4OGIA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with the inhibitor bi-2536
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Dual kinase-bromodomain inhibitors for rationally designed polypharmacology.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 44
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ogiA01
3TLPA 4J0SA 4QYLA 5FFWA 5E9VA 4ALHA 5LVRA 4NS5A 5EPBA 4IR3A 5BT4A 5LKZA 3P1FA 4QZSA 5E73A 5FE4A 3HMEA 4HBYA 4TZ8A 4NYXA 4OGJA 5KTXA 4RVRA 5FG4A 3UVDA 4UIUA 5EGUA 4MENA 3U5JA 3U5NA 5FB0A 5HRVA 4YYIA 5CUGA 5C89A 1N72A 4YABA 5CQ6A 5IGLA 4TZ2A 4LZ2A 5FE3A 2YYNA 5LJ2A 3JVLA 5D3TA 5EWDA 5L8TA 4QEWA 5A5NA 4YYNA 5DLXA 4J0RA 5EPSA 5DYCA 5CZGA 3AADA 4O70A 2G4AA 4NQMA 4MEOA 4TT6A 2R10A 4QUTA 5DX4A 3HMHA 5D3NA 5E3DA 2YDWA 4J1PA 4NRAA 3K2JA 2R0YA 2KTBB 4O72A 2YQDA 3JVKA 5F63A 1WUGA 4GPJA 4QSXA 4DONA 2F6NA 4NYWA 5H1TA 5CFWA 4A9EA 4LYIA 5DW1A 5HCLA 5LKUA 4UIYA 5AD2A 3Q2EA 4YBMA 2RNWA 4O74A 3D7CA 3UVXA 5EK9A 4A9IA 4TTEA 5DKCA 5LJ1A 5KTUA 4LZSA 4TT4A 4NRCA 2OO1A 2YELA 4NQNA 3U5PA 4LDFA 4LC2A 2WP1A 5DBMA 5CQ7A 4YY4A 3NXBA 5EVAA 3JVJA 5F1HA 5IGNA 2R0VA 4HXMA 4HXOA 1X0JA 3S91A 4A9MA 4HXPA 5D3JA 5C8GA 5HEMA 5CQTA 5KTWA 4O7FA 4QR4A 5FE5A 4CURA 4A9FA 5CQ4A 5L8UA 4PS5A 5IGKA 4LZRA 2DVRA 5DFBA 5EWWA 5KHMA 4BHWA 4PCEA 2RO1A 4HBWA 4BW3A 3LJWA 5E9MA 3UVYA 5I86A 5FG5A 5IIDA 4IR5A 3RCWA 4NR9A 2L84A 3QZSA 5FFVA 4O7EA 5FH7A 4IOQA 3MB3A 3MXFA 5FE7A 4CUUA 4MEQA 5D25A 4QR5A 5D3SA 3I3JA 3S92A 4UIXA 4C66A 5DY7A 4NUDA 3QZTA 4QEVA 4NR5A 3QZVA 4UYFB 5EP7A 5F36A 4QNSA 5CP5A 5ENHA 5ACYA 3Q2FA 4CUSA 4A9HA 4PTBA 4YBSA 2H60A 5L98A 5AD3A 4QSPA 4O7AA 5FE0A 4YBTA 3SVHA 5EICA 3O37A 2R0SA 5E7DA 4A9LA 5L99A 3DWYA 4KV1A 1JSPB 5EWVA 2DATA 4QSWA 5CRZA 3O36A 4A9JA 5ETDA 5A5SA 4Q0OA 5EISA 4TYLA 5HLSA 5FH8A 5HFQA 4NR7A 5A82A 4O7BA 4QSUA 4N4FA 5C85A 5D7XA 3U5KA 1ZS5A 5E74A 5KO4A 5FDZA 2GRCA 2RNXA 5LUUA 5F61A 5CQAA 5DKDA 4IR6A 4MR5A 5IG6A 5I29A 4MEPA 5I80A 5A85A 4F3IA 4Z6HA 2N9GA 5CUEA 4LR6A 4WHUA 4KCXA 5EI4A 4QR3A 4CL9A 5F25A 4MR3A 5C4QA 4BW4A 5ENFA 5DLZA 4IORA 4OUFA 5EQ1A 4MR6A 4WIVA 4YK0A 4UYFA 5A83A 4N4HA 2OSSA 4NRBA 5G4SA 4LYWA 4ZC9A 5DYUA 5II2A 2YEKA 4NR8A 4TU4A 4NUEA 3UW9A 5BT5A 3IU5A 5HQ6A 5CPEA 5F2PA 4HXSA 2I7KA 4UIVA 4QSSA 5BT3A 3G0LA 5A5RA 3U5OA 4PKLA 5F3AA 4QSRA 2YW5A 4UITA 5JI8A 4XYAA 2YEMA 4HXLA 3UV2A 4UYGA 5H1UA 4YY6A 4KV4A 5COIA 5FE9A 5FE1A 4TS8A 2LSPB 4YYMA 5I7XA 5HJCA 5EM3A 3UV4A 3HMFA 5CS8A 2L85A 5HQ5A 4QY4A 5CY9A 4YC9A 3P1DA 4BW1A 4Y03A 4CFKA 4QSQA 4YYJA 3LXJA 4UYHA 2WP2A 5EWHA 5F60A 5JWMA 4XUAA 5E9LA 2F6JA 4IOOA 4UYDA 5LVQA 4C67A 3JVMA 4YH3A 4IR4A 4YYGA 4E96A 5FG6A 4O71A 5HM0A 4O78A 4BJXA 4ALGA 5ENEA 3U5MA 1EQFA 5CUCA 4N4GA 5C7NA 5CQ8A 5LKTA 4A9NA 4X2IA 2I8NA 5I89A 2MJVB 5D26A 4CUTA 4J3IA 4CUQA 4NR6A 3O35A 4NXJA 5H85A 4Z1QA 5IGMA 3G0JA 3MULA 3ONIA 4TU6A 5ETBA 2NXBA 2DWWA 4NR4A 3SVFA 5A5PA 5E0RA 5EWCA 5KU3A 5FE6A 4YAXA 2E7NA 2DKWA 4TT2A 3U5LA 4UIZA 3IU6A 5TB6A 4N4IA 4YYHA 4CLBA 5E9YA 4NUCA 5FB1A 1JM4B 5CTLA 5DYAA 5HRWA 2DVQA 5IBNA 5ENJA 4A9KA 5EV9A 4HXKA 5F5ZA 5ENGA 5E3GA 3P1EA 4TQNA 5TCMA 2DVSA 4N3WA 3SVGA 5CQ3A 2RS9B 3O33A 4UYEA 2RI7A 4QSVA 4WHWA 5ENIA 4PY6A 5ENCA 4YYKA 5J0DA 5F62A 4CUPA 5FBXA 4FLPA 5I83A 3LQHA 5A5QA 2FSAA 4PCIA 4LYSA 5LJ0A 5H1VA 3DAIA 4HXRA 2E3KA 5HELA 5FFYA 5CUAA 4BW2A 3AQAA 5D3HA 5I1QA 4XY8A 2RNYA 2L5EA 4XY9A 4LRGA 4Z93A 4HBXA 3MB4A 5I7YA 5A81A 5HRXA 1WUMA 4AKNA 5C87A 4MR4A 5DYXA 4A9OA 3O34A 5DFDA 4Z6IA 4YATA 5K29A 2OUOA 5DKHA 4QUUA 4HBVA 5CGPA 3LQJA 3MQMA 3ZYUA 4QSTA 5HENA 2E7OA 4UIWA 4YYDA 4Q0NA 5DFCA 4Z1SA 5D3RA 5I88A 2RFJA 5D0CA 4XUBA 5DW2A 4YADA 5E9IA 3MUKA 5A5OA 5CQ5A 5AMFA 4NYVA 5A7CA 5EU1A 5L96A 2DVVA 5HFRA 4O76A 2D9EA 5EPRA 1F68A 5II1A 4CFLA 4QYDA 4HXNA 5CUDA 3P5OA 4O7CA 3GG3A 4ZQLA 5FH6A 5HQ7A 3UV5A 5D3LA 5L97A 1E6IA 3FKMX 5EA1A 3P1CA 5F1LA 5CUBA 4OGIA 5D24A 5CU8A 5CRMA 5D3PA 5E9KA 4QEUA 5ENBA 4ZW1A 4QB3A 4QC1A 5FE2A 4QBMA 4O77A 5G4RA 5LKXA 4YH4A 3LQIA 5FE8A 5I40A 3UVWA 5AMEA 4O75A 4QC3A 2D82A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TLPA 4J0SA 4QYLA 5FFWA 5E9VA 4ALHA 5LVRA 4NS5A 5EPBA 4IR3A 5BT4A 5LKZA 3P1FA 4QZSA 5E73A 5FE4A 3HMEA 4HBYA 4TZ8A 4NYXA 4OGJA 5KTXA 4RVRA 5FG4A 3UVDA 4UIUA 5EGUA 4MENA 3U5JA 3U5NA 5FB0A 5HRVA 4YYIA 5CUGA 5C89A 1N72A 4YABA 5CQ6A 5IGLA 4TZ2A 4LZ2A 5FE3A 2YYNA 5LJ2A 3JVLA 5D3TA 5EWDA 5L8TA 4QEWA 5A5NA 4YYNA 5DLXA 4J0RA 5EPSA 5DYCA 5CZGA 3AADA 4O70A 2G4AA 4NQMA 4MEOA 4TT6A 2R10A 4QUTA 5DX4A 3HMHA 5D3NA 5E3DA 2YDWA 4J1PA 4NRAA 3K2JA 2R0YA 2KTBB 4O72A 2YQDA 3JVKA 5F63A 1WUGA 4GPJA 4QSXA 4DONA 2F6NA 4NYWA 5H1TA 5CFWA 4A9EA 4LYIA 5DW1A 5HCLA 5LKUA 4UIYA 5AD2A 3Q2EA 4YBMA 2RNWA 4O74A 3D7CA 3UVXA 5EK9A 4A9IA 4TTEA 5DKCA 5LJ1A 5KTUA 4LZSA 4TT4A 4NRCA 2OO1A 2YELA 4NQNA 3U5PA 4LDFA 4LC2A 2WP1A 5DBMA 5CQ7A 4YY4A 3NXBA 5EVAA 3JVJA 5F1HA 5IGNA 2R0VA 4HXMA 4HXOA 1X0JA 3S91A 4A9MA 4HXPA 5D3JA 5C8GA 5HEMA 5CQTA 5KTWA 4O7FA 4QR4A 5FE5A 4CURA 4A9FA 5CQ4A 5L8UA 4PS5A 5IGKA 4LZRA 2DVRA 5DFBA 5EWWA 5KHMA 4BHWA 4PCEA 2RO1A 4HBWA 4BW3A 3LJWA 5E9MA 3UVYA 5I86A 5FG5A 5IIDA 4IR5A 3RCWA 4NR9A 2L84A 3QZSA 5FFVA 4O7EA 3VKHA 5FH7A 4IOQA 3MB3A 3MXFA 5FE7A 4CUUA 4MEQA 5D25A 4QR5A 5D3SA 3I3JA 3S92A 4UIXA 4C66A 5DY7A 4NUDA 3QZTA 4QEVA 4AKHA 4NR5A 3QZVA 4UYFB 5EP7A 5F36A 4QNSA 5CP5A 5ENHA 5ACYA 3Q2FA 4CUSA 4A9HA 4PTBA 4YBSA 2H60A 5L98A 5AD3A 4QSPA 4O7AA 5FE0A 4YBTA 3SVHA 5EICA 3O37A 2R0SA 5E7DA 4A9LA 5L99A 3DWYA 4KV1A 1JSPB 5EWVA 2DATA 4QSWA 5CRZA 3O36A 4A9JA 5ETDA 5A5SA 4Q0OA 5EISA 4TYLA 5HLSA 5FH8A 5HFQA 4NR7A 5A82A 4O7BA 4QSUA 4N4FA 5C85A 5D7XA 3U5KA 1ZS5A 5E74A 5KO4A 5FDZA 2GRCA 2RNXA 5LUUA 5F61A 5CQAA 5DKDA 4IR6A 4MR5A 5IG6A 5I29A 4MEPA 5I80A 5A85A 4F3IA 4Z6HA 2N9GA 5CUEA 4LR6A 4WHUA 4KCXA 5EI4A 4QR3A 4CL9A 5F25A 4MR3A 5C4QA 4BW4A 5ENFA 5DLZA 4IORA 4OUFA 5EQ1A 4MR6A 4WIVA 4YK0A 4UYFA 5A83A 4N4HA 2OSSA 4NRBA 5G4SA 4LYWA 4ZC9A 5DYUA 5II2A 1PUOA 2YEKA 4NR8A 4TU4A 4NUEA 3UW9A 5BT5A 3IU5A 5HQ6A 5CPEA 5F2PA 4HXSA 2I7KA 4UIVA 4QSSA 5BT3A 3G0LA 5A5RA 3U5OA 4PKLA 5F3AA 4QSRA 2YW5A 4UITA 5JI8A 4XYAA 2YEMA 4HXLA 3UV2A 4UYGA 5H1UA 4YY6A 4KV4A 5COIA 5FE9A 5FE1A 3VKGA 4TS8A 2LSPB 4YYMA 5I7XA 5HJCA 5EM3A 3UV4A 3HMFA 5CS8A 2L85A 5HQ5A 4QY4A 5CY9A 4YC9A 3P1DA 4BW1A 4Y03A 4CFKA 4QSQA 4YYJA 3LXJA 4UYHA 2WP2A 5EWHA 5F60A 5JWMA 4XUAA 5E9LA 2F6JA 4IOOA 4UYDA 5LVQA 4C67A 3JVMA 4YH3A 4IR4A 4YYGA 4E96A 5FG6A 4O71A 5HM0A 4O78A 4BJXA 4ALGA 5ENEA 3U5MA 1EQFA 1ZKRA 5CUCA 4N4GA 5C7NA 5CQ8A 5LKTA 4A9NA 4X2IA 2I8NA 5I89A 2MJVB 5D26A 4CUTA 4J3IA 4CUQA 4NR6A 3O35A 4NXJA 5H85A 4Z1QA 5IGMA 3G0JA 3MULA 3ONIA 4TU6A 5ETBA 2NXBA 2DWWA 4NR4A 3SVFA 5A5PA 5E0RA 5EWCA 5KU3A 5FE6A 4YAXA 2E7NA 2DKWA 4TT2A 3U5LA 4UIZA 3IU6A 5TB6A 4N4IA 4YYHA 2EJNA 4CLBA 5E9YA 4NUCA 5FB1A 1JM4B 3D1DA 5CTLA 5DYAA 5HRWA 2DVQA 5IBNA 5ENJA 4A9KA 5EV9A 4HXKA 5F5ZA 5ENGA 5E3GA 3P1EA 4TQNA 5TCMA 2DVSA 4N3WA 3SVGA 5CQ3A 2RS9B 3O33A 4UYEA 2RI7A 4QSVA 4WHWA 5ENIA 4PY6A 5ENCA 4YYKA 5J0DA 5F62A 4CUPA 5FBXA 4FLPA 5I83A 3LQHA 5A5QA 2FSAA 4PCIA 4LYSA 5LJ0A 5H1VA 3DAIA 4HXRA 2E3KA 5HELA 5FFYA 5CUAA 4BW2A 3AQAA 5D3HA 5I1QA 4XY8A 2RNYA 3D1BA 2L5EA 4XY9A 4LRGA 4Z93A 4HBXA 3MB4A 5I7YA 5A81A 5HRXA 1WUMA 4AKNA 5C87A 4MR4A 5DYXA 4A9OA 3O34A 5DFDA 4Z6IA 4YATA 5K29A 2OUOA 5DKHA 4QUUA 4HBVA 5CGPA 3LQJA 3MQMA 3ZYUA 4QSTA 3ERRA 5HENA 2E7OA 4UIWA 4YYDA 4Q0NA 5DFCA 4Z1SA 5D3RA 5I88A 2RFJA 5D0CA 4XUBA 5DW2A 4YADA 5E9IA 3MUKA 5A5OA 5CQ5A 5AMFA 4NYVA 5A7CA 5EU1A 5L96A 2DVVA 5HFRA 4O76A 2D9EA 5EPRA 1F68A 4AKIA 4AKGA 5II1A 4CFLA 4QYDA 4HXNA 5CUDA 3P5OA 4O7CA 3GG3A 4ZQLA 5FH6A 5HQ7A 3UV5A 5D3LA 5L97A 1E6IA 3FKMX 5EA1A 3P1CA 5F1LA 5CUBA 4OGIA 5D24A 5CU8A 5CRMA 5D3PA 5E9KA 4QEUA 5ENBA 4ZW1A 4QB3A 4QC1A 5FE2A 4QBMA 4O77A 5G4RA 5LKXA 4YH4A 3LQIA 5FE8A 4AI6A 5I40A 3UVWA 5AMEA 4O75A 4QC3A 2D82A
chains in the Genus database with same CATH topology
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