4O7FA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with sb-251527
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o7fA01
3QZVA 4NYWA 2D9EA 5E9VA 3LXJA 5E9IA 3O34A 3MXFA 3SVFA 5CQTA 4CUQA 2OSSA 5I1QA 2R0SA 5DKHA 5FFYA 5CUDA 4IOQA 4YC9A 3SVGA 5COIA 5C8GA 4J0SA 5CUGA 4GPJA 5FE5A 5EISA 4YABA 5DYXA 5A5SA 3LJWA 4N4IA 4TTEA 4CFLA 5HELA 4QEVA 4TYLA 3MB4A 5FFWA 1JSPB 5EWHA 5CUEA 4HXLA 3LQJA 5CP5A 5LKZA 4C66A 4A9MA 4Z6IA 4KV4A 2DVQA 3IU5A 3O33A 2RNXA 3D7CA 4O7FA 4A9NA 3TLPA 5CFWA 5F61A 4KV1A 2R10A 5DY7A 5L98A 4HBXA 5F2PA 5D3LA 2YYNA 4UYGA 3DWYA 4UIWA 5I89A 3HMFA 5DFBA 5LKXA 2RFJA 5LJ2A 5D3HA 4HBYA 2R0YA 2DWWA 5EU1A 4TZ2A 5KTUA 5A5OA 5CRMA 5E7DA 4CLBA 2LSPB 4WHUA 4O71A 4J0RA 3U5PA 5FE9A 4ALGA 4QSSA 4YYHA 5L97A 4CL9A 4QY4A 3I3JA 4LYSA 5DX4A 4BW3A 3UVWA 4NS5A 5DLZA 3S91A 4XY9A 4PCIA 5ENBA 3O35A 4QR5A 4QSWA 5EPSA 4A9LA 5KHMA 4QC1A 2MJVB 1WUGA 3G0JA 4LDFA 2E3KA 5IGMA 4XUAA 3Q2FA 4O7AA 4TT6A 4A9EA 5C4QA 4HXNA 5C7NA 5DYCA 5EA1A 5TCMA 3U5LA 5F5ZA 5DFDA 2RO1A 4HBVA 3HMHA 5CZGA 5HENA 4LR6A 4XUBA 5DFCA 3NXBA 5IG6A 4O75A 4O76A 3JVMA 4QYLA 2I7KA 5EQ1A 4YYJA 4HXOA 5CQ7A 5I29A 5HQ7A 4QUTA 4OGJA 4QNSA 3U5JA 2G4AA 5L8TA 4NUEA 4BW4A 5EICA 4O72A 5EPRA 4HBWA 3FKMX 4YH4A 5FH8A 2NXBA 4BW2A 2FSAA 5D3TA 5HJCA 3ZYUA 5CQ4A 4NUCA 4J3IA 4QSUA 4IR5A 3QZSA 4NRBA 4NRCA 5E3DA 5FBXA 4LYWA 4MENA 4NR4A 2DVRA 5CQ5A 5CU8A 4RVRA 4YYKA 3MB3A 4QSXA 5G4RA 4IR6A 4NQNA 5HQ5A 5E9MA 5HM0A 2F6JA 5FE7A 4NXJA 5FG5A 3UVYA 5I40A 4O70A 5CUAA 5D3SA 4QSQA 4Z1SA 2WP2A 3MULA 5C87A 4NRAA 1JM4B 4TS8A 5IGNA 5TB6A 3MUKA 5AD3A 5L8UA 3O36A 5A82A 5EK9A 2YQDA 5C85A 3P1DA 4YADA 5I88A 2YW5A 5DYAA 5FE6A 4TZ8A 4NR7A 4CURA 5EWCA 5DBMA 5HFQA 4PCEA 5DLXA 2YDWA 5EWDA 5G4SA 3AADA 4IR3A 5F25A 5K29A 4NYXA 5ETBA 5JWMA 4YH3A 2R0VA 4YK0A 5ENJA 5II1A 2YEKA 4LZSA 5A85A 3ONIA 5FFVA 5I86A 4A9KA 3U5MA 3GG3A 4QSVA 4XYAA 4LYIA 5FE0A 4QSRA 2H60A 2E7OA 2DVSA 4LRGA 3K2JA 5ENGA 3P5OA 4MEPA 4O77A 2L5EA 4UYEA 5F62A 4Z6HA 5A5PA 4O74A 4ZQLA 4UIUA 4ZC9A 2L85A 4QZSA 3UV2A 3Q2EA 3UW9A 3U5NA 4ALHA 5KU3A 3LQHA 4YBMA 4PS5A 4KCXA 4O7CA 5JI8A 5EM3A 5KO4A 5L99A 2KTBB 4QEWA 3P1EA 2RS9B 5D3PA 5EWVA 4A9OA 4Y03A 3S92A 5HRWA 4CUUA 4PKLA 5ACYA 5A83A 5D26A 3RCWA 5KTWA 4XY8A 2RNYA 2DATA 4YBTA 5CQ8A 5DW2A 3DAIA 5AD2A 5H1VA 5H1UA 4QC3A 5LVRA 4N4GA 4YAXA 5FH7A 5EPBA 5A81A 5J0DA 4HXSA 4CFKA 4YYIA 5DW1A 4F3IA 5ENCA 5EGUA 4YYNA 4MR4A 5FG6A 4PTBA 4UYDA 4WIVA 5FE3A 5I7YA 4CUSA 5D7XA 4YYGA 2RNWA 2L84A 5F60A 5FB1A 5EWWA 5L96A 2I8NA 3AQAA 4IORA 2D82A 5EI4A 5A5QA 3UVXA 4NYVA 4BJXA 5EV9A 4UIXA 4MR6A 5HLSA 1F68A 4TT4A 5E9LA 5A5RA 5D0CA 2WP1A 4O78A 5FH6A 5KTXA 4YYMA 5IIDA 4NR8A 4X2IA 5CS8A 5F36A 5F1HA 5CTLA 5LKUA 4UITA 4QBMA 5CGPA 3JVJA 2DVVA 5CRZA 2F6NA 4Q0NA 5II2A 3HMEA 5F63A 3UV5A 5E9YA 4IR4A 4A9HA 5AMFA 1WUMA 3O37A 4UYFA 5E74A 3U5KA 5IBNA 2OUOA 5FE1A 2OO1A 4DONA 5BT3A 5LUUA 3LQIA 4OGIA 4N4FA 4QR4A 4Q0OA 3UVDA 5AMEA 5A7CA 1X0JA 2N9GA 5ENHA 4UIVA 1EQFA 5BT4A 4MR5A 4QR3A 5D25A 4QB3A 5C89A 4TU6A 4HXMA 5A5NA 4YATA 5FE8A 5I80A 3QZTA 4MEQA 5D24A 5I7XA 4UIYA 4OUFA 5ENFA 5FG4A 4ZW1A 4Z1QA 5DKDA 4YY4A 5HCLA 4NQMA 4NUDA 5LJ0A 5CQ6A 5LKTA 5ENIA 4A9IA 5DKCA 5CPEA 3JVLA 5HQ6A 5F3AA 4CUTA 5CQ3A 5E3GA 5CUCA 1E6IA 4NR5A 3G0LA 4O7EA 4BHWA 4FLPA 5FDZA 5E9KA 5HRXA 5ETDA 4A9FA 4QSTA 5H1TA 2YELA 4QSPA 4E96A 4BW1A 4N3WA 5FE4A 4CUPA 4WHWA 4YYDA 5D3RA 5FE2A 4IOOA 5E0RA 5EVAA 5CY9A 3U5OA 5HRVA 1N72A 4N4HA 5HFRA 4LC2A 5E73A 4Z93A 4MR3A 4TT2A 5ENEA 3SVHA 3P1FA 5IGKA 4QYDA 5HEMA 4PY6A 5CUBA 4YBSA 4J1PA 5D3JA 2GRCA 4YY6A 5FB0A 4A9JA 4O7BA 2E7NA 5EP7A 4NR6A 1ZS5A 5D3NA 2RI7A 4C67A 5BT5A 4MEOA 4NR9A 4LZRA 3JVKA 4HXPA 5LVQA 3IU6A 4HXRA 4UYFB 5I83A 4TU4A 5LJ1A 3MQMA 5CQAA 4QEUA 2YEMA 4QUUA 5IGLA 4LZ2A 4AKNA 4UIZA 4UYHA 4TQNA 3UV4A 5F1LA 5H85A 4HXKA 5DYUA 3P1CA 2DKWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QZVA 4NYWA 2D9EA 5E9VA 3LXJA 5E9IA 3O34A 3MXFA 3SVFA 5CQTA 4CUQA 2OSSA 5I1QA 2R0SA 5DKHA 5FFYA 5CUDA 4IOQA 4YC9A 3SVGA 5COIA 5C8GA 4J0SA 5CUGA 4GPJA 5FE5A 5EISA 4YABA 5DYXA 5A5SA 3LJWA 4N4IA 4TTEA 4CFLA 5HELA 4QEVA 4TYLA 3MB4A 5FFWA 1JSPB 5EWHA 5CUEA 4HXLA 3LQJA 5CP5A 5LKZA 4C66A 4A9MA 4Z6IA 4KV4A 2DVQA 3IU5A 3O33A 2RNXA 3D7CA 4O7FA 4A9NA 3TLPA 5CFWA 5F61A 4KV1A 2R10A 5DY7A 5L98A 4HBXA 5F2PA 5D3LA 2YYNA 4UYGA 3DWYA 4UIWA 5I89A 3HMFA 5DFBA 5LKXA 2RFJA 5LJ2A 5D3HA 4HBYA 2R0YA 2DWWA 5EU1A 4AKHA 4TZ2A 5KTUA 5A5OA 5CRMA 5E7DA 4CLBA 2LSPB 4WHUA 4O71A 4J0RA 3U5PA 5FE9A 4ALGA 4QSSA 4YYHA 5L97A 4CL9A 4QY4A 3I3JA 4LYSA 5DX4A 4BW3A 3UVWA 4NS5A 5DLZA 3S91A 4XY9A 4PCIA 5ENBA 3O35A 4QR5A 4QSWA 5EPSA 4A9LA 5KHMA 4QC1A 2MJVB 1WUGA 3G0JA 4LDFA 2E3KA 5IGMA 4XUAA 3Q2FA 4O7AA 4TT6A 4A9EA 5C4QA 4HXNA 5C7NA 5DYCA 5EA1A 5TCMA 3U5LA 5F5ZA 5DFDA 2RO1A 4HBVA 3HMHA 5CZGA 5HENA 4LR6A 4XUBA 5DFCA 3NXBA 5IG6A 4O75A 4O76A 3JVMA 4QYLA 2I7KA 5EQ1A 4YYJA 4HXOA 5CQ7A 5I29A 5HQ7A 4QUTA 4OGJA 4QNSA 3U5JA 2G4AA 5L8TA 4NUEA 4BW4A 5EICA 4O72A 5EPRA 4HBWA 3FKMX 4YH4A 5FH8A 2NXBA 4BW2A 2FSAA 5D3TA 5HJCA 3ZYUA 5CQ4A 4NUCA 4J3IA 4QSUA 4IR5A 3QZSA 4NRBA 4NRCA 5E3DA 5FBXA 4LYWA 4MENA 4NR4A 2DVRA 5CQ5A 5CU8A 3ERRA 4RVRA 4YYKA 3MB3A 4QSXA 5G4RA 4IR6A 4NQNA 5HQ5A 5E9MA 5HM0A 2F6JA 5FE7A 4NXJA 5FG5A 3UVYA 5I40A 4O70A 5CUAA 5D3SA 4QSQA 4Z1SA 2WP2A 3MULA 5C87A 4NRAA 1JM4B 4TS8A 5IGNA 5TB6A 3MUKA 5AD3A 5L8UA 3VKHA 3O36A 5A82A 5EK9A 2YQDA 5C85A 3P1DA 4YADA 5I88A 2YW5A 5DYAA 5FE6A 4AKIA 4TZ8A 4NR7A 4CURA 5EWCA 5DBMA 5HFQA 4PCEA 5DLXA 2YDWA 5EWDA 5G4SA 3AADA 4IR3A 5F25A 5K29A 4NYXA 5ETBA 5JWMA 4YH3A 2R0VA 4YK0A 5ENJA 5II1A 2YEKA 4LZSA 5A85A 3ONIA 5FFVA 5I86A 4A9KA 3U5MA 3GG3A 4QSVA 4XYAA 4LYIA 5FE0A 4QSRA 2H60A 2E7OA 2DVSA 4LRGA 3K2JA 5ENGA 3P5OA 4MEPA 4O77A 2L5EA 4UYEA 5F62A 4Z6HA 5A5PA 4O74A 4ZQLA 4UIUA 4ZC9A 2L85A 4QZSA 3UV2A 3Q2EA 3UW9A 3U5NA 4ALHA 5KU3A 3LQHA 4YBMA 4PS5A 4KCXA 4O7CA 5JI8A 5EM3A 5KO4A 5L99A 2KTBB 4QEWA 3P1EA 2RS9B 5D3PA 5EWVA 4A9OA 4Y03A 3S92A 5HRWA 4CUUA 4PKLA 5ACYA 5A83A 3D1BA 5D26A 3RCWA 5KTWA 4XY8A 2RNYA 2DATA 4YBTA 5CQ8A 5DW2A 3DAIA 5AD2A 5H1VA 5H1UA 4QC3A 5LVRA 4N4GA 4YAXA 5FH7A 5EPBA 5A81A 5J0DA 4HXSA 4CFKA 4YYIA 5DW1A 4F3IA 5ENCA 5EGUA 4YYNA 4MR4A 5FG6A 4PTBA 4UYDA 4WIVA 5FE3A 5I7YA 4CUSA 5D7XA 4YYGA 2RNWA 2L84A 5F60A 5FB1A 5EWWA 5L96A 1PUOA 2I8NA 3AQAA 4IORA 2D82A 5EI4A 5A5QA 3UVXA 4NYVA 4BJXA 5EV9A 4UIXA 4MR6A 5HLSA 1F68A 4TT4A 5E9LA 5A5RA 5D0CA 2WP1A 4O78A 5FH6A 5KTXA 4YYMA 5IIDA 4NR8A 4X2IA 1ZKRA 2EJNA 5CS8A 5F36A 5F1HA 5CTLA 5LKUA 4UITA 4QBMA 5CGPA 3JVJA 2DVVA 5CRZA 2F6NA 4Q0NA 5II2A 3HMEA 5F63A 3UV5A 5E9YA 3VKGA 4IR4A 4A9HA 5AMFA 1WUMA 3O37A 4UYFA 5E74A 3U5KA 5IBNA 2OUOA 5FE1A 2OO1A 4AI6A 4DONA 4AKGA 5BT3A 5LUUA 3LQIA 4OGIA 4N4FA 4QR4A 4Q0OA 3UVDA 5AMEA 5A7CA 1X0JA 2N9GA 5ENHA 4UIVA 1EQFA 5BT4A 4MR5A 4QR3A 5D25A 4QB3A 5C89A 4TU6A 4HXMA 5A5NA 4YATA 5FE8A 5I80A 3QZTA 4MEQA 5D24A 5I7XA 4UIYA 4OUFA 5ENFA 5FG4A 4ZW1A 4Z1QA 5DKDA 4YY4A 5HCLA 4NQMA 4NUDA 5LJ0A 5CQ6A 5LKTA 5ENIA 4A9IA 5DKCA 5CPEA 3JVLA 5HQ6A 5F3AA 4CUTA 5CQ3A 5E3GA 5CUCA 1E6IA 4NR5A 3G0LA 4O7EA 4BHWA 4FLPA 5FDZA 5E9KA 5HRXA 5ETDA 4A9FA 4QSTA 5H1TA 2YELA 4QSPA 4E96A 4BW1A 4N3WA 5FE4A 4CUPA 4WHWA 4YYDA 5D3RA 5FE2A 4IOOA 5E0RA 5EVAA 5CY9A 3U5OA 5HRVA 1N72A 4N4HA 5HFRA 4LC2A 5E73A 4Z93A 4MR3A 4TT2A 5ENEA 3SVHA 3P1FA 5IGKA 4QYDA 5HEMA 4PY6A 5CUBA 4YBSA 4J1PA 5D3JA 2GRCA 4YY6A 5FB0A 4A9JA 4O7BA 2E7NA 5EP7A 4NR6A 1ZS5A 5D3NA 2RI7A 4C67A 5BT5A 4MEOA 4NR9A 4LZRA 3JVKA 4HXPA 5LVQA 3IU6A 4HXRA 4UYFB 5I83A 4TU4A 5LJ1A 3MQMA 5CQAA 3D1DA 4QEUA 2YEMA 4QUUA 5IGLA 4LZ2A 4AKNA 4UIZA 4UYHA 4TQNA 3UV4A 5F1LA 5H85A 4HXKA 5DYUA 3P1CA 2DKWA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3QZV A;  4NYW A;  2D9E A;  5E9V A;  3LXJ A;  5E9I A;  3O34 A;  3MXF A;  3SVF A;  5CQT A;  4CUQ A;  2OSS A;  5I1Q A;  2R0S A;  5DKH A;  5FFY A;  5CUD A;  4IOQ A;  4YC9 A;  3SVG A;  5COI A;  5C8G A;  4J0S A;  5CUG A;  4GPJ A;  5FE5 A;  5EIS A;  4YAB A;  5DYX A;  5A5S A;  3LJW A;  4N4I A;  4TTE A;  4CFL A;  5HEL A;  4QEV A;  4TYL A;  3MB4 A;  5FFW A;  1JSP B;  5EWH A;  5CUE A;  4HXL A;  3LQJ A;  5CP5 A;  5LKZ A;  4C66 A;  4A9M A;  4Z6I A;  4KV4 A;  2DVQ A;  3IU5 A;  3O33 A;  2RNX A;  3D7C A;  4O7F A;  4A9N A;  3TLP A;  5CFW A;  5F61 A;  4KV1 A;  2R10 A;  5DY7 A;  5L98 A;  4HBX A;  5F2P A;  5D3L A;  2YYN A;  4UYG A;  3DWY A;  4UIW A;  5I89 A;  3HMF A;  5DFB A;  5LKX A;  2RFJ A;  5LJ2 A;  5D3H A;  4HBY A;  2R0Y A;  2DWW A;  5EU1 A;  4TZ2 A;  5KTU A;  5A5O A;  5CRM A;  5E7D A;  4CLB A;  2LSP B;  4WHU A;  4O71 A;  4J0R A;  3U5P A;  5FE9 A;  4ALG A;  4QSS A;  4YYH A;  5L97 A;  4CL9 A;  4QY4 A;  3I3J A;  4LYS A;  5DX4 A;  4BW3 A;  3UVW A;  4NS5 A;  5DLZ A;  3S91 A;  4XY9 A;  4PCI A;  5ENB A;  3O35 A; 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