4OENA

Crystal structure of the second substrate binding domain of a putative amino acid abc transporter from streptococcus pneumoniae canada mdr_19a
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
220
structure length
220
Chain Sequence
KYIIASDSSFAPFVFQNSSNQYTGIDMELIKAIAKDQGFEIEITNPGFDAAISAVQAGQADGIIAGMSVTDARKATFDFSESYYTANTILGVKESSNIASYEDLKGKTVGVKNGTASQTFLTENQSKYGYKIKTFADGSSMYDSLNTGAIDAVMDDEPVLKYSISQGQKLKTPISGTPIGETAFAVKKGANPELIEMFNNGLANLKANGEFQKILDKYLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the second substrate binding domain of a putative amino acid ABC transporter from Streptococcus pneumoniae Canada MDR_19A
rcsb
molecule keywords Second substrate binding domain of putative amino acid ABC t
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule tags Transport protein
total genus 75
structure length 220
sequence length 220
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4oenA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4oenA02
3S4UA 4JWXA 2RCBA 2PVUA 2PT2A 1MM7A 3TTLA 4LZ8A 1IQ7A 3Q28A 3FVOA 4F18A 1DMBA 1NH8A 2DS9A 2ONSA 1J1NA 4K3FA 1MG1A 4KHZE 2OBGA 5I58B 2R71A 1DPPA 2I3VA 4F1VA 4JDFA 3TCHA 1HSJA 1B6HA 1UQWA 2VHAA 4ZZEA 3R7XA 2I0CA 4EQ7A 1TFAA 1AL3A 1ELJA 2R6GE 1LB9A 3PU5A 1WODA 4L17A 3KJTA 3B6QA 4H5FA 4XKPA 4XKRA 5HPQA 1WVJA 4OVJA 3PGFA 4YZZA 2ZMBA 1UTHA 3THIA 2W7YA 1YPNA 5EHMA 4U1OA 2BJJX 3M8UA 3K6WA 1UIVA 2V93A 1H44A 3K01A 1ZMGA 1VFEA 1JW4A 1PBPA 2Q88A 4GRKA 2O84X 4NF6A 5DVJA 5L9SA 4DIGA 4EXKA 2ZYMA 5L8DA 3F11A 1ZIUA 4ND9A 4NMYA 4C1UA 3MZBA 2HAUA 4AB5A 2DWAA 3FASA 4F29A 5CBRA 3QK6A 2I6EA 3RTFB 5AE4A 3S9NC 3EHUA 4RYAA 4Z0IA 3H7MA 3PPNA 2VD2A 3TCGA 4C1TA 4OHNA 4Z7EA 3WAFA 3IB2A 1YAEA 3EHTA 5CMCA 3FJ7A 4QSDA 1MM6A 1I6BA 2Q89A 4O3BA 3RN8A 2XD2A 2H98A 4R74A 4LUBA 4F2OA 2I4BA 1SI0A 3CSGA 4R6YA 3C4MA 1URSA 1P1UA 2ESNA 2H9BA 2QMWA 2A5TA 4X48A 3DLNA 5AA1A 3TQWA 1B05A 3OSQA 1B0HA 3EHSA 3SEUA 1B5JA 1SW1A 3KZGA 4GF8A 5KZTA 3U93A 3U8QA 2RKMA 2WKYA 3TELA 4RPOA 4ELPA 4F3GA 4P0GA 2KLFA 3IJOB 1D9YA 1IXGA 1S7YA 1IUDA 3G3JA 4OETA 5ITOA 4MFIA 3H06B 3TTRA 4KCDA 2A5TB 1DTZA 3ZS6A 4ESWA 3PUWE 2FYIA 1H3DA 3FGSA 5B7DA 2DVCA 3MZ9A 4NEDA 1TWYA 3OO6A 1I6QA 1XS5A 4TLMB 3EQ1A 2I48A 1MDP1 3HPIA 3KJ7A 4ELRA 2PT1A 2XXQA 4QSCA 3T66A 1SBPA 1PDAA 3VV5A 4LONB 1MQDA 5ICQA 4GFRA 1FQBA 2V3UA 1EU8A 4N6PA 4XIGQ 3KSJA 5I2KA 4U23A 2VD3A 1B4ZA 2O1LA 3KFMA 5M2VA 3PPPA 1II5A 3LSLA 4H5GA 4GL0A 1USYE 3H6UA 1QKBA 1B3HA 4BLAA 2OZZA 2B3BA 4QF9A 3HN0A 4JBZA 4R6HA 2DXYA 1US4A 3S9MC 1SYHA 4OFJA 4GVOA 3BBRA 2GHAA 3ZSFA 3O29A 5CBSA 4IO4A 3E4RA 3Q26A 4U4SA 5EYFA 3TTKA 2O69A 3K6VA 1LFIA 3PPQA 1NNTA 4IO2A 1XC1A 2ANJA 3RY3A 1LB8A 1XVYA 3RGYA 4M1VA 3C32A 4ZDMA 5CC2A 3CI8A 2M8CA 5JTYA 4EF1A 5AA2A 1JW5A 1B46A 5CMMA 4TLLB 2Y84A 2G29A 1POY1 4ZEFA 2NUVA 3K4UA 3IR1A 3H3GA 1B5HA 3N94A 2Z22A 1H76A 3DP4A 3O6GA 1IITA 1JVXA 5TU0A 4C0RA 3N5LA 3CVGA 2YPNA 3LSXA 1YTVA 5CRYA 2H99A 4NF5A 2QSXA 3VXBA 2YLNA 1R6ZA 5H8HA 4P0IA 1MXWA 3A09A 4F1UA 4IY5A 4OEUA 1QULA 4OFOA 5ICTA 3V5AA 4BDLA 1Y4CA 1XHYA 2OCUA 1FTLA 3KSXA 4KR5A 1ZKBA 2AIXA 4F19A 5H8FA 3IO4A 3MPLA 2DSFA 3H6VA 3LC8A 1I6AA 4U4XA 2QL3A 4RK2A 3TPAA 3E3KA 4JXIA 4YU0A 4DLDA 5BWJA 1ATGA 1N3WA 4ELQA 2V25A 1GTKA 4LVQA 1VSOA 2GRVA 1FQFA 4NF8A 3O6IA 3LUYA 4QSEA 4OQOA 3SEVA 2RC8A 2QS2A 2B65A 4NWDA 1Q1KA 4BDRA 3TCFA 2Q2AA 4G8HA 4YKJA 2DE4A 5H8QA 4DCXA 2X7QA 3WAEA 3IORA 3PPOA 2XXXA 4IY6A 2F35A 1ZU0A 1ZBMA 4DE8A 3SETA 2UYEA 3K0VA 1B3FA 4IGRA 3M3LA 1B3GA 3G3HA 3FXUA 4F3SA 2O6AA 5I58A 3O97A 3FZVA 3SKPA 3PD8A 1AOVA 4DDDA 3ZKKA 3FJMA 1PB7A 4YB5A 3TEPA 3S9EA 2AL5A 3OENA 3FXRA 3LBSA 3K6XA 3D4GA 1LSTA 4R9FA 1OMPA 3KGCA 3I6VA 3CRBA 4DXBA 3O9PA 4JWYA 1TT1A 1GV8A 1EH3A 2HEUA 4POXA 3MP6A 1JVYA 2RCAA 2Y7WA 2B3FA 3C9HA 4ONYA 4I62A 4EF2A 4GD5A 1MQHA 5K2YA 3RUMA 1JEVA 1WDNA 2HXWA 1NNPA 5KCJB 4R9GA 3T9HB 4R75A 3BKIB 3TTMA 2XXPA 4DZ1A 1HSLA 3K1NA 1B5IA 1JW1A 1Y9UA 3SERA 1SD3A 1LAGE 4G8NA 4X9TA 2DP8A 1QUIA 2DYXA 3MP8A 1LFHA 4KYSA 1UIUA 2DXRA 1DSNA 1B1XA 3SDFA 5I2NB 3CFLA 3OMBA 1P1WA 4IO5A 4MLQA 1MQJA 4ECFA 4Q30B 2DOJA 1B52A 3QYTA 3UORA 4M4GA 3H6WA 1A54A 3TODA 2LAOA 1MXYA 4JSDA 4PETA 2V3TA 1B2HA 1B9JA 2XX7A 1OLCA 2QS3A 3DP8A 4YAHX 3EF7A 3UGWA 4FEBA 3MQ9A 2GFEA 2THIA 4IO3A 2UVIA 3TYHA 1XOCA 4QHQA 3UIFA 2V84A 3KBRA 2PX1A 3MVYA 3MC2A 1A40A 2OJTA 3G7WA 2P1SA 2QMXA 3W9VA 1Y3QA 1MY3A 5H8SA 4G2ZA 1JNFA 3ODBA 2REJA 3T9XB 1FW0A 4R72A 5AA4B 4ZEKA 5K2XA 1GVCA 1CE2A 1NNFA 2X7PA 2VP1A 4X1DA 3RPWA 1QUJA 5L9MA 1MQIA 3VE1B 2F7CA 2XXVA 4GL8A 1FQCA 1M5CA 2Z8FA 3I3VA 3IJXB 4WEPA 4PFUA 3HCQA 1EZPA 4H6DA 1OLAA 2UVGA 3H03A 1GR2A 4RNSA 4HCWA 1LAFE 1ZLQA 3H4ZA 3VVDA 3OO9A 1FTJA 4MH5A 4POWA 1S9TA 3FV1A 4F3BA 3U92A 1O7TA 1P1OA 4RY1A 3SEXA 3HHFA 3KOSA 2OWSA 3FVGA 3C35A 1BIYA 1LGBC 4IB2A 3IOWA 5BUUA 3T93B 4LA9A 1PEBA 4UACA 3W9WA 1DTGA 5J1DA 3MPKA 1D9VA 4HS7A 3UP9A 1FQAA 1KWHA 3PV0E 1BP5A 4GLIA 3N26A 2NWJA 3OOAA 4Q0CA 1FQDA 5LOMA 1FTMA 2XXIA 3OO7A 3MWBA 2RINA 3TZAA 3QUFA 4MF3A 2Y7PA 4DXCA 1FTOA 1NKXA 3PMVA 3ILUB 1MY0A 4WXJA 5HBCA 3CG3A 1Q35A 1NMUA 1N84A 2R9JA 3C31A 4E0XA 4YMBA 5ITPA 2D21A 1LAHE 1QKAA 3O6HA 4O3CA 2CZLA 1NNKA 4IO7A 5DYHA 4ZE9A 4H8JA 4FJPA 1B7HA 3B6TA 1LLSA 2XD3A 4OENA 2ZXTA 3P7IA 1LCTA 4Q5TA 1Y3NA 4LQ2A 5FHMA 4ELOA 2QS1A 3OO8A 1FQEA 3K2DA 2Y7IA 3JV9A 2O51A 5CMBA 1LCFA 3G3FA 4FAJA 2PMSA 3DP6A 3DELB 3T22A 4OYVA 4OWDA 4QFLA 5I57B 1XT8A 1JETA 1AMFA 5I56B 4WEDA 1URDA 2QJEA 4F1YA 3TAJA 4FE8A 2XHDA 3K1MA 3PUZE 4G4PA 1Z7ME 3QXMA 2V3QA 4U1ZA 3RT8A 4UA8A 5DTBA 5EHSA 1Y4TA 4H8IA 3K00A 1VR5A 4N07A 4KFQA 2A5SA 5A5XB 1JQFA 4F2QA 5DVIA 5FTIA 3OEMA 4RPNA 4OMBA 3KN3A 4FATA 4EQBA 5I59B 3PMXA 5TP9B 2HAVA 4AB6A 3GBBA 3BFTA 2O1MA 1LFGA 1ANFA 4YKPA 1MXUA 3S2VA 1YCJA 3EN3A 4R73A 2NOOA 2ABHA 1MXXA 5KDTB 3TMGA 3BFUA 4LZ5A 4RXLA 3VDFA 3V83A 3TUSA 3PPRA 4E0WA 2F6PA 1GGGA 1OQGA 1MRPA 3KOTA 1MH4A 3IK6B 5AA3A 2DWHA 1VE4A 2DE2A 2F6GA 4FORA 4XTCQ 4G8MA 1SDXA 3R6UA 3RNNA 4P11A 1B4HA 1B0LA 1NFTA 3GZGA 3HV1A 4GOTA 4F31B 5H8NB 1IXCA 2Y7KA 3Q27A 2O68A 5ELVA 5IAIA 3RT6B 1SVXB 3MBPA 3OXNA 1N0TA 1UTBB 4N13A 1B7UA 4HCYA 5TPAB 5IKBA 3QUJA 2Y7RA 4FEDA 3N6UA 4QFNA 3W15C 3ONMA 4PP0A 2XXUA 3AXFA 4JSOA 4MLVA 2DWJA 1A8FA 5FHNA 4G68B 3M3KA 4I9DA 4YKIA 2REGA 3A3UA 4EQ9A 3E13X 4WKMA 2P0SA 1USYH 4MBPA 2CMOA 4NF4B 2O7IA 4F22A 5KCJA 3TFLA 1CB6A 1LBCA 2NVUB 3OEKA 3Q25A 3LSFB 3LSWA 2YJPA 3PUYE 3VLVA 1QW0A 4G77A 1MPDA 3EPEA 4EXLA 1HSEA 1Y1MA 5DEXB 2DWIA 4GXSB 1SW5A 2HCAA 3MW0A 5ISUA 3QIMA 5DVFA 5I2NA 1B3LA 2ZYKA 4XKQA 3CG1A 2ZNUA 3MVWA 4RK9A 3GXAA 4KD5A 1EZOA 1QUKA 2XXTA 3SEYA 4EUOA 3IX1A 2Z23A 3PUXE 1M5FA 2RF1A 2H25A 4YICA 3KEIA 3CR9A 2OK2A 4PFYA 5HM4B 1POTA 1IXHA 1TFDA 4ZZAA 2PBWA 1MXVA 5F1QA 4X1BA 1B3EA 2UVHA 4BDNA 3K1PA 1QVSA 2ALUA 4F39A 1LAXA 1B7ZA 2IA4A 1JEUA 4ZS9A 2HFBA 3UK4A 5AA4A 3VLWA 4ZEIA 4PFTA 4LATA 4IGTA 3ZKLA 1MQGA 4YKKA 2Z8EA 3MVXA 1T0KA 1R9QA 1IXIA 4OERA 1MXZA 2VGQA 3VFJA 1EZ9A 2XXHA 4NWCA 4QRZA 2XXRA 3VVEA 4ZEDA 3DM0A 4XKNA 3L6HA 2FNCA 4PFWA 1US5A 4JB7A 2I3WA 3KG2A 5JEIA 1L5TA 2GH9A 3PD9A 1Y1ZA 1UTHB 3CFXA 1DPEA 1P1NA 4GIZA 3C33A 2XXYA 1FTKA 3IOUA 5AA2D 4GQOA 4XXUA 1Z7NE 2F34A 3T9UA 1MPCA 3FIRA 4NF6B 3MUQA 3V8XB 5CMKA 2GHBA 1A8EA 4KYEA 4KPTA 1DOTA 4DCYA 4GXAA 5CI5A 4LQ5A 1P99A 4U22A 2HQ0A 4OTEA 1N76A 3G3IA 4OXVA 3Q29A 3JYRA 3VXCA 1MPBA 3B6WA 3IL1B 2H4IA 4QFPA 4R6KA 2RC9A 3KN8A 3MJNA 1A55A 4R2FA 2D5WA 4KI0E 3E9XA 3QSLA 4LP2B 4JWOA 4THIA 2UVJA 3CFZA 2Q9TA 1RYOA 1MY4A 3G3GA 4OESA 3MZ1A 4YB6A 1URGA 3IB1A 3N6TA 3FD3A 5I84A 4G68C 3O66A 3GBAA 3HSTA 1FCKA 1QJMA 2UXAA 1SI1A 3VLUA 2ZNTA 3K6UA 3ILTB 2F78A 4H1XA 4RJZA 3U72A 1B58A 2HZLA 3IOTA 4PE5B 2ZYOA 2ZNSA 5F7VA 2G93A 2QS4A 1D3KA 3TTNA 1H45A 1M5DA 3OSRA 1B51A 1P1QA 4F3PA 1O64A 3D4CA 1A99A 2F5XA 2QPQA 3MP1A 4QFKA 3C36A 2ONRA 3MVZA 4KCCA 3H6TA 3VVFA 2Q2CA 5I57A 3SESA 3V89B 3TKDA 3IOVA 3IAZA 1R1NA 5I56A 3USDA 3TQLA 2AYSA 3I5OA 3R26A 4NE4A 1H43A 4ZECA 1IZ1A 2XX9A 1MY2A 1PC3A 1R9LA 2D3IA 4OEVA 3FV2A 2X26A 3CSBA 2RC7A 4ZEBA 4KYDA 2NXOA 2E1SA 3A3CA 4H65A 2F8DA 4YB7A 1MH3A 5A5XA 1N3XA 3PMWA 4QFOA 5I2KB 1IIWA 2E0SA 3B7DA 4GWOA 4IO6A 1B32A 4H0WA 1RYXA 5I59A 4HTGA 5TP9A 3LR1A 3MAMA 2XXWA 4BDOA 1PBQA 5JK4A 1Y20A 4FIMA 3JZJA 1SW2A 4U21A 4OZ9A 4TOZA 2HZKA 1M5EA 3HHGA 2F7BA 5B70A 1ZJLA 1F9BA 1I69A 3RTWB 5KDTA 4Q8RA 1OQHA 3FVNA 2Z8DA 2FA7A 3K02A 4ZE8A 3FUZA 2DQVA 4DXUA 3L6GA 4AQ4A 2F97A 2H5YA 1XVXA 2VOZA 3KN7A 2AL4A 1TXFA 2I49A 1NL5A 1AH5A 3UA8A 2O7UA 1BKAA 2I0BA 1Y3PA 4O3AA 1BTJA 4ISUA 4KQPA 1SQYA 5JTYB 1PB9A 1SW4A 5AA2B 5H8NA 3S9LC 4PQJA 1M5BA 3ECRA 1B1HA 4BDMA 1ZTYA 2ZYNA 1OVBA 3U1OA 3FJGA 2IEEA 3G3KA 4I8CA 1PB8A 4BDQA 1UTBA 2DE3A 2QRYA 1VFDA 1OIBA 2F36A 1S50A 3T9VA 1N7WA 5TPAA 5FHOA 1BLFA 3C34A 1NH7A 3CIJA 3FATA 4TQUQ 2F7AA 4NF5B 3O28A 2OLBA 4YMAA 1D4NA 5L9OA 4U2RA 3HO7A 3OELA 2DVZA 5H8HB 3M3FA 3SEWA 4H67A 2UYFA 4R2BA 3RLFE 4OFLA 1IEJA 2XX8A 3O2AA 3FXQA 5H8FB 3TDJA 4G68A 1B40A 1O63A 2I4CA 4RA1A 4NF4A 2Q8JA 1N04A 1OVTA 1RKMA 3GLBA 4ESXA 1LBBA 3IB0A 1MDQA 5CM6A 4FECA 3U94A 1A7LA 5FTHA 3RQTA 5DEXA 4EDPA 3QAXA 4NF8B 4I1DA 3FVKA 4NTLA 2PYYA 1MY1A 4HW8A 3T96B 2P2AA 4LZ7A 3PUVE 2I58A 3IO6A 2OWTA 3UN6A 1AIVA 5H8QB 5DT6A 2ONKE 3OD7A 1SYIA 1N7XA 1MS7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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2H9BA 2QMWA 2A5TA 1FTAA 3IFAA 4X48A 3DLNA 4JVIA 5AA1A 5EYHA 3TQWA 1B05A 3OSQA 1B0HA 3EHSA 3SEUA 1B5JA 1SW1A 3KZGA 4GF8A 5KZTA 2WBBA 3U93A 3U8QA 2RKMA 2WKYA 3TELA 4RPOA 4ELPA 4F3GA 2WEFA 4P0GA 4GWUA 3ROJA 2KLFA 3IJOB 1D9YA 1IXGA 1S7YA 1IUDA 3FBPA 3G3JA 4OETA 5ITOA 4MFIA 3H06B 3TTRA 4KCDA 2A5TB 4N15A 1DTZA 3ZS6A 4ESWA 3PUWE 2FYIA 1H3DA 3FGSA 5B7DA 2DVCA 3MZ9A 4NEDA 1TWYA 3OO6A 1I6QA 1XS5A 4TLMB 3EQ1A 2I48A 4HE2A 1MDP1 3HPIA 3KJ7A 4ELRA 5EQAA 2PT1A 2XXQA 4MJOA 4QSCA 5T3JA 3T66A 1SBPA 1PDAA 3VV5A 4LONB 1MQDA 5ICQA 4PDHA 4GFRA 1FQBA 2V3UA 1EU8A 4N6PA 4XIGQ 3KSJA 5I2KA 4U23A 2VD3A 1B4ZA 2O1LA 3KFMA 5M2VA 4PAFA 3PPPA 1II5A 3LSLA 4H5GA 1LBZA 4GL0A 1USYE 3H6UA 1QKBA 1B3HA 4QXDA 4BLAA 2OZZA 2B3BA 4QF9A 3HN0A 3LUZA 2CEYA 4JBZA 4R6HA 2DXYA 2QFLA 1US4A 3S9MC 1SYHA 4OFJA 4GVOA 3BBRA 2GHAA 3ZSFA 3O29A 5CBSA 4IO4A 3E4RA 3Q26A 4U4SA 5EYFA 1QGXA 3TTKA 4H45A 2O69A 3K6VA 3SZPA 5IZZA 3E78A 1LFIA 3PPQA 5IM2A 1NNTA 4IO2A 4OA4A 1XC1A 2ANJA 3RY3A 1LB8A 1XVYA 3RGYA 4M1VA 3C32A 4ZDMA 5CC2A 3NOHA 3CI8A 2M8CA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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