4O8KA

Crystal structure of type iii pantothenate kinase from burkholderia thailandensis, apo structure
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
b'GVCLLIDAGNSRIKWALADTGRHFVTSGAFEHADDTPDWSTLPAPRGAWISNVAGDAAAARIDALIDAHWPALPRTVVRACAAQCGVTNGYAEPARLGSDRWAGLIGAHAAFPGEHLLIATFGTATTLEALRADGRFTGGLIAPGWALMMRSLGMHTAQLPTVSIDAATSLLDELAANDAHAPFAIDTPHALSAGCLQAQAGLIERAWRDLEKAWKAPVRLVLSGGAADAIVRALTVPHTRHDTLVLTGLALIAHSA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Type III pantothenate kinase from Burkholderia thailandensis, apo structure
rcsb
molecule keywords Type III pantothenate kinase
source organism Burkholderia thailandensis
molecule tags Transferase
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-12-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o8kA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4o8kA02
3CETA 1ZC6A 1X3NA 3FZHA 4NO7A 4O5FA 3SLCA 3CIPA 4JHDA 1R59O 2F9TA 5KQ8A 2QXLA 2A3ZA 5AQYA 5BPLA 2F9WA 3CQXA 3VENA 1ZXOA 2YCHA 1NGHA 3HI0A 3ATVA 4KBOA 3VF4A 2W40A 3LM2A 3UKRB 4AM6A 3AARA 1S3XA 3UE5A 3R8EA 3OHRA 2P9NA 1GLFO 1YAGA 3UB5A 4CZLA 2I7PA 5BPNA 1HPMA 2A41A 4H5VA 5AQXA 4F9OA 4JNEA 4WYBA 3H45C 4GY2B 3U8XA 4AM7A 4E1JA 4BRCA 3ZEUB 5KQDA 3CJ9A 4A2AA 5F1XA 1ATRA 1JCGA 3WXKA 3CJBA 2ZF5O 4CZFA 4FSVA 4CBWA 4PL8A 4EIAA 2CGKA 5AQUA 1MA9B 4BR5A 4ISEA 1YVNA 3MN6A 1JCEA 3R9PA 1XUPO 3C7NB 1ATNA 1TYQB 4J8FA 4JD2A 2FXUA 5JICA 2Q31A 2IVOA 2P9PA 5AQJA 5ADXA 3MN9A 2IVPA 4FOIA 4BR0A 3P4IA 4CZJA 3ULEA 2A5XA 2NRHA 4IZ9A 4CZGA 3DXKB 4FPBA 1T44A 4FWKA 4I6MA 5AQPA 3ZX2A 3MN5A 2Q97A 2VYPA 5AQQA 4B1VA 3GOIA 1NGJA 1SQKA 2A6AA 5AR0A 2E2OA 3W3DA 3ATUA 2J4RA 4JN4A 1V4TA 5KPTA 5AZIB 1GLJO 1NGEA 4B1ZA 4H0OA 5AQOA 4BR7A 1D4XA 4EAHD 3EKUA 4FPAA 3KHYA 3B8AX 4K42A 3FR0A 1NMDA 3S41A 2QWLA 3MDQA 3A8YA 3VEOA 4H0YB 3C0BA 4EFHA 3GG4A 2UYTA 4B1UB 3WQUA 5EVZA 4PKHA 3BF1A 1HKGA 4LC9B 3WUHA 3CI5A 2KHOA 2E88A 3M6GA 3ID8A 3D2FB 5CE3A 1KAYA 4BR2A 1S22A 3EO3A 4RCHA 4IXCA 1K8KA 3LL3A 4A61A 4BGBA 2AP1A 3W0LA 3BF3A 2PBDA 2Q36A 5AZJB 4FL9A 1Y64A 3SMSA 4BRGA 3EZWA 4HTLA 5JLFA 2ITMA 2Q0UA 2D4WA 3EKSA 4M7YA 3DJCA 1BOTO 3HTVA 4BQLA 4BROA 5BRDA 5BR9A 3WXIA 4RWTA 4B1WB 3WEEB 3ZX0A 2CH5A 3QB0A 3UKUB 3CJ1A 3D2EA 3FGUA 1TUYA 1OKJA 2CH6A 1YUWA 2GUPA 5KPZA 3TU5A 3QDKA 2D1KA 2P9SA 4K43A 5AQNA 3LM9A 3I33A 5EXWA 2P9IA 4B9QA 3FLCO 1XC3A 4BVPA 5AQWA 3QFUA 1NGIA 3H1VX 5BN8A 4H0TB 1TUUA 3VGMA 1HKCA 4RTFD 1GLBG 4B1YB 2P9LB 3SJHA 1E4GT 2A40A 2YJEA 3ENOA 3RSEB 3GDQA 3O5BA 2P9KB 2IVNA 2GELA 2HOEA 4BRMA 2D0OA 4FWOA 2EWSA 5AQTA 4PKGA 3CJ7A 3WXJA 3U4LA 5ADXH 1BA0A 4QS7A 3EL2A 4BRHA 1IJJA 4M63C 1Z05A 1GLCG 2E8AA 1P8ZA 3VOVA 5LJWA 3JXUA 4CZKA 1NGDA 1NM1A 3VESA 4QS8A 3QBWA 3DXMA 4BC5A 1U2VA 3ZX3A 2D0PA 2QWNA 1BG3A 3U9DA 1ZBSA 4FWPA 4HWIA 5AFUH 4FWNA 2FF3B 2QWPA 4BC3A 1GLDG 4CBUA 4DB3A 1NGGA 3ZETA 2P9UB 4MO4A 5AQFA 4XH1A 2CGLA 1QQMA 2YHYA 3CJAA 1E4FT 4BREA 1EQYA 1ESVA 1MDUB 2V51B 3LDNA 4JHDB 1RGIA 4WQ4C 1QQOA 1HLUA 4CJ7A 2V7ZA 2Q2RA 3WQTA 3VF6A 2ZGYA 3FFKB 3VPZA 1T6DA 3FE1A 3HSCA 2GEMA 1QHAA 4Z94A 1V4SA 4DQ8A 1NGCA 3G25A 3QICA 2A42A 1BUPA 1KAZA 1WOQA 3A5LC 5E26A 2ASPA 3CQYA 2P9NB 4BC4A 4BRKA 2V7YA 4CZMA 3SK3A 3VGLA 4BRFA 1NWKA 3KZBA 4H5TA 4YDUC 3UKRA 3O08A 1QQNA 3LDOA 3ENHA 3QFPA 4A62A 1H1VA 3VEZA 2ZWHA 4H5NA 3CHWA 5LJVA 2ASMA 3L4IA 3MN7A 5BREA 4XH4A 2YHWA 3HZ6A 1C0FA 1Z6RA 3ZEUA 2QWMA 4H03B 2WUSA 4JD2B 2P9PB 1DGKN 2BTFA 4BQZA 1GLAG 4M7XA 3ULEB 1C0GA 3J8AA 5AQZA 2QWQA 5JMVA 2E1YA 5FPMA 1HX1A 1NLVA 2NZTA 4I6MB 5AQRA 1NGFA 2E2NA 3FZKA 4BRIA 2GTDA 3MK6A 1LOTB 1NBWA 1TYQA 3C7NA 3VEWA 5BRHA 1WUAA 3WT0A 3O4WA 4K25A 1U6ZA 3LDPA 3O8MA 5FPEA 4CD3A 3DXKA 2QW9A 2HMPA 5F0XA 4BRDA 3GE1A 4FO0A 1DKGD 1CZAN 1MWKA 2IIRA 4MO5A 3BUZB 3A5OC 4L3QA 2VWBA 3M3ZA 2YHXA 3L6QA 3MCPA 2Q0RA 5AZIA 3VERA 2E2QA 3O1BA 3VETA 1G99A 3TPQA 4FWLA 3HBTA 4BRLA 5BPMA 3M1FA 4H0PA 4IWVA 4BG9A 4YDUA 1NGBA 4DHYA 2Q1NA 2W41A 5JLHA 3H46O 1QZ6A 1K8KB 1SAZA 4IO8A 3KVGA 2H3GX 2QM1A 3AAQA 3U9ZA 3JS6A 1MWMA 4BR9A 1IG8A 1X9JA 4FWRA 2HF3A 2E20A 4IJNA 3IMXA 3D2FA 4CZEA 2YJFA 3GL1A 4H5WA 3O1WA 4H5RA 3VEVA 4Y0WA 1ATSA 5FPDA 2FSKA 5KPRA 1KXPA 2AA4A 3CERA 4CZHA 5AZJA 3A0IX 3AAPA 1GLEG 1J6ZA 3HM8A 3O80A 5E84A 3D2EB 4NB4A 4WQ5C 1HJOA 2GWKA 1DEJA 3FZMA 2P9SB 5EX5A 3VEXA 2FLOA 2FSJA 2FF6A 3DWLA 2P9IB 3BEXA 3WEEA 1RFQA 3UKUA 4BRQA 4BR4A 4BC2A 5EOYA 3L0QA 5B8HA 4BRNA 4XH5A 2FSNA 5AQIA 4DCHA 3SMPA 1BO5O 3AY9A 4BRPA 1KAXA 4EHTA 2E2PA 2HF4A 3LDQA 3VEYA 1HUXA 2I7NA 2GWJA 3O6WA 1Q18A 3H1QA 5FPNA 5ELZA 1YXQA 1HKBA 2PAVA 3H3NO 3IFRA 4FWQA 4IJAA 4PKIA 3A5NC 3VF2A 3WXLA 4FWSA 4FOEA 4QS9A 3VGKA 4GNIA 5AFUA 2P9LA 4CD1A 4JAXA 5TKYA 1BA1A 3RSEA 4MLEA 2YI1A 5AQVA 1BU6O 2P9KA 5I9EB 4H0VB 2BUPA 4BG8A 3EN9A 3H6EA 5F2RA 4CBXA 3LDLA 3D7EO 3BP8A 2V52B 1BDGA 3QMLA 5AQHA 1XQSC 3CJCA 5AQMA 5AQGA 5AQLA 1X3MA 4B1XB 1SZ2A 4WQ5A 5BRFA 2CGJA 2QWOA 3DXMB 3GBTA 4PL7A 1U2VB 4XEIA 4CZIA 1JCFA 4ISGA 1RDWX 2OANA 1LCUA 1NGAA 5LY3A 4C23A 5BN9A 3MMVA 4WQ4A 3ZETB 1QZ5A 3A5MC 4K41A 1T6CA 2E1ZA 5AQSA 4O8KA 4BGAA 2NLXA 3F9MA 3I8BA 4EHUA 3FZLA 3IUCA 4A2BA 3H3OB 4H0XB 4ISFA 1BWFO 2QWRA 3IDHA 5EY4A 2P9UA 3FZFA 2VCPA 4FWMA 4CI6A 3R6MA 5AQKA 4BRAA 2ASOA 2ZGZA 4MLHA 4BVOA 2DPNA 3DAWA 1GLLO 3QBXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZC6A 1RNHA 2F9TA 4A57A 4K8ZA 5C42A 5AQYA 3CQXA 1ZBFA 2YCHA 2FBTA 2BANA 4DMNA 4CGHA 3VQPA 4KBOA 3TWHA 2YV0X 1VQ6N 2W40A 3OY9A 1WSEA 1OH6A 3WNHA 3AARA 4N56A 3J7YP 3F73A 1ZYQA 4AHRA 4FLXA 1VSLA 3OYNA 1NK6A 4IEIA 3O9QA 1BISA 4Z0UA 2A41A 1L3TA 3PO5A 2BDPA 2KZMA 4BRCA 2JWKA 5J1EA 2DTUA 1ATRA 1WNSA 3AVMA 2ZF5O 3THXB 3K2PA 3V1OA 3VTHA 4CJRA 1OH5A 4Z4CA 1OVYA 4CHPA 3RVCA 1N5YA 5JICA 1TYQB 4JD2A 2FXUA 2IVOA 2UXBK 4WE1A 4WFBL 3P4IA 3CCRN 2NRHA 3MWPA 2OZSA 4BACA 1RDUA 1T44A 4OX9K 4B1VA 4FLWA 2AJQA 4KPYA 1NNEA 2J4RA 3TARA 3DLGA 5JVGL 1HRHA 5KPTA 2ZD1A 3PIPL 4EAHD 4IKFA 3B8AX 2FBYA 4KTWA 2QWLA 5GAEP 3CG7A 4FM2A 5EVZA 1QS4A 3SUOA 4CEQA 3CI5A 4ELVA 2OZMA 4WFNL 3VN5A 4LF4K 4DSEA 3M6GA 3ID8A 3AGRA 2WONA 3NE6A 1S22A 4IXCA 1K8KA 4KHSA 4CESA 1UAXA 3BF3A 3FFIA 1RBRA 3DLBA 1XHXA 1Q9XA 4JV5K 3EZWA 2Q0UA 4NYFA 3D45A 5C2DA 1SL2A 1WB9A 3HTVA 3SNNA 2HBLA 3V1QA 3WXIA 2CH5A 3UKUB 2PZSA 3TTCA 2XRIA 2NRVA 4AHSA 2P9SA 3WNFA 4CEEA 2O8DA 3U3GA 1JLFA 4W5NA 4GMJB 2P5GA 3K0SA 4E3SA 4H0TB 1RBSA 3TSUA 4NLCA 1HKCA 3DOLA 4RTFD 4DF4A 4F3OA 3M8QA 4B9UA 3RMAA 3ID6A 1BCOA 5J2QA 5CZ1A 4JKFA 4Q0BA 3OYIA 3AVBA 4CJWA 1S6PA 2GELA 3CCEN 4N76A 4CHQA 2W6LA 1J9AA 3G6EN 4FWOA 3NBPA 4DU4A 4WCEL 3C95A 5K14A 4I9LA 3CJ7A 3E66A 3ZCMA 1BA0A 4QS7A 2O8FB 3EL2A 4CFBA 1WAFA 4MFBA 3KLGA 1P8ZA 3WXMB 3EE9A 1B9DA 4CZKA 1BL3A 3MAQA 3DXMA 4BC5A 2UUCK 4PUOA 1W9HA 2D0PA 1BG3A 3JYTA 3U9DA 4HWIA 3JAMO 4C8MA 1FKPA 4CF1A 3P1GA 5TKWA 1TKXA 3K5MA 1EXQA 4XH1A 2F96A 4LF6K 1E4FT 4FJLA 2JWLA 1HMVA 3LDNA 4JHDB 2HBKA 1QQOA 1HLUA 2V7ZA 3WQTA 4B08A 1KTQA 3CXCM 2HNDA 4K8XA 2GBZA 4CJLA 1T6DA 5DK5A 2GEMA 4IFEA 1QHAA 3QEXA 1BI4A 3AO2A 1N8RO 4C8NA 4DQ8A 1YF5L 3DI6A 1J5EK 3MXJA 3QEWA 1BUPA 1HYZA 3VQAA 3O3HA 2ASPA 3CQYA 1K9MO 4JKBA 4AQYK 4KFBA 4CZMA 1R0AA 3SK3A 5C2FA 3VGLA 1ZBLA 3O08A 1EX4A 4DQSA 4R5PA 2ZWHA 3DMJA 2DFFA 1T03A 4B9SA 1VSJA 3CHWA 3NVKA 3L4IA 3MN7A 3ZT2A 4CF9A 1EKEA 3R3LA 3M5RA 4H03B 4DR7K 3MXMA 4B3MK 3E9LA 5JMVA 1NLVA 2NZTA 4CFAA 3RMBA 1FKOA 4HCCA 3C7NA 5BR8K 3O4WA 3SUPA 4K25A 4C8OA 3LDPA 3O8MA 3WNEA 3DXKA 3Q7BA 3GE1A 2XY7A 4L3QA 3M3ZA 2YHXA 3N4QA 4U7BA 4KHNA 5D3GA 3O1BA 1VSIA 3SQ2A 4E7JA 5HRNA 3I0SA 3MECA 4BRLA 4HCBA 2EX3A 1WAJA 4H0PA 1TAUA 4LY7A 5SWMA 4FJMA 1NG9A 4LFBK 3IRXA 4DHYA 4LH5A 3H46O 1QZ6A 4FJ5A 4IO8A 3KVGA 2YKNA 2WFBA 3T3FA 1W0HA 2O4GA 1P90A 5J2NA 4E0DA 5FRMA 4AHCA 2E20A 4IBNA 4CZEA 2XY8A 4F2RA 4JI6K 1BQNA 1NMNA 1KFDA 2Z1HA 1KXPA 2YHAA 3A0IX 1GLEG 3MWTA 3HSTB 4NB4A 3RR7A 1YITN 4WQ5C 2P51A 3PSFA 3ZT0A 3NCIA 1S6QA 1D8YA 1LW0A 1K8AO 3J81O 4CK3A 2FF6A 3DWLA 4DSFA 1T3VA 2P9IB 3BEXA 3WEEA 1OH7A 4BRQA 4CEAA 4BR4A 5EOYA 1N36K 4XH5A 2YHBA 3SMPA 4CJVA 3AY9A 4EHTA 3LDQA 2HF4A 1HUXA 2I7NA 1Q8IA 1TKZA 5GADP 4Y1CA 4J2AA 1HKBA 4FWQA 3T1HK 4G9ZA 4A59A 4NXMK 3VF2A 3OJSA 4QS9A 5KRSA 4E89A 4Y1DA 3NDKA 1UOCA 3L4QA 4DV4K 1YJWN 1NK9A 1BA1A 2YI1A 2X6SA 1QSYA 2P9KA 5FROA 2NNWA 3H6EA 4M42A 3SUQA 2EHGA 3QIPA 2VQFK 3LDLA 2V52B 1FW6A 1BDGA 3T7ZA 3CD6N 5AQHA 1XQSC 3CJCA 2YNFA 5AQLA 4B1XB 3T69A 4WQ5A 1IBKK 3QETA 5BRFA 2O8BB 4NCBA 3CC4N 3GBTA 3OYBA 1IV0A 2X78A 4N47A 2OANA 1VRUA 3LP1A 4JI5K 1LCUA 1NGAA 4CGJA 3ZETB 4B3OA 1QZ5A 3K58A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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