4O77A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with sb 202190
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/inhibitor
total genus 46
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o77A01
5ACYA 3GG3A 5FE4A 4GPJA 4Z6IA 4QSPA 5A5SA 3QZSA 4F3IA 3I3JA 5KU3A 3S91A 2OUOA 4MR3A 4QB3A 4LC2A 5CGPA 5J0DA 5ENHA 5LKUA 4QEVA 5CUDA 4YADA 4IR5A 5I29A 5KHMA 4BJXA 4TZ2A 4E96A 4N4FA 5FG5A 4NYWA 5E9MA 2GRCA 5DLZA 5CZGA 4YYKA 2YEKA 3S92A 4O70A 5ENFA 5F25A 5HRXA 4MR5A 4DONA 4XUBA 3UV2A 5CQTA 5FG6A 4MEOA 3SVGA 5E9YA 5LKTA 4TT6A 4YYHA 5FH8A 4NR6A 4QY4A 5IGLA 5CRMA 4O7EA 4YY4A 5CUGA 4J0SA 5HQ6A 3K2JA 4NS5A 5CQ6A 5COIA 5E9IA 5C4QA 2D9EA 2E7OA 4IOQA 4J0RA 1WUGA 4CFLA 5HRWA 4LYIA 2G4AA 5EI4A 4Z6HA 3SVFA 2R0VA 5ENCA 5LJ1A 4LR6A 1EQFA 3LQJA 5DY7A 5ENJA 5TCMA 5IGMA 4HXRA 3MQMA 4UYEA 5CQ7A 4N3WA 4YBMA 3LQHA 4TS8A 4NUDA 4A9HA 4RVRA 5F3AA 2DATA 4X2IA 2DWWA 4NR5A 5E0RA 4QYDA 5A5QA 4HXLA 2OO1A 5DFDA 4MR6A 4TT4A 5I1QA 4ZC9A 5DFCA 4PS5A 5E7DA 5H85A 4A9MA 4QR4A 3U5LA 5JI8A 5DYAA 2R0YA 5FE1A 4Z1QA 5LVQA 3G0LA 3NXBA 5EP7A 5CQ3A 5ETBA 3QZVA 4O78A 4QSUA 5CQAA 3P5OA 4TQNA 5FE9A 5EQ1A 4BW3A 4O7BA 5CPEA 3DWYA 5E9KA 4HBYA 5D3HA 5FE6A 4IR3A 5CUAA 4NUCA 3P1DA 5CQ5A 5A85A 5L96A 5AD3A 1JSPB 5ENIA 5DW1A 5FH7A 5EGUA 5IGKA 4CURA 2YQDA 5I40A 5L8UA 4XY8A 5KO4A 2L5EA 4NQNA 5HRVA 4TTEA 4BW1A 2WP2A 5I83A 5FB1A 4O7AA 5EM3A 5FFVA 4QYLA 4LYSA 4Q0NA 4YBTA 3O34A 4QR3A 4UITA 5EWWA 5F63A 3O36A 4CUSA 3Q2EA 4UYFA 4CLBA 2MJVB 5DFBA 4MEPA 4NXJA 5F2PA 4O77A 4CUPA 4YBSA 5A5NA 5CQ4A 4A9NA 5EPBA 4NQMA 2E3KA 2RNYA 4QSXA 3Q2FA 3AQAA 5F61A 4Z93A 5FE7A 5LJ2A 4HXMA 2YEMA 5A7CA 2RI7A 4LZRA 4O75A 4TT2A 5D0CA 4UIXA 2FSAA 5C7NA 4ZQLA 4NR8A 5CS8A 3UV5A 5H1TA 4NYVA 4QNSA 5E73A 4QSQA 5C85A 4YH3A 4HXPA 3UW9A 3UVYA 3JVJA 5DYUA 4A9EA 5F1HA 2R0SA 4PCEA 5EVAA 2I8NA 2F6NA 3FKMX 4QSRA 5HM0A 1N72A 4NRAA 4A9JA 3LQIA 5BT4A 3QZTA 4A9LA 4HXKA 5EWDA 3RCWA 4BHWA 4NR4A 5LJ0A 5A5OA 5D26A 4HBXA 4PCIA 5EWHA 2R10A 4YATA 5JWMA 4TU6A 5EU1A 4O71A 4A9KA 2YW5A 4TU4A 4C67A 4YYIA 5KTWA 3D7CA 5D25A 4QEUA 3MXFA 5IBNA 5D24A 4UYFB 4QSVA 5C87A 3SVHA 2RNWA 5DLXA 4LZSA 3O35A 5CUCA 5EPRA 4ALHA 3U5MA 4QSWA 4YY6A 4WHWA 5A5PA 3ONIA 5F5ZA 4MEQA 5DYCA 4WIVA 4QSTA 4MR4A 5EV9A 5HFQA 5HFRA 5D3SA 4YC9A 2D82A 3P1EA 5I89A 5F60A 4PY6A 5KTUA 4LZ2A 4YH4A 4Q0OA 5EISA 5FH6A 5DYXA 3U5OA 4UIUA 5L99A 2OSSA 4OUFA 5L98A 5CFWA 5F1LA 5HCLA 4LYWA 4HXNA 5IGNA 5C89A 3P1FA 5EA1A 5KTXA 2KTBB 5A81A 4CUTA 5D3TA 4NRBA 4N4HA 5TB6A 4QSSA 5I88A 3JVMA 5C8GA 5H1VA 4QZSA 4QC1A 3HMHA 5L97A 4OGJA 3IU5A 3JVKA 4Y03A 4XUAA 5FE3A 4A9FA 5HEMA 4LRGA 5D3NA 3U5KA 1ZS5A 2RFJA 3DAIA 5BT3A 5DW2A 4O76A 5IIDA 5ENBA 4N4IA 5IG6A 4XYAA 5LUUA 5CP5A 4O7CA 5CRZA 4UYGA 4IR4A 5BT5A 5E3GA 3P1CA 5EK9A 4IORA 5CY9A 5CUEA 4O74A 5HJCA 3UVXA 3O33A 5DKHA 5DKCA 4NUEA 2DVVA 5FG4A 4FLPA 3LXJA 4HXSA 5FE0A 4KV1A 4O7FA 4A9IA 4CUQA 3G0JA 4QC3A 4OGIA 4HXOA 5I7XA 5D3RA 5AMFA 4NR7A 4QUUA 5DX4A 1X0JA 2DVRA 4CL9A 5E3DA 4YYDA 5I7YA 5D7XA 4N4GA 4UYHA 5CQ8A 2L84A 4TYLA 2YELA 5AMEA 4YYJA 5II2A 5I86A 5K29A 5FBXA 5EPSA 2L85A 2F6JA 2WP1A 3MB4A 4TZ8A 2LSPB 2RO1A 3O37A 2NXBA 5FFYA 2DVSA 2H60A 2N9GA 4NYXA 5AD2A 4KCXA 5FE8A 2YDWA 5HQ7A 2E7NA 2DKWA 5ETDA 1E6IA 5FFWA 3HMEA 1F68A 4UIWA 4MENA 2I7KA 4KV4A 4QR5A 5E74A 5E9VA 4NR9A 5FB0A 5LVRA 3MB3A 3UV4A 4HBVA 5D3JA 5I80A 3IU6A 4BW4A 3HMFA 4QEWA 4IR6A 5CU8A 2RNXA 4C66A 5FE5A 5ENGA 5L8TA 4HBWA 5F36A 3U5JA 5EWCA 3LJWA 5FDZA 3UVWA 5EWVA 4QBMA 4XY9A 4YYGA 4YK0A 5FE2A 5ENEA 4A9OA 5CTLA 2DVQA 4UIVA 5EICA 4YAXA 3ZYUA 5DKDA 5LKZA 4NRCA 5HELA 5CUBA 4Z1SA 3U5NA 4BW2A 5F62A 5II1A 4UIZA 3TLPA 4LDFA 3U5PA 4UIYA 3MUKA 5D3PA 3AADA 4UYDA 2RS9B 5E9LA 3JVLA 4PKLA 4ZW1A 4IOOA 4AKNA 5HENA 4O72A 5A82A 5LKXA 4YYNA 5A5RA 4CUUA 5G4SA 1WUMA 4QUTA 4CFKA 5HLSA 5A83A 4J1PA 4WHUA 4ALGA 3MULA 5DBMA 5D3LA 4PTBA 5G4RA 1JM4B 4J3IA 4YABA 3UVDA 4YYMA 2YYNA 5HQ5A 5H1UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ACYA 3GG3A 5FE4A 4GPJA 4Z6IA 4QSPA 5A5SA 3QZSA 4F3IA 3I3JA 5KU3A 3S91A 2OUOA 4MR3A 4QB3A 4LC2A 5CGPA 5J0DA 5ENHA 5LKUA 4QEVA 5CUDA 4YADA 4IR5A 5I29A 5KHMA 4BJXA 4TZ2A 4E96A 4N4FA 5FG5A 4NYWA 5E9MA 2GRCA 5DLZA 5CZGA 4YYKA 2YEKA 3S92A 4O70A 5ENFA 5F25A 5HRXA 4MR5A 4DONA 4XUBA 3UV2A 5CQTA 5FG6A 4MEOA 3SVGA 5E9YA 5LKTA 4TT6A 4YYHA 5FH8A 4NR6A 4QY4A 5IGLA 5CRMA 4O7EA 4YY4A 5CUGA 4J0SA 5HQ6A 3K2JA 4NS5A 5CQ6A 5COIA 5E9IA 5C4QA 2D9EA 2E7OA 4IOQA 4J0RA 1WUGA 4CFLA 5HRWA 4LYIA 2G4AA 5EI4A 4Z6HA 3SVFA 2R0VA 5ENCA 5LJ1A 4LR6A 1EQFA 3LQJA 5DY7A 5ENJA 5TCMA 5IGMA 4HXRA 3MQMA 4UYEA 5CQ7A 4N3WA 4YBMA 3LQHA 4TS8A 4NUDA 4A9HA 4RVRA 5F3AA 2DATA 4X2IA 2DWWA 4NR5A 5E0RA 4QYDA 5A5QA 4HXLA 2OO1A 5DFDA 4MR6A 4TT4A 5I1QA 4ZC9A 5DFCA 4PS5A 5E7DA 5H85A 4A9MA 4QR4A 3U5LA 5JI8A 5DYAA 2R0YA 5FE1A 4Z1QA 5LVQA 3G0LA 3NXBA 5EP7A 5CQ3A 5ETBA 3QZVA 4O78A 4QSUA 5CQAA 3P5OA 4TQNA 5FE9A 5EQ1A 4BW3A 4O7BA 5CPEA 3DWYA 5E9KA 4HBYA 5D3HA 5FE6A 4IR3A 5CUAA 4NUCA 3P1DA 5CQ5A 5A85A 5L96A 5AD3A 1JSPB 5ENIA 5DW1A 5FH7A 5EGUA 5IGKA 4CURA 2YQDA 5I40A 5L8UA 4XY8A 5KO4A 2L5EA 4NQNA 5HRVA 4TTEA 4BW1A 2WP2A 5I83A 5FB1A 4O7AA 5EM3A 5FFVA 4QYLA 4LYSA 4Q0NA 4YBTA 3O34A 4QR3A 4UITA 5EWWA 5F63A 3O36A 4CUSA 3Q2EA 4UYFA 4CLBA 2MJVB 5DFBA 4MEPA 4NXJA 5F2PA 4O77A 4CUPA 4YBSA 5A5NA 2EJNA 5CQ4A 4A9NA 5EPBA 4NQMA 2E3KA 2RNYA 4QSXA 3Q2FA 3AQAA 5F61A 4Z93A 5FE7A 5LJ2A 4HXMA 2YEMA 5A7CA 2RI7A 4LZRA 4O75A 4TT2A 5D0CA 4UIXA 2FSAA 5C7NA 4AI6A 4ZQLA 4NR8A 5CS8A 3UV5A 5H1TA 4NYVA 4QNSA 5E73A 4QSQA 5C85A 4YH3A 4HXPA 3UW9A 3UVYA 3JVJA 5DYUA 4A9EA 4AKIA 5F1HA 2R0SA 4PCEA 5EVAA 2I8NA 2F6NA 3FKMX 4QSRA 5HM0A 1N72A 3ERRA 4NRAA 4A9JA 3LQIA 5BT4A 3QZTA 4A9LA 4HXKA 5EWDA 3RCWA 4BHWA 4NR4A 5LJ0A 5A5OA 5D26A 4HBXA 4PCIA 5EWHA 2R10A 4YATA 5JWMA 4TU6A 5EU1A 4O71A 4A9KA 2YW5A 4TU4A 4C67A 4YYIA 5KTWA 3D7CA 5D25A 4QEUA 3MXFA 5IBNA 5D24A 4UYFB 4QSVA 5C87A 3SVHA 2RNWA 5DLXA 4LZSA 3O35A 5CUCA 5EPRA 4ALHA 3U5MA 4QSWA 4YY6A 4WHWA 5A5PA 3ONIA 5F5ZA 4MEQA 5DYCA 1ZKRA 4WIVA 4QSTA 4MR4A 5EV9A 5HFQA 5HFRA 5D3SA 4YC9A 2D82A 3P1EA 5I89A 5F60A 4PY6A 5KTUA 4LZ2A 4YH4A 4Q0OA 5EISA 5FH6A 5DYXA 3U5OA 4UIUA 5L99A 2OSSA 4OUFA 5L98A 5CFWA 5F1LA 5HCLA 4LYWA 4HXNA 5IGNA 3D1DA 5C89A 3P1FA 5EA1A 5KTXA 2KTBB 5A81A 4CUTA 5D3TA 4NRBA 4N4HA 5TB6A 4QSSA 5I88A 3JVMA 5C8GA 5H1VA 4QZSA 4QC1A 3HMHA 5L97A 4OGJA 3IU5A 3JVKA 4Y03A 4XUAA 5FE3A 4A9FA 5HEMA 4LRGA 5D3NA 3U5KA 1ZS5A 2RFJA 3DAIA 5BT3A 5DW2A 4O76A 5IIDA 5ENBA 4N4IA 5IG6A 4XYAA 5LUUA 5CP5A 4O7CA 5CRZA 4UYGA 4IR4A 5BT5A 5E3GA 3P1CA 5EK9A 4IORA 5CY9A 5CUEA 4O74A 5HJCA 3UVXA 3O33A 5DKHA 5DKCA 4NUEA 2DVVA 5FG4A 4FLPA 3LXJA 4HXSA 5FE0A 4KV1A 4O7FA 4A9IA 4CUQA 3G0JA 4QC3A 4OGIA 4HXOA 5I7XA 5D3RA 5AMFA 4NR7A 4QUUA 5DX4A 1X0JA 2DVRA 4CL9A 5E3DA 4YYDA 5I7YA 5D7XA 4N4GA 4UYHA 5CQ8A 2L84A 4TYLA 2YELA 5AMEA 4YYJA 5II2A 5I86A 5K29A 5FBXA 5EPSA 2L85A 2F6JA 2WP1A 3MB4A 4TZ8A 4AKGA 2LSPB 2RO1A 3O37A 2NXBA 5FFYA 2DVSA 2H60A 2N9GA 4NYXA 5AD2A 4KCXA 5FE8A 2YDWA 5HQ7A 2E7NA 2DKWA 5ETDA 1E6IA 5FFWA 3VKGA 3HMEA 1F68A 4UIWA 4MENA 2I7KA 4KV4A 4QR5A 5E74A 5E9VA 4NR9A 5FB0A 5LVRA 3MB3A 3UV4A 4HBVA 5D3JA 5I80A 3IU6A 4BW4A 3HMFA 4QEWA 4IR6A 5CU8A 2RNXA 4C66A 5FE5A 3D1BA 5ENGA 5L8TA 4HBWA 5F36A 3U5JA 5EWCA 3LJWA 5FDZA 3UVWA 5EWVA 4QBMA 4XY9A 4YYGA 4YK0A 5FE2A 5ENEA 4A9OA 5CTLA 2DVQA 4UIVA 5EICA 4YAXA 3ZYUA 5DKDA 5LKZA 4NRCA 5HELA 5CUBA 4Z1SA 3U5NA 4BW2A 5F62A 5II1A 4UIZA 3TLPA 4LDFA 3U5PA 4UIYA 3MUKA 5D3PA 3AADA 4UYDA 2RS9B 5E9LA 3JVLA 4PKLA 4ZW1A 4IOOA 4AKNA 5HENA 4O72A 5A82A 5LKXA 4YYNA 5A5RA 4CUUA 5G4SA 1WUMA 4QUTA 4CFKA 5HLSA 5A83A 4J1PA 1PUOA 4WHUA 3VKHA 4ALGA 3MULA 5DBMA 5D3LA 4PTBA 5G4RA 1JM4B 4J3IA 4YABA 3UVDA 4YYMA 2YYNA 4AKHA 5HQ5A 5H1UA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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