4O77A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with sb 202190
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
b'SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/inhibitor
total genus 46
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o77A01
5FE8A 4J3IA 5L8UA 3P5OA 5EWCA 5I29A 3O35A 2I8NA 5CUAA 4YK0A 4QR3A 4CURA 4QSXA 5DYXA 5D25A 4J1PA 4TQNA 5CFWA 4IR4A 4QSRA 5E0RA 4PKLA 4XY9A 3DWYA 5BT5A 3MULA 5I7XA 5AMFA 4XY8A 4OUFA 4YYKA 4TU6A 5KTXA 4QC1A 4MEQA 4XUAA 1N72A 4UIZA 3U5MA 5FBXA 4UYDA 5EWHA 3TLPA 5FE3A 4RVRA 5L8TA 3GG3A 1JSPB 4QEVA 4HBYA 2DVSA 2RNYA 4YC9A 4WHUA 3O34A 5DY7A 5LJ1A 4TU4A 4ZQLA 5C8GA 5HRWA 4O77A 5C4QA 4CFKA 4YYNA 5FE4A 5D3PA 5D26A 4LC2A 4O7EA 4LYWA 4QC3A 4N4GA 5FE7A 4XYAA 5C85A 5HCLA 4AKNA 2D82A 4YABA 4A9LA 4MR5A 5C7NA 5H1TA 2DVQA 2YELA 3LQIA 4QNSA 3MB3A 5E9KA 5EWWA 5F25A 4QYLA 4KV4A 5FE6A 5A7CA 1WUGA 4UYFB 4QUUA 5LKUA 5LJ2A 4YYIA 2DATA 3U5PA 4QSVA 5KHMA 5EWVA 4YYHA 3IU5A 3UW9A 4LR6A 2DWWA 4HXKA 5F62A 4UYEA 4IOQA 4QB3A 5IGKA 5FG5A 5L98A 4LZ2A 5ENJA 5D3JA 2WP2A 5D24A 5HRVA 3MB4A 4MENA 2WP1A 4KCXA 4Z6HA 5DYAA 4PCIA 2R0SA 5F60A 5EICA 4HBWA 4NR9A 5EU1A 3SVFA 5ACYA 4A9NA 2RO1A 4QSWA 3HMEA 4N4IA 4NYWA 5CQ3A 5F63A 4NUEA 5IGLA 5EV9A 5JWMA 4UIYA 3LJWA 4Q0OA 5FFWA 5HENA 5A5RA 4O72A 2FSAA 5L99A 4TYLA 4HBVA 4QEWA 5CY9A 2E7OA 4QR4A 5CQ4A 5DLXA 2GRCA 4LZSA 5CRZA 3FKMX 2R0YA 4GPJA 3P1DA 5I1QA 5CZGA 5KTUA 5DW1A 4A9MA 2YDWA 5EM3A 4ALHA 4TT6A 5II2A 5CUEA 4YBSA 5E9LA 5COIA 4FLPA 5I7YA 4WHWA 4YH3A 5I86A 2N9GA 4TZ2A 5HLSA 5K29A 2YW5A 5DX4A 5ENIA 4QBMA 5D3HA 4NRBA 5D3LA 5KO4A 5F2PA 2DVRA 4BW1A 5LKZA 5CQ8A 4Z93A 3DAIA 4QYDA 5AD3A 4NXJA 5FE1A 4UIVA 5DFCA 4PS5A 2YYNA 3P1FA 5TB6A 5TCMA 4QSSA 3HMFA 5HQ5A 5D3RA 5CQ6A 2L5EA 5CGPA 5FB0A 5IGMA 4F3IA 5HRXA 5IGNA 4QSQA 4IR3A 5BT3A 4NUCA 5CQTA 5FE2A 4HXRA 5CQ5A 3Q2FA 4LYIA 3O37A 5ETBA 5C89A 4NR7A 3G0LA 5A5OA 4N4FA 5D7XA 2RNWA 4NS5A 4CL9A 5I83A 1F68A 3SVGA 5FH8A 1X0JA 3O33A 5EP7A 5E3GA 5CUCA 2E7NA 3MQMA 5ENFA 4UIXA 4NR5A 2L85A 4WIVA 4LDFA 3S91A 3S92A 4HXSA 4PCEA 4O75A 4ALGA 4MEPA 5E74A 2DVVA 3SVHA 4A9IA 5F1HA 5FH6A 3U5NA 4O7BA 4OGIA 3AQAA 3QZTA 3QZVA 5H1UA 3RCWA 2I7KA 5HQ7A 4BHWA 2YEMA 4A9KA 4DONA 2KTBB 4UYGA 4LRGA 4C67A 4CUPA 4NQMA 4YYMA 5A5PA 5F3AA 5EA1A 4NUDA 5IG6A 1JM4B 4QZSA 5EK9A 5DKDA 5EWDA 5FB1A 4A9OA 4A9EA 5FFYA 5FFVA 5ENHA 4HXNA 5II1A 5EPRA 5HJCA 5A82A 2G4AA 4HXOA 5LKTA 5HEMA 5D0CA 5CQ7A 2R10A 1E6IA 3U5LA 5A5SA 5D3SA 4NR8A 4MEOA 5DFDA 4OGJA 4TZ8A 5CU8A 4YYGA 5E9IA 4QEUA 5ENEA 4PY6A 5J0DA 3JVKA 3K2JA 5I80A 4YATA 3UVDA 2E3KA 3U5KA 4YYDA 5E7DA 4NRCA 4Q0NA 4IR6A 5F1LA 4CUSA 5ENBA 2DKWA 5LVRA 4CUUA 3UVWA 5FDZA 4O78A 4J0SA 4YBTA 4YAXA 5L97A 4QSTA 4YYJA 4Y03A 1EQFA 4O70A 4PTBA 4UIUA 2RI7A 4NR4A 5HQ6A 5EVAA 5D3TA 4O71A 5CS8A 4QSPA 3JVJA 3LXJA 4MR3A 5EPSA 5I88A 4YADA 3LQHA 4O7FA 5LJ0A 5A81A 5E9YA 4CUTA 4UITA 4E96A 3UV2A 5FE5A 2OUOA 4YBMA 5DW2A 2F6NA 4NRAA 4A9JA 5KU3A 4A9FA 3LQJA 4O74A 5C87A 5CPEA 4UYFA 4HXLA 5H85A 4O76A 5IIDA 5A5NA 5FH7A 4HXPA 2OO1A 5A5QA 3JVMA 5ENCA 3Q2EA 3P1EA 4MR4A 4TT4A 4BW3A 5D3NA 4CLBA 3MXFA 4Z1SA 5EI4A 2H60A 2YEKA 5HFQA 3NXBA 5H1VA 5A83A 5AD2A 4NYVA 5AMEA 4XUBA 4N4HA 4O7AA 5DKHA 4QUTA 5BT4A 5F5ZA 4QSUA 2L84A 5FG6A 4CUQA 5HFRA 4J0RA 2RNXA 2LSPB 5HM0A 2F6JA 4YH4A 5E73A 3U5OA 5CUDA 3ZYUA 4C66A 4LYSA 4ZC9A 5G4SA 4TT2A 4Z6IA 5ENGA 3D7CA 5DYUA 5CQAA 5ETDA 1WUMA 5IBNA 4MR6A 4O7CA 4QR5A 4TTEA 4TS8A 3I3JA 2MJVB 3MUKA 4HBXA 3UV5A 2RFJA 3HMHA 5CTLA 3UV4A 1ZS5A 3AADA 4LZRA 5DFBA 5I40A 4A9HA 5E9MA 4YY4A 4IR5A 5CUGA 5FG4A 4KV1A 3UVYA 2OSSA 3O36A 4CFLA 5HELA 4IOOA 2D9EA 4UYHA 4QY4A 5EQ1A 3QZSA 5DKCA 4BW4A 5E9VA 4ZW1A 5JI8A 5I89A 4NYXA 5CP5A 5DBMA 5DYCA 5FE9A 5LVQA 5A85A 5F61A 3ONIA 5EISA 3IU6A 5LKXA 5E3DA 2RS9B 3U5JA 3G0JA 5LUUA 2YQDA 5FE0A 2NXBA 5L96A 2R0VA 4BJXA 3JVLA 4X2IA 5KTWA 4YY6A 3P1CA 5CUBA 4N3WA 4NQNA 5EGUA 4HXMA 4NR6A 4BW2A 5F36A 3UVXA 5DLZA 5EPBA 5CRMA 4IORA 4UIWA 4Z1QA 5G4RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FE8A 4J3IA 5L8UA 4AKHA 3P5OA 5EWCA 5I29A 3O35A 4AI6A 2I8NA 5CUAA 4YK0A 4QR3A 4CURA 4QSXA 5DYXA 5D25A 4J1PA 4TQNA 5CFWA 4IR4A 4QSRA 5E0RA 4PKLA 4XY9A 3DWYA 5BT5A 3MULA 5I7XA 5AMFA 4XY8A 4OUFA 4YYKA 4TU6A 5KTXA 4QC1A 4MEQA 4XUAA 1N72A 4UIZA 3U5MA 5FBXA 4UYDA 5EWHA 3TLPA 5FE3A 4RVRA 5L8TA 3GG3A 1JSPB 4QEVA 4HBYA 2DVSA 2RNYA 4YC9A 4WHUA 3O34A 5DY7A 5LJ1A 4TU4A 4ZQLA 5C8GA 5HRWA 4O77A 5C4QA 4CFKA 4YYNA 5FE4A 5D3PA 5D26A 4LC2A 4O7EA 4LYWA 4QC3A 4N4GA 5FE7A 4XYAA 5C85A 5HCLA 4AKNA 2D82A 4YABA 4A9LA 4MR5A 5C7NA 5H1TA 2DVQA 2YELA 3LQIA 4QNSA 3MB3A 5E9KA 5EWWA 5F25A 4QYLA 4KV4A 5FE6A 5A7CA 4AKGA 1WUGA 4UYFB 4QUUA 5LKUA 5LJ2A 4YYIA 2DATA 3U5PA 4QSVA 5KHMA 5EWVA 4YYHA 3IU5A 3UW9A 4LR6A 2DWWA 4HXKA 5F62A 4UYEA 4IOQA 4QB3A 5IGKA 5FG5A 5L98A 4LZ2A 5ENJA 5D3JA 2WP2A 5D24A 5HRVA 3MB4A 4MENA 2WP1A 4KCXA 4Z6HA 5DYAA 4PCIA 2R0SA 5F60A 5EICA 4HBWA 4NR9A 5EU1A 3SVFA 5ACYA 4A9NA 2RO1A 4QSWA 3HMEA 4N4IA 4NYWA 5CQ3A 5F63A 4NUEA 5IGLA 5EV9A 5JWMA 4UIYA 3LJWA 4Q0OA 5FFWA 5HENA 5A5RA 4O72A 2FSAA 5L99A 4TYLA 4HBVA 4QEWA 5CY9A 2E7OA 4QR4A 5CQ4A 5DLXA 2GRCA 4LZSA 5CRZA 3FKMX 2R0YA 4GPJA 3P1DA 5I1QA 5CZGA 5KTUA 5DW1A 4A9MA 2YDWA 3D1BA 5EM3A 4ALHA 4TT6A 5II2A 5CUEA 4YBSA 5E9LA 1PUOA 5COIA 4FLPA 5I7YA 4WHWA 4YH3A 5I86A 2N9GA 4TZ2A 5HLSA 5K29A 2YW5A 5DX4A 5ENIA 4QBMA 5D3HA 4NRBA 5D3LA 5KO4A 5F2PA 2DVRA 4BW1A 5LKZA 5CQ8A 4Z93A 3DAIA 4QYDA 5AD3A 4NXJA 5FE1A 4UIVA 5DFCA 4PS5A 2YYNA 3P1FA 5TB6A 5TCMA 4QSSA 3HMFA 5HQ5A 5D3RA 5CQ6A 2L5EA 5CGPA 5FB0A 5IGMA 4F3IA 5HRXA 5IGNA 4QSQA 4IR3A 5BT3A 4NUCA 5CQTA 5FE2A 4HXRA 5CQ5A 3Q2FA 4LYIA 3O37A 5ETBA 5C89A 4NR7A 3G0LA 5A5OA 4N4FA 5D7XA 2RNWA 4NS5A 4CL9A 5I83A 1F68A 3SVGA 5FH8A 1X0JA 3O33A 5EP7A 5E3GA 5CUCA 2E7NA 3MQMA 5ENFA 4UIXA 4NR5A 2L85A 4WIVA 4LDFA 3S91A 3S92A 4HXSA 4PCEA 4O75A 4ALGA 4MEPA 5E74A 2DVVA 3SVHA 4A9IA 5F1HA 5FH6A 3U5NA 4O7BA 4OGIA 3AQAA 4AKIA 3QZTA 3QZVA 5H1UA 3RCWA 2I7KA 5HQ7A 4BHWA 2YEMA 4A9KA 4DONA 2KTBB 4UYGA 4LRGA 4C67A 4CUPA 4NQMA 4YYMA 5A5PA 5F3AA 5EA1A 4NUDA 5IG6A 1JM4B 4QZSA 5EK9A 5DKDA 5EWDA 5FB1A 4A9OA 4A9EA 5FFYA 5FFVA 5ENHA 4HXNA 5II1A 5EPRA 5HJCA 5A82A 2G4AA 2EJNA 4HXOA 5LKTA 5HEMA 5D0CA 5CQ7A 2R10A 1E6IA 3U5LA 5A5SA 5D3SA 4NR8A 4MEOA 5DFDA 4OGJA 4TZ8A 5CU8A 4YYGA 5E9IA 4QEUA 5ENEA 4PY6A 5J0DA 3JVKA 3K2JA 5I80A 4YATA 3UVDA 2E3KA 3U5KA 4YYDA 5E7DA 4NRCA 4Q0NA 4IR6A 5F1LA 4CUSA 5ENBA 2DKWA 5LVRA 4CUUA 3UVWA 5FDZA 4O78A 4J0SA 4YBTA 3ERRA 4YAXA 5L97A 4QSTA 4YYJA 4Y03A 1EQFA 4O70A 4PTBA 4UIUA 2RI7A 4NR4A 5HQ6A 5EVAA 5D3TA 4O71A 5CS8A 4QSPA 3JVJA 3LXJA 4MR3A 5EPSA 5I88A 4YADA 3LQHA 4O7FA 5LJ0A 5A81A 5E9YA 4CUTA 4UITA 4E96A 3UV2A 5FE5A 2OUOA 4YBMA 5DW2A 2F6NA 4NRAA 4A9JA 5KU3A 4A9FA 3LQJA 4O74A 5C87A 5CPEA 4UYFA 4HXLA 5H85A 4O76A 5IIDA 5A5NA 5FH7A 4HXPA 2OO1A 5A5QA 3JVMA 5ENCA 3Q2EA 3P1EA 4MR4A 4TT4A 4BW3A 5D3NA 4CLBA 3MXFA 4Z1SA 5EI4A 2H60A 2YEKA 5HFQA 3NXBA 5H1VA 5A83A 5AD2A 4NYVA 5AMEA 4XUBA 4N4HA 4O7AA 5DKHA 4QUTA 5BT4A 5F5ZA 4QSUA 2L84A 5FG6A 4CUQA 5HFRA 4J0RA 2RNXA 2LSPB 5HM0A 2F6JA 4YH4A 5E73A 3U5OA 5CUDA 3ZYUA 4C66A 4LYSA 4ZC9A 5G4SA 4TT2A 4Z6IA 5ENGA 3VKGA 3D7CA 5DYUA 5CQAA 5ETDA 1WUMA 5IBNA 4MR6A 4O7CA 4QR5A 4TTEA 4TS8A 3I3JA 3VKHA 2MJVB 3MUKA 4HBXA 3UV5A 2RFJA 3HMHA 5CTLA 3UV4A 1ZS5A 3AADA 4LZRA 5DFBA 3D1DA 5I40A 4A9HA 5E9MA 4YY4A 1ZKRA 4IR5A 5CUGA 5FG4A 4KV1A 3UVYA 2OSSA 3O36A 4CFLA 5HELA 4IOOA 2D9EA 4UYHA 4QY4A 5EQ1A 3QZSA 5DKCA 4BW4A 5E9VA 4ZW1A 5JI8A 5I89A 4NYXA 5CP5A 5DBMA 5DYCA 5FE9A 5LVQA 5A85A 5F61A 3ONIA 5EISA 3IU6A 5LKXA 5E3DA 2RS9B 3U5JA 3G0JA 5LUUA 2YQDA 5FE0A 2NXBA 5L96A 2R0VA 4BJXA 3JVLA 4X2IA 5KTWA 4YY6A 3P1CA 5CUBA 4N3WA 4NQNA 5EGUA 4HXMA 4NR6A 4BW2A 5F36A 3UVXA 5DLZA 5EPBA 5CRMA 4IORA 4UIWA 4Z1QA 5G4RA
chains in the Genus database with same CATH topology
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 5FE8 A;  4J3I A;  5L8U A;  3P5O A;  5EWC A;  5I29 A;  3O35 A;  2I8N A;  5CUA A;  4YK0 A;  4QR3 A;  4CUR A;  4QSX A;  5DYX A;  5D25 A;  4J1P A;  4TQN A;  5CFW A;  4IR4 A;  4QSR A;  5E0R A;  4PKL A;  4XY9 A;  3DWY A;  5BT5 A;  3MUL A;  5I7X A;  5AMF A;  4XY8 A;  4OUF A;  4YYK A;  4TU6 A;  5KTX A;  4QC1 A;  4MEQ A;  4XUA A;  1N72 A;  4UIZ A;  3U5M A;  5FBX A;  4UYD A;  5EWH A;  3TLP A;  5FE3 A;  4RVR A;  5L8T A;  3GG3 A;  1JSP B;  4QEV A;  4HBY A;  2DVS A;  2RNY A;  4YC9 A;  4WHU A;  3O34 A;  5DY7 A;  5LJ1 A;  4TU4 A;  4ZQL A;  5C8G A;  5HRW A;  4O77 A;  5C4Q A;  4CFK A;  4YYN A;  5FE4 A;  5D3P A;  5D26 A;  4LC2 A;  4O7E A;  4LYW A;  4QC3 A;  4N4G A;  5FE7 A;  4XYA A;  5C85 A;  5HCL A;  4AKN A;  2D82 A;  4YAB A;  4A9L A;  4MR5 A;  5C7N A;  5H1T A;  2DVQ A;  2YEL A;  3LQI A;  4QNS A;  3MB3 A;  5E9K A;  5EWW A;  5F25 A;  4QYL A;  4KV4 A;  5FE6 A;  5A7C A;  1WUG A;  4UYF B;  4QUU A;  5LKU A;  5LJ2 A;  4YYI A;  2DAT A;  3U5P A;  4QSV A;  5KHM A;  5EWV A;  4YYH A;  3IU5 A;  3UW9 A;  4LR6 A;  2DWW A; 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