4O77A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with sb 202190
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 46
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o77A01
2WP2A 5ENBA 3FKMX 4TS8A 5EP7A 4YYMA 5K29A 5DYUA 4BHWA 4XUAA 4QY4A 4YADA 5BT5A 3DAIA 5EI4A 5E9YA 5CRZA 5E9KA 3IU5A 3UVXA 4O77A 5I80A 4A9NA 5CU8A 4UYHA 5FE0A 5D7XA 4CUPA 4A9FA 5DKHA 5H1TA 4UYFA 5H85A 2RNWA 5CPEA 5DYCA 5F1HA 5FBXA 3O35A 4O7BA 5LUUA 3JVLA 2NXBA 5EICA 3SVHA 4LRGA 4J0SA 5FH7A 5A5SA 5IGLA 1E6IA 2YDWA 3UV4A 4YYDA 4IOOA 3MUKA 5F63A 4UYEA 4BW3A 5C87A 4YC9A 5FG6A 4PY6A 5AMEA 4UYDA 4UIWA 5A85A 5DYXA 1JM4B 5CUAA 2D82A 3HMEA 4BW2A 5A83A 5L97A 4WIVA 4LYIA 4N4GA 5DLZA 5EPBA 5EGUA 4CLBA 3JVKA 2E7OA 5F62A 5FB1A 5I7YA 3U5JA 4O71A 2N9GA 4KCXA 4NQMA 5A5RA 5ACYA 5II2A 2R0YA 5DW1A 2L84A 4C66A 5HQ7A 1WUMA 5E9MA 5LVQA 5I40A 5LKUA 4HBXA 4QSQA 5I89A 5KTWA 5EPSA 5FB0A 5CQTA 4QR4A 5DKCA 5IGMA 3QZSA 5F36A 5HRVA 4CUUA 4QB3A 5CP5A 4NRCA 2RFJA 4ALHA 5DFCA 4PTBA 5HM0A 1F68A 3AQAA 4N4FA 3QZVA 2LSPB 5DFBA 4UYGA 5IG6A 3Q2EA 4NUCA 2DATA 4LR6A 5FE7A 5TCMA 5TB6A 5IGKA 4HXMA 4YYKA 4UIYA 4Y03A 5KU3A 4YAXA 2F6JA 4QUUA 4CUTA 5KTXA 4O74A 5COIA 5CFWA 4OGIA 5F3AA 2DVRA 2YQDA 2OO1A 5KHMA 2FSAA 4PCIA 3P1CA 5EWCA 2DVQA 5F25A 5C89A 4YBTA 5CQ5A 5CUEA 5LJ0A 1WUGA 5F2PA 4IORA 5CS8A 4NQNA 5CQ3A 5EPRA 5H1VA 4CURA 5FE5A 4AKNA 3HMHA 5HEMA 3P1FA 2E3KA 5F60A 3MXFA 1X0JA 1ZS5A 4YYIA 4NS5A 4LC2A 4J1PA 4IR4A 2DWWA 4QUTA 2RNXA 5HCLA 5D3RA 5LKZA 4A9LA 5J0DA 5E73A 5ENHA 2GRCA 5D3TA 3S92A 5D3SA 4ALGA 4N4IA 4Z6HA 2L5EA 3U5NA 5EK9A 4YYHA 5D26A 4XYAA 4QR3A 5JI8A 3G0JA 4Z93A 4Z1QA 4HXLA 5I86A 3P1DA 3UVWA 3JVMA 4QNSA 5FFVA 4LZRA 4LZSA 4MENA 4NXJA 3MB4A 5EU1A 5L8TA 3LQHA 4MEPA 5FE2A 5DYAA 5EM3A 5BT4A 3LXJA 4IR3A 5HELA 1N72A 2RI7A 4Q0NA 4QSPA 5IBNA 4QSXA 4CUQA 5CQAA 4CFKA 4O75A 3U5LA 5AMFA 4X2IA 4LDFA 2I7KA 4UIUA 2YEKA 2YEMA 4YK0A 5HFQA 2I8NA 2DVSA 3JVJA 4O70A 3UVDA 2KTBB 5FDZA 5HQ6A 4HXOA 5D24A 3O36A 5CQ7A 4TU6A 3UV2A 4NR4A 5KO4A 4O7FA 5A5QA 5D3PA 5ETDA 5HQ5A 4NR9A 3SVFA 3O37A 4NR8A 5I83A 4YH3A 5DBMA 2R10A 3U5MA 5FFYA 3K2JA 4LYWA 4A9JA 4BW4A 5D3NA 5C4QA 2G4AA 3SVGA 4IR5A 4MEQA 4UITA 4QC1A 5ENEA 4NR6A 5HRXA 4UIXA 4QEVA 5FH8A 3IU6A 4TTEA 4ZW1A 2H60A 4O72A 5FG4A 5D3HA 4YBMA 4HXNA 3RCWA 5CGPA 4O7CA 2OUOA 3LJWA 2YELA 4RVRA 5LKTA 5C8GA 4A9HA 5FE8A 4O78A 5FE9A 3P5OA 5DW2A 3S91A 3MQMA 4LYSA 3U5KA 5KTUA 5E9VA 4MR6A 5DFDA 5EWDA 3D7CA 5CUBA 5EV9A 4DONA 4YYNA 5CQ8A 5E7DA 4QSSA 5ENFA 4NYVA 5H1UA 4LZ2A 5DX4A 4A9OA 4O76A 5IGNA 4QSVA 1JSPB 4CL9A 4NRBA 3I3JA 5L96A 4A9MA 4NR7A 5FE3A 5CZGA 5LJ1A 4XUBA 4ZC9A 4QSWA 2E7NA 5LJ2A 5L8UA 3U5OA 5IIDA 5EQ1A 4FLPA 2WP1A 4NUDA 5FE6A 1EQFA 5LVRA 3TLPA 4NRAA 5L99A 5D3JA 4PCEA 4KV1A 4TT2A 3MB3A 5CUGA 4J0RA 4MR5A 5D3LA 5HLSA 4MR3A 4XY9A 2OSSA 5FH6A 4OUFA 5I1QA 4NR5A 5A5NA 4IOQA 4IR6A 3LQJA 2DVVA 2YW5A 5FG5A 4Z1SA 4QBMA 5E9IA 4UIZA 5ENIA 4WHWA 4HXPA 3O34A 4QZSA 4YY6A 4QSUA 5II1A 5I88A 5G4SA 5DY7A 5F61A 5D25A 4CUSA 5HJCA 4J3IA 5C85A 5CUDA 4NUEA 5A5PA 4ZQLA 4YABA 5I29A 3Q2FA 4O7EA 5FE4A 4N4HA 5E0RA 4QSTA 4MEOA 2R0VA 4A9IA 3MULA 4HXSA 4WHUA 5CTLA 5E3GA 5EISA 5A81A 5D0CA 2RO1A 5CRMA 4HBWA 4QSRA 2RNYA 3DWYA 4TQNA 2RS9B 3NXBA 3G0LA 4UIVA 5DKDA 5JWMA 5ENGA 3UVYA 5AD3A 5A5OA 3ONIA 5AD2A 4NYWA 4YATA 4F3IA 4C67A 3HMFA 2L85A 3UW9A 2R0SA 5C7NA 2D9EA 5E9LA 4BJXA 3ZYUA 4A9KA 3P1EA 4TT6A 4Q0OA 5CQ4A 5DLXA 5E74A 5A82A 4TZ2A 4GPJA 5CY9A 5L98A 4TU4A 5EA1A 5I7XA 4BW1A 4QEWA 3O33A 5HENA 5G4RA 3QZTA 4XY8A 4HXRA 4TZ8A 5CQ6A 5ENJA 5EVAA 4YY4A 4QYLA 4TYLA 4YBSA 4YYJA 4KV4A 4MR4A 4N3WA 5F5ZA 4Z6IA 5ENCA 4QC3A 5CUCA 5FE1A 4QR5A 4NYXA 5A7CA 2DKWA 4QEUA 4YH4A 5BT3A 5LKXA 5EWVA 4HXKA 4A9EA 4PKLA 3UV5A 4OGJA 4QYDA 2YYNA 4HBVA 5HFRA 5E3DA 5ETBA 2F6NA 5EWWA 4UYFB 2MJVB 5HRWA 4O7AA 4CFLA 3AADA 5EWHA 4YYGA 4E96A 4TT4A 5FFWA 5F1LA 3LQIA 4HBYA 4PS5A 3GG3A 3U5PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2WP2A 5ENBA 3FKMX 4TS8A 5EP7A 4YYMA 5K29A 5DYUA 4BHWA 4XUAA 4QY4A 4YADA 5BT5A 3DAIA 5EI4A 5E9YA 5CRZA 5E9KA 3IU5A 3UVXA 4O77A 5I80A 4A9NA 5CU8A 4UYHA 5FE0A 5D7XA 4CUPA 4A9FA 5DKHA 5H1TA 4UYFA 5H85A 2RNWA 5CPEA 5DYCA 5F1HA 5FBXA 3O35A 4O7BA 5LUUA 3JVLA 2NXBA 5EICA 3SVHA 4LRGA 4J0SA 5FH7A 5A5SA 5IGLA 1E6IA 2YDWA 3UV4A 4YYDA 4IOOA 3MUKA 5F63A 4UYEA 4BW3A 5C87A 4YC9A 5FG6A 4PY6A 5AMEA 4UYDA 4UIWA 5A85A 5DYXA 1JM4B 5CUAA 2D82A 3HMEA 4BW2A 5A83A 5L97A 4WIVA 4LYIA 4N4GA 5DLZA 5EPBA 5EGUA 4CLBA 3JVKA 2E7OA 5F62A 5FB1A 5I7YA 3U5JA 4O71A 2N9GA 4KCXA 4NQMA 5A5RA 5ACYA 5II2A 2R0YA 5DW1A 2L84A 4C66A 5HQ7A 1WUMA 5E9MA 5LVQA 5I40A 5LKUA 4HBXA 4QSQA 5I89A 5KTWA 5EPSA 5FB0A 5CQTA 4QR4A 5DKCA 5IGMA 3QZSA 4AKIA 5F36A 5HRVA 4CUUA 4QB3A 5CP5A 4NRCA 2RFJA 4ALHA 5DFCA 4PTBA 5HM0A 1F68A 3AQAA 4N4FA 3QZVA 2LSPB 5DFBA 4UYGA 5IG6A 3Q2EA 4NUCA 2DATA 4LR6A 5FE7A 5TCMA 5TB6A 5IGKA 4HXMA 4YYKA 4UIYA 4Y03A 5KU3A 4YAXA 2F6JA 4AKHA 4QUUA 4AI6A 4CUTA 5KTXA 4O74A 5COIA 5CFWA 4OGIA 5F3AA 2DVRA 2YQDA 2OO1A 5KHMA 2FSAA 4PCIA 3P1CA 5EWCA 2DVQA 5F25A 5C89A 4YBTA 5CQ5A 5CUEA 5LJ0A 1WUGA 5F2PA 4IORA 5CS8A 4NQNA 5CQ3A 5EPRA 5H1VA 4CURA 5FE5A 4AKNA 3HMHA 5HEMA 3P1FA 2E3KA 5F60A 3MXFA 1X0JA 1ZS5A 4YYIA 4NS5A 4LC2A 4J1PA 4IR4A 2DWWA 4QUTA 2RNXA 5HCLA 5D3RA 5LKZA 4A9LA 5J0DA 5E73A 5ENHA 2GRCA 5D3TA 3S92A 5D3SA 4ALGA 4N4IA 4Z6HA 2L5EA 3U5NA 5EK9A 4YYHA 5D26A 4XYAA 4QR3A 5JI8A 3G0JA 4Z93A 4Z1QA 4HXLA 5I86A 3P1DA 3UVWA 3JVMA 4QNSA 1ZKRA 5FFVA 4LZRA 4LZSA 4MENA 4NXJA 3MB4A 5EU1A 5L8TA 3LQHA 4MEPA 5FE2A 5DYAA 5EM3A 5BT4A 3LXJA 4IR3A 5HELA 1N72A 2RI7A 4Q0NA 4QSPA 5IBNA 4QSXA 4CUQA 5CQAA 4CFKA 4O75A 3U5LA 5AMFA 4X2IA 4LDFA 2I7KA 4UIUA 2YEKA 2YEMA 4YK0A 5HFQA 2I8NA 2DVSA 3JVJA 4O70A 3UVDA 2KTBB 5FDZA 5HQ6A 4HXOA 5D24A 3O36A 5CQ7A 4TU6A 3UV2A 3D1BA 4NR4A 5KO4A 3VKHA 4O7FA 5A5QA 5D3PA 5ETDA 5HQ5A 4AKGA 4NR9A 3SVFA 3O37A 4NR8A 5I83A 4YH3A 5DBMA 2R10A 3U5MA 5FFYA 3K2JA 4LYWA 4A9JA 4BW4A 5D3NA 5C4QA 2G4AA 3SVGA 4IR5A 4MEQA 4UITA 4QC1A 5ENEA 4NR6A 5HRXA 4UIXA 4QEVA 5FH8A 3IU6A 4TTEA 4ZW1A 2H60A 4O72A 5FG4A 2EJNA 5D3HA 4YBMA 4HXNA 3RCWA 5CGPA 4O7CA 2OUOA 3LJWA 2YELA 4RVRA 5LKTA 5C8GA 4A9HA 5FE8A 4O78A 5FE9A 3P5OA 5DW2A 3S91A 3MQMA 4LYSA 3U5KA 5KTUA 5E9VA 4MR6A 5DFDA 5EWDA 3D7CA 5CUBA 5EV9A 4DONA 4YYNA 5CQ8A 5E7DA 4QSSA 5ENFA 4NYVA 5H1UA 4LZ2A 5DX4A 4A9OA 4O76A 5IGNA 4QSVA 1JSPB 4CL9A 4NRBA 3I3JA 3ERRA 5L96A 4A9MA 4NR7A 5FE3A 5CZGA 5LJ1A 4XUBA 4ZC9A 4QSWA 2E7NA 5LJ2A 5L8UA 3U5OA 5IIDA 5EQ1A 4FLPA 2WP1A 4NUDA 5FE6A 1EQFA 5LVRA 3TLPA 4NRAA 5L99A 5D3JA 4PCEA 4KV1A 4TT2A 3MB3A 5CUGA 4J0RA 4MR5A 5D3LA 5HLSA 4MR3A 4XY9A 1PUOA 2OSSA 5FH6A 4OUFA 5I1QA 4NR5A 5A5NA 4IOQA 4IR6A 3LQJA 2DVVA 2YW5A 5FG5A 4Z1SA 4QBMA 5E9IA 4UIZA 5ENIA 4WHWA 4HXPA 3O34A 4QZSA 3VKGA 4YY6A 4QSUA 5II1A 5I88A 5G4SA 5DY7A 5F61A 5D25A 4CUSA 5HJCA 4J3IA 5C85A 5CUDA 4NUEA 5A5PA 4ZQLA 4YABA 5I29A 3Q2FA 4O7EA 5FE4A 4N4HA 5E0RA 4QSTA 4MEOA 2R0VA 4A9IA 3MULA 4HXSA 4WHUA 5CTLA 5E3GA 5EISA 5A81A 5D0CA 2RO1A 5CRMA 4HBWA 4QSRA 2RNYA 3DWYA 4TQNA 2RS9B 3NXBA 3G0LA 4UIVA 5DKDA 5JWMA 5ENGA 3UVYA 5AD3A 5A5OA 3ONIA 5AD2A 4NYWA 4YATA 4F3IA 4C67A 3HMFA 2L85A 3UW9A 2R0SA 5C7NA 2D9EA 5E9LA 4BJXA 3ZYUA 4A9KA 3P1EA 4TT6A 4Q0OA 5CQ4A 5DLXA 5E74A 5A82A 4TZ2A 4GPJA 5CY9A 5L98A 4TU4A 5EA1A 5I7XA 4BW1A 4QEWA 3O33A 5HENA 5G4RA 3QZTA 4XY8A 4HXRA 4TZ8A 5CQ6A 5ENJA 5EVAA 4YY4A 4QYLA 4TYLA 4YBSA 4YYJA 4KV4A 4MR4A 4N3WA 5F5ZA 4Z6IA 5ENCA 4QC3A 5CUCA 5FE1A 4QR5A 4NYXA 5A7CA 2DKWA 4QEUA 4YH4A 5BT3A 5LKXA 3D1DA 5EWVA 4HXKA 4A9EA 4PKLA 3UV5A 4OGJA 4QYDA 2YYNA 4HBVA 5HFRA 5E3DA 5ETBA 2F6NA 5EWWA 4UYFB 2MJVB 5HRWA 4O7AA 4CFLA 3AADA 5EWHA 4YYGA 4E96A 4TT4A 5FFWA 5F1LA 3LQIA 4HBYA 4PS5A 3GG3A 3U5PA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2WP2 A;  5ENB A;  3FKM X;  4TS8 A;  5EP7 A;  4YYM A;  5K29 A;  5DYU A;  4BHW A;  4XUA A;  4QY4 A;  4YAD A;  5BT5 A;  3DAI A;  5EI4 A;  5E9Y A;  5CRZ A;  5E9K A;  3IU5 A;  3UVX A;  4O77 A;  5I80 A;  4A9N A;  5CU8 A;  4UYH A;  5FE0 A;  5D7X A;  4CUP A;  4A9F A;  5DKH A;  5H1T A;  4UYF A;  5H85 A;  2RNW A;  5CPE A;  5DYC A;  5F1H A;  5FBX A;  3O35 A;  4O7B A;  5LUU A;  3JVL A;  2NXB A;  5EIC A;  3SVH A;  4LRG A;  4J0S A;  5FH7 A;  5A5S A;  5IGL A;  1E6I A;  2YDW A;  3UV4 A;  4YYD A;  4IOO A;  3MUK A;  5F63 A;  4UYE A;  4BW3 A;  5C87 A;  4YC9 A;  5FG6 A;  4PY6 A;  5AME A;  4UYD A;  4UIW A;  5A85 A;  5DYX A;  1JM4 B;  5CUA A;  2D82 A;  3HME A;  4BW2 A;  5A83 A;  5L97 A;  4WIV A;  4LYI A;  4N4G A;  5DLZ A;  5EPB A;  5EGU A;  4CLB A;  3JVK A;  2E7O A;  5F62 A;  5FB1 A;  5I7Y A;  3U5J A;  4O71 A;  2N9G A;  4KCX A;  4NQM A;  5A5R A;  5ACY A;  5II2 A;  2R0Y A;  5DW1 A;  2L84 A;  4C66 A;  5HQ7 A;  1WUM A;  5E9M A;  5LVQ A;  5I40 A;  5LKU A;  4HBX A;  4QSQ A;  5I89 A;  5KTW A;  5EPS A;  5FB0 A;  5CQT A; 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