NUCA 5I80A 5HQ7A 2RNXA 4HBVA 3NXBA 5H1TA 5CQTA 4HBWA 5E7DA 5DLZA 4YK0A 4IORA 4NUDA 5HJCA 2E3KA 4LDFA 5FB1A 4OGJA 4IOOA 5CRMA 5F2PA 2DATA 3MQMA 4UIYA 4IOQA 4BHWA 4A9HA 5A85A 3U5NA 4Z1QA 5I29A 4IR5A 4C67A 4A9LA 2R0VA 3LQHA 3K2JA 4YBTA 5L8UA 5I1QA 2E7OA 4QR5A 5ENJA 4XYAA 4LC2A 4CUUA 5KTUA 4UIWA 5JI8A 5KHMA 5G4RA 2YDWA 4HXRA 5EQ1A 5DY7A 5A5QA 5F63A 2RI7A 5DYCA 5L8TA 5CY9A 3P1CA 4CFLA 5COIA 5CZGA 4NYXA 4BW1A 5EPRA 3U5LA 4QEVA 2YW5A 4QC1A 4UYFB 5KU3A 4A9OA 5HRXA 4UIXA 4A9EA 4NYVA 5CP5A 5ENHA 4NUEA 5CFWA 1E6IA 3U5JA 5LJ2A 5L98A 5E0RA 2L84A 4QSRA 5DFDA 2OO1A 2YEMA 4XUAA 5D3PA 5A5NA 5IGMA 3MXFA 2WP1A 4LYWA 5CUEA 5D24A 3JVKA 3AADA 4FLPA 5CRZA 4MR3A 3LJWA 5AMFA 5CQAA 3ZYUA 2I8NA 4TU6A 5CQ5A 5CQ4A 5ENIA 4A9JA 1JM4B 4PCEA 3QZVA 4NYWA 4O7BA 4QYDA 5HEMA 3O34A 1ZS5A 5HENA 3MUKA 5DKHA 3LXJA 5FE0A 5H85A 5A5PA 3U5KA 1WUMA 2D82A 3UVDA 4TZ8A 5FE7A 4O7AA 4O7FA 5DW2A 4TT4A 4UYEA 2DVVA 5A7CA 5LUUA 2RNYA 5D26A 4YYMA 3JVJA 4HXSA 4NRCA 4YY4A 5D3HA 5K29A 3JVLA 5DBMA 5E9MA 5A5OA 4MR5A 4Q0OA 5CS8A 5F1LA 3S91A 4ZC9A
chains in the Genus database with same CATH topology
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