4OFLA

Crystal structure of ynta from yersinia pestis in complex with ni(l-his)2
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
HTLQLAIGDEPTEGFDPMLGWSHGSYLLLHSPLLKQNEDFSWDSLLLSQYQPSDDGKTWLLTLKPDLKFSDGSPLTAKDVAFTYNNAAASGGKVDMGNFLSAEVIDPLNVRIHLKAPQSTFVNVLGSLGIVSADKYNAKTYAQKPIGAGPYRLVSFQPGQQMIVEANPYYAGNKNDFDKLIFVFLDEDSAFAAAQSGQLGVVRIPPSMAVGSVNNMKLWVRPSVENRGIVFPTTPAGKKDAHGYPIGNDVTADVAIRRAINYAINRQLLADQIMEGHAIPAYTGVQGLPWNNPDSAIKDGDIDKAKQILEQAGWQLNSQGTREKNGLPAKITLWYTSGDTTRRDLAQALRSMLKPIGIDVDLKSGSWETVERNMHANPTLFGWGSLDPMELYHHYSSNAAGVEYYNPGYYKNPMVDKHLQQALDAPTWQQAVPFWQQVDWDGTTGAGIRGDAAWAWLLNIQHTYLANNCVDLGKGTPEIHGSWSLLNSIDSWKWTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Extracytoplasmic Nickel-Binding Protein YpYntA
publication title Promiscuous nickel import in human pathogens: structure, thermodynamics, and evolution of extracytoplasmic nickel-binding proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia pestis
molecule tags Transport protein
total genus 144
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 4oflA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4oflA01
5FTHA 2UVHA 1BLFA 4KYSA 2ZNSA 3TTMA 4OERA 3CR9A 4OTEA 5LOMA 3H06B 3V83A 4BDMA 4ZS9A 1LCFA 5CMBA 2QPQA 2X7QA 1MG1A 5JEIA 1UTHA 2O1LA 3MUQA 3O6IA 3KJ7A 3A09A 1WODA 1ZJLA 4JB7A 1MY2A 2XXIA 3LBSA 3N6UA 2F5XA 3DP6A 1JEUA 3OO9A 1Z7NE 4ECFA 2XXUA 2F7AA 4IO2A 1PEBA 5I2KA 2RINA 4OENA 1SI1A 5CI5A 3PGFA 4FORA 3IJXB 4JSDA 3ILTB 3TPAA 1Y3NA 4R74A 5ELVA 4I8CA 4U22A 2DWAA 5DEXA 5HM4B 2CZLA 2I4BA 3K1MA 4RNSA 2OCUA 1R9QA 3TTKA 4NF8A 2F6GA 3FTOA 3OEKA 3SKPA 1POY1 2NVUB 4NF6B 4IB2A 1H3DA 4R6KA 3LR1A 4JWYA 4RYAA 4KCDA 1LB8A 1J1NA 1PC3A 4TLMB 4RA1A 4QFOA 1UTBA 2I6EA 2ONKE 3V5AA 5DTBA 3K2DA 3SEXA 4IO4A 3OENA 1M5DA 5KDTA 2Q8JA 4Q5TA 4MBPA 4R9GA 5CMKA 1SW2A 3ZSFA 2ZYOA 2DYXA 4YAHX 3ECRA 4F1UA 2B3BA 5A5XB 3UGWA 1QJMA 5DYHA 4OESA 4F2QA 3RTWB 4R75A 1M5BA 1LAFE 3OSQA 3I3VA 3DM0A 3SEYA 5AA2D 3M3KA 4H8JA 1MXYA 2AYSA 5H8FA 3RY3A 3FXUA 1ZLQA 1MDQA 4GD5A 3S2VA 3LC8A 1P99A 2LAOA 2V3UA 4OETA 4PFUA 2AL4A 4RY1A 3FASA 3D4CA 4ELPA 3K4UA 4I62A 2ZYMA 5AA1A 2ONSA 3FJGA 5I56B 4POWA 4N6PA 1MY4A 4O3AA 2F7CA 4OQOA 3TODA 2ZMBA 1YPNA 1PDAA 5AA3A 3B6TA 3TUSA 3PU5A 2OZZA 2UXAA 4JWXA 1TXFA 3CHGA 2NOOA 3FV1A 2VGQA 3K1NA 2DVCA 3Q27A 5A5XA 4NWCA 3C36A 1R9LA 4R6HA 3VVEA 4H1XA 2Q2CA 4ND9A 3TYHA 4K3FA 3DRGA 1B3FA 5CM6A 4U2RA 2E1SA 4DZ1A 2V3TA 4QFNA 5TU0A 2F8DA 4LUBA 3RNNA 1ATGA 1MXXA 2O69A 3E3KA 3CG3A 3E4RA 3OO6A 4GWOA 1QKBA 4ZE9A 4TLLB 1YCJA 2PVUA 2O1MA 3K0VA 4F3SA 1B4HA 4GXSB 4IO3A 1PB8A 5I57B 3Q25A 4YB7A 3CI8A 3LSXA 4KR5A 1USYH 4OVJA 1ZBMA 4IO7A 3KOTA 2NUVA 3IK6B 4ZEIA 2Y7RA 1OMPA 1EU8A 1YTVA 1MXVA 3CFXA 2OBGA 2ALUA 1MQGA 1MXZA 1P1QA 4F3GA 1SW1A 5HBCA 2YJPA 5CMCA 3FVOA 1NMUA 1B40A 3RQTA 1B7UA 2GHAA 3IB0A 3FVGA 1AIVA 4MLQA 5EYFA 4YMAA 1UIVA 3OO8A 2ZYNA 3FVNA 3BBRA 5TPAB 5KCJA 3DP8A 3JV9A 5IKBA 4PQJA 2OLBA 2F35A 1LAXA 2FNCA 4HW8A 5DT6A 3RGYA 4HS7A 3OXNA 2XXRA 4C1UA 2DE2A 1MY1A 3IOWA 4WXJA 1JETA 5I2NB 3KSXA 2PT1A 1XVYA 3KFMA 3QIMA 1B9JA 2XX8A 3UA8A 1A99A 3H6WA 3PPOA 5KZTA 1LCTA 4R6YA 2R6GE 1UQWA 4KHZE 5I57A 2WOLA 4IGRA 4ONYA 1VFDA 3MJNA 1B2HA 1H76A 4R9FA 4DXBA 1Y3QA 3TFLA 3H6VA 5ISUA 2ANJA 3ONMA 3W15C 3T9UA 1NH8A 3PV0E 3ILUB 1EH3A 3PPQA 3TCGA 2H5YA 4MF3A 4EF1A 4JDFA 4GIZA 4QF9A 4HCYA 5ITPA 5F1QA 3PMVA 4G8HA 4F22A 5AA4B 4F1YA 5TPAA 1MH4A 3IB2A 3MZBA 2HXWA 3LSFB 3O28A 2G93A 1BTJA 2ZNUA 4U21A 3IO6A 4MFIA 1KWHA 4ELQA 2F7BA 3G7WA 4G77A 3TQLA 3TCHA 1NFTA 2I0BA 1B5IA 5I2NA 4OMBA 4BDNA 1TFDA 3GXAA 1MPDA 3CRBA 3VVDA 4OFOA 4OZ9A 1QUIA 3O6PA 3C9HA 5H8HA 4OYVA 1JVYA 3MZ1A 4H5FA 1FTJA 3R26A 2FA7A 4FE8A 1S50A 1IQ7A 4U1OA 1VR5A 4NF5B 5B70A 3SESA 3QXMA 5EHSA 4BDQA 1FQFA 2REJA 1B52A 1AOVA 4F3BA 2R9JA 1PB9A 4GOTA 1B46A 4YMBA 3FJMA 3HO7A 1DSNA 1QUKA 3FUZA 3GZGA 2OJTA 4EDPA 4LZ5A 3T93B 3IOTA 2B65A 3TQWA 4QFPA 3H03A 1OLAA 2VP1A 3S9MC 1FQCA 4RK2A 2E0SA 1B4ZA 2PT2A 4NWDA 1Y4CA 1PBQA 1RKMA 1MQDA 5AA4A 2I3WA 4FEDA 5AA2B 3KEIA 4H67A 1I6QA 3TTNA 3MZ9A 3O2AA 1MPBA 1ZTYA 4GVOA 3S9LC 4PFTA 4ZE8A 1VSOA 4LVQA 3TAJA 1DPEA 4IGTA 3HN0A 1DOTA 3O9PA 1A40A 4EUOA 1MXUA 4XXUA 3WAFA 3W9WA 3K6VA 2H99A 3VDFA 4R2BA 1P1WA 4F3PA 3A3UA 5EHMA 3TTRA 1FQAA 2XXYA 1SW5A 1N3WA 2V25A 1LB9A 1XC1A 3KGCA 2DXRA 4C1TA 3L6GA 4LQ5A 2Q89A 4NF5A 1B3EA 4EQ9A 1XT8A 4U1ZA 4ESWA 4PETA 1FTKA 1P1NA 5BUUA 4YKIA 2NWJA 1O7TA 3E13X 3MVYA 4KPTA 1XHYA 3LSWA 1Q35A 3IR1A 2HAUA 1B3HA 1URSA 2ABHA 1D9YA 2I3VA 1FTMA 3CVGA 2RC8A 2PX1A 3VLVA 2I49A 1B0LA 2IA4A 2F34A 2HZLA 3MWBA 3C31A 3VFJA 3KZGA 1P1UA 3LSLA 4F31B 4GL8A 4UA8A 4NF4B 4UACA 3T66A 1IXHA 3MBPA 1IXCA 3IAZA 2AIXA 3FXRA 4O3BA 3BFTA 5L9SA 5DVIA 3LUYA 4NE4A 2QSXA 2UYFA 3MVWA 3FJ7A 2A5TB 4G2ZA 4RK9A 4Q0CA 5H8QB 3EN3A 3OO7A 2HAVA 2HFBA 3S4UA 4ZEBA 1WDNA 2DSFA 3QUFA 3V8XB 3EHTA 3K02A 3U72A 4F39A 3B7DA 3OELA 1M5FA 5CMMA 1B6HA 1P1OA 3SEWA 4AB5A 3DLNA 3EPEA 4P0GA 2H98A 4JXIA 1IZ1A 3TEPA 1GR2A 4GQOA 4X1DA 3O29A 4DIGA 1SVXB 2HQ0A 1D4NA 1FTLA 4NF6A 4OXVA 5DVJA 5K2YA 4RJZA 1OVTA 1H44A 4DXUA 1FW0A 3K6WA 2DWHA 4WKMA 2Y7KA 5FTIA 4DLDA 1GV8A 2THIA 3T22A 2V93A 5ICTA 4H6DA 4OEUA 4NMYA 3M8UA 4LQ2A 4JWOA 5AE4A 1JW1A 1URDA 4XKPA 1N3XA 4THIA 4Q8RA 1M5CA 1B1XA 1BIYA 5B7DA 1N7XA 2A5TA 1UIUA 2P2AA 4X1BA 3UORA 2BJJX 3PD8A 4NEDA 3IORA 3TMGA 1QW0A 1HSLA 4GRKA 2Z8EA 3K1PA 1MY0A 3DRJA 4R2FA 1JQFA 4TQUQ 2XX9A 1R1NA 4G8MA 1JNFA 4EF2A 1NNPA 5H8SA 2DP8A 3EHUA 4I1DA 1H45A 4Z7EA 2O68A 1OLCA 3G3IA 1EZPA 2V3QA 4KYEA 1II5A 3IX1A 2X7PA 5I56A 1IITA 3O97A 3CIJA 3VVFA 3MP8A 4BDRA 2OWTA 1QUJA 4H8IA 2DWJA 1QVSA 2XHDA 3PMWA 3KSJA 3TDJA 1L5TA 3U92A 2H25A 3L6HA 3DRFA 2XD2A 1T0KA 1IUDA 3U93A 2REGA 2A5SA 5FHOA 2Y84A 3H3GA 1AMFA 3G3FA 4ISUA 1B32A 3K01A 3KG2A 4AQ4A 2Q2AA 1URGA 3V89B 2KLFA 1FQEA 3I5OA 1XOCA 3VXCA 3GLBA 3THIA 4M4GA 1HSEA 3A3CA 1FQDA 4MLVA 5IAIA 4HCWA 4X48A 2CMOA 2HCAA 3RT8A 4LP2B 4IY6A 1LFGA 2D21A 1D3KA 3BKIB 5M2VA 3UN6A 4XKRA 2O7IA 3D4GA 2PMSA 3N26A 1HSJA 3SDFA 2R71A 1SQYA 4JSOA 1B1HA 2I58A 3PUVE 3IL1B 1MXWA 4LONB 4QSCA 4R72A 4YU0A 3G3HA 1BKAA 1I69A 3MQ9A 2ZXTA 4ZZAA 1MM6A 1LAGE 3FVKA 3TZAA 5BWJA 3PUYE 2DQVA 3PPPA 4GFRA 3SERA 4QHQA 3IOUA 3N6TA 2O84X 2DE4A 4WEDA 3RLFE 1B5JA 4YB6A 4R73A 2VHAA 2D3IA 2X26A 2UVIA 2I0CA 2GH9A 2DWIA 1OVBA 3OEMA 2QS2A 4M1VA 1SDXA 2Z22A 1VFEA 4OWDA 1US5A 3C35A 3JYRA 4GLIA 4XTCQ 4LZ8A 2H4IA 3MVZA 4F29A 1LGBC 3IB1A 3M3FA 5I58B 3PPNA 1O63A 3TCFA 2OWSA 3UP9A 1NNKA 5F7VA 1I6AA 3FATA 3T9HB 3RPWA 3K6XA 1Y4TA 4HTGA 2Y7WA 1UTHB 5I59B 4OHNA 3JZJA 3CFZA 1TWYA 5I84A 2DS9A 2DVZA 3VXBA 3RTFB 3KN8A 3PPRA 4EQBA 4H0WA 5JTYB 2O6AA 4F18A 4RPNA 2UVJA 4GXAA 1S9TA 3GBAA 3TTLA 2UVGA 3H4ZA 1MY3A 4N13A 4XIGQ 4BDLA 5DEXB 3QAXA 4YKJA 5H8NB 3H7MA 2O7UA 1IXIA 1TFAA 1ZMGA 2YLNA 4KQPA 5FHNA 2O51A 5JK4A 5L8DA 2Q9TA 1JW5A 3CSBA 4N07A 3S9NC 1B7HA 3B6QA 1SD3A 4QSDA 4KD5A 3IO4A 2QRYA 1OQHA 4H5GA 1Y1ZA 3HCQA 1WVJA 5I58A 3DP4A 1UTBB 2PYYA 5L9MA 1A7LA 3S9EA 2F36A 4TOZA 2RC9A 5KDTB 3HHFA 4G68B 1TT1A 3UK4A 5I59A 2F97A 1IEJA 2P1SA 3HSTA 2ESNA 3KJTA 3C4MA 2RKMA 3AXFA 5JTYA 3RYBA 4ZDMA 3ZKLA 3SEUA 3CFLA 1D9VA 1S7YA 3IJOB 4GF8A 1BP5A 4F19A 1Y20A 5H8FB 3VV5A 3HPIA 1B58A 1LFHA 5H8NA 3FV2A 4O3CA 1B0HA 1PB7A 3H6TA 5AA2A 3W9VA 1GGGA 2Z8FA 3QUJA 1LLSA 1YAEA 2G29A 1LAHE 1N84A 2ONRA 4U23A 1QULA 5J1DA 3OOAA 3HV1A 3PMXA 2GRVA 4LATA 2PBWA 3SETA 1OQGA 2NXOA 2HZKA 4BDOA 3QYTA 4XKQA 1B5HA 4EQ7A 4AB6A 2UYEA 1JEVA 4G68A 1B3GA 4FJPA 3E9XA 3FGSA 3ODBA 2XX7A 3R6UA 3ZS6A 2QMXA 3R7XA 3H6UA 3B6WA 3PUXE 3PD9A 3O6HA 3T9XB 2XXPA 4FEBA 2YPNA 1US4A 2VD3A 1Z7ME 3KBRA 2VOZA 4FATA 2XXWA 1MS7A 1Q1KA 4P0IA 3T9VA 3IOVA 3UIFA 2H9BA 1B7ZA 1NH7A 3C34A 3EQ1A 1MM7A 4PFWA 3MC2A 4NF4A 3EF7A 3O66A 2D5WA 3M3LA 3T96B 3FZVA 5CBSA 1R6ZA 3K6UA 2P0SA 2I4CA 1OIBA 3MP6A 1ANFA 1NKXA 4KCCA 1MH3A 5DVFA 4ESXA 1CE2A 1MDP1 1USYE 2RF1A 3Q28A 2Q88A 1O64A 4POXA 3TKDA 1MRPA 5H8QA 4RPOA 4EXLA 2W7YA 5TP9B 4PFYA 1ZU0A 2AL5A 3CSGA 3PAMA 2Z23A 2WOPA 3C33A 1AH5A 2QS4A 4U4SA 4KFQA 4X9TA 2RC7A 5L9OA 2XXTA 1AL3A 5KCJB 3U8QA 3VLWA 4ZEDA 4IO6A 2ZYKA 5CC2A 1LFIA 1LBCA 4ZEFA 1Y1MA 3USDA 4YICA 1XVXA 4G4PA 2F78A 3MP1A 4EXKA 3K00A 4YB5A 4OFJA 3QSLA 5HPQA 1DTZA 3LVUA 1SW4A 3N94A 1DTGA 4ZZEA 4KYDA 1FQBA 2GFEA 4QRZA 1ZKBA 1M5EA 4XKNA 2XXQA 3OSRA 1PBPA 2QMWA 1CB6A 4WEPA 3DRIA 1SYIA 5ITOA 1F9BA 4ELOA 3BFUA 2VD2A 1SBPA 2GHBA 1GVCA 1LSTA 3OMBA 1JW4A 5TP9A 3FD3A 1ZIUA 2Y7PA 4QSEA 3G3GA 3MVXA 3Q26A 4BLAA 3KN7A 1RYXA 4LZ7A 1JVXA 3DRKA 4GL0A 1IIWA 2XXHA 3DELB 4RXLA 1NNTA 3RUMA 1Y3PA 4NTLA 3C32A 1RYOA 4QFKA 2F6PA 2XD3A 4ZECA 4P11A 1I6BA 2V84A 4IO5A 3Q29A 5CBRA 2B4LA 3U1OA 1MQJA 1POTA 3G3JA 4H65A 4DXCA 1ELJA 2RCBA 4OFLA 3MW0A 1MPCA 3O6GA 4C0RA 1N76A 3RT6B 5H8HB 4PE5B 2FYIA 3KN3A 1IXGA 1SI0A 3KOSA 2QJEA 4MH5A 4E0WA 3VLUA 2QS3A 2QL3A 4F1VA 2HEUA 5ICQA 1EZ9A 1MQIA 2XXVA 4L17A 4F2OA 3MPKA 4QFLA 3QK6A 3I6VA 3DRHA 4Z0IA 2XXXA 1FCKA 5CRYA 4ELRA 1A54A 3TELA 2Z8DA 1LBBA 3OD7A 4FAJA 3FXQA 3P7IA 3ZKKA 3PUWE 1A55A 1Y9UA 1A8EA 2WKYA 1H43A 2I48A 4U4XA 1B3LA 1FTOA 2B3FA 2QS1A 5K2XA 1MQHA 2DE3A 4JBZA 4DDDA 4IY5A 1SYHA 2IEEA 2Y7IA 1N04A 3CG1A 3PUZE 4G8NA 3N5LA 4DCXA 3MPLA 4DE8A 1N0TA 1NNFA 3SEVA 3U94A 1XS5A 2DXYA 5FHMA 2OK2A 4DCYA 3RN8A 3F11A 2RCAA 4ZEKA 3VE1B 4G68C 3G3KA 1N7WA 5I2KB 3GBBA 4E0XA 3FIRA 3RYAA 1EZOA 1B05A 1B51A 2ZNTA 1GTKA 1DPPA 4FIMA 4I9DA 4KI0E 1QKAA 2WOKA 3HHGA 3WAEA 2M8CA 4OEVA 1VE4A 4NF8B 4LA9A 2B4MA 4YKPA 4YZZA 3EHSA 4YKKA 1A8FA 3MAMA 1DMBA 2DOJA 4PP0A 4FECA 1NL5A 4Q30B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QVRA 5FTHA 2UVHA 1BLFA 4KYSA 2OWZA 2ZNSA 2P3NA 3TTMA 4OERA 3CR9A 4OTEA 5LOMA 5ESYA 3H06B 3V83A 4BDMA 4PBQA 1LCFA 4ZS9A 5CMBA 2QPQA 2X7QA 1MG1A 2CEXA 5JEIA 1UTHA 2O1LA 3MUQA 3O6IA 3KJ7A 3A09A 1WODA 4NF0A 1ZJLA 4JB7A 4PDHA 1MY2A 2XXIA 3LBSA 3N6UA 2F5XA 3DP6A 1JEUA 1NV2A 3OO9A 1Z7NE 4ECFA 2XXUA 2F7AA 4IO2A 1PEBA 5I2KA 2RINA 4OENA 1SI1A 5CI5A 3PGFA 4FORA 3IJXB 4JSDA 3ILTB 3TPAA 1Y3NA 4R74A 5ELVA 4I8CA 4U22A 2DWAA 5DEXA 5HM4B 2CZLA 2I4BA 3K1MA 4RNSA 2OCUA 1R9QA 3TTKA 1LBWA 2WYPA 4NGUA 4NF8A 2F6GA 3FTOA 1EYIA 3OEKA 3SKPA 1POY1 2NVUB 4NF6B 4IB2A 1H3DA 4R6KA 3LR1A 4JWYA 4RYAA 4KCDA 1LB8A 1J1NA 4PBHA 4HE2A 1PC3A 4TLMB 4RA1A 4QFOA 1UTBA 2I6EA 2ONKE 4PFIA 1FPIA 3V5AA 5DTBA 3K2DA 2ZZWA 3SEXA 4IO4A 3OENA 1M5DA 5KDTA 1VDWA 2Q8JA 4Q5TA 4MBPA 4R9GA 5CMKA 1FPBA 1SW2A 2CZIA 2VPNA 3ZSFA 2ZYOA 2DYXA 4O94A 4YAHX 3ECRA 4F1UA 2B3BA 5A5XB 3UGWA 1QJMA 1KZ8A 5DYHA 4OESA 4F2QA 3RTWB 4R75A 1M5BA 1LAFE 3OSQA 3I3VA 3DM0A 3SEYA 2XA5A 5AA2D 3M3KA 4H8JA 1MXYA 2AYSA 5H8FA 3RY3A 4P8BA 3FXUA 1LBYA 1ZLQA 4PTKA 2WBBA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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