4O8KA

Crystal structure of type iii pantothenate kinase from burkholderia thailandensis, apo structure
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
GVCLLIDAGNSRIKWALADTGRHFVTSGAFEHADDTPDWSTLPAPRGAWISNVAGDAAAARIDALIDAHWPALPRTVVRACAAQCGVTNGYAEPARLGSDRWAGLIGAHAAFPGEHLLIATFGTATTLEALRADGRFTGGLIAPGWALMMRSLGMHTAQLPTVSIDAATSLLDELAANDAHAPFAIDTPHALSAGCLQAQAGLIERAWRDLEKAWKAPVRLVLSGGAADAIVRALTVPHTRHDTLVLTGLALIAHSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Type III pantothenate kinase from Burkholderia thailandensis, apo structure
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Burkholderia thailandensis
molecule keywords Type III pantothenate kinase
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-12-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o8kA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o8kA02
4H5NA 1QHAA 4IWVA 2HF4A 3FFKB 5AQFA 3VGMA 2QM1A 3CJCA 1YXQA 4WQ5C 3CJ9A 3ZEUA 4BRLA 3B8AX 2I7PA 4BRQA 4YDUC 3UKUB 2F9TA 1Y64A 3FLCO 1X3NA 3CJ1A 4RTFD 1HJOA 1S22A 2Q1NA 3H3OB 1EQYA 1DKGD 5BREA 3O1BA 3CJAA 1NGCA 4BRGA 3O1WA 5BRDA 3R6MA 3IUCA 3GOIA 4PKIA 1T44A 1BUPA 3VF6A 4DQ8A 2FSKA 4B1UB 2QWRA 2ZGZA 3O6WA 4YDUA 4MO4A 1ATNA 2CGJA 4JD2A 4B1YB 1GLEG 2HMPA 1HKBA 2E1ZA 4DHYA 2AP1A 2GUPA 4CZIA 4QS7A 2F9WA 3DXMA 3M3ZA 4RWTA 1NGBA 2QWNA 2QWLA 4PL7A 4CZJA 5EX5A 4GY2B 2ZF5O 1QZ5A 3C7NA 4JD2B 2QWPA 3FE1A 4CZHA 4M63C 1GLJO 3FR0A 4Z94A 4H5RA 3JS6A 1NBWA 5JMVA 3DXMB 4JHDA 5KQ8A 3QFUA 2P9LA 4IO8A 3LDPA 1BA0A 1DGKN 3OHRA 5AQOA 2E8AA 1P8ZA 3ZETB 5JLFA 2QWOA 3AARA 1GLAG 2BTFA 1LOTB 1RFQA 4IZ9A 5AQTA 4BR9A 1MDUB 1X3MA 4IXCA 1KAXA 4IJAA 3VERA 2ZGYA 3H45C 5AQIA 2P9LB 2FSNA 2WUSA 5BRFA 1Q18A 3ENOA 2VWBA 1HUXA 4XH1A 1ZXOA 3CQYA 4FWLA 4CZLA 2NRHA 2CGLA 3U4LA 4DCHA 2NLXA 4O8KA 4B1VA 4A62A 1ZC6A 3TU5A 2ASPA 3ENHA 3CQXA 2FXUA 4H0TB 1NGAA 3ATVA 3VOVA 5KPTA 2Q97A 4FWNA 5AFUA 1U6ZA 3MN7A 3HTVA 3CJ7A 3O5BA 5AQHA 3TPQA 3D2FA 4BRNA 3WEEA 3LDNA 3O80A 1BU6O 3M1FA 2E2PA 1E4GT 3ID8A 5B8HA 1K8KA 2Q0UA 4WYBA 1V4TA 1BG3A 2V7YA 4FL9A 3UB5A 1IG8A 4B1WB 2P9PA 3WEEB 2HOEA 3H3NO 1T6CA 2A40A 3KZBA 4KBOA 3FZKA 4A61A 1GLDG 4CD1A 2YHWA 2UYTA 3QICA 1TYQB 5BN9A 3SJHA 3ZX0A 4BRAA 3FZFA 1LCUA 1HX1A 3BEXA 2BUPA 1ATSA 5AQKA 1OKJA 4H5VA 5ADXH 3A5LC 3A5OC 3QFPA 3HSCA 3VENA 2EWSA 1HKGA 1QZ6A 5FPNA 1WOQA 2ZWHA 4JAXA 2Q31A 4K41A 2QXLA 5AFUH 1GLLO 2J4RA 2OANA 3VESA 4CJ7A 1NMDA 2VCPA 4FPBA 4DB3A 5FPMA 4CZMA 4NB4A 2P9NA 4QS8A 5AQJA 3CETA 3ZEUB 3S41A 4H0PA 2D0PA 5E84A 1JCFA 3BF1A 3FZMA 1V4SA 3WXLA 5ELZA 1H1VA 4K42A 5EXWA 5KPRA 1TUUA 4WQ5A 4K43A 3SK3A 3A8YA 2P9NB 1QQMA 2AA4A 4FWSA 4EFHA 3DJCA 4CZFA 3IMXA 3LDOA 4FWPA 3VGKA 3MK6A 4H5TA 4BRCA 4CD3A 3EKSA 5LJWA 5AQLA 3D7EO 3CIPA 1CZAN 2FF6A 2VYPA 4E1JA 1SAZA 5AQVA 1BDGA 2A6AA 2Q0RA 2YHYA 1U2VA 3O4WA 3WXIA 4BG9A 2NZTA 2IVNA 3W0LA 4BC2A 4BRPA 4H03B 3H46O 1NM1A 1MA9B 3VPZA 3ZX3A 5FPEA 3A5MC 2A3ZA 3QB0A 5AQSA 3VEOA 2CH6A 3LL3A 4FO0A 1MWMA 3BUZB 3EKUA 4B1XB 4LC9B 3C7NB 3VETA 1NGJA 3H6EA 5I9EB 1E4FT 1NGEA 5AQZA 2GWJA 2A5XA 2IVOA 4JHDB 2Q2RA 1BWFO 4M7YA 3EN9A 1NGHA 1SZ2A 4MLEA 1GLBG 3L6QA 4H0VB 5AQPA 3LDQA 4ISEA 3M6GA 4BR2A 4PKGA 4EHTA 3SMSA 3GDQA 5ADXA 3D2EA 5AZJA 1Z05A 4BRKA 2A41A 2ITMA 2P9SA 1G99A 3C0BA 2GELA 4WQ4C 3U9ZA 3F9MA 1JCEA 1RDWX 2E1YA 4BR5A 4C23A 2ASOA 1D4XA 1XUPO 2GTDA 5AQUA 4EAHD 3VEWA 2W40A 3D2EB 3U8XA 4BRFA 3EO3A 1MWKA 5AZIA 2P9SB 4QS9A 2QWMA 1ESVA 3RSEA 4PKHA 3KHYA 3MCPA 2QW9A 4A2BA 3R9PA 5F0XA 5AQMA 2P9UA 3VF4A 2YHXA 3O8MA 1X9JA 1HPMA 3DAWA 4WQ4A 4BR4A 4BRHA 5BPLA 3D2FB 4CBXA 2YJEA 1XQSC 5AQNA 2CGKA 3ULEA 4HWIA 4FOEA 2E20A 4O5FA 3G25A 4EIAA 1BOTO 3MN5A 4CI6A 1KAZA 1K8KB 3VEYA 4HTLA 2P9PB 4JNEA 4M7XA 1C0FA 1DEJA 5AR0A 3ULEB 4I6MA 5AQQA 3UKRA 3AY9A 1ATRA 2P9IA 3FZHA 2V52B 4BC4A 3MDQA 2E88A 2IIRA 5EVZA 4H5WA 2E2NA 4IJNA 5AQXA 4I6MB 5AQYA 3JXUA 3SLCA 3UKUA 1R59O 2P9IB 5AQGA 4B9QA 4BVOA 1YVNA 1C0GA 5EOYA 3QDKA 1J6ZA 1BA1A 1WUAA 3J8AA 4H0YB 3GG4A 2H3GX 3FZLA 4RCHA 5BPNA 5F1XA 4CZKA 5TKYA 3MN9A 3I8BA 4BR7A 2W41A 1KAYA 3ATUA 5LJVA 4K25A 3GBTA 1BO5O 3BP8A 4FOIA 5E26A 3CERA 5BPMA 3VGLA 3IFRA 3WQTA 4BGBA 2ASMA 4XH5A 1QQNA 2I7NA 4CBWA 3SMPA 2YCHA 4BC5A 4L3QA 2QWQA 2PBDA 4FWMA 2E2OA 4A2AA 1NGDA 4B1ZA 2Q36A 2YJFA 3VEZA 1S3XA 1U2VB 3EZWA 2V51B 3U9DA 3KVGA 4Y0WA 3CJBA 2E2QA 1T6DA 1YUWA 4FWKA 4FWOA 3LM2A 2GWKA 1HLUA 2GEMA 3HZ6A 3ZETA 1KXPA 4BRDA 1NGIA 3CHWA 3IDHA 2P9KA 3VEXA 4ISGA 3QBXA 3P4IA 2FF3B 5KPZA 3DWLA 1TUYA 4BRMA 3LM9A 1XC3A 4XH4A 4MLHA 4CBUA 1GLCG 3WXKA 4BR0A 4XEIA 4H0OA 5AQWA 2P9KB 3AAQA 5BN8A 4CZEA 1QQOA 5AQRA 2PAVA 3ZX2A 3HM8A 4EHUA 4AM6A 1RGIA 1SQKA 2FSJA 5CE3A 2D1KA 2CH5A 3WXJA 5AZJB 3VF2A 3LDLA 4FPAA 2V7ZA 4BVPA 3WQUA 4BG8A 1NWKA 3L0QA 4PL8A 1IJJA 5FPDA 1JCGA 3O08A 3H1VX 3GL1A 1HKCA 5BRHA 4ISFA 1YAGA 3WUHA 2YI1A 4BRIA 4FWQA 4JN4A 5EY4A 2D0OA 4J8FA 1GLFO 4GNIA 5AZIB 3I33A 1NGFA 4CZGA 3FGUA 1ZBSA 3H1QA 3RSEB 3HI0A 3GE1A 4BC3A 2FLOA 1NGGA 4FSVA 3UE5A 2P9UB 2HF3A 2KHOA 3R8EA 3A5NC 4MO5A 5BR9A 3VEVA 2IVPA 3CI5A 4H0XB 4BGAA 4FWRA 5JLHA 1TYQA 2DPNA 3DXKA 4BREA 3L4IA 3MMVA 4AM7A 3HBTA 4BQZA 3BF3A 2D4WA 3QBWA 2A42A 1NLVA 3MN6A 5KQDA 1Z6RA 3QMLA 4BQLA 4BROA 4NO7A 5LY3A 3W3DA 3A0IX 3AAPA 3WT0A 5JICA 3DXKB 4F9OA 5F2RA 3EL2A 3UKRB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZE2A 3HL8A 3NFAA 2X6SA 2Z1GA 1YXQA 3O9UA 3ZSRA 3CJ9A 3RMAA 3SPZA 4BRQA 1BL3A 3OYMA 1VQ4N 3FLCO 4F2SA 1HJOA 1VQMN 2Q1NA 3KK3A 5KI6A 1RDBA 1YIJN 3O1WA 1HMVA 3R6MA 4RW7A 5M1KA 1M90O 4ZHRA 1NG9A 4GV6A 1NNEA 4KO0A 2A1RA 4B1YB 1HKBA 4OGCA 4DHYA 1IG9A 2ZJRL 1UWBA 2UUBK 2QWLA 4PL7A 2VGNA 2A1SA 4CZJA 2HB5A 3TSPA 3C7NA 4JD2B 2QWPA 4M63C 3DLKA 3FR0A 4H5RA 1NBWA 4M3RA 3VTIA 4CHNA 4KHWA 3VQBA 3MECA 1BA0A 3OHRA 4CJKA 5JLFA 1VK0A 5MLCQ 3AARA 5HL7L 2DFEA 1LOTB 4IZ9A 3J81O 4IJAA 1UAXA 3H45C 2QI2A 4IFYA 2HHVA 3RR8A 2WUSA 5BRFA 1JL1A 1EP4A 2ZQBA 1ZXOA 3CQYA 4JKBA 4CZLA 1NOZA 2CGLA 2NRHA 2YX6A 3U4LA 1OH5A 1VQNN 2NLXA 1N36K 4O8KA 4M3WA 3DOLA 3AO4A 4DSEA 1IV0A 1ZC6A 2ASPA 1EETA 3CQXA 1HR0K 4H0TB 1NGAA 3TI0A 4CJLA 2Q97A 4O55A 4DU3A 4FWNA 4JKGA 4JKEA 1YTAA 3SUOA 3SAGA 4DTXA 1NKEA 3O5BA 5AQHA 1S72N 3IKMA 4BRNA 3EZ5A 3O80A 3M1FA 2E2PA 1TGOA 5DK5A 1W7AA 1E4GT 5B8HA 1LAVA 4CEEA 1FKOA 1K8KA 4WYBA 4JKDA 3UB5A 1IG8A 1Q81O 2WTUA 1NK7A 2P9PA 3MWPA 1W97L 3H3NO 2UXBK 3KZBA 2B4JA 4KBOA 4E7HA 3FZKA 3K0SA 2BDPA 1VSEA 4CD1A 5JVGL 4E7LA 2UYTA 5BN9A 2HHXA 3OYIA 4BRAA 3FZFA 3O4QA 5FRMA 5AQKA 1OKJA 2KKZA 3A5LC 1NJXA 2D5RA 2RKIA 3HSCA 3VENA 3QESA 4KHUA 3ZSWA 4JAXA 5AFUH 4CJ7A 4IEIA 5FPMA 3ZEUB 5HP1A 3S41A 4IOCL 1IKWA 2D0PA 5E84A 3BF1A 4IKFA 1RILA 3WXLA 4NCGA 1H1VA 1KLNA 3JYTA 3VQ8A 5FDLA 4DV0K 3AGKA 4WQ5A 2HHHK 4YOWA 4LF7K 4BE1A 3HK2A 5C10A 2AA4A 4QOZB 4CZFA 3MK6A 2ZJQL 3KK7A 3EKSA 5AQLA 1RT5A 2FF6A 3B6OA 4DMNA 4EP5A 1SAZA 1VSLA 4C1NK 3TR8A 4OPAA 3CCRN 1NKBA 4FK2A 2NZTA 1BCMA 4H03B 4J2AA 4KKOA 1I94K 5GINA 2BE2A 3OVNA 4CIGA 2XY6A 5DM6L 3BUZB 1CXQA 3EKUA 3AVCA 4RG8A 3AVKA 3C94A 4B8CA 3PY8A 1NK8A 4N56A 2GWJA 3VQCA 3LPUA 1ZBLA 4JYAK 3MX5A 1U48A 2G8VA 3NH0A 4CK3A 1KC8O 3OYEA 4OKEA 1VQ8N 1ZYQA 4ISEA 1YF5L 4O44A 2YNGA 4DV5K 1T7PA 3F5TA 2QEXN 5K14A 3ZSXA 2R7YA 3QIOA 1Z05A 1B92A 4KFBA 3ZYYX 3G4SN 1N32K 1EX4A 3ZT0A 4BWJA 3CFRA 3RRHA 4MDBA 1Q9XA 3EE8A 4NCAA 3C6AA 4LFAK 4BRFA 3EO3A 1QSLA 1ESVA 1WSFA 4M3YA 3CFOA 3V1OA 5GAGP 3SQ2A 1ZBFA 4G1QA 3OYKA 1RBRA 5CY4A 4A2BA 3LWLA 5AQMA 4ELVA 4IBNA 4DSJA 4IDKA 1HPMA 1TKXA 2WFBA 2HNZA 3KD1E 3ZT4A 4A59A 4F4KA 2WC9A 3DRRA 2CGKA 4FOEA 3AVNA 4O5FA 1TKTA 1O13A 3OYCA 3BDPA 2GBZA 4CI6A 1KAZA 3VEYA 1C0FA 5C15A 1LW2A 4CHOA 5C2DA 5AJ3K 3U3GA 2P9IA 1EXQA 4CESA 2KZZA 3FZHA 5IT9O 3MDQA 4JI1K 2Z1JA 4H5WA 4IJNA 3VQ7A 4AQYK 3SLCA 3LP0A 5HLFA 4FLVA 3UKUA 1N8RO 3QERA 3TTCA 2O8DB 1YVNA 1C0GA 2E4LA 1SS6A 4DF4A 3UIQA 1JJ2M 2FC0A 3OS0A 4RCHA 5BPNA 1BI4A 4CZKA 5TKYA 1N5YA 2EHGA 2OZMA 3KK2A 3AA2A 4BR7A 4JKCA 4DSLA 3ATUA 4QCLA 3EEQA 4K25A 1ZBHA 4NYNA 4FOIA 3IFRA 3CQ8A 2HVHA 1VQ5N 5J2MA 3ZSVA 3NHGA 4FK4A 4FJ9A 1SL2A 3J7AP 3OW2M 3VA0A 4J2EA 4B08A 2UUCK 3VQPA 3VQDA 3VEZA 1S3XA 1U2VB 3AO1A 3EZWA 4GV3A 4AHUA 3OS1A 3CJBA 2UU9K 5KTQA 2HBJA 4FWKA 1KXPA 4YOXA 4BRDA 3A2FA 3HXMA 2HHSA 3TABA 4FJXA 4IG0A 4CJEA 4KRFA 3P4IA 2FF3B 3DWLA 4MDAA 1TUYA 3LM9A 3CM6A 4RW6A 4MLHA 3WXKA 5CZ1A 4GMJB 4LH5A 5AQWA 2F8SA 3AGRA 3AAQA 4CGFA 4CZEA 1BGXT 2HW3A 3E1YA 1SQKA 4JI7K 4DR6K 3LDLA 4FJ5A 2HHWA 2V7ZA 3WQUA 1NWKA 3HRGA 3R3LA 1IJJA 1JCGA 1HNWK 1KSPA 3H1VX 5BRHA 4AHRA 1RT4A 3WUHA 4DTPA 2YKNA 3PUFA 2HBMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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