4OGIA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with the inhibitor bi-2536
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Dual kinase-bromodomain inhibitors for rationally designed polypharmacology.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/inhibitor
total genus 44
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ogiA01
3O34A 5A7CA 4ALHA 4NR9A 5EWVA 5HELA 3UW9A 3UV2A 4Z1SA 5F36A 4PY6A 3JVLA 2LSPB 5LKZA 3U5OA 3MULA 3ONIA 4GPJA 5EK9A 5A5RA 4MR3A 4NYVA 5DYUA 3SVFA 3AADA 5E74A 5ACYA 5ENBA 5CP5A 1F68A 4O70A 5E0RA 5AD3A 2FSAA 5EWHA 5CQ6A 4N4FA 5FE4A 5CQ8A 3MB3A 4PTBA 2R0VA 5FFVA 4LDFA 4XYAA 4NQMA 5HENA 3MB4A 4QC1A 4NUCA 4MEOA 1WUMA 4PKLA 4TT6A 2YYNA 5CUAA 5E9VA 2YQDA 4YBTA 3HMEA 4O77A 5EV9A 5HRWA 3U5MA 2G4AA 3QZVA 5ENJA 5L97A 5IG6A 5C85A 3JVMA 5DYCA 5J0DA 4CLBA 4J3IA 3O33A 4O7EA 5LJ0A 5D25A 3LQHA 4Q0NA 5I1QA 4YYDA 4N4IA 4BJXA 3LQIA 4LR6A 3UVDA 3ZYUA 3I3JA 4YYGA 5D3HA 2YW5A 4NR7A 4LYSA 5C89A 4QSTA 5C7NA 5D3NA 3G0JA 3U5LA 5ENIA 4A9MA 5D3SA 4TS8A 5D24A 5FE0A 4NS5A 5ENEA 4YABA 4NUDA 4NR8A 3UVWA 3K2JA 5CRZA 4Y03A 5DKDA 5CQ5A 5TCMA 5BT3A 5FE1A 4QSUA 4XUAA 3P1DA 2NXBA 5A5SA 4YYJA 4DONA 2MJVB 4QYLA 4YATA 5HRXA 5D3RA 3P1EA 3O35A 5LVQA 4ZW1A 4J0RA 1E6IA 4YYHA 5E7DA 3IU5A 5F1LA 5I40A 2I8NA 5CFWA 3O36A 2RNYA 5H1UA 4O7BA 4HXLA 4KCXA 4NR4A 4N3WA 5KU3A 2R10A 2YEKA 5FDZA 4CURA 5K29A 2N9GA 4A9OA 5CRMA 5LKTA 5LJ2A 4HBYA 5CPEA 3DWYA 4UIXA 2E3KA 4UYDA 5HCLA 1WUGA 5EWDA 2RO1A 5L99A 4QSVA 5CTLA 4QC3A 4QUUA 3UVXA 4CUPA 4QEUA 4HXNA 5D26A 5AD2A 5HFQA 4HXMA 2L5EA 4O7FA 4UIWA 5CY9A 4QEWA 4NR5A 4QEVA 5CUDA 5F60A 4LZSA 2OUOA 4YADA 5D3LA 4O72A 5L8UA 5ENHA 5IGNA 5F25A 5DFCA 4ALGA 5FB0A 5CQ3A 5G4SA 4BHWA 5EA1A 4IR4A 4YK0A 4O71A 5IGLA 2WP1A 5LVRA 3UVYA 3UV4A 4A9HA 5EP7A 5CUCA 1X0JA 2F6NA 5FH8A 5FG5A 4BW1A 5I89A 4YY6A 3TLPA 4HBVA 5DW2A 4IR6A 5DBMA 4NRCA 5CZGA 2RNXA 5D3PA 5FH6A 5HLSA 5C4QA 5CQAA 2RFJA 4LZ2A 4YYMA 4YH4A 2F6JA 4QY4A 5AMFA 5ETBA 3MXFA 4IORA 3Q2EA 4PCIA 2H60A 5F62A 4A9IA 2RNWA 3MUKA 4MENA 4YBMA 4Z6HA 4LYWA 5FE9A 5FG4A 5ENGA 5G4RA 5A81A 3U5KA 4QSWA 4UYFB 2OSSA 4BW3A 4UIUA 1JSPB 4CL9A 2DVQA 3S92A 4TT4A 3DAIA 4KV4A 4TT2A 5ENCA 2DVSA 4TU4A 5ETDA 5II2A 4TQNA 5LKXA 4A9JA 4LRGA 4NYWA 4YC9A 3RCWA 5EVAA 4Z1QA 5CUBA 4TYLA 3P5OA 5A85A 3LJWA 5IGKA 3U5NA 4NR6A 4NRBA 4QSRA 4UYFA 5F2PA 3FKMX 3O37A 4QZSA 4TTEA 3JVJA 4F3IA 2YELA 5A82A 5EWCA 2YDWA 5DY7A 4QNSA 2DATA 5E3DA 5CQTA 2GRCA 4QSSA 4PCEA 4WHUA 4A9NA 4WIVA 2KTBB 5CQ4A 5E3GA 5EGUA 5DFBA 3MQMA 5FE6A 4X2IA 5I7YA 5EPSA 5KO4A 5DYAA 5DW1A 4CFKA 5FG6A 5D3TA 5I80A 3QZSA 5E9YA 4MEPA 4YY4A 5EPBA 4PS5A 2I7KA 5FH7A 3UV5A 5C87A 4YH3A 3Q2FA 4NQNA 4IOQA 4Z93A 4Q0OA 5H1VA 4UIVA 5TB6A 5AMEA 4O78A 5DX4A 4TU6A 5F1HA 4QR4A 3IU6A 2E7NA 5HJCA 4CUUA 5EWWA 4UYGA 5F3AA 5F61A 4AKNA 4XY9A 4OGJA 4QSPA 5HQ7A 5FE3A 2L84A 4QYDA 2WP2A 5KHMA 4YYNA 1N72A 4CUTA 2D9EA 5IIDA 5HRVA 4OGIA 2L85A 4HXSA 5A83A 4HXRA 5JI8A 4A9KA 3QZTA 4QUTA 2OO1A 3GG3A 5E9KA 5EISA 4HXOA 4QSQA 4RVRA 5HQ5A 4IR5A 5BT5A 5HQ6A 4LC2A 4NYXA 2R0YA 5EU1A 5D3JA 2YEMA 4O76A 2R0SA 5CU8A 4C67A 1JM4B 5A5NA 5I88A 2DVVA 5I86A 3HMFA 3SVHA 5DKHA 5LKUA 5JWMA 5DFDA 2RS9B 4MR6A 4MR4A 4NRAA 5E9MA 4YAXA 2DKWA 3NXBA 4A9EA 4CUQA 4N4GA 3G0LA 5DLXA 4IOOA 5A5QA 5DYXA 5FB1A 4KV1A 3HMHA 4XY8A 5I83A 4O74A 4XUBA 5HFRA 4Z6IA 3SVGA 4QR5A 4NUEA 4J0SA 4UITA 4QSXA 4ZC9A 4YYIA 5A5PA 5EQ1A 2E7OA 4YBSA 4BW4A 4UIYA 5EI4A 5E73A 4HXPA 4WHWA 4TZ8A 5KTXA 3LXJA 5KTWA 5IBNA 4MEQA 4ZQLA 3D7CA 5KTUA 4UIZA 5IGMA 3P1FA 5L96A 5FE8A 4UYHA 2RI7A 4HBWA 4UYEA 5F5ZA 4O7AA 4IR3A 5CGPA 5ENFA 5DLZA 5L98A 5II1A 5A5OA 4O75A 4J1PA 4QB3A 3U5PA 5F63A 3P1CA 5EICA 5H1TA 5FE7A 3S91A 3U5JA 4A9FA 4QR3A 5COIA 4YYKA 4A9LA 5FE2A 5H85A 2DVRA 4HXKA 5CUGA 4BW2A 4QBMA 5EPRA 5FE5A 3LQJA 4CFLA 2D82A 5HM0A 5CUEA 5DKCA 4C66A 5E9LA 5E9IA 4OUFA 4O7CA 5FBXA 5FFYA 4E96A 4LYIA 1EQFA 5LJ1A 5BT4A 3JVKA 5FFWA 5D0CA 5LUUA 5HEMA 5I29A 2DWWA 4CUSA 4MR5A 4NXJA 5C8GA 4N4HA 5L8TA 4LZRA 1ZS5A 4HBXA 5EM3A 4TZ2A 5CQ7A 5CS8A 4FLPA 5I7XA 3AQAA 5D7XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1PUOA 3O34A 5A7CA 4ALHA 4NR9A 5EWVA 5HELA 3UW9A 3UV2A 4Z1SA 5F36A 4PY6A 3JVLA 2LSPB 5LKZA 3U5OA 3MULA 3ONIA 4GPJA 5EK9A 5A5RA 4MR3A 4NYVA 5DYUA 3SVFA 3AADA 5E74A 5ACYA 5ENBA 5CP5A 1F68A 4O70A 5E0RA 5AD3A 2FSAA 5EWHA 5CQ6A 4N4FA 5FE4A 5CQ8A 3MB3A 4PTBA 2R0VA 5FFVA 4LDFA 4XYAA 4NQMA 5HENA 3MB4A 4QC1A 4NUCA 4MEOA 1WUMA 4PKLA 4TT6A 2YYNA 5CUAA 5E9VA 2YQDA 4YBTA 3HMEA 4O77A 3VKGA 5EV9A 5HRWA 3U5MA 2G4AA 3QZVA 5ENJA 5L97A 5IG6A 5C85A 3JVMA 5DYCA 5J0DA 4CLBA 4J3IA 3O33A 4O7EA 5LJ0A 5D25A 3LQHA 4Q0NA 5I1QA 4YYDA 4N4IA 4BJXA 3LQIA 4LR6A 3UVDA 3ZYUA 3I3JA 4YYGA 5D3HA 2YW5A 4NR7A 4LYSA 5C89A 4QSTA 5C7NA 5D3NA 3G0JA 3U5LA 5ENIA 4A9MA 5D3SA 4TS8A 5D24A 5FE0A 4NS5A 5ENEA 4YABA 4NUDA 4NR8A 3UVWA 3K2JA 5CRZA 4Y03A 5DKDA 5CQ5A 5TCMA 5BT3A 5FE1A 4QSUA 4XUAA 3P1DA 2NXBA 5A5SA 4YYJA 4DONA 2MJVB 4QYLA 4YATA 5HRXA 5D3RA 3P1EA 3O35A 5LVQA 4ZW1A 4J0RA 1E6IA 4YYHA 5E7DA 3IU5A 5F1LA 3D1DA 5I40A 2I8NA 5CFWA 3O36A 2RNYA 5H1UA 4O7BA 4HXLA 4KCXA 4NR4A 4N3WA 5KU3A 2R10A 2YEKA 5FDZA 4CURA 5K29A 2N9GA 4A9OA 5CRMA 5LKTA 5LJ2A 4HBYA 5CPEA 3DWYA 4UIXA 2E3KA 4UYDA 5HCLA 1WUGA 5EWDA 2RO1A 5L99A 4QSVA 5CTLA 4QC3A 4QUUA 3UVXA 4CUPA 4QEUA 4HXNA 5D26A 5AD2A 5HFQA 4HXMA 2L5EA 4O7FA 4UIWA 5CY9A 4QEWA 4NR5A 4QEVA 5CUDA 5F60A 4LZSA 2OUOA 4YADA 5D3LA 4O72A 5L8UA 5ENHA 5IGNA 5F25A 5DFCA 4ALGA 5FB0A 5CQ3A 5G4SA 4BHWA 5EA1A 4IR4A 4YK0A 1ZKRA 4O71A 5IGLA 2WP1A 5LVRA 3UVYA 3UV4A 4A9HA 5EP7A 5CUCA 4AKGA 1X0JA 2F6NA 5FH8A 5FG5A 4BW1A 5I89A 4YY6A 3TLPA 4HBVA 5DW2A 4IR6A 5DBMA 4NRCA 5CZGA 2RNXA 5D3PA 5FH6A 5HLSA 5C4QA 5CQAA 2RFJA 4LZ2A 4YYMA 4YH4A 2F6JA 4QY4A 5AMFA 5ETBA 3MXFA 4IORA 3Q2EA 4PCIA 2H60A 5F62A 4A9IA 2RNWA 3MUKA 4MENA 4YBMA 4Z6HA 4LYWA 5FE9A 5FG4A 5ENGA 5G4RA 5A81A 3U5KA 4QSWA 4UYFB 2OSSA 4BW3A 4UIUA 1JSPB 4CL9A 2DVQA 3S92A 4TT4A 3DAIA 4KV4A 4TT2A 5ENCA 2DVSA 4TU4A 5ETDA 5II2A 4TQNA 5LKXA 4A9JA 4LRGA 4NYWA 4YC9A 3RCWA 5EVAA 4Z1QA 5CUBA 4TYLA 3P5OA 5A85A 3LJWA 5IGKA 3U5NA 4NR6A 4NRBA 4QSRA 4UYFA 5F2PA 3FKMX 3O37A 4QZSA 4TTEA 3JVJA 4F3IA 2YELA 5A82A 5EWCA 2YDWA 5DY7A 4QNSA 2DATA 3VKHA 5E3DA 5CQTA 2GRCA 4QSSA 4PCEA 4WHUA 4A9NA 4WIVA 2KTBB 5CQ4A 5E3GA 5EGUA 5DFBA 3MQMA 5FE6A 4X2IA 5I7YA 5EPSA 5KO4A 5DYAA 5DW1A 4CFKA 5FG6A 5D3TA 5I80A 3QZSA 5E9YA 4MEPA 2EJNA 4YY4A 5EPBA 4PS5A 2I7KA 5FH7A 3UV5A 5C87A 4YH3A 3Q2FA 4NQNA 4IOQA 4Z93A 4Q0OA 5H1VA 4UIVA 5TB6A 5AMEA 4O78A 5DX4A 4TU6A 5F1HA 4QR4A 3IU6A 2E7NA 5HJCA 4CUUA 5EWWA 4UYGA 5F3AA 4AI6A 5F61A 4AKNA 4XY9A 4OGJA 4QSPA 5HQ7A 5FE3A 2L84A 4QYDA 2WP2A 5KHMA 4YYNA 1N72A 4CUTA 4AKIA 2D9EA 5IIDA 5HRVA 4OGIA 2L85A 4HXSA 5A83A 4HXRA 5JI8A 3ERRA 4A9KA 3QZTA 4QUTA 2OO1A 3GG3A 5E9KA 5EISA 3D1BA 4HXOA 4QSQA 4RVRA 5HQ5A 4IR5A 5BT5A 5HQ6A 4LC2A 4NYXA 2R0YA 5EU1A 5D3JA 2YEMA 4O76A 2R0SA 5CU8A 4C67A 1JM4B 5A5NA 5I88A 2DVVA 5I86A 3HMFA 3SVHA 5DKHA 5LKUA 5JWMA 5DFDA 2RS9B 4MR6A 4MR4A 4NRAA 5E9MA 4YAXA 2DKWA 3NXBA 4A9EA 4CUQA 4N4GA 3G0LA 5DLXA 4IOOA 5A5QA 5DYXA 5FB1A 4KV1A 3HMHA 4XY8A 5I83A 4O74A 4XUBA 5HFRA 4Z6IA 3SVGA 4QR5A 4NUEA 4J0SA 4UITA 4QSXA 4ZC9A 4YYIA 5A5PA 5EQ1A 2E7OA 4YBSA 4BW4A 4UIYA 5EI4A 5E73A 4HXPA 4WHWA 4TZ8A 5KTXA 3LXJA 5KTWA 5IBNA 4MEQA 4ZQLA 3D7CA 5KTUA 4UIZA 5IGMA 3P1FA 5L96A 5FE8A 4UYHA 2RI7A 4HBWA 4UYEA 5F5ZA 4O7AA 4IR3A 5CGPA 5ENFA 5DLZA 5L98A 5II1A 5A5OA 4O75A 4J1PA 4QB3A 3U5PA 5F63A 3P1CA 5EICA 5H1TA 5FE7A 3S91A 3U5JA 4A9FA 4QR3A 5COIA 4YYKA 4A9LA 5FE2A 5H85A 2DVRA 4HXKA 5CUGA 4BW2A 4QBMA 5EPRA 5FE5A 3LQJA 4CFLA 2D82A 5HM0A 5CUEA 5DKCA 4C66A 5E9LA 5E9IA 4OUFA 4O7CA 5FBXA 5FFYA 4E96A 4LYIA 1EQFA 5LJ1A 5BT4A 3JVKA 5FFWA 5D0CA 5LUUA 5HEMA 5I29A 2DWWA 4CUSA 4MR5A 4NXJA 5C8GA 4N4HA 5L8TA 4LZRA 1ZS5A 4HBXA 5EM3A 4TZ2A 4AKHA 5CQ7A 5CS8A 4FLPA 5I7XA 3AQAA 5D7XA
chains in the Genus database with same CATH topology
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