4O7FA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with sb-251527
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
b'SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/inhibitor
total genus 39
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o7fA01
5FE9A 3HMFA 4A9NA 5I89A 3SVGA 5FB1A 1N72A 5KU3A 4Z1SA 4CL9A 5HLSA 5FFVA 4WHWA 5IGLA 4O70A 4QEUA 4O7BA 4YADA 5ENIA 4QSRA 4YBTA 5LKZA 5I7XA 4QSXA 5IGKA 5I80A 5KO4A 4QUUA 5A5QA 5F2PA 3NXBA 3UVDA 4KCXA 5DKHA 3SVFA 3MB4A 2R0SA 5CUCA 4YYNA 5CUGA 2DVSA 4TZ8A 5FE2A 4QR4A 5DFBA 3UVYA 2R0VA 5DBMA 2YEMA 5FFYA 5DYXA 2L85A 4NR6A 4TU6A 4UITA 4NUEA 5CQ7A 5E9KA 4HXNA 4MR6A 2RS9B 5CP5A 4LR6A 5D3RA 5DFCA 5EM3A 5D3NA 5II1A 1EQFA 5D24A 4QR5A 4Q0NA 5FH6A 2WP2A 4O7FA 4ZW1A 4O75A 5E9YA 4LZ2A 5A5RA 4NR7A 4QBMA 5D0CA 2D82A 4KV1A 4PCIA 4UYHA 5FG6A 4LC2A 5JWMA 4PCEA 3JVJA 4QC3A 5CUAA 4MR5A 4WHUA 4YH4A 4WIVA 5LKUA 2RFJA 5ENGA 5I1QA 3D7CA 3TLPA 4ALGA 2I8NA 3P1FA 4NXJA 5F1LA 4NYXA 2YQDA 4TT6A 2DATA 3MUKA 5LJ1A 4BJXA 5E74A 5EI4A 2DVVA 5E9VA 3U5JA 1JSPB 5G4SA 4NR9A 4XY9A 3LJWA 5D7XA 2RNYA 4A9HA 3DWYA 5FG5A 3U5LA 4QY4A 5ENEA 5HFQA 4YYGA 4MR4A 4UYEA 3IU6A 5ETBA 5EP7A 4NRAA 5HQ6A 4HBWA 3IU5A 5ETDA 4UIWA 5A82A 5AMEA 5C89A 4X2IA 5HRXA 5E9IA 2R10A 4TU4A 5FE7A 4PS5A 1E6IA 5LVQA 5C8GA 4YBSA 5E3DA 5CS8A 5DYCA 5FE1A 4ALHA 4LYWA 4NQNA 2N9GA 3QZTA 3G0LA 5I83A 5TCMA 4LYIA 4A9IA 4QSQA 4TYLA 4QC1A 4HXLA 4YYKA 3UW9A 4QYDA 5C7NA 4O7CA 4QSPA 4C67A 5CRZA 4NQMA 4IR3A 5IGMA 5FE0A 4QB3A 2YW5A 4YATA 5LVRA 4YC9A 4TT2A 5L98A 4CLBA 4PKLA 4XUAA 4CURA 4NRCA 5F61A 2I7KA 5A85A 4HXKA 2RI7A 5CU8A 4XYAA 5F3AA 4Z6IA 4J1PA 5EV9A 4HXOA 5EU1A 3P5OA 4NR8A 4HXPA 5CUDA 3MB3A 2DWWA 5H1UA 3Q2EA 2MJVB 4YYJA 4HBVA 3MQMA 4NUCA 5EWHA 4O7AA 5I7YA 4UYFB 5H1TA 3U5KA 1ZS5A 2DVQA 5A5SA 3QZSA 2WP1A 4BW2A 4BW3A 3P1DA 5EVAA 2E7NA 4N4IA 5ENHA 4CFKA 4IOQA 5FFWA 5CQTA 3GG3A 4UIVA 5F62A 4YYIA 5KTXA 4UYGA 2F6JA 5DKCA 4A9KA 2KTBB 4LZSA 4HXSA 4CUTA 4Z1QA 5DYAA 5HENA 5IBNA 3O34A 5DFDA 5A5NA 5FE5A 5EWCA 1X0JA 4MR3A 4FLPA 4TT4A 3I3JA 4IR5A 5EWDA 5EPSA 5HFRA 4O7EA 4QSSA 5CQAA 5CQ8A 5EK9A 4F3IA 5C85A 5EWVA 5DW1A 3UV5A 5F63A 4NS5A 4O72A 3JVLA 2YYNA 4LDFA 4J3IA 3U5OA 4QYLA 2RNXA 3QZVA 4A9MA 5EISA 5A5OA 1JM4B 3JVKA 2H60A 4HXMA 5FE6A 5IGNA 3U5PA 4YH3A 4MENA 5F25A 5FH8A 4UYDA 5HCLA 5IG6A 5HM0A 4QZSA 1WUMA 4UIZA 5CZGA 5KTUA 3S92A 4Q0OA 4O74A 5ACYA 5AMFA 3LQHA 5L97A 3P1CA 2E3KA 3AADA 5EGUA 4YBMA 4TZ2A 5CQ6A 5CFWA 5LKXA 5A7CA 5ENJA 4NRBA 4LRGA 4LZRA 4YYHA 4IORA 4A9FA 4YY6A 4QNSA 5EA1A 4UIXA 3UVWA 4CUPA 2F6NA 2RNWA 5FG4A 3G0JA 4N4HA 2RO1A 2YDWA 5CUEA 4DONA 4QSTA 5A83A 4QSWA 4O71A 3LXJA 4N4GA 3UV2A 4MEQA 5F60A 3UVXA 5FE3A 4HBYA 4YAXA 3O35A 5D3LA 4QEVA 5D3TA 5AD3A 4QEWA 5E7DA 4UIYA 5I40A 1F68A 5CQ3A 4QSUA 3LQJA 4YABA 5EWWA 5BT3A 5E73A 4N3WA 2YELA 3S91A 5ENFA 4HXRA 4MEOA 5ENCA 4QR3A 5FDZA 5HRVA 4BW1A 4YYMA 5D25A 5F5ZA 5DKDA 5JI8A 5LJ0A 5COIA 5F36A 5DW2A 3JVMA 2FSAA 3ONIA 4E96A 4NR5A 5FE4A 4C66A 4NYVA 2OSSA 5L8UA 3K2JA 4BHWA 2DKWA 3Q2FA 3O33A 4YYDA 4CUQA 4O76A 4NR4A 5H1VA 5L96A 5CUBA 5HEMA 3AQAA 4OUFA 4QSVA 4Z93A 4QUTA 4ZQLA 5FB0A 3UV4A 5KHMA 5LJ2A 4O77A 4GPJA 5D3SA 4TS8A 5AD2A 5CQ5A 3U5MA 4A9EA 5DLZA 5CGPA 4ZC9A 4J0SA 3FKMX 5BT4A 5HQ7A 5DY7A 3HMHA 4UIUA 5EPBA 5EPRA 5HQ5A 5TB6A 4XY8A 5G4RA 3U5NA 5D3JA 4CFLA 4PY6A 2OO1A 4UYFA 4A9LA 5HRWA 4BW4A 4YY4A 5K29A 4Z6HA 5L99A 5ENBA 2R0YA 5BT5A 5F1HA 5DLXA 4CUUA 5CTLA 5D3HA 4A9OA 5D3PA 5H85A 5FH7A 4J0RA 5E0RA 3O37A 4YK0A 3MXFA 4IR6A 4CUSA 4NUDA 5C87A 5EICA 4KV4A 5CY9A 5A5PA 5DX4A 5E9LA 2G4AA 2DVRA 2YEKA 3DAIA 3O36A 4XUBA 1WUGA 3ZYUA 5L8TA 5II2A 5I86A 5C4QA 4TTEA 5CRMA 2E7OA 4RVRA 4O78A 5CPEA 4OGJA 4TQNA 4IOOA 4PTBA 4IR4A 4LYSA 3SVHA 5HELA 2NXBA 5J0DA 4HBXA 4NYWA 5CQ4A 5E3GA 5IIDA 3P1EA 4Y03A 5FBXA 5FE8A 5LKTA 4N4FA 5D26A 2LSPB 2GRCA 5KTWA 2L84A 5DYUA 2L5EA 5A81A 5I29A 5HJCA 4AKNA 2D9EA 5E9MA 3RCWA 2OUOA 5LUUA 4OGIA 3LQIA 5I88A 5EQ1A 3HMEA 3MULA 4A9JA 4MEPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FE9A 3HMFA 4A9NA 5I89A 3SVGA 1ZKRA 5FB1A 1N72A 5KU3A 4Z1SA 4CL9A 5HLSA 5FFVA 4WHWA 5IGLA 4O70A 4QEUA 4O7BA 4YADA 5ENIA 4QSRA 4YBTA 5LKZA 5I7XA 4QSXA 5IGKA 5I80A 5KO4A 4QUUA 5A5QA 5F2PA 3NXBA 3VKGA 3UVDA 3ERRA 4KCXA 5DKHA 3SVFA 3MB4A 2R0SA 5CUCA 4YYNA 5CUGA 2DVSA 4TZ8A 5FE2A 4QR4A 5DFBA 3UVYA 2R0VA 5DBMA 2YEMA 5FFYA 5DYXA 2L85A 4NR6A 4TU6A 4UITA 4NUEA 5CQ7A 5E9KA 4HXNA 4MR6A 2RS9B 5CP5A 4LR6A 5D3RA 5DFCA 5EM3A 5D3NA 5II1A 1EQFA 5D24A 4QR5A 4Q0NA 5FH6A 2WP2A 4O7FA 4ZW1A 4O75A 5E9YA 4AKHA 4LZ2A 5A5RA 4NR7A 4QBMA 5D0CA 2D82A 4KV1A 4PCIA 4UYHA 5FG6A 4LC2A 5JWMA 4PCEA 3JVJA 4QC3A 5CUAA 4MR5A 4WHUA 4YH4A 4WIVA 5LKUA 2RFJA 5ENGA 5I1QA 3D7CA 3TLPA 4ALGA 2I8NA 3P1FA 4NXJA 5F1LA 4NYXA 4AKGA 2YQDA 4TT6A 2DATA 3MUKA 5LJ1A 4BJXA 5E74A 5EI4A 2DVVA 5E9VA 3U5JA 1JSPB 5G4SA 4NR9A 4XY9A 3LJWA 5D7XA 2RNYA 4A9HA 3DWYA 5FG5A 3U5LA 4QY4A 5ENEA 5HFQA 4YYGA 4MR4A 4UYEA 3IU6A 5ETBA 5EP7A 4NRAA 5HQ6A 4HBWA 3IU5A 5ETDA 4UIWA 5A82A 5AMEA 5C89A 4X2IA 5HRXA 5E9IA 2R10A 4TU4A 5FE7A 4PS5A 1E6IA 5LVQA 5C8GA 4YBSA 5E3DA 5CS8A 5DYCA 5FE1A 4ALHA 4LYWA 4NQNA 2N9GA 3QZTA 3G0LA 5I83A 5TCMA 4LYIA 3D1DA 4A9IA 4QSQA 4TYLA 4QC1A 4HXLA 4YYKA 3UW9A 4QYDA 1PUOA 4O7CA 5C7NA 4QSPA 4C67A 5CRZA 4NQMA 4IR3A 5IGMA 5FE0A 4QB3A 2YW5A 4YATA 5LVRA 4YC9A 4TT2A 5L98A 4CLBA 4PKLA 4XUAA 4CURA 4NRCA 5F61A 2I7KA 5A85A 4HXKA 2RI7A 5CU8A 4XYAA 5F3AA 4Z6IA 4J1PA 5EV9A 4HXOA 5EU1A 3P5OA 4NR8A 4HXPA 5CUDA 3MB3A 2DWWA 5H1UA 3Q2EA 2MJVB 4YYJA 4HBVA 3MQMA 4NUCA 5EWHA 4O7AA 5I7YA 4UYFB 5H1TA 3U5KA 1ZS5A 2DVQA 5A5SA 3QZSA 2WP1A 4BW2A 4BW3A 3P1DA 5EVAA 2E7NA 4N4IA 5ENHA 4CFKA 4IOQA 5FFWA 5CQTA 3GG3A 4UIVA 5F62A 4YYIA 5KTXA 4UYGA 2F6JA 5DKCA 4A9KA 2KTBB 4LZSA 4HXSA 4CUTA 4Z1QA 5DYAA 5HENA 5IBNA 3O34A 5DFDA 5A5NA 5FE5A 5EWCA 1X0JA 4MR3A 4FLPA 4TT4A 3I3JA 4IR5A 5EWDA 5EPSA 5HFRA 4O7EA 4QSSA 5CQAA 5CQ8A 5EK9A 4F3IA 5C85A 5EWVA 5DW1A 3UV5A 5F63A 4NS5A 4O72A 3JVLA 2YYNA 4LDFA 4J3IA 3U5OA 4QYLA 2RNXA 3QZVA 4A9MA 5EISA 5A5OA 1JM4B 3JVKA 2H60A 4HXMA 5FE6A 5IGNA 3U5PA 4YH3A 4MENA 5F25A 5FH8A 4UYDA 5HCLA 5IG6A 5HM0A 4QZSA 1WUMA 4UIZA 5CZGA 5KTUA 3S92A 4Q0OA 4O74A 5ACYA 5AMFA 3LQHA 5L97A 3P1CA 2E3KA 3AADA 5EGUA 4YBMA 4TZ2A 5CQ6A 5CFWA 5LKXA 5A7CA 5ENJA 4NRBA 4LRGA 4LZRA 4YYHA 4IORA 4A9FA 4YY6A 4QNSA 5EA1A 4UIXA 3UVWA 4CUPA 2F6NA 2RNWA 5FG4A 3G0JA 4N4HA 2RO1A 2YDWA 4AI6A 5CUEA 4DONA 4QSTA 5A83A 4QSWA 4O71A 3LXJA 4N4GA 3UV2A 4MEQA 5F60A 3UVXA 5FE3A 4HBYA 4YAXA 3O35A 5D3LA 4QEVA 5D3TA 5AD3A 4QEWA 5E7DA 4UIYA 5I40A 1F68A 5CQ3A 4QSUA 3LQJA 4YABA 5EWWA 5BT3A 5E73A 4N3WA 2YELA 3S91A 5ENFA 4HXRA 4MEOA 5ENCA 4QR3A 5FDZA 5HRVA 4BW1A 4YYMA 5D25A 5F5ZA 5DKDA 5JI8A 5LJ0A 5COIA 5F36A 5DW2A 3JVMA 2FSAA 3ONIA 4E96A 4NR5A 5FE4A 4C66A 4NYVA 2OSSA 5L8UA 3K2JA 4BHWA 2DKWA 3Q2FA 3O33A 4YYDA 4CUQA 4O76A 4NR4A 5H1VA 5L96A 5CUBA 5HEMA 3AQAA 4OUFA 4QSVA 4Z93A 4QUTA 4ZQLA 5FB0A 3UV4A 5KHMA 5LJ2A 4O77A 4GPJA 5D3SA 4TS8A 5AD2A 5CQ5A 3U5MA 4A9EA 5DLZA 5CGPA 4ZC9A 4J0SA 3FKMX 5BT4A 5HQ7A 5DY7A 3HMHA 4UIUA 5EPBA 5EPRA 5HQ5A 5TB6A 4XY8A 5G4RA 3U5NA 5D3JA 4CFLA 4PY6A 2OO1A 4UYFA 4A9LA 5HRWA 4BW4A 4YY4A 5K29A 4Z6HA 5L99A 5ENBA 2R0YA 5BT5A 5F1HA 5DLXA 4CUUA 5CTLA 5D3HA 4A9OA 5D3PA 5H85A 5FH7A 4J0RA 5E0RA 3O37A 4YK0A 3MXFA 4IR6A 4CUSA 4NUDA 5C87A 5EICA 4KV4A 5CY9A 5A5PA 5DX4A 5E9LA 2G4AA 2DVRA 2YEKA 3DAIA 3O36A 4XUBA 1WUGA 3ZYUA 5L8TA 5II2A 5I86A 5C4QA 4TTEA 5CRMA 2E7OA 4RVRA 4O78A 4AKIA 5CPEA 4OGJA 4TQNA 4IOOA 4PTBA 4IR4A 4LYSA 3SVHA 5HELA 2NXBA 5J0DA 4HBXA 3VKHA 4NYWA 5CQ4A 5E3GA 5IIDA 3D1BA 3P1EA 4Y03A 5FBXA 5FE8A 5LKTA 4N4FA 5D26A 2LSPB 2GRCA 5KTWA 2L84A 5DYUA 2EJNA 2L5EA 5A81A 5I29A 5HJCA 4AKNA 2D9EA 5E9MA 3RCWA 2OUOA 5LUUA 4OGIA 3LQIA 5I88A 5EQ1A 3HMEA 3MULA 4A9JA 4MEPA
chains in the Genus database with same CATH topology
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