4O7EA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with sb-610251-b
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 43
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o7eA01
4UYGA 5LVQA 5CZGA 2R10A 3Q2EA 4N4GA 4DONA 2OO1A 3G0JA 5EV9A 4QSWA 5HFQA 5FE0A 3U5PA 5EU1A 5FE6A 5C7NA 5DYUA 4QYLA 5F1HA 3U5MA 3U5OA 4O7CA 5C89A 5DKCA 4Z6IA 5C85A 4UYHA 2MJVB 4NR4A 5DW2A 5D26A 5HRXA 4LYIA 3RCWA 2D82A 5FFYA 4BJXA 5IGLA 3JVJA 5G4RA 5JI8A 5L8TA 3SVGA 4YYJA 4CUTA 2E7OA 4YK0A 4QY4A 3S91A 4QZSA 4J3IA 4A9MA 5H85A 2DWWA 5EISA 4MEPA 3UVWA 4YH4A 4FLPA 5CQ8A 5EGUA 4XUAA 5DKDA 3O35A 5FH7A 5HEMA 4QBMA 5ENGA 3HMHA 4CUSA 4IR5A 3O36A 2YEKA 5ENFA 4MR5A 3LXJA 3I3JA 4LR6A 3UV4A 5L99A 5HM0A 5IGNA 5BT4A 5IG6A 5ENHA 3P1CA 2YEMA 5KTXA 3MQMA 5FB1A 2RNXA 4O76A 5D24A 4WHWA 5KHMA 4N4IA 5D0CA 4CURA 4HXLA 5CQTA 3Q2FA 5D3RA 5DLXA 1F68A 4A9OA 4A9KA 5KO4A 4UIUA 3IU5A 4TU4A 5HJCA 3LQIA 2G4AA 3UV5A 5EWCA 5L98A 4A9JA 1EQFA 4UIYA 5F25A 4MENA 2E7NA 4WIVA 4QR3A 4YYMA 3U5LA 4NR9A 4NS5A 5TB6A 5HQ7A 5K29A 5FG4A 5D3NA 4CUUA 5LJ0A 4NYXA 3AQAA 5COIA 4IOOA 4XY8A 4LZSA 2RNWA 4LZRA 4MEQA 4ALHA 5ENBA 5DW1A 4MEOA 4YBTA 3MB3A 5CQ6A 5A5NA 4TZ2A 2DVQA 4NXJA 3HMEA 4QSXA 5FE2A 3MULA 5I7XA 5CQ3A 4YBMA 5FE8A 4HBWA 4J0RA 2YELA 3FKMX 4YYDA 4C67A 2YQDA 4NR6A 3DAIA 4NRBA 4J0SA 4Z1SA 2L84A 4KV1A 5F2PA 5F1LA 4QR5A 4YY4A 4CUQA 5DY7A 5I7YA 4ZC9A 4ZW1A 4A9IA 4O7EA 5ETBA 4AKNA 4QEWA 1WUGA 5E3GA 4GPJA 3SVHA 4HXNA 5DYXA 4TS8A 5I86A 4O7BA 4BW1A 3MXFA 4Q0OA 2I8NA 4HXPA 5EP7A 5LKTA 5E9KA 4YYHA 4QSTA 4TT6A 4O74A 5ENCA 3ZYUA 4BW3A 4YYKA 5F62A 4QNSA 4QSQA 5DYAA 3MUKA 3P1EA 4MR4A 5CRMA 3P5OA 5F3AA 2N9GA 5EWVA 4QEUA 4UIXA 2RI7A 4TT4A 2WP1A 1X0JA 5D3JA 3U5KA 2F6JA 4NR8A 3P1DA 5D7XA 5EA1A 5EK9A 5CQAA 5ETDA 5I88A 5FFWA 5KTUA 4NR7A 4PCEA 5A5QA 5FE7A 4UYFA 5EWHA 4N4FA 4HBYA 4QC3A 5E9VA 5I89A 5F60A 5CQ7A 4LZ2A 5F63A 2RS9B 4QSUA 4CFLA 2YW5A 4A9EA 4QYDA 4C66A 5A83A 4OUFA 5LVRA 5E73A 5FE4A 3LQHA 4QUUA 5LJ1A 4LC2A 2RFJA 5I29A 2F6NA 3LQJA 5DLZA 5IBNA 4TT2A 5A81A 4YH3A 4HXSA 2L85A 4UYEA 5LUUA 5HENA 5I1QA 3UVDA 5D3HA 2R0YA 5AMEA 4Z1QA 4IORA 3LJWA 5DFDA 5HRVA 2DVRA 2H60A 2DKWA 5E9YA 4NUCA 5EPBA 5AD3A 5IIDA 4O7FA 4HXMA 5CUEA 5E9MA 4PS5A 5CUDA 4NUDA 2OUOA 4CUPA 5FE9A 4NR5A 3JVKA 4QB3A 4A9LA 5CUAA 4TQNA 4LYWA 5ENEA 4ZQLA 5FFVA 5CQ5A 5F5ZA 4YY6A 5EI4A 3U5NA 5A85A 4YYIA 4NQMA 5E7DA 5L97A 1JM4B 5I83A 5ENJA 5II2A 5D3LA 5A5PA 5KTWA 5EWWA 5G4SA 2I7KA 4PCIA 4BHWA 4E96A 3SVFA 4QSSA 5IGMA 5FE1A 5HQ5A 4UYFB 5CTLA 5F36A 4YADA 4YABA 5EQ1A 5HFRA 3O37A 5A5OA 5FG5A 4NYVA 5CGPA 3G0LA 5E9IA 4IR4A 1JSPB 4BW4A 4XUBA 5CRZA 3P1FA 4OGIA 3QZVA 2YYNA 4N3WA 5TCMA 3TLPA 5EVAA 2RO1A 4XY9A 5EPRA 4HXOA 4WHUA 5CU8A 5FE5A 5CPEA 4QUTA 5HCLA 4PY6A 2DATA 2OSSA 4XYAA 4LDFA 2KTBB 4LRGA 4CFKA 3HMFA 4OGJA 4PKLA 2RNYA 5CP5A 5F61A 5D3SA 2R0VA 3JVMA 2DVVA 5BT5A 3UVXA 4NQNA 3K2JA 2WP2A 5BT3A 4O77A 5IGKA 3UV2A 5D3TA 4Q0NA 5DKHA 4HBVA 4A9NA 5I40A 4F3IA 4IR3A 4UYDA 5II1A 4Z6HA 4YYNA 4A9FA 4YYGA 5EICA 5CY9A 4BW2A 4YBSA 3S92A 5FE3A 3O33A 4O71A 4UIVA 4TTEA 5FH6A 4Z93A 1WUMA 4NUEA 4QSPA 4O72A 5HELA 5HQ6A 4TYLA 5EWDA 5KU3A 2YDWA 4N4HA 4HBXA 5L96A 4UITA 4IR6A 5H1TA 4HXKA 2DVSA 1ZS5A 5C8GA 5A5RA 5DFBA 2LSPB 4NRAA 4YATA 4Y03A 4A9HA 3JVLA 2E3KA 4O78A 5FB0A 4NYWA 2R0SA 4RVRA 5E0RA 5ENIA 4O7AA 4PTBA 2GRCA 5E74A 5C87A 5FBXA 5C4QA 3QZSA 5FG6A 5AMFA 2D9EA 5H1UA 4QSVA 4YC9A 1E6IA 5E9LA 5H1VA 5FH8A 5LKXA 5CUBA 3DWYA 2L5EA 4CLBA 4MR3A 3ONIA 5DX4A 4NRCA 5CUGA 1N72A 4TZ8A 5E3DA 5HRWA 5CQ4A 5D3PA 5CFWA 5JWMA 3AADA 5A5SA 5DBMA 4TU6A 5AD2A 5DYCA 4UIZA 5A82A 4KCXA 5I80A 4MR6A 4X2IA 3GG3A 4HXRA 4QC1A 4O75A 4YAXA 5LKUA 4J1PA 4O70A 3UVYA 4LYSA 4QSRA 3QZTA 5CUCA 2FSAA 4KV4A 5EM3A 5LJ2A 5CS8A 3U5JA 3IU6A 5A7CA 4QEVA 3UW9A 3NXBA 5FDZA 5ACYA 5D25A 5DFCA 5HLSA 3O34A 2NXBA 3MB4A 4ALGA 5EPSA 4IOQA 5L8UA 4CL9A 3D7CA 5LKZA 5J0DA 4UIWA 4QR4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UYGA 5LVQA 5CZGA 2R10A 3Q2EA 4N4GA 4DONA 2OO1A 3G0JA 5EV9A 4QSWA 5HFQA 5FE0A 3U5PA 5EU1A 5FE6A 5C7NA 5DYUA 4QYLA 5F1HA 3U5MA 3U5OA 4O7CA 5C89A 5DKCA 4Z6IA 5C85A 4UYHA 2MJVB 4NR4A 5DW2A 5D26A 5HRXA 4LYIA 3RCWA 2D82A 5FFYA 4BJXA 5IGLA 3JVJA 5G4RA 5JI8A 5L8TA 3SVGA 4YYJA 4CUTA 2E7OA 4YK0A 4QY4A 3S91A 4QZSA 4J3IA 4A9MA 5H85A 2DWWA 5EISA 4MEPA 3UVWA 4YH4A 4FLPA 5CQ8A 5EGUA 4XUAA 5DKDA 3O35A 5FH7A 5HEMA 4QBMA 5ENGA 3HMHA 4CUSA 4IR5A 3O36A 2YEKA 5ENFA 4MR5A 3LXJA 3I3JA 4LR6A 3UV4A 5L99A 5HM0A 5IGNA 5BT4A 5IG6A 5ENHA 4AKIA 3P1CA 2YEMA 5KTXA 3MQMA 5FB1A 2RNXA 4O76A 5D24A 4WHWA 5KHMA 4N4IA 5D0CA 4CURA 4HXLA 5CQTA 3Q2FA 5D3RA 5DLXA 1F68A 4A9OA 4A9KA 5KO4A 4UIUA 3IU5A 4AKHA 4TU4A 5HJCA 3LQIA 2G4AA 3UV5A 5EWCA 5L98A 4A9JA 1EQFA 4UIYA 5F25A 4MENA 2E7NA 1PUOA 4WIVA 4QR3A 4YYMA 3U5LA 4NR9A 4NS5A 5TB6A 5HQ7A 5K29A 5FG4A 5D3NA 4CUUA 5LJ0A 4NYXA 3AQAA 5COIA 4IOOA 4XY8A 4LZSA 2RNWA 4LZRA 4MEQA 4ALHA 5ENBA 5DW1A 4MEOA 4YBTA 3MB3A 5CQ6A 5A5NA 4TZ2A 2DVQA 4NXJA 3HMEA 4QSXA 5FE2A 3MULA 5I7XA 5CQ3A 4YBMA 5FE8A 4HBWA 4J0RA 2YELA 3FKMX 4YYDA 4C67A 2YQDA 4NR6A 3DAIA 4NRBA 4J0SA 4Z1SA 2L84A 4KV1A 5F2PA 5F1LA 4QR5A 4YY4A 4CUQA 5DY7A 5I7YA 4ZC9A 4ZW1A 4A9IA 4O7EA 5ETBA 4AKNA 4QEWA 1WUGA 5E3GA 4GPJA 3SVHA 4HXNA 5DYXA 4TS8A 5I86A 4O7BA 4BW1A 3MXFA 4Q0OA 2I8NA 4HXPA 5EP7A 5LKTA 5E9KA 4YYHA 4QSTA 4TT6A 4O74A 5ENCA 3ZYUA 4BW3A 4YYKA 5F62A 4QNSA 4QSQA 5DYAA 3MUKA 3P1EA 4MR4A 5CRMA 3P5OA 5F3AA 2N9GA 5EWVA 4QEUA 4UIXA 2RI7A 4TT4A 2WP1A 1X0JA 5D3JA 3U5KA 2F6JA 4NR8A 3P1DA 5D7XA 5EA1A 5EK9A 5CQAA 5ETDA 5I88A 5FFWA 5KTUA 4NR7A 4PCEA 5A5QA 5FE7A 4UYFA 5EWHA 4N4FA 4HBYA 4QC3A 5E9VA 5I89A 2EJNA 5F60A 5CQ7A 4LZ2A 5F63A 2RS9B 4QSUA 4CFLA 2YW5A 4A9EA 4QYDA 4C66A 5A83A 4OUFA 5LVRA 5E73A 5FE4A 3LQHA 4QUUA 5LJ1A 4LC2A 2RFJA 5I29A 2F6NA 3LQJA 5DLZA 5IBNA 4TT2A 5A81A 4YH3A 4HXSA 2L85A 4UYEA 1ZKRA 5LUUA 5HENA 5I1QA 3UVDA 5D3HA 2R0YA 5AMEA 4Z1QA 4IORA 3LJWA 5DFDA 5HRVA 2DVRA 2H60A 2DKWA 5E9YA 4NUCA 5EPBA 5AD3A 5IIDA 4O7FA 4HXMA 5CUEA 5E9MA 4PS5A 5CUDA 4NUDA 2OUOA 4CUPA 5FE9A 3ERRA 4NR5A 3JVKA 4QB3A 4A9LA 5CUAA 4TQNA 4LYWA 5ENEA 4ZQLA 5FFVA 5CQ5A 5F5ZA 4YY6A 5EI4A 3U5NA 5A85A 4YYIA 4NQMA 5E7DA 5L97A 1JM4B 5I83A 5ENJA 5II2A 5D3LA 5A5PA 5KTWA 3VKHA 5EWWA 5G4SA 2I7KA 4PCIA 4BHWA 4E96A 3SVFA 4QSSA 5IGMA 5FE1A 5HQ5A 4UYFB 5CTLA 5F36A 4YADA 4YABA 5EQ1A 5HFRA 3O37A 5A5OA 5FG5A 4NYVA 5CGPA 3D1BA 3G0LA 5E9IA 4IR4A 1JSPB 4BW4A 4XUBA 5CRZA 3P1FA 4OGIA 3QZVA 2YYNA 4N3WA 5TCMA 3TLPA 5EVAA 2RO1A 4XY9A 5EPRA 4HXOA 4WHUA 5CU8A 5FE5A 5CPEA 4QUTA 5HCLA 4PY6A 2DATA 2OSSA 4XYAA 4LDFA 2KTBB 4LRGA 4CFKA 3HMFA 4OGJA 4PKLA 2RNYA 5CP5A 5F61A 5D3SA 2R0VA 3JVMA 2DVVA 5BT5A 3UVXA 4NQNA 3K2JA 2WP2A 5BT3A 4O77A 5IGKA 3UV2A 5D3TA 4Q0NA 5DKHA 4HBVA 4A9NA 5I40A 4F3IA 4IR3A 4UYDA 5II1A 4Z6HA 3VKGA 4YYNA 4A9FA 4YYGA 5EICA 4AKGA 3D1DA 5CY9A 4BW2A 4YBSA 3S92A 5FE3A 3O33A 4O71A 4UIVA 4TTEA 5FH6A 4Z93A 1WUMA 4NUEA 4QSPA 4O72A 5HELA 5HQ6A 4TYLA 5EWDA 5KU3A 2YDWA 4N4HA 4HBXA 5L96A 4UITA 4IR6A 5H1TA 4HXKA 2DVSA 1ZS5A 5C8GA 5A5RA 5DFBA 2LSPB 4NRAA 4YATA 4Y03A 4A9HA 3JVLA 2E3KA 4O78A 5FB0A 4NYWA 2R0SA 4RVRA 5E0RA 5ENIA 4O7AA 4PTBA 2GRCA 5E74A 5C87A 5FBXA 5C4QA 3QZSA 5FG6A 5AMFA 2D9EA 5H1UA 4QSVA 4YC9A 1E6IA 5E9LA 5H1VA 5FH8A 5LKXA 5CUBA 3DWYA 2L5EA 4CLBA 4MR3A 3ONIA 5DX4A 4NRCA 5CUGA 1N72A 4TZ8A 5E3DA 5HRWA 5CQ4A 5D3PA 5CFWA 5JWMA 3AADA 5A5SA 5DBMA 4TU6A 5AD2A 5DYCA 4UIZA 5A82A 4KCXA 5I80A 4MR6A 4X2IA 3GG3A 4HXRA 4AI6A 4QC1A 4O75A 4YAXA 5LKUA 4J1PA 4O70A 3UVYA 4LYSA 4QSRA 3QZTA 5CUCA 2FSAA 4KV4A 5EM3A 5LJ2A 5CS8A 3U5JA 3IU6A 5A7CA 4QEVA 3UW9A 3NXBA 5FDZA 5ACYA 5D25A 5DFCA 5HLSA 3O34A 2NXBA 3MB4A 4ALGA 5EPSA 4IOQA 5L8UA 4CL9A 3D7CA 5LKZA 5J0DA 4UIWA 4QR4A
chains in the Genus database with same CATH topology
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 4UYG A;  5LVQ A;  5CZG A;  2R10 A;  3Q2E A;  4N4G A;  4DON A;  2OO1 A;  3G0J A;  5EV9 A;  4QSW A;  5HFQ A;  5FE0 A;  3U5P A;  5EU1 A;  5FE6 A;  5C7N A;  5DYU A;  4QYL A;  5F1H A;  3U5M A;  3U5O A;  4O7C A;  5C89 A;  5DKC A;  4Z6I A;  5C85 A;  4UYH A;  2MJV B;  4NR4 A;  5DW2 A;  5D26 A;  5HRX A;  4LYI A;  3RCW A;  2D82 A;  5FFY A;  4BJX A;  5IGL A;  3JVJ A;  5G4R A;  5JI8 A;  5L8T A;  3SVG A;  4YYJ A;  4CUT A;  2E7O A;  4YK0 A;  4QY4 A;  3S91 A;  4QZS A;  4J3I A;  4A9M A;  5H85 A;  2DWW A;  5EIS A;  4MEP A;  3UVW A;  4YH4 A;  4FLP A;  5CQ8 A;  5EGU A;  4XUA A;  5DKD A;  3O35 A;  5FH7 A;  5HEM A;  4QBM A;  5ENG A;  3HMH A;  4CUS A;  4IR5 A;  3O36 A;  2YEK A;  5ENF A;  4MR5 A;  3LXJ A;  3I3J A;  4LR6 A;  3UV4 A;  5L99 A;  5HM0 A;  5IGN A;  5BT4 A;  5IG6 A;  5ENH A;  3P1C A;  2YEM A;  5KTX A;  3MQM A;  5FB1 A;  2RNX A;  4O76 A;  5D24 A;  4WHW A;  5KHM A;  4N4I A;  5D0C A;  4CUR A;  4HXL A;  5CQT A;  3Q2F A;  5D3R A;  5DLX A;  1F68 A;  4A9O A;  4A9K A;  5KO4 A;  4UIU A;  3IU5 A;  4TU4 A;  5HJC A; 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